5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
2VCPA 3FZFA 4H0TB 5BR9A 1QQNA 4CZFA 5ELZA 2QWMA 2ZGYA 3CJCA 3U8XA 4CBXA 1MWKA 2QWPA 1NWKA 4YDUC 1SAZA 4PL8A 2P9LB 1NGGA 2E2NA 2QWRA 4BRGA 4ISEA 2F9TA 2Q36A 1HLUA 4CZMA 2P9IA 5AR0A 3HTVA 3O1WA 1GLAG 3FZMA 2ASMA 2HMPA 2QXLA 2YHXA 1LCUA 1S22A 4K25A 5AQPA 1TUUA 3BUZB 4FWRA 4IXCA 4K43A 1QQMA 4EAHD 1NBWA 4FOEA 1IG8A 4NO7A 5KPZA 4FWPA 4JNEA 1NLVA 5FPDA 2IVNA 1ESVA 3AAQA 3O80A 1Q18A 3OHRA 3FFKB 3EO3A 3I33A 4MO5A 4LC9B 4B1UB 5JLHA 4E1JA 5AQGA 3IMXA 1NGFA 5EY4A 4ISFA 1WUAA 2E1ZA 5LJWA 3KZBA 2P9KB 3FZKA 2CGKA 4WQ5A 3J8AA 2E20A 3IUCA 2Q2RA 3DAWA 2IVOA 3U9DA 4K42A 5FPNA 2NRHA 4HWIA 1BDGA 4BQLA 5BREA 1HJOA 2P9PA 5EXWA 3UB5A 5TKYA 2FF3B 2E2QA 4IZ9A 5LY3A 4CZHA 3GG4A 4FPAA 4FWOA 2YJFA 2W41A 1RFQA 2ASPA 2A41A 4MO4A 4B1VA 2D0PA 4QS8A 1QHAA 2ITMA 4BR0A 3VGLA 1LOTB 1C0GA 3LM9A 1ATSA 5AQWA 2P9IB 4K41A 2ZGZA 1DGKN 1DKGD 3UKRA 3D2EA 1WOQA 3HBTA 4AM7A 2UYTA 3H46O 5KPRA 5F2RA 4JD2A 1MA9B 2KHOA 3HI0A 1BA0A 4CBWA 5BPNA 2H3GX 4BVPA 3G25A 2WUSA 3MCPA 3IFRA 5AFUH 1BU6O 4FWSA 1BWFO 3D2FA 3VGKA 4FO0A 4H5WA 2D1KA 3S41A 4ISGA 3QDKA 1ZC6A 3WQUA 3C7NA 1JCEA 3AARA 1U2VB 4JHDA 4CD1A 4EHTA 3GL1A 1KXPA 4I6MA 5BPLA 3H45C 2E88A 5AQOA 4IWVA 4CZGA 5AFUA 1X3MA 2A42A 4JN4A 2QWNA 5F1XA 3BP8A 1QQOA 2QW9A 4XH4A 4BC2A 2AP1A 4MLHA 4BR4A 3DXKA 2P9PB 3AY9A 4A61A 4Y0WA 4GY2B 1T6CA 4H0YB 1E4GT 4QS7A 3IDHA 3VEZA 2GELA 4EIAA 3UKUA 3U4LA 2J4RA 3MN5A 3ZX3A 5AQHA 2P9NB 4YDUA 1YVNA 1MDUB 4BRMA 1RDWX 3A5NC 5AQVA 1KAYA 2FF6A 5JLFA 1TYQA 3UKRB 3D2EB 4PKIA 1ZXOA 1Y64A 5AZIB 3ZEUA 1Z6RA 2BUPA 4JD2B 4BRHA 3MN7A 1T6DA 2QWQA 3QBXA 4GNIA 4KBOA 4H5NA 3GE1A 3LM2A 2GTDA 1MWMA 5CE3A 5FPEA 1BG3A 2A5XA 5AQFA 3F9MA 3MMVA 3D2FB 5FPMA 4O8KA 3ULEA 4BRIA 2QM1A 3MN9A 