5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
3O80A 2ZF5O 3VESA 4FL9A 3QMLA 4RCHA 4Y0WA 3GBTA 4CZMA 3RSEB 2A41A 3D2EA 2BUPA 3CQXA 4BROA 3M6GA 1OKJA 1NGJA 4BR7A 4IJAA 1NGFA 3IFRA 1XUPO 3EN9A 4NB4A 3VF6A 3ZX0A 3EKSA 3HI0A 2YJFA 4ISEA 3R9PA 3UE5A 5AQZA 4FWKA 5BRFA 2IIRA 1BO5O 4JHDB 1LCUA 5AQMA 5FPEA 4IZ9A 2Q0UA 5LJVA 2E2OA 2ITMA 5EOYA 2I7NA 4BRAA 3BEXA 3HTVA 4LC9B 4BVOA 3WEEB 3D2FA 5JLHA 1Z6RA 1NGBA 3O6WA 5AQHA 1D4XA 4BR0A 1TYQA 4FO0A 3ZX2A 1BOTO 1U2VA 5F0XA 4BRMA 4FWRA 5AQGA 2WUSA 2A6AA 2VYPA 1IG8A 1YAGA 4WQ5C 5FPNA 2Q0RA 1DEJA 3CJ9A 3VEWA 2CGKA 2VWBA 5EXWA 1ESVA 3IMXA 3KHYA 3CI5A 3MN6A 5F2RA 3DXMB 2AP1A 2YHWA 2OANA 4A2AA 1T6CA 1QZ6A 1E4FT 2P9UB 2V7ZA 3ENOA 3VERA 2E1ZA 1QHAA 4EHTA 3R8EA 3WQUA 2PAVA 4CJ7A 2NRHA 5F1XA 4MO5A 2GTDA 3EL2A 2A42A 2P9IB 4DCHA 3U8XA 3VF2A 3UKUA 1HX1A 5ADXA 5AZJB 2D4WA 1ZC6A 4K41A 4BRDA 3L0QA 4I6MB 1X3NA 3VPZA 3LL3A 4B1UB 4HWIA 4XH4A 4BVPA 1NGEA 4CBUA 3P4IA 1ZXOA 2E2QA 4FPAA 4PKHA 2ZWHA 3J8AA 3UKRB 3JS6A 3H1VX 1QZ5A 2Q97A 3VOVA 2P9KA 1V4SA 3ZETB 3VEYA 4BGBA 1CZAN 3VGMA 3O8MA 5FPDA 4BG9A 2J4RA 5AQKA 3C0BA 5AQJA 2W41A 3FGUA 3O08A 4C23A 2IVPA 4CBWA 3CJAA 4CZIA 3VGKA 3I33A 5AQNA 5AQUA 2CH5A 4K43A 4O8KA 3M1FA 1HJOA 3FR0A 4M7YA 2FXUA 3CERA 2QWRA 3TU5A 2ASPA 2ASMA 2ZGYA 4XH1A 4BC5A 3KVGA 3DXKB 5AQQA 3RSEA 2W40A 5AQPA 3WUHA 2QXLA 1GLAG 3L6QA 2A3ZA 3VEXA 1MWMA 4EHUA 3A5OC 3C7NB 3B8AX 4K42A 2E88A 3SLCA 5BR9A 3WXJA 3LDQA 4JHDA 2QWOA 2E2NA 3W3DA 1HKGA 3AAPA 3FZLA 3CETA 4A2BA 4QS9A 1S3XA 1R59O 1LOTB 1YXQA 3ENHA 2NLXA 2YI1A 1BUPA 4YDUA 3WEEA 1KAXA 3ULEB 2YHYA 4M63C 4WQ5A 1QQMA 1GLLO 4ISGA 3VEVA 1NGCA 4FWSA 4CZJA 5AR0A 4CD1A 1YVNA 4B1ZA 3IDHA 1NBWA 3CHWA 1T44A 3H45C 2P9SB 3CJCA 5ADXH 4FWPA 5BRDA 4WQ4A 3BUZB 3UB5A 5AQWA 1KXPA 2Q31A 4FWLA 3DXMA 4AM6A 1KAYA 1TUYA 2P9UA 2KHOA 3QFUA 5E84A 4BRGA 3EKUA 3CJ7A 4A62A 3JXUA 2P9IA 3AY9A 4FOEA 5AQXA 2P9PB 3AAQA 4B1YB 4BR9A 5AZJA 3WXKA 5KPRA 4BRQA 1GLBG 3KZBA 4IO8A 3SJHA 2BTFA 3FLCO 3H3OB 4I6MA 3SMPA 