4H0PA

Crystal structure of acetate kinase from cryptococcus neoformans
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
431
structure length
431
Chain Sequence
AEYLLAINCGSSSIKGKLFAIPSFELLANLAVTNISSSDERVKIKTTWEEGKGKDSEEEADYGDKIRYASLVPILLDHLTNSTHVKKEEIKYVCHRVVHGGMHDKGIRVVKGHEEGLMEMDKLSEFAPLHNHRAVLAVKSCIDALPHHTSLLLFDTIFHRTIAPEVYTYALPPPDTELTMPLRKYGFHGLSYASIVQSLAEHLKKPSDQINVVVAHLGSGSSSCCIKNGKSIDTSMGLTPLEGLLGGTRSGTIDPTAIFHHTEDAASDANVGDFTVSKAEIILNKNSGFKALAGTTNFGHIIQNLDPSKCSEEDHEKAKLTYAVFLDRLLNFVAQYLFKLLSEVPIESIDGLVFSGGIGEKGAELRRDVLKKLAWLGAEVDEEANNSNSGGAVKCITKEGSKLKGWVVETDEEGWMARMAKEEFGFLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords acetate kinase
publication title Crystal structures of acetate kinases from the eukaryotic pathogens Entamoeba histolytica and Cryptococcus neoformans.
pubmed doi rcsb
source organism Cryptococcus neoformans
total genus 141
structure length 431
sequence length 431
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA02
2ZF5O 3CQYA 3L6QA 4K42A 3QICA 3QFUA 5BR9A 1NGGA 4BG8A 4BC4A 2IVNA 3HZ6A 3CJCA 4CZGA 4FL9A 4BGAA 3UKRA 3F9MA 3D2EA 1YVNA 4IJAA 4A2BA 5B8HA 3QBXA 3WQUA 5BREA 4F9OA 4FO0A 4H0PA 3CIPA 2EWSA 1YUWA 2GTDA 2A5XA 5TKYA 2I7NA 5EOYA 4DB3A 1NGBA 3D7EO 3H6EA 3MN9A 3WXIA 3AY9A 3VF2A 1RFQA 3VOVA 4MO5A 3VPZA 5BRFA 4BR4A 2YHWA 4JN4A 3GBTA 3DAWA 1QQMA 1EQYA 1SQKA 3H3NO 1NGHA 3WQTA 2V52B 5AQQA 3H1VX 1MWMA 3JS6A 4CZFA 5FPNA 3O1WA 3B8AX 4KBOA 4BQLA 4C23A 2AP1A 3ZETB 3IFRA 4PL7A 3L0QA 4JNEA 4EFHA 3MMVA 4DHYA 3O80A 2ITMA 1XUPO 4JHDB 4HWIA 3WT0A 4B1WB 2BUPA 1QQNA 1K8KA 3BF1A 1CZAN 3ZX0A 2E20A 3GL1A 2NZTA 5AQMA 3FZMA 1XC3A 2H3GX 3UB5A 3FZFA 3CJ1A 1T44A 3J8AA 3WEEB 3R9PA 3VF6A 5E26A 2Q36A 3BEXA 4K41A 2E2QA 4QS9A 5F0XA 3FLCO 2CGLA 1GLDG 5E84A 1MA9B 3RSEB 3H45C 3LDPA 4XH4A 2F9TA 3S41A 5KQDA 1ATRA 2P9NA 3MCPA 5AFUH 3ATUA 2A6AA 5AQTA 2GUPA 3R6MA 3GOIA 3ENOA 2E1ZA 2CH6A 3BF3A 3DXKA 3H3OB 4DQ8A 