3CC4N

Co-crystal structure of anisomycin bound to the 50s ribosomal subunit
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cc4N00
4IO9L 1M90O 1VQMN 4WCEL 1Q7YO 1VQ8N 5HL7L 2QEXN 5JVGL 2ZJPL 3CCEN 5GADP 3CCLN 3CCSN 4UY8O 1K73O 5DM6L 1Q86O 5JVHL 2ZJQL 1YITN 1YJNN 5GAHP 3CCUN 4U67L 3G4SN 2QA4N 1VQ9N 1VQLN 1M1KO 1N8RO 3CCRN 1W2BM 2ZJRL 2OTLN 1VQPN 4WFBL 4WFAL 1YJ9N 1Q82O 3CXCM 1Q81O 1VQ7N 5GAGP 3PIOL 3PIPL 1YHQN 3CF5L 1OVYA 1KQSM 3CMEN 2OTJN 1QVGM 1K8AO 3CCMN 4IOAL 1VQ5N 1KD1O 3CC7N 3G6EN 3DLLL 1VQ4N 1YJWN 1NJIO 3OW2M 1QVFM 1ILYA 5DM7L 3CMAN 3G71N 3J7ZO 3CCJN 1S72N 5H1SQ 3CC4N 1VQ6N 3I55N 4WFNL 1VQKN 3I56N 4WF9L 3CD6N 5MLCQ 3CCVN 1K9MO 5GAEP 3CPWM 1KC8O 3CC2N 4IOCL 1VQON 1YIJN 1JJ2M 1VQNN 3CCQN 1YI2N
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M3ZA 4J2DA 2A40A 3QINA 5AZIA 4C8NA 1HX1A 4N47A 4CEQA 4BRDA 3AGRA 2QTDA 4KAZA 2VWJA 1T3VA 4NCBA 4DU1A 1XMOK 3ULEA 2W41A 3AY9A 1N33K 5C2DA 4DQIA 1YXQA 4LSLA 4BROA 3NBPA 1C1CA 2G8FA 3A0IX 4CEOA 1QSLA 4B9SA 3VF6A 2Q0RA 1ATSA 3TSPA 1BG3A 4C8OA 4FOIA 2HNYA 2KHOA 4R79A 3G4SN 1OVQA 1N32K 3AVGA 4E1MA 3KKSA 4B9UA 3DWLA 4BQLA 3WNGA 4M7YA 2E20A 1JLEA 4H0YB 5AQXA 3CXCM 3KLEA 3LDLA 5LJVA 4ELVA 3ZEUB 5C25A 3H3NO 3M1FA 4BRAA 4BR5A 4FJXA 4PUOA 4CJ7A 3P31A 3A5OC 4IOAL 1S6PA 1EO1A 5CR4A 3CJ7A 3FGUA 1XC3A 3P39A 4BE2A 4KTWA 3OS0A 5GIPA 2YCHA 1NK5A 4FJLA 4ID1A 4DB3A 3QO9A 3CJCA 4EFHA 3CMAN 3BZKA 5CYMA 1KCFA 1MDUB 2IS3A 5CY4A 3NGIA 2GWJA 4PL8A 5F0XA 2E8AA 5AQMA 4GVMA 1ZBIA 3KD1E 1IJJA 3OVNA 2Z1JA 4JK7A 2P9NA 1BQNA 3F73A 1TL3A 3AO1A 3AO4A 3CETA 3I8BA 3OYFA 4CIFA 3THYA 3SI6A 2VG7A 5LJWA 2G8UA 4Z4IA 4KH4A 1QHAA 3MXJA 3LDNA 4BRPA 4WCEL 3TANA 1N36K 1HKGA 1L3UA 1UA0A 2AA4A 5AQLA 3MXIA 4DLGA 4XH1A 3TR8A 4JKGB 1S5JA 4CJKA 5M1FA 3QNNA 4LF5K 4CBWA 1ZXOA 3B8AX 3P38A 5AQQA 4RWTA 1OH6A 4KHNA 1RT2A 1WSHA 1K73O 3O3GA 4CD3A 4B1ZA 3RSEB 3ZT3A 5AZJA 3SAHA 4PWDA 2ZJQL 5C24A 1KVCA 4BR4A 4BRKA 3M8QA 4KHQA 2HHVA 4U67L 4OPHA 1VSLA 2F96A 2HHSA 2P9IB 1HLUA 1J54A 4PY5A 1BO5O 3PSIA 5FPEA 2O8CB 4HHTA 3VENA 1CXUA 2E2PA 4WFAL 