1ZC6A

Crystal structure of putative n-acetylglucosamine kinase from chromobacterium violaceum. northeast structural genomics target cvr23.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
285
structure length
285
Chain Sequence
PSIRYLIGVDGGGTGTRIRLHASDGTPLAMAEGGASALSQGIAKSWQAVLSTLEAAFQQAGLPAAPASACAIGLGLSGVHNRQWAGEFESQAPGFARLSLATDGYTTLLGAHGGQPGIIVALGTGSIGEALYPDGSHREAGGWGYPSGDEASGAWLGQRAAQLTQMALDGRHSHSPLTRAVLDFVGGDWQAMMAWNGRATPAQFARLAPLVLSAARVDPEADALLRQAGEDAWAIARALDPQDELPVALCGGLGQALRDWLPPGFRQRLVAPQGDSAQGALLLLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords probable N-acetylglucosamine kinase
publication title Crystal Structure of Putative N-acetylglucosamine Kinase from Chromobacterium violaceum
rcsb
source organism Chromobacterium violaceum
total genus 86
structure length 285
sequence length 285
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01869 BcrAD_BadFG BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1zc6A01
3MN9A 1LCUA 1D4XA 3ZETB 2OANA 2V7ZA 2HF4A 1TYQA 1BU6O 5AFUH 4FL9A 2QW9A 5F2RA 3SMPA 4DQ8A 3G25A 3M6GA 4H0VB 4JD2A 5BR9A 2Q0RA 2IVNA 3DWLA 5JLFA 3L4IA 2QWLA 3EL2A 3ZX3A 4BR0A 2FF3B 3KHYA 3CETA 4GY2B 3OHRA 3R9PA 4MO4A 1BA0A 4QS9A 4PKHA 3QBWA 4I6MB 4JHDB 5AFUA 1Z05A 3ULEA 1U6ZA 4FO0A 4CZGA 2E2OA 4A61A 2E8AA 3UB5A 3VF4A 4CD1A 3QFUA 3HTVA 5AZIA 4BQZA 3WQTA 2P9LB 4BR9A 4H0PA 4YDUC 1X3NA 3TU5A 5EVZA 2H3GX 3U4LA 4BRPA 3H1QA 1Z6RA 2D0PA 5AQUA 4BVOA 5CE3A 3VGMA 4CJ7A 5FPDA 3BF3A 1NGIA 4H5RA 5AQKA 5AQTA 3A5LC 4XEIA 3LL3A 3U8XA 4M7XA 3O4WA 2CGJA 3A0IX 4B1ZA 3VEVA 3VF2A 3ZETA 4CBUA 2P9NB 3ID8A 3AAPA 1RGIA 5AQFA 1OKJA 2P9UB 3CERA 5KQDA 3J8AA 4XH4A 1U2VB 3IDHA 4IJAA 2QWQA 1K8KB 2HMPA 3D2FA 3R8EA 2FSJA 3UE5A 3ZEUB 1GLJO 2D0OA 5BPLA 3VOVA 2IVOA 5LJWA 3H6EA 3VENA 3EKSA 1RFQA 2QWPA 5JICA 2E88A 3GDQA 2ZF5O 2ITMA 4JHDA 3VGKA 4CZHA 3DXMA 5EXWA 2A5XA 3QBXA 3O5BA 2P9IB 3FE1A 3I8BA 3LM9A 3SJHA 1HKGA 4RCHA 2P9LA 4EHTA 5F0XA 4JN4A 3P4IA 1NGCA 1BA1A 4BRQA 2ZGYA 3O6WA 1BDGA 3FZKA 3VESA 5FPEA 3HI0A 2GWKA 2ASPA 1V4TA 3KVGA 1TUUA 1HKCA 1XQSC 1GLBG 1SQKA 2VCPA 2YHYA 1GLDG 2A40A 4L3QA 3GBTA 2CH5A 2P9NA 1E4GT 