5AQLA 1NWKA 3M3ZA 3MN9A 1XQSC 3I8BA 5AQRA 4B1XB 2E8AA 4FWNA 1NM1A 2CH6A 4FWQA 3UKRA 3A5LC 4K25A 5AQVA 4MO4A 1SAZA 4KBOA 1BU6O 1BG3A 3A8YA 3ZETA 3MK6A 1XC3A 4BRPA 4PKIA 3FZHA 3A5NC 2IVOA 1SQKA 5AQSA 3CQYA 4DHYA 1NGAA 5AZIB 3MCPA 5AQFA 3EO3A 1C0FA 2AA4A 3LM9A 1NGGA 4MLHA 2P9NB 4CZLA 5AFUA 4CBXA 4BRNA 2QM1A 5JICA 4JD2B 3L4IA 1ZBSA 2CGJA 4L3QA 3VEZA 1WUAA 1S22A 4IJNA 5KQDA 3LDPA 1GLJO 4MLEA 3MMVA 3LDLA 3CJ1A 3A5MC 5EX5A 3DXKA 1HPMA 4H0YB 3DAWA 3U4LA 4B1WB 4CZHA 3MN7A 1IJJA 3WXIA 3QBXA 5ELZA 4F9OA 5AQOA 4WYBA 4BR4A 2P9LA 2QWMA 3O1BA 5EY4A 4CI6A 4O5FA 3C7NA 4H0XB 5JMVA 2I7PA 3GDQA 2E2PA 4BRIA 1C0GA 4M7XA 1DKGD 2P9LB 2QWPA 3WT0A 3HBTA 3ID8A 1HUXA 2GWKA 2HMPA 1BA1A 4HTLA 4BG8A 2A40A 4H0OA 1BWFO 3AARA 5BPMA 1P8ZA 4BC3A 4AM7A 3BF3A 2DPNA 5AQIA 2F9WA 3F9MA 3ULEA 3HZ6A 4BRLA 4CD3A 1K8KB 5BRHA 1T6DA 1QQOA 3DJCA 1YUWA 3O5BA 4RWTA 4XEIA 2F9TA 5AQTA 3D7EO 3GOIA 4H03B 4QS7A 2GEMA 1TUUA 4PL7A 1G99A 2P9SA 4BQLA 5AQYA 3S41A 4CZFA 2FF6A 2GELA 2HOEA 5JLFA 5KQ8A 3VGLA 4CZEA 3HM8A 1SZ2A 4BQZA 3U9DA 4PL8A 2A5XA 2YCHA 4H5VA 1WOQA 3W0LA 4FWOA 2V51B 1ATSA 3IUCA 1U6ZA 3D2EB 3HSCA 3O1WA 4BR5A 3SK3A 4PKGA 1NMDA 2YHXA 3H46O 4A61A 2ASOA 2NZTA 5LJWA 3QFPA 2E1YA 5BN9A 4CZKA 2D0PA 5TKYA 3U9ZA 1RFQA 4QS8A 3A0IX 2P9PA 1V4TA 3GL1A 1EQYA 1MDUB 3LM2A 4BRKA 4Z94A 4BGAA 1H1VA 2FSNA 3QDKA 1HKCA 3ATUA 2VCPA 3GG4A 3OHRA 4EIAA 1GLCG 5AFUH 1GLEG 1MA9B 1JCEA 2QWNA 5LY3A 1NGDA 4BREA 1Z05A 4FSVA 4BRCA 1MWKA 4YDUC 3D2FB 1J6ZA 2Q2RA 4H0VB 2V52B 4H5RA 2FF3B 2EWSA 3WQTA 5KPTA 1DGKN 5AZIA 3LDNA 2FSJA 2V7YA 1ATNA 1TYQB 2GWJA 1U2VB 4BRHA 1GLDG 4BR2A 4JAXA 3VF4A 4NO7A 4DQ8A 2P9NA 4EAHD 3GE1A 4FPBA 4H5NA 2HF3A 1KAZA 2QW9A 2FSKA 3VETA 4WQ4C 5BPLA 4JD2A 4DB3A 5I9EB 3ZEUA 3CJBA 3MDQA 4J8FA 3O4WA 1JCFA 1RDWX 3FE1A 2D1KA 1BA0A 2Q36A 5BPNA 3WXLA 1X9JA 2E20A 2CGLA 4CZGA 1Y64A 4XH5A 3VENA 3ZEUB 1JCGA 1QQNA 1NLVA 2ZGZA 2D0OA 4B9QA 3QBWA 3ZX3A 2GUPA 3UKUB 4JNEA 1ATRA 5EVZA 4RTFD 4H5TA 4H0TB 1BDGA 4BC4A 2HF4A 4IXCA 4BC2A 