3IDHA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 453
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3idhA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3idhA01
1ZXOA 1BO5O 4J8FA 5JICA 3ZX3A 5AZIA 3CQXA 5BPNA 1Z05A 2D0PA 4WQ4A 3JS6A 1SAZA 4H0XB 4CZEA 4FWNA 3FZLA 1ATNA 4BG9A 1YAGA 2E2PA 4MLEA 3BF1A 3HBTA 5AR0A 1Q18A 1ATRA 2A6AA 3AARA 2HF4A 3DAWA 1QQOA 5KQDA 2CH5A 3M1FA 4H03B 5EXWA 4BRPA 3QBWA 5AQMA 3WXIA 3I8BA 4A62A 2GWJA 3VGLA 4BQZA 3FZFA 2ZGYA 3LDPA 4B1XB 5BRFA 1NGHA 1TYQB 2YHXA 4CZIA 3CIPA 3ZX2A 3VEXA 1HKCA 4I6MB 3LM9A 1GLFO 4PKGA 3HI0A 3C7NB 4C23A 1HKBA 2CH6A 4MO5A 5BRHA 4QS9A 1NGFA 3VEWA 1MDUB 3UB5A 3WXKA 3TU5A 3ZEUA 4FOIA 1GLAG 3R9PA 3W0LA 2FF3B 3AAQA 4CBWA 1YVNA 2P9LB 1YUWA 3DXKA 3ZETB 2HOEA 2V7YA 3J8AA 2D0OA 2YJFA 2Q1NA 4FWMA 1T44A 2Q36A 3DXMA 3O08A 3CQYA 3SLCA 1JCGA 2Q0RA 4FPAA 1P8ZA 4B1VA 5FPNA 4B1UB 3TPQA 4A2AA 3SJHA 2GELA 3CJ9A 3LDOA 3CJ1A 4XH5A 1NGBA 2ITMA 3ULEA 5E26A 4BG8A 3LDQA 1MA9B 5AQZA 2HMPA 3VEOA 3LM2A 5KPTA 3AAPA 5BN8A 3WEEA 4XH1A 4F9OA 5AQSA 3H3OB 3IDHA 1YXQA 3D2FA 4BRGA 5AQHA 5F0XA 3IUCA 3M6GA 4DCHA 1X3MA 1DKGD 4IO8A 2V51B 1QZ5A 2H3GX 4YDUC 3DJCA 5FPEA 4MO4A 2KHOA 1J6ZA 1NGIA 3MMVA 2QW9A 2ASPA 2IVOA 3MN7A 1T6CA 4CZMA 4BVOA 3BF3A 1TUUA 5AQIA 1NGCA 1ZC6A 5AQJA 3SMSA 2YI1A 2IVNA 2HF3A 2VCPA 3WQTA 5AQFA 4BROA 3C0BA 5EY4A 2P9KA 3QFPA 2F9TA 3ENHA 4CJ7A 3H45C 4B9QA 5E84A 3I33A 5AQQA 1MWKA 4H0OA 1BOTO 1G99A 4BRNA 5I9EB 2QXLA 1NMDA 5AQRA 2P9PA 2P9SB 2E1ZA 5AZJA 1U2VB 4FL9A 4H0YB 4XH4A 1X9JA 2AA4A 2OANA 3VEZA 5AQXA 1RFQA 4FWKA 3MN9A 3RSEB 4BRKA 4CZFA 1JCFA 4JHDB 4BRHA 2P9IB 4PKIA 1K8KB 1HUXA 2WUSA 1MWMA 1KAYA 3FR0A 4H5VA 4H0TB 4H5WA 4I6MA 2I7PA 5AQLA 5JMVA 3CJ7A 4CZGA 2EWSA 2ZWHA 2YHWA 3IFRA 1BDGA 4JD2B 3O4WA 4BQLA 4CD3A 3UKUA 1V4SA 3D2EB 4H5TA 4BC5A 1QQMA 3M3ZA 4M7XA 3UKRA 3WXJA 2QWPA 3QDKA 1NM1A 1NGGA 3VGMA 3VF2A 2I7NA 4GNIA 2QWMA 5AZIB 2FSNA 2P9NA 5AFUA 1NGDA 3VF4A 2A41A 4EFHA 4K42A 