1RCHA

Solution nmr structure of ribonuclease hi from escherichia coli, 8 structures
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Endonuclease
molecule keywords RIBONUCLEASE HI
publication title Solution Structure of Ribonuclease Hi from Escherichia Coli
pubmed rcsb
total genus 35
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1995-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rchA00
5JS2A 5FROA 3NGIA 3NGYA 3TAMA 1C0MA 5KRTA 3AO2A 1IKWA 1RTIA 4E3SA 5J2QA 3KLHA 4KHUA 1C0TA 4LSLA 1VSLA 2YKMA 3AVJA 2R7YA 1LWCA 2G8UA 4M3YA 1WNSA 3BGRA 4Z4CA 1RNHA 4FJLA 4DSJA 4CJQA 1WSGA 2E4LA 4OJRA 3ZT1A 3SZ2A 4KHNA 2YHBA 4KB1A 4FCYA 1TK8A 1B92A 4BWMA 3H08A 4CK1A 1VRTA 2FBTA 3AVFA 1EETA 3NAEA 4O55A 3VQ5A 3ZT4A 4EP4A 4M3RA 3KLEA 4DQQA 4B9NA 2BE2A 1S1TA 4DTXA 5J2NA 1RBRA 1CZBA 1QHTA 2HB5A 2VG5A 3T1AA 3VQEA 3ZSZA 1IKXA 4FLYA 4N76A 1VSFA 1S9EA 3V9UA 5HRNA 3OY9A 3OYBA 1NOYA 3VQPA 1BIUA 4CEQA 5FRNA 5SZTA 3CFOA 3QNNA 1YVUA 2ITGA 3QO9A 1TKDA 4KRFA 3PO4A 1RDDA 3K5LA 1TK5A 4KAZA 2G8KA 3DLGA 3ZSRA 1CXUA 4CESA 3V9WA 1Z26A 4O0JA 1LV5A 4I9QA 5FRMA 4E7IA 2HHVA 3DRPA 1S9GA 2IAJA 3FFIA 1VSDA 4FM2A 3NHGA 3QEIA 1L3VA 1NJYA 2OPQA 3EZ5A 4L8RB 3QETA 4CJFA 1KVCA 4CJRA 3NBPA 4W5QA 3TAFA 1RT5A 3DOLA 3D45A 2RKIA 4KREA 1HQEA 3O3FA 1LAWA 3NCIA 3LZJA 3QIOA 1LW2A 3SI6A 1XC9A 1ZYQA 1D9DA 4BDPA 4DTJA 1Q9XA 4B9LA 4RW6A 4Z4GA 3SNNA 1GOAA 4WE1A 1WSEA 1EKEA 2D0BA 4Y1DA 3M8SA 3S3NA 2X74A 3KKSA 1HMVA 4ID5A 3C95A 3PV8A 3ASMA 3OYHA 2F8SA 2Y1IA 5EU7A 4M3ZA 4IFVA 1TAQA 1VRUA 3T19A 1SKWA 4PY5A 4IG0A 2DY4A 3VQ6A 4DTPA 4G1QA 1QSYA 1ZBLA 4H4OA 4DS5A 4OGEA 3UIQA 4Z4EA 5C25A 3O4NA 2VWJA 1VSEA 5CY4A 3SQ0A 4KB0A 4CIEA 4C8NA 4PWDA 1VSMA 4HTUA 1S1XA 1S6PA 4IBNA 