5FPNA

Structure of heat shock-related 70kda protein 2 with small-molecule ligand 3,5-dimethyl-1h-pyrazole-4-carboxylic acid (at9084) in an alternate binding site.
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
381
structure length
379
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGCGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords HEAT SHOCK-RELATED 70 KDA PROTEIN 2
publication title Detection of Secondary Binding Sites in Proteins Using Fragment Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 119
structure length 379
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5fpnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5fpnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5fpnA04
4FWLA 1MDUB 5EOYA 1MA9B 3IDHA 3MN7A 4JNEA 2E8AA 5AQOA 4MO5A 4DCHA 5JLFA 4MLEA 3TPQA 2IVNA 5FPNA 4CZEA 2D0OA 4FWPA 1GLAG 2E2PA 1YXQA 2VYPA 2QWQA 3VETA 4WQ5C 4CBUA 3F9MA 1GLCG 2PBDA 3BF1A 4CBWA 1YVNA 2ZGZA 4BQLA 1NGAA 4K42A 1U2VA 2E88A 4K41A 5EY4A 1IG8A 2QWMA 4FOIA 3BP8A 4FWNA 5ADXA 1NWKA 3O4WA 1KAXA 1T6DA 3UKUB 5AQSA 1T44A 3ATUA 3GDQA 2VCPA 3VOVA 3HBTA 4HWIA 1QHAA 2VWBA 4EIAA 3O6WA 2BUPA 1K8KA 3KHYA 3WUHA 1Z6RA 3LDNA 3UB5A 2UYTA 1X9JA 1MWKA 1BDGA 3EZWA 5BN9A 3CERA 3H3NO 3J8AA 3R9PA 4DHYA 3HZ6A 2Q1NA 3CJ9A 4EAHD 1KXPA 1R59O 4K25A 2P9LA 4QS9A 1GLEG 2AP1A 1EQYA 5JLHA 3I8BA 5AR0A 1U2VB 3FE1A 4WQ4A 5I9EB 4CBXA 3WXKA 1NBWA 1X3MA 1DKGD 2AA4A 1NLVA 5AQFA 4B1YB 2Q0UA 4H5WA 3WEEB 2P9PA 3VEVA 4Y0WA 4C23A 5FPMA 5B8HA 4F9OA 4FWRA 1OKJA 1Q18A 1K8KB 2GEMA 4IJAA 2WUSA 1RFQA 1NGFA 4BRCA 4BGAA 4BRHA 5AQZA 4A62A 3CJCA 4FL9A 1GLDG 3CHWA 2GTDA 4B9QA 1NGJA 5AZIA 4CZIA 1S22A 3R6MA 2A6AA 2P9LB 4WQ5A 3VEZA 5KQDA 1DEJA 2OANA 3CJ7A 3KZBA 3LM2A 2W41A 3SLCA 3H6EA 3QBWA 4H0YB 4L3QA 5AQWA 1GLFO 3B8AX 2H3GX 4BRIA 3VEXA 1QZ6A 1BG3A 1C0FA 2HF3A 3LDLA 3CETA 2P9PB 3FZHA 2NLXA 5BRFA 2Q36A 4CZFA 