2P9LB

Crystal structure of bovine arp2/3 complex
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
203
structure length
201
Chain Sequence
IQAVLTLYAQGLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-like protein 3
publication title Insights into the Influence of Nucleotides on Actin Family Proteins from Seven Structures of Arp2/3 Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 54
structure length 201
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2p9lB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2p9lB02
4NB4A 3ZX2A 1ZXOA 3O5BA 3LDQA 1V4TA 3VEOA 5AQFA 4JD2A 1SAZA 1E4FT 3O6WA 3VENA 4BRCA 4DB3A 3ID8A 3MN6A 3SLCA 5BPLA 4MLHA 2YHYA 4EAHD 4GY2B 3KHYA 2Q2RA 2GEMA 1TUUA 4HWIA 4I6MA 2V52B 1QQOA 5BPNA 2I7NA 3IMXA 4CI6A 3LDLA 3R9PA 2E2NA 1ATSA 1HPMA 1HX1A 3CJBA 4QS9A 1NGGA 1ZC6A 1R59O 3LM2A 1RGIA 4H5TA 2H3GX 5BRFA 4B1UB 4K41A 3AAPA 1Z6RA 2P9SB 3MN7A 3UE5A 3ENHA 2E2PA 1TYQB 5B8HA 3WXKA 3MDQA 5CE3A 5AQVA 5JICA 2CH6A 3OHRA 1D4XA 4FPBA 4DCHA 4FOIA 5AQWA 3C0BA 5AQJA 5BR9A 5BRHA 5LY3A 5E84A 4WYBA 4AM7A 1S3XA 4KBOA 4BRNA 1NGJA 4H5VA 2P9SA 1YXQA 1KAXA 3H1VX 4CBUA 4ISFA 1DGKN 3UB5A 4EHTA 4IJNA 1TYQA 3HZ6A 5AZJB 3BEXA 4BRFA 4CZMA 1NMDA 2NRHA 3GL1A 2BTFA 1ZBSA 2ASMA 5JLFA 5AQXA 2VWBA 2AP1A 3QDKA 5EX5A 1DEJA 3D2EA 4QS8A 3VGLA 5EOYA 4CBXA 3EZWA 3MK6A 2FSJA 2Q36A 2D0PA 3HTVA 1MDUB 1YVNA 5AQIA 5I9EB 3VF4A 2QWRA 1XQSC 3U9ZA 5E26A 1SQKA 3VESA 5AZJA 2V7YA 3WXJA 3LDNA 4B1XB 3CQXA 4JAXA 2Q1NA 5AFUA 4BRMA 4Y0WA 2E8AA 3QMLA 1BUPA 3A8YA 5AR0A 3VGKA 1XUPO 3O8MA 2P9PB 3QFPA 2FLOA 3KZBA 3SMPA 1GLBG 2IVPA 4JN4A 3VF6A 3HSCA 4M7XA 2E1YA 3U4LA 3LDPA 1RFQA 2A40A 3SMSA 4O8KA 3VEXA 3SK3A 1NWKA 4H5WA 4IO8A 4BR0A 1GLJO 2DPNA 2E1ZA 3HM8A 2GWJA 4BVOA 1NBWA 4FPAA 3BP8A 3ZETB 4ISEA 3EKSA 1BU6O 2NLXA 5AQOA 2ASOA 5AQMA 3VEVA 2P9PA 4EFHA 5AQTA 4H0XB 2IVNA 2E2OA 2IIRA 3O80A 5BRDA 1NGDA 4BC4A 1CZAN 4K25A 5AQLA 4BQZA 1H1VA 4A62A 1KAYA 1T6CA 4F9OA 2P9LA 3WXLA 4EHUA 5JLHA 3ZETA 3O4WA 4PKGA 1JCFA 2P9UB 4YDUC 1EQYA 4BRHA 1WUAA 4A2BA 2YJFA 