2EX3A 3LP2A 3KKRA 3TAQA 3B6OA 4AHRA 2Z1HA 5FDLA 4CE9A 3VQ8A 4Z4HA 5J1EA 4E7JA 4FJGA 4CIGA 4FJXA 3V9SA 3NE6A 4O0IA 3IAYA 4AHVA 4KI4A 4IKFA 3QLHA 4DQPA 3SPZA 3AO5A 1TV6A 1NKBA 1BI4B 4Z4IA 1XWLA 3L3VA 1JL2A 1KVBA 4I2QA 5C42A 4DF4A 5I42A 2KFZA 3MEGA 3NH0A 4NYNA 4CERA 4RW7A 5KI6A 2OYQA 4J2DA 3K5NA 4CFDA 2BANA 3OYFA 4FJNA 4B9TA 2YV0X 3AO1A 3HP6A 3V1OA 5JS1A 4IG3A 3ULDA 5J2PA 1X9SA 1L3UA 4Q0BA 1HPZA 4O4GA 3QEPA 1WN7A 3KLFA 3TANA 3DRSA 1RT1A 4JRQA 3NH2A 4FJ8A 1DTQA 4DTNA 1WSHA 4FJ7A 2F96A 1IO2A 1G15A 3PY8A 3NFAA 3QEXA 1GOCA 4LY7A 3ZSQA 3V9ZA 1GOBA 3RRGA 4KTWA 2G8IA 1IKVA 2HHXA 4MQ3A 3HT3A 3U6FA 4BACA 1RT2A 4Q5VA 1F21A 4CFAA 3L2WA 3TABA 1FKPA 3RMAA 3S3MA 3MEDA 4DSEA 1KLMA 1L3SA 1XHXA 4HUEA 1HNIA 4F3OA 1QQCA 2HHSA 2RPIA 3VQDA 1BI4A 4E1MA 4O5BA 3NF6A 4ZTJA 4NYFA 3IRXA 4BE1A 2RN2A 2QKKA 1X9WA 2XY5A 2OZSA 4FLUA 1JLQA 3G10A 3KK1A 3G0ZA 4CJVA 3SV3A 2XRIA 3OS0A 4B9SA 2B5JA 1YTUA 1DTTA 3L2VA 3VQ7A 1D9FA 2HW3A 2YNGA 3LWMA 3LDSA 4CEBA 1O1WA 3LZIA 4GVMA 4I7FA 2YNIA 4H8KA 4CF0A 2XHBA 4E7LA 3RTVA 4B08A 4ELUA 4CHOA 3HVRA 3PX0A 4DQSA 4DWIA 5T7BA 2YNHA 3F9KA 3MEEA 1JL1A 4CGHA 2HHQA 3M8PA 4KTZA 3NGZA 2HNYA 4E89A 1XI1A 3AV9A 4FLXA 1NOZA 3QEWA 1T05A 5CZ2A 2ATQA 1WAJA 4LD0A 2HVHA 1TKXA 4FZXC 3HPGA 5HRSA 4ELTA 3PX4A 3KK3A 4HUFA 3NF7A 1BCMA 3SUNA 1T7PA 3HO1A 1ZBUA 4KHWA 4UQGA 4CEZA 4DTSA 3OYGA 1Q8IA 2FC0A 3AA4A 3TAPA 4EZ6A 1UWBA 4H4MA 4BE2A 1RBTA 4CEAA 2O4IA 1KVAA 4DTOA 1NJWA 4NCBA 3C6TA 4DTRA 3PUFA 1S6QA 4CK3A 4CGDA 4ZTFA 2KQ2A 4FK4A 4PQUA 1HYZA 2XY7A 3V1RA 1TK0A 2OA8A 4N47A 4B3OA 1NK5A 1QSSA 1C1AA 3S3OA 1SL0A 3DRRA 1TKZA 1BQMA 4CJ5A 4JLHA 4N41A 1JLCA 3AVHA 3DMJA 2PZSA 2NUBA 4F2SA 2YNFA 4I2PA 3HXMA 4LH4A 3MXJA 4LSNA 3ZSYA 3CFRA 4B8CA 4W5RA 