3F9MA

Human pancreatic glucokinase in complex with glucose and activator showing a mobile flap
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
455
structure length
451
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 186
structure length 451
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3f9mA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3f9mA01
3ENHA 4I6MA 2E2QA 3D2FB 4RCHA 5AQFA 1LCUA 3O4WA 3ZX0A 4XEIA 1WUAA 2Q2RA 2WUSA 4M63C 1DEJA 1S22A 2NRHA 2P9PA 3WEEA 3FFKB 2ZGZA 4BRHA 3DAWA 1K8KB 4FSVA 2FLOA 4XH5A 1MA9B 4FWMA 1JCGA 4FPBA 1HKBA 3U8XA 5BN9A 1QQNA 3D2FA 5BN8A 1ATNA 1Z05A 3VOVA 1DKGD 3KZBA 1BA1A 2A5XA 4FWNA 1NLVA 2VWBA 3ZETB 3MDQA 4BRMA 3KVGA 1P8ZA 1C0GA 3UKRB 3J8AA 2E1ZA 3TU5A 3WXLA 3HBTA 3C7NB 5AQSA 1BA0A 1Y64A 1K8KA 5BREA 4FO0A 4GNIA 2Q97A 3ULEB 4BC3A 1U6ZA 3R6MA 4BRLA 3CJBA 5AZIB 1U2VB 4BROA 4A61A 2J4RA 3ZETA 4H5TA 4ISEA 4YDUA 3UKRA 1QZ6A 3DXKA 5EX5A 2E2PA 4RTFD 4B1UB 4BRFA 3C7NA 3QFUA 3CHWA 3CI5A 4BGAA 3ULEA 1QHAA 3VEZA 2GELA 4MO4A 1NGCA 5AZIA 4BREA 5JLHA 1U2VA 4K25A 3HZ6A 4B1VA 3SJHA 3A5OC 3GG4A 3JXUA 1BWFO 4DB3A 1SZ2A 5ADXA 4CZEA 3O1BA 3U4LA 2A40A 3L6QA 3BP8A 4BRAA 2ZF5O 2V51B 3M6GA 4FOEA 2KHOA 3WQUA 1KAXA 3CJAA 3LL3A 5EOYA 3VGMA 1NGJA 3MN5A 3VGLA 1BG3A 5EY4A 5KQDA 4JN4A 4K41A 2Q0RA 5E84A 4A2AA 2GWKA 1HPMA 4NO7A 4J8FA 4IO8A 2VYPA 3WT0A 5AQMA 4H5NA 3O1WA 5I9EB 4PKIA 3D7EO 1T44A 3CQYA 3A5LC 1EQYA 4BC2A 3BF1A 3VPZA 3WXKA 4IXCA 3BUZB 5LJWA 2AA4A 2YI1A 3I33A 3LDQA 4B1XB 3FR0A 3RSEB 1NGGA 4H0XB 2FF3B 2E88A 1Q18A 2P9SB 2PAVA 3VF4A 5ELZA 3QICA 2QM1A 4WQ5A 1IJJA 2P9KA 3MN6A 2OANA 5F2RA 3O5BA 3SK3A 3VEYA 5BRFA 3CJ1A 3AY9A 1NMDA 4ISGA 1IG8A 2P9LB 4CZKA 2E2NA 2VCPA 2CGJA 3P4IA 3EKUA 3RSEA 2Q1NA 3JS6A 1BUPA 2P9SA 2W40A 4FWQA 1GLBG 4BG8A 4PL7A 1X9JA 3KHYA 3IFRA 3TPQA 3WQTA 4BC5A 5AQHA 1H1VA 3HI0A 4FPAA 3VERA 1QQOA 3ZX3A 1NGBA 1D4XA 5BPMA 4YDUC 4H0TB 2W41A 3H1QA 2QW9A 3AAQA 3VGKA 2P9LA 3WUHA 2GEMA 2E20A 4H0YB 1NGAA 4JD2B 1GLAG 4HTLA 2BUPA 3VESA 