1WOQA 3O1WA 1T44A 3IDHA 4CZEA 3FZFA 4MLEA 4BVPA 3LDOA 2V51B 3H3NO 3VGMA 1NGIA 5AQKA 5AZIB 2I7PA 3EO3A 4QS7A 2QWQA 4A2AA 2A6AA 5ADXH 2PBDA 4H03B 2KHOA 2CGJA 2HF3A 1GLEG 2P9UA 2IVOA 1BG3A 5AQZA 3VEZA 4H5RA 3J8AA 1V4SA 2YI1A 3R8EA 4FWMA 4CBWA 4FWKA 1YUWA 1NGCA 5BN8A 4YDUA 1C0GA 3EN9A 4PL7A 3B8AX 3ATUA 3FLCO 3R6MA 5AZIA 3D2FB 3P4IA 2Q31A 3ULEB 4CZJA 2VCPA 2GUPA 4XH5A 3WXIA 3FZKA 4PL8A 3H1QA 3AAQA 4IJAA 2ZWHA 3AARA 3MN5A 4FL9A 4CZLA 3FZLA 1HKBA 2ASPA 4K43A 1GLCG 1OKJA 3A5OC 5KPTA 3SJHA 4BRLA 3A5NC 1IJJA 5JMVA 5LJVA 2YJEA 5AQHA 1BO5O 3D2FA 3L0QA 3ULEA 4BGBA 3TPQA 4BRPA 4CZGA 4CZHA 4BRGA 3H6EA 3I33A 2AA4A 1U6ZA 2P9IB 3VF2A 2D4WA 1JCEA 2P9NB 3LM9A 3FR0A 4FWOA 3GDQA 3AY9A 1GLLO 3U9DA 3KVGA 1NGFA 4H0VB 4H0TB 3VERA 3WEEB 2HMPA 5KPRA 2WUSA 3S41A 2W40A 1X9JA 1SZ2A 2W41A 4BGAA 4L3QA 3CIPA 1S22A 5KQDA 4JNEA 1NGBA 5KQ8A 2P9IA 3ATVA 4ISGA 3ZEUB 4E1JA 2P9NA 5FPDA 1J6ZA 2QWMA 1NLVA 5AQYA 1U2VB 5BN9A 3IFRA 2E88A 3WEEA 1HLUA 2GELA 4FWPA 1MWMA 4MO5A 3QBWA 2NZTA 4IXCA 4FWRA 3O08A 5FPMA 3DWLA 4BRDA 4EIAA 2HF4A 5LJWA 2BUPA 1BA1A 2QWOA 3C7NB 3QB0A 5F1XA 3FFKB 5TKYA 4DHYA 1YAGA 3ZX0A 1HKGA 3FZMA 3L6QA 2A3ZA 4HTLA 4XEIA 1KAZA 3FGUA 3ZEUA 1QZ6A 1QZ5A 1U2VA 2A5XA 4JD2B 3UKRB 2FXUA 3GE1A 4BREA 4O5FA 4DQ8A 1P8ZA 4MO4A 5BREA 5EXWA 3U8XA 3WQTA 4BROA 2QXLA 3WUHA 3CJ9A 1K8KB 4C23A 3GBTA 2A42A 3C7NA 5AQQA 4WQ4C 3G25A 3QBXA 4M7YA 4M63C 1G99A 2P9KB 3HI0A 4FWLA 1Q18A 4FWQA 2ZGZA 2QM1A 1MWKA 4IWVA 3UKRA 5FPNA 2FSKA 4H0OA 3M6GA 3MCPA 4FWNA 2YHWA 3DXMB 1LCUA 1Z05A 1NGEA 3VOVA 5EY4A 1K8KA 1QHAA 3D7EO 5AQGA 1QQMA 4CZKA 2Q0RA 2D0OA 4BRKA 2CGLA 2E20A 2FF6A 2Q0UA 2ZGYA 2GTDA 4CZFA 2YHXA 3BF1A 3JXUA 2P9KA 3ENOA 4FOEA 4PKIA 3CJ1A 3MMVA 5AFUH 4K42A 4H5NA 3H45C 4FWSA 1QQNA 1BA0A 2D1KA 4WQ4A 1BWFO 3DXMA 3M3ZA 3QFUA 2FSNA 5F2RA 2GWKA 2E2QA 1HJOA 5ELZA 3IUCA 3QICA 1HKCA 3CQYA 4BR9A 3FZHA 1JCGA 3TU5A 3MN9A 3WT0A 2J4RA 1LOTB 2HOEA 3DXKB 4XH1A 4J8FA 5AQRA 4BRAA 3D2EB 1Y64A 3VEYA 3A5MC 3BUZB 1X3NA 2ITMA 2QWNA 2ZF5O 4GNIA 3CJ7A 3I8BA 1T6DA 2A41A 4RWTA 3RSEB 2YCHA 