2YHWA 2P9UA 3TPQA 1BUPA 1U2VA 1K8KA 3WXKA 3QMLA 4FWSA 5EOYA 3FZHA 3EZWA 2F9WA 1WUAA 2VYPA 4HTLA 3UKUB 5AQJA 3CIPA 1NGEA 3C7NB 3HSCA 3S41A 5BRDA 5AQOA 4H0XB 3F9MA 3LDNA 2QWMA 3JXUA 3CJBA 3ZX0A 1ESVA 2P9IA 2D4WA 4WQ5A 3VERA 3ZX2A 2NRHA 3FZMA 4B1VA 4EHUA 5KPRA 4BC5A 2CH6A 4ISFA 1ATSA 5KPZA 2GTDA 3DJCA 4FWQA 3DXKB 5AQRA 4CI6A 5BN8A 1HPMA 1KAYA 1S3XA 3ATUA 2Q1NA 5BREA 3CQXA 5AQWA 3W3DA 1BWFO 3VEYA 1DEJA 5ELZA 2WUSA 3FGUA 4BREA 2A3ZA 2E1ZA 2FSKA 4LC9B 1LOTB 4A2AA 1DKGD 5AZJA 1H1VA 1ZXOA 4BC2A 1MWKA 2ZWHA 3JS6A 4M7YA 1MA9B 4AM6A 4CZMA 4RWTA 2ZGZA 5AQLA 2V51B 2FLOA 2QM1A 2QWOA 5AR0A 3CQYA 5BRFA 5AQSA 1QQMA 4NO7A 4K41A 5EY4A 2YJFA 3MCPA 3VEOA 4HWIA 4EFHA 3D2EB 3VETA 2BUPA 1QQNA 3C7NA 2F9TA 3H3NO 4H5NA 4WYBA 3O1WA 4FWOA 3A5NC 3BF1A 4PL8A 1HUXA 1NGHA 4A62A 5JMVA 4PKGA 1HJOA 4BG9A 2Q31A 2KHOA 3LM2A 3R6MA 5BN9A 5LJVA 3DXKA 3A5MC 4RTFD 5E84A 5AQNA 5BRHA 1BG3A 1IG8A 2ASOA 1CZAN 4ISEA 4CZJA 3VEXA 2QXLA 4BRAA 3FR0A 2PBDA 3QB0A 2Q2RA 5AQXA 1GLAG 2GWJA 2E2PA 4Y0WA 4FSVA 4BRMA 4I6MA 3RSEB 3FFKB 1QHAA 1HX1A 4YDUA 4XH1A 2CGKA 5I9EB 5BPNA 4FWKA 1T6CA 4CZIA 2I7NA 4BR5A 4FWMA 3MN6A 1JCGA 1WOQA 3AARA 3B8AX 4MLHA 4MLEA 2E2NA 3FZFA 3MK6A 4B1UB 1QQOA 5AQMA 3W0LA 4FWRA 4BRKA 1HLUA 2W41A 3QDKA 1MWMA 2AP1A 3WQUA 3D2EA 2Q36A 4FOEA 1YXQA 4XH5A 3CJ1A 4MO5A 4BC3A 2NZTA 4DHYA 1IJJA 1TYQB 3GOIA 3AY9A 3M1FA 4DCHA 3VPZA 2HOEA 4CZLA 2J4RA 3O80A 3MDQA 2YHXA 3C0BA 3ENOA 4PKIA 4BQLA 1JCEA 1NBWA 2UYTA 3ZEUA 2A6AA 3WUHA 3IFRA 1G99A 4CBXA 1J6ZA 1NGBA 3H1VX 5F1XA 3LDQA 1GLLO 3RSEA 1GLEG 4IO8A 4B9QA 5LY3A 3VGLA 3HM8A 4M63C 3BUZB 3VEWA 2P9SB 4H0OA 4NB4A 1NWKA 4BGAA 1ZC6A 4IZ9A 3LDOA 4B1YB 3SMSA 3KZBA 5FPMA 3BEXA 4BRDA 3L0QA 2P9PB 3I33A 3O1BA 2PAVA 5KQ8A 4H03B 1C0GA 2I7PA 4IJNA 2EWSA 1TUYA 4F9OA 3D2FB 3M3ZA 2YCHA 3IUCA 4BVPA 1RDWX 4JAXA 4AM7A 4EAHD 1NGDA 1NLVA 1NM1A 3L6QA 2AA4A 1EQYA 2Q0UA 4O5FA 3CI5A 3WEEB 4BR2A 1GLCG 3MMVA 2GUPA 4A2BA 2BTFA 1HKBA 3BP8A 2VWBA 4H5VA 3UKUA 1GLFO 3VEZA 4E1JA 1SZ2A 4K25A 5B8HA 3DXMB 4CZFA 4BC4A 4C23A 3FZLA 4K42A 2P9KB 2P9SA 2QWNA 3LDPA 4CZEA 3WT0A 2QWRA 5TKYA 2NLXA 1JCFA 1YUWA 5AQZA 3H3OB 1ATRA 4BROA 1P8ZA 2DPNA 1NGFA 4QS7A 3UKRB 