3MDQA 4BC3A 2E2QA 3JXUA 4O8KA 3EO3A 2BTFA 1TUYA 5JLFA 3R8EA 3SK3A 3O1BA 5ADXA 2VYPA 4XEIA 4YDUA 3DWLA 2DPNA 1ZBSA 4EIAA 4BRLA 1D4XA 2YHYA 2QWNA 4NO7A 3ZX0A 2E8AA 4BR5A 1H1VA 3LDLA 2ASOA 5BN9A 2A42A 2UYTA 4K41A 2P9UA 1ATSA 3BUZB 4QS8A 2ASMA 1XC3A 2AP1A 4B1YB 2GEMA 2CGKA 4FOEA 4NB4A 3U8XA 1JCEA 1QZ6A 2A5XA 1LCUA 3ZEUB 2QWRA 5TKYA 4BR7A 1HX1A 1BA1A 4FWPA 3QICA 3DXKB 5BREA 3CJCA 1KAZA 4BRIA 1Z6RA 3O6WA 1T6DA 3AY9A 3R6MA 1X3NA 1GLEG 3FE1A 2Q2RA 2E2OA 3H3NO 4H0PA 4CD1A 2NLXA 4MLHA 4BREA 3HZ6A 3WT0A 4PKHA 5BRDA 1E4GT 3O5BA 2GUPA 4IXCA 3U4LA 1BUPA 2FLOA 4FWOA 4BRQA 2ZF5O 3CERA 4FWSA 3D7EO 3FLCO 1IG8A 3ULEB 4EHTA 5BPMA 4BRAA 3VF6A 2Q0UA 5EVZA 4FWLA 2BUPA 1GLLO 3EZWA 4H5RA 3WEEB 4FSVA 4CBUA 4ISFA 4BR2A 3D2FB 4B1ZA 5AQOA 4CI6A 5AQGA 5KPZA 1K8KA 3L4IA 3ATUA 1WUAA 3VEYA 4GY2B 4CZKA 2A3ZA 3A5LC 3A0IX 4WQ5C 1C0FA 1NGEA 3VETA 4M7YA 3KZBA 2GWKA 1EQYA 5F1XA 3BP8A 5EOYA 2W41A 3ENOA 5LJWA 4H5NA 3P4IA 4KBOA 1BU6O 3GL1A 5LJVA 1HPMA 1Y64A 1TYQA 4EAHD 2E1YA 1BA0A 2YCHA 3H46O 3UE5A 4E1JA 3ID8A 5FPMA 4AM6A 4DQ8A 3C7NA 3S41A 3U9ZA 4BC2A 1C0GA 3HM8A 4BC4A 4LC9B 4L3QA 2P9KB 3SMPA 2PBDA 3A8YA 4AM7A 4JAXA 2W40A 3CJBA 4BR0A 4CBXA 4CZHA 3FZKA 4DB3A 2F9WA 4Y0WA 2P9LA 3H1QA 2IVPA 3O1WA 3ZETA 2P9PB 1RDWX 4BRMA 3F9MA 3L0QA 5AZJB 2Q97A 5AFUH 3WQUA 3HSCA 5AQWA 3FFKB 2QWOA 4BRDA 2J4RA 3H1VX 3IMXA 4RTFD 3CJAA 1BWFO 5AQUA 3QBXA 3GE1A 3W3DA 4A2BA 5AQKA 5JLHA 4PL7A 1E4FT 3MK6A 1GLDG 5ADXH 3HTVA 2ZGZA 3QFUA 4H0VB 4M63C 1XUPO 4RWTA 3VGKA 3A5OC 4WYBA 3KVGA 2CGJA 3GOIA 2A40A 1KXPA 3G25A 4IZ9A 4WQ4C 2VWBA 4JN4A 5ELZA 5KPRA 1LOTB 5AQVA 4PL8A 2FSJA 2YJEA 3UKUB 4A61A 1S22A 3ATVA 1S3XA 4HTLA 1QHAA 4BGAA 3CI5A 3UKRB 1KAXA 2V52B 2D1KA 4QS7A 4FWRA 4CZLA 3VERA 3VENA 4BRFA 5LY3A 4RCHA 1U6ZA 3A5NC 3VPZA 1OKJA 4K25A 3OHRA 2P9NB 2FSKA 2QWQA 5F2RA 1R59O 3L6QA 2E2NA 3FZMA 3MCPA 5AQYA 1QQNA 4FPBA 1GLCG 5AQPA 1NBWA 4FO0A 5B8HA 3QMLA 1IJJA 3CETA 3GDQA 4IWVA 5KQ8A 2V7ZA 1SZ2A 3GG4A 4DHYA 