2CGJA

Crystal structure of l-rhamnulose kinase from escherichia coli in complex with l-fructose and adp.
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
479
structure length
479
Chain Sequence
TFRNCVAVDLGASSGRVMLARYERECRSLTLREIHRFNNGLHSQNGYVTWDVDSLESAIRLGLNKVCAAGIAIDSIGIDTWGVDFVLLDQQGQRVGLPVAYRDSRTNGLMAQAQQQLGKRDIYQRSGIQFLPFNTLYQLRALTEQQPELIPHIAHALLMPDYFSYRLTGKMNWEYTNATTTQLVNINSDDWDESLLAWSGANKAWFGRPTHPGNVIGHWICPQGNEIPVVAVASHDTASAVIASPLNGSRAAYLSSGTWSLMGFESQTPFTNDTALAANITNEGGAEGRYRVLKNIMGLWLLQRVLQERQINDLPALIAATQALPACRFIINPNDDRFINPDEMCSEIQAACREMAQPIPESDAELARCIFDSLALLYADVLHELAQLRGEDFSQLHIVGGGCQNTLLNQLCADACGIRVIAGPVEASTLGNIGIQLMTLDELNNVDDFRQVVSTTANLTTFTPNPDSEIAHYVALIHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords L-RHAMNULOSE KINASE
publication title Structure and Reaction Mechanism of L-Rhamnulose Kinase from Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 167
structure length 479
sequence length 479
ec nomenclature ec 2.7.1.5: Rhamnulokinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2cgjA02
1SAZA 5BRHA 1GLEG 3H45C 4FWRA 3SMSA 3WXJA 4MLEA 3GOIA 3F9MA 5EY4A 5AR0A 3FZMA 4JHDB 5FPNA 4H5NA 1R59O 4MO4A 4AM6A 2A41A 4H0OA 3H1VX 4E1JA 3C0BA 4JN4A 2P9KB 4BC2A 2Q31A 1NGGA 4IZ9A 3R6MA 3MN7A 3LM9A 3U9DA 1U2VA 1GLDG 3D2FB 4FWKA 3ULEA 1MA9B 1DGKN 4YDUA 1E4GT 2ASOA 2QW9A 2IVOA 3DXMB 3GL1A 5AQIA 4O5FA 2HOEA 2BTFA 2GWKA 3H6EA 2E8AA 5JLHA 3DAWA 2J4RA 3VOVA 2HMPA 4GNIA 4B1XB 3ZEUB 3VF4A 5BN9A 1BDGA 1QQNA 3UKRB 1XUPO 2AA4A 2QWPA 2E88A 1V4TA 3KHYA 2YI1A 3M1FA 1NGAA 4H0PA 4HTLA 2CGKA 2V7YA 4FWMA 3L6QA 3VERA 2P9SA 2PAVA 2QM1A 1Z6RA 3RSEA 4BC5A 4H0TB 5FPEA 2Q2RA 5EX5A 4H0YB 1YUWA 2CGJA 1MWMA 4BRDA 2VYPA 2P9NA 2AP1A 1NM1A 1S22A 2Q0RA 2UYTA 2D0OA 3FFKB 5ADXH 1XQSC 4A2AA 4BR5A 4FWOA 3FZHA 4BQLA 3BF1A 3VPZA 1BU6O 4XEIA 4BR2A 3UKUB 2YHWA 4CZLA 3SK3A 5EOYA 3ID8A 3UB5A 1GLFO 4DQ8A 1QZ5A 3ATVA 5LJVA 3CJAA 4CZMA 1QHAA 5E84A 4MO5A 4EFHA 2P9PB 4QS9A 4H03B 3MN6A 4BRPA 4FWLA 5FPDA 1XC3A 1BUPA 2GEMA 1KAXA 4BRIA 1CZAN 5BR9A 2IIRA 3O5BA 4BG9A 2Q36A 3O8MA 2ZWHA 4CZGA 1D4XA 2ASPA 3OHRA 4FWSA 5AZJB 3IDHA 5KQ8A 5AQOA 4RTFD 4BQZA 1JCGA 3O08A 5E26A 