2YJFA 4O5FA 5B8HA 5BPLA 2E2OA 4A62A 1ATSA 2FF6A 1HLUA 3MN9A 3VF6A 3EL2A 4CZMA 3GE1A 5KPRA 4WYBA 3DXKB 4M7YA 2A42A 4RWTA 4QS9A 4H5VA 3EZWA 4CD3A 4FWOA 4H0VB 4MLEA 2V7ZA 4JD2A 4NB4A 3FZMA 1OKJA 1J6ZA 3LDLA 1RGIA 2NZTA 3DXMB 2IIRA 5AFUH 3AARA 4BGBA 2P9NA 1ZC6A 1GLJO 2GTDA 3VF2A 1MWKA 3LM2A 1BU6O 4C23A 3HSCA 5EVZA 1HKGA 1TYQA 3WXIA 1V4SA 1S3XA 4MLHA 4B9QA 1C0FA 3F9MA 1Z6RA 2P9UA 1X3NA 4WQ4C 2CGKA 3SLCA 2FSKA 1KAYA 1RFQA 2ASOA 5AQVA 4E1JA 4HWIA 4QS7A 3DXMA 3UE5A 1BDGA 4Y0WA 2H3GX 1NGEA 2V7YA 4H5RA 1T6DA 2QWQA 4BRDA 4CD1A 3VETA 4FWRA 4FWKA 2QXLA 3R8EA 1GLLO 1ZXOA 1E4GT 1YAGA 3H3NO 4H03B 4BR2A 2IVNA 5AQXA 1NGDA 3OHRA 3R9PA 1MDUB 4H0OA 3O8MA 4K42A 4BR9A 2NLXA 3ID8A 5BPNA 2YJEA 4CZIA 3A5NC 2PBDA 2YCHA 4WQ5C 4JHDB 4DQ8A 2Q31A 3G25A 4DCHA 3B8AX 2FXUA 4PKGA 3FZFA 4WQ4A 5AQYA 3EN9A 3LDNA 3U9ZA 4EIAA 1BOTO 3DJCA 3ZEUB 2ASPA 4B1YB 5FPMA 2D0PA 1HJOA 5JICA 4O8KA 1KAZA 4IZ9A 2P9KB 4AM6A 1YXQA 3QBWA 4CZFA 3WXJA 4FWPA 1BO5O 4BR7A 3CJCA 1X3MA 3O08A 2F9WA 3GBTA 4JHDA 4B1ZA 5JMVA 1TUUA 3ZX2A 4Z94A 2Q0UA 1NWKA 1JCEA 5F0XA 1NGHA 3ZEUA 3VEOA 3A0IX 3CJ7A 3CIPA 3QMLA 3VENA 1TUYA 2HF3A 1ZBSA 2BTFA 2CH6A 2ZWHA 4K43A 4XH1A 5ADXH 2CH5A 3IDHA 5AQLA 4BG9A 5AQRA 1GLCG 3SMPA 5FPEA 5LJVA 3FLCO 1GLDG 3FE1A 3M1FA 2ITMA 2A6AA 1DGKN 2I7NA 2E8AA 1RDWX 3H3OB 2F9TA 5AQOA 4CBXA 5TKYA 4FWLA 1V4TA 1NGFA 2A41A 5AFUA 4CZHA 4BQLA 5BR9A 3H6EA 2YHWA 3IUCA 2GWJA 2HF4A 5EXWA 5AQPA 3HM8A 4GY2B 4BRQA 3AAPA 1JCFA 3BEXA 2V52B 3MMVA 2P9NB 1QQMA 4BR5A 4IJAA 3C0BA 3BF3A 5AQGA 1YUWA 5KQ8A 3CQXA 1TYQB 2YHXA 1NM1A 5F1XA 4BC4A 2P9UB 3A5MC 5AQNA 3CETA 2Q36A 1HKCA 4EAHD 3L0QA 4JNEA 5FPDA 5KPZA 5AZJB 1ESVA 4BRGA 5E26A 2IVPA 3HTVA 4IWVA 5AQKA 4BRIA 3QBXA 3H1VX 2IVOA 4BR4A 3CERA 4JAXA 1XUPO 2QWLA 4H0PA 2QWOA 4CZLA 1QZ5A 2A3ZA 3EKSA 5KPTA 1G99A 3M3ZA 5AZJA 3I8BA 4BRKA 1SAZA 2DPNA 5AQQA 2D0OA 2GUPA 5AQWA 2P9IB 3O80A 4CZJA 3FZLA 4QS8A 3LDPA 3FZKA 3GDQA 4XH4A 3QDKA 5AR0A 1NBWA 4PL8A 3H46O 5AQJA 1HUXA 2FSJA 3UB5A 3GOIA 4BVOA 4BRNA 1CZAN 1GLEG 