2A42A

Actin-dnase i complex
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Actin-bound structures of Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP)-homology domain 2 and the implications for filament assembly
pubmed doi rcsb
total genus 123
structure length 360
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 2a42A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2a42A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2a42A04
1S3XA 3SK3A 4BR4A 3FLCO 5KQDA 2P9SA 2F9WA 2GWKA 2BTFA 4QS9A 3VGMA 2FXUA 3FR0A 1KXPA 3MN7A 5AR0A 4BRLA 4CBUA 1QZ5A 3EZWA 1XC3A 4I6MA 2YHXA 1T6CA 1QQMA 1LOTB 2ITMA 2P9SB 2FSKA 2ZGYA 1TUYA 3W0LA 5FPNA 4I6MB 2Q0UA 2EWSA 4MO4A 1NGBA 5BRFA 3HTVA 4BVPA 1YXQA 3H1QA 1NGCA 3BF3A 3ZETA 2D4WA 4BRHA 2ZGZA 4BR7A 4DB3A 2ASMA 4BRPA 5AQJA 1NGAA 4IJAA 1GLFO 1Z6RA 2Q1NA 3VEXA 3HM8A 3VEYA 3VEWA 4PL7A 2H3GX 3AY9A 3ZEUB 4A2BA 4J8FA 5AZIB 4RWTA 4FPAA 1RFQA 2V51B 1CZAN 3R6MA 4ISEA 4Z94A 1BA1A 3CERA 1C0GA 3VERA 1NWKA 5EX5A 3M6GA 4B1WB 1NBWA 3I8BA 1K8KA 3B8AX 5LJWA 3QICA 3U9DA 2W41A 4HTLA 3QDKA 3L4IA 4IO8A 3F9MA 2V52B 5EXWA 4BR0A 4WQ4A 3O4WA 1DKGD 2P9UA 1SZ2A 2QWRA 4FWPA 3VF4A 2IVOA 4B9QA 3FGUA 1GLDG 3L0QA 4BC3A 3LM9A 2YCHA 3ENOA 4YDUC 3RSEA 4Y0WA 1Q18A 1X9JA 4H5TA 4HWIA 4BRMA 5AQZA 4F9OA 5KPZA 2AP1A 3U9ZA 5AQLA 2YI1A 2A42A 2P9PB 3RSEB 3CJ1A 4BR9A 4CBXA 3A5LC 1Z05A 2KHOA 3LDNA 4H0PA 5JICA 5EVZA 2YHYA 4BR2A 3O6WA 1T44A 4CJ7A 3LDPA 4MLHA 4AM6A 1GLAG 3I33A 3O5BA 3ULEA 4B1UB 1GLCG 2ASOA 3IUCA 2Q36A 2GEMA 4JHDB 5BN9A 5LY3A 5ADXH 3WXKA 5BRDA 5JMVA 4WQ5A 5F2RA 3FZLA 2OANA 3CJCA 4FPBA 4PKGA 1MWMA 1NGFA 1U2VB 3EL2A 2Q97A 2E2OA 1NGEA 4BVOA 1ZXOA 4DCHA 5FPDA 3MDQA 2AA4A 1HUXA 1HPMA 3VPZA 2E2QA 4NB4A 4BC5A 4H0YB 3C7NA 3FZHA 1BA0A 1NGGA 2HF4A 1ZC6A 5BRHA 3FE1A 4IZ9A 3D2EA 4A61A 2A40A 1SQKA 2W40A 3CHWA 1MWKA 5BPMA 3CI5A 4CZFA 3WQTA 4BRGA 4FWNA 3TPQA 2P9IB 3VGKA 3MN6A 4DQ8A 3D2EB 1G99A 3GBTA 3DXKA 4M7YA 4BREA 2E88A 4K25A 2QM1A 1BDGA 4BR5A 4BQZA 4GNIA 2CH5A 1X3MA 4FOEA 3CETA 5AQUA 