3LDLA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldlA04
4YDUA 3GDQA 4BREA 4BC5A 4BR0A 2PBDA 3U4LA 1OKJA 3D2EA 1HKBA 3A5OC 3O6WA 3FLCO 4EAHD 3DXMB 3G25A 5F0XA 3MCPA 1J6ZA 5CE3A 2H3GX 4BRNA 1HLUA 2ZGZA 5E26A 5KPTA 2FLOA 4FWSA 3WXKA 2A3ZA 2W41A 2QWLA 5AQTA 2IVPA 3C7NB 3CJ9A 2IVNA 2E8AA 3R9PA 5BPMA 3U9ZA 3WQTA 3H6EA 4JHDB 4JN4A 5AQLA 2P9UA 1CZAN 4IZ9A 4XH4A 1IJJA 2F9WA 5AZIA 4I6MA 1YXQA 4B1XB 4O5FA 4E1JA 3ZEUB 2D1KA 4CBXA 4BRHA 4FWNA 4O8KA 4CZHA 1QQOA 2FSNA 3HM8A 3WT0A 4CD3A 1NWKA 3FZHA 4FWOA 4BG8A 5AQOA 5EVZA 3BEXA 2BUPA 5AR0A 4AM7A 1U6ZA 3O1WA 4GNIA 3MN6A 4BRPA 3SMSA 3VF2A 3O80A 4WYBA 4CZFA 2YJEA 4JD2B 2CGJA 3M1FA 3FFKB 1X3NA 4B1YB 3CETA 1YVNA 1SZ2A 3DXMA 2AP1A 3M3ZA 1TUUA 4H0YB 4CZLA 2VCPA 1NBWA 2V7YA 3LM2A 4H0XB 4CZKA 2I7NA 1NGBA 1Z05A 5KQ8A 1TYQB 4A62A 1JCGA 3C7NA 4CZGA 2FSJA 1MDUB 5AQMA 3DXKB 4WQ5C 3CJ7A 3H1VX 1GLDG 4JHDA 4FWQA 4WQ4A 4A61A 5AQQA 4KBOA 5AQKA 1QHAA 5AQNA 2GWKA 4J8FA 3MK6A 2D4WA 2E2QA 4CBWA 3O08A 3HBTA 4RWTA 4PKGA 4DQ8A 3H3NO 3ZEUA 3L0QA 3CERA 3AARA 4EHTA 2FF3B 1KAYA 4B9QA 4BRAA 4BR7A 3UKRA 3VEXA 4ISFA 1Z6RA 1GLEG 2A5XA 3QB0A 2EWSA 1T6CA 3ZX0A 3WEEA 3MMVA 3IMXA 4H5NA 3H45C 4FWPA 3VF4A 2FXUA 4FL9A 4PKIA 1X9JA 4K43A 3HI0A 3IUCA 4CD1A 2NRHA 4JD2A 2ASMA 2P9IB 3BF1A 3QBXA 3O1BA 3FR0A 4H5VA 3QBWA 3WXJA 1T6DA 2P9LB 4DHYA 4CZMA 2QM1A 3QFUA 1BO5O 2QWPA 1IG8A 4IJNA 2Q2RA 2DPNA 3J8AA 5AZIB 1HPMA 1MA9B 2V7ZA 4PL8A 3DXKA 1ATNA 3TU5A 1C0FA 3SK3A 1ZXOA 1C0GA 3CQYA 5BPLA 2VYPA 3QICA 4A2AA 4CI6A 3D2FB 5EX5A 3BF3A 3MDQA 1NGJA 1DEJA 2FF6A 3RSEA 4FPAA 2UYTA 1ESVA 3GE1A 4BRIA 3O8MA 4QS9A 3P4IA 1R59O 4FWKA 5EOYA 2CGLA 4BVOA 1KXPA 2YCHA 5BN9A 2CH5A 4EIAA 2W40A 1NGEA 5FPDA 3CI5A 4H0OA 4M7YA 2Q36A 5BN8A 2ASOA 1JCFA 2P9IA 3A5NC 5AZJA 4BR9A 