1J6ZA

Uncomplexed actin
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
368
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords ACTIN ALPHA 1
publication title The crystal structure of uncomplexed actin in the ADP state.
pubmed doi rcsb
total genus 125
structure length 368
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1j6zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1j6zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1j6zA04
3VERA 4BGAA 3AARA 4CD1A 4PKHA 4CZHA 3KZBA 4PKGA 1V4SA 3VF6A 5AQOA 5ELZA 1BDGA 3DJCA 5F2RA 2A6AA 3WEEA 4IZ9A 4L3QA 5AQWA 1HKCA 1NMDA 1P8ZA 2P9LA 1NGCA 4FPAA 4IJAA 3VETA 4CZKA 2E1ZA 3WXLA 1WUAA 1X9JA 4K25A 5FPMA 3VENA 1GLCG 3MCPA 2HMPA 2CGKA 3LDLA 2PBDA 4XEIA 4MLHA 1HX1A 1H1VA 2CH6A 3EL2A 2P9NB 3ZETB 1NWKA 1BUPA 3BF3A 5BPNA 5AQXA 5AZIA 1RGIA 4CZMA 4FSVA 4FWMA 1S22A 1NGFA 1YXQA 3IUCA 1JCGA 5FPEA 3RSEB 3D7EO 1QQMA 5AQMA 4H5VA 3HM8A 3LM9A 4K41A 5KQ8A 1HKBA 1XUPO 2IVOA 3DXMB 3BUZB 3FGUA 4ISEA 1MWKA 3SMSA 3VESA 4CI6A 3VEWA 1DEJA 1NGEA 4C23A 4BVOA 3U8XA 1NM1A 5AQJA 3AAQA 3CJ1A 4CBWA 1YVNA 2VCPA 3EO3A 3ULEB 4HTLA 4B1VA 1KAYA 4BRDA 1D4XA 4O8KA 2GWKA 2Q36A 3SLCA 4KBOA 2P9IB 3SJHA 2CH5A 3CJAA 1QQOA 4BR5A 3LDPA 4IJNA 2FSNA 4FWRA 4FWNA 3GOIA 3W0LA 4IXCA 3GL1A 3A0IX 3CERA 2CGJA 4BQZA 3VEVA 2ZWHA 2F9TA 4YDUA 4RWTA 4CZJA 2P9NA 3QBWA 3ZETA 4A62A 5CE3A 4BR7A 4J8FA 2QWLA 1LOTB 5BRDA 2W40A 1HUXA 5BREA 3D2FB 2KHOA 2V51B 3JS6A 2HF3A 2YHXA 4CJ7A 4JAXA 5B8HA 2E20A 2AP1A 1C0FA 2V52B 4H0OA 5AQIA 4EIAA 4H0PA 2V7YA 2H3GX 4QS7A 3TU5A 3VEOA 4PL7A 4XH1A 3CQYA 5AQNA 1GLDG 3DXMA 5AFUA 1G99A 2D1KA 2CGLA 5LJWA 3I8BA 2UYTA 3ULEA 5ADXH 4FWOA 1ATNA 3FZMA 3AY9A 3L0QA 3QB0A 4FOIA 5EOYA 3FZHA 4DHYA 4FOEA 3ZX2A 4BGBA 4B1XB 1SQKA 1Z05A 2ASOA 1ESVA 4NO7A 4FWPA 3IMXA 2P9IA 3HSCA 2FF6A 3DXKB 3CJBA 1DKGD 5AQZA 1KAXA 1X3MA 3D2EB 1HPMA 5AQUA 4AM7A 4WQ4A 4LC9B 2GUPA 2PAVA 4ISGA 1SAZA 2V7ZA 1BU6O 4M7XA 3O8MA 2VYPA 3I33A 2D0OA 3GG4A 5BPLA 3VGLA 4BRCA 1XC3A 2P9SB 2J4RA 3LDNA 1GLFO 3WXKA 1S3XA 3UE5A 3D2FA 4CZFA 1XQSC 1ZBSA 4WQ5A 1TUYA 