3GL1A

Crystal structure of atpase domain of ssb1 chaperone, a member of the hsp70 family, from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
AEGVFQGAIGIDLGTTYSCVATYESSVEIIANEQGNRVTPSFVAFTPEERLIGDAAKNQAALNPRNTVFDAKRLIGRRFDDESVQKDMKTWPFKVIDVDGNPVIEVQYLEETKTFSPQEISAMVLTKMKEIAEAKIGKKVEKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGAISGLNVLRIINEPTAAAIAYGLGAGKSEKERHVLIFDLGGGTFDVSLLHIAGGVYTVKSTSGNTHLGGQDFDTNLLEHFKAEFKKKTGLDISDDARALRRLRTAAERAKRTLSSVTQTTVEVDSLFDGEDFESSLTRARFEDLNAALFKSTLEPVEQVLKDAKISKSQIDEVVLVGGSTRIPKVQKLLSDFFDGKQLEKSINPDEAVAYGAAVQGAILT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein SSB1
publication title Crystal structure of ATPase domain of Ssb1 chaperone, member of the HSP70 family from Saccharomyces cerevisiae.
rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 124
structure length 383
sequence length 383
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-03-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gl1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gl1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gl1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gl1A04
1U2VB 1JCEA 1S3XA 3SJHA 3ZEUB 4CZKA 1X3MA 4L3QA 1D4XA 1ZXOA 2P9NA 1NGIA 1GLJO 5AQRA 1HX1A 1OKJA 2Q0RA 1DKGD 2IVNA 4GNIA 1YUWA 3MN9A 4IO8A 3RSEB 3WXIA 1NBWA 2A6AA 3EL2A 5KPTA 4BRKA 5FPDA 3FR0A 3WEEA 4BG8A 3I8BA 2GWJA 3BEXA 3J8AA 1WUAA 3VEWA 1BWFO 2ZF5O 4Z94A 4MO5A 5AQLA 4CD3A 5AQUA 2F9WA 5FPNA 5AQTA 4JN4A 4BRGA 4J8FA 3ULEA 5EXWA 3WQUA 3H1QA 4B1YB 5FPMA 2IVOA 3TU5A 1HKCA 3HI0A 2YI1A 3LL3A 4BGAA 2BTFA 3CJ7A 1RFQA 1BU6O 5AQHA 3L6QA 3O1WA 5AQVA 3GDQA 4LC9B 4BC4A 1S22A 5B8HA 5KPZA 1BA0A 2FF6A 1TYQA 1H1VA 5AQNA 3ENOA 1T6CA 4WQ4A 3ATVA 1BG3A 3GL1A 3QFUA 2VCPA 3H3OB 2NRHA 4CZGA 1E4FT 3VENA 3D2FB 4BREA 3VEYA 5EOYA 4CZLA 4CI6A 5JLHA 4H5TA 1HKBA 1QHAA 2V7ZA 3QFPA 2FXUA 1U2VA 2Q97A 3MN7A 1BOTO 2GELA 4H5RA 2HF3A 4NB4A 1NGBA 3FZLA 5AQJA 4FWMA 4B1UB 