4UY8O

Molecular basis for the ribosome functioning as a l-tryptophan sensor - cryo-em structure of a tnac stalled e.coli ribosome
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
DKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S RIBOSOMAL PROTEIN L32
publication title Molecular Basis for the Ribosome Functioning as an L-Tryptophan Sensor.
pubmed doi rcsb
total genus 33
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4uy8O00
1Q82O 1VQ7N 2ZJQL 2OTLN 2QA4N 5GAHP 4WF9L 1Q86O 3G71N 2ZJRL 5DM7L 1W2BM 3CPWM 1JJ2M 1VQLN 3CCJN 3CXCM 1VQKN 3CCQN 1VQ9N 4WCEL 1N8RO 3I55N 3G4SN 1QVGM 3CC4N 5HL7L 4IO9L 5GAGP 3CCMN 1VQPN 1YIJN 1ILYA 1YHQN 3I56N 4IOAL 1KQSM 5H1SQ 1NJIO 1OVYA 5MLCQ 3CCEN 1K8AO 3CCVN 1VQ8N 1KD1O 1YITN 3G6EN 1Q7YO 4WFAL 3PIOL 1QVFM 1VQON 1VQ5N 1VQMN 3CC7N 1VQ6N 1Q81O 3OW2M 2ZJPL 5DM6L 2OTJN 3CMEN 1K73O 1YI2N 3DLLL 1M90O 5GADP 5JVHL 5GAEP 4U67L 3CC2N 1S72N 3J7ZO 2QEXN 1KC8O 3CF5L 3PIPL 1YJNN 5JVGL 4WFBL 1M1KO 1VQNN 1YJ9N 3CCUN 3CCRN 4UY8O 3CD6N 4IOCL 3CCSN 4WFNL 1K9MO 3CMAN 1VQ4N 3CCLN 1YJWN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJ7A 5C0YA 4JAXA 3FZLA 3KHYA 2P9KB 3SK3A 3QFPA 4ILJA 1NG9A 1C0TA 3IMXA 1NNEA 2BGGA 3DXMB 2ZJRL 3RR7A 1KCFA 1HJRA 4KBOA 3CFPA 4W5OA 3TR8A 1FW6A 3TAFA 1WOQA 2ZD1A 2JGUA 2BE2A 2QWRA 3SZ2A 4BDYA 1VK0A 3K59A 1JLBA 4H03B 4E7JA 3EO3A 5KTQA 1N8RO 1NGEA 5J2PA 4AHSA 3ZSXA 5T7BA 4DTSA 2XY8A 2Q2RA 2UXDK 3THVA 3PX0A 5BREA 1BUPA 5CE3A 4KTQA 5E84A 4FXDA 3Q7CA 4C23A 5C15A 4RW6A 2IVOA 4DUZK 1YIJN 5LMNK 4DFKA 3THYA 2KKZA 4DFMA 4EZ6A 4O8KA 1RBTA 1G99A 4FM0A 4DCHA 4A5BA 3KK1A 3QB0A 3NMUA 3TAEA 3KLFA 5GIOA 1YTUA 3TU5A 3TPQA 2IOCA 5KPTA 2PYJA 4FK0A 3LALA 2PY5A 4IFVA 5LJVA 4H5RA 3VMFB 1KFDA 3CQXA 1IG9A 1RT1A 2FBVA 2Z1IA 1QZ6A 1X3NA 1E3MA 