1NGFA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFNLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
total genus 121
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngfA04
3VEYA 5EY4A 4M7XA 4O8KA 4BC2A 3ENOA 2QW9A 4GY2B 4CZMA 1SZ2A 2QWPA 2A40A 2PAVA 2A42A 4JNEA 4O5FA 4K41A 4BQLA 3A5MC 5FPMA 4BVPA 3IUCA 3I33A 4J8FA 2CH5A 3CJ7A 3SMSA 4CZFA 3MN9A 2D0PA 3VF6A 3R8EA 5LY3A 2QWRA 1ESVA 4CZGA 3A0IX 3VERA 1Z6RA 3IFRA 4IO8A 1QZ5A 1GLDG 4FSVA 2GELA 3WXIA 1D4XA 2DPNA 5F2RA 3O1WA 3UKUB 3W3DA 3H45C 1YVNA 3H46O 3ZEUA 2Q0UA 3MMVA 4C23A 1YUWA 3H6EA 4MLEA 5B8HA 3QDKA 5AQKA 5BN9A 3SMPA 3GOIA 2AA4A 2GTDA 1XUPO 2A5XA 4F9OA 1KAYA 3QMLA 2Q0RA 3M3ZA 4MO4A 1TYQB 2VWBA 3CJBA 3VEWA 1R59O 1GLCG 3ULEA 4IWVA 5KPZA 4WQ4C 2V7ZA 2E2QA 1DKGD 2V7YA 3MDQA 4B1UB 3WXJA 1NLVA 5BRHA 2P9UB 2FLOA 4CBWA 1ZBSA 4H0PA 1XC3A 3DJCA 2P9PB 3W0LA 1YAGA 2E1ZA 3HI0A 4BRDA 2FSKA 2V51B 2GEMA 3AY9A 5AQOA 5AFUA 3QBWA 4H0OA 3SK3A 4BR9A 1BUPA 3DWLA 5KQDA 4WQ5C 4GNIA 1HPMA 4BRQA 2IVNA 2YI1A 3C7NA 1V4TA 5AQXA 3BUZB 5AZJB 4BRLA 3IMXA 4WQ4A 3CI5A 1HX1A 5AQQA 1NGEA 1KAXA 1ATNA 5AR0A 4AM6A 3LL3A 3VF4A 3A5OC 4MLHA 5AZIA 3KVGA 1IG8A 3WXLA 1GLAG 2I7PA 1KXPA 1NGBA 1T44A 5BPMA 3VEVA 2IIRA 3VGMA 5AQRA 4MO5A 4WQ5A 2I7NA 3UKUA 4CZKA 4RTFD 2ZF5O 1DGKN 2D0OA 4BR7A 5F1XA 4K42A 4DQ8A 3EKSA 3UB5A 4FL9A 4BRGA 2E2OA 4FWNA 1QHAA 3QB0A 4FOEA 3GDQA 2J4RA 3KZBA 4FWQA 2A41A 1TYQA 5LJWA 2ASPA 3I8BA 3TPQA 3M1FA 5AFUH 3FLCO 3ULEB 4H5WA 3O08A 2P9UA 4PKGA 3BF1A 3FR0A 5AQYA 2P9PA 3VEOA 2HF3A 3FZHA 3WQUA 1E4FT 1HJOA 4DCHA 1GLBG 3AARA 4B1XB 4PKHA 2FSJA 2UYTA 4ISEA 3U9ZA 3WEEB 2HMPA 2QWOA 4B1VA 4LC9B 3QICA 2QWQA 4I6MB 2E88A 2ZWHA 2F9WA 1V4SA 3R6MA 4M7YA 3ATUA 3VGLA 4BR2A 3D2EB 4AM7A 1U6ZA 2FF6A 5AZJA 4CJ7A 3C7NB 1NBWA 3FZKA 4PL8A 1Y64A 4BRIA 3EN9A 5TKYA 5FPEA 2FSNA 2QM1A 3AAQA 3L4IA 1BU6O 5AZIB 3UKRB 1U2VB 4BRAA 3G25A 4B1YB 4BRFA 1NGHA 3M6GA 4EHTA 1HKBA 2CGLA 3HZ6A 1KAZA 2Q31A 5FPNA 4K25A 4B9QA 3P4IA 3AAPA 2CGJA 1WOQA 3FZLA 3WUHA 4A61A 1YXQA 1NM1A 