3ZX2A 3QDKA 2P9LA 2IIRA 4BRKA 4FOEA 4BRCA 3FZLA 1Q18A 4MLHA 4BRQA 3F9MA 2IVOA 3GL1A 3VETA 1ATSA 4IXCA 3VERA 3QFPA 2VWBA 1BA0A 4WQ4C 1BA1A 5ADXH 5BRDA 2CGKA 1NMDA 1S3XA 2Q1NA 3FZKA 3FE1A 2QXLA 3I33A 4PL7A 3UKRB 1XUPO 5JLHA 3D2FA 1BOTO 2D0PA 2GWJA 5I9EB 1V4SA 3H46O 3WEEB 3VGKA 4BC2A 1K8KA 4NO7A 2D0OA 5F1XA 4DCHA 2ZGYA 3KZBA 2E20A 1EQYA 3VOVA 3JS6A 3LDQA 1SAZA 1KAXA 2ZWHA 4JNEA 2P9PB 4BQZA 2QWOA 3C0BA 5AQPA 2CH6A 5LY3A 3JXUA 4BRMA 3ENOA 5JLFA 3VEWA 5AFUA 4XH5A 2PAVA 3AY9A 5AQYA 1RFQA 2QWNA 1GLFO 3EL2A 4NB4A 3LDLA 2A6AA 1GLLO 4BROA 4Z94A 4H5WA 5BR9A 5ELZA 4ISGA 3FZFA 2QWQA 3OHRA 3VEVA 3VGLA 3A5LC 4K41A 3ATUA 4MO4A 5AQSA 1NM1A 4RCHA 4BGAA 3RSEB 5KQDA 3VEZA 1NGAA 3D7EO 3WUHA 4FSVA 1QQNA 2P9KB 4MLEA 5KPRA 1RDWX 2BTFA 4BRFA 2Q97A 2E88A 4AM6A 3LM9A 4ISEA 3VPZA 3H3OB 4YDUC 3B8AX 1G99A 3M6GA 1H1VA 2GTDA 5AZJB 1V4TA 2NZTA 3EO3A 2P9PA 5AQIA 1BG3A 2Q0UA 2AA4A 1QZ5A 3CJCA 3HZ6A 3WQUA 2ASPA 5KPZA 1RGIA 2GELA 2P9SB 1ZC6A 3ZETB 4LC9B 2NLXA 3W3DA 4H5RA 4BC3A 1HX1A 3EKUA 2J4RA 3EKSA 2OANA 1YAGA 3VEOA 3ULEB 3VF6A 1D4XA 2YHYA 3LDNA 3LDOA 2Q0RA 5ADXA 5LJWA 2QWRA 5FPNA 3S41A 3SMPA 4FOIA 4HWIA 3DAWA 4H0TB 4H03B 4XH1A 2F9TA 3SJHA 5BRFA 3GG4A 3A0IX 5JMVA 3CJAA 5AQVA 1K8KB 4K42A 4RTFD 4EFHA 4BC4A 1NGCA 1GLBG 2P9KA 3O4WA 1NGIA 2I7PA 5EY4A 3ID8A 3CJBA 5AQRA 3H1QA 3AAQA 4IWVA 4CZEA 1NLVA 3FZMA 1QZ6A 5FPEA 3O5BA 5EXWA 5JICA 4M63C 1NGHA 1WUAA 2KHOA 3DJCA 4IO8A 2YJFA 3IFRA 4IJAA 1U2VB 2P9SA 2ZF5O 3ZETA 1LCUA 3TPQA 1DGKN 4H0PA 4K25A 3EN9A 3ULEA 1X3MA 3W0LA 3CJ1A 4BVPA 4B1VA 4M7XA 2A40A 1QQMA 2E1YA 3ATVA 4QS8A 1HUXA 1HKCA 2YHWA 4BR5A 3UKUB 3VEYA 4B1WB 3AAPA 3KVGA 2P9NB 4BGBA 5AQWA 3I8BA 1GLCG 1S22A 5AQHA 5AQXA 4BRDA 4XEIA 1XC3A 4FWRA 2GEMA 3EZWA 1KAZA 2E2PA 3A5MC 5B8HA 4BRGA 3LL3A 