3CIPA 2FXUA 3L0QA 4BRAA 5KPTA 1XC3A 4K43A 1MWMA 2A3ZA 3ULEA 4H0OA 4PL8A 1NGHA 1C0GA 3VEYA 4IO8A 5AQHA 5JICA 1HX1A 3RSEA 1JCEA 3U9DA 2D4WA 5AZIB 1P8ZA 3L4IA 3BUZB 4BR7A 5AQTA 2V7ZA 5F0XA 3VGKA 2GWJA 1QQNA 2A42A 3ZX3A 5LY3A 3EO3A 1V4SA 3MCPA 4H03B 2YCHA 4NB4A 4IXCA 3QICA 3O1WA 3BEXA 4FPBA 1ATRA 1ESVA 4H0TB 3CQXA 5AQUA 2QW9A 1IJJA 1YAGA 3A5NC 2V51B 4ISGA 3A5OC 4XH5A 3UKRA 1NM1A 4AM7A 3M6GA 4CZLA 2P9UA 3FLCO 4CZJA 4NO7A 3LM9A 3ULEB 4RWTA 2QWRA 5E84A 2P9SA 3EN9A 4B1WB 3WQUA 2V7YA 3RSEB 3ZEUA 4BRGA 3GL1A 2Q0RA 4JHDA 5EXWA 2F9TA 2Q97A 3WXLA 2V52B 3OHRA 4ISFA 3M3ZA 4BROA 2GUPA 3C0BA 3H45C 5AQKA 3QFUA 4CZHA 2A41A 2W40A 4YDUC 4BQZA 1KAYA 1HJOA 2I7NA 1RDWX 2ITMA 3U4LA 3TU5A 5BRDA 3UE5A 1NGBA 4CZMA 1WUAA 1HKCA 1BWFO 4BG8A 3H46O 2FF3B 3FR0A 3MN5A 4PKIA 3ZETA 1XUPO 4BRQA 4BREA 2IVPA 4MLHA 4B1VA 4RTFD 4M7XA 3H3OB 5FPDA 5AQXA 3P4IA 3LDPA 3S41A 2FF6A 3UKRB 4BC5A 3DXMA 3VPZA 4CI6A 2E2QA 2P9UB 3ID8A 4KBOA 5BR9A 1Y64A 4XH1A 2QWNA 1NGDA 5AZJA 2P9SB 4O5FA 1S3XA 4QS8A 1V4TA 4H0XB 4AM6A 2FSJA 3SMPA 5AFUH 1JCFA 2QXLA 5AQYA 3FZFA 3IUCA 4CZKA 3O08A 4A2AA 1XQSC 4JHDB 2QWLA 1JCGA 2ZF5O 5CE3A 4BVOA 4FOEA 5F2RA 3C7NA 2E20A 3GBTA 3HTVA 4B1ZA 1SZ2A 1NMDA 3BF3A 2NRHA 3R8EA 1NGGA 3SJHA 3VGLA 3VENA 3WXIA 5ADXH 3D2FA 2F9WA 2NZTA 4BRLA 3MK6A 3A0IX 4BRFA 4JAXA 4BR5A 1E4FT 2I7PA 2EWSA 5AQMA 4PL7A 2CH6A 3FGUA 5AZJB 3U8XA 3WQTA 1ZBSA 4B1UB 3W3DA 1ZXOA 5TKYA 5ELZA 3QB0A 2BTFA 3VF4A 3ATVA 3FZLA 1BO5O 4JD2A 3MDQA 2PAVA 1D4XA 3MN6A 4BRMA 3VEWA 4BC3A 2ASPA 4CD3A 2ZGYA 2YJEA 3EL2A 3CJ1A 3C7NB 4YDUA 4BC4A 1YUWA 3O5BA 5AQJA 1QZ5A 1GLBG 2QM1A 3CI5A 4CD1A 3QFPA 2E2NA 5F1XA 4WYBA 3VERA 3D2FB 4M7YA 3M1FA 1BA1A 3LDOA 1HUXA 3CJAA 3O80A 4O8KA 1LCUA 2J4RA 2IIRA 4GY2B 5AQIA 3L6QA 4M63C 2P9NA 3O1BA 2D0PA 3DXKA 4FWSA 3JS6A 4BRDA 1ATSA 3A5LC 3EKSA 4CJ7A 5LJVA 4JD2B 4H5TA 4BR9A 5AQPA 3VGMA 5AQRA 4H5VA 5AFUA 3H1QA 1KAZA 3GG4A 5BREA 