3RRHA 2E5LK 3GE1A 3DLEA 3M8RA 4XH4A 3ZT0A 3MMVA 3WEEA 1BIUA 4BR7A 3TPQA 1SAZA 3O5BA 3JXUA 3L2WA 3IAYA 4G1QA 2Z1IA 1VRUA 3K57A 3HOSA 1VQ5N 4JS4A 2NLXA 3MN5A 4LFAK 2HNZA 1VQ4N 4EIAA 2UXDK 2GELA 3J7AP 4YDUA 4GKJK 2NZTA 2V7YA 3KK7A 2KTQA 4CGHA 2HW3A 2IAJA 3CPEA 1NGFA 2UUBK 2UXCK 3NDKA 4C23A 4JI7K 1XNRK 3QBXA 3WXMB 4RW4A 2RN2A 2BE2A 1KSPA 1DKGD 3HL8A 2KLAA 5C15A 4I6MA 2UUCK 2FBVA 4DTSA 3VEYA 3AVJA 4IFYA 3MAQA 2KFNA 4M42A 3OYMA 3UKUB 3VQQA 4DV5K 2E2OA 3FZLA 2KQ2A 1VSHA 4NB4A 5CYQA 1X9WA 1Q7YO 3IG1A 4CHYA 3TARA 1XUPO 3HSCA 1HJOA 3W0LA 3MEEA 5KPZA 4JS5A 3D45A 2WONA 4BRHA 4B9TA 3CHWA 3ZX2A 5DK5A 3V9UA 5DM6L 4XH5A 4ISEA 1NK4A 4LH5A 3VN5A 3U6FA 3PY8A 2E1ZA 4DV1K 3B6PA 3C6HA 1NKEA 5AQOA 3VETA 2PFUA 4O8UA 3BUZB 4CHOA 1NWKA 1HNZK 5BREA 4F9OA 4CJ3A 1Q9YA 4KPYA 2ZGYA 1S1WA 3GL1A 3V9XA 1W2BM 4LF8K 4JEPA 4C8LA 4DR5K 4H0PA 1GLDG 1J5EK 1TAUA 5J2QA 2QW9A 1YJ9N 1Q82O 1VAZA 3MEGA 3ASMA 1HYVA 3DXMB 3PIPL 3I8DA 3E01A 3JYTA 2HNDA 2IVOA 4IOXA 3HTVA 1J6ZA 4FVUA 1HNVA 1KQSM 1BIZA 1S1XA 3ZT1A 1WOQA 2R7YA 4LF4K 3BF3A 2QWRA 1RCHA 1RTDA 1ATRA 3EL2A 4B8AB 4EP4A 3G6EN 3JS6A 1JKHA 5BPLA 4DF4A 3EE8A 5AJ3K 4HTUA 4Z94A 2V51B 3D2EB 4X62K 3J81O 4CEDA 3OYEA 3K5NA 1U04A 4DR4K 3SYZA 3DM2A 1OH7A 5SWMA 3HO1A 1KAZA 4MLHA 3SUPA 5J2NA 3NH2A 4A61A 4IOCL 2HVHA 1YIJN 1VQNN 1D9DA 3LL3A 5E26A 1XQSC 1D8YA 3BY5A 3ZSVA 1SL2A 4CEFA 1X3MA 2E88A 4DHYA 5AQNA 1SZ2A 1HNXK 1LW0A 1VQ8N 3FFKB 2QEXN 4FJHA 4CIEA 4DR7K 3CFRA 5BR8K 3L2VA 3QLHA 3CCLN 3T1AA 3P4IA 3VEOA 2CH5A 1EX4A 2Q97A 4CJTA 3ZSRA 3D2FB 2XHBA 1EQYA 4JKDA 1VSIA 5GAHP 5JICA 4TSXA 4DV6K 4BE0A 3FZMA 4O5FA 5M1QA 2B5JA 4HUEA 3RR8A 1VQLN 4XEIA 4DLEA 4CCHA 3Q7CA 3PX6A 3THXA 4FOEA 1NMNA 3HBTA 3TSQA 1TGOA 3QETA 3DXKB 1KTQA 4OX9K 4JI6K 3E9PA 4H0OA 1W0HA 3C7NB 1TYQA 2XY8A 1T44A 4HWIA 3WNFA 3SMPA 2FSKA 4KHYA 4DTPA 3HI0A 2YNGA 1GLEG 4M63C 4ZTFA 2BH1A 3CF5L 1LWCA 3LDPA 4DV0K 3T69A 3PO4A 1KAXA 2WC9A 4PKGA 2OTJN 4RCHA 2BDPA 4DUYK 2KKZA 2D4WA 5I3UA 2P5OA 1Z25A 4ELTA 1VRTA 4CZFA 5FPMA 3EZ5A 1DT9A 4IFEA 4J2AA 1YTUA 3NH0A 4BG8A 2ZE2A 4JYAK 4CEZA 5M1KA 