4BROA 1GLJO 4BC4A 3GL1A 1JCEA 3CQYA 4NO7A 5BREA 4IJAA 3R9PA 3O5BA 4NB4A 4QS7A 1NGDA 4BRNA 1Q18A 3MN7A 2F9TA 1ZXOA 3BF3A 1QQOA 3HTVA 4CBXA 5AQFA 4PKIA 2QXLA 4BRPA 2P9KB 4KBOA 1LCUA 2PBDA 2CGKA 2NLXA 1BA1A 2QWMA 4BRKA 3LM9A 2Q2RA 5AQZA 1ATSA 5EXWA 3O8MA 1MWKA 1S22A 2BUPA 4JD2A 1RFQA 2YCHA 3LDLA 3WEEA 4I6MA 5AQJA 4B1ZA 5JLHA 5EX5A 3D2EA 4H5TA 3EO3A 3VGKA 4BGBA 4WYBA 3FZMA 3S41A 2GUPA 5AQVA 3O4WA 1SAZA 2VYPA 4EAHD 2A3ZA 4BRHA 5ELZA 1HKGA 2IVPA 3MN6A 3UKRA 1U2VA 4A2BA 4CZEA 4A62A 3CJ1A 3VENA 4H0TB 3H1QA 4ISGA 4FWMA 3VEXA 2YHWA 3O80A 3EZWA 1TUYA 5JICA 3LM2A 4JN4A 5BRDA 3D7EO 3FGUA 4K43A 2D4WA 3GE1A 3VF2A 3ATVA 2YHXA 4JHDB 3FZFA 4ISFA 3O6WA 3FFKB 5AQLA 4CZIA 4H5RA 2EWSA 1NWKA 2GWJA 5AQPA 2HOEA 1C0FA 4BR4A 4Z94A 1BWFO 2Q36A 1SQKA 3EKUA 1OKJA 2YJFA 3CJCA 1ATRA 1BDGA 3SJHA 1RGIA 4FO0A 2P9LB 5FPDA 2P9KA 4IJNA 3ZETB 5ADXA 3A5NC 1NGCA 2E2PA 2P9IA 1BO5O 3LDPA 2YHYA 1X3NA 1EQYA 4QS9A 1MA9B 4IXCA 1J6ZA 4JD2B 1QQNA 2NRHA 2E2NA 4XH1A 3HM8A 1NGIA 1HLUA 4JAXA 4XH4A 1TUUA 2E1YA 5I9EB 3CETA 4B1WB 1CZAN 2AP1A 5AQGA 2FXUA 5AQUA 3IDHA 1BG3A 3RSEA 3UE5A 3F9MA 4RCHA 5CE3A 3C0BA 3HBTA 4FWKA 3DXMB 3H1VX 3WT0A 3L6QA 3U4LA 5AQIA 4FWRA 4CBUA 3MN5A 1H1VA 4BQZA 3JXUA 2V52B 3DXKA 2YJEA 3MCPA 3A8YA 1GLFO 2BTFA 1BA0A 4HWIA 5BRFA 2P9NB 4BREA 3CIPA 3LDNA 4H0XB 3B8AX 2P9SB 5JLFA 3A5LC 4JHDA 3H3OB 4H0YB 1NGJA 2VCPA 1G99A 2ASMA 5ADXH 4CI6A 5E26A 2IVOA 1S3XA 1X9JA 4BC3A 4IZ9A 4EHUA 2HF4A 3VETA 4XH5A 4Y0WA 2E8AA 2P9LA 5KQ8A 4FWOA 3ZETA 2NZTA 1MDUB 2ZGZA 5AQNA 4H03B 4EFHA 3WQTA 1C0GA 1T6CA 3VOVA 2P9IB 4CZLA 1E4GT 2ITMA 4BRCA 2QWLA 4EIAA 5E84A 1Z05A 4FWPA 4BG8A 3ZX2A 2OANA 2Q1NA 4H5VA 4BVOA 2D1KA 1WUAA 5BPLA 4H0VB 1DEJA 2WUSA 3KHYA 3D2FB 3U8XA 1X3MA 3CJAA 3RSEB 2GWKA 3DXMA 3WXKA 1HUXA 4XEIA 3OHRA 1NGFA 1XQSC 3LDOA 5KPTA 3EL2A 4BR0A 5AQSA 4YDUC 5AQHA 1K8KB 2H3GX 3L0QA 3DXKB 1GLEG 2P9NA 3HSCA 1NMDA 4QS8A 2E20A 4FPAA 3TU5A 3ENHA 4A2AA 3H3NO 5EOYA 3ID8A 3BEXA 2P9SA 2KHOA 1GLLO 5KPRA 4FOIA 3SLCA 4BG9A 1QQMA 2Q97A 3O1BA 5F0XA 