4MO4A

Crystal structure of anmk bound to amppcp
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
362
structure length
345
Chain Sequence
PRYLGLMSGTSLDGMDIVLIEQGDRTTLLASHYLPMPAGLREDILALCVPGPDEIARAAEVEQRWVALAAQGVRELLLQQQMSPDEVRAIGSHGQTIRHEPARHFTVQIGNPALLAELTGIDVVADFRRRDVAAGGQGAPLVPAFHQALFGDDDTSRAVLNIGGFSNVSLLSPGKPVRGFDCGPGNVLMDAWIHHQRGEHFDRDGAWAASGQVNHALLASLLANLPWLQEHLARHPALPAADIQATLLELSARSISESLLDAQPDCEEVLVCGGGAFNTALMKRLAMLMPEARVASTDEYGIPPAWMEGMAFAWLAHRFLERLPGNCPDVTGALGPRTLGALYPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
publication title Conformational Itinerary of Pseudomonas aeruginosa 1,6-Anhydro-N-acetylmuramic Acid Kinase during Its Catalytic Cycle.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 118
structure length 345
sequence length 362
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.170: Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03702 AnmK Anhydro-N-acetylmuramic acid kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4mo4A01
3OHRA 4A2AA 3MN7A 1ZBSA 4A2BA 4J8FA 4PL8A 3O08A 3MN5A 2A5XA 3JXUA 5AQRA 3AARA 4BC3A 1Z05A 2GELA 5FPDA 3IDHA 5AQIA 3LDLA 4FSVA 2WUSA 4ISEA 3FZLA 4PKGA 5FPEA 2YHXA 4M7YA 4CZMA 5AQPA 3EO3A 4IZ9A 3B8AX 4BREA 4FOEA 1BO5O 3GDQA 3FGUA 5JLHA 5LJWA 3O1WA 4K42A 5F1XA 5KPZA 1NMDA 1XC3A 1GLAG 4FWKA 3VERA 4EHTA 3VEVA 5LY3A 2P9NA 5BPLA 4BRIA 4H0VB 4DB3A 3R8EA 3QBWA 1E4GT 2P9NB 4MLHA 3GOIA 4NB4A 4BGBA 1S3XA 3U9ZA 4K25A 4FWNA 3VF4A 3U9DA 2D4WA 3QB0A 5AFUA 4WQ5A 3ENHA 4H0TB 3EL2A 3O8MA 3O80A 4JHDA 3A5LC 4AM7A 4B1ZA 4XH1A 5E26A 4BRDA 2A42A 5EY4A 4IWVA 1BDGA 1LCUA 4JHDB 4EAHD 3WQUA 1SQKA 2AP1A 4EFHA 1NGDA 1S22A 3VEWA 3D2FA 4FOIA 1BA0A 2FLOA 4H5WA 1NWKA 4BR0A 1EQYA 3L6QA 3D2FB 4BC2A 4KBOA 1GLFO 5BREA 1K8KA 2GEMA 3WXKA 5AQOA 3FFKB 3M3ZA 4EHUA 1JCGA 3QDKA 3ATVA 2Q31A 2P9PA 1QQNA 2BUPA 1Y64A 1K8KB 4H5TA 2QWLA 1OKJA 5BR9A 3D2EA 2GWJA 4JD2A 3ZX0A 