3LM9A 2AP1A 4CJ7A 4EHTA 4FOIA 3MK6A 1GLFO 2P9IA 2D1KA 2UYTA 5AQUA 4DHYA 5AQZA 5CE3A 4KBOA 3L4IA 1LOTB 5LY3A 3SMSA 4LC9B 2QWNA 4FL9A 2ASMA 3IMXA 3DWLA 5AQTA 3A8YA 3W3DA 4M7XA 4BRCA 3QFPA 4EFHA 2ZGYA 4PKHA 1XQSC 2E1YA 3MN7A 3ATUA 3QB0A 4BRPA 4MO5A 1SQKA 1ATRA 3W0LA 5BRDA 1KXPA 3ENOA 3D2EB 4CZGA 4ISFA 4A2BA 2I7PA 4CI6A 4F9OA 3H45C 1XC3A 1NGIA 1R59O 4L3QA 3UKUB 4AM7A 2D4WA 3O6WA 1T6CA 4H5WA 2YHYA 3GL1A 3LDOA 3MCPA 5JLFA 4I6MB 1HX1A 3FGUA 2QWMA 3EO3A 4FWSA 1WOQA 4EHUA 2CGLA 2QWPA 1E4FT 5AQIA 3D2EA 2FSNA 2QWRA 3U9DA 4BR0A 4B1WB 4IJNA 3VEVA 2EWSA 3CJ9A 2HMPA 3UKUA 2HOEA 4BQZA 3FZHA 2P9PB 4BVPA 5FPNA 3VEWA 5BRHA 3WEEB 3VEXA 1MWMA 4CBWA 3ATVA 4CBUA 3S41A 1YVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ILYA 3ENHA 4I6MA 3TWHA 1NJXA 1LWEA 4CK3A 4JK9A 1C0TA 2E2QA 1RT1A 1NJWA 3LZJA 4ELTA 1IKXA 3O4WA 2UU9K 1CZBA 3ZX0A 2ZD1A 4B8AB 4DF4A 4M63C 1S22A 2NRXA 3HVRA 5HRPA 3IAYA 4DU4A 2FLOA 4WE1A 1J5OA 2E6MA 4FWMA 4CEQA 2OPPA 3TTFA 4FLTA 4FPBA 1HKBA 4YOVA 3TAGA 1QQNA 3U3GA 4J2AA 4FZXC 1ATNA 3VOVA 1QTMA 3KZBA 2A5XA 4BWJA 2VWBA 5J2QA 4I2QA 2DTUA 3WXLA 1JLAA 1BA0A 1FXXA 4CJSA 3HT3A 4BC3A 1U6ZA 3R6MA 4CHNA 3CJBA 3K57A 4DU3A 1BGXT 4BROA 1VQ4N 4C8OA 5IWAK 3DLEA 4RTFD 4B1UB 3C7NA 3NE6A 1J54A 4DV1K 3K5MA 1XI1A 4AH9A 4BGAA 3WNEA 3VEZA 2GELA 4DS4A 4DQIA 4OX9K 3CFPA 1NGCA 5AZIA 4BREA 1C1CA 1YTAA 3B6PA 4K25A 3A5OC 3GG4A 3DLRA 1BWFO 4OKEA 3I0SA 4KHUA 4JV5K 5ADXA 4FK2A 3O1BA 3U4LA 4HCBA 4B9LA 4KTZA 4CIGA 3ALYA 5M1FA 1KAXA 5AJ3K 1A5XA 2XO7A 3OYCA 4K41A 4DKWA 1RDBA 4A2AA 1HYZA 3O4NA 4DR4K 3WT0A 4DTOA 3K5LA 4H5NA 3WNHA 5I9EB 3C65A 4TSXA 3SAFA 2X78A 3D7EO 3HPGA 3CQYA 3QLHA 3A5LC 2OYQA 3K5OA 3O9UA 4BE0A 3Q7CA 3BUZB 3V9SA 1M90O 3V81A 4R5PA 4MDAA 3LDQA 4GKKK 3S3NA 1N36K 3JYTA 4FJMA 5GAEP 4DLEA 3QICA 4CGDA 4WQ5A 1IJJA 3AV9A 3MN6A 5HROA 4JK7A 2PYJA 4OGCA 1G15A 5GIPA 3HP9A 3SK3A 3DRPA 3VEYA 1IG8A 1T3VA 2P9LB 4CZKA 1Q9YA 5MLCQ 3RSEA 2IAJA 3RR8A 1BUPA 2P9SA 4PL7A 3K0SA 4FJ8A 2RPIA 4YHHK 5GAGP 4FXDA 3VGKA 2O8BA 