1RBTA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADGKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
molecule keywords RIBONUCLEASE H
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 53
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbtA00
4CEEA 1RT6A 3CM6A 3ZSWA 3VQBA 1Q9XA 4FJ7A 3HP9A 3QLHA 3VQQA 3PO5A 4KHWA 4PQUA 1RNHA 3LAKA 3T19A 2XO7A 3AVGA 4IFVA 4PWDA 4FZZA 1RDDA 3I8DA 1LAWA 1B9FA 2RPIA 5I42A 2OPRA 2DFHA 2DY4A 1RTIA 4Y1CA 3QEIA 4W5NA 3NFAA 4KI6A 1ITGA 3HPOA 2KQ2A 4DTMA 2XY6A 4KTZA 3AVCA 1JL2A 4CF1A 4CHPA 1TK8A 4M3YA 4RW6A 3KIOA 2AJQA 4MQ3A 4DF8A 1JLGA 1VSIA 2QKKA 4CEOA 4HTUA 2XY7A 1S1UA 1LWCA 4NYNA 3P1GA 4BE2A 4CHYA 4ID5A 1ZBHA 1TGOA 4KV8A 4HUFA 4M45A 2Z1JA 4FLWA 4DSLA 4E7LA 4CFDA 4DSKA 4I9LA 3EZ5A 4DTNA 2D5RA 3TAQA 4FJKA 5HRSA 3NE6A 2OZMA 4FK2A 3HSTB 3KK3A 3VQ8A 1ASWA 3O3HA 4CEQA 4W5TA 4B9VA 4IFYA 1L3TA 3OYIA 2DTUA 5CZ2A 3ITHA 4E7IA 2X6NA 3PO4A 4F3OA 4OLBA 1LW2A 4OVLA 4KPYA 2OPSA 1C1CA 1VRUA 2Z1IA 4LY7A 3C6TA 4AHRA 4DS5A 2Y1IA 3BDPA 3OS0A 1J53A 1NK7A 1TV6A 3KLGA 2Z1GA 3SQ1A 1JL1A 5JS1A 1BHLA 3QEPA 3AVFA 4B9MA 3I0SA 1HRHA 3VQ5A 3CFPA 3V6DA 3L3VA 4FK0A 4E89A 2VWJA 1NK0A 4F8RA 1U47A 3T1AA 2HHUA 3DLHA 3L2RA 3SV4A 3KLEA 1I39A 1KSPA 1TAUA 1LWFA 1UA0A 1L3UA 2X78A 1WSJA 4DLGA 4EZ6A 2G8IA 1KFDA 4F4KA 1QHTA 1RT3A 2HW3A 3OYAA 2P5OA 3QO9A 4ID1A 4FM0A 4DU1A 1C1BA 3QNOA 4CF0A 3SJJA 3NF9A 4CHQA 2RF2A 3OYKA 3RRHA 4CFCA 2A1RA 1SKRA 1EXQA 1RDCA 1BCMA 1UAXA 1ASUA 1G15A 3SPZA 4IDKA 4LSNA 4E7HA 1LW0A 4CGJA 1X9WA 3LZJA 1SL1A 1REVA 1BQNA 1S1XA 4CECA 4QAGA 4W5OA 3PX4A 2G8KA 4AHVA 3ZT2A 4O55A 1U04A 5FROA 4Z4FA 1CXUA 1WSFA 4BWMA 2KFNA 5CYMA 1NJZA 1RDAA 5HLFA 1ZYQA 3KD1E 4J2BA 4QCLA 4KTWA 1RT4A 3KLHA 4KI4A 3ZSOA 1S9EA 5KGWA 5J2QA 5E41A 5C24A 3SPYA 3U3GA 3KK1A 2FBXA 4OLAA 1KVAA 4Z4EA 1HYSA 4CFBA 4DSIA 3TANA 3NBPA 3OJSA 2PYLA 3OY9A 4M3TA 1KVBA 4B9NA 3CFRA 1ZBIA 4O5BA 3AA3A 3AVAA 4H4MA 1VSEA 3O3GA 3C95A 1N6QA 2D0AA 2W42A 1QTMA 1EKEA 1JLBA 3MXJA 5JS2A 4FM2A 4BACA 1HMVA 4KHQA 1TKTA 4HVJA 1JLCA 4FJXA 2P5GA 1QSLA 2OZSA 3KD5E 1B92A 2ZD1A 4B9TA 2BGGA 5KI6A 4FJMA 1S6PA 1VSDA 1BISA 