1X3MA 1T44A 1NGAA 4H0YB 1KAXA 2P9PA 2YJEA 4H5TA 1XUPO 4FWLA 3U9DA 3CJCA 4IWVA 2FSNA 4FOIA 1NGJA 4BRNA 2HF3A 2V7YA 4WQ4C 4K43A 4BGBA 4GNIA 3DAWA 5AQPA 1KXPA 5AQHA 2GELA 4BR7A 4B1XB 1SAZA 5AQVA 4O8KA 5KPTA 1BO5O 2CGLA 3WEEA 3A5OC 4JNEA 3WXJA 4BRHA 3CJ7A 1KAZA 1C0FA 2W40A 4KBOA 1MDUB 3MN5A 4CD3A 4FPBA 4BRGA 4H5WA 3CJAA 2E2QA 2D1KA 2FF6A 2GEMA 1E4FT 3CJ9A 3EO3A 5ADXH 3QICA 2A41A 3GE1A 2P9KA 3ATVA 4BRFA 3AAQA 3LDLA 5FPNA 1ATNA 4Z94A 4CBWA 4CZKA 2ASMA 4JD2B 5AQGA 4B1WB 2E1YA 5AQQA 1R59O 4FWNA 3H45C 5E26A 4EIAA 4WQ4A 4WQ5C 3UKRA 5JLHA 3HBTA 5AQYA 5ADXA 4H0TB 1ZBSA 2IVPA 1V4SA 3H46O 3MN7A 4BRIA 4FPAA 3ULEB 5BPMA 3WXIA 3ENHA 3VF6A 5AZJB 4FWPA 2E20A 3A8YA 3D7EO 3FLCO 4BRCA 1T6DA 1DGKN 1X9JA 4BRLA 4ISGA 5AZIB 3SK3A 2V52B 3IMXA 3U9ZA 1Y64A 2Q97A 3SLCA 3QFPA 3GG4A 5EX5A 1BOTO 3EKUA 2IIRA 3GL1A 3O08A 1QZ6A 1NMDA 1S22A 4BG8A 1Q18A 3O8MA 2A42A 4BR4A 4IXCA 3EN9A 3HZ6A 1YAGA 2YI1A 2FXUA 1NGGA 4QS8A 3WXLA 5AQIA 4J8FA 1XC3A 3CHWA 4PL7A 4DB3A 1QZ5A 1YVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CG7A 3ZETB 4DV0K 3I0SA 2V7ZA 4U7BA 4FL9A 3SQ0A 1YJWN 4DQ8A 4CF2A 3HRGA 1QSSA 1VSIA 2Q0RA 4IOXA 3NGIA 1EKEA 3ZX3A 1BQNA 1RILA 4BR0A 3KHYA 3CETA 4GY2B 4RG8A 4QS9A 3QBWA 3QEVA 4I6MB 3ENBA 5AFUA 3ULEA 1U6ZA 3CMAN 4FO0A 3CPEA 4F8RA 4A61A 3R1XA 3UB5A 1KFSA 1T3VA 4Y1CA 3HTVA 3AA2A 5AZIA 3WQTA 2P9LB 3MWTA 4YDUC 3G6EN 3RR8A 4JI5K 3RMCA 3V9XA 5CE3A 3VGMA 1MU2A 4CJ7A 4LY7A 5AQTA 1VSLA 5AQKA 3OYMA 4XEIA 3U6FA 4M7XA 3O4WA 4F2SA 3AO4A 3VEVA 3AVBA 3VF2A 5JLFA 4DV4K 1RGIA 3G10A 4KHNA 2P9UB 2NRXA 3ZSWA 1IBMK 3HPHA 4HUGA 2QWQA 1K8KB 3ULDA 2ZE2A 3AVFA 4DSEA 2KFZA 3TAMA 3UE5A 3VQPA 1GLJO 3ZEUB 3OTOK 3DYAA 2XHBA 1QTMA 3IG1A 1E3MA 3EKSA 2E88A 2EX3A 3L4QA 2ZF5O 2RKIA 5KI6A 1NOZA 3O3HA 4YORA 4CZHA 3QEPA 2X6SA 2NRRA 2P9IB 1QS4A 1VSDA 3TTFA 1U04A 2B4JA 5F0XA 1FKOA 3KK1A 4JN4A 3ZSQA 3HVTA 3OYEA 1YT3A 4CIEA 1C0TA 4BRQA 1NJXA 3JYTA 2ZGYA 3TANA 1U47A 3O6WA 3O9RA 1G15A 2JWKA 1K73O 4DQRA 3VESA 3KK3A 1S1XA 2GWKA 5HOOA 3NH0A 3KVGA 3SUOA 4FJJA 4M3WA 1GLBG 2VCPA 3HO1A 4QOZB 2X78A 3MEGA 1KFDA 4MQ3A 1BGXT 3IS9A 1U2VA 3AVJA 1REVA 5IT9O 3PX0A 4AHSA 3OBYA 4PA1A 3KLHA 