1ATNA 4YDUA 3SLCA 2P9PB 3O1BA 3VENA 2FSKA 3LM9A 4RTFD 3D2EB 2QWPA 4JD2B 2CH6A 3IUCA 1MWMA 2ZGYA 3VESA 2J4RA 1GLLO 3FZMA 2NRHA 1QZ5A 1GLEG 2IVPA 2CGJA 2ASPA 4K43A 1MA9B 4CZJA 3ENOA 4GY2B 3VEYA 4WQ5C 4JNEA 2KHOA 3M6GA 3W0LA 1HJOA 4BRGA 3ZETA 4CZEA 3UKUA 1U6ZA 4FPBA 3A8YA 3HTVA 2ZGZA 4XH5A 1GLBG 3I8BA 3UKUB 4BG8A 3UKRA 4B1WB 1WUAA 3QBXA 3VOVA 5AQZA 3A0IX 3FZFA 3UKRB 4CD3A 2EWSA 3W3DA 4BROA 3MN9A 5F0XA 5KQ8A 3DJCA 4LC9B 1KAYA 4BRPA 4BR9A 4BRAA 1Q18A 4RWTA 2E2OA 4FWLA 4FPAA 4BRHA 3H6EA 1T6DA 1NGEA 4IO8A 2P9UA 5E84A 3SMSA 4YDUC 3EKUA 2P9UB 3O6WA 3VPZA 5AZIA 3GG4A 4H0OA 2A6AA 1DEJA 3CJAA 3IFRA 3HSCA 3G25A 3MN6A 2QWRA 2IVNA 5AZIB 1NGBA 1BWFO 3GE1A 1E4FT 2Q1NA 1LOTB 3QFPA 1Z6RA 2FF6A 1TYQA 2YJEA 2Q0RA 3QMLA 4WYBA 3FZHA 1TYQB 2E1ZA 3WXLA 3U4LA 2ZWHA 1BOTO 5B8HA 3ID8A 4XEIA 1SZ2A 1T44A 4JN4A 4CZHA 3ATUA 1R59O 1HKGA 4L3QA 3KVGA 1H1VA 3SK3A 3FLCO 5ADXH 1NGJA 2I7PA 4QS9A 4IXCA 5AQGA 5AQSA 1YUWA 2AA4A 2V51B 4H0PA 4GNIA 5AQXA 2D0PA 4CZIA 1QQMA 3MMVA 2PBDA 4EIAA 5JICA 3CIPA 3VEOA 3EN9A 5AQQA 5JMVA 2V7ZA 1V4TA 2FSNA 3BEXA 2A41A 1CZAN 2YHWA 5EOYA 4FWMA 4AM6A 2CGLA 4PKHA 5AQYA 3ULEA 3CJ7A 1HLUA 3BF3A 1XUPO 4BRLA 4CZFA 4BGAA 3ULEB 1IG8A 4M63C 5F2RA 4PL7A 3LDOA 1D4XA 1YXQA 1ZXOA 3VF2A 2P9KA 4H5VA 1X9JA 3H1VX 2P9SA 2E1YA 4BR5A 1WOQA 1BG3A 2UYTA 3SJHA 2E2NA 3H1QA 2IIRA 2HF3A 2ITMA 4BG9A 2P9KB 2V7YA 3UE5A 3M1FA 2P9SB 3HM8A 3S41A 3VEXA 1GLJO 5AZJA 2QWNA 2QW9A 3BF1A 4F9OA 4BRNA 1HKCA 4FWQA 4BRQA 4BR4A 4BR2A 3CERA 2VWBA 5AZJB 3D7EO 3WXJA 4BC5A 1X3MA 2Q2RA 2E2PA 3AAPA 1HX1A 4WQ4A 4CZKA 5BPMA 1NGCA 3R9PA 3H3OB 2H3GX 1ZC6A 4FWOA 1NGHA 4FO0A 4M7XA 1NGFA 1MWKA 4BRCA 2W40A 4ISGA 3ZETB 3FE1A 3O4WA 1XQSC 2P9LA 3AY9A 5AQUA 3MDQA 5AQFA 2ZF5O 3AAQA 4CD1A 2P9LB 1ESVA 3BP8A 3CJ9A 2GTDA 2YJFA 4CBWA 2E20A 2HF4A 3VF6A 4B1YB 1V4SA 5BN8A 3A5OC 5EXWA 3EZWA 4BVOA 3LDNA 3HI0A 2VYPA 1IJJA 2QM1A 5AQHA 5ADXA 3KHYA 3MK6A 4XH4A 4O8KA 3TPQA 1ATRA 1RFQA 