4FWLA 1MWMA 1GLJO 1P8ZA 3R8EA 1LOTB 3UB5A 2QW9A 3VESA 4EHUA 5TKYA 3ENHA 4MO5A 1U2VA 5F2RA 3WXIA 4QS7A 3L6QA 4CZJA 5BREA 2V52B 3BUZB 4CZIA 3A8YA 4B1ZA 3CQXA 1BU6O 1T44A 1WOQA 3MN9A 5AQUA 5BPNA 4CBUA 5AQZA 1SQKA 1XQSC 3GBTA 5FPMA 3UKUA 5AQGA 3SLCA 1HJOA 3GOIA 4B1UB 3HSCA 2P9NA 4H5TA 4GY2B 3U8XA 1YUWA 1NGDA 2QWMA 3UE5A 2HMPA 3QMLA 3LDPA 3BP8A 4Y0WA 4BQLA 4L3QA 4FO0A 2FSKA 2A42A 1GLAG 2YHXA 5BRHA 1JCEA 3IDHA 3D2EB 4BR2A 3FGUA 3CIPA 2A41A 5AQJA 3L4IA 2HOEA 2HF4A 1ATRA 5AFUH 1Y64A 1BDGA 4BR4A 2HF3A 2ITMA 1MWKA 4BRLA 4FWMA 4FPBA 1HKGA 2V51B 3KHYA 1NGFA 1E4FT 3ZX3A 1ZBSA 4WQ5A 4BG9A 4H0VB 2P9UB 1DKGD 1TYQA 4I6MB 3HTVA 5AQFA 4HTLA 2E2OA 2WUSA 3MN5A 1BUPA 3CHWA 1TUYA 4A2BA 4JAXA 3MN7A 1E4GT 2E1ZA 3U9DA 4C23A 2E2NA 3WXLA 4CJ7A 3VENA 4PKHA 5E84A 2YI1A 1NGGA 3DWLA 4DB3A 2Q31A 2GUPA 5LJVA 3VGMA 4F9OA 3R6MA 1BWFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KRFA 1SL1A 3J81O 3GDQA 4BC5A 2PBDA 1NJZA 3T19A 2I61A 3O6WA 3G25A 1ZBIA 1Q8IA 3KJVA 4BRNA 3L4QA 3MEEA 2LI7A 5E26A 4FWSA 4DV0K 3TWHA 2QWLA 2IVPA 4DQPA 3KD5E 3TANA 3WQTA 2E4LA 3KK7A 3ID6A 1ZBHA 1KV0A 3O9SA 4FLWA 1IJJA 3NF9A 1T0ZA 5KGXA 4HHFA 1T8EA 4NLCA 3ZEUB 1WBBA 4CBXA 4LF6K 3QO9A 5C25A 4EP5A 1Q7YO 4CEZA 2FSNA 2KZMA 4KTWA 4ELUA 4CD3A 4FJ8A 5AQOA 4AM7A 4GNIA 1NJWA 2NUBA 3SMSA 3O80A 4WYBA 2YJEA 1ASUA 4JD2B 2CGJA 4A59A 3FFKB 1IKVA 4BE2A 3DXMA 3MWTA 1TK8A 1TUUA 1ZYWA 1VQMN 4YOWA 4CFDA 4LF8K 1NOZA 3OVNA 1N32K 2OTJN 3IRXA 5KQ8A 3E1YA 4A62A 4DQIA 1JCGA 3C7NA 3OYDA 4JI8K 4LH5A 4JHDA 1CZBA 4KBOA 4KHWA 1NNEA 1QHAA 4A5AA 2GWKA 4JK9A 3MK6A 4J8FA 2PYJA 4CBWA 4CFCA 1QHTA 4AHTA 4CEBA 4O8UA 4PKGA 3QEWA 3CERA 3AARA 3RRHA 3HRGA 2OPQA 4JI3K 2XHBA 3LAMA 1FJGK 1L3UA 1HYZA 3BY5A 2BH1A 1GLEG 4KHPK 4FJ7A 3MMVA 2NRVA 3IMXA 