2IVNA 3QB0A 5E26A 2QWLA 3FZMA 3DWLA 3G25A 3MN5A 3H3NO 3SMSA 2UYTA 4GNIA 1Q18A 5CE3A 3CIPA 3FZKA 1HLUA 3FFKB 1HKBA 3VEOA 4H5WA 2P9KB 3R6MA 4IWVA 2Q1NA 5BREA 4E1JA 4BRFA 3BF1A 4ISFA 3TPQA 5KPZA 1K8KA 2QWQA 1E4GT 1GLFO 1X3MA 2YJEA 4FWMA 3ATVA 3H6EA 4H0PA 2PBDA 3BP8A 3H1QA 3EZWA 3QICA 4B1VA 3FZFA 4EFHA 4GY2B 5B8HA 4FOIA 5FPMA 3LDOA 1NGIA 1NGHA 1RGIA 4JN4A 2H3GX 5BN8A 2FLOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E5LK 4C1NK 3F9KA 1TL1A 1F21A 4RCHA 3GBTA 2EX3A 4CZMA 4OGCA 4HCBA 4CE9A 2BANA 4JKGA 4KTZA 3VF6A 3EKSA 3R9PA 2YJFA 4ISEA 3CCVN 5CR4A 5HP1A 3VQ7A 1N32K 3OYHA 4DG1A 1TKDA 4NLCA 1IKWA 4IOAL 1L3SA 3QEVA 2D0AA 1OVQA 2K35A 3D0PA 5EOYA 1NK7A 4KYPA 3M5RA 4GV6A 3D2FA 1WSFA 4M3XA 1QQCA 2YIOA 1BMRA 5HRNA 2IS3A 1XHZA 3LWMA 3OVNA 1TYQA 3ZX2A 1BOTO 4HHFA 4BRMA 5JS1A 4FWRA 4AH9A 2G8VA 5AQGA 2LY5A 2WUSA 1HYSA 2WTUA 2A6AA 2VYPA 1IG8A 4CJ4A 2Z1HA 2CGKA 1C0MA 2N69A 4FLYA 2ZJQL 5EXWA 1ESVA 3PO4A 3S9HA 3CI5A 2FBTA 3ZSRA 2V7ZA 3QIPA 5TKWA 4CFBA 4W5TA 3QNOA 3THWB 2PAVA 3I8DA 3P83D 1HJRA 4MFBA 1WNSA 3UKUA 1HX1A 2D4WA 3U3GA 4I6MB 2A1RA 3VPZA 3SQ4A 4BVPA 1NGEA 4CBUA 3JSMA 1ZXOA 1JJ2M 3UKRB 2ZWHA 3O9RA 2XO7A 2BE2A 1P0AA 3PV8A 2P9KA 3DI6A 4DLEA 4BGBA 1JKZA 3PX6A 3MECA 1XNRK 1EX4A 2J4RA 1RDDA 3Q7CA 1D5AA 3C0BA 3HM9A 3HVTA 3ITHA 3C65A 1IBKK 4C23A 1RBSA 4OPJA 3N4PA 4IEIA 1S1UA 4Z4EA 1U4BA 3J7ZO 3I33A 3KLIA 4LFAK 4O8KA 3M1FA 3FR0A 1W0HA 2HHHK 3CERA 2E6MA 3SNNA 4JKFA 2ASPA 2ZGYA 4DTPA 5HRRA 1Q86O 5AQQA 2RF2A 4RW7A 1PE4A 3AVKA 2QXLA 1D9DA 4B9TA 3VEXA 3VA3A 4BECA 4K42A 5C2FA 1L3TA 1NRAA 4KAZA 1UA0A 4UJ0A 4PY5A 2QWOA 4DTSA 1N5YA 1BCGA 3W3DA 5E41A 4V19S 3L2UA 4DFMA 3C6UA 1HNVA 3SCXA 4QS9A 1T7EA 2YI1A 2WONA 4DQSA 1A5WA 1T7AA 4WQ5A 2UXCK 1GLLO 2HMIA 1NGCA 4XJXA 4CZJA 2F8SA 2BH1A 1NBWA 3VQ8A 2IC3A 3SPYA 5KGXA 1YTUA 4CEQA 3OS1A 4FZZA 2BGGA 4JV5K 3VQ4A 3BUZB 5JVHL 5AQWA 1HNZK 3KP0A 1HMVA 1X9MA 1KAYA 2F7TA 3KOZA 4DTRA 3PO5A 5LL6Z 3QFUA 5E84A 3ID6A 3THWA 3EKUA 1J53A 4WF9L 3V9SA 3QI7A 