5ADXA 5F1XA 1WOQA 4GY2B 1HLUA 3D7EO 5AQTA 3WT0A 3GL1A 2ASPA 1C0FA 4CZEA 4MLEA 4FO0A 5F0XA 1GLLO 4H5WA 4MO5A 2BUPA 3VETA 3U8XA 4WYBA 2HOEA 3WQUA 1ATNA 3AAQA 4EAHD 2YJFA 4CD1A 2P9NA 1JCEA 3ZETB 1OKJA 1V4TA 4ISGA 2P9KA 2CGLA 4BRDA 1NGJA 2P9LA 4EHTA 4WQ4C 4KBOA 4QS8A 5EOYA 1NLVA 5KQ8A 3WXIA 3EKSA 1HX1A 1JCFA 3D2FA 3QMLA 2E1ZA 5E84A 3FZFA 4AM7A 3IMXA 2J4RA 2P9LB 1MDUB 4B1ZA 3ZX0A 2QWPA 2E20A 4FWLA 4FSVA 3SMPA 1HKGA 2I7PA 2VYPA 4B1YB 2IIRA 4BC4A 5FPEA 3CQXA 1K8KB 3LM2A 3VEOA 2FLOA 3KHYA 2QWOA 3H6EA 1RDWX 2Q2RA 1NGIA 2V7YA 1BWFO 2FSNA 4BROA 2P9UB 2IVPA 1ATSA 3HBTA 5AQKA 3UKRA 4JD2A 5AQYA 3ZX3A 1X3NA 2Q31A 3WEEA 2NRHA 3QFPA 1GLEG 3IFRA 1HJOA 2GWJA 1GLBG 3BF1A 2GTDA 3CIPA 3CJ9A 3ZX2A 5AZJA 4WQ5C 3VESA 3MCPA 1H1VA 4NO7A 5AQMA 3A5NC 1E4GT 2YJEA 3EN9A 5AFUA 1BG3A 1V4SA 3O08A 4BRQA 4BRCA 3SJHA 5AQXA 3ULEB 5AQFA 3O8MA 4FWMA 4M7XA 2E1YA 4CD3A 4CZJA 4H0OA 3GG4A 5AQPA 4FOIA 3QB0A 2QW9A 4H5NA 3QBXA 2E2NA 3GE1A 3MN5A 4H0VB 4O8KA 3L6QA 4A62A 2Q0RA 3O1WA 2VWBA 4H5RA 4CZLA 4H0XB 1D4XA 4BG9A 3U4LA 3LDOA 4CI6A 5BR9A 1JCGA 3FFKB 2QWNA 3KVGA 3KZBA 1TYQA 3C7NB 2DPNA 1BO5O 3H1VX 2CGKA 2V7ZA 3R9PA 4K41A 1GLJO 3SLCA 2E2PA 5ELZA 3H45C 4EIAA 3DWLA 3WXJA 4C23A 4QS7A 2D0PA 1QHAA 2PAVA 4JN4A 3VF2A 1ATRA 2D0OA 3M1FA 3FZKA 1T6DA 2D1KA 3DXKB 1EQYA 3MK6A 1HKBA 1DEJA 3O80A 2PBDA 1NGDA 3HSCA 5BPNA 1NM1A 3A5OC 2WUSA 3MN9A 3AARA 5AQSA 4IXCA 4BRKA 5JLHA 1QQNA 1QQOA 4H0TB 3WXLA 3H3OB 5AQWA 1KAXA 2YHWA 1XQSC 3LDLA 5AQHA 5EY4A 3CJ7A 4BGBA 4RTFD 5KPTA 5JLFA 3GOIA 1MA9B 2A3ZA 2F9TA 1E4FT 3VEVA 5AFUH 2A6AA 1J6ZA 1Y64A 2P9NB 3BEXA 2CGJA 4H03B 4L3QA 2E8AA 4FWOA 3TU5A 3HZ6A 1RGIA 2P9KB 4FL9A 2CH6A 3ZEUA 3JXUA 3J8AA 5AZIA 4RCHA 5BN8A 4FWRA 3G25A 1BU6O 1R59O 4E1JA 3ATUA 3D2FB 5AQVA 4K43A 2I7NA 1S22A 2A5XA 3H3NO 2QXLA 4O5FA 3GDQA 4XH4A 4XEIA 2QWLA 4BRIA 2ZWHA 3OHRA 3H46O 3SMSA 4PKHA 1NGHA 3FZMA 3VOVA 4A2AA 4B1XB 4DHYA 2GUPA 4PKIA 2FSJA 1TUUA 3A8YA 2NLXA 3VGLA 1ZBSA 1YAGA 1IJJA 3LDQA 4BG8A 1SAZA 3CJAA 1IG8A 1YUWA 4XH5A 5AQRA 2VCPA 3UKRB 4JD2B 