3UB5A 5AFUA 2A5XA 3FZMA 4BC5A 3U4LA 5AZIB 4FSVA 5AQYA 3RSEA 3VPZA 3MDQA 3VF2A 1JCFA 1HKGA 3CHWA 5AQWA 5AQZA 1R59O 3KHYA 4ISEA 4EAHD 1ATSA 2CGJA 3CERA 1LCUA 3FLCO 4AM6A 2CGLA 5AQPA 2A40A 3O5BA 3VGKA 4FPAA 2V7YA 2ZGYA 1ZC6A 5KQ8A 3U9DA 3CJ9A 4BRNA 1SAZA 3O1BA 1TUUA 3EO3A 5AZJB 3DXKB 2D0OA 5ADXH 1HUXA 3IFRA 4FWLA 3WXLA 1MWMA 1NGAA 3QBWA 3D2EA 2QWLA 2VWBA 3SLCA 1KAZA 3DXMA 4WQ5A 2HF4A 3A5LC 1QZ5A 1QQOA 4FWNA 3GOIA 3P4IA 5JICA 4H0YB 4XH5A 3O80A 2Q0UA 3CJCA 4BRPA 5EX5A 1JCGA 3QICA 4I6MB 1WOQA 2YHXA 4JHDB 3D2FA 4GY2B 3FFKB 3BP8A 3HZ6A 3DWLA 1XQSC 3UKUA 1NLVA 5AQXA 3VGMA 1NGJA 4H5WA 1QQMA 2P9SB 1YAGA 4JD2B 4CBXA 4CZMA 2E2PA 3GG4A 4CJ7A 5JMVA 4BRFA 1RDWX 2P9LA 1DEJA 4O8KA 2QWPA 2F9TA 3O08A 4PKIA 3AARA 3UKRB 2P9IB 4YDUA 4O5FA 2YHYA 4K43A 2Q2RA 3JXUA 3EZWA 2ZGZA 4MO4A 1C0GA 4BQZA 5EVZA 2P9UA 3O8MA 1NGDA 4FWPA 3MK6A 2ASOA 2HMPA 4BR4A 3ENHA 2Q36A 4H0PA 4JAXA 3AAQA 3VEOA 1NM1A 4QS7A 1RGIA 4EFHA 3CQYA 1V4SA 3DJCA 3W3DA 4FL9A 3O4WA 3VF4A 5AZJA 3BF1A 3DXKA 3I33A 2QWQA 4BRCA 1SQKA 2P9PA 4RTFD 4WYBA 3SK3A 3HSCA 4EHUA 3LM2A 5F2RA 4K41A 3ID8A 4FOIA 2E2OA 5JLFA 4QS8A 4M7XA 1GLEG 5LJVA 1QQNA 4WQ5C 3U8XA 4BR0A 3OHRA 3CQXA 1G99A 5F1XA 2ASPA 2D1KA 2IIRA 2BUPA 4I6MA 5E84A 3MN6A 2UYTA 4BR5A 2NZTA 3WT0A 5CE3A 3SMPA 4FOEA 1C0FA 4A62A 1CZAN 4BRHA 2P9SA 3BUZB 4IXCA 5KPRA 4BC2A 4Y0WA 1KXPA 2E2NA 3L4IA 4YDUC 3UKRA 5BN9A 2P9IA 3ZEUA 5AQMA 4K42A 4A61A 1YXQA 1GLCG 3H1VX 1NGGA 1BDGA 3H46O 3TPQA 3H45C 1EQYA 3VF6A 4XH1A 2E1YA 2V51B 4MLHA 4CZFA 3FE1A 2FSNA 3BF3A 3ZX3A 4A2BA 1KAXA 5AQIA 2GTDA 3M3ZA 4PKGA 5FPEA 3QBXA 2E20A 5BRHA 5AQGA 4BRIA 3FZKA 1KAYA 4IJAA 1GLLO 3VEXA 1P8ZA 3QB0A 1HPMA 2GWKA 2IVPA 3EKSA 4FWSA 2P9KB 4A2AA 4BGBA 1BUPA 4BRDA 1MA9B 2E1ZA 4M7YA 2WUSA 3MCPA 4CBWA 3R6MA 2OANA 5E26A 1Y64A 5AQSA 1X9JA 3L0QA 3LDPA 4MLEA 4FO0A 4EHTA 4BR2A 4DHYA 3HTVA 4M63C 4PKHA 3ULEB 5BREA 2QM1A 5BRFA 1IJJA 2FSJA 4PL8A 1NGHA 1YVNA 3F9MA 3UE5A 3O6WA 3FZFA 4H5NA 3H6EA 4FWRA 4BC3A 4XEIA 2QWRA 3IMXA 2FF3B 