1NGEA 4CZFA 5AQLA 1Q18A 2P9LB 4B1YB 4JHDA 4PL7A 1NMDA 1C0FA 4IO8A 4Z94A 2YJFA 3FR0A 1KAZA 2P9KA 1GLBG 3FZKA 3CHWA 3WEEB 5F1XA 1BWFO 2F9TA 2NLXA 1T44A 2A5XA 2Q1NA 1GLJO 1JCFA 3ZX3A 4H5WA 1ATSA 3DXKB 4K25A 1LOTB 1GLCG 3VEWA 1YXQA 2P9IB 2IVPA 3DXMA 3WQTA 3QBXA 1T6CA 3ZX0A 4J8FA 1X3MA 3IUCA 1YAGA 2DPNA 3D2EB 3QDKA 3ZEUA 4EIAA 4H5RA 4WQ5A 4A62A 4JNEA 4JAXA 4BROA 3H46O 3ENOA 2CH6A 4FWPA 4CZJA 4WQ4A 1NGHA 1LCUA 3O80A 4EHUA 2FF6A 3VGMA 4BREA 1NGBA 1U6ZA 4ISFA 3CERA 3MK6A 5BPLA 1TYQB 2WUSA 3GG4A 3TU5A 1OKJA 3ZETB 1Z05A 3BEXA 1JCEA 2E1YA 5JMVA 4BRAA 4BRLA 3A5MC 3FGUA 3UKUA 1NGIA 1DKGD 3P4IA 2OANA 3UE5A 5AQKA 2E20A 5AQPA 1WOQA 3VEZA 4NB4A 3QB0A 3HTVA 2ZF5O 4B1WB 2P9PA 1HUXA 4M7YA 3ENHA 3MN9A 4K43A 5AQZA 4EAHD 3ATUA 4FL9A 3SLCA 3D7EO 5F0XA 4M7XA 2NZTA 2H3GX 2FSJA 3CJ1A 4ISGA 2P9UB 4PKHA 4BRNA 5AZIB 4EHTA 2YHXA 4DB3A 3L4IA 3VEXA 1MDUB 4K41A 3WXKA 4BR4A 3WUHA 3CQYA 5AQFA 1SZ2A 3QICA 5AQNA 1EQYA 3CJCA 4BC4A 4L3QA 2P9LA 4MLHA 5ELZA 3EL2A 1ZXOA 3SMPA 2GTDA 3WT0A 4XH1A 2E2QA 5AQVA 4F9OA 1H1VA 2W41A 4C23A 5KPZA 2ASMA 1K8KB 2QXLA 3JXUA 4CBWA 3WEEA 4CBUA 4CD1A 4XH5A 3VGKA 4CZKA 2P9SB 4FWNA 2PBDA 3TPQA 2IVNA 3GE1A 3RSEB 1YVNA 3DXKA 1RFQA 3VGLA 5AQTA 3O6WA 1P8ZA 4BRGA 5BPNA 1KXPA 2P9IA 2VCPA 1HLUA 4BGAA 3CJBA 3DJCA 5AQUA 3LDLA 3U9ZA 4BVOA 3CJ9A 3D2EA 5TKYA 4IWVA 5AQGA 3EZWA 3LDNA 2E2NA 2CH5A 3KZBA 3LL3A 3O1WA 3EKSA 4BRMA 3IMXA 4NO7A 4BRCA 4FSVA 1Y64A 3IFRA 3D2FA 3EKUA 5BRFA 1GLAG 2A3ZA 4KBOA 5AQQA 4CJ7A 4PKGA 3CETA 2VWBA 5AQJA 3VEVA 3C7NB 1V4SA 5BPMA 1TYQA 1ATNA 3ZETA 3CQXA 4I6MB 4PL8A 1HKBA 4B1VA 2FLOA 2YHYA 3H1QA 2GWJA 2E2OA 1ZC6A 1QZ6A 4H5TA 4WQ5C 3UKRA 3BUZB 4BG8A 5FPMA 3DWLA 3EN9A 1ATRA 3BF3A 3A8YA 4WQ4C 3GDQA 4JD2B 2YCHA 3FE1A 3MN5A 1IJJA 4QS7A 2Q0UA 3CI5A 3KVGA 3QFUA 2ZGYA 3O4WA 1BOTO 2QWMA 1NLVA 4YDUC 4WYBA 3QFPA 4BVPA 2HF4A 3VEYA 1ZBSA 2P9UA 3R9PA 5AZIA 2KHOA 3GBTA 4CD3A 4GY2B 3EO3A 5BREA 3MCPA 3VETA 5LJWA 1MWKA 3HBTA 1RGIA 2EWSA 3J8AA 1BO5O 2FSKA 2HF3A 4BRFA 1NGCA 2GUPA 4PKIA 4O8KA 4RWTA 1X9JA 1G99A 3LM2A 2Q97A 1QQMA 5BN8A 1BG3A 3CJ7A 3U4LA 2CGLA 4FPBA 4H0VB 3L0QA 3FZLA 1KAYA 2BUPA 4CBXA 4K42A 4A2BA 1T6DA 1RDWX 4BRKA 5EVZA 1TUYA 1HJOA 4CZHA 