5AQOA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqoA04
3FGUA 1GLEG 1NGDA 2F9TA 3F9MA 2GELA 3EZWA 3ZX3A 4YDUA 4BREA 4FWKA 3R9PA 3KVGA 2VCPA 5BRDA 1P8ZA 2FF3B 4HWIA 2P9LB 3CJ7A 4XH5A 3ZX0A 1E4FT 1IG8A 1TYQA 4B1WB 3FZLA 1BG3A 4FOEA 2PBDA 1MDUB 1T44A 1OKJA 4BC3A 5LJWA 3O1BA 4JAXA 3A5NC 2HMPA 2VYPA 3VEXA 5I9EB 4BR5A 1RFQA 5AQPA 2P9IB 4DQ8A 3VF4A 3ENHA 1U2VB 3FR0A 3GG4A 5E26A 5LY3A 2Q97A 2V7ZA 5FPMA 3DWLA 4MO4A 1TUYA 2W41A 3CIPA 1Q18A 4WQ5A 2ITMA 4CZHA 3GL1A 2P9PB 2HF3A 1ATNA 4BRAA 4BRHA 4DB3A 3D2EB 4BC4A 3VF6A 1X3NA 5AQOA 1NGJA 4E1JA 5TKYA 4F9OA 1HJOA 3H6EA 3UKUB 4JN4A 3D2FB 3AARA 4FWNA 4BRFA 1ZBSA 4B1VA 4L3QA 5AQVA 3FFKB 3VEVA 3TU5A 1BUPA 2FSJA 2FXUA 4IZ9A 3CJ1A 3ZEUB 2V7YA 2GWJA 3EO3A 4EFHA 1QHAA 1HKCA 1MA9B 4JHDA 1C0FA 3VF2A 5EX5A 5AZIB 3G25A 2ZGZA 5KPRA 5AQMA 2GTDA 4Y0WA 1S3XA 3ZETB 3FZMA 3WXIA 2D4WA 3UB5A 5AQFA 2NRHA 5AZJB 3ID8A 1QZ5A 2QWRA 3A5MC 1YAGA 4H0VB 4O5FA 3ULEA 1T6DA 4CZGA 3HI0A 2Q0UA 3DXKB 1ATSA 4K25A 3VERA 3MCPA 3D7EO 2D0PA 2Q36A 3CQYA 5AQWA 3VGLA 3R6MA 2AA4A 4J8FA 2YHXA 3VOVA 3R8EA 1Z6RA 1KAZA 3ENOA 1GLCG 1V4SA 2GWKA 5BREA 3IFRA 4CZMA 3CJBA 2Q0RA 2FLOA 4IJAA 1YUWA 2UYTA 3O4WA 4CZFA 3UKRA 4CZEA 5KPZA 3UE5A 3LL3A 2A5XA 2CH6A 2E20A 4EAHD 5JICA 3M6GA 3U9DA 3CI5A 4B1YB 1SAZA 1R59O 1HKBA 2CGLA 3CQXA 1NGAA 2BUPA 1ZXOA 3HTVA 4AM7A 1LCUA 4A62A 4EHUA 5AQYA 1BWFO 2IVPA 3LDOA 1BU6O 1DGKN 3DXMA 2P9SA 1TYQB 3LM9A 3SK3A 1J6ZA 2YJEA 4B1UB 2E2NA 3FE1A 2IIRA 2PAVA 3CJAA 5AQZA 1NBWA 4O8KA 2OANA 5AQQA 4BRKA 4CZLA 3MN7A 3P4IA 3VETA 4BVOA 1Z05A 5BRHA 2VWBA 2YHWA 3H1QA 4AM6A 3O08A 1H1VA 1CZAN 2QWMA 1RDWX 2YI1A 4BROA 5EY4A 2E88A 1LOTB 1GLFO 1NM1A 2IVNA 3BF1A 5EOYA 4BR0A 4IO8A 4FWLA 1JCGA 4ISGA 4M7YA 3H45C 4JD2A 2ASMA 4H0PA 1RGIA 1NGIA 