4BRIA 1NGFA 4EAHD 3VGMA 4BRKA 4IZ9A 1ZC6A 4FWSA 1HX1A 4NO7A 4LC9B 2IVPA 1GLEG 5AQXA 3U8XA 4BR7A 4MLEA 5AQLA 1JCEA 3VEWA 4BRGA 3LM2A 3LDLA 1GLJO 4H5TA 4BR5A 3OHRA 2F9WA 3AAQA 2ASPA 2VCPA 5AQGA 1Z6RA 3L4IA 3HSCA 5AQWA 4HTLA 3W0LA 3A8YA 4JHDA 3G25A 3ZEUA 3MK6A 4M7YA 5BN8A 2VYPA 3MDQA 2KHOA 5KPZA 3EL2A 1QZ5A 1QHAA 4PKHA 5AQIA 2A40A 2P9PB 4BVOA 3WEEA 3VEXA 1K8KB 1J6ZA 1T6CA 3A5NC 5KQ8A 1BA1A 3U9DA 4M7XA 1ZBSA 2GELA 3C0BA 3EKSA 2HMPA 3EZWA 4PL8A 5AQKA 3RSEA 3GG4A 5AQSA 5BN9A 4FSVA 1NGAA 2FLOA 3D2FA 3UKUB 4PKGA 2HF3A 2V7ZA 4GNIA 1D4XA 3QFPA 1U6ZA 3QBWA 5EXWA 1OKJA 4BQZA 4IXCA 2P9NB 3VEYA 4JAXA 1E4FT 5BPLA 2YJEA 1T6DA 4BRPA 4M63C 4O5FA 5BRHA 3DXKB 4WQ4C 1S22A 3UE5A 5KPRA 4CZIA 3VEVA 2YJFA 3QMLA 4Y0WA 2FSJA 2GEMA 4FOIA 4H0TB 5LY3A 2D1KA 4YDUC 4K43A 3FZHA 2E2PA 5AQJA 3A0IX 3ULEB 2W41A 4J8FA 2OANA 1IJJA 5JLHA 3SK3A 1X9JA 2ASOA 4BRMA 3O8MA 1G99A 3BP8A 2Q31A 5FPMA 4FWNA 3HM8A 1RDWX 2PBDA 4WQ5C 3ENHA 2FXUA 1ATSA 1ATNA 1BO5O 3ZX2A 1NWKA 2QWRA 2P9PA 1YAGA 2E2NA 3VF4A 3VERA 4BRCA 4H5WA 2QWQA 3P4IA 3FR0A 3ZEUB 2QW9A 1KXPA 1HKCA 5I9EB 5LJWA 1ESVA 2WUSA 4BRHA 5AQVA 4XEIA 2ZGYA 3CJ9A 1KAYA 3WXKA 4MO4A 2W40A 3U4LA 3UKUA 3CJBA 3IDHA 4CD1A 1YXQA 2V7YA 1P8ZA 4CZKA 4BR0A 3FZKA 4BRDA 3TU5A 3D2FB 1U2VA 4BRLA 3AARA 4EHUA 3U9ZA 4NB4A 2DPNA 4AM7A 4CBXA 3C7NB 4BGBA 2QWPA 3FZLA 1LOTB 4AM6A 1WUAA 4BC3A 1BG3A 1QQOA 3DJCA 4WQ4A 2D4WA 2E88A 2HF4A 5AQOA 3HTVA 3KZBA 3O1BA 1Y64A 5BPMA 3VENA 2Q0RA 3I8BA 3ULEA 4YDUA 1HKGA 4BROA 3LL3A 4IO8A 5AQYA 4K25A 4H0VB 2FSNA 2GWJA 2A3ZA 4L3QA 1DKGD 5ELZA 3VESA 4I6MB 1DEJA 3MN5A 2AA4A 4BRAA 5JMVA 5EVZA 3ZX3A 1DGKN 1BA0A 2IIRA 3CQXA 4FWPA 3M6GA 4CI6A 4CBWA 5BRDA 4CJ7A 3LDOA 1NGEA 1GLBG 5AZJA 4CBUA 2V51B 5AR0A 3M1FA 3WXJA 2ZGZA 4FWMA 1HUXA 1NM1A 2YCHA 2YHYA 3A5OC 4FPBA 4EIAA 1XQSC 4B1VA 2D0OA 2QWNA 2QWLA 4BC5A 2UYTA 1V4SA 2QWMA 5AQRA 1BDGA 4Z94A 2P9UB 2I7PA 1MDUB 3CJAA 1ZXOA 3M3ZA 1GLAG 4CZHA 1GLLO 4BG9A 1TUUA 5F2RA 3EN9A 