5AZIA 3U9ZA 4NO7A 4E1JA 3HBTA 4FWQA 4BQLA 3WXKA 3R8EA 1DGKN 3VGLA 4H0TB 1TYQB 3QDKA 4B1VA 2E2QA 3HM8A 3IUCA 5I9EB 2H3GX 5BPLA 2Q31A 5AQFA 1IG8A 2YJEA 4XH4A 1GLFO 3CI5A 1Z05A 4B1XB 3LDLA 2EWSA 4CD1A 4F9OA 4H0OA 5AQQA 2J4RA 2P9KA 3VESA 3VERA 3KVGA 2KHOA 4CBUA 3FGUA 2D0PA 3CJ1A 3MMVA 1GLBG 1Z6RA 3VOVA 3CIPA 4RWTA 1ATNA 2V52B 3ZX0A 3LM9A 4BRMA 3ZX2A 3WUHA 5ELZA 4BR7A 1NGCA 4KBOA 1ZBSA 1ATRA 1QZ6A 4BG9A 4BRLA 3EKUA 4H03B 3VETA 5AFUH 4JHDA 2ITMA 2FLOA 5AR0A 1TUYA 2QXLA 3A0IX 3D7EO 2YHWA 4IZ9A 1K8KB 3JS6A 4IWVA 2NLXA 4JD2A 3M6GA 5KQDA 1BA1A 2Q1NA 2W41A 1XC3A 4B1ZA 3A5OC 4C23A 5AQKA 2YCHA 1Q18A 3D2EB 3GE1A 3ZETB 5TKYA 4FPBA 3LDNA 4ISFA 4PL7A 3DXMB 5ADXA 3ATUA 1NMDA 1NWKA 4H5VA 5EY4A 3W0LA 4BR9A 1X3NA 3MN5A 4CZHA 1MDUB 3G25A 4DB3A 3C7NB 1T6DA 4FWKA 4HTLA 3VEVA 4BVOA 4DCHA 1J6ZA 3UKUB 2ASMA 4K25A 2AP1A 4H0VB 5BPMA 2HOEA 4CZJA 4EIAA 3QMLA 2AA4A 5F0XA 2A41A 3M1FA 2P9LB 5BN8A 2VYPA 3CETA 2CH5A 5BPNA 1BO5O 3GBTA 1T44A 2QW9A 4BRAA 3VEZA 3EN9A 1ESVA 2P9NB 1SZ2A 2GEMA 4FWOA 4H0XB 1NGFA 2DPNA 2P9UB 3CJBA 4CZEA 1U6ZA 4IJNA 4HWIA 3A5MC 5AQOA 1XUPO 3LDOA 3WEEB 4BVPA 5BRDA 2FSKA 5LY3A 4RCHA 2D4WA 3R9PA 3KZBA 1K8KA 2W40A 1HJOA 3AY9A 2P9PB 5LJWA 2A42A 2QWOA 2PAVA 4DQ8A 2E8AA 3B8AX 3C0BA 1MWKA 1HLUA 2I7PA 3S41A 1GLAG 2QWNA 3WQTA 3LDQA 3ZETA 2CH6A 1V4TA 4ISGA 4AM7A 3A8YA 4B1WB 2GUPA 2I7NA 3CJAA 3IDHA 1GLDG 2CGKA 2PBDA 1LOTB 3SMSA 4WQ4C 4BROA 3FZHA 4B9QA 3H3NO 1E4GT 4JNEA 2E88A 3C7NA 4QS9A 1NGEA 3A5NC 4CZIA 2ZWHA 5BR9A 3AAPA 3DAWA 2A3ZA 4BRQA 2YJFA 2QWMA 3WXJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1U2VB 5KI6A 3SJHA 3PX0A 3TR8A 3O4NA 4GVEA 1D4XA 4JI3K 2HBJA 4EZ9A 1JLBA 1NNEA 2IVNA 1ASUA 4GNIA 1SKRA 2HHUA 1JZAA 3WXIA 1IBMK 2A6AA 2FBVA 4LF8K 4BRKA 3QEPA 3MEGA 3LZJA 3HRGA 4N47A 3VQEA 2GWJA 3BEXA 1JLQA 3D45A 3VQAA 3QO9A 1VQPN 1BWFO 3KOWA 4BE7B 3D6RA 2F9WA 4BRGA 4Y1DA 5EXWA 3H1QA 3LANA 4B1YB 4LF7K 5GAGP 4GV6A 2YI1A 4DV5K 1KV0A 1WMTA 3ASMA 4O5BA 2Y1JA 3THXB 4BY9C 1RFQA 4CJTA 