5BPMA

Crystal structure of unhydrolyzed atp bound human hsp70 nbd double mutant e268q+r272k.
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACQRAKKTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bpmA04
1GLAG 4H5WA 4C23A 2WUSA 3FR0A 1HPMA 5AZIA 5AQYA 4B1YB 4FWOA 2GWKA 4BR2A 2E2QA 4JNEA 3DWLA 4BRMA 3HM8A 1QZ6A 2E1ZA 3ZEUB 1QZ5A 3MN9A 4H0TB 5AQMA 4L3QA 4WQ5C 2P9IB 3S41A 1ATNA 1TUYA 3EKSA 3ZX3A 4BVOA 2ZGZA 3VPZA 2A3ZA 1NGIA 3CJ9A 4BR9A 3QBWA 1HKCA 2A41A 3HTVA 3F9MA 4PL8A 3D2EA 4BC2A 4IO8A 3LDPA 2P9NB 3H3OB 3VF2A 2KHOA 2W41A 4DCHA 2D0OA 4FWRA 4K42A 4CZMA 1E4GT 3M3ZA 1DGKN 3TPQA 4JAXA 5AQQA 4FWMA 4EHTA 3MN6A 3U9ZA 3WT0A 3QMLA 4FWSA 4DQ8A 1MWMA 2BUPA 4BR0A 4BRGA 1JCGA 5ELZA 5BRFA 3FZLA 5AQUA 3AARA 5BRHA 1MWKA 1YVNA 2E2NA 2GEMA 4KBOA 5E84A 3CJ7A 4CZGA 4CD1A 1P8ZA 3KZBA 2V51B 4HWIA 5AQPA 2IVOA 2J4RA 2P9UA 3FFKB 4B1VA 5AZJB 2GTDA 4K41A 4BRQA 5AR0A 4BR7A 2H3GX 3MCPA 2QXLA 2FLOA 4CZFA 2CGKA 1XQSC 4I6MA 5AFUH 3FE1A 3QFPA 4MLHA 3A8YA 2VWBA 3W3DA 1HUXA 1NMDA 1GLCG 2Q97A 5JICA 2E88A 2ZGYA 4FPBA 4B1ZA 2YJEA 3FZMA 3HZ6A 4M63C 2ZF5O 4WQ4A 1SAZA 1LCUA 1OKJA 4FOIA 5FPEA 2ASPA 4BC4A 2A42A 5TKYA 2Q2RA 3QBXA 4BRDA 4BQLA 3O08A 5BRDA 1NGFA 1ZBSA 2P9LA 2PAVA 4CZKA 3UKUB 4IJNA 1KAXA 2QWRA 3SMPA 3ENHA 4DB3A 3EZWA 3WQUA 3ZEUA 2Q0UA 2V7YA 4BQZA 1QHAA 3ULEB 2P9IA 4I6MB 3CJBA 3GBTA 1BUPA 4BR5A 1ESVA 2V52B 3AAPA 3I33A 3RSEB 3M1FA 3SLCA 3A5MC 1BA1A 5AQWA 4EIAA 3FLCO 1SZ2A 5F2RA 2IIRA 1J6ZA 1JCEA 2P9NA 4Y0WA 1XC3A 3EO3A 3SMSA 4CBXA 3DAWA 3BF1A 4F9OA 4BREA 4CZJA 3QFUA 1EQYA 2IVNA 4MLEA 3H46O 2CH6A 3O6WA 2GELA 3KVGA 2P9LB 1BDGA 5BPNA 2ASMA 3QDKA 3BEXA 1Y64A 4IZ9A 5AQVA 1ATRA 4PKGA 4XEIA 3A5OC 3LDOA 2NLXA 1C0FA 1BG3A 3G25A 5KQ8A 3WXLA 3DJCA 1U2VB 5BPMA 4BROA 4JN4A 3WQTA 2A5XA 3ZX0A 2P9KB 3MN5A 5AZJA 5LJWA 3DXMB 3GG4A 4XH5A 1NGBA 2HF4A 1E4FT 3IUCA 4WYBA 3VENA 4BGBA 2E2OA 2E20A 3ID8A 4EHUA 1NGCA 4YDUA 2D4WA 5I9EB 3MK6A 3O1BA 2FSJA 3ATVA 4BR4A 4CBWA 4FO0A 3O8MA 4A61A 4CZIA 4PL7A 5KPZA 3ENOA 4LC9B 