4BQLA 4OPHA 1RGIA 3SAGA 3AVAA 3TTFA 2A5XA 5JLHA 1M90O 3VTHA 2DY4A 2ASPA 4AQYK 1NK5A 1J54A 3L3UA 5AZJB 1SL2A 4KRFA 4N47A 2F8TA 1HNWK 4PQUA 4CF9A 3LL3A 3O4NA 3VEZA 5DMRA 2FXUA 1I3AA 1KC8O 3VEYA 2F8SA 2UUBK 4BC5A 5JVGL 2HMIA 1WSFA 3OYDA 2IIRA 2UXBK 1HUXA 4H0YB 3VQ4A 4F4KA 2YHXA 3A0IX 4CD1A 4IOXA 3CCSN 1NK0A 1VSJA 1XC9A 3CPEA 4LC9B 1ZYQA 5F1XA 2B5JA 4C1NK 3C94A 2X6SA 1Q82O 4E89A 4LF9K 4O8UA 4BGBA 5ELZA 2OTLN 4FWPA 5JS2A 4KHYA 1VSHA 4MLHA 4I2QA 4JI7K 4OGEA 3I8BA 3NVKA 4CZKA 5BR8K 4B1YB 2W40A 4DHYA 3DI6A 5AQJA 4ZHRA 1G15A 3VQCA 1VQLN 4DTJA 1KSPA 3CCJN 1LW0A 3RSEB 3T1HK 3EEQA 3MDQA 1NKBA 1VQKN 2O8FB 1JLCA 4GKJK 2B6AA 2O4IA 3DWLA 5FLXO 1NJWA 1HYSA 3THXA 3I0SA 3PO4A 4R79A 3VGLA 3C7NB 3O1BA 5HRPA 2RHKA 5EOYA 4ILGB 3FR0A 2E2PA 4E7KA 4CJKA 3AARA 1IBLK 5J2MA 4KI4A 4E19A 5M1PA 1XHXA 3ZSOA 5E41A 3EZWA 4FVMA 4NCAA 2P9KA 4KKOA 4BQZA 1KD1O 4BRLA 2VG7A 1HNVA 3L2QA 4YOWA 4YOUA 4MO4A 3D0PA 3HK2A 2X78A 1KAZA 1YUWA 4OPJA 1WLJA 4QOZB 1HLUA 2ASMA 2ZJPL 5ADXH 1TKTA 4Y0WA 4FK4A 5CYQA 4AHTA 1YI2N 1J5OA 1Q8IA 1TUUA 3T7ZA 4DSLA 1T3VA 3K0SA 2P9SB 2D0AA 1BOTO 1RDUA 3CJAA 1U47A 2YHAA 3N4QA 2WBNA 3GE1A 1V4SA 3OY9A 2CH5A 2P9IA 5HRRA 3TANA 4Y1CA 3CJ1A 2UUCK 1QTMA 3O08A 4OKEA 1QSLA 4AHVA 3OJSA 3MAQA 3G25A 4X66K 1RTIA 3E9OA 3UKRA 4QS9A 5M1OA 4FZXC 3AVCA 5HOOA 3EY1A 1L3UA 1JL1A 4K42A 4AILC 4OPKA 3TAPA 3V81A 3G0ZA 3DLHA 4FJHA 2GBZA 3O3GA 4ZTJA 2DTUA 1KLMA 5AZIA 5AQSA 5B8HA 4DU3A 3DOLA 2BUPA 5KRTA 4G9ZA 1BIZA 3JSMA 4PUOA 5C2FA 4EP4A 3CJ7A 4CF0A 1CXQA 4JK8A 3L2UA 5HL7L 3HTVA 3PO5A 2CGLA 3QIOA 3KK3A 3UE5A 4CJEA 1JLQA 3CCMN 4DV7K 3SYZA 4ISFA 1RTHA 1SQKA 3KZBA 3K5OA 3R8EA 4OJRA 3MEDA 1NGFA 3KK2A 3H1VX 3DOKA 2QWNA 1W7AA 1WAJA 3ENOA 3EYZA 4Z4GA 5LY3A 4QS7A 4GV3A 2O4GA 4FLWA 3G6EN 1NJXA 2VWJA 4IFYA 1GLBG 4B9TA 