3O08A 4JD2B 3DXMB 5ADXA 2J4RA 2ZWHA 3CETA 4BR2A 2P9IB 3ID8A 3C7NA 2Q0UA 5AZIA 1U2VB 2FSKA 4ISGA 2HOEA 2FF3B 4A62A 4IWVA 4CZLA 5AQZA 4H5RA 3MN7A 1JCGA 2E1YA 5BPNA 2CGJA 1IG8A 3GDQA 4EHTA 1NMDA 1C0FA 1GLCG 1HPMA 3IMXA 3SLCA 3VEZA 3WXLA 2E8AA 2A41A 1NGCA 1C0GA 4I6MA 3EKUA 2QWOA 4E1JA 1S3XA 4CZEA 4BC2A 3A5MC 2P9LB 3O4WA 4BRNA 2Q1NA 4BREA 1NGIA 1NGJA 3QDKA 4FWRA 4CD3A 1BOTO 4H5NA 4H03B 5F1XA 5AQNA 1BU6O 3CJ7A 4B9QA 2IVOA 1X3NA 4FOEA 3JXUA 4B1XB 3BUZB 2D0PA 1MWKA 5AQFA 2P9UA 4BR9A 5AZJB 3LDQA 3VGLA 5FPEA 2P9SB 3QB0A 2CH5A 4ISEA 1SZ2A 1KAXA 2QM1A 4H0YB 2Q97A 4JD2A 3DXMA 2P9KA 3R8EA 1TYQA 2P9IA 3DWLA 5KPTA 2VWBA 4FWKA 1X3MA 3IUCA 4RTFD 3HBTA 3TPQA 1Z05A 3H46O 2YHXA 4XH1A 1GLFO 4CZJA 4B1UB 4H5VA 3MN6A 1KAZA 1NLVA 3CERA 3HI0A 5AZIB 3AAPA 1R59O 3KVGA 4QS8A 4RCHA 5JICA 4IJNA 3I33A 3WUHA 2BTFA 2CGKA 5EY4A 3VETA 5LJVA 3LDNA 1WOQA 1E4GT 3SMSA 2FF6A 3UKRB 4A2AA 3D2EB 2P9LA 4GY2B 5AQPA 1TUYA 1SAZA 1V4TA 4DCHA 3KHYA 5FPDA 2Q2RA 1RGIA 3ATVA 3SMPA 1BUPA 3LM9A 3CHWA 1HLUA 1HKBA 4WQ5A 1Q18A 4A61A 3VGKA 5AFUA 4CZMA 4H0XB 5CE3A 1H1VA 4FWLA 1JCFA 4B1ZA 5ADXH 4FWQA 2A42A 4BRFA 2QXLA 4BVPA 2P9SA 3ZETA 1NBWA 1HJOA 5EX5A 5JLFA 4RWTA 4FPAA 2E2OA 3O5BA 2PAVA 2NRHA 4H0OA 4QS7A 1QZ6A 3GE1A 3H1QA 4ISFA 3VEOA 3FGUA 3CI5A 3W3DA 4PKIA 1NGDA 4WYBA 3FFKB 2P9KB 3A5LC 5AQHA 4B1YB 4BRQA 1LCUA 1TYQB 4FWOA 3O6WA 4XH5A 3SJHA 5AQUA 2GWKA 2ASMA 3EO3A 2NLXA 3FE1A 2YI1A 4O8KA 1BWFO 4MLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YITN 1T03A 3U6FA 3NGZA 3U3GA 4KB1A 3QICA 3QFUA 2IVNA 4AILC 3CJCA 4CZGA 5KI6A 4CFBA 3UKRA 4F9OA 2E6MA 4KO0A 2YNHA 1OH8A 4DB3A 4KHNA 2E5LK 4AHCA 2HHVA 3AY9A 3IG1A 4IG0A 1NOZA 2Z1HA 3THXB 4QAGA 4JN4A 3ITHA 1J5OA 3DAWA 3THYB 1SQKA 3NVMA 3H3NO 3R1XA 2V52B 4DS4A 4CVNE 2OA8A 3JS6A 3RMAA 1KRPA 2FBXA 4KH6A 4Y1DA 4C23A 1NKCA 3IFRA 4NXNK 4IG3A 3QNOA 3L0QA 4EFHA 1Q81O 4CJUA 4OJRA 1QQNA 5C25A 1CZAN 2E20A 1RILA 2NZTA 3UB5A 4JS4A 1Z26A 2ZJRL 1OH7A 2YV0X 