3J8AA 4HTLA 3CQXA 1ZC6A 4H5NA 1LOTB 2A6AA 3FE1A 1JCFA 1JCGA 4DB3A 3BP8A 1P8ZA 4BR5A 2FF3B 4BC5A 4YDUA 5AQTA 4FPBA 1IJJA 3LDQA 3CJ9A 4M63C 4PL7A 4RWTA 1HKCA 5BR9A 1RDWX 3CERA 4E1JA 1NGAA 5AQWA 5BN8A 2ASOA 3ZEUB 1BOTO 4BRMA 5BPNA 3GG4A 3VEZA 4CZJA 1QZ6A 4FWSA 3CHWA 2W40A 4DHYA 4CZHA 2W41A 4CD1A 5AQMA 4L3QA 3QFPA 2ZGYA 3D2FA 1T6DA 5JMVA 1MWMA 3GBTA 3JS6A 3ZX3A 3QFUA 5EVZA 3VPZA 3VESA 3U9DA 3MK6A 3DAWA 2QWNA 4BGAA 3QBXA 5LJVA 1K8KA 1NGGA 3ZX0A 2CH6A 4FWLA 4CD3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KVBA 4N47A 1Y97A 1D9DA 4BC2A 3LANA 5H1SQ 4BACA 3E7UX 1LAWA 1LAVA 2GV9A 4CEDA 1SZ2A 3KKRA 4E7KA 2PAVA 1K73O 1IH7A 4DSIA 4K41A 1NE5A 3PIOL 4BEBA 4BQLA 3A5MC 5FPMA 2FBTA 4BVPA 3SAHA 3IUCA 3CCJN 1XMQK 1J53A 3O3HA 4C8LA 3VF6A 2WFBA 3V9WA 4KHSA 5LY3A 4UAEF 3A0IX 3NF9A 1Z6RA 1O1WA 3VERA 4WE1A 4CHNA 1OH7A 1C0TA 2F8SA 1QZ5A 3PY8A 3CQ8A 3VQ5A 3KP1A 3WXIA 4E89A 3SUQA 1YI2N 1UA0A 3O1WA 4NCAA 5HRSA 4C23A 4CJLA 4RW7A 1QHTA 5J1EA 1RNHA 1XRSB 3U3YA 2AA4A 4KYPA 3M3ZA 1TYQB 1GLCG 4KHPK 3CXCM 1DQ7A 2E5LK 4FK0A 1TL3A 1YTAA 4B1UB 3WXJA 2C1GA 2FBXA 1NPIA 3MECA 3NBPA 3L8BA 3SF4D 1TL1A 4E19A 4Z4GA 4DV7K 4H0PA 1XC3A 3DJCA 2P9PB 2O8EA 1YAGA 4LF7K 3OJSA 4FJHA 3V1OA 2GEMA 3QBWA 1BQMA 4BR9A 4RW9A 4EP4A 4GNIA 4BRQA 2IVNA 2QXFA 4FLXA 4CGDA 3OVNA 3ENBA 2RF2A 4BRLA 4DFJA 4YY3K 4JYAK 2C1IA 1KAXA 3HXMA 2W6KA 1RT6A 3VF4A 3SQ0A 1VQNN 1RBRA 3HL8A 5AZIA 5CY0A 3NH0A 2I7PA 5FDLA 1NGBA 2QKBA 5JS1A 3VGMA 5HOOA 1WSEA 4WQ5A 1NOYA 2ZF5O 2D0OA 4BR7A 1YJ9N 2KJAA 2VG6A 4BRGA 1IO2A 2E2OA 4M3TA 2UUCK 2A1SA 3SQ2A 4FOEA 2QEXN 2W42A 3MXMA 3RR8A 4JKEA 2YNGA 3M1FA 5AFUH 4FJXA 3FLCO 3ULEB 4C8NA 2QI2A 4FVMA 4XJXA 2ETJA 1IBLK 3OS1A 1S6PA 3WQUA 1HJOA 4DCHA 1S1TA 3C6UA 3CM5A 4B1VA 4LC9B 2QWQA 4ELUA 2ATBA 2E88A 2ZWHA 5HP1A 3SUPA 1BI4B 2F4VK 3VGLA 3D2EB 1U6ZA 4V1DC 1NKBA 4DR1K 3DYAA 4W5NA 3PLAA 3AA5X 2QKKA 3L4IA 1BU6O 1WAJA 4BRAA 4IDHA 2G8FA 3M6GA 1SKSA 3C65A 1HKBA 5C10A 1VHXA 3HO1A 4LD0A 2DY4A 4FLZA 1OVQA 4KV8A 3AAPA 3FZLA 4A61A 