4B8CA 4CFCA 4OGCA 3TAEA 1YVUA 2NRXA 3HPHA 4E7JA 3ENOA 2P9PA 1FW6A 3ZT4A 3KZBA 1WSIA 2Z1HA 4BG9A 4FLWA 5BN9A 4Y1DA 1G99A 3IS9A 3ULEB 3L3UA 5KRTA 2ZWHA 3VEWA 1JCEA 1SQKA 4NXNK 4ILGB 3R3LA 5JVGL 4UQGA 2BUPA 1SUQA 2IIRA 4O4GA 1YF5L 2A42A 3SK3A 3SPZA 4FWMA 1LW2A 3VF4A 5EOYA 1NLVA 4K42A 3T19A 1ZBFA 4B3OA 4CK1A 3H08A 1HKCA 4CGJA 3S41A 4DQSA 3FZKA 3OBYA 3OS1A 1P90A 3HZ6A 1X9JA 4FWPA 4DU4A 1M1KO 4IG3A 5T7BA 3VPZA 1TK8A 4JI3K 3CCRN 2HB5A 3QIPA 1HRHA 1VQPN 4KREA 3SPYA 2QWLA 5M1PA 5AQYA 4DTOA 3VEVA 2F4VK 3SNNA 4LC9B 1RT6A 4FPAA 4BRGA 3VA3A 1BHLA 4FLYA 2HBLA 5KPTA 5AQHA 3OY9A 4JN4A 5LMUK 1L5UA 3AVHA 3WXIA 4DV3K 1RT4A 3C6AA 3K9JA 1RILA 4OO1J 2O8EA 3DLBA 2VG5A 1XHXA 2A5XA 3BF1A 3N4PA 3LDQA 5BN8A 5HBMA 4FM2A 1KLMA 1U48A 4F3OA 1QQNA 3HVTA 4E19A 2IDOA 2P9SA 1LOTB 1ZBUA 2BANA 4AM6A 3BEXA 4Q5VA 2OPQA 5JS2A 3ZETA 3U3GA 4A59A 3THYB 2HMIA 4FM1A 2OZSA 2RE2A 2A41A 1YT3A 3IDHA 5BPMA 2QXFA 4A5AA 3TU5A 3UIQA 1NOZA 4H0TB 3DMJA 2PY5A 1RT1A 3CPWM 1TKZA 1FKPA 3SAFA 1NJYA 3DYAA 4YORA 4QCLA 5KI6A 1O1WA 4CJRA 3M8SA 4FJ7A 2KZMA 1IBLK 3LP1A 4CD1A 3RTVA 5BRHA 2PYJA 3PO5A 4BGAA 5FROA 3CIPA 2UXBK 1U6ZA 3KJVA 4BREA 5AZJB 3V1QA 4AQYK 1Q8IA 4AILC 4B3SK 1HKBA 1QSSA 4W5NA 2Q1NA 4PKIA 3VQPA 2Y1JA 3C65A 1QQMA 3ZSWA 1SL1A 1LAWA 3OYKA 1Z26A 2UU9K 3TAFA 2VWKA 1BWFO 3EKSA 3S3MA 2I7PA 1BOTO 1C0GA 1U2VA 3NF7A 3EYZA 5HP1A 3NMUA 3E9LA 3MEDA 3LANA 3QEXA 2A3ZA 2D0BA 3WXJA 3OS2A 3OYNA 3AVKA 1NGHA 3A5NC 3WEEB 4JI1K 3BDPA 5AQIA 4CGDA 4FZYA 4MQ3A 3DLHA 4N56A 1K6YA 1JLAA 4O0IA 2X74A 1RDDA 3MCPA 2P5GA 4F2SA 2D0AA 2HHTA 4JI4K 4AHUA 4E3SA 4V19S 4W5OA 1QHTA 3TAGA 1D5AA 2HF3A 3P83D 3J8AA 4CVNE 1RTJA 3MN7A 5JMVA 2F9WA 1QE1A 3R8EA 4RW8A 2XY6A 4Q0BA 1NOYA 1ILYA 4OJRA 3AVFA 3NVMA 4CJFA 1RDWX 3CERA 4I6MB 4JD2A 2PZSA 4BRLA 3SCXA 2GV9A 3CFPA 4MLEA 5AQZA 3MN6A 2F9TA 2OZMA 3DLKA 5CHIA 4RW6A 4BGBA 1TUUA 4KRFA 1LAVA 3OJUA 4F8RA 1ASUA 1M90O 2P51A 3DOKA 1UWBA 1GLAG 3IKMA 2P9KA 4FYDA 1LWEA 1HQEA 2Q0UA 2W42A 5AQGA 2E6MA 1EXQA 1S1UA 4BWMA 3CJ9A 4QAGA 4DTMA 4CZIA 4YY3K 3DRPA 3H3OB 2Z1GA 2GUPA 2FSJA 1JXBA 2VG6A 