5AQTA 2HF3A 5KQDA 5AQOA 5AQNA 5B8HA 5AQRA 1RDWX 3VGKA 1U6ZA 2D1KA 5ADXH 5BREA 4H0OA 3SJHA 4DHYA 3P4IA 2GUPA 2F9TA 3CJCA 3UKUA 5E26A 4ISGA 4BG8A 3H3NO 2FSNA 3CIPA 3IDHA 1CZAN 2Q31A 1G99A 2I7NA 3LDNA 3EN9A 3JS6A 1NWKA 4J8FA 4K25A 4A2BA 2QWMA 5BR9A 2Q36A 5JLFA 4H5VA 3VEYA 1GLEG 3O4WA 3J8AA 3U9DA 4NO7A 3ULEA 2YJFA 3SK3A 1XUPO 3VETA 1YXQA 3RSEA 2YHYA 3C7NB 4FWKA 4PKIA 1Z6RA 3H1VX 2CH5A 1X3NA 1BO5O 3L0QA 3C0BA 1YUWA 5AQSA 1JCFA 4RTFD 4GNIA 3FZFA 3HSCA 1GLFO 1K8KB 5KPRA 2YI1A 1QQOA 3TU5A 4E1JA 1T6DA 3GOIA 1KAYA 2P9PB 3EL2A 4QS9A 3ATUA 4EFHA 2YHWA 1S22A 2P9SB 3H1QA 1MDUB 3WXJA 5AQFA 4FWLA 4FSVA 3CJ1A 4JHDB 3L4IA 4BGAA 1BA0A 1DEJA 1U2VA 1X9JA 3WEEB 3VOVA 5AFUA 4FPAA 4BC5A 1S3XA 2A6AA 3QICA 4B1UB 5AQLA 5F0XA 3ZETB 2P9KA 2AP1A 3DXMA 4FWPA 4GY2B 3U8XA 3LDQA 4CZEA 1RGIA 5EOYA 1IG8A 4WQ5A 1C0GA 1IJJA 2E2PA 4BRCA 3I8BA 3A5LC 4K43A 1HKGA 1SQKA 5EY4A 3WXIA 4H5RA 4WQ4C 1TYQB 1D4XA 3LM9A 3LDLA 2Q0RA 3H6EA 5JMVA 1HJOA 2I7PA 4FOEA 3L6QA 3UE5A 4QS7A 3CHWA 2FF3B 3MMVA 3CETA 2EWSA 4O8KA 4FL9A 4H0YB 5AQJA 3A0IX 2ITMA 3VEVA 3VERA 4BG9A 4CBUA 4H0XB 4IJAA 4H0VB 5AQIA 3O80A 2QWPA 2Q1NA 4CZLA 4RCHA 3UKRB 4CZHA 1NBWA 4QS8A 3IFRA 4BRHA 3R8EA 4ISFA 3R9PA 1NGHA 3FZHA 5AQKA 5EX5A 3VGMA 4H5TA 1Z05A 4JD2B 2YHXA 3DXKB 1BWFO 1MA9B 3JXUA 2ZWHA 1QQMA 3BF3A 1GLBG 1BOTO 3D7EO 4MO5A 1GLJO 4NB4A 4O5FA 2UYTA 3CJAA 1NGAA 3AAQA 4A2AA 1RFQA 3CI5A 3A5NC 4BRIA 1ZXOA 2E8AA 3C7NA 2OANA 2F9WA 4FWNA 1HX1A 4CD3A 1ZC6A 1YAGA 3MDQA 3WXKA 2V7ZA 2FXUA 3GL1A 2QW9A 3WUHA 2QWLA 3HI0A 1K8KA 1BU6O 1DKGD 4B1XB 1NGJA 2FSKA 3LM2A 5KPTA 3D2FB 5LJVA 2A40A 2P9PA 2FF6A 3VF6A 5AQZA 3H45C 2P9SA 3M6GA 4BVPA 1HLUA 2NRHA 5AZIB 3VEOA 3EKUA 4BRFA 4H0PA 4Z94A 1GLDG 1Q18A 4XH4A 2CGJA 4JHDA 3WEEA 3VF4A 4XH1A 5EXWA 4IWVA 5JLHA 2VYPA 1NGDA 3ZETA 4BC3A 3VEZA 5BN9A 3VGLA 3HBTA 5FPDA 4YDUC 1QQNA 4BRKA 2DPNA 2HMPA 2YCHA 3KHYA 3VESA 3CQYA 4H03B 4CJ7A 2QWNA 4IXCA 4B9QA 4BRAA 3MN7A 3D2EB 3UB5A 1TUUA 5ADXA 3R6MA 5FPNA 1TYQA 4HTLA 4RWTA 1V4SA 2CGLA 4BRPA 