3D2FB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 116
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2fB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2fB04
5BPMA 3L6QA 2HOEA 4PL8A 1LOTB 2ASOA 4IXCA 3ZEUB 3EO3A 3W3DA 3BUZB 5FPEA 4CZGA 2Q31A 2P9KA 4J8FA 3FZLA 4E1JA 2FF6A 4IO8A 2QW9A 3JXUA 1D4XA 3FZFA 3CERA 1GLCG 4IJAA 3FLCO 3VF6A 5AQWA 4I6MB 3D2FB 4WQ4A 5BRDA 4FWQA 3DXKB 3LM9A 3M3ZA 3DWLA 3AAQA 4FWLA 3C7NA 3M6GA 3O80A 2P9NA 3O6WA 3WQUA 5FPDA 1BA0A 1BA1A 2D1KA 3CQYA 4XH1A 3WT0A 3FZMA 4BRPA 2GUPA 4CZEA 4FOEA 5AQJA 1HUXA 3HBTA 4FWPA 3QFPA 4BR9A 5AQMA 2E2PA 3WXJA 5BPLA 3CJAA 4WYBA 4BG8A 3RSEA 1T6DA 3CJBA 2FXUA 3LL3A 2J4RA 4BRHA 4RWTA 4L3QA 3ZX0A 3HM8A 4CJ7A 2FSNA 4FO0A 5EOYA 3VETA 4EHTA 3O4WA 5BN8A 3MDQA 3B8AX 2UYTA 5I9EB 1NGBA 5KPTA 3LDPA 4WQ4C 2FSJA 1GLAG 3AY9A 2YHWA 4DHYA 2P9SB 1NGDA 3A5NC 4NB4A 3I33A 4JD2B 4M63C 1X3NA 4BR4A 3BF3A 2P9UA 5EX5A 4FWKA 4H0XB 3ATUA 4RCHA 3AARA 1JCGA 4YDUA 2P9PB 2HF4A 4BC2A 1HKCA 3BP8A 4FWNA 3D2EA 2E2OA 1V4TA 3UKRB 3MN6A 5ADXA 1QHAA 3ATVA 1MA9B 4B1XB 2VWBA 1NGAA 4A2BA 3ZETA 2IIRA 3D2FA 4BVOA 1BUPA 3SK3A 3DXKA 3R6MA 3R9PA 2H3GX 4H03B 3JS6A 2ITMA 5CE3A 1NGGA 1GLBG 4BC3A 3H46O 3I8BA 4BREA 4PL7A 3CIPA 4XH4A 3ULEB 4B1VA 4BVPA 2I7NA 5F0XA 4BRGA 5AQNA 4K43A 4A61A 1BOTO 3O08A 4BG9A 2NRHA 4ISGA 3UB5A 3F9MA 4DCHA 1OKJA 3IFRA 4JHDA 1GLJO 4H5NA 3QBWA 4BGBA 4WQ5C 4B1WB 5ADXH 3A8YA 3HSCA 4YDUC 5AZJB 3DJCA 3H3NO 4C23A 4CZKA 3BF1A 1QZ5A 3WXIA 4BRMA 3M1FA 3MMVA 2IVOA 1NWKA 1JCFA 5AQKA 3HTVA 1QQOA 4DQ8A 2V52B 5E26A 2P9SA 4H0VB 3U9ZA 4CZIA 5BRFA 5BREA 1QQNA 4F9OA 3SMSA 5AZIA 1XC3A 1BO5O 1K8KA 1XQSC 5AQGA 3QBXA 3OHRA 4M7XA 4PKGA 3QB0A 1G99A 3VOVA 3GOIA 4M7YA 5BPNA 1LCUA 1ATNA 2W40A 4EAHD 4JNEA 1TYQA 1U6ZA 5AQXA 3WXKA 1YUWA 1Y64A 