1G15A

Co-crystal of e. coli rnase hi with two mn2+ ions bound in the the active site
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
150
structure length
141
Chain Sequence
KQVEIFTDGSALGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHAEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKARGWKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVGHPENERADELARAAAMNPTLEDTGYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords RIBONUCLEASE HI
publication title Co-crystal of Escherichia coli RNase HI with Mn2+ ions reveals two divalent metals bound in the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 47
structure length 141
sequence length 150
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2000-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1g15A00
2YNGA 4I2PA 1C0UA 4ZTFA 1TK5A 3ZSWA 1FKPA 1VSHA 3HP6A 4ZTJA 1WAFA 1U47A 4CFDA 3M8PA 3OJUA 3DLHA 3MXMA 5HRNA 3KIOA 1B92A 4KHSA 1JXEA 2IOCA 4AH9A 4CERA 4W5RA 1LAWA 3I0RA 2QXFA 3VQ8A 4CGHA 3MAQA 4PY5A 5CYMA 5FRNA 4BWMA 3L2QA 1Q9XA 3NF7A 3O3FA 3K5OA 3V9UA 1BIZA 3QLHA 3AO4A 1NKEA 3QETA 4KKOA 4DU1A 4CJQA 4E19A 4IKFA 3HPGA 2RN2A 4CJSA 2ZD1A 3AA5X 1S1XA 4M45A 4CHOA 3RTVA 4FJ8A 1HMVA 2IDOA 1BL3A 3ZSRA 4KHYA 1BI4B 3DLRA 4I9QA 3SV4A 4BE1A 1C0MA 2GV9A 4EZ6A 4IG0A 4DQIA 2HNZA 1KRPA 4FYDA 4IDKA 1S5JA 4G1QA 2D0CA 4FZZA 3F73A 4IG3A 4CJUA 3OYMA 5D3GA 3HK2A 4F2RA 2JLEA 3IG1A 4KREA 2KW4A 3TWHA 4M3YA 3PX6A 4PUOA 4AHUA 4F3TA 1BI4A 3P1GA 2LSNA 4LSLA 1A5VA 1WLJA 3ITHA 4JS5A 1X9MA 4KFBA 5KGXA 3QEVA 1RBUA 5DMRA 4CHZA 1T8EA 4CK1A 2G8WA 2PZSA 3K2PA 3VA0A 3TABA 1SL0A 4E7JA 3AA4A 3SQ0A 3VQ9A 1S1TA 4FVMA 4O0IA 1LW0A 4DF8A 3V9SA 3AVAA 3MEEA 1MU2A 4OKJA 1LW2A 1HQEA 1WSJA 2HNDA 1D9FA 4CJVA 1VSMA 4YNQA 4IFYA 2YV0X 4NCGA 3KD5E 2HHQA 1RBVA 1VRTA 