1Z05A 3IMXA 2A5XA 2D1KA 4BVPA 5AQLA 5KPZA 4BRKA 3FFKB 5BPLA 4LC9B 3VESA 3ZX0A 4FSVA 4I6MA 4FWMA 3W0LA 3ENHA 1CZAN 5FPEA 5KQ8A 4IZ9A 4BR0A 5AQGA 3QDKA 4H5RA 4IJNA 1QQMA 2CGLA 4H5NA 1BU6O 3WEEA 2QWPA 2P9NB 1HLUA 3DXKB 3H1VX 2YHWA 3GOIA 4FWOA 4BG9A 4FWQA 2HF4A 3MMVA 4BR4A 2E1ZA 4PKGA 3ZX2A 3D7EO 4A2BA 2ASMA 1NGIA 2GELA 4E1JA 2HMPA 1H1VA 3CJBA 4DQ8A 5JMVA 3GE1A 5AQVA 4BC2A 5BN8A 2CH5A 3DAWA 3ZEUB 3AY9A 4DB3A 5AQNA 1NGEA 2ASOA 3AAPA 4I6MB 4ISEA 4BRNA 1RGIA 4XH4A 1GLJO 2YHXA 4IWVA 5BPNA 5EX5A 2E1YA 4BR2A 1LOTB 4QS7A 2GWKA 2IVOA 1SQKA 1GLLO 5E26A 1TUYA 1X3NA 2FSNA 3D2EA 3HI0A 1HKGA 3ZETB 2Q31A 2HOEA 2P9KA 1NGCA 3QMLA 4MO4A 3CQYA 2ZWHA 3JXUA 3QBXA 3VF6A 5AQQA 4A61A 3WXJA 4EHTA 3DXMB 4CZGA 4H0VB 5KPRA 3LDQA 2DPNA 1DGKN 4FPAA 2CGKA 3ENOA 3WT0A 4HTLA 4BRPA 3HSCA 1BA0A 3LL3A 3EKUA 2YI1A 4FWKA 3SK3A 3O8MA 2CGJA 1TYQA 2P9IA 3IFRA 4H0PA 2KHOA 4XEIA 4EHUA 3G25A 3FZKA 1TUUA 1U6ZA 1WOQA 3VEOA 4PKHA 3DJCA 1E4GT 1T6CA 2YHYA 4RCHA 4Z94A 2FSKA 3DWLA 1J6ZA 3D2EB 1HKBA 1ZC6A 2YJFA 5BRHA 2QWOA 2P9KB 3AAQA 4WQ4C 1QQOA 4EFHA 2FLOA 4J8FA 3I33A 3A5MC 4GNIA 4BGBA 3HM8A 1BOTO 1SAZA 3UKUA 3FZMA 3MN9A 4FO0A 3A8YA 1ATNA 5BPMA 1BUPA 2A40A 1HPMA 3U9ZA 1G99A 3KVGA 4B1XB 4JN4A 2Q2RA 1TYQB 2P9IB 3SMSA 5EVZA 2E2OA 5LJWA 3AARA 3VF2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UQGA 1MA9B 2E8AA 3TAMA 3O9SA 4MLEA 3E9OA 4ILJA 1NK7A 1WSHA 1X9SA 4CZEA 2D0OA 4N47A 1CXUA 4K8ZA 4CBUA 3Q7CA 2PBDA 1J54A 1FK9A 4K42A 3MX2A 2E88A 5JENA 5EY4A 3BP8A 2JWKA 4CJUA 3V9WA 4B3MK 2WOMA 3O4WA 1KAXA 3NH0A 1XMQK 3LP1A 1RDUA 2N2RA 4AAZA 1WAJA 4CEAA 1WB9A 2UUAK 4OPHA 3J81O 2B4JA 4JI4K 3CCQN 2DFFA 4DMNA 3PIPL 3KHYA 2NNWA 3V9ZA 2KQ2A 3WUHA 4NLCA 3TARA 4FZZA 1K8AO 1NJIO 2OPQA 1BDGA 5BN9A 4KPYA 3R9PA 5C42A 4DHYA 4V19S 4QAGA 1NNEA 1FH3A 4EAHD 2GL1A 1S1UA 5FROA 4K25A 3NHGA 1D5AA 5HRNA 5JLHA 5CR4A 3V9XA 3E1YA 3PY8A 4WQ4A 3PIOL 1IKVA 2W6LA 1HQUA 