4CZGA 1QZ6A 3O5BA 2OANA 4BRKA 5CE3A 3H46O 1DKGD 3ZX3A 1BUPA 1NM1A 4HWIA 3ZEUA 1YAGA 2QWMA 4PKIA 2ASOA 5BN9A 3WEEA 1BA1A 4BRMA 1YVNA 5AQMA 1JCFA 5AQNA 3A5NC 2Q36A 2QWOA 3ZEUB 4WQ4C 3R6MA 3WEEB 2FSJA 2IVOA 3FZKA 2QWQA 4FL9A 1MDUB 5I9EB 3WUHA 4BR7A 5ELZA 4MO4A 4DCHA 2E2QA 2NZTA 4CJ7A 2GWKA 2HOEA 2YHYA 2Q97A 2W41A 3CHWA 4QS8A 5LJVA 4FWRA 4H5NA 4B1XB 2F9TA 3QFUA 2FXUA 3VGLA 4I6MA 2ASMA 2P9IA 1JCEA 5EX5A 3LL3A 5AQKA 3J8AA 4CI6A 1P8ZA 3QICA 4I6MB 4NO7A 1KXPA 3ZX2A 4BC4A 3P4IA 2E8AA 2CH5A 2P9IB 1TUYA 3IMXA 3MCPA 1G99A 1GLDG 2D0OA 5BRDA 3C7NA 3JS6A 3H45C 1HKBA 3H3NO 3I33A 2D1KA 1ATSA 3C7NB 3CETA 3DXKA 4ISFA 2NLXA 5AQTA 1KAXA 2BTFA 3RSEA 4Y0WA 1NGAA 4A61A 5KPRA 1HPMA 5BPNA 3DXKB 3TU5A 1GLCG 1NBWA 4C23A 3RSEB 1HUXA 3FR0A 5BRHA 5JLFA 4JAXA 3CJ1A 2Q0UA 3CJBA 2CGKA 4B9QA 5AQVA 3WQTA 3L4IA 3U8XA 4CBUA 3VGKA 1DGKN 3DXMA 3DAWA 3EKSA 4BVPA 4CBXA 4IJNA 5EVZA 4B1VA 1C0FA 3DXMB 5AQJA 4DHYA 4E1JA 4DQ8A 3HBTA 3GL1A 4CZLA 1SAZA 4MLEA 2A40A 2I7NA 4BQZA 3KZBA 1QHAA 2YCHA 3A5MC 3CQXA 3C0BA 3SMPA 2FF3B 3VGMA 2E88A 4BQLA 1NGGA 4H03B 1RGIA 3LDQA 1C0GA 3CQYA 3DWLA 1RDWX 4FWSA 3CJCA 4K41A 4HTLA 1QQOA 5KPTA 2GUPA 1U2VA 2QXLA 1T6CA 4RCHA 5AFUH 1TUUA 4FWPA 5AQLA 5BRFA 3L0QA 5AR0A 3VETA 3HZ6A 1U2VB 3GBTA 4O5FA 4BRFA 3WXIA 3WT0A 1KAZA 3CI5A 4QS7A 2DPNA 4IJAA 4MO5A 2A3ZA 4H5RA 5AQWA 3VEZA 3F9MA 4B1UB 5TKYA 2HMPA 2PAVA 5KQDA 2YI1A 1X3NA 2V52B 3LM2A 1J6ZA 4H0XB 1NGIA 4A62A 2VCPA 3UB5A 4Z94A 2F9WA 1NLVA 1BU6O 4H0YB 3BUZB 5FPNA 3LDPA 5FPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JLGA 4A2AA 4CEFA 4A2BA 3CPEA 4J8FA 1A5XA 1A5VA 4YOTA 4DV0K 3SUNA 3NCIA 3VTIA 2GELA 5AQIA 1RT2A 3AO5A 2WUSA 1KD1O 2WOMA 4CJ5A 3NBPA 4NXMK 4E89A 3AA4A 4PKGA 1C0TA 1IH7A 1HNIA 1JXBA 4CIFA 1RT1A 5AQPA 3EO3A 1NK0A 1QVFM 2O8BB 4CHZA 5LJWA 3EE8A 3KK3A 3ZSQA 4K42A 3L2RA 1M90O 4DS4A 4FWKA 4E7KA 3AVIA 3AVMA 4PWDA 4FCYA 1VQPN 3R8EA 3OYFA 4H4MA 1TAUA 1ITGA 4A59A 