5F2RA 3L0QA 1K8KA 4PL8A 5BPMA 1ESVA 1NGBA 3O5BA 2CGKA 4I6MA 4A61A 2P9KA 5AQHA 5AQGA 4CZKA 3WXLA 5KPTA 1BA1A 3WXKA 3GDQA 2H3GX 2QM1A 4BRQA 1V4TA 5BN9A 3CETA 4CBUA 4JHDB 4CZIA 2KHOA 1NGFA 1NMDA 5FPNA 3I8BA 3O80A 4BRPA 3BP8A 4BR2A 3AY9A 1TUUA 4A2BA 2D1KA 4BC2A 4EIAA 3WXJA 4K42A 2CGJA 4QS9A 3MDQA 3JS6A 4PKGA 3MN5A 5CE3A 3ATUA 3ULEB 4XH1A 2E2OA 2IVOA 3H1VX 3MN6A 2QWNA 2A6AA 4PKIA 3W0LA 1XC3A 1GLBG 2E2QA 3M1FA 2Q1NA 3HZ6A 1GLLO 3GBTA 3DAWA 5AQRA 4QS7A 4WQ4C 1DKGD 4RCHA 5ADXH 5JLHA 5KQDA 4CD3A 2YHYA 3UKRB 5AR0A 3H46O 4PL7A 4FSVA 3VGMA 1D4XA 4FL9A 4FOIA 1WOQA 2Q31A 3WUHA 3A5LC 1MWKA 3VEYA 4DHYA 2I7PA 3VEZA 1HLUA 3LDPA 1BDGA 3LM2A 3QBXA 4ISFA 1DEJA 2GUPA 4PKHA 4MLHA 4BQZA 3O8MA 3AAQA 4GY2B 4NB4A 3TPQA 2QWPA 1GLDG 4BRIA 4BGBA 2QXLA 1HX1A 3MN9A 3DXMB 2P9SB 4DCHA 1U6ZA 2FSKA 4H5VA 4BRDA 2F9WA 1KAYA 1NWKA 1SZ2A 3FLCO 2HOEA 4Z94A 1X9JA 3KZBA 1S22A 5ADXA 3B8AX 1ATRA 3C7NA 5BPLA 4H5TA 1C0GA 4FWQA 2DPNA 1NGHA 5AFUH 4H0TB 3QFUA 5F0XA 3U4LA 3LDLA 3QICA 1GLAG 4A2AA 1HKGA 2YCHA 3A0IX 4BR4A 4CD1A 2V51B 4JD2B 3A5OC 4BGAA 5FPEA 3U9ZA 1YVNA 3RSEA 4C23A 1K8KB 4JNEA 4H0YB 1MWMA 4FWMA 4H0OA 1EQYA 4I6MB 4CZJA 2BTFA 2D0OA 2P9KB 3IMXA 3ATVA 4MO5A 3VGKA 2QWQA 1NGEA 1WUAA 4YDUC 3GE1A 2FSNA 2I7NA 1BA0A 1NLVA 1QZ6A 3C0BA 4IXCA 5AFUA 3LDQA 1QQNA 3EN9A 2AP1A 4BC5A 1GLJO 3SLCA 3SMPA 4RTFD 4K43A 3SJHA 4KBOA 2CH5A 5AQXA 2P9UA 2P9NA 4LC9B 3WEEA 3WT0A 1IJJA 4FWSA 5AQJA 5B8HA 4BG9A 1XQSC 3CERA 4XEIA 2ASOA 5AQNA 2QWOA 4WQ5C 4H5NA 2NZTA 3A8YA 4H03B 3VEWA 3O1WA 5BN8A 1BO5O 4M7XA 3S41A 4BR7A 5AQLA 3VENA 3QMLA 4GNIA 2P9LA 4BRCA 4FPBA 4QS8A 3QDKA 4HTLA 1XUPO 2WUSA 4BR9A 1NGCA 4FPAA 1HPMA 5AQTA 1QQMA 3FZHA 5JLFA 3IUCA 4FO0A 3AAPA 1YXQA 1HUXA 2A40A 4BRGA 3EKUA 1JCEA 3HM8A 1T6CA 2ASPA 