1HNVA 4DFKA 1IG9A 3VQ7A 5I42A 3OJSA 2OA8A 2IC3A 5HRSA 5HBMA 4QAGA 1ZBLA 3VQCA 2IAJA 3VQQA 4M3ZA 1RT6A 2DTUA 1BCMA 1C6VA 1UAXA 3LPTA 1JLCA 3S3OA 3PO4A 1BQMA 1RTJA 2I5JA 4CGGA 4DSFA 3PX0A 1S6QA 4N47A 4O5BA 3HT3A 3AO3A 1XC9A 1TKTA 1FK9A 4ID5A 4CESA 5HROA 1JL2A 4C8LA 1RBRA 4H8KA 3TARA 1KVAA 2E6LA 3TAFA 3S3MA 2HNYA 1KVCA 1S9EA 4CF2A 3KLHA 4I9LA 4FLVA 2HHUA 3OYGA 2HVIA 3DOLA 3TAMA 3RR7A 3MEGA 3L2UA 3LZIA 2DFEA 1HRHA 3L3VA 3SI6A 3TAPA 3PY8A 4PQUA 3WNFA 4M41A 2D0AA 3AO2A 4GW6A 3VQPA 4Z4IA 2HHVA 1TKXA 2X6NA 5HRRA 4B9UA 4DTSA 1TAUA 4CJWA 3NH0A 3NF9A 3TAGA 4B9MA 1S1UA 3O3GA 4HCBA 4PWDA 3OYAA 3ZT4A 2BDPA 4KTWA 2G8IA 1EX4A 3AA2A 3LAMA 4CIFA 3QEPA 4KHQA 2Y1IA 4CK2A 4CE9A 3RMDA 4QOZB 1CZBA 5EU7A 2XHBA 3LAKA 5KTQA 4W5TA 4LSNA 3LP3A 2DFHA 4Z4FA 4FK2A 1HQUA 3U3GA 4W5OA 4UQGA 1J9AA 2Z1JA 4HHTA 4E7HA 4NCAA 4BACA 3OYLA 1DTQA 3QIOA 1EXQA 4CF8A 1W0HA 1ZYQA 4CJPA 3O4NA 3SCXA 2Z1GA 4PA1A 4CEBA 3L2WA 2KFZA 4CECA 5KGWA 1SUQA 3SUPA 4KRFA 2P1JA 1QQCA 2IGIA 1GOCA 4BWJA 3KTQA 3RMCA 3NHGA 5I3UA 1BQNA 4B8CA 2OPRA 4KAZA 1RT3A 3LP1A 5DK5A 1S9GA 5C25A 3SUOA 3M8RA 1RBTA 3TI0A 3ZSOA 3B6PA 4N76A 4DTXA 3NGYA 4DQPA 3OS2A 3CFOA 2YKMA 1SKSA 1L3SA 4TSXA 1D5AA 1ASVA 2YNFA 3CM5A 3HL8A 1QS4A 3PX4A 4DU4A 3HSTB 4FM0A 3OYDA 2X74A 4DFPA 4FLYA 4FZXC 4DTUA 2PY5A 2HVHA 5CZ2A 3VA3A 1I39A 4HUGA 3PV8A 1ASUA 2GBZA 4ID1A 3NAEA 3AVIA 5T7BA 4JS4A 4FZYA 3HPHA 3NBPA 3SJJA 3L3UA 1FKOA 3IAYA 4J2AA 1YTUA 1LV5A 3VQDA 4E0DA 1X9WA 4KHNA 1VK0A 3LP0A 1VSDA 3C94A 3LALA 1SL2A 3DOKA 2X6SA 1RDCA 1RCHA 3S9HA 4B9LA 1LWEA 4CK3A 1QSYA 1W9HA 3T3FA 3D45A 4CEEA 1NK6A 4AILC 2A1SA 3KK1A 3QEWA 1RILA 3AO1A 4FM1A 4DSEA 4FJIA 1EETA 4KI4A 3OY9A 1C1AA 3DRPA 2HHSA 4RG8A 2OPSA 3L8BA 4DTRA 5J2NA 1Q9YA 1ASWA 3C6TA 5HLFA 2Q3SA 4OVLA 3TANA 1ZBHA 1D8YA 1EP4A 1KCFA 2OPPA 2R7YA 