3L2UA 1RBVA 4M45A 3K5MA 3SV4A 4E7HA 4DU1A 3ISNC 4DU3A 3OYKA 4FJMA 3PX6A 1ZBIA 3LALA 3LP0A 3HL8A 4TSXA 2E6MA 3DLRA 2DFHA 1S1UA 1YTAA 1I3AA 3OYNA 3L8BA 1R0AA 1U48A 3B6PA 1L3TA 1JXEA 5KTQA 3CFPA 2G8VA 4FVMA 3ZT3A 2WOMA 5DMRA 2OPRA 3I0RA 3RRHA 1RILA 2FBYA 4FZYA 4Y1CA 4CJPA 2VWKA 1CLQA 1ASUA 4IDKA 3SUOA 2OPSA 4HVJA 3P5JA 1NK8A 1S1VA 4HCCA 1RBSA 1RTJA 1N5YA 3AO3A 4CEFA 4DU4A 1UOCA 4KO0A 4I9LA 2HHTA 1BIZA 4FW1A 1YT3A 3OYCA 4CF1A 2EHGA 2GV9A 3AVGA 4CFBA 3F73A 3MXIA 1VK0A 3O4QA 3AVAA 1X9MA 2B6AA 1NK9A 3TARA 1ZBFA 4ICLA 4J2AA 2O4GA 2D0CA 3OYDA 4CJUA 3QEVA 5HP1A 1RT4A 2QKBA 2KTQA 3V1QA 1C1CA 4E7KA 1EX4A 4OGCA 3ZSWA 3TAGA 1HYSA 3HP9A 4FW2A 4RW8A 1J5OA 3NH1A 2KZMA 2VG6A 4CJTA 3RMDA 3CM5A 3SPYA 1Z25A 4RG8A 3SUPA 4FJKA 3LP1A 4FLWA 4DFMA 3THVA 1NJXA 4CIFA 3L2RA 1W9HA 1WSFA 3KLIA 1KTQA 3HYFA 4CHPA 3KTQA 3JSMA 4FLVA 4AHSA 4M3TA 4JS4A 1BCOA 1DLOA 3OS2A 4AH9A 2Z1GA 3AO4A 3SCXA 4DTUA 3BDPA 5HRPA 4DFJA 3AA2A 3EYZA 1N6QA 1SKSA 1EXQA 3KJVA 1U47A 4FJ5A 5K14A 4K8XA 4J2BA 3DI6A 1JLEA 4W5TA 1JLGA 1A5XA 1RTDA 4Z4FA 3O3HA 4CF2A 4FK2A 4DLEA 2PY5A 3ITHA 3OVNA 2OPPA 3RWUA 4FM0A 1CZ9A 2IC3A 3TAEA 2RF2A 3SQ4A 3ZT0A 3KD1E 4E1NA 1J9AA 1RBUA 3IS9A 4BWJA 1MU2A 1B9FA 1TAUA 1QE1A 1JLAA 1X1PA 4HCBA 3V81A 4CEDA 4B9UA 1HJRA 4DS4A 3LP3A 3VQBA 4C8KA 1HRHA 4K8ZA 1VSHA 3QIPA 3L2QA 3HJFA 3CM6A 2QXFA 4F4KA 3QNOA 3OYIA 4OPJA 1KSPA 1LAVA 3OS1A 3AVKA 4EP5A 2OZMA 1UA1A 3AVIA 3WNGA 2D5RA 1CXQA 1HNVA 3OYMA 1S5JA 4M41A 3RR8A 2LSNA 1WAFA 3A2FA 1NK0A 1RDAA 4DQRA 2X78A 4B9MA 3QESA 1T8EA 3K57A 3OJSA 4DMNA 1A5VA 1NJZA 3SJJA 4B9VA 1A5WA 4PA1A 5HLFA 1K6YA 3MAQA 4W5OA 2IDOA 3MECA 2Z1IA 5HRRA 3NF8A 3ZSXA 2PYLA 4FJIA 4W5NA 3M8QA 2Q3SA 3U3GA 4YFUA 4CEOA 4M3XA 5E41A 5KRSA 