1JLAA 1OMYA 4EP4A 3AAQA 4B1YB 1MU2A 2RN2A 1WSJA 3HO1A 4BDPA 1GLBG 4IO8A 3U6FA 3HVRA 4I6MA 3H3OB 4CGJA 3SMPA 3UIQA 5J2NA 3M3ZA 2MZ0A 3T69A 3KK1A 1XQSC 5AQRA 2QXFA 4B1XB 4FWNA 1NM1A 3MX5A 2CH6A 3UKRA 2WBNA 3A5LC 5AQVA 4MO4A 2LY6A 4KBOA 3NFAA 4DV6K 2E6LA 4DV0K 4DU1A 3PLAA 1IKXA 3LDSA 1VQPN 2QI2A 3CMAN 4V1DC 4X64K 4F4KA 1SQKA 2GV9A 4JI8K 3U3YA 5AZIB 3RVCA 3AVGA 2XY7A 4DR3K 3C95A 4K8ZA 3MCPA 3L3VA 1CLQA 3LM9A 2DFHA 1KFSA 4CZLA 5AFUA 4BY9C 4CBXA 1QSSA 3VTIA 2E3GA 4DV2K 3DLKA 2CGJA 3AA3A 4FJGA 3T1YK 3CCUN 3MEDA 4MLEA 3J7YP 3A5MC 5EX5A 3RMCA 1HPMA 2ZD1A 1QSYA 3MN7A 3G4SN 3KLHA 4BR4A 2RHKA 2FBYA 1S1WA 1JLBA 2QWMA 1RDAA 2DFEA 4CI6A 1B3CA 3J7AP 2HHTA 4A59A 4FLWA 5JMVA 3QIOA 3PY8A 3GDQA 5KTQA 2E2PA 4CEFA 1T03A 2NY8X 4A5BA 1FJGK 1JXCA 4I2PA 4AHTA 1VQMN 2P9LB 4JKAA 3WT0A 2O8DA 1NJIO 4HTLA 2HNDA 4GKKK 1BWFO 4LD0A 1RT5A 1TGOA 4LSNA 4CFDA 1JLQA 5BPMA 5BR8K 4BC3A 4FJJA 4B3OA 2NRVA 3S5TA 4CD3A 3F9MA 3HZ6A 3OYFA 1K8KB 3ZSYA 4ELUA 3K5MA 1UA1A 4XEIA 2F9TA 1NH5A 2YILA 5AJ3K 3P5JA 3E9LA 4QS7A 1G99A 4BQLA 2VG6A 3QO9A 3AA2A 2YNHA 4UY8O 4CEBA 2HOEA 5JLFA 5KQ8A 4CZEA 4R79A 3HXMA 3K58A 4BDZA 2KZZA 4F3TA 4FW2A 4PL8A 1WOQA 4CF0A 3IUCA 3TANA 1U6ZA 2ZE2A 3EEQA 4BR5A 4H8KA 4J2BA 3L56A 5MLCQ 2ASOA 4AHUA 5LJWA 1ITGA 1VHXA 1RBVA 5BN9A 1RT2A 4CZKA 2D0PA 5TKYA 4KHQA 3QETA 1RFQA 5C0YA 3LP1A 3GL1A 1JZBA 1XRSB 4BGAA 1H1VA 2O8EB 2N2QA 3K5OA 3GG4A 1WAFA 4CFAA 2E4LA 4MDAA 4OVLA 5AFUH 2W6LA 1BHLA 3EE8A 5LY3A 2ZM6K 4FLUA 4NYFA 5C12A 3NH2A 1MWKA 2V52B 4H5RA 5CYQA 2EWSA 4OPHA 1WSIA 1DGKN 5AZIA 1LWEA 3WXMB 2V7YA 1VQKN 1ATNA 1KVBA 4B8AB 2YIPA 4B9UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4NO7 A;  4DQ8 A;  2P9N A;  4EAH D;  3GE1 A;  4FPB A;  4H5N A;  2HF3 A;  1KAZ A;  2QW9 A;  2FSK A;  3VET A;  4WQ4 C;  5BPL A;  4JD2 A;  4DB3 A;  5I9E B;  3ZEU A;  3CJB A;  3MDQ A;  4J8F A;  3O4W A;  1JCF A;  1RDW X;  3FE1 A;  2D1K A;  1BA0 A;  2Q36 A;  5BPN A;  3WXL A;  1X9J A;  2E20 A;  2CGL A;  4CZG A;  1Y64 