4FYDA 4NB4A 4CIEA 1BGXT 1WN7A 1S3XA 3VF4A 4DR7K 3R3LA 3ZT1A 2ATQA 3QB0A 4WQ5A 2G8WA 4H0TB 4FLXA 4B1ZA 4XH1A 5E26A 2A42A 5EY4A 1FW6A 3AGKA 4KTQA 3S9HA 4JHDB 4EFHA 4AHTA 1NGDA 2EHGA 3CCSN 2YV0X 3V1OA 1EQYA 3L6QA 3D2FB 3VQAA 4ILJA 3VQDA 1GLFO 3IAYA 2GEMA 4E1NA 3PSIA 4FJXA 4EHUA 4RW7A 3ZSWA 1HNZK 4H5TA 4DFPA 5BR9A 2GWJA 4JD2A 3O9UA 1ATNA 3SLCA 2XY6A 1Q82O 3KK7A 4CFBA 3OS0A 3SCXA 1RBUA 1W7AA 3D2EB 3D45A 2ZGYA 3VESA 2KZZA 2NRHA 3OYAA 2YNGA 3MXIA 1MA9B 4CZJA 4X66K 1NK8A 3VEYA 5M1PA 4FK2A 2UXCK 4DR2K 2KHOA 2HVIA 3W0LA 1HJOA 3BDPA 3ZETA 3SUQA 3UKUA 1C0UA 3R1XA 4FPBA 4DTNA 3HTVA 4K8ZA 2HHVA 2NUBA 4BG8A 3UKRA 1S1WA 3VOVA 4H4OA 4FK4A 3I0RA 3OYGA 3HXMA 3DLHA 4BROA 5DM6L 5F0XA 1NK4A 3DJCA 4LC9B 5H1SQ 4FXDA 4BRPA 4BRAA 3NE6A 2KTQA 3D6RA 4FWLA 3Q7CA 4FPAA 1T6DA 1RT3A 1SV5A 1RTDA 5CZ2A 4JKHA 4KHYA 4YDUC 1NJZA 3EKUA 2ZM6K 3VPZA 1WSFA 1R0AA 4H0OA 3RRHA 3MN6A 3CJAA 3IFRA 2XO7A 1S1XA 1RBTA 3KK1A 4ILGB 2IVNA 4GVMA 1BWFO 4W5QA 2Q1NA 3KD5E 1LOTB 1Z6RA 1VSLA 3QIOA 2FF6A 1Z26A 2YJEA 3LPTA 3CQ8A 1IBLK 2X78A 3CCMN 3NF9A 4LH4A 1WBBA 4CGFA 2BDPA 3E1YA 5C42A 4FJJA 1VHXA 1TYQB 2E1ZA 4DSEA 4OPAA 4HHTA 1U48A 5KGXA 4CJUA 4XEIA 1T44A 4DTPA 4YOWA 3ZT2A 3ATUA 4L3QA 3KVGA 4DV6K 4DS5A 2I7PA 4M3WA 5AQGA 2ZJQL 1YUWA 3BZKA 1T05A 3MMVA 4KTZA 3VEOA 2UU9K 3TSPA 1ZBLA 2KW4A 1V4TA 1Z25A 4R79A 3THYB 4PKHA 3ULEA 1NK9A 3BF3A 2G8IA 2G8KA 5SZTA 1OH5A 2O4IA 4BGAA 2PY5A 4NXNK 4BDYA 1IG8A 1P90A 4PL7A 2VGMA 3L2QA 4FJKA 1D4XA 5C25A 2P9KA 2P9SA 5GIPA 2X74A 3ZT0A 4BR5A 4ELVA 3QO9A 4BG9A 3NGIA 3M1FA 3C6TA 3S41A 1S9GA 1YIJN 4CESA 2HNDA 4BRQA 3HRGA 3D7EO 3WXJA 1JLCA 3B6PA 4I2PA 5GAGP 4CCHA 4DTJA 4OVLA 5GINA 3MXMA 5BPMA 3R9PA 1ZC6A 3TR8A 4CW7B 3VMFB 3I55N 2RF2A 4LY7A 1BL3A 3HPGA 4FJ7A 1WNSA 2W40A 1FK9A 3ZETB 4OPHA 1VQNN 3DLGA 4Y1DA 4LF6K 4CJ4A 3IKMA 3J80O 3TAQA 1ZBFA 3LWLA 2P9LB 3BP8A 5C2DA 1HQUA 4HUEA 1RILA 2E20A 4AHRA 5BN8A 5HRNA 4LFCK 5LL6Z 1IJJA 4OLAA 