5AQHA 4DFMA 5M1PA 4CEQA 3NAEA 4LC9B 1S22A 4BWMA 2YILA 1TYQA 2I5JA 3KK2A 4WQ4A 4YORA 1SKWA 4IOXA 3H3OB 1QSYA 2NRHA 4YOTA 4KHSA 4CZLA 3IAYA 4H5TA 2V7ZA 3QFPA 2OTJN 4I9LA 2UXBK 3MN7A 2G8KA 2W42A 4H5RA 1TL3A 3LP3A 5CZ2A 2C1IA 3OYAA 3BZCA 4AB0A 2ZJPL 5C0YA 4M42A 5AZIB 4PY5A 3VPZA 3MDQA 1S72N 5AQWA 4M3YA 5AQZA 4C8NA 4DU1A 4AM6A 4IDKA 3RR8A 3HPHA 2W6LA 4AHTA 3NCIA 2KPYA 2OTLN 3CM5A 3ZSVA 1IG9A 1Z25A 2HVHA 2KLAA 1TK8A 5J2MA 3SAHA 3NGIA 5ADXH 3LAMA 3ITHA 4NLCA 1XI1A 4M3XA 3KKSA 3IFRA 4E7HA 3WXLA 2QI2A 4ELUA 1CZ9A 3AVKA 4CHYA 3THVA 4FLYA 3J81O 2O8FB 4DU4A 3M8RA 2XY5A 4NLBA 1JCGA 3AVAA 2D5RA 1BQMA 4LF9K 1SUQA 3D2FA 1VSKA 5A2QO 3FFKB 4B9TA 4LFBK 3K57A 1PX9A 1HNVA 1Q9XA 3L8BA 3QETA 1QQMA 1YAGA 2P9SB 3PSIA 1T05A 3GG4A 4CJ7A 4B9NA 5JMVA 3ZT0A 5HRRA 3AARA 1R0AA 2F7TA 2P9IB 1MU2A 4F8RA 2O4GA 4K43A 4JYAK 2VWKA 1NH5A 3EZWA 4UJ0A 4MO4A 1C0GA 4MQ3A 4HUGA 5SWMA 2ASOA 3TWHA 5FRNA 3ENHA 4A59A 4JAXA 4DTUA 3AAQA 3VEOA 4NXMK 4TSXA 3AVIA 1NK5A 1CZBA 3CCLN 2C1GA 1HYZA 1IKYA 1VRUA 4FL9A 3VF4A 5HRSA 3DXKA 2QWQA 3SK3A 3BZKA 4EHUA 4RW4A 4CJUA 3PUFA 4JI1K 5JLFA 1BMRA 2E2FA 4DTNA 1GPTA 3MEEA 3PLAA 1RT5A 3CQXA 3PO4A 2UXCK 3VQCA 4YOXA 2ASPA 2B3CA 1KVBA 3LWMA 4DSJA 4NXNK 3KK7A 3JYTA 3ZSZA 5E84A 1JZBA 2UYTA 3O3FA 3MX2A 4CEOA 4FOEA 4CFBA 4A62A 3RRHA 1CZAN 4IFVA 1OVQA 3V9WA 3T7ZA 3AO3A 4BC2A 4Y0WA 4LF6K 3EZ5A 2O8CA 2E2NA 4X64K 4JLHA 4YDUC 4JI6K 2IAJA 4CIGA 5DM6L 4K42A 4A61A 2UUCK 2EX3A 3O9QA 4NCBA 1FXXA 1BDGA 4OPHA 4CJWA 1UA0A 3ZLJA 2KZMA 3FE1A 3LP1A 4WCEL 4A2BA 1KAXA 3C65A 3M3ZA 2YNHA 1W7AA 4KPYA 3QBXA 5BRHA 3L2QA 3VEXA 1J5EK 3QB0A 2MN5A 1DLOA 4FWSA 1DTQA 3ZSOA 4JS5A 1KC8O 3M8PA 3THXA 3ULDA 2NY9X 4I9QA 1RT7A 4FLXA 4M7YA 4YY3K 4B8CA 3TAMA 3NF6A 2QKKA 1VRTA 3LDPA 4MLEA 4MFBA 2VY6A 4BR2A 2PZSA 4DHYA 2GMOA 1OZZA 4PKHA 3R1XA 5BRFA 2FSJA 4JKBA 3V9XA 2KQ2A 1DQ7A 3F9MA 2G8FA 4H5NA 4DV1K 2OZSA 4BC3A 5AZIA 3VTHA 3K59A 3WXKA 1TV6A 3VQ8A 2E2QA 3HM8A 5AJ3K 5CHIA 5J2NA 1CXQA 4CQKA 4PHTX 1EWRA 3CI5A 1NOZA 