4I7FA 3H45C 4FWPA 3TTFA 4M3YA 3OW2M 3P38A 4PKIA 1KC8O 2NRXA 4GKJK 2YNHA 3MEGA 2NRHA 5C15A 1C55A 3BF1A 4YHHK 4PUOA 3DLGA 1KRPA 4DHYA 1RCHA 2QM1A 2ASCA 3QFUA 2FBVA 3L2RA 4FCYA 1KCFA 2LSNA 2Q2RA 4JI6K 3S9HA 1K9MO 1NK7A 3G10A 3TAEA 1YJNN 2YV0X 4KTZA 5HOOA 1LQQA 2D0BA 1JLEA 3CQYA 2VYPA 5DMRA 4CJQA 1TK5A 2FF6A 1ESVA 4CJRA 1R59O 1HNIA 2YC1C 1TKXA 4FVMA 4FWKA 2CGLA 2HNYA 1RTDA 3T7ZA 5SZTA 5HLFA 3NVMA 2PYLA 4M7YA 1XMQK 3M8QA 5BN8A 4U7BA 4XIUA 1NK5A 2P9IA 4BDZA 1YT3A 3ZX2A 4Q0BA 2RN2A 5CHIA 3QDKA 3BZKA 3OS1A 2IIRA 1YJ9N 3K9KA 5CYMA 4KV8A 1ATSA 4IXCA 3T69A 3VTIA 3QNOA 3QFPA 1I2UA 2OTLN 4KI4A 4FJJA 1XNQK 2B68A 1S1XA 1REVA 2QXLA 4PL7A 3DLBA 1QTMA 3KLFA 1RBSA 2UXCK 1BOTO 1XHXA 1PTXA 3VA0A 2QI2A 1L3TA 2E5LK 1HPZA 3AVCA 2WC9A 4DTUA 3HP9A 3MCAB 1YTUA 3HPGA 2E20A 4CJVA 2JGUA 3PO4A 4BQZA 4JRPA 1XRSB 1QSYA 5AQPA 3CCSN 1B92A 3A2FA 3JXUA 4Q5VA 3ENOA 5JLFA 4IEIA 3VEWA 4CGJA 4DSJA 4FJXA 5AQYA 1RFQA 3NH2A 1NKCA 2XRIA 4BROA 3LAKA 5GINA 3NF6A 1YF5L 4FM0A 3IKMA 3V9WA 1OMYA 5GAEP 4IO9L 3VGLA 1GOCA 1KVAA 1VQ8N 2OZMA 4GW6A 1BI4A 1IKXA 5DK5A 3U3YA 2O8DB 2VQFK 2YNGA 3D7EO 3WUHA 5J2QA 2YBRC 3PSMA 4F4KA 1I3AA 5KPRA 1LV5A 4CIFA 2BTFA 3C6TA 3TAPA 4BRFA 2N69A 4AM6A 1BISA 4ISEA 4CHNA 3H3OB 4YDUC 3M6GA 4LH4A 3TI0A 1V4TA 5C42A 2PZSA 4CF2A 3OYFA 1BG3A 4AEIA 3F5TA 3WQUA 3CJCA 1L5UA 4KH6A 4BC3A 4LF5K 1Q86O 1KD1O 4DS4A 1VQPN 1YAGA 3ULEB 4JS4A 2IS3A 5HRPA 5M1KA 3LDNA 3CM6A 1RDAA 1FXXA 5IWAK 1NRAA 3VQ7A 4X65K 5LJWA 2QWRA 4H0TB 5BRFA 2F9TA 3OYBA 4QOZB 3CJAA 5AQVA 2KBJA 3G4SN 4BC4A 4JI2K 4CF1A 2P9KA 3DYAA 2I7PA 5EY4A 2JWLA 3H1QA 3PX6A 1KTQA 5C2FA 4IWVA 4CZEA 3FZMA 1VRUA 5H1SQ 3D6RA 4M63C 3KD1E 3WNGA 1RBVA 4IFEA 2HBMA 4IO8A 3VN5A 3D45A 3CQ8A 3NDKA 3SYZA 3ZETA 2Z1JA 4DTPA 1W2BM 3CCQN 5C24A 