4EZ6A 3TPQA 4CZGA 4JLHA 3DRSA 2OANA 3O5BA 4BRKA 5CHIA 3H46O 1S72N 2BANA 4HWIA 3G71N 2QA4N 3WEEA 4E19A 4BRMA 4OKKA 5AQNA 3SNNA 4RW8A 3A5NC 3EZ5A 3NF7A 4WQ4C 4NCBA 2WTUA 2DFEA 4DFKA 3EEQA 4GMJB 3FZKA 2IS3A 4HCCA 3TAPA 3A2FA 2O8FB 1MDUB 4WFBL 5ELZA 5KGWA 4MO4A 4DCHA 2HHWA 4OPJA 3M8PA 5HOOA 4WFAL 2HOEA 2YHYA 3CHWA 4QS8A 4KKOA 4FWRA 3VGLA 4I6MA 4Z4IA 2DFHA 4JRQA 1NJYA 1JCEA 3SQ0A 3LL3A 5AQKA 3J8AA 4CI6A 1SKSA 1SUQA 1KXPA 4B3OA 1TKTA 2D0OA 5BRDA 3C7NA 5M1FA 1QTMA 3OBYA 2OCEA 1HKBA 3I33A 1C1CA 3SJJA 5AQTA 3RSEA 1S9EA 4Y0WA 3OYMA 1ASVA 3TU5A 1BIUA 1NBWA 1YVUA 5BRHA 1IO2A 2QKKA 3T1AA 5C12A 1WLJA 3KD1E 2CGKA 4F2RA 3L4IA 4E7JA 1KC8O 3AVNA 3DXMA 2B5JA 4OKEA 4H8KA 3DAWA 4BVPA 3LAKA 2OTJN 5EVZA 4B1VA 5M1QA 1WSHA 4DHYA 4MLEA 3S3MA 2A40A 2I7NA 1D9DA 4DTRA 4BQZA 1B9DA 1K8AO 2O8DB 4H03B 1RGIA 4TSXA 4DTOA 3ALYA 5HLFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SQ1 A;  2HNZ A;  5CZ1 A;  4B9Q A;  1YI2 N;  3C65 A;  4E7L A;  3U8X A;  1CXU A;  1DGK N;  2NRW A;  4DTX A;  3EKS A;  5GAD P;  1BIS A;  4CBX A;  1FKO A;  4IJN A;  1JLQ A;  3DXM B;  3QNN A;  4FZZ A;  3OA9 A;  3E9P A;  2O8E A;  4HCB A;  3GL1 A;  4CZL A;  4M3X A;  4HVJ A;  3THV A;  2YCH A;  3A5M C;  3PX6 A;  3CQX A;  3C0B A;  4BQL A;  1LW0 A;  5KRS A;  4AQY K;  5JS1 A;  2BE2 A;  1VQL N;  3KK2 A;  1ASU A;  3LP1 A;  4IG0 A;  3DWL A;  2OPR A;  3TI0 A;  3QIN A;  2GUP A;  4V19 S;  1L3S A;  5AFU H;  5AR0 A;  5D3G A;  2G8F A;  1S1T A;  2QTD A;  3VET A;  3GBT A;  3DM2 A;  4DSL A;  4B8C A;  3CCQ N;  5EU7 A;  2B4J A;  3V6D A;  5FRM A;  3KKS A;  2A3Z A;  1N6Q A;  1KSP A;  3TAR A;  3VEZ A;  3F9M A;  5TKY A;  2HMP A;  2PAV A;  1XNQ K;  3V9U A;  4I9Q A;  3OY9 A;  3UB5 A;  2XY8 A;  4FLV A;  1LWF A;  1UAX A;  1VK0 A;  2RKI A;  3PX4 A;  1RBR A;  3LPU A;  3LDP A;  3SUO A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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