2W00A 4BROA 4CEZA 3J81O 3T1YK 1KLMA 3TTDA 3D0PA 4AHVA 3CQYA 4NO7A 4CFAA 4IJAA 3R9PA 3O5BA 1T7BA 4FJ8A 4QS7A 2WBNA 3OYJA 2KSKA 4KKOA 4BRNA 1Q18A 3MN7A 3VQ6A 2KBKA 1ZXOA 4IEEA 4RG8A 1NH5A 4CBXA 1VNBA 3HPOA 1N5YA 4CEBA 5AQFA 1RT1A 2QXLA 4BRPA 3T69A 3LM9A 3QIOA 1NK5A 1RFQA 3ZT1A 3I0SA 2FBVA 3SV3A 4DTRA 2PZSA 1NK0A 3ZT4A 5JLHA 1HJRA 2HHUA 4ID5A 3FZMA 3S41A 1VQ8N 1UAXA 2VYPA 2A1RA 4N5SA 3IS9A 1S1UA 4BRHA 5M1NA 3MN6A 4CCHA 1RBVA 1U2VA 4A2BA 3P5JA 3ZSVA 4FM0A 1PTXA 3H1QA 3F5TA 4ISGA 2ZM6K 3SJJA 4FWMA 4B3SK 1NMNA 1VRTA 3EZWA 3D7EO 1YHQN 2D4WA 3VF2A 1KQSM 2YHXA 2ASCA 3NGZA 4AB0A 1IKYA 4GW6A 4ISFA 3FFKB 1T7AA 2WTUA 3M8QA 2RE2A 3SUNA 2GWJA 3CF5L 4H4MA 3HSTB 1BWFO 5M1QA 4B9TA 3SJHA 3CJCA 2Z1HA 1LWEA 4NYFA 2P9LB 1U4BA 1POIA 1D5AA 2P9KA 3V1QA 4B8CA 4AILC 5ADXA 3C94A 2IAJA 3TANA 3TSUA 3LWMA 3ZT3A 1MA9B 2X74A 4IXCA 4F3OA 1QQCA 4CK3A 4JD2B 1YJWN 3TTFA 2YV0X 4DR3K 3O3FA 4XH1A 2HHQA 3HT3A 1NGIA 2IDOA 2WONA 2E1YA 3CETA 3MWPA 5HROA 5JS2A 2IC3A 1EWQA 5AQUA 3NDKA 1VQMN 3N4PA 2X6SA 4JI6K 5CE3A 3C0BA 4FWKA 5FRMA 3K5MA 3H1VX 2YNHA 1M1KO 2PFUA 1AHOA 2V52B 3MCPA 3VQBA 1X9MA 2HBLA 1BA0A 5BRFA 1RT3A 4JKCA 1DJTA 3K9JA 1AYJA 3PX0A 2KPYA 3LDNA 2VWKA 4DQQA 4CESA 3NHGA 4HUFA 1KCFA 3KC6A 2BGGA 1GOAA 3KLIA 3H3OB 4C8MA 3DRSA 1NGJA 2VCPA 2ASMA 1S3XA 3KD1E 3AGKA 1O13A 3C95A 4EHUA 1L5UA 4Z4HA 5KQ8A 1WB9A 4FWOA 5TKWA 4NLBA 4EFHA 3LAKA 4BDPA 3L3UA 4DTUA 1T6CA 3U6FA 3VA3A 4CZLA 1KC8O 1E4GT 4BRCA 2NRWA 4EIAA 1RDCA 3SBTA 1Z05A 4CHZA 3ZX2A 1W9HA 4CJ3A 2D1KA 2OTJN 1TV6A 1S1WA 4DV6K 2ZQBA 4H0VB 5SZTA 3RMCA 1DEJA 2WUSA 3D2FB 3E9PA 2HHTA 4XEIA 1CZ9A 4OPKA 1XQSC 3LDOA 4JKGA 3THYB 3AVIA 4BR0A 3DM2A 3LP3A 3L0QA 1GLEG 1NJYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2GWK A;  3DXM A;  3WXK A;  1HUX A;  4XEI A;  3OHR A;  1NGF A;  1XQS C;  3LDO A;  5KPT A;  3EL2 A;  4BR0 A;  5AQS A;  4YDU C;  5AQH A;  1K8K B;  2H3G X;  3L0Q A;  3DXK B;  1GLE G;  2P9N A;  3HSC A;  1NMD A;  4QS8 A;  2E20 A;  4FPA A;  3TU5 A;  3ENH A;  4A2A