1H1VA 4EAHD 5LY3A 2AA4A 2PBDA 2BTFA 4FWQA 4B1WB 4CI6A 3VEXA 3CQXA 3GE1A 3W0LA 3IMXA 3CERA 1X3MA 4BRLA 2ASOA 3UKRA 4H5NA 2VCPA 3O1WA 1KAZA 3LL3A 4BRNA 1LOTB 4PKHA 5F1XA 4JD2A 1GLLO 2HOEA 4M7YA 3DXKA 3O5BA 2P9UB 1R59O 2QWOA 4MO4A 1T6CA 3GDQA 5CE3A 1NGGA 2IVPA 3BUZB 4AM7A 5AQHA 1HKBA 3ZX2A 2NZTA 1ATSA 2QWQA 1WUAA 1NGEA 5BPLA 5BN8A 2QM1A 3FGUA 3QB0A 4A62A 1V4TA 2W40A 5AQGA 1NM1A 1KXPA 1T44A 3OHRA 5AQXA 3U4LA 2D0PA 3AY9A 2GWJA 3BP8A 4M7XA 3VEWA 2E1YA 1NLVA 3D2FA 3FZKA 3B8AX 5FPMA 4ISEA 4AM6A 5EVZA 1WOQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UUBK 1GLAG 1RBUA 1RT7A 3A2FA 3HL8A 1U4BA 3FR0A 3LP2A 5AQYA 1BCGA 4FWOA 2GWKA 3MX5A 5CYQA 3SAGA 3PO5A 1PE4A 1DTQA 1M90O 3DLKA 3C95A 1JKZA 3SUOA 4EZ9A 5J2QA 3C94A 3KWIA 4DV7K 4DUZK 2RE2A 3MECA 5JVHL 1ATNA 4GW6A 1TUYA 3ZX3A 4DFKA 3RWUA 5KK4A 2ZGZA 4BWJA 3CJ9A 4CEQA 4O5BA 4C1NI 4WFNL 1WMTA 2KKZA 4YY3K 1UA0A 4CJRA 4YOYA 4GVEA 4BC2A 2I5JA 4NCAA 3LDPA 3KK1A 1HNIA 2P9NB 2KHOA 1NJWA 3LDSA 4GV9A 5DM7L 4DCHA 5HROA 1DQ7A 3C6AA 4K42A 1ZBIA 4LFAK 4FLZA 4JAXA 4CJVA 1QTMA 3U9ZA 4CESA 1F21A 5J1EA 1RCHA 4DQ8A 1ASWA 3ZSZA 2F8SA 4FW1A 1NRBA 1JCGA 3CCSN 4M42A 3FZLA 5AQUA 1VAZA 4GV6A 1YVNA 4RW8A 1P8ZA 1M1KO 2KBKA 3FFKB 2P9UA 1I94K 3PSMA 3DLLL 1EETA 4DU3A 3VQ4A 3M8SA 4M3ZA 4PWDA 2WC9A 3OYNA 1JZBA 4XIUA 2H3GX 3HPGA 1LAWA 2CGKA 2HHQA 3TARA 1S1XA 1BQMA 3KOWA 3A8YA 4PUOA 3KHWA 3PSFA 3THYB 3TAGA 1NMDA 4CHZA 4CJPA 4FM0A 4JKHA 2ZGYA 1A5XA 1I39A 2YJEA 4CFAA 4WQ4A 1SAZA 3LPTA 1IG9A 4DFJA 1B92A 1LCUA 3THWB 1VQKN 1RDDA 4DQIA 2QA4N 4UAEF 4FOIA 2ASPA 1D8YA 1HRHA 3U3YA 4CHPA 2HHVA 2QXFA 4EP4A 4O55A 1U48A 1PTXA 3AVIA 4CZKA 4FM1A 4CVNE 1FK9A 2HVHA 1KLNA 3ZEUA 1VQ9N 4C8NA 4I7FA 4JV5K 4F2RA 1TKDA 4LF4K 1CN2A 1VNAA 3IKMA 1KCFA 3ULEB 4W5RA 2XO7A 4ILJA 2N2QA 1J5EK 1BUPA 2HB5A 4WCEL 3SLCA 1BA1A 1WSHA 4CF0A 1J6ZA 3VQQA 1YJNN 2WFBA 1RTIA 3EO3A 4CBXA 3DAWA 4X66K 2VWJA 1C0UA 2KJAA 4F9OA 4JS4A 1XNQK 1BIUA 1MR4A 4MLEA 5BPNA 3BEXA 1Y64A 4IZ9A 3KC6A 2F96A 2YKMA 4A57A 4DR3K 4KREA 