3O3FA 1W7AA 3WEEB 3NAEA 1X9MA 1VRTA 3R9PA 5E26A 4LF8K 4NCGA 3CM5A 1L3TA 5E84A 3H45C 4UQGA 3MXJA 2Q3SA 1NK5A 1HJRA 4KTWA 4LH4A 2E1ZA 2CH6A 3DXKA 3HOSA 3NF6A 3ZSZA 3H3OB 1HNXK 4BRIA 3KLIA 4AHVA 1ASUA 3DRPA 2FBYA 4FWSA 3CMAN 1ZBLA 3RVCA 3OYDA 1VQ6N 1TL1A 3KKRA 4M3TA 4GVMA 3LM2A 5TKWA 4FJKA 2PYJA 4K0KK 5AQGA 3MEDA 4FJLA 3HYFA 2G8WA 4F8RA 1B92A 2G8VA 3G25A 3HK2A 2WC9A 4TSXA 1FJGK 4JEPA 1KD1O 4B9SA 3MECA 5DM7L 4PKHA 5AQIA 3V9SA 1NJIO 1J6ZA 3SZ2A 4JKGA 4U67L 5J2QA 4FLWA 1VQ9N 3A5NC 1KVCA 1E3MA 1BA1A 4OGEA 3PO5A 1TGOA 3EKSA 4PHTX 5AQKA 5AQSA 2FLOA 2HBMA 2HF3A 4N56A 3SBGA 3SV3A 3SYZA 3ZSWA 3UIQA 3K59A 1RTHA 4BQZA 4JI7K 3AVGA 3L2UA 2OTJN 4YNQA 3VEYA 4X62K 1BQMA 3H08A 4CJKA 4M63C 4CHNA 4M3WA 1QSSA 5J2MA 2GEMA 3M8RA 2D1KA 1RBVA 4YDUC 4DR1K 3FZHA 4LY7A 3AGRA 3ENBA 4DFMA 3PX6A 2E2PA 3EYZA 5AQJA 3RMBA 4PUOA 4J8FA 5JLHA 3OYFA 1BIUA 2ASOA 1RT1A 1X9WA 2Q31A 1EWQA 5FPMA 4FWNA 4WQ5C 4C1NI 2P9PA 4KI4A 2R7YA 4H5WA 3V1OA 3ZEUB 4DSKA 1KXPA 1GOBA 1OVYA 5AQVA 3C65A 3CJ9A 1IO2A 2KQ2A 2ZE2A 3KK3A 3AVLA 1ZBFA 3EE9A 3PLAA 5LMUK 2W40A 4B9LA 3U4LA 4JI5K 1UWBA 3IDHA 1VQ5N 5SZTA 3NE6A 2V7YA 3PIOL 1RT6A 5I3UA 3DLBA 1KLMA 3FZKA 4CEFA 3TU5A 3D2FB 1U2VA 3KLHA 2W6KA 4NB4A 3SAGA 3KWIA 5HRSA 3OS1A 5C2FA 3IRXA 3FZLA 2BE2A 4B9TA 1N33K 1QQOA 4FLXA 5AQOA 3J7YP 5K14A 2HHHK 3M5RA 1CXUA 2X6SA 1HKGA 1NMNA 1N5YA 4DQQA 3QLHA 5AQYA 3ZSQA 3OVNA 5I42A 1TKXA 3LWMA 1RT2A 2F8TA 1DEJA 1NK4A 3ZSVA 5EVZA 4Z4CA 1NKBA 1BA0A 2YNGA 3TTDA 2QKKA 2IIRA 3HPGA 4FLTA 3M6GA 1N8RO 4CI6A 3I8DA 4DTSA 3QEXA 4A57A 4OVLA 1NM1A 3A5OC 4EIAA 1FW6A 2D0OA 2QWLA 4Z94A 2UYTA 4DV6K 3CJAA 4FVUA 1OH5A 1ZXOA 3M3ZA 1GLAG 1Z25A 4E1MA 3EN9A 2VG5A 4IOXA 2DFFA 4BDZA 2BH1A 3SQ2A 3ID8A 4EP5A 1ZBIA 5HROA 1YTAA 2HOEA 1B9FA 2FF3B 4MDBA 2YHAA 4H5RA 4CJRA 1T3VA 3MN7A 3QEIA 3CCLN 1JCGA 1KTQA 4KFBA 2IC3A 4CHZA 4F2SA 3DRSA 1NMDA 4LF9K 3WXLA 2E8AA 4CJ5A 3OBYA 1C0GA 2WBNA 4I6MA 3ZSXA 2QWOA 4OPKA 1S3XA 4JYAK 1K73O 4BRNA 