3BUZB 4IJNA 3DXMA 3EO3A 3WEEB 3CQYA 2P9PA 3MMVA 3EKUA 4CBWA 3VENA 2FF3B 4BC2A 3DJCA 3UB5A 2IVNA 4CZIA 2GELA 3DXMB 5AZJB 4PL8A 3HI0A 3LL3A 2QWMA 1P8ZA 3UE5A 1YVNA 1WUAA 4FWKA 4IWVA 5CE3A 3W3DA 3QBWA 4EFHA 1HKCA 3ENHA 3UKUA 5AQIA 4LC9B 4YDUA 5AQNA 4JHDA 5AQGA 4JNEA 5AQOA 2ZF5O 4ISFA 3S41A 5TKYA 3CJBA 3BP8A 4CZGA 3VF6A 3JS6A 1KAYA 5B8HA 5I9EB 4K42A 3UKUB 4BQLA 5BPLA 3WUHA 4FWSA 4JAXA 1DGKN 3IDHA 4B1VA 1U2VA 1BUPA 3AAPA 4XH1A 1U6ZA 1QZ6A 3ATVA 4CZMA 1LCUA 3A5MC 4CZKA 5FPMA 3O1BA 4BRNA 4BRAA 2HMPA 4EHUA 5BREA 5AQQA 3C0BA 1KAZA 3P4IA 1ESVA 5LJVA 1XUPO 2NZTA 4CZHA 3R8EA 5E26A 4M63C 3QFUA 2QWQA 5KPRA 4BGAA 4BRFA 3VEZA 3DAWA 1TYQB 4H5VA 1BOTO 3M3ZA 2FF6A 3ID8A 2HF3A 2P9IA 3A0IX 4FWQA 2A41A 2UYTA 1NMDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SK3A 3LZJA 3FLCO 4YFUA 4E7IA 2P9SA 4N47A 4W5OA 4M3WA 2BTFA 5J2PA 3VGMA 4LF8K 2WTUA 2XY8A 3TWHA 1YT3A 3MN7A 5CYMA 5AR0A 4BRLA 4CHOA 3G10A 2RPIA 1TKZA 3AO1A 3EZWA 2UXDK 2YHXA 1QQMA 1LOTB 1DLOA 3VQ8A 5FPNA 3VQCA 1IH7A 4MO4A 3QIOA 3OYGA 1FJGK 3RMCA 3BF3A 3HYFA 4NYFA 4W5TA 1VQ9N 4BRHA 1UWBA 2W6KA 3P1GA 2UUBK 1VSIA 4DB3A 5AQJA 2G8VA 3VEXA 3HM8A 3VEYA 1OH8A 2H3GX 4WCEL 3ZEUB 4J8FA 5I42A 5JVGL 4B3SK 2P5OA 1C0GA 3LANA 4DFMA 3OYCA 3CPEA 4JI6K 4JS5A 4E7KA 1I94K 1S6PA 4I9LA 3U9DA 3THYA 1N32K 3SPZA 1M90O 2HB5A 1RDAA 4C8KA 1RCHA 4WQ4A 2BH1A 1DKGD 4FWPA 3NGYA 2OPQA 3NF8A 3PX4A 4CJPA 3BY5A 3THWA 4YOYA 3FGUA 4CGIA 4CW7B 4YDUC 3RSEA 4KH4A 4EP4A 1HQEA 2JWLA 4XJXA 3G4SN 5AQZA 4F9OA 4K0KK 2YI1A 2P9PB 4FJNA 2KKZA 3A5LC 2KHOA 3O9RA 4FLXA 4JKGB 4QAGA 4CHNA 5EVZA 2YHYA 4JRQA 1SS6A 3O6WA 1LWFA 4FW2A 1WBBA 4MLHA 5FROA 3ZLJA 1QSSA 1Y97A 4CERA 3ULEA 1VRTA 3QEVA 5J1EA 3SZ2A 4ID5A 1KQSM 4FJGA 3IAYA 2Q36A 1NK4A 2GEMA 5GINA 3NFAA 1VSKA 5BN9A 4DF8A 5C24A 4WE1A 3C95A 3BGRA 4WQ5A 3S3MA 1XI1A 3CQ8A 1VSJA 2F7TA 3B6OA 1DTQA 2O8FA 1T7PA 4BVOA 4CEDA 5HRNA 1YJWN 2GX9A 2XRIA 2HVHA 5FPDA 3OJSA 3LWMA 2AA4A 1HUXA 1HPMA 4BC5A 5HLFA 2HHUA 4IDKA 3C7NA 1VQLN 1ZC6A 3FE1A 3KK1A 2O8BB 2HHTA 4Z4CA 3KLFA 