1WB9A 4FLUA 2NNWA 3HOTA 4KRFA 1UOCA 3S9HA 3K9JA 1NGEA 3HSCA 3S41A 3V6DA 1X9SA 1NK9A 3JXUA 3OYJA 1N8RO 2XY8A 2HBJA 1YTUA 3VERA 1JLAA 3FZMA 4EHUA 1K6YA 4ISFA 1ATSA 3PIOL 3KLFA 4DTOA 2GTDA 3KLIA 3DXKB 3AVHA 5J2QA 4JI7K 3TSQA 5BREA 1QSYA 2NRZA 2O8FB 4FJ5A 4LH5A 2E1ZA 2FSKA 4LC9B 3AGKA 4LF9K 4E19A 2QKKA 1MWKA 4M7YA 1T05A 4YOVA 2YNGA 4CZMA 4FLTA 3SNNA 1BIZA 1R0AA 5AQLA 4FM1A 4KI6A 2BANA 3T7ZA 2QWOA 3CQYA 2QA4N 1JXEA 2ETJA 1QQMA 1BIUA 2HB5A 2YJFA 1TKZA 4N47A 3ZT3A 3KD5E 3O9TA 3C7NA 3PX4A 4WYBA 3H3NO 3DI6A 3O1WA 4JLHA 4CECA 3A5NC 3KIOA 4CE9A 1JLGA 1SUQA 3C6AA 3P31A 1HNZK 1HJOA 4CJRA 3VA0A 2KHOA 4CGJA 3LM2A 4NYFA 4CESA 3ISNC 4ISEA 3BGRA 4DU3A 3VEXA 4B3TK 2OCEA 4CJTA 3QB0A 5AQXA 3V1RA 3VN5A 1NJIO 4Y0WA 4CJ5A 4LF6K 1HMVA 3RSEB 1XC9A 4FWKA 3CFRA 1T6CA 3SYZA 1L3UA 5M1OA 4IFVA 3VQ5A 1JCGA 4U67L 4KREA 4M42A 2P5GA 3B8AX 4MLHA 4FJ7A 2VQFK 2UXCK 2HSTA 3EE8A 2KKZA 3OYAA 4FWRA 4BRKA 2G8VA 1MWMA 4CHZA 3CCVN 4XH5A 4MO5A 1SS6A 2NZTA 3THVA 1HNVA 3TAGA 3VPZA 3SPYA 3KKSA 2YHXA 1J5OA 4FLVA 4YOXA 4M3ZA 3SUNA 4NCGA 1G99A 1NGBA 4NXMK 3MEDA 2WBNA 5F1XA 4KH5A 4RW4A 3CC7N 4ICLA 1T8EA 1SKRA 3I8DA 2YNFA 1ZBLA 2F8TA 4Q5VA 5C2FA 4DS4A 2NRWA 4UY8O 1OH6A 1BISA 4CGIA 2GV9A 5FROA 1QE1A 4KTZA 3HJFA 1A5XA 4DFKA 1ZC6A 4IFEA 4J2EA 3LZJA 3KZBA 3BEXA 5SWMA 2QKBA 3L0QA 4JI6K 2ITGA 5JVHL 3DLHA 4B8AB 4W5QA 1D5AA 4EP4A 3O1BA 1VQ6N 3P5JA 2PAVA 4KKOA 1XMOK 3AVAA 3NGZA 4M3RA 1BI4A 1NLVA 2AA4A 1EQYA 4LSNA 3F5TA 4CJFA 3BY5A 3CI5A 3KTQA 4BR2A 4JKHA 3MMVA 2GUPA 4H5VA 2VWBA 2PYLA 1GLFO 4FCYA 1SZ2A 4JKCA 3K5NA 3T3FA 4DTJA 4RW7A 4BC4A 2D0BA 2E4LA 3O9SA 4CJVA 2G8HA 1HYSA 4K42A 1BCMA 2GUIA 3QEWA 2P9KB 3U3GA 2WOMA 2G8WA 2P9SA 1OH7A 3LDPA 4O4GA 4JRQA 4DQPA 1BQMA 1NK7A 3L3VA 1ATRA 4BROA 2P5OA 2ZQBA 4YOWA 1T44A 1VQ5N 4LFBK 1N5YA 4GV6A 4CGFA 3U9DA 1IKWA 4IEIA 1XUPO 4FWLA 3QEIA 4CERA 3NF6A 1NOYA 4IWVA 2V7YA 2F7TA 1SL0A 3CM5A 1VK0A 5AQPA 3V9WA 3I56N 4ZHRA 3FFIA 2KTQA 2GELA 1FW6A 4OVLA 3SBGA 2XY6A 1KRPA 3ZYYX 4JNEA 2YHAA 4B3SK 2W40A 4H4OA 4IOCL 2BGGA 4FPBA 2E2QA 4MDAA 3HPOA 3O4NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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