2D0BA 3B6OA 3ISNC 5EU7A 3VQDA 2P51A 3AV9A 3ZT3A 3HP6A 4FXDA 3L8BA 4OJRA 3WNEA 3ZSYA 4PY5A 4CF8A 4DFKA 4I9QA 1HQUA 1VK0A 2Q3SA 2FBYA 4MFBA 1JLFA 4CK2A 4CK3A 1DTQA 2F8TA 2HHQA 4DFJA 3D45A 4C8OA 3PY8A 2BANA 2E4LA 4AHTA 3AVIA 4CHOA 4DQQA 4FJNA 3SQ2A 4DQIA 2B5JA 2EX3A 3DLGA 4C8LA 1VSHA 1VSJA 2A1SA 1C1AA 2XHBA 2G8HA 1BCOA 4JRPA 3M8QA 4GVMA 1RT7A 3KLFA 4BDPA 4HCBA 3U6FA 4AHUA 3KKRA 3TAEA 3OJUA 1O1WA 3AO3A 4DQRA 3AVBA 2BDPA 1L3SA 1KVCA 5HRNA 3PX0A 2FBTA 2YHAA 4O44A 3K59A 1YTAA 1KRPA 1C6VA 2DFFA 4CJFA 4PUOA 3DRSA 4BDYA 2E6LA 3V9SA 3LAMA 4Z0UA 4C8MA 1NK4A 2HNZA 1WNSA 2HNDA 1WSHA 4XIUA 5J2NA 3VQ6A 3CG7A 3E01A 1WSIA 1IKYA 3OYFA 2B6AA 3SV3A 4M3ZA 4K8ZA 5CY4A 4N41A 2BE2A 3DLRA 2IDOA 3V1QA 3ZSZA 4CIEA 3L2VA 2IOCA 4IBNA 2HB5A 1JLQA 3LP3A 3S9HA 1CXQA 2B4JA 2EHGA 4B8AB 3VA3A 4OPKA 3NAEA 1SV5A 4ELTA 4B3OA 4QOZB 4GMJB 3LDSA 4O4GA 3RMBA 2O4GA 4OKEA 3HPHA 4CGHA 1TKZA 3M8PA 4E1MA 1TK0A 1IG9A 3HL8A 4W5QA 5SZTA 2LSNA 4CESA 4OPJA 4FJHA 4KHYA 2G8UA 3ZCMA 5J1EA 3V9ZA 1SL0A 3VQAA 3G10A 4RW9A 3ASMA 5HP1A 4F2RA 2R7YA 5FRNA 2G8FA 5K14A 1X9MA 1ASVA 1BIZA 1LWEA 4CJSA 1ZBUA 2RKIA 1RBUA 1RBSA 3MECA 3VQCA 3V9UA 1XC9A 2ETJA 1NKBA 3MAQA 4NCAA 3OYHA 2YV0X 3DLEA 3EY1A 4RG8A 4BWJA 3SZ2A 4ICLA 4KREA 4CEBA 4CJUA 4CEZA 4DTRA 2FBVA 1NJWA 1SKSA 3DM2A 1KFSA 4FLZA 3OYDA 1QE1A 3MEDA 1A5XA 4GW6A 1I3AA 1SL2A 1J5OA 1UOCA 4CJPA 3NHGA 1RTHA 1YTUA 5SWMA 1NOZA 1K6YA 4CGGA 4CJWA 3SNNA 1DLOA 3FFIA 2OPQA 3LPTA 3LANA 4IG3A 3MXMA 4DTOA 1NKEA 3K5OA 2OPPA 3AO2A 3TAPA 1GOAA 4I7FA 1WN7A 1JXEA 4JS5A 3RMAA 1HQEA 1D8YA 2QK9A 3C6UA 1Z25A 3ZSQA 3LP0A 1LV5A 2YKNA 5HROA 3HK2A 2G8WA 3WNHA 4R5PA 1TAQA 4J2DA 1NJXA 4CJ3A 4HUEA 3RRGA 3V9WA 4DQPA 4E1NA 4RW4A 3AVKA 2KZMA 4CEFA 3KJVA 2IAJA 5T7BA 3OYLA 4Z4IA 1W9HA 4DG1A 4AH9A 4FW2A 4O0IA 1ZBLA 4DFMA 1FKOA 3OYBA 1BGXT 2GUIA 4YNQA 4FJGA 1TL3A 1Q8IA 3RR7A 1N5YA 4Q0BA 2QXFA 3DOKA 4FJ5A 4C8NA 3LWLA 5D3GA 4F2SA 4KB1A 3JYTA 3RTVA 4LH4A 4BDZA 4LD0A 4KHUA 3L2UA 3K5LA 2ITGA 4LH5A 3VQ7A 3IAYA 4FZXC 3SUOA 3V1RA 2ZQBA 1UWBA 1NJYA 2VG7A 3BGRA 3QINA 4DSFA 2VWKA 3NH0A 4NCBA 4N56A 1RBRA 2KZZA 4CHNA 3VQ9A 4CERA 1JLEA 3KKSA 