3MN6A 2CGLA 3EKUA 4HWIA 4EHUA 3BEXA 4FWQA 2E20A 4BR4A 3EN9A 2D4WA 3VEVA 3EL2A 3GBTA 4WQ5A 4B1WB 2GTDA 2Q31A 1GLBG 3DXMB 4BGBA 1HKGA 1HJOA 4JNEA 1RGIA 3U9DA 3VOVA 5CE3A 3KHYA 4K43A 3O80A 1NLVA 1CZAN 2P9UB 3CHWA 1DEJA 2P9SA 3LDNA 1U2VA 3FGUA 1BG3A 2IIRA 3A5MC 3QB0A 2QM1A 3H6EA 1XQSC 3VESA 4BVPA 1V4TA 3RSEA 4CZJA 1SQKA 2FF6A 4JHDA 4BR9A 2PAVA 4IJAA 1ESVA 2P9IA 3O8MA 3EKSA 4ISGA 4IJNA 2E88A 4O5FA 3B8AX 1DGKN 2NRHA 3MN5A 3WXLA 1GLJO 5AQNA 3LL3A 4JD2A 5BPLA 1NGAA 3D2EA 5EX5A 5BR9A 1NGJA 1HLUA 2NZTA 2QWLA 1NWKA 2FXUA 4Z94A 1WOQA 5AQTA 3FZHA 5FPDA 4ISEA 3WUHA 4BRCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X65K 3QERA 3DLHA 2P51A 1NJIO 5M1PA 3O4QA 2OZSA 3HPGA 5KGWA 4FWNA 1VQNN 1IBLK 1ASVA 4ZHRA 1YAGA 3BF1A 3L3VA 3HBTA 3OYHA 4OVLA 4QOZB 4AF1A 5TKWA 4OGCA 1TV6A 5EXWA 4BRPA 1WAJA 2ZE2A 1Q9XA 3WXIA 4DR3K 4N47A 4A62A 3VGLA 3HJFA 4CJLA 1IG9A 1HNVA 3WNFA 1KVAA 1LV5A 1WBBA 4M3WA 1J54A 4KTQA 1QTMA 5DMRA 4C23A 1HKBA 4HHTA 4DTNA 3S9HA 4KO0A 2HHSA 3VEWA 4E7HA 4C8KA 3ZEUA 4FLZA 4AHCA 2YHBA 5DM7L 1TAQA 4B8AB 1NKEA 1YVNA 3I55N 4DFJA 2HOEA 3J8AA 3VQQA 4YFUA 1VSFA 5C42A 4FWMA 4I9QA 1T44A 3O08A 1KVBA 4CGJA 3CQYA 3SLCA 4CEQA 3CCQN 4B1VA 4BE2A 1RT1A 4A2AA 3KIOA 3SJHA 4KI6A 3OYNA 3LDOA 5MLCQ 4B9SA 1U45A 3ULEA 5E26A 1FW6A 5KPTA 3LM2A 1S72N 4W5OA 4KB0A 1WLJA 1TKZA 5BN8A 2HNYA 3WEEA 4YOXA 3NF9A 3IDHA 1YXQA 3AVLA 4DSFA 1F21A 2Z1JA 1SL2A 3ZYYX 5F0XA 2F96A 4CVNE 4KI4A 3IUCA 4DCHA 4IO8A 2V51B 4FVUA 4CIEA 5HP1A 1QZ5A 1A5XA 3D0PA 4JK8A 3V9WA 4B3RK 2XHBA 1NGIA 3MMVA 2Q3SA 5CR4A 3KWIA 4DQIA 1NJYA 3BF3A 5M1OA 4DV6K 5HRSA 4M42A 3V1QA 1OH7A 4CF8A 5AJ3K 3NDKA 3K5MA 2HF3A 2HHUA 3C0BA 3PIOL 2P9KA 2F9TA 3ENHA 4M3TA 4DV0K 4JI8K 5J2NA 4JYAK 4B9QA 5E84A 4O55A 1MWKA 2YV0X 1BOTO 4H0OA 4BRNA 4KAZA 3U6FA 1KC8O 1GOAA 1TKXA 1JL1A 3MEEA 4RW8A 1B9FA 2P9SB 4FL9A 1RDCA 3QO9A 4XH4A 4CK3A 2VG6A 2UUCK 3HK2A 3MN9A 3RSEB 2RHKA 4BRKA 3AVKA 4V19S 1HNZK 3FR0A 3M8SA 3TANA 3B6OA 5GIOA 