3WUHA 5TKYA 5JMVA 3FZKA 5AQYA 2GELA 3BP8A 1CZAN 1EQYA 2F9WA 1GLLO 4MLEA 4M63C 3EKSA 4BRFA 4JNEA 2HOEA 4BVPA 2IVPA 1QZ5A 3B8AX 3CIPA 1T44A 2FSKA 2P9PB 3LM2A 3ID8A 4B1ZA 1U6ZA 2A40A 1NGJA 3BEXA 3VEZA 3G25A 4BRGA 3U9ZA 3A5NC 4BRKA 4FWLA 2QW9A 3P4IA 3O1WA 1KAZA 1BA0A 3FR0A 3DXKA 1YUWA 3A8YA 4IO8A 3MK6A 4H5TA 3D2EA 1ZXOA 2P9UA 4A61A 2P9KB 1GLJO 4H0VB 5AQHA 5AZJB 3ATVA 1TYQA 1TUUA 2OANA 4BR9A 2ZF5O 3R9PA 5LY3A 3UKRA 5EX5A 1NBWA 3VGKA 1NGBA 4BROA 2P9SA 5E84A 5E26A 4BG9A 3IFRA 1BOTO 2QWNA 2YCHA 2HF4A 1BA1A 3GE1A 2Q0UA 2BTFA 3VF2A 4K43A 2GEMA 3S41A 1HKGA 1NGDA 1T6CA 3FZFA 3CQXA 2FF3B 3H45C 4JHDB 4E1JA 5AQPA 4BC3A 5JICA 4BRPA 2QWOA 4AM6A 3FFKB 1ATSA 2Q0RA 5KPRA 3KHYA 5KPTA 2E2OA 3CJ9A 3MN9A 2P9PA 3O1BA 2ASMA 4GY2B 3CETA 3H3NO 3OHRA 3WXJA 1NGGA 3HZ6A 3JXUA 1IG8A 5AQKA 5AQRA 3IDHA 3MN7A 3QFUA 4F9OA 3QDKA 4BC5A 3MN6A 5BRHA 4H5NA 2A42A 4GNIA 3MDQA 2Q2RA 3AAPA 1QHAA 4BQLA 3M1FA 4BC4A 3ZEUA 4EFHA 2P9KA 4FPBA 4BRIA 3O08A 4EAHD 5AZJA 2GWJA 4A2AA 2QWQA 1RDWX 1OKJA 3CI5A 3QICA 3H1VX 4JD2B 1SZ2A 2ITMA 3VPZA 3GBTA 1X3NA 4BR0A 5ADXA 5AQSA 2YHYA 3EZWA 1NGHA 4XH4A 4I6MB 2A3ZA 2W41A 4BR2A 5AR0A 1RFQA 2GTDA 3R8EA 2EWSA 1GLAG 3VEXA 4FWQA 3CHWA 2P9UB 2YJEA 4H5RA 1ATRA 3ENHA 3MN5A 4H0XB 3VEYA 3EKUA 5F1XA 5KPZA 4Y0WA 1TYQB 2FLOA 2YI1A 3LDOA 3UKRB 3FZLA 3M6GA 4A2BA 1HJOA 5BN8A 1BG3A 1J6ZA 4JHDA 3H1QA 3UKUB 5BRFA 3HBTA 2A5XA 1HLUA 1YAGA 4B1UB 3O6WA 3CJ7A 4BRLA 2QM1A 4WYBA 4BG8A 3SK3A 1MWMA 2ZGZA 3O4WA 4PL8A 3J8AA 5FPDA 3O5BA 4CZIA 5BPMA 2FSJA 3MMVA 1Y64A 3L4IA 1E4FT 4XH5A 2IVNA 1V4TA 1IJJA 4BC2A 4CD3A 3HI0A 4BR4A 2NZTA 2E2NA 4IWVA 4H0TB 3GDQA 3R6MA 3WQTA 3F9MA 3ENOA 4H5WA 1Q18A 2Q1NA 3WT0A 1QZ6A 4EHUA 4JD2A 1BO5O 5BR9A 4FL9A 2IIRA 4FO0A 4I6MA 5EVZA 1MDUB 4HWIA 2YHWA 4Z94A 4FWKA 4YDUC 1JCEA 5AQVA 3SMPA 3VF4A 3ZEUB 4CBXA 1R59O 4BREA 4B1YB 2E8AA 3U9DA 1ZC6A 3LL3A 2DPNA 2Q97A 3C7NA 2E2QA 4MO4A 5AQFA 3VGMA 3WQUA 2NLXA 3FE1A 1MA9B 4BRQA 3EN9A 3UKUA 5F0XA 4PKIA 3TPQA 3QMLA 3HTVA 2D4WA 3ATUA 3U4LA 4DB3A 4BRHA 2D0PA 4RCHA 5AQGA 4JN4A 3CJCA 4DCHA 1JCFA 3C0BA 5I9EB 4QS8A 1K8KB 3H46O 