1U4BA 5M1OA 1YTAA 3H46O 5KQDA 2OA8A 2AJQA 3AVLA 5KGWA 3SV4A 3CI5A 1ASVA 1FXXA 4CEBA 2DY4A 2IVPA 2ZD1A 3U4LA 1IG8A 1XWLA 4JK8A 4CHZA 4FK2A 2WTUA 2FXUA 5CZ2A 5FLXO 4NO7A 5HRPA 4OVLA 3QIOA 1MA9B 4WFBL 3E66A 3H1VX 3CQXA 3HM8A 4E1NA 3RMAA 5C2FA 1TV6A 3FLCO 1Q81O 4N41A 1KFDA 1BDGA 1DLOA 2DFEA 4CJUA 1W97L 4ELUA 4E7KA 2LSNA 4IJAA 3UKRA 2QI2A 3N4QA 2P9UA 3G25A 3CCMN 2WBNA 1NU0A 3RMDA 3AVAA 3HRGA 4QOZB 1NGDA 5KPRA 4GNIA 1R59O 4FL9A 4DQ8A 2O8BA 2A1SA 3KKRA 3QDKA 2I7NA 3VQ9A 1TK0A 4LFBK 3OYDA 5EVZA 3NF9A 4BRCA 4KHPK 3VQ6A 4AH9A 3TI0A 1A5XA 1FJGK 3LDSA 3HK2A 3TABA 4ISGA 3SLCA 5FRMA 3AVCA 1JCGA 1T6CA 3PV8A 4H5NA 5AQKA 4M3WA 3FZHA 1UOCA 2DFHA 3OYCA 3VGMA 3TTFA 3HJFA 4BRMA 3SBGA 4CZEA 3JSMA 4E7IA 1I94K 3SQ0A 1SKWA 3TSUA 1ATNA 4PA1A 3BP8A 2D0CA 1ZC6A 1WBBA 3VEXA 4ICLA 4FK4A 2YHWA 2GEMA 4DV7K 5FPNA 1Y97A 3GOIA 5AFUH 3O9UA 4NLBA 2XRIA 3MCAB 1TUYA 2F7TA 1REVA 1IO2A 3O80A 1WSFA 4K8ZA 5C0YA 1S6QA 3L8BA 4K25A 1GOAA 3THXB 1IKVA 3I0SA 4AHRA 3T1YK 4Y1CA 2QA4N 4WQ5C 1TYQB 4JKHA 4CJEA 3CQ8A 4HCCA 2NRRA 4H4MA 2FBTA 1DGKN 4KBOA 4EHTA 4DSJA 4IEIA 4A2BA 1IH7A 3CM5A 1SS6A 2RHKA 2ASMA 4HTLA 2ITMA 4XIUA 3O9TA 3DRSA 1WBDA 5BPNA 3PLAA 3A2FA 4W5RA 5DMRA 3VEZA 4H03B 4H8KA 3QEPA 3RRGA 1HJRA 2RF2A 1IKWA 3AA2A 4OLBA 1BISA 5LMNK 4A5BA 4CEEA 3LPTA 3G0ZA 3AAPA 3TAMA 2GBZA 3AVBA 2P9PB 2WFBA 1X9MA 1BI4A 4LY7A 4O44A 1VSFA 1KAYA 3KLFA 2X6SA 1T05A 2RKIA 5H1SQ 4F2RA 1JLBA 1RDCA 2YNIA 1S1TA 3V9WA 2G8VA 3CJAA 1S9GA 2B6AA 3O1WA 4WF9L 3ZT2A 1WAFA 4IEEA 4CF9A 1RNHA 5GAEP 1SL0A 2KFZA 3ITHA 1YVNA 3CC2N 3F2KA 3K2PA 2ATQA 4CZGA 3RWUA 5C12A 4BVPA 1BCMA 4LF6K 4OKKA 1JLQA 4DSFA 4KFBA 3NFAA 4Z0UA 4B1WB 4M3TA 4H5WA 4IFVA 4E89A 1WB9A 1GOCA 1RTIA 4QS8A 1NGEA 3H45C 3RMBA 3QICA 3VGLA 3V6DA 1CXQA 3QNOA 4MO5A 5GADP 4CJLA 4DUZK 1B9FA 2ETJA 2ZQBA 3BZCA 3Q7BA 5A2QO 3NGZA 4KHUA 1TAQA 1QTMA 4B3MK 4J8FA 2NUBA 3WXKA 1VSMA 2E4LA 4KTQA 4FJ8A 3OHRA 4BR9A 1L3TA 2OPRA 2FF3B 1L3VA 3TAPA 4FLUA 5GIOA 3ID6A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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