4B9QA 5AQXA 3O08A 3CQYA 1NGHA 3LL3A 3VESA 4FWKA 5BN9A 5AQSA 4BREA 4H0VB 3C7NB 3A5MC 4JHDB 3ENHA 2IIRA 2P9SA 4HTLA 4I6MB 4BR9A 1KAZA 4A2BA 1YAGA 3GOIA 3EZWA 3LDOA 4PKGA 5BRFA 3VOVA 4BRAA 3DXKB 3U9ZA 3P4IA 4JAXA 4BRLA 3O1BA 5AQRA 2GEMA 2A40A 3CJAA 4FWNA 3WT0A 2D0OA 3CI5A 4H5TA 2V52B 3VPZA 3VERA 1NMDA 4BG9A 1DEJA 4WQ5C 3H3NO 2I7PA 4RWTA 3I8BA 3EN9A 1E4FT 3WEEA 4B1XB 3VEOA 5F0XA 3SMSA 1JCGA 2Q0UA 3UKUB 4XH5A 4CD3A 5LJVA 2FSJA 4H0OA 2YHYA 4EFHA 2Q97A 3FE1A 1J6ZA 3CETA 5EOYA 4A62A 2DPNA 2CH5A 3TPQA 3VEYA 3A5LC 3WXLA 1TYQB 3O4WA 3O8MA 1H1VA 1QZ6A 1EQYA 4FWLA 3ZEUB 3KVGA 3WXIA 5AQUA 5EX5A 4BRQA 1NGCA 1QZ5A 4CJ7A 3HM8A 4DCHA 3KHYA 3AAPA 3M3ZA 3SJHA 4EHUA 3GDQA 1ATRA 2A6AA 3H6EA 3ULEB 4BRPA 3A5OC 5AQIA 2FSKA 3BEXA 3VEVA 1BUPA 1BA1A 5AQJA 3JS6A 3L4IA 1KAXA 5AZJA 2P9UA 3CJ1A 4CZJA 4IO8A 3FZHA 2P9SB 1ATNA 4WQ4A 1HKGA 4H0XB 3VENA 3A8YA 4BG8A 3EKUA 1YUWA 5B8HA 3ZX2A 1GLEG 4WYBA 4BGAA 2HF3A 3WXJA 4L3QA 3VETA 3WXKA 1S3XA 3ATVA 4BGBA 4BRNA 1P8ZA 2YHWA 5KPTA 5KQDA 4M63C 4BR7A 2GUPA 2FSNA 3VGMA 3DJCA 3C0BA 3VEWA 4H5VA 2CH6A 5E26A 3DWLA 3WEEB 5AQKA 4RTFD 2ZF5O 2QWLA 4B1WB 4NB4A 3VEXA 2A3ZA 3ZETA 3FGUA 5AQLA 3M1FA 4MLEA 1SQKA 3FZLA 1XC3A 5KQ8A 2Q1NA 5I9EB 4BR5A 1K8KA 3D7EO 2W40A 5AQMA 3BF3A 3W0LA 2AA4A 5AQTA 2BTFA 4C23A 4CI6A 4CZIA 2HF4A 1ZBSA 1NGBA 3QMLA 3SK3A 1G99A 3BF1A 3WQTA 5BRDA 5EVZA 4CBUA 4B1YB 1OKJA 3W3DA 4FSVA 1D4XA 4XH1A 2E1YA 4FL9A 2Q0RA 3LDNA 3EL2A 1NGIA 3SMPA 5AZJB 2P9UB 3EKSA 2ZWHA 1GLFO 3QFPA 1U6ZA 1X9JA 3ZX0A 2YCHA 1HUXA 3ID8A 4J8FA 2PBDA 4BC3A 3H1VX 2GWJA 1SZ2A 4IJAA 4IJNA 3QBWA 4M7YA 4BRKA 1BOTO 1HKCA 3CIPA 3M6GA 3SLCA 2GWKA 4FWQA 2Q31A 3RSEA 4BC4A 4DB3A 1GLBG 4DQ8A 4BR2A 3LDPA 4H0PA 3CQXA 3LDQA 2V7ZA 3L0QA 3DXMA 2NLXA 1Z05A 4PL7A 2NZTA 4H5RA 