2BUPA

T13g mutant of the atpase fragment of bovine hsc70
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGGTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2bupA04
2P9PA 2P9LA 4EFHA 4BRAA 1NGAA 1LCUA 3O80A 5EXWA 2BTFA 1QHAA 4M7XA 4CZLA 4A62A 4BRIA 4B1YB 1JCGA 3DWLA 2CGJA 4H03B 4JHDB 3CQYA 3FZHA 5AQTA 2NLXA 3O1WA 1X9JA 2P9KB 4DHYA 3FR0A 3H1QA 2P9NA 3H1VX 3O6WA 1MA9B 2H3GX 3WQUA 4FWPA 5B8HA 5BREA 2QWOA 1KAYA 1NGGA 1HKGA 3MDQA 4IWVA 4WQ4A 4M63C 4CBXA 3W3DA 2YHYA 2P9UA 3WUHA 4CZHA 1RFQA 4NB4A 4IO8A 2VYPA 5F1XA 2KHOA 3WXKA 2E2OA 1QQNA 1BDGA 2V7YA 1S22A 2E88A 4AM7A 1ATRA 2A40A 2A42A 3P4IA 2P9IB 2YJFA 4FOIA 2E2NA 4BR4A 5KQDA 4H5TA 5BPLA 3MN7A 4DCHA 4QS8A 3VF6A 4GY2B 1NLVA 4QS9A 4MLEA 4CZEA 3TU5A 1KAZA 4XH5A 3M1FA 3S41A 4O8KA 2ZF5O 4MO5A 2P9UB 2FSKA 4RWTA 5BRDA 4I6MB 1DEJA 4H0PA 3L6QA 5FPEA 2AA4A 3ZETB 3A5OC 2CH6A 1BA0A 2GWKA 4FWQA 3VGMA 3CHWA 3KHYA 4B1UB 1T6CA 1Z05A 1D4XA 1NM1A 5ELZA 5AQWA 5ADXA 1U6ZA 4IZ9A 2DPNA 5AQYA 4ISEA 4MLHA 1DGKN 3O1BA 4FO0A 3HSCA 5EY4A 2E2QA 3RSEA 3LDQA 3R9PA 4H0VB 1XQSC 3WEEA 2E8AA 3MCPA 4QS7A 3UB5A 2A3ZA 1V4SA 3H46O 3AAPA 4FPAA 4BRPA 3QB0A 2Q0RA 1QZ5A 3H3NO 3FZFA 4CZFA 2IVOA 2QWMA 2V52B 4XH1A 3U4LA 1ZC6A 4K25A 4H5VA 1MDUB 4IJNA 2ASMA 2VWBA 3WQTA 2P9SA 2V7ZA 5JICA 2QWLA 3ULEA 4JNEA 1X3MA 3MK6A 1MWMA 3IMXA 4BC5A 1XUPO 4BRQA 2QWNA 3WXLA 2OANA 3EKSA 4FWLA 2YI1A 2WUSA 1BWFO 5LJVA 2QM1A 2QW9A 3SMSA 2YHWA 4RTFD 1YAGA 3IDHA 2E1YA 3ZX3A 2HMPA 4CI6A 5FPNA 3EZWA 4BRMA 1Z6RA 3MMVA 5FPMA 3MN6A 3VETA 4YDUA 3GG4A 2W41A 3QDKA 5BPMA 1BU6O 1X3NA 2UYTA 3FFKB 3I33A 2P9SB 3KZBA 4ISGA 1DKGD 4K41A 4PKIA 1Y64A 2HOEA 3EKUA 3FLCO 3F9MA 3SLCA 3CJAA 2Q97A 3UE5A 1TYQA 3UKUA 3QFUA 3VEXA 3MN5A 5TKYA 4EIAA 5AR0A 4IJAA 5AQIA 3FZLA 3CERA 3QFPA 5AFUA 4Z94A 3HZ6A 4BRNA 