4FJHA 1L3TA 3HXMA 3C6UA 4CEFA 3KJVA 3SQ1A 3ZSZA 4M3XA 1RTHA 3V4IA 3RWUA 3AVGA 1XHZA 3NGZA 3K5MA 2ATQA 3LZJA 2VG6A 3DI6A 4MQ3A 4AHTA 3S3NA 3K5LA 1LWFA 4H4MA 2VWJA 4AHSA 3SUNA 3ZT2A 4CHQA 4OKEA 1DTTA 1NOYA 3HVTA 1LAVA 3SPYA 2ZE2A 4CFBA 1O1WA 1QSLA 1HYVA 3KK3A 3IRXA 2RPIA 4FJNA 1IO2A 2VG5A 3QESA 1G15A 3TR8A 1C1CA 1IKWA 3BGRA 1NK7A 4K8ZA 3VQEA 4FJXA 3EY1A 4J2DA 1TL1A 4DLEA 2W42A 4FM2A 4HUFA 3D0PA 3SV3A 1QTMA 3AVCA 2X78A 1KVBA 3MXJA 4FJLA 2XO7A 3V9ZA 4JLHA 2F8SA 1BISA 3AVKA 4CJRA 4FW2A 3V1QA 1UWBA 4CIGA 4M3RA 2KFNA 3O3HA 1NJYA 1CZ9A 5J2MA 3KD1E 5C24A 3CYMA 2VG7A 4NYNA 2DFFA 1WSGA 3AVLA 3HO1A 2BE2A 2FBVA 3NDKA 4FJ7A 4BE2A 3ISNC 1CLQA 4K8XA 1Q8IA 5CY4A 4HVJA 4B8AB 5JS1A 4GVMA 1JLGA 2KTQA 3M8SA 3L2RA 1ZBIA 1U48A 3NCIA 3OVNA 4GMJB 4LD0A 4CHNA 1NJZA 4BDPA 5SZTA 5FDLA 4B9SA 2XRIA 3QINA 1SL1A 2OZSA 3QIPA 1KLMA 5K14A 3UIQA 2HHWA 4CJ4A 3KKRA 2OYQA 4EZ9A 3AVMA 1WSIA 1UA0A 4RW4A 1NK5A 4M42A 3KK2A 3DYAA 4FLTA 3KKSA 3ZT0A 3ZSQA 1B9DA 3SYZA 4B3OA 4DTPA 1RT7A 5SWMA 3WNGA 1RTDA 4KPYA 3ZSYA 4Z4CA 2YHBA 3AVFA 3VQ6A 1IKXA 4DTMA 3SQ2A 4LH4A 1TVRA 1SKWA 4FJGA 4H4OA 2BANA 2Y1JA 3VN5A 2XY5A 3DLEA 3K59A 4HCCA 3P5JA 4FJ5A 3MEDA 3DMJA 4E89A 4LY7A 4ELUA 4DQQA 1L5UA 1NJWA 3K57A 1BCOA 3ZT1A 3QNNA 3SQ4A 2PYJA 4AHRA 3CFRA 2D5RA 1VRUA 4FK4A 4IBNA 3JYTA 4M3TA 1QE1A 3OYJA 1HNIA 1Y97A 2Z1IA 4RW8A 1RBSA 1WSEA 5CYQA 4FLZA 4FLXA 4E7LA 1KFSA 2KZZA 4F4KA 3H08A 1J53A 4I7FA 4OKKA 3OS1A 5J2QA 3CM6A 4DS4A 1DLOA 3SPZA 1N5YA 5FROA 4FJ9A 4FJMA 4E1NA 4NYFA 4W5QA 2F8TA 4CGIA 4RW6A 1N6QA 1KSPA 4N41A 2KZMA 4RW7A 3FFIA 4J2BA 3K58A 2EHGA 2G8UA 3OS0A 4CJKA 4JRPA 4DLGA 3OYKA 3P83D 2OPQA 4C8NA 3U6FA 3DLKA 2F96A 4CEDA 2B4JA 4CJLA 3QERA 1Z26A 4Z4HA 3SZ2A 1T03A 1YVUA 4OGEA 1TK0A 3HYFA 4CCHA 3HVRA 1CXUA 2RF2A 4DQRA 3F9KA 2XY7A 4F2SA 1JLAA 4DSLA 4W5NA 