1NKCA 4AHCA 2YKNA 4AHRA 1QVGM 3K2PA 1JLCA 3VERA 3VESA 5EU7A 3KVGA 1WSFA 4FYDA 3WNHA 3MMVA 3KLIA 3THYB 3VOVA 2KW4A 4YOWA 3CIPA 1U47A 4RWTA 2V52B 2I61A 3ZX2A 5ELZA 2N2RA 2O8FA 3TANA 4DSEA 1QZ6A 1VSJA 4WE1A 3ZSXA 4FVUA 4H03B 4DR4K 2YHAA 3S9HA 3M5RA 2QXLA 3A0IX 3V1QA 3HVRA 3JS6A 1P00A 3V1RA 2LJMA 5KQDA 1BA1A 2Q1NA 3V4IA 1JJ2M 4OVLA 4HCBA 4C23A 2BGGA 3FFIA 3O9TA 4OKKA 1Q18A 4CJ3A 3GE1A 4IEIA 4JKGB 4Z4GA 4BWJA 4DTOA 1GPSA 1KCFA 3DXMB 5ADXA 1T7BA 3T1HK 3ATUA 4JI2K 1NWKA 1XWLA 3KK3A 4CZHA 3K5LA 4E19A 3G25A 3QLHA 4DB3A 3NH2A 5DK5A 1T6DA 4HTLA 3HVTA 5J2PA 1MYNA 4DQPA 3T1AA 4E72A 5C2FA 1L3SA 1RBRA 4G1QA 4BDZA 4H0VB 2P1JA 3OA9A 3HPOA 3VMFB 3M1FA 4JI5K 4CJ4A 1N5YA 1BIZA 4Z4FA 3CETA 1NRBA 3TAPA 2QW9A 3EN9A 4FWOA 3DYAA 4B9LA 3KWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1U2V B;  5KI6 A;  3SJH A;  3PX0 A;  3TR8 A;  3O4N A;  4GVE A;  1D4X A;  4JI3 K;  2HBJ A;  4EZ9 A;  1JLB A;  1NNE A;  2IVN A;  1ASU A;  4GNI A;  1SKR A;  2HHU A;  1JZA A;  3WXI A;  1IBM K;  2A6A A;  2FBV A;  4LF8 K;  4BRK A;  3QEP A;  3MEG A;  3LZJ A;  3HRG A;  4N47 A;  3VQE A;  2GWJ A;  3BEX A;  1JLQ A;  3D45 A;  3VQA A;  3QO9 A;  1VQP N;  1BWF O;  3KOW A;  4BE7 B;  3D6R A;  2F9W A;  4BRG A;  4Y1D A;  5EXW A;  3H1Q A;  3LAN A;  4B1Y B;  4LF7 K;  5GAG P;  4GV6 A;  2YI1 A;  4DV5 K;  1KV0 A;  1WMT A;  3ASM A;  4O5B A;  2Y1J A;  3THX B;  4BY9 C;  1RFQ A;  4CJT A;  5AQH A;  4DFM A;  5M1P A;  4CEQ A;  3NAE A;  4LC9 B;  1S22 A;  4BWM A;  2YIL A;  1TYQ A;  2I5J A;  3KK2 A;  4WQ4 A;  4YOR A;  1SKW A;  4IOX A;  3H3O B;  1QSY A;  2NRH A;  4YOT A;  4KHS A;  4CZL A;  3IAY A;  4H5T A;  2V7Z A;  3QFP A;  2OTJ N;  4I9L A;  2UXB K;  3MN7 A;  2G8K A;  2W42 A;  4H5R A;  1TL3 A;  3LP3 A;  5CZ2 A;  2C1I A;  3OYA A;  3BZC A;  4AB0 A;  2ZJP L;  5C0Y A;  4M42 A;  5AZI B;  4PY5 A;  3VPZ A;  3MDQ A;  1S72 N;  5AQW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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