4BQZA 3QFUA 2YJEA 4BVOA 1YXQA 2HOEA 4CZEA 3CHWA 1U2VA 1GLDG 2VYPA 2E2PA 2YI1A 5JMVA 5BPMA 2V51B 3ZETB 1BO5O 3HSCA 3L6QA 3FR0A 3UE5A 2QWOA 1TUYA 3VF4A 1K8KB 4B1ZA 5AQZA 3CJ9A 4RCHA 4BRCA 1NGDA 4Z94A 1JCFA 3B8AX 5BN8A 3CJBA 1HKBA 2VWBA 3MN6A 2V7YA 3O6WA 4BC5A 3CJ7A 1RGIA 4FOIA 4XEIA 3QICA 2I7NA 1HX1A 3H3OB 1GLJO 2FLOA 3HZ6A 4F9OA 2P9LA 4BROA 3A0IX 2F9WA 1R59O 4BRDA 1IJJA 1C0FA 2P9NA 1XQSC 5AQYA 5AQQA 1NM1A 1V4TA 2IVPA 2OANA 3H1QA 3VF6A 5ADXH 3TU5A 5E84A 3GBTA 5JICA 3FLCO 3JXUA 3ATUA 2E8AA 3CERA 3ENOA 5AZIA 1T44A 4CZLA 2FXUA 4M7XA 3LDLA 2E2OA 1NGAA 4FPBA 5BRHA 5AQNA 3RSEB 3VF2A 1GLCG 1CZAN 5ADXA 3DXMB 4O5FA 3MDQA 4A2AA 4AM6A 1NGJA 2ASOA 4QS9A 4WQ4C 4DHYA 3WUHA 3R8EA 3QB0A 2D4WA 4BRFA 1HPMA 2CGJA 4H03B 3R9PA 2P9KA 2PAVA 1X3NA 1XUPO 4PKHA 1GLLO 3O5BA 4FWMA 4CZKA 1V4SA 2CGLA 3MK6A 2EWSA 3R6MA 1NGEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FZFA 4CJ5A 2DTUA 5T7BA 1BL3A 5FDLA 4BWMA 4B08A 5ELZA 2QWMA 3CJCA 4YDUC 4CJQA 2P9LB 1T05A 1NGGA 2E2NA 4CJEA 4W5QA 4E72A 2QWRA 4X65K 1R0AA 4BRGA 2F9TA 2Q36A 4KTQA 4DTOA 1NRBA 1RTJA 1W2BM 2P9IA 1M1KO 3HJFA 3BZKA 3L3VA 1RBSA 3VQ5A 3MXMA 3OW2M 4FWRA 4DTNA 4K43A 3TTCA 3ZSXA 4UJ0A 5KPZA 2B6AA 4FWPA 4IOXA 1XMOK 3WXMB 3DLKA 3AAQA 2N2RA 1Q18A 3O80A 4FLYA 2A1RA 3EO3A 3I33A 4CESA 5M1NA 1SL1A 4LC9B 3IMXA 4CHOA 1NGFA 4ISFA 1WUAA 5C2FA 3NFAA 5IT9O 2HHQA 4YOYA 2OPQA 1T7AA 4WQ5A 3VQPA 3CC7N 1X9SA 3O4NA 1Y97A 3F2KA 3A2FA 3U9DA 5FPNA 3PIOL 4FZZA 5TKYA 3PX4A 1K8BA 3SUOA 5LY3A 3AO4A 3OA9A 1JKZA 4CEEA 1TVRA 2WONA 2ZJPL 1NK9A 2ZQBA 3OS1A 3O4QA 4QS8A 1QHAA 1FW6A 4CEBA 2XY8A 1N32K 3VGLA 1VQNN 1GOAA 1VSMA 3E7UX 2Y1IA 3M8QA 1EX4A 1K6YA 1UAXA 2ZGZA 3ZCMA 1DGKN 4J2DA 1OH8A 5DK5A 1QQCA 4AM7A 4R79A 4DU3A 2ITGA 3VMFB 1Q7YO 2O8BA 