2P9IA 3BUZB 4BRNA 1ZC6A 5AQUA 4CJ7A 4EHTA 4BRMA 2QWLA 1U2VA 4FWRA 1G99A 3WQTA 1QQOA 3KHYA 3ZX2A 3LDNA 4B9QA 5FPDA 3M3ZA 5BR9A 2A3ZA 2E2PA 2A41A 2P9PA 3QB0A 4WQ4A 4IJNA 2YJFA 3BF3A 4ISEA 3D2EA 5ELZA 1E4GT 2ZWHA 2W40A 3C7NB 3DJCA 3BEXA 2E1YA 1JCFA 4XH4A 3OHRA 5JMVA 3UKUA 1KXPA 4RWTA 5AQSA 3D2FA 4IWVA 5AQKA 3JXUA 4H5RA 2NLXA 3EL2A 2ZGYA 3ZEUA 3QBWA 3SMSA 4M63C 4BG8A 2QW9A 2EWSA 5KQ8A 4WYBA 5EXWA 5AZIA 3L4IA 3L6QA 3CJ9A 3RSEB 1X3MA 2HF4A 3H3OB 3ZETA 3HSCA 3FZFA 3WQUA 3VESA 5AZJA 3MK6A 4B1XB 3EKSA 5LJVA 1Y64A 3GOIA 3MMVA 3VPZA 4CI6A 5EVZA 3J8AA 4CBXA 5AQIA 1BOTO 2FF6A 3DXKA 4H0XB 3W3DA 2A42A 4MLEA 3CHWA 3U8XA 2V52B 4BVPA 2E8AA 4BRLA 3FZKA 3VEOA 5F1XA 4NO7A 5BPNA 1KAXA 3HBTA 4BQLA 5BRFA 4FWOA 3I33A 3O6WA 4B1ZA 2P9UB 1SQKA 2P9NB 4CBWA 3IDHA 4H5WA 3WEEB 2Q2RA 3QFPA 3H3NO 4K41A 2ZF5O 2J4RA 3CJCA 2GEMA 5E84A 2E1ZA 1NGGA 4FWPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1P00A 1NGDA 2XRIA 2GELA 3OYAA 1K6YA 2HHXA 3KJVA 4BREA 3SNNA 1AYJA 4LD0A 4OGCA 3CYMA 4XH5A 1IG8A 4KHWA 3TSUA 5I42A 1YITN 1K8AO 3JSMA 1MDUB 4K0KK 4J2BA 3ENBA 4JK8A 3M8QA 3KKSA 3R2VA 5I9EB 3AVGA 1R0AA 4V1DC 4K8XA 4MQ3A 3E7RL 4E72A 4BDZA 5JVGL 4DTMA 1X1PA 2HBKA 1NJZA 3FR0A 5E26A 4AAZA 4JKEA 4JLHA 2V7ZA 3DWLA 4JEPA 1TUYA 1HNIA 1I3AA 3V9SA 4DUZK 1Q8IA 2QA4N 4CIGA 2Z1JA 4Z4HA 5CHIA 5AQOA 3TTFA 2VWKA 1JZAA 2QXFA 3KHWA 3CXCM 5AQVA 1I39A 4GMJB 3U3GA 4CJ3A 4H4OA 4MFBA 1B9FA 3ZEUB 2V7YA 3EO3A 5C25A 4OO1J 1C0FA 1BIZA 2XO7A 3G25A 2D0AA 3ZSOA 1NK5A 1FXXA 2GTDA 3HPOA 3PO4A 4CVNE 4DFPA 4CE9A 5J2NA 3ID8A 1QZ5A 3KK3A 5HBMA 3A5MC 4DV2K 1T6DA 3DXKB 3VA3A 3VERA 2Q36A 4GV9A 3L2VA 3R6MA 5SZTA 1T03A 2OA8A 4J8FA 4DR1K 4GKKK 3ENOA 1GLCG 3CJBA 4CW7B 1C6VA 1VSIA 2Y1JA 3UKRA 4FVMA 3P38A 2Z1IA 2E3GA 