3H45C 3CJBA 1NBWA 4JD2B 5ADXH 5BR9A 3DXKB 4Y0WA 3BP8A 1ATNA 3ATUA 4B1WB 3VEZA 4B1ZA 3EO3A 2P9LB 2P9PB 1P8ZA 5AZIA 4BRFA 3ZEUA 1QQMA 4FWSA 5BRHA 4BR7A 2GWJA 1EQYA 3BF1A 3HBTA 4A2AA 1NWKA 2FLOA 4JN4A 4BC2A 2ZGYA 3CJ9A 3SJHA 4EHTA 3G25A 4BRHA 2E20A 1C0FA 2FXUA 3C7NA 1JCFA 1HUXA 3KVGA 1RGIA 4FSVA 3JXUA 2IVNA 5AQFA 3TPQA 2FF3B 3O08A 2E1ZA 2P9NB 2ITMA 3VGLA 3LM2A 5JLFA 1WUAA 1RDWX 5AQLA 4FOEA 4IXCA 2QWQA 4BRKA 4BC3A 4WQ5C 1QQOA 3D2EA 3QBXA 5EVZA 2V51B 3BUZB 3CIPA 2HF4A 4PL8A 1S3XA 4BR2A 1TUUA 3BF3A 2Q0UA 4CD1A 5JMVA 3WXJA 3VGKA 1OKJA 1G99A 4H0XB 3ZEUB 3ID8A 3GL1A 2I7PA 4XH4A 1V4TA 1HPMA 3U9ZA 4H5RA 1U2VA 4BR9A 3VPZA 5AQVA 3VEWA 3LDPA 2A41A 1NGDA 1H1VA 5AQUA 4A2BA 4BRGA 3C7NB 2Q2RA 5AZJA 4C23A 1NGCA 5JLHA 2NRHA 1E4FT 1Q18A 1TUYA 4DQ8A 3FZMA 2EWSA 1GLEG 3D2FA 2ASPA 3VOVA 4BVPA 4PKHA 3SK3A 1XC3A 3FGUA 1NGHA 2ASOA 3L0QA 3VERA 3MN9A 4JAXA 1IJJA 3D2EB 5AQHA 3CJCA 1YXQA 4DB3A 3U8XA 3ENOA 5AQXA 3VEVA 1CZAN 3EN9A 4H0OA 4BGBA 2NZTA 5BRFA 2GEMA 1BA1A 4H5NA 3A0IX 1NMDA 3O8MA 3VESA 4BQZA 1KAXA 4BR5A 1U2VB 2W40A 2CGKA 4CBUA 2J4RA 3AARA 4L3QA 5AQSA 3RSEB 4K42A 4HWIA 5AZJB 4BVOA 1IG8A 4H0TB 3WEEB 4PL7A 2F9WA 5AQPA 3U9DA 3D7EO 4FWNA 4XEIA 3M6GA 1SQKA 3OHRA 1HKCA 4A61A 4CZIA 4BR0A 1NGJA 2A5XA 4B1VA 3DJCA 3SMPA 4B1XB 3LDOA 3QBWA 5BPNA 3I8BA 3FZKA 3VEYA 4BREA 4BC4A 1T44A 2YHXA 2QWRA 2P9KA 4CBWA 5EOYA 4CZKA 4EHUA 4PKGA 2IIRA 5AQRA 1GLFO 2GELA 4B9QA 4BRCA 5AQKA 3O5BA 3ULEB 4FWMA 4M7YA 1MWKA 2Q1NA 5I9EB 4FPBA 2HF3A 4AM6A 4MO4A 1JCEA 4LC9B 2QXLA 2E2PA 4BG8A 1WOQA 1ZXOA 2FF6A 3HI0A 2FSNA 5AQOA 1GLJO 1GLLO 4J8FA 1HLUA 2QWPA 3A5MC 2FSJA 2YCHA 3H3OB 1ESVA 5LY3A 4CZGA 3FE1A 2P9IA 2F9TA 4CJ7A 1NGFA 4CZJA 3EL2A 1GLCG 1SAZA 4BQLA 2ZWHA 3L4IA 4WQ4C 1E4GT 5KQ8A 4BG9A 3ENHA 3M3ZA 3UKUB 3IFRA 3VENA 1TYQB 