1U2VB 4A62A 1GLFO 4IZ9A 3UKRA 4BR0A 1X9JA 4CZFA 3CQXA 4BRNA 2Q1NA 5AQQA 1WUAA 2DPNA 3VGMA 3O1WA 3KVGA 4HTLA 4HWIA 2VYPA 2OANA 1NGJA 1NGIA 4A2AA 4GY2B 1DKGD 5FPMA 4DB3A 1YXQA 3GBTA 2WUSA 2YJFA 1KAZA 3SLCA 3KHYA 5AQYA 5F1XA 1NBWA 4BR2A 4BRDA 4BC5A 2P9IB 3WXLA 4NO7A 4K25A 4BRAA 1SZ2A 4FWSA 2QWMA 2CGKA 5KPZA 1S3XA 3P4IA 5EXWA 2CH6A 1Z05A 2E2NA 3J8AA 3R8EA 4IWVA 3TU5A 2A6AA 3VEVA 3UKUB 1HX1A 1ZXOA 2QXLA 5AZJA 4H5WA 4CZJA 5AQSA 2YI1A 5AQOA 4BROA 4CBXA 3H1QA 1BU6O 3ZEUA 5AR0A 2BTFA 2GWJA 4FOIA 2PAVA 1NMDA 3W0LA 4O5FA 4GNIA 1NM1A 2EWSA 1DEJA 3H3OB 4CD1A 2PBDA 2QWRA 5JICA 3MN7A 5TKYA 1RDWX 2IVPA 5AFUA 4RTFD 4BRIA 5JLHA 3EZWA 3CI5A 4I6MA 3O5BA 1SQKA 2CGJA 1X3MA 2GEMA 4QS8A 4EIAA 3HZ6A 2ZGYA 4Z94A 4BGAA 2Q97A 3H6EA 5JLFA 3WQTA 1BWFO 1YAGA 4BC4A 5KQDA 1GLEG 4BR5A 4CZHA 2IVNA 2D4WA 2W41A 2ZGZA 3DAWA 1MWMA 2E88A 5JMVA 3VF2A 3SJHA 4BRKA 2A40A 1TUYA 2VCPA 2CH5A 2KHOA 4AM7A 1KAXA 4BR7A 1HKBA 3A0IX 2A5XA 4QS9A 5KPRA 4CI6A 1GLLO 3ZX3A 1HLUA 1S22A 2F9TA 3CJ7A 2E1ZA 3SMPA 2QWPA 3FE1A 5KQ8A 4MLEA 2CGLA 3O8MA 4JN4A 3WUHA 2D0OA 2YJEA 4B1UB 1Z6RA 2V51B 3ENOA 5B8HA 3FGUA 4PKIA 1RGIA 3L4IA 2F9WA 1HPMA 4JD2A 1QQMA 3AAPA 2P9UB 1TUUA 2E20A 2NZTA 3VEOA 4BRLA 2ZF5O 2QWQA 3TPQA 3VENA 2Q0RA 3H1VX 3DXMB 2BUPA 5AQFA 2E8AA 4XH5A 1NGFA 3D2EB 2P9PA 3GG4A 1SAZA 1BDGA 1NGEA 4BQLA 4MO4A 2A42A 4H5RA 2AA4A 3QMLA 3ZETB 2YCHA 1YVNA 3CHWA 1C0GA 2NLXA 3GDQA 1EQYA 3CJ9A 1T44A 1GLDG 2GWKA 3MN5A 4BRFA 3IMXA 4CBWA 3U9DA 4MO5A 1ZBSA 1QZ6A 3FZHA 3A5MC 3VEZA 2ASPA 2P9LB 3C0BA 3D7EO 4CZLA 3ULEA 4XEIA 4LC9B 5AQRA 3BEXA 4H0TB 3LDLA 3LDNA 3QDKA 3EN9A 1ATSA 4ISEA 4B9QA 4JHDB 2E2QA 2FSKA 3H45C 3VEWA 2GELA 2Q0UA 3MK6A 3GL1A 3CJCA 5LY3A 4H0OA 3S41A 3VPZA 2YHXA 5AQIA 1E4FT 4CD3A 2ASMA 1MDUB 4CZMA 2Q2RA 2A41A 4FPBA 