4B08A 4B9LA 1TKXA 3DI6A 4DTXA 3S3MA 3LWMA 1F21A 1HPZA 5HRRA 1WSEA 3L2WA 1CZ9A 3QESA 4LSLA 3O3FA 4DQSA 4OKJA 1W0HA 2GBZA 3AVJA 4JLHA 4N76A 4FM1A 2VG6A 4CJ5A 1RT1A 5DK5A 4CJEA 1S6QA 3HPGA 1X1PA 4Z4CA 4FLVA 1IKVA 3PV8A 4CK1A 4DTSA 1L3VA 3V4IA 3RR8A 4KAZA 4FJJA 3NGYA 5FRMA 4Q5VA 4RW7A 3DOLA 4FCYA 1RBVA 3LPUA 1Q9YA 1U4BA 1NK8A 3OS1A 1S1TA 4DTUA 3A2FA 3NH2A 4CGDA 4Z4GA 1QSSA 5HBMA 4KO0A 3TR8A 2PZSA 2PY5A 3OVNA 4CJVA 4EP4A 3UIQA 3QERA 2FC0A 4N47A 2HHXA 2HHVA 1BQMA 3ZSRA 3S3OA 1VSLA 3SCXA 1IKXA 1TVRA 4CJRA 3AA2A 3U3YA 1T8EA 1HYZA 1RILA 3ZT1A 3LZIA 1U45A 1IKWA 1KLMA 4CJKA 3D0PA 1WSGA 4ZHRA 2YNGA 4DSJA 1U48A 2KW4A 2RN2A 3K5NA 4FLTA 3AO1A 4M42A 1JKHA 3THVA 4CJQA 4HHTA 4DFPA 2P1JA 2ATQA 1X9SA 4O0JA 3KTQA 1C0UA 3PX6A 1RT2A 3NCIA 2HVHA 3QEWA 3L2QA 2Y1JA 3AO4A 4CEAA 3OYJA 1HYVA 1TL1A 1RT5A 4CE9A 1KTQA 4KTQA 2YNIA 4CHZA 3OYCA 3TARA 3CYMA 4ZTFA 1TKDA 1QSYA 1WAFA 3CQ8A 4E7JA 1A5VA 4RW8A 5CZ1A 4DU4A 4KB0A 2XRIA 2X74A 4DLEA 2GV9A 3AVNA 4TSXA 1BI4A 4K8XA 4FLYA 3S3NA 4CJLA 4FZYA 4NCGA 4H8KA 3SUNA 3M8SA 4DSEA 1LAVA 4EP5A 3SYZA 4DTJA 3QETA 3JSMA 1Y97A 4E3SA 4L8RB 4DU3A 2ZE2A 3I0RA 5KGXA 1CLQA 4CIFA 5KRTA 4FLUA 3KK2A 3SI6A 1T05A 1NKCA 2F96A 2PYJA 4E19A 3IG1A 3LP2A 1FXXA 1HJRA 3OYMA 3TAGA 3HVRA 3SQ4A 1SKWA 2E6MA 3OS2A 3HT3A 4JS4A 3DMJA 4E0DA 2I5JA 3LALA 3VQEA 4CGFA 5HRPA 4G1QA 1HNVA 1XI1A 1BI4B 2XY8A 5DMRA 4C8KA 4CF2A 5J2PA 1J9AA 3QEVA 1QS4A 4CJ4A 3O4QA 1SUQA 2Z1HA 2G8VA 2HMIA 3AA5X 1FK9A 3G0ZA 3KLIA 4Z4HA 2VG5A 1RBTA 3AVHA 1EETA 2YNFA 4KHSA 3AVLA 2JGUA 3CM5A 4Y1DA 3O4NA 3C94A 4CF9A 1RTDA 3OYGA 4DTPA 1S1WA 3B6PA 1KLNA 2DFEA 1DTTA 1B9DA 4CJTA 4BE0A 4AILC 4W5RA 3VQPA 1S5JA 2IC3A 4ELVA 3MEGA 3DRPA 1EP4A 4HCCA 3H08A 1RCHA 1NK9A 1NK6A 4M3UA 1RTJA 3K2PA 4OGCA 1YT3A 3PUFA 4F3TA 4NYFA 2KFZA 3ALYA 1VSMA 3AVMA 3K5MA 4CCHA 3HYFA 3MXIA 1L5UA 4I2QA 2KTQA 3V9XA 4AHSA 1GOCA 2X6SA 3HM9A 2HNYA 3SQ0A 2HHSA 3RWUA 4CEDA 4E7KA 5C25A 1NK5A 3QIPA 1BIUA 3RMCA 3DYAA 4JRQA 4YFUA 4M3WA 3SUPA 5FDLA 1S1VA 3VQ4A 1XWLA 1WAJA 3QEXA 3ULDA 4ELUA 1Z26A 4OGEA 4FJIA 1J54A 1D9DA 2F8SA 3M8RA 2QKBA 3HO1A 3T3FA 4KHNA 1D9FA 4KFBA 3NDKA 1GOBA 