1NK4A 4DV5K 3MECA 3N4QA 4CEFA 4NLCA 3CCSN 4NYFA 4O5FA 4F4KA 1ATSA 4ID1A 1UAXA 1FJGK 1A5WA 3NF6A 4WYBA 4M7YA 1CZ9A 4RWTA 4QS9A 4WFNL 3ZLJA 3EZWA 4YOYA 3ULDA 3PX4A 3T7ZA 3IS9A 4H0VB 4F3TA 1EWQA 3MXIA 4C8KA 1ASWA 1RT7A 1QVGM 3WXMB 4OKJA 2GTDA 3VF2A 4JI5K 4FM1A 2HBJA 4JEPA 1MWKA 2XHBA 4C23A 3RRHA 4IG3A 5EVZA 1TYQA 1S3XA 3NH2A 2P9UA 3F9MA 3UIQA 1XMQK 1RFQA 2ASOA 3NFAA 3KLHA 5AQVA 3DXMA 1TK0A 3RVCA 1CLQA 3SI6A 1NG9A 1BDGA 4Y0WA 5CZ1A 2XY5A 3AA2A 4H5RA 3LALA 2QWQA 4DUYK 1QQCA 4IEEA 5HL7L 1OH8A 3QIPA 2GBZA 2WONA 1RNHA 5I3UA 3R9PA 1Q8IA 1WSJA 4KH6A 1L3VA 1L3SA 4K42A 5BPNA 1S6PA 2YJEA 5GAHP 3KWGA 2PBDA 2W6KA 4WQ5C 3HK2A 2Q31A 1N8RO 3B8AX 2ASPA 3VN5A 4KI4A 1C0UA 2ATQA 3ZT1A 4ZHRA 3TAQA 5JICA 1KAZA 2P9KB 4AM6A 2VG6A 4CZFA 3WXJA 4LFCK 3CJCA 1X3MA 4B08A 1WLJA 4B1ZA 2W6LA 4I2PA 1TUUA 4F3OA 3S3MA 4JS5A 1TAUA 1RDCA 5F0XA 4Z4CA 1TUYA 4J2BA 2CH6A 2WFBA 2RE2A 4XH1A 5LL6Z 4BG9A 1XC9A 5CHIA 5LJVA 4DSKA 3ZYYX 3F73A 3FE1A 5HBMA 2ITMA 1FKOA 2E8AA 2AJQA 2FC0A 1RTJA 1TL3A 3VTHA 1ZBIA 2BH1A 4BQLA 3D0PA 1KLMA 4CEOA 4DV2K 4YOWA 3K59A 1BIUA 3HPHA 1E3MA 2IGIA 4AILC 5AQPA 3HM8A 2KZZA 1O13A 2D0CA 3VQ7A 3T3FA 3DI6A 1JCFA 1KFSA 2P9NB 3PSFA 1QQMA 3OS2A 1K9MO 3AVNA 1RBTA 2BE2A 3LANA 3HXMA 4DLGA 1JLFA 3PIOL 1YUWA 3C6UA 2YHXA 4FJKA 2YNIA 4CHYA 5HOOA 4Z4FA 4JI4K 3KD1E 5AQNA 3SUNA 2Q36A 1HKCA 3ZT2A 4EAHD 3ZT3A 2E5LK 3L0QA 4JNEA 5KPZA 3VQ5A 4UY8O 3B6OA 5KRSA 4N76A 5E26A 2IVPA 1B9DA 4NLBA 4FW1A 4BRIA 2YV0X 4E1NA 3LP1A 3R3LA 4BR4A 4CFAA 3F9KA 4DV0K 3TI0A 4CF8A 1RBVA 4H0PA 3T1YK 1IG9A 3NF7A 1QZ5A 2A3ZA 2X6SA 4HTUA 3ASMA 5AZJA 2DFFA 2F96A 1FKPA 3L2WA 1DTQA 4KREA 3ZT4A 2GUPA 5AQWA 1JL2A 4CZJA 1VSFA 1JLBA 4CCHA 3QEWA 1W9HA 3FZKA 2QK9A 2R7YA 2FSJA 3UB5A 3GOIA 3WNFA 4BRNA 3M8QA 1VQ6N 1CZAN 1GLEG 3NAEA 2AP1A 5CZ2A 3T1AA 1I39A 4PQUA 4M3ZA 1W97L 2UYTA 4KBOA 3L4IA 2O8EB 4DSFA 1LOTB 3CCQN 4LC9B 2QWNA 1VSDA 4FL9A 3IMXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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