3V9ZA 3DJCA 2NUBA 2YNIA 4CJSA 2G2KA 1KFDA 2UXBK 3CM6A 3U3GA 2P9KB 5AZJA 5LJWA 3E7RL 3AVLA 4E7LA 2LY5A 3QIOA 3HK2A 4IFYA 3SI6A 4E89A 2HF4A 1WNSA 1E4FT 3VENA 1JLGA 2E2OA 3I8DA 2E20A 4EHUA 1X9SA 2MN5A 3RMBA 4UJ0A 2D4WA 2WONA 1VSLA 3MK6A 1JLQA 1NK8A 1VHXA 4PL7A 5KPZA 3CFPA 3ENOA 5KQDA 4I9QA 3THXB 3T1YK 1N32K 1L4VA 3VGKA 2B4JA 3VA3A 1U6ZA 2BH1A 4DQRA 3VQ8A 3Q7BA 1RBTA 2QI2A 3CIPA 4DR6K 3IDHA 4J8FA 2Q31A 3EN9A 2I7NA 2KZZA 5J2NA 3OTOK 2QWMA 3L3VA 5BR9A 2Q36A 2YHAA 5JLFA 3O4WA 3PO4A 1BI4A 2YJFA 4FZXC 5KTQA 3K9KA 4UY8O 5H1SQ 2UUAK 5KGWA 1C55A 2YHYA 2ZJPL 2HW3A 4FWKA 1OVQA 5C25A 2CH5A 1QSYA 1YUWA 1LAVA 1T7BA 4O8UA 4Y1DA 3PX4A 4FW2A 3CW4A 4JI6K 4DQSA 1N5YA 2YI1A 2HNDA 4B9UA 3TU5A 1Q82O 1RTDA 2B6AA 1LQHA 1KAYA 1RDUA 1IV0A 1DJTA 5FROA 3HP6A 1Q81O 2HVIA 1MDUB 4F2SA 4ILHA 3I56N 4GKJK 3ID6A 5M1KA 1BA0A 2OZSA 1U2VA 4KTZA 4FPAA 1S3XA 2E4LA 2E3GA 4CF2A 3DYAA 1KFSA 3KK7A 1S6QA 5GINA 1RGIA 5EOYA 3NGZA 3NHGA 1C0GA 1S1WA 5DK5A 2GBZA 3SV3A 1IJJA 2RHKA 1L5UA 4W5NA 1SN4A 3QEVA 4H5RA 1D4XA 3LM9A 5HOOA 3K5LA 3NE6A 2Q0RA 1B7DA 1TK8A 4DV1K 3G10A 3UE5A 4JI7K 3SCXA 4E7KA 3MMVA 4K8ZA 3CETA 3KTQA 4FL9A 3ZSRA 4DV3K 4IJAA 4H0VB 3O80A 4CZLA 1RTJA 3UKRB 4EP5A 4FZZA 3KJVA 1YT3A 1C6VA 3EE8A 1QSLA 2XY8A 3IFRA 4CJEA 4FXDA 4DQPA 4ISFA 1OH5A 4N41A 3FZHA 1NJXA 3V9WA 4FJ8A 2Q3SA 1BWFO 1MA9B 3AVNA 2ZWHA 1QQMA 1JLFA 1BOTO 2NY9X 4O5FA 1RBVA 2UYTA 4F8RA 4HCCA 3L3UA 2MBKA 1RFQA 3A5NC 4B3MK 1ZUTA 3C7NA 1UOCA 1VRUA 4CFDA 3BZKA 4CCHA 4X62K 1NNEA 3C6TA 2O8BA 3WUHA 2QWLA 3HI0A 1WT7A 3OA9A 3ZT1A 1BU6O 1HQEA 1NGJA 2JDQD 3R1XA 4DSLA 3D2FB 3OJSA 3ZSYA 4DSFA 2LY6A 2FF6A 3VF6A 3LWMA 4M3WA 2ETJA 4LH4A 4B3SK 3HYFA 2ITGA 5GADP 2NRHA 3CC4N 2YKNA 4W5OA 5HP1A 1HMVA 3EKUA 4H0PA 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1RDBA 3HJFA 5AQQA 4FWMA 1YJ9N 2UXCK 3VQCA 3LWLA 2PZSA 1HPZA 3B6OA 3WNHA 3EZ5A 1SEGA 3MN6A 3WT0A 4AHSA 4KHYA 2HHSA 4DSKA 3TR8A 3AARA 4DTMA 4IDHA 2D0AA 1IKWA 4KBOA 5KRSA 5E84A 1T3VA 4CZGA 2BDPA 2G8IA 4F3TA 4HWIA 