1SL0A 4B08A 1RDAA 3OBYA 3W0LA 2P9LB 4WQ4C 2OA8A 1VQMN 3V9UA 1UA0A 4PA1A 3GDQA 4CI6A 3BP8A 1TL1A 4IZ9A 2DFHA 1Y64A 4OPAA 3ZSRA 3MXJA 2Q3SA 4FM2A 3VERA 3CC2N 4CJTA 1J9AA 3CQYA 4M3RA 4B9VA 4DV5K 3LM2A 1E4GT 4H5VA 1HKGA 2Q97A 4JKHA 1LWEA 4DV6K 2YNGA 1OH7A 3J7YP 4JKCA 4BC4A 4CJLA 3AO3A 3AY9A 5AQYA 1X9JA 3QBWA 2QWLA 3CMAN 3K5LA 3M6GA 1JLFA 3KTQA 1XQSC 3D45A 2H3GX 3LP3A 3K9JA 1NGAA 5I9EB 4FJKA 3EL2A 2Q31A 2RPIA 3HSCA 2G8VA 2KFZA 2O8BA 4CFDA 5J2QA 1U4BA 4CF8A 2QW9A 1LV5A 4YOXA 2A6AA 4FJ9A 1CXUA 1KAYA 3E66A 3CXCM 1X9MA 1WBBA 3LPTA 3O80A 4IWVA 3WNEA 4C8OA 4DQ8A 4WQ5A 2KQ2A 4IG3A 1VHXA 3HO1A 3H45C 4DTRA 2W41A 3KKSA 3R3LA 1HNXK 1HRHA 2GUPA 1NK6A 4I2PA 4W5RA 1TK8A 1MA9B 3A5OC 5HRNA 2AJQA 3D2FA 4O55A 3IKMA 4FW1A 3AVFA 5MLCQ 3CCEN 4IG0A 3IS9A 4B9SA 3S3OA 2HBJA 2QXFA 1WBDA 1VQ8N 4L8RB 4JI0K 3L4QA 1LW2A 4KTWA 2PAVA 2P9PA 2Q1NA 2I7PA 3THWA 4PKHA 1A5XA 3U6FA 1NU0A 1RT3A 2QWPA 4F2SA 3VEVA 4BGAA 3WUHA 4OO1J 1IBKK 2CGJA 2VQFK 3K58A 1T05A 4B1XB 3K5NA 4CJWA 3TAMA 1K8KB 1TV6A 2ZWHA 3TSPA 1FKOA 3D7EO 2FBYA 4CEAA 2CH6A 4RW7A 5HRSA 4CD3A 3CJBA 2YJEA 2UXCK 4CF1A 1RT7A 3MMVA 4IFEA 3L2VA 2PBDA 3OYAA 2F9WA 3TABA 2G8UA 5M1FA 3T1YK 2O8DA 3H3OB 5AQLA 1NOZA 3JYTA 5CYMA 3QEXA 2HBKA 5LL6Z 3HBTA 1NMNA 3ZSVA 4AM7A 4DLGA 1S9EA 3SMPA 2ASOA 3DLRA 5AQFA 3SI6A 3NH2A 4DLEA 4CJFA 2NRTA 1HMVA 1NGHA 4JK7A 4BR0A 4WF9L 4RW4A 1D5AA 2A41A 3Q7BA 1ZBHA 1TK0A 2AP1A 3A5LC 1S1XA 4F9OA 1NWKA 2VWKA 2P9UA 2E88A 4Z4IA 4C8MA 2VQEK 4JYAK 4BROA 2VWBA 3MX5A 3D2EA 2P9NA 4GV9A 4CHQA 1CZ9A 1EKEA 3LPUA 3AO1A 2OPSA 3QNOA 5BPLA 1WSHA 1RDCA 3KVGA 2YJFA 4OKJA 3F73A 3V1QA 1C1CA 4DG1A 4DV2K 5DK5A 5IT9O 4IOAL 2X74A 1WN7A 1QQCA 5BRFA 4B3SK 1U49A 4E7IA 4FLUA 2VG6A 1Q9XA 2HNZA 1YVNA 1WB9A 3VA0A 3P5JA 1TL3A 1OH6A 3SAFA 3ZT0A 3ZEUB 4KB1A 3PIOL 4DTOA 