1DKGD 1MR4A 2AA4A 5AQFA 4B1YB 3T3FA 2Q0UA 4FM2A 4FW1A 3MEEA 4DUYK 3VEVA 1NRBA 2YIOA 5B8HA 4F9OA 1OKJA 2UXBK 1Q18A 1K8KB 3VN5A 1NGFA 4I9QA 4BRHA 1NJZA 1F21A 1C56A 2Y1IA 3IRXA 4M3WA 4FL9A 1Z26A 2KYQA 2QTDA 1RT2A 3HO1A 4RG8A 4DQQA 1S1WA 3CCUN 1BI4B 4WQ5A 3JYTA 1NMNA 1DEJA 3CJ7A 3QBWA 3L3VA 1ASUA 1XWLA 1GLFO 1GPTA 3B8AX 5HROA 4F2RA 1C0FA 5C0YA 3CETA 3OJSA 1I6FA 1ZU3A 1VQON 4HCBA 3CIPA 5C2DA 3NDKA 5KPTA 1MWMA 3ULEA 1C0GA 2KPYA 5AZIB 3L3UA 1SEGA 2D0BA 1PE4A 5AQTA 3QLHA 1N34K 3VGKA 4YNQA 1D9DA 2C1IA 4BECA 3AO1A 1JXCA 1V4SA 3MCPA 4H03B 5EU7A 4IOAL 3DOLA 4GV3A 4IXCA 1KFDA 4DTXA 3BEXA 5GINA 5FLXO 4IOXA 2LR3A 5AQUA 3VQ7A 1YIJN 1HNVA 1NU0A 4BE0A 1U48A 4YOUA 3A5OC 3UKRA 4CJKA 1NM1A 4AM7A 1TK5A 3M6GA 5HRPA 3AVMA 4NO7A 3LM9A 1WNSA 2Z1JA 2HHXA 3P83D 3V1OA 3EN9A 4B1WB 2V7YA 2N69A 4KKOA 3LAMA 2Q0RA 2NRXA 3DRPA 3WXLA 4ISFA 3M3ZA 2ZE2A 1NJXA 3C0BA 3QFUA 1KVBA 3S3NA 1HJOA 4DLGA 3L2UA 2ITMA 3TU5A 1WSGA 3T1AA 5JVGL 1HKCA 1BWFO 4BG8A 1S1XA 1QSYA 2FF3B 1B9DA 3MN5A 4BREA 1VQ9N 3K57A 3KLEA 1D8YA 5AQXA 3LDPA 3OBWA 2FF6A 2VY6A 3DXMA 3VPZA 4C8MA 2E2QA 4KBOA 1Y64A 2QWNA 4DR2K 2P9SB 1RTIA 1S3XA 4AM6A 2FSJA 1BCMA 1JCFA 2OPPA 2QXLA 4FYDA 4CGIA 1JCGA 2ZF5O 4BVOA 2F8TA 2NY9X 4FOEA 1Q81O 5BR8K 1YHQN 4AHVA 4N41A 3GBTA 5JVHL 3HTVA 5M1FA 4B1ZA 3V6DA 3BF3A 1SKWA 1DTTA 3SJHA 3VGLA 3VENA 3WXIA 5ADXH 3RMCA 3OYLA 3LPTA 5D3GA 3ZSRA 4BRLA 3AVNA 5HP1A 3BZCA 4IDKA 4FJKA 4BR5A 3NF6A 3FGUA 4B1UB 1VNAA 3A2FA 5C10A 3SQ2A 1NK0A 4DKWA 3CG7A 3VF4A 4FLWA 4FXDA 4FJLA 4LF8K 3MN6A 2OA8A 1T7BA 3VEWA 4BC3A 2ASPA 4CD3A 3HPHA 5KRTA 3EL2A 1NKEA 1YJNN 3C7NB 1OH6A 2HHVA 4DR1K 4YDUA 1TK8A 1YUWA 1P90A 2O8CB 1IKYA 3CI5A 2KTQA 4U67L 3RRGA 2Q3SA 5F1XA 4F3OA 3ALYA 1VQLN 2X6NA 4DTMA 2JWLA 4KRFA 3M1FA 1BA1A 4X62K 3QESA 1VSHA 4CJLA 3O80A 4FJIA 4CEQA 2J4RA 1NKCA 1RBSA 4FVMA 1BHLA 3L6QA 4M63C 1Q7YO 2P9NA 1UAXA 1ATSA 4CJ7A 4DFKA 3U6FA 3EYZA 4DV3K 