5AQPA 2IVOA 2J4RA 3L2QA 3AA4A 5AZJB 4DR7K 3AVFA 4K41A 4BRQA 4BR7A 5CY0A 3BDPA 4BACA 2C1IA 2QXLA 3C6HA 1NOZA 2FLOA 4BE0A 4CZFA 3TSQA 1POIA 1CHZA 3DM2A 3AA5X 4YOUA 4CEOA 3LP1A 4MLHA 1TV6A 2NRXA 3NH0A 1GLCG 4FJHA 2E88A 4B1ZA 4QAGA 1VSJA 3J7AP 4M63C 2DTUA 4B8AB 2OTJN 3O3GA 1OKJA 3V9UA 1IKXA 1HQUA 4BE7B 4FVMA 5J2PA 3OYGA 2B68A 4OPKA 4LFCK 2BANA 4KH6A 4BRDA 4HHFA 1NE5A 3TAQA 4BWMA 1HYZA 4KHSA 2QWRA 3S3OA 1RDCA 5HRNA 1GPTA 4DB3A 1XMOK 3EZWA 4RG8A 1KV0A 2OCEA 1BI4B 2P9IA 4I6MB 3AO2A 4BR5A 1O13A 2V52B 3P5JA 1VSDA 3O3HA 3M1FA 4AEIA 1S9EA 3A5MC 1YTAA 4EIAA 3FLCO 1SZ2A 5F2RA 2IIRA 1RT5A 2WBNA 1JCEA 3ZT0A 3ZSOA 4C8LA 2YILA 1ZYVA 3OS1A 3MXMA 4BREA 4CJ3A 3QFUA 5C10A 1EQYA 2HNZA 4M3TA 3H46O 2CH6A 3KLIA 3NVMA 3O6WA 3SUNA 3U6FA 2P9LB 3HOSA 1R0AA 5SZTA 4AILC 1ATRA 1TAUA 1U49A 4XEIA 3SAFA 5DMRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2UUB K;  1GLA G;  1RBU A;  1RT7 A;  3A2F A;  3HL8 A;  1U4B A;  3FR0 A;  3LP2 A;  5AQY A;  1BCG A;  4FWO A;  2GWK A;  3MX5 A;  5CYQ A;  3SAG A;  3PO5 A;  1PE4 A;  1DTQ A;  1M90 O;  3DLK A;  3C95 A;  1JKZ A;  3SUO A;  4EZ9 A;  5J2Q A;  3C94 A;  3KWI A;  4DV7 K;  4DUZ K;  2RE2 A;  3MEC A;  5JVH L;  1ATN A;  4GW6 A;  1TUY A;  3ZX3 A;  4DFK A;  3RWU A;  5KK4 A;  2ZGZ A;  4BWJ A;  3CJ9 A;  4CEQ A;  4O5B A;  4C1N I;  4WFN L;  1WMT A;  2KKZ A;  4YY3 K;  1UA0 A;  4CJR A;  4YOY A;  4GVE A;  4BC2 A;  2I5J A;  4NCA A;  3LDP A;  3KK1 A;  1HNI A;  2P9N B;  2KHO A;  1NJW A;  3LDS A;  4GV9 A;  5DM7 L;  4DCH A;  5HRO A;  1DQ7 A;  3C6A A;  4K42 A;  1ZBI A;  4LFA K;  4FLZ A;  4JAX A;  4CJV A;  1QTM A;  3U9Z A;  4CES A;  1F21 A;  5J1E A;  1RCH A;  4DQ8 A;  1ASW A;  3ZSZ A;  2F8S A;  4FW1 A;  1NRB A;  1JCG A;  3CCS N;  4M42 A;  3FZL A;  5AQU A;  1VAZ A;  4GV6 A;  1YVN A;  4RW8 A;  1P8Z A;  1M1K O;  2KBK A;  3FFK B;  2P9U A;  1I94 K;  3PSM A;  3DLL L;  1EET A;  4DU3 A;  3VQ4 A;  3M8S A;  4M3Z A;  4PWD A;  2WC9 A; 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