3U8XA 3WEEB 1XUPO 2E1YA 5ELZA 5FPNA 3MCPA 3VERA 2GTDA 4H0YB 3ID8A 3L0QA 3ZX2A 4ISFA 2P9KB 1Q18A 5EY4A 4AM6A 3EKSA 1HJOA 5AQZA 3GE1A 2QM1A 4IJNA 2FLOA 3QFUA 1NLVA 1ZC6A 2ZWHA 5BR9A 5LJWA 5AZIB 1J6ZA 1K8KB 1MWKA 1JCEA 2QWOA 2V7YA 2Q36A 5AQVA 5BRHA 1H1VA 1CZAN 1TYQB 3C7NB 4FSVA 4JAXA 4QS7A 4WQ5A 3HI0A 3ENHA 4FWRA 2FF3B 2P9NB 3IUCA 5EVZA 3LDOA 5LJVA 3DXMA 2AP1A 4EHUA 3LDQA 4K42A 1U2VA 1KXPA 3A5OC 5E84A 1HKGA 4Y0WA 4CBUA 3A5LC 4BRCA 2QWLA 5BN9A 3G25A 3VESA 3IDHA 1WOQA 5AQLA 3VGLA 5AQPA 3O1BA 5AQUA 1RFQA 2A3ZA 3VGKA 4EFHA 1NGHA 3MN9A 3RSEB 3EKUA 2HF3A 3VEYA 4KBOA 1P8ZA 2V7ZA 1BG3A 1C0FA 3FR0A 4K41A 5AFUH 3CETA 4FWMA 4PKHA 2I7PA 5AQTA 3VEXA 1T6CA 3UE5A 1R59O 4FL9A 4BQZA 2P9LA 3KZBA 4O8KA 4H5VA 1ESVA 3U4LA 1KAYA 1IG8A 4FPAA 1E4GT 1NGCA 1V4SA 3VF4A 4H5TA 5AQHA 2P9IA 4B1ZA 4BRQA 1IJJA 3QICA 2YHYA 3FZKA 1DGKN 3CJ1A 2D0PA 5F2RA 3LM2A 3FFKB 3EL2A 2QWNA 4H0PA 3UKUA 4FWOA 4B1YB 2HMPA 1ATRA 3WEEA 4MLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L6QA 1LOTB 3W3DA 5AJ3K 3ISNC 2HBJA 2RE2A 5CR4A 4IO8A 1PE4A 1TL1A 1L5UA 2KTQA 1VSHA 3CERA 4B9VA 1WSHA 3THXA 3O9QA 5KTQA 4ILHA 3MWTA 4DSEA 5CYQA 4CJKA 1RBSA 3D2FB 1XWLA 4WQ4A 1DT9A 3LM9A 5GIPA 3TAEA 3O9TA 3M6GA 4C8LA 1BHLA 3SQ2A 1WB9A 3WT0A 4H8KA 1JLQA 3PSMA 3AO5A 5C2DA 3OYFA 3FZMA 1C56A 2GUPA 3PX6A 4CZEA 1S6QA 1TKTA 4NLBA 5AQJA 1HUXA 3TTFA 4E7IA 3CPEA 3QFPA 1EX4A 2NNWA 1DLOA 4Z4EA 3WXJA 4WYBA 2LSNA 3RSEA 3CJBA 2O8DA 2HBLA 4CJ7A 3VETA 4EHTA 3O4WA 5BN8A 5E41A 1HNVA 3B8AX 3EY1A 3ULDA 4DTOA 3C95A 1FW6A 3LDPA 3SAHA 1WLJA 4M3TA 4ID5A 1K8BA 1XRSB 1Q81O 3K5LA 3SQ1A 4DV2K 1W2BM 2NUBA 1JLBA 4IOXA 4H4MA 1D9DA 4JI5K 3BF3A 3VTIA 3N4PA 5EX5A 2VG5A 3CCEN 1G15A 4EZ9A 1NE5A 2YC1C 2ITGA 4YDUA 1WT7A 1FKPA 2P9PB 1HNZK 1HKCA 3BP8A 3D2EA 3V9UA 