4FJKA 3OYFA 3VQAA 5J2PA 3B6OA 4ICLA 1TK8A 1VSJA 3ZT3A 3AO5A 4OPKA 2XY8A 3ALYA 4Q5VA 1NOZA 4C8KA 1A5XA 4DG1A 1RT1A 2Z1HA 4WE1A 5KI6A 3AA3A 3V81A 4CFCA 1RNHA 1XWLA 1BIUA 4N5SA 3G10A 2D0BA 3LDSA 4KO0A 4EP5A 2YKNA 3VQ4A 1U45A 1HPZA 4FLWA 1JLFA 4BDZA 4FW1A 4N56A 4Y1CA 3LWLA 4KTZA 4E7KA 2E6MA 5KRSA 1VSIA 1YT3A 1RDAA 2XY6A 3E01A 3OYNA 3A2FA 3LANA 4AHVA 3OYCA 2OZMA 1RDDA 1TKZA 3RMAA 4L8RB 1WSFA 5HRPA 4FXDA 2AJQA 3M8QA 1Z25A 3T1AA 4C8MA 2RKIA 3RRGA 3DM2A 1IKVA 1NKCA 3G0ZA 4DFJA 4CGFA 4OLAA 2WONA 3VQ5A 1JL1A 1RT2A 1I3AA 4CHPA 1YTAA 3HPOA 3QEIA 2G8HA 4F8RA 1UOCA 4OPJA 4Q0BA 2E4LA 2PYLA 4DSJA 3PUFA 4FK0A 3ZCMA 3KLEA 1L3UA 5J1EA 3THVA 2NUBA 3TAEA 4ZHRA 1SV5A 2B5JA 3JSMA 1GOAA 2FBXA 3CQ8A 5JS2A 4E3SA 4MFBA 3V9XA 3RMBA 3OYBA 1XHXA 3AVHA 3ZSXA 3NF8A 4DFMA 4CIEA 1KFDA 2G8KA 1J5OA 3OYEA 3EYZA 3QEXA 4OLBA 3VQBA 4KI6A 1S6PA 3MECA 4FLUA 1X9SA 1JKHA 1TKDA 1S1WA 4CEAA 4ELVA 4XIUA 1XI1A 1WNSA 3CG7A 4J2EA 2O4IA 4CEZA 4CF1A 4F3OA 4E1MA 3NE6A 3LP2A 4KV8A 3BDPA 1J54A 3WNHA 2P5OA 2HW3A 4M3UA 2ETJA 1NK0A 4O4GA 2FC0A 3C95A 1UA1A 3NH2A 2FBYA 3I0SA 1SKRA 1TV6A 1QHTA 4Y1DA 1REVA 1VSEA 1IH7A 1RTIA 1BHLA 4CJ3A 4HUEA 3DLBA 4ELTA 5FRMA 2HHXA 3KLGA 2P51A 1A5WA 1WN7A 4LH5A 1ITGA 3T19A 4YFUA 1K6YA 3V1OA 3HP9A 1C1BA 3AVNA 1ZBFA 4OJRA 5CZ1A 5KRTA 3K5NA 3QO9A 2GUIA 4CJTA 1RDBA 3ZSVA 3SNNA 2QKBA 3DRSA 4DSKA 1BGXT 1X1PA 4DMNA 4E7IA 4Z4GA 4DSIA 1KLNA 4QCLA 1HYSA 1C0TA 1NKBA 3KLIA 4CF9A 5HP1A 1NK4A 3NF6A 4CF0A 2YHAA 1TGOA 1TAQA 1IKYA 1JXBA 2YNHA 5C42A 3ULDA 4B9VA 1KTQA 3NH1A 1ZBUA 4O44A 3V9WA 2B6AA 3NGIA 4BDYA 3AVBA 4DTJA 3O4QA 4B9NA 1HJRA 4OGCA 4CJEA 3V6DA 4CGDA 5E41A 4C8OA 4HTUA 3DLGA 1TL3A 4IFVA 4Z0UA 1WSHA 1U49A 2BGGA 1EKEA 1LWCA 3WNEA 2VWKA 3RRHA 4KB0A 2WOMA 4CGJA 3QNOA 4KHWA 3LPUA 1HYZA 3OYIA 3KLFA 3DRRA 4DTOA 3LWMA 1R0AA 