3OBYA 4H0PA 4IFVA 2B4JA 4BVPA 1T7BA 1C0UA 2HBKA 4CHOA 1FKOA 2B6AA 2IAJA 4MQ3A 3I55N 1HKCA 1RDBA 4BR5A 3HOSA 1HMVA 3R1XA 3UKUB 4K0KK 2VGMA 3AAPA 1MYNA 1O13A 4DLGA 4M41A 4IG3A 5AQHA 4DSEA 1KLNA 2GBZA 4M45A 2GEMA 4E7IA 2E2PA 3A5MC 4DG1A 4HUGA 1YI2N 5B8HA 4FWLA 1N8RO 2E6LA 3JSMA 1JL1A 1GLJO 1P8ZA 1QE1A 1BCMA 1LOTB 2KSKA 4UJ0A 1DQ7A 3PV8A 1S72N 3CMAN 5F2RA 1OH8A 4QS7A 2GMOA 1HJRA 3J80O 2XY8A 3E7RL 1DTQA 2F96A 3RWUA 2ATQA 3G6EN 1P0AA 1GOAA 2V52B 4CEDA 3SI6A 1KQSM 1VQLN 2G8VA 2C1GA 3O9RA 2HBLA 2AJQA 3A8YA 3SAGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KRF A;  1SL1 A;  3J81 O;  3GDQ A;  4BC5 A;  2PBD A;  1NJZ A;  3T19 A;  2I61 A;  3O6W A;  3G25 A;  1ZBI A;  1Q8I A;  3KJV A;  4BRN A;  3L4Q A;  3MEE A;  2LI7 A;  5E26 A;  4FWS A;  4DV0 K;  3TWH A;  2QWL A;  2IVP A;  4DQP A;  3KD5 E;  3TAN A;  3WQT A;  2E4L A;  3KK7 A;  3ID6 A;  1ZBH A;  1KV0 A;  3O9S A;  4FLW A;  1IJJ A;  3NF9 A;  1T0Z A;  5KGX A;  4HHF A;  1T8E A;  4NLC A;  3ZEU B;  1WBB A;  4CBX A;  4LF6 K;  3QO9 A;  5C25 A;  4EP5 A;  1Q7Y O;  4CEZ A;  2FSN A;  2KZM A;  4KTW A;  4ELU A;  4CD3 A;  4FJ8 A;  5AQO A;  4AM7 A;  4GNI A;  1NJW A;  2NUB A;  3SMS A;  3O80 A;  4WYB A;  2YJE A;  1ASU A;  4JD2 B;  2CGJ A;  4A59 A;  3FFK B;  1IKV A;  4BE2 A;  3DXM A;  3MWT A;  1TK8 A;  1TUU A;  1ZYW A;  1VQM N;  4YOW A;  4CFD A;  4LF8 K;  1NOZ A;  3OVN A;  1N32 K;  2OTJ N;  3IRX A;  5KQ8 A;  3E1Y A;  4A62 A;  4DQI A;  1JCG A;  3C7N A;  3OYD A;  4JI8 K;  4LH5 A;  4JHD A;  1CZB A;  4KBO A;  4KHW A;  1NNE A;  1QHA A;  4A5A A;  2GWK A;  4JK9 A;  3MK6 A;  4J8F A;  2PYJ A;  4CBW A;  4CFC A;  1QHT A;  4AHT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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