1SS6A 2SN3A 1BA0A 4Y1DA 2KFNA 3CFOA 3QEWA 3G25A 4FWSA 4LF9K 4H5WA 3Q7CA 4ISGA 1UGLA 3QDKA 3VQDA 2OPSA 3ID6A 1U49A 3AARA 1NPIA 4CD1A 3RTVA 4I7FA 2HHSA 4AH9A 4HUEA 3QEIA 4IWVA 2E88A 3O3FA 5AFUA 4KTZA 1Q81O 2UXDK 2A42A 4JN4A 3HSTB 1U04A 3ZSOA 3DXKA 2P9PB 1E4GT 4QS7A 3IDHA 3J7YP 2XRIA 4KYPA 1S1VA 4E7HA 4CFDA 3KWIA 4B3OA 5JENA 4OPAA 1VNAA 1DTQA 2GX9A 1B92A 4IFYA 3UKUA 3U4LA 1VQ6N 1OMYA 3MN5A 4IDKA 3ZX3A 4AHRA 2HNDA 2E3GA 3SQ2A 4B3MK 3VTHA 3VQQA 4DS4A 4BRMA 2K35A 1RDWX 2W6LA 3A5NC 1JLQA 4K0KK 3UKRB 3D2EB 1T8EA 2PFUA 1Z6RA 4JD2B 4JI7K 2O8EB 1T6DA 1HNVA 3F5TA 4UQGA 2D5RA 4CJKA 1CXQA 3QBXA 4KH5A 4KBOA 4GV3A 3AVMA 4H5NA 2GTDA 2A7TA 3VQEA 3LP1A 4BWJA 1NJYA 3D2FB 5FPMA 1NK8A 1XHXA 3MN9A 2G8IA 4LSNA 5BN9A 4YOUA 5HRSA 4LH5A 2HSTA 2P9SA 3DOLA 4BR9A 4NCBA 1KAZA 1TGOA 3RMDA 1C55A 4BRAA 3OS0A 3PV8A 2HNYA 2M8BB 5BR8K 2HVHA 4E3SA 4CGFA 2D0OA 3E9OA 4XIUA 3KK2A 1NMDA 3D6RA 4CFAA 4EZ6A 3CCEN 2I7PA 2P5GA 1EKEA 3SMSA 4JKGA 4XH5A 3VQ6A 4DQIA 1TK8A 1OH6A 4EFHA 2Q97A 1RTDA 1J6ZA 3CETA 4CIEA 2QKKA 2FBTA 2CH5A 2HHHK 2OTLN 1BI4B 3A5LC 4FJGA 1TYQB 2YEOA 1QS4A 3O4WA 3O8MA 2B68A 4U67L 3MEDA 2LN8A 5C25A 3WXIA 4BRQA 3AVGA 4JKFA 4DCHA 1QSLA 1LQHA 4B8AB 3RVCA 4M45A 4OLAA 1LWCA 3AAPA 4QOZB 1RT7A 2GV9A 4M3RA 1W9HA 1SKSA 2P1JA 4EHUA 3GDQA 3ULEB 3A5OC 2EX3A 1BA1A 1XNRK 3NH2A 1KAXA 3OYDA 2VGNA 4G1QA 4X64K 2NY8X 4B9LA 4E89A 4CZJA 1PTXA 3THXB 3FZHA 1JLAA 4H0XB 3S5TA 3A8YA 4BG8A 4E7LA 3SI6A 2NRVA 3AO1A 3PLAA 1VK0A 1S9EA 4BGAA 5GIPA 4JEPA 2QKBA 2VWKA 2VQFK 4OLBA 2HHTA 4I2PA 1KVAA 5KQDA 3NCIA 4M63C 4OKKA 4BR7A 2GUPA 4GKJK 3DJCA 1S1WA 4CJ3A 3VEWA 4F8RA 5E26A 1HYVA 5HROA 3F9KA 2QWLA 1I94K 4KHYA 3KOXA 4B1WB 5D3GA 3IG1A 3VEXA 5M1KA 2A3ZA 3ZETA 4FJ5A 1HQUA 5LMNK 3NGIA 4PQUA 2Z1IA 5J2NA 4W5NA 