4FWKA 3HTVA 4I6MA 4H0YB 3W0LA 3ATVA 3GDQA 1BO5O 3J8AA 3ZETA 4WYBA 5KPRA 1ZBSA 1R59O 1C0GA 4E1JA 1HJOA 1NGBA 2A6AA 3VEOA 4BRDA 2CH5A 3CQXA 3VF4A 4WQ5A 5E84A 3LL3A 1QZ6A 5AZIB 2VCPA 2Q31A 4EAHD 2AP1A 3AAQA 3CI5A 5KPZA 3A8YA 2GUPA 4FWRA 3LM9A 3C0BA 3JS6A 3GBTA 1K8KA 1NGEA 3R8EA 4GNIA 2ZGZA 4FL9A 3WXIA 1BOTO 3ZX0A 5AQNA 1GLDG 3UKRA 4KBOA 1BUPA 3WT0A 1YVNA 5BN8A 4CD3A 1KXPA 5LJWA 3R6MA 4FWOA 2D1KA 1T6DA 2CGLA 3AY9A 3H6EA 2BUPA 1BG3A 4ISFA 3HM8A 3CJ7A 3CETA 4CZMA 3QMLA 2D0PA 2PBDA 5AQZA 2I7NA 5AFUH 1NGIA 3B8AX 3IUCA 3DXMA 3ZX2A 2IVPA 4BRLA 1K8KB 5KPTA 3QICA 2D0OA 4BGAA 5AQJA 1J6ZA 1HKBA 3UKRB 2PAVA 4NO7A 5AQGA 3LDLA 2YJEA 4K43A 3D2FB 3CJ1A 3GE1A 2Q36A 1SZ2A 2GTDA 5CE3A 3O4WA 3DAWA 1LOTB 3BEXA 4O5FA 3A5LC 1ATSA 1YUWA 5F2RA 4JHDA 4F9OA 3A5NC 4BROA 5BN9A 5AQMA 1GLAG 3LDNA 5E26A 2D4WA 4H5WA 3DXMB 3GOIA 1GLBG 4RCHA 3VF2A 5FPDA 1HX1A 5AQQA 4JD2A 3DXKA 4HTLA 5F0XA 5EX5A 4YDUC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WBBA 3J7AP 3O80A 3TR8A 1PE4A 4CZLA 4C8NA 4A62A 1D8YA 4TSXA 3NGIA 1RBRA 3C65A 3CQYA 3KK1A 2NLXA 1KFSA 1WSHA 3HPHA 3H1QA 3H1VX 1JZAA 1YITN 5BREA 1HKGA 3ZT2A 4WE1A 1ASUA 3CCLN 4KREA 5M1KA 2YV0X 3THYA 4CIGA 2HB5A 2E2OA 4CEAA 3K59A 2V7YA 3ZSQA 5J1EA 3M8PA 1MYNA 1ATRA 3AVFA 4J2EA 4C8LA 1IBKK 1T7BA 3P4IA 2P9IB 4CW7B 1UOCA 1NK6A 4DQQA 4FOIA 2E2NA 4CK2A 4BR4A 2NRXA 4DCHA 4YOYA 2JLEA 4DTJA 1VQMN 1J5OA 4IOAL 4GY2B 3LP2A 1NLVA 3DLLL 4CZEA 3TU5A 4BECA 1RT2A 3NCIA 3S41A 4Q0BA 3QNOA 4MO5A 1EKEA 2P9UB 1M1KO 4WCEL 2A7TA 4RWTA 2KTQA 1D9DA 3OYCA 5BRDA 1TK8A 2QI2A 5M1PA 4W5NA 2CH6A 1BA0A 5IT9O 4X65K 4IDHA 4JV5K 1Q8IA 4B1UB 5AQWA 3G10A 1KLMA 4B9MA 5AQYA 3EYZA 4M3UA 3O1BA 4LFBK 2OTJN 3O3GA 4DSLA 1EP4A 3KLHA 3CXCM 4O8UA 1V4SA 5C2DA 4KTWA 3AAPA 4BRPA 3QB0A 1ICAA 1SL1A 3E66A 5C10A 