1T7AA 2E2OA 4DR4K 1QHAA 3HP9A 1WBBA 2Z1GA 4B1XB 2VWBA 2YNIA 1SN4A 2HVHA 1NGAA 4RW6A 3RMCA 2IIRA 1BCGA 2FBVA 1D5AA 4KKOA 4KPYA 1JLAA 1GLBG 4ZTJA 2MBKA 3I8BA 4CHYA 4B1VA 2I7NA 2WTUA 5F0XA 1UA1A 5AQNA 4V1DC 3AVGA 4A61A 1VSMA 3VQ9A 1L3SA 2BGGA 3E7RL 4BG9A 4C8KA 1DQ7A 3SV3A 3UB5A 3L2VA 4E7HA 2FBXA 3F9MA 4DCHA 2KFZA 1OKJA 4DQQA 1JL2A 3IFRA 2A7TA 1LAWA 4FJ7A 4KV8A 4AH9A 3CW4A 2D0BA 3VQDA 1JZBA 3A8YA 3NH2A 1RTDA 2NRZA 1VSKA 3V1QA 1JKHA 1UA0A 4RW8A 2HVIA 4C23A 4DUZK 1VQNN 2FBYA 4CZKA 4W5RA 4N47A 3BF1A 1QZ5A 3P38A 3O9SA 2EHGA 2PY5A 3LPTA 3E66A 2IVOA 4HVJA 2N2QA 5AQKA 3RRGA 3LP0A 1RDAA 1O1WA 5HOOA 4F8RA 4DQ8A 4FJIA 1RDCA 2V52B 4LF8K 5E26A 3U9ZA 4CZIA 3F73A 5GAGP 3ZT0A 5AZIA 4FLYA 4YORA 1BO5O 1K8KA 3THYB 3F5TA 4M7XA 4PKGA 1LWCA 4M7YA 4EAHD 1TYQA 4LSLA 2KGQA 4LF7K 3SI6A 1YUWA 1GOCA 4O44A 4A62A 2YIPA 4FZYA 1NH5A 1I94K 5FRNA 3RRHA 3NF6A 3MCAB 1X9JA 4KH4A 3WNGA 4AQYK 3SZ2A 4B3SK 1VRUA 2B6AA 1S72N 4DWIA 1N32K 2OANA 2KJAA 1NGJA 1NGIA 1BCMA 4A2AA 4GY2B 3SUOA 1VSEA 1KVBA 1YXQA 3GBTA 1LW0A 1BK8A 2YJFA 3KHYA 4DUYK 3E9OA 4BR2A 4BRDA 3WXLA 3EZ5A 3MXJA 4M42A 1F21A 3K57A 1TV6A 2OPQA 2QWMA 1B7DA 3P4IA 1T8EA 4NYFA 3R3LA 3CM5A 3O9UA 4IWVA 3UKUB 1ZXOA 3K9KA 4KHWA 4W5OA 4CJSA 4AILC 2X6NA 1BU6O 5M1PA 5AR0A 4RW4A 4E3SA 3KTQA 4UY8O 4CJUA 3EE9A 4O5FA 2M8BB 5HRPA 2F96A 3DRRA 3KKSA 1T03A 1A5XA 3H3OB 4FLUA 4E0DA 4W5NA 5AFUA 5A2QO 4BRIA 3CCMN 3ZT3A 1YJ9N 4M3RA 2W6LA 1ICAA 2E5LK 4CHNA 4JI1K 4DKWA 2VY6A 3T1HK 1SQKA 2CGJA 2RKIA 1OH5A 2GEMA 4CHPA 3HZ6A 2ZGYA 1SEGA 3HVRA 4BGAA 3T7ZA 3WQTA 4KYPA 3CCUN 1WSGA 3O4NA 5KQDA 1GLEG 2G8UA 4CIGA 4BR5A 4CZHA 2D4WA 2W41A 3DAWA 4AAZA 2E6MA 4BRKA 2A40A 3LDSA 4B3TK 4AM7A 4BR7A 3K59A 1JLCA 3U3GA 4QS9A 1VSLA 4EP5A 4OGEA 4FLTA 4V19S 4CJQA 4KHPK 1HYSA 2QWPA 3NBPA 4FLVA 