2I7PA 3MX5A 3CJ7A 1BDGA 4CJEA 5CYQA 4CD3A 3O4WA 4AHVA 4H5TA 1NMNA 3M3ZA 3UKRA 5M1FA 1VSJA 3CFPA 1RNHA 3VGMA 2UXCK 3K5NA 2O8FB 3SCXA 5AFUA 2XY5A 2A41A 4DLGA 3MECA 4E3SA 1EXQA 4JI4K 2E2QA 3PO4A 4BDYA 4TSXA 2BTFA 1TUYA 5JLFA 3EY1A 2LSNA 3DWLA 2G8KA 1IH7A 2DPNA 4EIAA 2O8EB 4FK4A 1D4XA 3MWTA 4E7IA 3QESA 1H1VA 4CEOA 1BI4B 1TVRA 3THVA 3DMJA 4CK1A 2ASOA 1HRHA 2UYTA 4KHNA 3TABA 4CEDA 1QSLA 1I94K 1XC3A 1JLFA 4FOEA 3T1AA 3A2FA 1JLEA 1NOZA 1WSEA 3V1RA 3AA4A 4JK9A 4F3TA 4DU3A 3ZSYA 1LWFA 3OJSA 5BREA 3P31A 3R6MA 2FBVA 3FE1A 3HOTA 2Q2RA 2NLXA 1NKCA 4UQGA 4GV6A 2HBJA 3WT0A 4DV2K 4FZZA 5CY4A 3NF7A 5FRNA 4IXCA 3U4LA 3IS9A 1RT6A 2FLOA 3C94A 3J7AP 3V81A 4FWSA 3DYAA 3Q7BA 5BPMA 5EVZA 1SKWA 3AA5X 4A5BA 1VSLA 1IKWA 4FWLA 3TTFA 5IT9O 4DFMA 3J80O 4K8XA 1R0AA 4PA1A 4B1ZA 3C6HA 5AQOA 2PYJA 4DU4A 1RBVA 2IGIA 5AQGA 3LAKA 4AH9A 5KPZA 3NHGA 1G15A 3L4IA 1SV5A 3ATUA 4JLHA 4GY2B 1CXQA 4CZKA 2A3ZA 3OVNA 3A0IX 3VETA 4M7YA 3KZBA 5F1XA 1XMOK 2PYLA 5J2MA 1VQMN 4I2QA 3RMCA 3ASMA 1RBSA 4RW7A 3TAMA 4Z4GA 3GL1A 5LJVA 2HVHA 3K2PA 1W2BM 2PY5A 4CJTA 4OPHA 3AO2A 3RMDA 4CJWA 4E7LA 3G71N 4DQ8A 1NOYA 3AVAA 3IAYA 4O44A 1C0GA 4CGIA 4L3QA 1WN7A 3T19A 2W40A 3CJBA 1RTIA 4CBXA 3NH2A 2F9WA 4Y0WA 3VQDA 2P9LA 3AGRA 3ZETA 3CYMA 3MAQA 3HSCA 2QI2A 4GKJK 3CJAA 1HNIA 1BL3A 3QBXA 4JKHA 3W3DA 4Z4CA 2JWKA 4KH4A 3ULDA 4Q0BA 1WNSA 5ADXH 4M63C 4H0VB 1XC9A 1XUPO 4GVEA 5IWAK 3A5OC 2F7TA 4F4KA 3KVGA 2A40A 1NJWA 3CCEN 4PL8A 4CIFA 3QLHA 4DTPA 1S22A 4HTLA 4L8RB 3THXA 1VSHA 4CF0A 4FWRA 3VERA 4BRFA 3MWPA 1DTTA 4LFBK 1K6YA 3VPZA 3TAFA 3I56N 3THWB 2P9NB 5F2RA 3WNGA 2E2NA 3MCPA 4GV3A 4FJKA 1CZ9A 5FLXO 4CEZA 3QMLA 3CFRA 1D8YA 1IJJA 4KB1A 2ZQBA 1TGOA 4FJGA 2CGLA 3THYA 3EKUA 4EHUA 5E41A 2D5RA 4IDHA 4FZXC 2D4WA 1D5AA 4ZTJA 3P5JA 4FCYA 1EKEA 2RPIA 4B3TK 4BGBA 3P39A 1C1AA 1SUQA 1XMQK 1VSIA 4BE0A 3U9DA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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