4DWIA 1FKPA 3QNNA 3F73A 1VRTA 4BE1A 5KTQA 4CGIA 5KRSA 2XY5A 1NOYA 3OYNA 4FYDA 3MEEA 3NGIA 4DF4A 2HHWA 2YKMA 3HVTA 1MU2A 4DMNA 3AA4A 1XHZA 4PA1A 3ZSXA 4AHCA 3K58A 4UQGA 3LP1A 4KKOA 3TAMA 3TABA 1KCFA 4J2AA 4OKKA 3L3UA 1WLJA 3NGZA 3TI0A 4J2EA 2IS3A 3IRXA 2YNHA 3P5JA 3NF8A 3F9KA 3WNGA 3ZSVA 3OYEA 4B9SA 2HVIA 3IS9A 2OYQA 2NUBA 2HHTA 1VSKA 1TK5A 4CFAA 2JLEA 2WONA 4FLXA 5I3UA 1D5AA 3TWHA 1IH7A 2WOMA 1T03A 3NF6A 4WE1A 3NH1A 1YVUA 1C0MA 5J2MA 1XHXA 3SUQA 1CZBA 3HJFA 4FJ8A 3AO5A 1UA1A 4M3XA 3VN5A 1RDBA 4B9UA 3DLKA 4B8CA 4CIGA 3V1OA 4IKFA 1ZBFA 1T7PA 1HNIA 1BL3A 1QQCA 4HUGA 4KRFA 3QIOA 3V81A 4DS4A 5CYQA 1JXBA 3CFOA 3DRRA 3VA0A 1EX4A 3DLBA 4FVMA 3P83D 4ZTJA 1U49A 4FJLA 4H4OA 3NF7A 4FJ9A 1S9GA 1C0TA 4I2PA 4M41A 1A5WA 3WNFA 3HXMA 3ZT4A 3EYZA 1R0AA 4N5SA 3RMDA 4M3RA 4IG0A 2YHBA 2O4IA 2IGIA 4FK4A 1VSFA 1IO2A 4EZ9A 3ZT0A 4FW1A 3K57A 2D0CA 2OA8A 1JLAA 3TAFA 5C42A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGJA 3CM6A 4FJ7A 2VGNA 3HP9A 3PO5A 1RNHA 3LAKA 3AVGA 1R59O 1MWMA 1RDDA 2QWOA 3VMFB 1LAWA 3THYB 3DAWA 2OPRA 2DY4A 2QW9A 3I33A 3RSEB 4DKWA 4RW6A 4CZGA 1JLGA 1BA0A 3LL3A 3P1GA 4I6MA 1TGOA 3LDNA 4M45A 1KC8O 5AJ3K 4DSKA 4I9LA 5HRSA 5DM6L 3GL1A 4DR1K 1ASWA 3CJAA 1L3TA 2DTUA 2D4WA 1IV0A 2X6NA 4F3OA 1VRUA 3CMEN 3C6TA 3VTHA 3CCQN 3BDPA 3O9QA 3KLGA 4G9ZA 4I6MB 1JL1A 4L3QA 3I0SA 1HRHA 2NRRA 3L3VA 1NK0A 4F8RA 4LF7K 5TKWA 3L2RA 3M3ZA 1TAUA 4KHPK 2WUSA 2X78A 1L3UA 3LDQA 5C2DA 4AM6A 3OYAA 2P5OA 3QO9A 4CHQA 4CJ7A 1RDCA 5FPNA 1QVGM 3LZJA 1SL1A 4W5OA 3PX4A 5FROA 3G6EN 1CXUA 3K0SA 4HWIA 1NJZA 1RDAA 3BUZB 3T7ZA 4KTWA 1RT4A 3CCEN 4GY2B 5KGWA 2E88A 4B1UB 4GKJK 3SPYA 3U3GA 3KK1A 4FWSA 2OTLN 4OLAA 3WXIA 3P4IA 3NBPA 3I8BA 2PYLA 4JYAK 3R3LA 4PHTX 1WBBA 3AVAA 4H4MA 1VSEA 3O3GA 1N6QA 3MXJA 4KHQA 4JI8K 3E1YA 1H1VA 4LFAK 3SAFA 1S6PA 3VQDA 5TKYA 1KD1O 4GKKK 3HP6A 3FZHA 4PKIA 4I9QA 1VK0A 2IVNA 4MFBA 4CK2A 1DTQA 4DV6K 1S72N 3U8XA 2HHQA 2BANA 2E4LA 4AHTA 4FJNA 3SQ2A 1K73O 1HKGA 3WQUA 1TYQA 3DLGA 3MN6A 2A1SA 1HPMA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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