2PFUA 4J2EA 3O3GA 4B1UB 5D3GA 1EETA 3J7AP 3WXMB 5HBMA 4B9NA 4FJNA 5SZTA 3S3MA 1RGIA 3L4IA 2F9WA 1HPMA 3K0SA 1QQMA 3TI0A 1ZYWA 1LQHA 2NZTA 1IKXA 4C8NA 2NRTA 3VEOA 2HNZA 4KI4A 3P1GA 2Q0RA 4UQGA 2BUPA 4FXDA 4Z0UA 3AO2A 3AO4A 3TABA 3ZSVA 4XH5A 3WNHA 3RMAA 2P9PA 3AVBA 2LR3A 1X1PA 2DFHA 1NGEA 4BQLA 4MO4A 2A42A 1OH8A 4PHTX 3OW2M 2AA4A 2LN8A 3M8RA 2E6LA 1RT2A 1YVNA 3CHWA 3GDQA 3DYAA 1EQYA 3AA4A 2GWKA 2HSTA 3SNNA 3IMXA 4B9UA 2C1GA 1QZ6A 1RT1A 1EWQA 4LC9B 2UUBK 4GV9A 2ETJA 4H0TB 4BACA 1VSIA 4KAZA 2D56A 3NGZA 4CGHA 1KVAA 3DLHA 4YHHK 1S1UA 2YHXA 5GAHP 3IKMA 3NCIA 4DU4A 2A41A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3L6Q A;  1LOT B;  3W3D A;  5AJ3 K;  3ISN C;  2HBJ A;  2RE2 A;  5CR4 A;  4IO8 A;  1PE4 A;  1TL1 A;  1L5U A;  2KTQ A;  1VSH A;  3CER A;  4B9V A;  1WSH A;  3THX A;  3O9Q A;  5KTQ A;  4ILH A;  3MWT A;  4DSE A;  5CYQ A;  4CJK A;  1RBS A;  3D2F B;  1XWL A;  4WQ4 A;  1DT9 A;  3LM9 A;  5GIP A;  3TAE A;  3O9T A;  3M6G A;  4C8L A;  1BHL A;  3SQ2 A;  1WB9 A;  3WT0 A;  4H8K A;  1JLQ A;  3PSM A;  3AO5 A;  5C2D A;  3OYF A;  3FZM A;  1C56 A;  2GUP A;  3PX6 A;  4CZE A;  1S6Q A;  1TKT A;  4NLB A;  5AQJ A;  1HUX A;  3TTF A;  4E7I A;  3CPE A;  3QFP A;  1EX4 A;  2NNW A;  1DLO A;  4Z4E A;  3WXJ A;  4WYB A;  2LSN A;  3RSE A;  3CJB A;  2O8D A;  2HBL A;  4CJ7 A;  3VET A;  4EHT A;  3O4W A;  5BN8 A;  5E41 A;  1HNV A;  3B8A X;  3EY1 A;  3ULD A;  4DTO A;  3C95 A;  1FW6 A;  3LDP A;  3SAH A;  1WLJ A;  4M3T A;  4ID5 A;  1K8B A;  1XRS B;  1Q81 O;  3K5L A;  3SQ1 A;  4DV2 K;  1W2B M;  2NUB A;  1JLB A;  4IOX A;  4H4M A;  1D9D A;  4JI5 K;  3BF3 A;  3VTI A;  3N4P A;  5EX5 A;  2VG5 A;  3CCE N;  1G15 A;  4EZ9 A;  1NE5 A;  2YC1 C; 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