3CCUN 2V52B 1VSKA 3SCXA 2VWBA 2P9SA 2V7ZA 4KTZA 1C0MA 1U49A 3RMDA 3MK6A 2VQEK 3IMXA 4BC5A 4CHPA 4CJTA 1XUPO 4UAFE 4BRQA 1BQMA 1NKEA 3BGRA 3EKSA 1S1XA 1VSHA 1GPSA 4YOUA 3HK2A 1BWFO 5LJVA 2QW9A 3AO1A 4AAZA 5TKWA 3SMSA 3NH0A 3HM9A 1W9HA 4AH9A 4KPYA 4IO9L 2HMPA 3AO2A 2E6MA 3EZWA 5FPMA 1HYZA 3SJJA 3QDKA 4N76A 3O3HA 4XJXA 4K41A 4JK7A 2EX3A 1Y64A 2HOEA 3FLCO 1S6QA 3SLCA 3J80O 2Q97A 1WSFA 1TYQA 2X74A 2E3FA 5M1OA 3P83D 1T8EA 4HTUA 2W6LA 3CERA 4BWMA 4OPJA 3O9QA 1P90A 1HYSA 3H45C 2O8FA 4Y0WA 2GUIA 3NH2A 4B1ZA 3OTOK 5LL6Z 1KRPA 4UY8O 2UUAK 4WF9L 3L2RA 4X64K 4FWSA 3VQPA 1EQYA 2M8BB 3P1GA 4DKWA 4JN4A 4BC2A 3SYZA 2DTUA 3PLAA 3G25A 4BRHA 1LQQA 2E20A 1C0FA 3PY8A 4E7JA 2Z1IA 3DLRA 3JXUA 1SN4A 2ETJA 3O08A 4XIUA 3L2VA 1YIJN 5M1FA 2ZJRL 4NCBA 1RDWX 4WQ5C 4BACA 1QQOA 5HRSA 1HJRA 4KO0A 2HF4A 1MR4A 4PL8A 3BF3A 3SUOA 3M8RA 1B7DA 3WXJA 3CYMA 4CJVA 1X9WA 1OKJA 3ZEUB 3OJSA 4WFBL 3ID8A 1I3AA 5I42A 1HPMA 2K35A 3C94A 1Q86O 3TAEA 3U9ZA 1S6PA 3VPZA 1JZBA 4LY7A 1AYJA 4B3TK 3E1YA 3R1XA 1SS6A 3S3MA 4JKHA 2A41A 4BRGA 2JGUA 2Q2RA 4C23A 3AVNA 5JLHA 2DFEA 4DQ8A 3FZMA 2EWSA 3D2FA 3SK3A 2G8HA 4UAEF 2ASOA 5FLXO 3MN9A 2LJMA 2P1JA 4ELTA 4JK9A 3I8DA 4FJJA 1RT7A 3CYGA 5GINA 5HROA 4E3SA 4BE0A 2LR3A 1IKVA 2NRRA 3EN9A 3OA9A 4DV0K 2FBVA 3AV9A 2WTUA 3JSMA 1ZVEA 2CGKA 3CCQN 1N34K 3SI6A 4MDAA 3KD5E 2D0BA 2RE2A 1SL0A 3OYGA 3K5LA 4NYFA 5AZJB 4BVOA 1IG8A 4Z4EA 3QIOA 1VSDA 1N4NA 3D7EO 1YJWN 1NGJA 4YOVA 4KKOA 3TAMA 1N6QA 2QK9A 3LDOA 2YKNA 5DM7L 3KK7A 5BPNA 4CF1A 4BC4A 3CCJN 2D5RA 3Q7BA 3OBYA 2QWRA 3EE8A 2BE2A 1D9FA 3O9SA 4IG3A 4EHUA 2FBYA 2KZZA 1RDBA 3WXMB 4BRCA 4CK3A 3OS1A 2O4IA 3HRGA 4RW8A 3HXMA 4AM6A 1C6VA 1J9AA 3G4SN 1K8BA 4UJ0A 2QXLA 5CY0A 4MDBA 2HHVA 1GLJO 3L56A 3VMFB 2X6NA 4FXDA 1TAUA 1N33K 4LF7K 1X1PA 3K5MA 3KK2A 