A;  4XH5 A;  3VEN A;  3ZEU B;  1JCG A;  1QQN A;  1NLV A;  2ZGZ A;  2D0O A;  4B9Q A;  3QBW A;  3ZX3 A;  2GUP A;  3UKU B;  4JNE A;  1ATR A;  5EVZ A;  4RTF D;  4H5T A;  4H0T B;  1BDG A;  4BC4 A;  2HF4 A;  4IXC A;  4BC2 A;  2IVN A;  3QB0 A;  5E26 A;  2QWL A;  3FZM A;  3DWL A;  3G25 A;  3MN5 A;  3H3N O;  3SMS A;  2UYT A;  4GNI A;  1Q18 A;  5CE3 A;  3CIP A;  3FZK A;  1HLU A;  3FFK B;  1HKB A;  3VEO A;  4H5W A;  2P9K B;  3R6M A;  4IWV A;  2Q1N A;  5BRE A;  4E1J A;  4BRF A;  3BF1 A;  4ISF A;  3TPQ A;  5KPZ A;  1K8K A;  2QWQ A;  1E4G T;  1GLF O;  1X3M A;  2YJE A;  4FWM A;  3ATV A;  3H6E A;  4H0P A;  2PBD A;  3BP8 A;  3H1Q A;  3EZW A;  3QIC A;  4B1V A;  3FZF A;  4EFH A;  4GY2 B;  5B8H A;  4FOI A;  5FPM A;  3LDO A;  1NGI A;  1NGH A;  1RGI A;  4JN4 A;  2H3G X;  5BN8 A;  2FLO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E5L K;  4C1N K;  3F9K A;  1TL1 A;  1F21 A;  4RCH A;  3GBT A;  2EX3 A;  4CZM A;  4OGC A;  4HCB A;  4CE9 A;  2BAN A;  4JKG A;  4KTZ A;  3VF6 A;  3EKS A;  3R9P A;  2YJF A;  4ISE A;  3CCV N;  5CR4 A;  5HP1 A;  3VQ7 A;  1N32 K;  3OYH A;  4DG1 A;  1TKD A;  4NLC A;  1IKW A;  4IOA L;  1L3S A;  3QEV A;  2D0A A;  1OVQ A;  2K35 A;  3D0P A;  5EOY A;  1NK7 A;  4KYP A;  3M5R A;  4GV6 A;  3D2F A;  1WSF A;  4M3X A;  1QQC A;  2YIO A;  1BMR A;  5HRN A;  2IS3 A;  1XHZ A;  3LWM A;  3OVN A;  1TYQ A;  3ZX2 A;  1BOT O;  4HHF A;  4BRM A;  5JS1 A;  4FWR A;  4AH9 A;  2G8V A;  5AQG A;  2LY5 A;  2WUS A;  1HYS A;  2WTU A;  2A6A A;  2VYP A;  1IG8 A;  4CJ4 A;  2Z1H A;  2CGK A;  1C0M A;  2N69 A;  4FLY A;  2ZJQ L;  5EXW A;  1ESV A;  3PO4 A;  3S9H A;  3CI5 A;  2FBT A;  3ZSR A;  2V7Z A;  3QIP A;  5TKW A;  4CFB A;  4W5T A;  3QNO A;  3THW B;  2PAV A;  3I8D A;  3P83 D;  1HJR A;  4MFB A;  1WNS A;  3UKU A;  1HX1 A;  2D4W A;  3U3G A;  4I6M B;  2A1R A;  3VPZ A;  3SQ4 A;  4BVP A;  1NGE A;  4CBU A;  3JSM A;  1ZXO A;  1JJ2 M;  3UKR B; 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