4BC3A 3CI5A 1C0FA 5EVZA 3CERA 3CJCA 2CH5A 1MA9B 3UKUB 3A0IX 4RTFD 3ZX3A 3DXKA 3O1BA 4CD1A 3A5LC 3LL3A 3W3DA 4BG9A 2QWLA 3H46O 2Q97A 4FSVA 3F9MA 4Z94A 5FPEA 3WQUA 4PKHA 1ATNA 4IZ9A 5BPMA 3EKUA 4B1YB 4BR7A 5ADXA 4WQ5C 3CJAA 3RSEA 2F9TA 4B1ZA 3CHWA 4CJ7A 4BR5A 3BF3A 4LC9B 3JS6A 3GOIA 4H0YB 3DJCA 3UKUA 5KPZA 4CD3A 4BC2A 4H0PA 4FO0A 2QWPA 3CETA 4BQLA 1BOTO 3HBTA 4BRQA 5F0XA 1GLFO 3VETA 2EWSA 4JHDB 4B9QA 2FF3B 2V7ZA 4CZIA 1GLDG 2OANA 3H3OB 4BR2A 4XH4A 4B1WB 4B1VA 5AQUA 5AQSA 3VEWA 3W0LA 1GLAG 3EL2A 5AQNA 3M1FA 2UYTA 1KXPA 5AQPA 4BR4A 1HUXA 1TUYA 2PAVA 4WQ5A 4BG8A 3DAWA 2P9LB 4AM6A 1E4GT 1IG8A 2F9WA 1ESVA 3L4IA 1NGHA 1X3MA 2VYPA 4JHDA 4NO7A 4I6MB 1NM1A 1ATRA 4A61A 3FE1A 1XC3A 4BRIA 1DKGD 3GG4A 2CGKA 3VPZA 1NGAA 4BC5A 2QW9A 1BDGA 4RCHA 1RDWX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NB4A 3AVGA 4BDPA 3LDQA 1VSLA 2O8EB 4ID5A 1SAZA 2WONA 1E4FT 4CJ3A 4FXDA 3ID8A 1WSJA 3VTIA 3I8DA 4E19A 3LPUA 1TKZA 2YHYA 2HHTA 3PX6A 3V9XA 4EZ9A 4FJJA 3IMXA 3ENBA 4H4MA 4F2SA 4C1NI 3NF9A 3LDLA 3R9PA 1HPMA 4QS9A 5GADP 1RGIA 1XMQK 5M1OA 1NMNA 4DV0K 4K41A 3AAPA 1NJXA 1RILA 3IG1A 1Q8IA 3DLRA 3RR8A 4E7IA 3CCSN 1Z6RA 4M3RA 4CF9A 4KI6A 1VSDA 3TI0A 1WNSA 3OBYA 1QQCA 4HUFA 1TYQB 4WFAL 5CE3A 4F2RA 5JICA 2CH6A 1D4XA 3E01A 3S5TA 5AQJA 2E5LK 2JLEA 4KB1A 3QERA 3QLHA 4EZ6A 4KBOA 1NGJA 4BDYA 3J7ZO 1BQNA 3V6DA 2Q3SA 4IDHA 4LFCK 2KZMA 1DGKN 2F7TA 3PX0A 4G9ZA 4BRFA 2F8SA 3B6OA 4WCEL 4M42A 4ZHRA 5JLFA 5AQXA 4JI6K 3QDKA 4YOYA 4FLXA 4QS8A 4CBXA 3MK6A 5TKWA 4DTMA 4KTQA 2D0PA 1YVNA 5AQIA 5I9EB 1J5OA 1XQSC 5CHIA 1RT5A 5AJ3K 4BDZA 1U04A 1VRTA 3DOKA 3VA3A 5AZJA 1IBMK 3LDNA 2KKZA 1HYZA 3QMLA 3L2WA 2X6SA 4CESA 4CVNE 4ILHA 1OH7A 4L8RB 4N76A 3KZBA 3VMFB 5GAEP 4JN4A 2WC9A 4M7XA 2VQEK 4NXNK 2A40A 4KREA 4KRFA 4O8KA 4H5WA 4DV2K 4BR0A 1JLEA 4GV9A 2ZD1A 3OY9A 1GLJO 4BVOA 2GWJA 1NBWA 3MEDA 2XY7A 1NK9A 3BP8A 4B8AB 1IKYA 1U47A 1S6PA 2NLXA 5AQOA 5AQMA 2ZM6K 3VEVA 4ILGB 1DTTA 3EE9A 3ZT1A 3ULDA 1BI4A 4CGFA 5AQTA 1RDDA 2E2OA 2IIRA 3ZSOA 4GW6A 2NRXA 4BC4A 4A62A 3QEVA 2BGGA 4C1NK 