4FLWA 1ASWA 1W7AA 3OYAA 4LF8K 2P9IA 1FJGK 4CJ7A 4B9VA 4DTXA 4DR1K 1SAZA 3LP3A 1IH7A 5KRTA 1S72N 4LF5K 5M1NA 3CPEA 4E7KA 4IEIA 1ITGA 4N41A 1HNXK 1ZUTA 4FWKA 4KHNA 4DSJA 4H0YB 3W0LA 2XY5A 3ATVA 2WFBA 3CCSN 3TAPA 2OPSA 3IS9A 4C8KA 5KPRA 3OYEA 3CCRN 1AHOA 1HJOA 1NGBA 1HNWK 2LN8A 3BDPA 2B6AA 4B3RK 3J7YP 4JRQA 2CH5A 3CQXA 5AZIB 1VQON 4FCYA 4HCBA 4H8KA 1YT3A 4CJSA 4FWRA 3K2PA 3C0BA 3JS6A 1K8KA 1NK8A 1WSEA 4CJQA 3DYAA 1DT9A 3L2UA 3NE6A 4CJWA 3C95A 2I61A 1BUPA 3WT0A 3I0SA 1LAWA 4CD3A 1KXPA 2VG5A 3PO4A 2D1KA 1T6DA 2GL1A 3MX5A 1BL3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WBB A;  3J7A P;  3O80 A;  3TR8 A;  1PE4 A;  4CZL A;  4C8N A;  4A62 A;  1D8Y A;  4TSX A;  3NGI A;  1RBR A;  3C65 A;  3CQY A;  3KK1 A;  2NLX A;  1KFS A;  1WSH A;  3HPH A;  3H1Q A;  3H1V X;  1JZA A;  1YIT N;  5BRE A;  1HKG A;  3ZT2 A;  4WE1 A;  1ASU A;  3CCL N;  4KRE A;  5M1K A;  2YV0 X;  3THY A;  4CIG A;  2HB5 A;  2E2O A;  4CEA A;  3K59 A;  2V7Y A;  3ZSQ A;  5J1E A;  3M8P A;  1MYN A;  1ATR A;  3AVF A;  4J2E A;  4C8L A;  1IBK K;  1T7B A;  3P4I A;  2P9I B;  4CW7 B;  1UOC A;  1NK6 A;  4DQQ A;  4FOI A;  2E2N A;  4CK2 A;  4BR4 A;  2NRX A;  4DCH A;  4YOY A;  2JLE A;  4DTJ A;  1VQM N;  1J5O A;  4IOA L;  4GY2 B;  3LP2 A;  1NLV A;  3DLL L;  4CZE A;  3TU5 A;  4BEC A;  1RT2 A;  3NCI A;  3S41 A;  4Q0B A;  3QNO A;  4MO5 A;  1EKE A;  2P9U B;  1M1K O;  4WCE L;  2A7T A;  4RWT A;  2KTQ A;  1D9D A;  3OYC A;  5BRD A;  1TK8 A;  2QI2 A;  5M1P A;  4W5N A;  2CH6 A;  1BA0 A;  5IT9 O;  4X65 K;  4IDH A;  4JV5 K;  1Q8I A;  4B1U B;  5AQW A;  3G10 A;  1KLM A;  4B9M A;  5AQY A;  3EYZ A;  4M3U A;  3O1B A;  4LFB K;  2OTJ N; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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