4CJ5A 1WAJA 2JGUA 4B08A 4CEQA 3EZ5A 4NCBA 1D9DA 4KB1A 2G8VA 4RW9A 2HHTA 2KQ2A 1FXXA 1NK8A 4CFAA 4KHUA 2EX3A 1CXQA 3OYHA 4DS5A 3L2VA 1NK9A 2IS3A 4DU3A 4KTQA 3AV9A 4CJFA 4EP4A 2G8FA 1JLQA 4O0JA 4BE0A 1F21A 3PO5A 1JLBA 2ITGA 2QK9A 2DY4A 1VSKA 4JRQA 4DF4A 2O4GA 2YNIA 4DWIA 1L3VA 4DTNA 2P5GA 3HJFA 3V1RA 2HMIA 4FJJA 4AHCA 1JLEA 4R5PA 3IS9A 2A1RA 4I2QA 2HB5A 2QKKA 1VSFA 3ASMA 1S1VA 1RT5A 1T05A 1NJXA 4B9TA 3RR8A 3MXIA 4CHYA 3SUQA 1T7PA 3AVJA 4O55A 2ZQBA 1U4BA 1U04A 4CEOA 3I8DA 1QSSA 4DQSA 4Z4EA 1RT4A 1VSLA 1B9FA 1GOBA 4FCYA 3TAQA 3CFPA 2FBTA 3U3YA 3HM9A 3NFAA 4M3WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C0UA 3ZSWA 1FKPA 3C65A 4MO4A 4BRGA 3MXMA 1VQ8N 3HI0A 4AH9A 3VQ8A 4CGHA 4PY5A 5CYMA 5FRNA 2E2QA 1YF5L 4CD1A 4K25A 5JLFA 1NOYA 4GKKK 3QETA 4KKOA 4CJQA 4F9OA 3ULEB 3EEQA 4A2AA 3HPGA 2RN2A 4CJSA 4CHOA 4M45A 4FJ8A 4I9QA 4EZ6A 5KQDA 4BC4A 4IDKA 3WXLA 2HF3A 4CJUA 2EWSA 3HK2A 4C1NI 2JLEA 5E26A 4AHUA 1KC8O 3P1GA 1X9MA 4G9ZA 4BRCA 4KFBA 4WQ5C 4CHZA 3MN9A 4E7JA 5BRFA 1S1TA 4BRPA 3V9SA 1MU2A 1HQEA 1D9FA 1VSMA 4IFYA 2HHQA 1RBVA 3OA9A 4X64K 2OA8A 1VQ6N 5GAHP 5HBMA 1ZBLA 3VQCA 3A5OC 1RT6A 4JKEA 1C6VA 1JLCA 3PO4A 4RWTA 2I5JA 4CGGA 1HKGA 1SS6A 3AO3A 1DT9A 1TKTA 1RBRA 4H8KA 3VF2A 3TAFA 3P38A 5M1FA 4NO7A 5FLXO 3TAMA 3ID6A 3MEGA 3LZIA 3PY8A 3SI6A 3CIPA 4JI5K 4BRKA 5I9EB 3CJ7A 3WT0A 4GW6A 2HHVA 1ZC6A 3VQPA 4FWSA 4B9UA 3TAGA 4B9MA 4PWDA 3OYAA 3ZT4A 2BDPA 5AFUA 5EX5A 2WBNA 1C0GA 4QOZB 2XHBA 3LAKA 4LSNA 3MWTA 4J8FA 3CJBA 2GELA 4UQGA 1J9AA 5C10A 3CXCM 4E7HA 2IIRA 4BACA 4CF8A 1W7AA 4KH6A 1ZYQA 5LJVA 3SCXA 4PA1A 4FWNA 3MMVA 4KRFA 2OTLN 1QQCA 2IGIA 1Q82O 1NGAA 2NRVA 3FFKB 5I3UA 1BQNA 2OPRA 1OH7A 3MX2A 2ZF5O 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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