1BIZA 1EKEA 4YY3K 3H08A 3CM6A 3T1YK 4OGEA 3TPQA 3THXB 2P9IB 3TAEA 4HUFA 2ZE2A 3GBTA 3M5RA 4M7YA 4JI5K 1TKTA 2IAJA 4CHYA 3S5TA 3QEWA 3QEXA 2Y1IA 1KD1O 4RW8A 4GNIA 1VQ6N 3K59A 3SAGA 3AVAA 5DM6L 5AQUA 5F1XA 4GY2B 3PIOL 1S9EA 3GL1A 4LFCK 1C0FA 3TSPA 2RE2A 3DLRA 4BECA 2OCEA 2HW3A 1GLLO 2Z1GA 3ZCMA 2IDOA 1BHLA 4MO5A 2BUPA 3AAQA 2YJFA 2P9NA 1RILA 1JCEA 1LW0A 1FK9A 1OKJA 1KLMA 4H4MA 4DV0K 3HRGA 4QS8A 2OPSA 5EOYA 1NLVA 3SUOA 2X74A 4WFNL 3D2FA 5E84A 4KRFA 3FZFA 4ILHA 2P9LB 2P1JA 2QWPA 2E20A 3MEGA 2O8CA 4FSVA 1HKGA 3N4QA 1NG9A 4DLEA 2XY5A 4NXMK 4BDYA 3THYB 2KZMA 4NLBA 3H6EA 1SL1A 3C65A 4I7FA 1BWFO 4CEEA 2ZM6K 4BROA 2IVPA 5CY4A 2DY4A 1WSHA 3ZT4A 2FC0A 2NRHA 4BWMA 1GLEG 4E19A 4W5RA 2KQ2A 1VSHA 3SQ4A 3EY1A 3QEIA 2GTDA 4BE1A 1D8YA 3CJ9A 1A5WA 4A5BA 3I0RA 3VESA 4Z4EA 3MCPA 3V9WA 2B4JA 4CJFA 1UA1A 4NO7A 3L3UA 4NYNA 1J5EK 3RMBA 1NK9A 1E4GT 5AFUA 1BG3A 3O08A 4BRQA 3HXMA 3V4IA 3PX0A 2A1RA 5AQXA 3ULEB 3EE9A 1Q86O 1Q9XA 3K58A 1JXEA 1HMVA 2IS3A 4H0OA 2O8EA 1OH6A 3GG4A 4DTOA 3CF5L 4DR3K 3QB0A 4ID1A 1SKSA 4OLAA 3QBXA 1S1WA 5C12A 1LW2A 1VRUA 3AO4A 2VWBA 3O1WA 3OBYA 4FLYA 3QESA 4H0XB 2JLEA 4BG9A 4CI6A 3SV4A 2O8FB 4Y1CA 4O0JA 4J2BA 2F4VK 1KVAA 3C7NB 1BO5O 1HRHA 1ILYA 1I3AA 4DU4A 2V7ZA 4B3OA 1VSFA 3SLCA 1QSYA 4DR5K 3RR7A 4GKKK 3NH2A 3B6PA 5ELZA 3DYAA 3HVTA 1WSGA 4QS7A 3VF2A 3E9OA 2HVIA 3FZKA 1R0AA 4B9LA 2D1KA 1HJRA 2LSNA 4KH5A 4IFEA 1DEJA 3O80A 2HHHK 2ZD1A 1YITN 1D5AA 1J54A 4LD0A 1NM1A 4GVMA 4BRKA 3LP3A 5IT9O 1W9HA 4FJ5A 4BGBA 1WSFA 4CF1A 5HRPA 5JLFA 3SYZA 3GOIA 4CJUA 1BIUA 4C8OA 3VEVA 4PA1A 2P9NB 4PY5A 4H03B 3VMFB 4L3QA 5CZ1A 2QA4N 3HZ6A 1C6VA 4CF8A 4FL9A 3AO3A 4RCHA 1HYZA 4HVJA 3HSTB 3VQEA 4AILC 2XY6A 3D2FB 4CHZA 1VQMN 3CCUN 4K43A 1EWRA 3VA3A 1T03A 3AA2A 2QWLA 4PKHA 4DV7K 4JKHA 1NGHA 4B1XB 4ELVA 4KHNA 5GAEP 1B9DA 1IKXA 1JLFA 5EU7A 5GAHP 3CYGA 1IJJA 5CYQA 2HHXA 1IG8A 1VSDA 3DOLA 1X1PA 3EO3A 4FJXA 2OTLN 3ZSVA 3KK2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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