3NBPA 4BR9A 2XY7A 1XI1A 3VGMA 2YNIA 2E6LA 4BWJA 3THXA 2LJMA 4AILC 3KJVA 4CCHA 2A5XA 1BK8A 1K6YA 1FXXA 4DQIA 1HRHA 5AQLA 4BRKA 4CW7B 2W42A 3FFKB 5BPLA 4LC9B 4E1MA 3V9UA 4DS5A 3SUQA 4CK1A 4OLBA 2HHSA 1VQ4N 3RTVA 3D6RA 1X1PA 1TI5A 1ZFUA 2PYJA 3SV3A 3DRRA 4IZ9A 3CPEA 5AQGA 1C1BA 3QDKA 3R3LA 4IJNA 4ZHRA 4FVUA 3WNFA 1GOBA 3LALA 2CGLA 3QNNA 4FW2A 3WEEA 2QWPA 3K5MA 2XO7A 2YNHA 3QINA 2BANA 1CN2A 3SAGA 3TI0A 4BG9A 2QI2A 4HHTA 2E6MA 3ID6A 3ASMA 1HYSA 2F8SA 3PO4A 1RT7A 1NGIA 1O13A 4E1JA 1H1VA 3QIOA 3CJBA 4FJHA 1YVUA 3QIPA 5AQNA 3AAPA 4M3YA 4IEEA 1BISA 5BPNA 2X6SA 3SV4A 4B3RK 4DV2K 1S6PA 2IVOA 3WNHA 1VHXA 3HI0A 2Q31A 5A2QO 1J5EK 3QMLA 2X74A 4LF5K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UQG A;  1MA9 B;  2E8A A;  3TAM A;  3O9S A;  4MLE A;  3E9O A;  4ILJ A;  1NK7 A;  1WSH A;  1X9S A;  4CZE A;  2D0O A;  4N47 A;  1CXU A;  4K8Z A;  4CBU A;  3Q7C A;  2PBD A;  1J54 A;  1FK9 A;  4K42 A;  3MX2 A;  2E88 A;  5JEN A;  5EY4 A;  3BP8 A;  2JWK A;  4CJU A;  3V9W A;  4B3M K;  2WOM A;  3O4W A;  1KAX A;  3NH0 A;  1XMQ K;  3LP1 A;  1RDU A;  2N2R A;  4AAZ A;  1WAJ A;  4CEA A;  1WB9 A;  2UUA K;  4OPH A;  3J81 O;  2B4J A;  4JI4 K;  3CCQ N;  2DFF A;  4DMN A;  3PIP L;  3KHY A;  2NNW A;  3V9Z A;  2KQ2 A;  3WUH A;  4NLC A;  3TAR A;  4FZZ A;  1K8A O;  1NJI O;  2OPQ A;  1BDG A;  5BN9 A;  4KPY A;  3R9P A;  5C42 A;  4DHY A;  4V19 S;  4QAG A;  1NNE A;  1FH3 A;  4EAH D;  2GL1 A;  1S1U A;  5FRO A;  4K25 A;  3NHG A;  1D5A A;  5HRN A;  5JLH A;  5CR4 A;  3V9X A;  3E1Y A;  3PY8 A;  4WQ4 A;  3PIO L;  1IKV A;  2W6L A;  1HQU A;  1DKG D;  1MR4 A;  2AA4 A;  5AQF A;  4B1Y B;  3T3F A;  2Q0U A;  4FM2 A;  4FW1 A;  3MEE A;  4DUY K;  3VEV A;  1NRB A;  2YIO A;  5B8H A;  4F9O A;  1OKJ A;  2UXB K;  1Q18 A;  1K8K B;  3VN5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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