4M3TA 3WXLA 4AHRA 4CIGA 5GAHP 3WNGA 5FDLA 4KB0A 4YDUC 1R0AA 3AVAA 5SWMA 1WUAA 4A2BA 2YJFA 1KLNA 4CEEA 2HB5A 4N56A 4JK8A 1WSHA 3OYNA 4JI0K 4MLEA 3SBGA 3CM5A 4OO1J 1EP4A 1EX4A 1Q9YA 2F8TA 4G1QA 4V19S 4QS7A 3DLHA 2A6AA 4A59A 4LSLA 2YNGA 5HROA 1TK8A 2P9UA 5CZ2A 4OPKA 2YNFA 3VEZA 2OCEA 4NCBA 1GOBA 1HMVA 4BE1A 1D8YA 3OYLA 4CJUA 3HK2A 1D9FA 3OJSA 1YUWA 1NGCA 4CJQA 1W7AA 3EN9A 4IEIA 4A5AA 4IFVA 3QNOA 1WB9A 3R6MA 5AZIA 1S1VA 2Q31A 3ULEB 1J53A 4CZJA 2VCPA 3PX4A 1JXEA 3WXIA 1BIZA 3LZJA 3VQ4A 4O8UA 4FL9A 2O4IA 4K43A 1HKBA 3DI6A 2HNYA 2A1SA 4DUYK 3A5OC 5EU7A 4YNQA 4BRLA 3A5NC 3DLLL 3SPYA 4KAZA 2VQFK 1BO5O 4KTZA 4JI4K 2BE2A 3TPQA 1NJIO 4BRGA 2VWJA 4KHPK 2R7YA 3H6EA 3AVMA 1RBRA 2AA4A 3E9LA 3KWIA 1RCHA 2D4WA 2P9NB 5E41A 2I5JA 4ZTJA 3GDQA 1TKXA 1GLLO 3KVGA 4LF4K 4H0TB 2X74A 2HVIA 1KVCA 1X9JA 3V81A 3MX5A 3LAKA 1SZ2A 2W41A 4KHWA 4CFBA 2P9IA 3DLKA 4DLEA 4CK3A 5AQYA 3DLBA 4JI3K 4IKFA 4N47A 3IFRA 1EWRA 5C0YA 1XHZA 4OJRA 1REVA 4A5BA 3VQ8A 3WEEA 3AA3A 4H4OA 4MO5A 1MWMA 4FWRA 3O08A 5FPMA 3DWLA 4HVJA 2BUPA 5GIPA 3PSIA 1BA1A 3QB0A 5TKYA 4PQUA 3OYJA 2Z1GA 3ZX0A 1HKGA 4HTLA 2A3ZA 5HL7L 1Z25A 3ZEUA 4F3OA 1K9MO 2QKBA 1QZ5A 3GE1A 3THYA 1X1PA 4FK4A 5BREA 4RG8A 1N33K 3WQTA 2QA4N 2QXLA 3CJ9A 4RW6A 1K8KB 1XC9A 1RTHA 4EP5A 2A42A 4B3OA 1VRUA 4DFKA 4DR3K 2P9KB 3RR7A 3RRGA 3K57A 1U49A 2ZGZA 3H08A 3UKRA 2G8WA 3RWUA 4FZZA 3MCPA 4FWNA 1NK0A 2YHWA 1YIJN 4Z4GA 1LCUA 3MWPA 3VOVA 1QQMA 2D0OA 2CGLA 2Q0UA 2ZGYA 4CZFA 4PA1A 1O1WA 3JXUA 3BZCA 4FW1A 4CEBA 1OVQA 3DM2A 4H5NA 4FWSA 1QQNA 4KHNA 3QFUA 5F2RA 4GV3A 2UUBK 1HKCA 3TSUA 3S3OA 4IFYA 4BR9A 3OYMA 1N32K 3T1AA 3TU5A 3VQBA 2J4RA 1SKWA 3DXKB 2FBVA 4BRAA 4KO0A 4TSXA 1YJNN 3C6HA 1Y64A 4LFBK 3O4QA 2D0AA 4JKGA 3A5MC 4FJ7A 2NRWA 4DR7K 1G15A 4FLYA 4B9UA 5KTQA 1XHXA 2A41A 1U45A 4YHHK 4EP4A 5CYMA 3K5LA 4BC3A 3CI5A 1X9WA 3RRHA 4MDBA 1C0FA 4JI1K 3CCEN 4CD1A 4YOXA 2G8HA 4LF7K 4CE9A 2XRIA 3W3DA 4BG9A 2E6LA 1T05A 2Q97A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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