1VQ9N 2D0CA 1UOCA 3OYGA 4EAHD 2KBKA 2G8UA 3M6GA 5D3GA 4FK4A 2BUPA 1ZXOA 4AM7A 1BWFO 2NNWA 3M8SA 1QE1A 2P9SA 4B3MK 1TYQB 2MZ0A 2YJEA 4CJEA 4LF5K 1B3CA 2E2NA 5K14A 3G4SN 4V19S 1T0ZA 4O8KA 4CF0A 1XRSB 1WSEA 4BVOA 1Z05A 5BRHA 3V1QA 4KYPA 2G8FA 2HBJA 1QHTA 4Z4GA 3G71N 2QWMA 3CCLN 4MDBA 3VA0A 4DV1K 5GAEP 1KLMA 1VK0A 1NM1A 2UU9K 2RE2A 4WFAL 1NKBA 4UAFE 4ISGA 3DLKA 4M7YA 1J5EK 4KHSA 1NGIA 2UUBK 2A1RA 2YNFA 3ZSRA 3QNOA 3O5BA 4YFUA 4I6MA 4GKJK 1NRBA 5AQGA 3E9OA 1JXEA 4A59A 1BA1A 1P90A 4EP4A 2H3GX 2QM1A 1KRPA 2ZQBA 4BRQA 4O44A 2HNDA 3B6PA 1N6QA 2WC9A 1T3VA 1ASVA 4CZIA 1NGFA 3AV9A 4FM1A 3CYGA 1Q82O 2Q3SA 4BRPA 3K9JA 3BP8A 3AY9A 4N56A 3LAKA 4EIAA 3WXJA 4B9NA 4JI1K 3BK3C 3MDQA 3AVAA 5HRNA 3KLEA 3ULEB 4WE1A 3I0RA 4YOXA 4ZHRA 1TK8A 2A6AA 3VQQA 1XC3A 1GLBG 2E2QA 2XHBA 4JI5K 5KK4A 3HZ6A 2VG5A 4GV3A 4ZTFA 3DAWA 4WQ4C 4DR6K 1DKGD 3NAEA 1GOBA 3OW2M 4CD3A 5AR0A 3H46O 1NG9A 4C8LA 1XHZA 1ASUA 4FSVA 1OZZA 3E9LA 5FROA 1ZU3A 2HSTA 2OPSA 1UGLA 3F73A 2Q31A 4JI6K 3PSMA 3A5LC 3VEYA 2HHSA 3CPEA 3VEZA 1BI4A 1HLUA 3K59A 3L4QA 3RMBA 2HMIA 4ISFA 1DEJA 3TPQA 2GV9A 1GLDG 2G8VA 4DSKA 3MN9A 1HX1A 1JKHA 4H5VA 1WSIA 4OX9K 1HR0K 4BRDA 2EHGA 1KAYA 3O3HA 1NK8A 1X9JA 5J2MA 5IT9O 3TAFA 3B8AX 3DOLA 3C7NA 4BE0A 3PX4A 5BPLA 2P1JA 4A5AA 3DLRA 1X9SA 3SAHA 3QFUA 4CGHA 3HO1A 3OYNA 3K5MA 1BIUA 4BDYA 3C6TA 4DV7K 1EO1A 2UXDK 1HPZA 2RF2A 3K5OA 4ELTA 4FW1A 3A0IX 1DJTA 1LAVA 4ZTJA 5LMUK 1RT7A 3SBGA 4BGAA 3U9ZA 3RSEA 1K8KB 2G8KA 3UIQA 4FWMA 4H0OA 4DTSA 1EQYA 3HSTB 4CZJA 1KSPA 1EETA 2D0OA 3MX5A 3ATVA 4O8UA 1NGEA 3R3LA 5M1FA 4RG8A 3GE1A 5AJ3K 1ICAA 3G0ZA 1NLVA 1QZ6A 3D45A 5AFUA 1QQNA 4DKWA 1NK6A 3RWUA 3CC2N 4K43A 1BK8A 2YV0X 3OYCA 4UADE 3SQ1A 3EY1A 5AQXA 2P9UA 2P9NA 3WT0A 4YNQA 4E7IA 3EE9A 