1T7PA 2ETJA 1BI4B 2OZMA 2JWKA 3OYIA 1LWCA 4N41A 1U04A 3H6EA 4PY5A 4BY9C 5AQXA 4A62A 3DM2A 2E8AA 1KFSA 3J7AP 2G8KA 1FXXA 4K8ZA 4FJJA 3L2WA 4B8CA 3WXLA 4X62K 4FJIA 2GX9A 3SUNA 4E7LA 3SUPA 4FOEA 4BREA 4DR4K 4K41A 3FZFA 3A5NC 5K14A 4MO5A 1LOTB 1BA1A 1ASWA 1VQNN 4DU1A 2YHWA 3KD1E 4J2BA 1BQNA 3AO2A 1C0GA 4DWIA 4B9UA 2EX3A 3LP0A 4ELUA 4Y1DA 3KWIA 1SKRA 3TARA 2FF3B 1XWLA 2HNYA 3PX4A 3LDQA 4FJLA 4CZEA 1XMOK 3RVCA 2E20A 1W2BM 1N34K 4CZGA 4BRNA 4DR5K 4DFJA 3K57A 3OYHA 4K43A 4RCHA 4Z4CA 1O13A 4DR6K 4CZIA 3LANA 1IKYA 3QEWA 4KTZA 1TYQB 2FC0A 4JKAA 4K25A 4DTMA 3VQ8A 3JXUA 4JKGA 3AGRA 2E6MA 4CGDA 4H4OA 4BVPA 4HUEA 3SUOA 1KRPA 4GMJB 1KQSM 3DLGA 3ATVA 3O5BA 4DV0K 2E2QA 1DKGD 2IAJA 2OPQA 3HYFA 3VQQA 3BDPA 2G8HA 1SUQA 4U7BA 3P83D 1YITN 4LD0A 4E0DA 3ENHA 1IKVA 3QICA 2O8EB 3T19A 3ZT2A 1BGXT 2BDPA 2ZE2A 3AVHA 5LJWA 1BCOA 3DXKB 5FROA 1IV0A 1QQNA 5EVZA 2QK9A 1GLCG 2G8WA 1DGKN 1WSJA 1ZXOA 3V9WA 3ULEB 1S6PA 3HP6A 1RTDA 1QZ5A 3RMCA 4DR1K 5HROA 4DSJA 1ASUA 3OBWA 1Q9YA 4DKWA 3H1QA 4CW7B 1ZBSA 2IDOA 3SQ0A 1U48A 2Z1GA 1HNZK 3NF7A 2GWKA 3EE9A 1UOCA 4PKGA 5AQKA 2O8CB 3OS2A 1D9DA 1EO1A 3ZETB 4RWTA 4CK1A 2ZGYA 5C12A 5C42A 1X3MA 1LAVA 4CJ4A 5C2DA 1KVAA 3O4QA 3NVMA 3QMLA 3O9TA 3FZHA 4BDZA 5CZ1A 4CECA 4O5BA 3WEEB 2HOEA 4E1MA 3A8YA 3DMJA 3G71N 5DM7L 3LP2A 3T1AA 2E1ZA 1ESVA 4KHWA 2A42A 3HXMA 3CETA 4BE2A 3O9RA 4DF4A 2HB5A 1SAZA 1TKDA 3AA5X 4CESA 4JD2A 4AH9A 4Q0BA 5M1QA 1J53A 2FF6A 4KHUA 4KFBA 4OX9K 4H8KA 4CGHA 1NK7A 4DSIA 4Z4HA 4JI8K 3J80O 4CERA 4IDKA 4CK3A 3F5TA 4FWMA 3WNHA 3D6RA 2OYQA 3MECA 1JLEA 3ASMA 3L4IA 1HQEA 4B9NA 3M8QA 3LM9A 5AQRA 4FJNA 5AQPA 2JWLA 4DTUA 5AQTA 3QINA 4LH5A 4BACA 1QHAA 2V7YA 1QVFM 1N32K 2XY6A 1HKCA 2HHSA 4XH4A 4B1ZA 1VQ5N 3CIPA 4JNEA 2A1RA 3CJCA 1S6QA 1TKXA 5DM6L 2VYPA 3HT3A 2OTJN 