A;  3H3N O;  5EOY A;  3ID8 A;  3BEX A;  2P9S A;  2KHO A;  1GLL O;  5KPR A;  4FOI A;  3SLC A;  4BG9 A;  1QQM A;  2Q97 A;  3O1B A;  5F0X A;  3J8A A;  4HTL A;  3CQX A;  1ZC6 A;  4H5N A;  1LOT B;  2A6A A;  3FE1 A;  1JCF A;  1JCG A;  4DB3 A;  3BP8 A;  1P8Z A;  4BR5 A;  2FF3 B;  4BC5 A;  4YDU A;  5AQT A;  4FPB A;  1IJJ A;  3LDQ A;  3CJ9 A;  4M63 C;  4PL7 A;  4RWT A;  1HKC A;  5BR9 A;  1RDW X;  3CER A;  4E1J A;  1NGA A;  5AQW A;  5BN8 A;  2ASO A;  3ZEU B;  1BOT O;  4BRM A;  5BPN A;  3GG4 A;  3VEZ A;  4CZJ A;  1QZ6 A;  4FWS A;  3CHW A;  2W40 A;  4DHY A;  4CZH A;  2W41 A;  4CD1 A;  5AQM A;  4L3Q A;  3QFP A;  2ZGY A;  3D2F A;  1T6D A;  5JMV A;  1MWM A;  3GBT A;  3JS6 A;  3ZX3 A;  3QFU A;  5EVZ A;  3VPZ A;  3VES A;  3U9D A;  3MK6 A;  3DAW A;  2QWN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1KVB A;  4N47 A;  1Y97 A;  1D9D A;  4BC2 A;  3LAN A;  5H1S Q;  4BAC A;  3E7U X;  1LAW A;  1LAV A;  2GV9 A;  4CED A;  1SZ2 A;  3KKR A;  4E7K A;  2PAV A;  1K73 O;  1IH7 A;  4DSI A;  4K41 A;  1NE5 A;  3PIO L;  4BEB A;  4BQL A;  3A5M C;  5FPM A;  2FBT A;  4BVP A;  3SAH A;  3IUC A;  3CCJ N;  1XMQ K;  1J53 A;  3O3H A;  4C8L A;  3VF6 A;  2WFB A;  3V9W A;  4KHS A;  5LY3 A;  4UAE F;  3A0I X;  3NF9 A;  1Z6R A;  1O1W A;  3VER A;  4WE1 A;  4CHN A;  1OH7 A;  1C0T A;  2F8S A;  1QZ5 A;  3PY8 A;  3CQ8 A;  3VQ5 A;  3KP1 A;  3WXI A;  4E89 A;  3SUQ A;  1YI2 N;  1UA0 A;  3O1W A;  4NCA A;  5HRS A;  4C23 A;  4CJL A;  4RW7 A;  1QHT A;  5J1E A;  1RNH A;  1XRS B;  3U3Y A;  2AA4 A;  4KYP A;  3M3Z A;  1TYQ B;  1GLC G;  4KHP K;  3CXC M;  1DQ7 A;  2E5L K;  4FK0 A;  1TL3 A;  1YTA A;  4B1U B;  3WXJ A;  2C1G A;  2FBX A;  1NPI A;  3MEC A;  3NBP A;  3L8B A;  3SF4 D;  1TL1 A;  4E19 A;  4Z4G A;  4DV7 K;  4H0P A;  1XC3 A;  3DJC A;  2P9P B;  2O8E A;  1YAG A;  4LF7 K;  3OJS A;  4FJH A;  3V1O A;  2GEM A;  3QBW A;  1BQM A;  4BR9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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