1T05A 4LD0A 3S9HA 1U49A 3QDKA 4CD3A 4H5NA 4H03B 5F1XA 3THWB 4FCYA 1HNZK 1BU6O 3VMFB 3O9SA 3K5NA 4B1XB 4KHWA 4RW8A 4CEZA 2P1JA 1XMQK 2E4LA 4KHSA 1MWKA 3ALYA 1DTTA 4BR9A 3LDQA 4YOWA 4FJ7A 2RPIA 2VQFK 3D0PA 5FPEA 2QM1A 4H0YB 4JD2A 1WNSA 1GOAA 4CEDA 3R8EA 2P9IA 1TKTA 2QK9A 3TPQA 3HXMA 1LAVA 4XH1A 1JLEA 4CZJA 4IO9L 5JS1A 3CERA 3HI0A 4J2AA 4RCHA 3WXMB 2XY6A 1LW2A 4IJNA 4CE9A 2CGKA 3G6EN 5EY4A 3LDNA 4KB0A 2XHBA 1E4GT 4B9UA 4FLUA 1NK8A 1X1PA 4B3MK 4FJXA 2HHSA 1RBUA 3UKRB 1KFSA 4JKHA 4GY2B 1TUYA 2O8CA 2Q2RA 4FVMA 3AO2A 3SMPA 1HNVA 4JKDA 4YY3K 4JLHA 3HP6A 1Q18A 5KTQA 5FDLA 4A61A 2AJQA 3VGKA 5AFUA 2JLEA 4J2BA 3OJUA 2UXBK 2A42A 4CF0A 4B9NA 2PYLA 4CJVA 2D0BA 4JI1K 4LSNA 5EX5A 4DF4A 4W5OA 2E2OA 4H0OA 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3AAQA 2ASPA 4M3YA 1Z6RA 4HTLA 4JHDA 1UA0A 3KTQA 3TSQA 4CK1A 1C1BA 3DRRA 3MK6A 5M1QA 2HVIA 3MDQA 1WB9A 1LWEA 2A40A 2P9PB 4GW6A 4CGDA 1K8KB 3QINA 3CC7N 3DI6A 2JGUA 4AH9A 5KQ8A 3U9DA 1IBMK 3O4QA 1ZBSA 2GELA 3C0BA 3EZWA 4PL8A 3NMUA 4FSVA 4C8LA 4NCBA 3RMDA 2P51A 5KRSA 4M3ZA 2RKIA 2V7ZA 3WNFA 1D4XA 4CJ3A 1IKVA 1OKJA 2DTUA 4IXCA 5GIPA 3SUQA 4O0JA 3O9RA 3T1HK 4YFUA 2HMIA 1U45A 1VSJA 2YJEA 2VG6A 1T6DA 4BRPA 4W5NA 4AQYK 1YF5L 3AO5A 1RDAA 1M1KO 1S22A 4C8OA 1JXBA 3VEVA 2ATQA 4Y0WA 4ELUA 1VQ4N 5GAGP 1D5AA 2Z1IA 5LY3A 3HPOA 5H1SQ 3BZCA 4M3UA 4K43A 1TL3A 4CF8A 4E1NA 5GINA 4CCHA 4FZZA 1IJJA 3CCSN 3RR7A 3SK3A 3OS2A 2P5OA 4GMJB 1G99A 1RDWX 3R3LA 2FXUA 4CEOA 4DF8A 3VF4A 4FJNA 3QEVA 1VSEA 3SQ0A 5IT9O 4DTRA 2BGGA 1ESVA 2WUSA 4XEIA 3PY8A 4IDHA 3MEGA 3VQ9A 4LF4K 3VQPA 4MO4A 1S1WA 2IS3A 3UKUA 2OTLN 3CJBA 4E19A 4CFDA 1P8ZA 1JLBA 4BR0A 4BRDA 1WSFA 4IFVA 1RBTA 3KK1A 4O55A 4BRLA 2F8SA 4JKAA 1JL1A 4JI8K 1IKXA 4CEEA 3E9LA 2DPNA 4AM7A 3E9OA 4J2DA 1LOTB 4AM6A 3OYGA 1WUAA 4CIFA 2E88A 3EE8A 3HTVA 1NNEA 1LWFA 4JKCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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