4Y0WA 1TUUA 3HZ6A 2NRHA 4CZIA 3FLCO 2A6AA 2QWRA 2QWLA 2I7NA 1K8KA 1NBWA 4B9QA 5AQMA 5AQHA 5CE3A 3W0LA 3WQUA 3M6GA 2V51B 1BA1A 2F9WA 4H0XB 3VF6A 4BR9A 2GELA 3B8AX 5LY3A 2V52B 1NWKA 5AZJA 5AQWA 4M63C 1U2VB 3LDQA 3ULEB 3AAPA 2ITMA 5AQYA 3M3ZA 3MMVA 3O1BA 1HX1A 4ISEA 4BR0A 1QQOA 3SJHA 5AQXA 3A5LC 4AM7A 2QWOA 4DHYA 1NGFA 2D0PA 2D1KA 4FOIA 1SQKA 3S41A 1E4FT 2E2PA 3FZFA 1WUAA 1C0GA 3H3OB 5AFUH 3G25A 3A5NC 4BRHA 5JLFA 3WXLA 5JICA 3VEOA 1HKCA 1BA0A 3WXIA 4BRQA 4A61A 1NGJA 3A5OC 4FOEA 2ZGZA 1DEJA 2YJEA 3R8EA 5KPTA 3C7NA 1GLLO 2E1ZA 3LDPA 4DCHA 2P9NB 3QBWA 5KQDA 4B1UB 3AY9A 4I6MA 1J6ZA 2QWQA 2I7PA 1IG8A 3AARA 3LDOA 2QWNA 5AQRA 1HKGA 4XH4A 4BR7A 3BP8A 2FXUA 1NGDA 3A0IX 2A42A 2D4WA 4FO0A 4FWQA 3AAQA 5F2RA 3U8XA 3I8BA 3W3DA 3JS6A 1ESVA 4JD2A 3HSCA 4IJAA 4QS8A 1S3XA 4BGBA 3QMLA 2FF3B 3VF2A 3CIPA 4IJNA 5ADXA 5B8HA 4BC3A 4CZEA 3HI0A 3HM8A 1HPMA 5KPRA 5I9EB 4FPAA 2A40A 2W40A 5EXWA 5AQSA 5AFUA 4B1ZA 2V7ZA 3H3NO 4LC9B 1X3NA 4RCHA 3VESA 3VENA 2FSNA 4H5VA 5BRDA 3ZX2A 4IXCA 3MDQA 4CI6A 4HWIA 3I33A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PV8A 1SAZA 5BRHA 1GLEG 2NRRA 1NOZA 3SMSA 2IS3A 5EY4A 4OPJA 3OS0A 4JHDB 2HVIA 4MO4A 4U7BA 4FLZA 4CERA 1QVFM 3OBYA 3C0BA 3U6FA 4JN4A 4BC2A 2Q31A 2G8FA 1HYVA 4FJ7A 1BGXT 4FWKA 3EZ5A 1BISA 3OS1A 4LF5K 3MEDA 1TL1A 3THWA 5FRMA 4LF8K 2ASOA 4CEDA 3QERA 4YOYA 3GL1A 4IBNA 1RNHA 3DM2A 5JLHA 2VG6A 2E8AA 1FK9A 4CJPA 2HMPA 3ZEUB 3VF4A 1YJ9N 3KLEA 1QQNA 5JS2A 3HVRA 3QEVA 1XUPO 1V4TA 3PSIA 1LWEA 2YI1A 1NGAA 4FW2A 3NGYA 3QETA 1I94K 1KLMA 4DTMA 2P9SA 2PAVA 2KFNA 4BC5A 3DOKA 1KRPA 4H0YB 1YUWA 1RT2A 2Q0RA 2F8SA 4FZZA 2UXBK 1IG9A 1EP4A 2YX6A 3A2FA 4BQLA 3CPEA 1NU0A 3UKUB 2YHWA 4CZLA 1EWQA 1Q86O 1K9MO 3RTVA 3ATVA 3S9HA 2QI2A 2YKMA 4MO5A 4EFHA 4QS9A 2UUCK 3OTOK 1WSFA 1TKTA 4F4KA 4FWLA 5HBMA 4CFDA 4LF7K 3VQ6A 4N56A 4BRIA 3O3GA 1CZAN 4ELUA 1IKWA 3O5BA 4DV1K 3QEPA 4FM0A 2G8WA 3OHRA 3CF5L 4CESA 3HPHA 4RW4A 5AZJB 3L8BA 5DMRA 2JLEA 1LAVA 5AQOA 4N41A 5J2MA 2UXCK 3AVKA 5E26A 4DSKA 3CCQN 3RWUA 4CZFA 5AQLA 1Q18A 1RDCA 4NLBA 1S6PA 3SV4A 1C0FA 4F3OA 4U67L 2P9KA 2RPIA 4O4GA 3WEEB 5M1PA 5F1XA 1ZBLA 1BWFO 2YHAA 3LWLA 4DR3K 2A5XA 3DLGA 4K0KK 4K25A 