2QXLA 1NJZA 3UKUA 1TYQA 2E6LA 3NGIA 4BWJA 1DEJA 2ZF5O 4L3QA 1K73O 1GOAA 4CZMA 4H0PA 3BZCA 2KW4A 1BU6O 4YY3K 1NGGA 4KPYA 3QERA 1J5EK 4NB4A 3OS0A 2HHUA 2A3ZA 1C1AA 1BG3A 1RT4A 1N5YA 1XUPO 4H4MA 2YX6A 3DXMA 4M3ZA 4IJNA 3C6AA 1A5WA 1ZC6A 2HVIA 1HYZA 3OJUA 4MFBA 5AQVA 3VTIA 3AVNA 3IG1A 3CCRN 4FJGA 3E01A 1U2VB 4BRHA 3WT0A 2D0CA 2VGNA 4J8FA 2GELA 4NO7A 5BN8A 4PKIA 1RDDA 3N4PA 4CFAA 3RMAA 1IG8A 3MWPA 5AR0A 3WXMB 3MCPA 3NHGA 5TKWA 3QEVA 4JS5A 3MCAB 1D8YA 4K0KK 1DT9A 1WNSA 1C0UA 4JKFA 3SPYA 2GUIA 4B3MK 4BG9A 3EE8A 4CFCA 1B9FA 1KXPA 1T03A 4FM1A 1IKWA 3PX6A 3I55N 4KHSA 3ZSZA 5F2RA 3LDSA 3NBPA 4LF6K 4EFHA 2J4RA 5M1KA 3L8BA 4FZYA 3I56N 5AZJA 4DQIA 1XI1A 3FZKA 1TVRA 1CZAN 1K8AO 3OS1A 3NH1A 2ITGA 3E1YA 3V1RA 3WEEA 4F3OA 1BIUA 5BPMA 3UIQA 5HP1A 3OYMA 4DUYK 3PSIA 1BL3A 4DTXA 3BUZB 4JI1K 2VGMA 3O9SA 3LDPA 4A61A 3DRRA 4BE0A 3K9KA 4BR4A 5KQDA 3VQ6A 3WQTA 3LZJA 3HP9A 1HQUA 3CMEN 4IO8A 1TAUA 3KD5E 1T44A 4FVUA 5KGXA 3ZSWA 4GW6A 3JAMO 1QE1A 4LF8K 4HUFA 3HRGA 3B6OA 2Z1HA 1ATSA 5KI6A 4FJXA 4XEIA 4MDAA 4C1NI 1M1KO 4B1VA 3O3HA 3RSEA 4IDHA 2O8FA 4FJMA 2G8FA 4F3TA 3ZX3A 3VGKA 4FWSA 4E7HA 2E2NA 4CZHA 3CCLN 3OYGA 4M7XA 4CGFA 4FWLA 3C7NA 4G1QA 5SZTA 3GBTA 1EWRA 4YDUA 3VEWA 3VQ9A 2DFEA 4FPAA 2WONA 1TK5A 2E5LK 4ELVA 3SPZA 2EHGA 1JJ2M 4F8RA 4E3SA 1Z25A 1VSDA 5JICA 1ZBFA 4KO0A 1QQMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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 1Q82 O;  1VQ7 N;  2ZJQ L;  2OTL N;  2QA4 N;  5GAH P;  4WF9 L;  1Q86 O;  3G71 N;  2ZJR L;  5DM7 L;  1W2B M;  3CPW M;  1JJ2 M;  1VQL N;  3CCJ N;  3CXC M;  1VQK N;  3CCQ N;  1VQ9 N;  4WCE L;  1N8R O;  3I55 N;  3G4S N;  1QVG M;  3CC4 N;  5HL7 L;  4IO9 L;  5GAG P;  3CCM N;  1VQP N;  1YIJ N;  1ILY A;  1YHQ N;  3I56 N;  4IOA L;  1KQS