4IOAL 3OYLA 4BG9A 4CEEA 3CERA 4IFEA 1SS6A 2EX3A 3IKMA 2QWOA 1O1WA 2D56A 3A8YA 4CERA 3VEWA 3O1WA 5BN8A 5JVHL 1BO5O 4M7XA 3S41A 4DR5K 3AA3A 1C0TA 3OVNA 1J5OA 4BRCA 4AHCA 3DRPA 3LPTA 5A2QO 1HPMA 5AQTA 1QQMA 2O8FB 5H1SQ 2A40A 4FZXC 4CJ5A 3ZT1A 3HM8A 2BE2A 1N32K 2LN8A 5HRPA 1EXQA 4JI7K 3BUZB 4BRNA 1ZC6A 5AQUA 1F21A 4BRMA 1EKEA 1G99A 3WQTA 4CJRA 5CR4A 1S5JA 3KHYA 4CF1A 3HL8A 1VRUA 2E3FA 4B9QA 1G15A 2E2PA 3HRGA 3QB0A 3ALYA 4ELVA 3AA2A 4ISEA 5KI6A 4AF1A 3NF7A 3F2KA 4HHTA 2WTUA 4B9LA 4FVUA 3QEVA 3S5TA 3G6EN 5AQSA 3ZSYA 1I94K 3JXUA 4DQRA 3HT3A 5GIOA 3ZEUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1P00 A;  1NGD A;  2XRI A;  2GEL A;  3OYA A;  1K6Y A;  2HHX A;  3KJV A;  4BRE A;  3SNN A;  1AYJ A;  4LD0 A;  4OGC A;  3CYM A;  4XH5 A;  1IG8 A;  4KHW A;  3TSU A;  5I42 A;  1YIT N;  1K8A O;  3JSM A;  1MDU B;  4K0K K;  4J2B A;  3ENB A;  4JK8 A;  3M8Q A;  3KKS A;  3R2V A;  5I9E B;  3AVG A;  1R0A A;  4V1D C;  4K8X A;  4MQ3 A;  3E7R L;  4E72 A;  4BDZ A;  5JVG L;  4DTM A;  1X1P A;  2HBK A;  1NJZ A;  3FR0 A;  5E26 A;  4AAZ A;  4JKE A;  4JLH A;  2V7Z A;  3DWL A;  4JEP A;  1TUY A;  1HNI A;  1I3A A;  3V9S A;  4DUZ K;  1Q8I A;  2QA4 N;  4CIG A;  2Z1J A;  4Z4H A;  5CHI A;  5AQO A;  3TTF A;  2VWK A;  1JZA A;  2QXF A;  3KHW A;  3CXC M;  5AQV A;  1I39 A;  4GMJ B;  3U3G A;  4CJ3 A;  4H4O A;  4MFB A;  1B9F A;  3ZEU B;  2V7Y A;  3EO3 A;  5C25 A;  4OO1 J;  1C0F A;  1BIZ A;  2XO7 A;  3G25 A;  2D0A A;  3ZSO A;  1NK5 A;  1FXX A;  2GTD A;  3HPO A;  3PO4 A;  4CVN E;  4DFP A;  4CE9 A;  5J2N A;  3ID8 A;  1QZ5 A;  3KK3 A;  5HBM A;  3A5M C;  4DV2 K;  1T6D A;  3DXK B;  3VA3 A;  3VER A;  2Q36 A;  4GV9 A;  3L2V A;  3R6M A; 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