3SNNA 1LOTB 1L5UA 4CGGA 1YXQA 1UAXA 2E6MA 3MAQA 2IVPA 4KI4A 2D0BA 3NE6A 1YITN 3V1RA 1T6CA 2WOMA 2RKIA 4J8FA 2A1SA 2UUAK 4ICLA 4FZYA 4CJWA 4H5RA 5J1EA 3T1AA 4WQ5A 1RT1A 4G9ZA 4JNEA 3K59A 3H46O 2O8FB 2ZM6K 3PX0A 4FK4A 1LCUA 4KHQA 4B08A 2ZJQL 1S5JA 2FF6A 4LFBK 1NGBA 1HMVA 2ATQA 3CERA 3MK6A 5BPLA 2WUSA 3IG1A 3TU5A 3BEXA 4DFKA 4BRAA 4BRLA 4DV7K 1U04A 1BCOA 2OANA 5AQKA 3C6TA 4NB4A 1W97L 1J9AA 1S6QA 3QB0A 3HTVA 4I2PA 4HUGA 4CHZA 1N32K 1HUXA 3ULDA 4IDKA 3MN9A 4EAHD 4FK0A 2X6SA 3D7EO 4M7XA 1NJXA 3NAEA 4DV2K 3SUPA 1YVUA 4Q5VA 1TVRA 3CJ1A 2R7YA 5AZIB 4EHTA 4OO1J 3V9SA 2HW3A 3LPUA 4CFCA 1MDUB 4M3TA 3AVMA 2Z1IA 4JI2K 4DF4A 3P31A 5AQFA 3THXB 3TAGA 1SZ2A 4CVNE 3QICA 5AQNA 4O5BA 4W5RA 4KHUA 1L3SA 1CZ9A 2P9LA 1XHXA 3EL2A 3SMPA 3LP1A 2E2QA 1TGOA 5AQVA 4GVMA 1Q8IA 3KKRA 3P5JA 4CBWA 4LF4K 4PY5A 4CD1A 4FWNA 4QCLA 3SPZA 3RSEB 3THYA 5CYMA 1RFQA 3O6WA 3OYLA 5BPNA 3ZT1A 4FYDA 1HLUA 2QEXN 2O8CB 3LDLA 3OYDA 3CJ9A 4RG8A 1BIZA 2YNGA 3ITHA 3D2EA 5KGXA 1QSYA 2E2NA 2CH5A 3KZBA 2P1JA 3CCJN 3HYFA 3L2WA 3IMXA 4FSVA 5M1QA 5BRFA 4DR6K 1CXUA 1EKEA 3OBWA 5DM6L 4HUFA 4PKGA 2VWBA 1GOAA 1CLQA 4DR5K 3G0ZA 1NK5A 1SL2A 2HBJA 1ATNA 3ZETA 3AVBA 4PL8A 2YHYA 4E7JA 4DWIA 2PY5A 4GV3A 3LALA 1QZ6A 5I3UA 4YOTA 4W5TA 5FPMA 3DWLA 4I7FA 1KCFA 3BF3A 2AJQA 4DLGA 1VSMA 4WQ4C 3CCLN 3NFAA 3GDQA 4JD2B 3DI6A 3FE1A 4CECA 2QTDA 3KVGA 1HYSA 2O8EA 3TAEA 3CXCM 2HBMA 2ITGA 3QFPA 3DOLA 3E9LA 1E3MA 3VEYA 2P9UA 1T3VA 4FJ8A 2VWKA 2JGUA 3GBTA 2O4IA 2X6NA 5BREA 4JKDA 1UWBA 5IWAK 4AH9A 3J8AA 1BO5O 3F5TA 3OJSA 3HK2A 1CZBA 2GUPA 2FBYA 1X9JA 1DLOA 1YT3A 2Q97A 5JVHL 1TK8A 2Q3SA 4J2BA 3K57A 1KAYA 1EO1A 4K42A 4A2BA 4CIEA 2UUBK 4CZHA 1QQCA 4DR1K 4LD0A 5AQMA 3QINA 3M6GA 3ZT0A 2KZMA 4C1NK 4BE0A 1KD1O 4H0XB 2GELA 5GAGP 2V52B 4M63C 4DU1A 1NJYA 1U2VB 3VQEA 4B3TK 1CXQA 3AVGA 4B9NA 3E9OA 3MMVA 1DTQA 3VQ5A 4YNQA 4ISEA 2QKBA 5JS1A 4BR0A 5AQXA 4R5PA 4DHYA 1NJWA 4FLYA 1LW0A 4DR4K 2HHTA 4E1NA 4WCEL 2VGMA 4JKGB 1OVQA 3Q7CA 2D0AA 5JLFA 3WXLA 1S9GA 4CHYA 1HKCA 1NGJA 4OKJA 4KAZA 2FC0A 1VSHA 5DK5A 1KVCA 5KPTA 4IOAL 3LDPA 2P9NB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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