M;  5H1S Q;  1NJI O;  1OVY A;  5MLC Q;  3CCE N;  1K8A O;  3CCV N;  1VQ8 N;  1KD1 O;  1YIT N;  3G6E N;  1Q7Y O;  4WFA L;  3PIO L;  1QVF M;  1VQO N;  1VQ5 N;  1VQM N;  3CC7 N;  1VQ6 N;  1Q81 O;  3OW2 M;  2ZJP L;  5DM6 L;  2OTJ N;  3CME N;  1K73 O;  1YI2 N;  3DLL L;  1M90 O;  5GAD P;  5JVH L;  5GAE P;  4U67 L;  3CC2 N;  1S72 N;  3J7Z O;  2QEX N;  1KC8 O;  3CF5 L;  3PIP L;  1YJN N;  5JVG L;  4WFB L;  1M1K O;  1VQN N;  1YJ9 N;  3CCU N;  3CCR N;  4UY8 O;  3CD6 N;  4IOC L;  3CCS N;  4WFN L;  1K9M O;  3CMA N;  1VQ4 N;  3CCL N;  1YJW N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CJ7 A;  5C0Y A;  4JAX A;  3FZL A;  3KHY A;  2P9K B;  3SK3 A;  3QFP A;  4ILJ A;  1NG9 A;  1C0T A;  3IMX A;  1NNE A;  2BGG A;  3DXM B;  2ZJR L;  3RR7 A;  1KCF A;  1HJR A;  4KBO A;  3CFP A;  4W5O A;  3TR8 A;  1FW6 A;  3TAF A;  1WOQ A;  2ZD1 A;  2JGU A;  2BE2 A;  2QWR A;  3SZ2 A;  4BDY A;  1VK0 A;  3K59 A;  1JLB A;  4H03 B;  4E7J A;  3EO3 A;  5KTQ A;  1N8R O;  1NGE A;  5J2P A;  4AHS A;  3ZSX A;  5T7B A;  4DTS A;  2XY8 A;  2Q2R A;  2UXD K;  3THV A;  3PX0 A;  5BRE A;  1BUP A;  5CE3 A;  4KTQ A;  5E84 A;  4FXD A;  3Q7C A;  4C23 A;  5C15 A;  4RW6 A;  2IVO A;  4DUZ K;  1YIJ N;  5LMN K;  4DFK A;  3THY A;  2KKZ A;  4DFM A;  4EZ6 A;  4O8K A;  1RBT A;  1G99 A;  4FM0 A;  4DCH A;  4A5B A;  3KK1 A;  3QB0 A;  3NMU A;  3TAE A;  3KLF A;  5GIO A;  1YTU A;  3TU5 A;  3TPQ A;  2IOC A;  5KPT A;  2PYJ A;  4FK0 A;  3LAL A;  2PY5 A;  4IFV A;  5LJV A;  4H5R A;  3VMF B;  1KFD A;  3CQX A;  1IG9 A;  1RT1 A;  2FBV A;  2Z1I A;  1QZ6 A;  1X3N A;  1E3M A;  4BQL A;  4OPH A;  1RGI A;  3SAG A;  3AVA A;  3TTF A;  2A5X A;  5JLH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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