2XY6A 4F3TA 4E0DA 3ZSVA 4GMJB 3AVNA 1TKTA 3VQQA 2X6NA 4CK2A 1ITGA 2IS3A 2QK9A 1UA0A 5SWMA 3PO5A 4RW9A 3CQ8A 2DFEA 2D0AA 3V6DA 2F8TA 1U45A 4OLBA 1ZBHA 1FK9A 4CGFA 4FJJA 1WSIA 1HQUA 3AVCA 3OYEA 4CHQA 4NCAA 1IG9A 4FLTA 4FJHA 2I5JA 3SYZA 4JS5A 3LPTA 3WNHA 3V4IA 2DTUA 4M3WA 2KW4A 4CEEA 2PYJA 4CGIA 3M8RA 2AJQA 4KHQA 3KD5E 3VQ9A 1B9DA 3HVTA 1SL1A 1TL1A 4CJSA 4CHNA 2P1JA 1KFDA 2IOCA 4DF8A 3SUQA 1BL3A 2BGGA 1U4BA 2XO7A 3ZCMA 3RMBA 4J2EA 1U04A 1L5UA 4E19A 2WONA 3AVBA 5KGWA 2A1SA 4ID1A 4CJLA 1W0HA 3DLEA 4KFBA 3AA5X 1TVRA 3OJUA 1C1BA 3DOKA 3RMCA 2FBXA 3S9HA 2A1RA 3HK2A 4F8RA 1HYVA 4R5PA 1D8YA 4CJ3A 4M3UA 1LW0A 1D5AA 2G8WA 1SKRA 1BISA 4B8AB 4CECA 3QINA 4CHYA 2B4JA 4DQIA 4BE0A 3TI0A 3VA0A 3QERA 1BHLA 3KK2A 1NKEA 3K59A 3D0PA 3V9XA 1U49A 1S1WA 3HSTB 3CYMA 4AHCA 4OKKA 3WNFA 1NKCA 3KLGA 2JGUA 3DLHA 3RR7A 2E6LA 4CHZA 4HUGA 3TR8A 4DSIA 1BGXT 3ZSOA 4OPKA 4EZ9A 3LAKA 4DSFA 1VSIA 1JLBA 3T3FA 4CJ4A 3OYJA 1T03A 3C6UA 3SQ1A 3LWLA 4XIUA 1XHZA 1RDBA 5DK5A 4DLGA 4CFCA 3EY1A 4OVLA 2GBZA 3VQCA 3ZT2A 2G8FA 3DLBA 4QOZB 4FYDA 4FM1A 1RTHA 3DLKA 1RDCA 2HHWA 4JRPA 3K58A 5KGXA 1RT6A 3TWHA 1Y97A 2G8HA 2IGIA 3L3UA 1C6VA 4N5SA 3HPOA 5HROA 4IFYA 1KLNA 2XY8A 2VG7A 3VA3A 1C0UA 5I3UA 5HBMA 4CJWA 2Y1JA 1ASWA 1QTMA 1QS4A 4F2RA 4KKOA 1Q9YA 1RT3A 1FXXA 3VN5A 2KFNA 4N56A 1WLJA 2YKNA 1LWEA 4KHYA 4AHUA 4RW4A 1ASVA 1WSJA 4KV8A 1JLFA 1VSKA 3MXMA 2W42A 4LH5A 4CGJA 1SL2A 1VSJA 2KZZA 1RT7A 2HNZA 3DM2A 4CCHA 4DTMA 2HMIA 4MFBA 3VQ4A 1KCFA 4YNQA 2HHUA 4QCLA 3I0SA 1SUQA 4DFPA 2ZE2A 3K2PA 3O3GA 3OYAA 5J2MA 1LWFA 4KHSA 4M42A 2ZD1A 1IKYA 3E01A 3P83D 1JXBA 4DG1A 1KFSA 4C8OA 3I8DA 4C8LA 4CJKA 2ETJA 4CF8A 4FZZA 4KPYA 4DFKA 4FK0A 3SQ2A 4DSLA 1NK4A 3CG7A 3JYTA 3NDKA 3HPHA 2HVIA 