4GV6A 5AJ3K 3W0LA 2AA4A 4CI6A 1NKCA 2HF4A 3CYMA 4JI4K 1VSEA 3BF1A 4I2QA 3WQTA 3SPZA 1Z26A 4CJTA 4PHTX 1OKJA 3VQ7A 2YIPA 3U3YA 2OA8A 1KFDA 5HP1A 3SMPA 3IAYA 3CC4N 1JL2A 3NF7A 1X9JA 4G9ZA 1HUXA 4J8FA 2PBDA 2MZ0A 3H1VX 2GL1A 4FJXA 1ZBHA 4LF6K 4Q0BA 1C6VA 2GWKA 4FWQA 4CHZA 4ELVA 4DQ8A 4C8KA 3CQXA 3OTOK 3EZ5A 4ELUA 2NLXA 4JI8K 2QTDA 2BE2A 2O8CA 2KJAA 2FBVA 1YXQA 2A1SA 4DR3K 4IFVA 4KI6A 4E7KA 1O13A 3TR8A 5BPMA 4DV0K 2NNWA 1IKVA 3HSCA 1VSKA 1TUYA 3VF4A 3R2VA 1K8KB 3IKMA 1JLBA 1D9DA 3CJBA 3LZIA 1JZAA 3O6WA 4K8XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FZF A;  4CJ5 A;  2DTU A;  5T7B A;  1BL3 A;  5FDL A;  4BWM A;  4B08 A;  5ELZ A;  2QWM A;  3CJC A;  4YDU C;  4CJQ A;  2P9L B;  1T05 A;  1NGG A;  2E2N A;  4CJE A;  4W5Q A;  4E72 A;  2QWR A;  4X65 K;  1R0A A;  4BRG A;  2F9T A;  2Q36 A;  4KTQ A;  4DTO A;  1NRB A;  1RTJ A;  1W2B M;  2P9I A;  1M1K O;  3HJF A;  3BZK A;  3L3V A;  1RBS A;  3VQ5 A;  3MXM A;  3OW2 M;  4FWR A;  4DTN A;  4K43 A;  3TTC A;  3ZSX A;  4UJ0 A;  5KPZ A;  2B6A A;  4FWP A;  4IOX A;  1XMO K;  3WXM B;  3DLK A;  3AAQ A;  2N2R A;  1Q18 A;  3O80 A;  4FLY A;  2A1R A;  3EO3 A;  3I33 A;  4CES A;  5M1N A;  1SL1 A;  4LC9 B;  3IMX A;  4CHO A;  1NGF A;  4ISF A;  1WUA A;  5C2F A;  3NFA A;  5IT9 O;  2HHQ A;  4YOY A;  2OPQ A;  1T7A A;  4WQ5 A;  3VQP A;  3CC7 N;  1X9S A;  3O4N A;  1Y97 A;  3F2K A;  3A2F A;  3U9D A;  5FPN A;  3PIO L;  4FZZ A;  5TKY A;  3PX4 A;  1K8B A;  3SUO A;  5LY3 A;  3AO4 A;  3OA9 A;  1JKZ A;  4CEE A;  1TVR A;  2WON A;  2ZJP L;  1NK9 A;  2ZQB A;  3OS1 A;  3O4Q A;  4QS8 A;  1QHA A;  1FW6 A;  4CEB A;  2XY8 A;  1N32 K;  3VGL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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