4FJ9A 1FKOA 4PUOA 1JKHA 2ZQBA 1SV5A 4KTQA 3K5OA 1EP4A 1TL3A 1TGOA 3DYAA 3U3YA 1J53A 1NK7A 1REVA 2DFFA 2YHAA 3AA3A 4DSKA 4Z0UA 3VQAA 3WNEA 3P1GA 4O44A 4CJEA 4CF9A 4BDZA 4AHTA 2FBVA 3C94A 1KRPA 3LAMA 2BDPA 1QSLA 3AVMA 3KIOA 2P51A 4NCGA 5CYQA 3IG1A 3AVLA 4OKJA 4C8MA 1NK6A 2HNDA 4KI6A 4FLZA 4ELVA 1J54A 2Z1JA 3LANA 1IH7A 3OYLA 4BDYA 2GUIA 4HHTA 2P5GA 3NF9A 4OLAA 4FXDA 1BQNA 1I39A 4AILC 5CZ1A 2P5OA 1RCHA 3LPUA 4ZHRA 4QAGA 5CYMA 3ALYA 5D3GA 5C24A 2X6SA 4OKEA 2JLEA 1UAXA 4CGGA 4GW6A 3HM9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JS2A 5F2RA 1C0MA 2D4WA 4BC4A 4LSLA 3AVJA 3MN7A 1RNHA 3TTFA 4DV4K 2E4LA 4KB1A 3QBWA 3IFRA 2QI2A 2QWLA 3NAEA 4DQQA 3VQ5A 1CZBA 1QHTA 3VQEA 1N36K 1VQ5N 4YY3K 5HRNA 3VTHA 3P38A 3OY9A 5BPLA 3OYBA 1NOYA 2O8EB 4CZIA 3CFOA 4BRKA 3ZETB 3M1FA 4KAZA 4B3MK 3QB0A 3IDHA 2KKZA 1CXUA 3V9WA 2GTDA 4E7IA 2IAJA 4H0OA 1S3XA 4BQZA 3QEIA 2Q1NA 2KLAA 2E2OA 3AAPA 3QETA 4L8RB 4CJFA 3CQYA 3DOLA 4KREA 1HQEA 1LAWA 4IDHA 3QIOA 3P4IA 1GOAA 4WE1A 1OVQA 3CXCM 1EKEA 2X74A 3KKSA 1HMVA 2ZJQL 2F8SA 2UXBK 5AQQA 4IFVA 3HOTA 1SKWA 4PY5A 3VQ6A 2O8EA 1ZBLA 4BRLA 5AQKA 2FSKA 4BC3A 4DUYK 4OPAA 4BR4A 4YOVA 4WQ4A 3A5MC 2W40A 4O0IA 3THXB 5EX5A 4IKFA 3I55N 1RDWX 1KVBA 2J4RA 4U67L 3VGKA 4JI3K 5I42A 4NYNA 4JI7K 3EKUA 4CFDA 2BANA 3CCSN 3OYFA 2NRVA 4FJNA 4B9TA 3J7YP 3ZX3A 3DXMB 3QEPA 1WN7A 1W2BM 1RT1A 4JRQA 4FJ8A 1DTQA 2F96A 1BUPA 3NFAA 1DKGD 4LY7A 3ZSQA 3V9ZA 3RRGA 4A5AA 2HHXA 3HT3A 1N8RO 1F21A 3TABA 1N33K 3THXA 3WXJA 3G25A 1QQNA 3UKUB 3EZWA 3W0LA 4O5BA 3NF6A 4NYFA 3IRXA 2QKKA 3U9DA 3BF3A 2OZSA 4FLUA 1JLQA 3KK1A 1V4TA 4CJVA 3CCQN 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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