1T6DA 1U2VB 2FXUA 3KVGA 4B9QA 4CBUA 4FWSA 4MO5A 4CZEA 1NGAA 5AQQA 1E4GT 3A5LC 2QXLA 5LJVA 4M7YA 1QQNA 3M3ZA 2A41A 3ZX0A 3DWLA 4DQ8A 3W3DA 3WEEB 2QWPA 1NGIA 3H6EA 4WQ4C 5KQDA 3BF1A 3VOVA 5JLHA 4BRMA 2P9LB 2VWBA 5FPNA 4K42A 5EXWA 2ASPA 3L6QA 4NB4A 2QWMA 4H0YB 3H3OB 5AFUH 3O80A 1WOQA 2YJFA 4H03B 5BN9A 4ISFA 3RSEA 1BWFO 2E1YA 4CZLA 3UB5A 2E88A 4WQ5C 1NLVA 3ZX3A 4BRNA 1LCUA 3DAWA 2BUPA 2NRHA 2ZGYA 5AQTA 5EY4A 3LDQA 3A5OC 5AQLA 1Z6RA 5JLFA 5AZIB 3QBXA 4CZGA 2AA4A 3WXIA 4RTFD 2I7PA 2WUSA 4O5FA 1C0GA 3C7NB 1GLEG 1DGKN 2QWRA 2E2PA 1GLBG 4B1WB 3QFPA 4QS9A 1K8KA 4BRAA 2I7NA 3FLCO 4EHTA 1KXPA 1U2VA 3A5MC 2Q31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O8EB 3PX6A 3AARA 4DTOA 3OYNA 3VQPA 4PKGA 3VF6A 3KLFA 3J7ZO 5HL7L 3OS0A 1BDGA 3AO3A 4JKEA 4AHSA 5F2RA 1TAUA 3TAQA 3OYMA 5AQWA 1SS6A 4KRFA 3K59A 3AVIA 4N47A 1VSHA 4F3OA 4BDYA 3AO5A 3L2RA 3VENA 4DS5A 3O3HA 3VQ5A 2HMPA 1LAVA 2PBDA 4XEIA 1D9DA 4AHRA 3TANA 4FLXA 1RBVA 3E66A 4C1NI 4WFNL 4FLUA 3CC2N 3HRGA 4QCLA 2WFBA 5AQXA 4BDZA 4DR4K 1RGIA 4CZMA 4FJXA 3JAMO 4CJQA 1HYZA 2ZM6K 4HUGA 3CD6N 1WN7A 3ZSWA 3RSEB 4NXMK 3QEWA 4JKBA 4DV7K 1VSEA 3VQBA 4AHCA 1HKBA 1XUPO 3DXMB 4ISEA 1HYVA 3BUZB 4AQYK 2O8EA 2P5OA 1X9SA 4CF0A 1LW0A 2ETJA 5FLXO 3ULEB 3EO3A 3LWLA 3PSFA 5HRNA 4E7KA 1RDCA 1K8AO 3CYMA 3AA3A 1S1XA 2P9IB 3CJAA 2GX9A 3THYA 4DF4A 4CF1A 3LDPA 3S5TA 2NRVA 2P51A 2FSNA 4FWRA 4IXCA 2W00A 4DV1K 3NF7A 3GL1A 1Q7YO 4YDUA 4A62A 1VQMN 4KV8A 1LOTB 2YKMA 3O3GA 3ITHA 5BREA 4JK8A 2HF3A 5GAEP 2YHXA 3G71N 1C0FA 4H0PA 2V7YA 1Q9YA 4PL7A 1NJXA 5AQNA 1L3UA 3DXMA 1G99A 3VQAA 2D1KA 4CK3A 5LJWA 2PYJA 4JKDA 2UYTA 3ULEA 4FYDA 2FBTA 4B9MA 4FZXC 4E7LA 4FOIA 3HM9A 2JLEA 3C94A 5DM6L 2ASOA 2P9IA 3NH1A 3ID6A 3AVFA 2A1RA 2FF6A 4ID5A 5AQZA 4KH6A 3D2EB 1HPMA 2X78A 3HVRA 3QINA 2GUPA 4W5TA 1BCOA 3GG4A 5BPLA 3SAGA 3NGZA 1UWBA 1XC3A 4BRCA 3AVJA 2X6NA 1IKWA 1VSDA 1C1CA 5A2QO 3HPOA 4OJRA 4BY9C 3P38A 4WQ5A 1TUYA 1WB9A 5AQYA 2OCEA 4E7JA 1CXUA 1ASUA 2F9WA 1KRPA 3EKSA 3OJSA 2UXCK 4BVPA 2EX3A 4FJ5A 1QZ5A 4M3YA 2FSKA 3E1YA 4HUEA 4HVJA 2QK9A 5FRNA 4YORA 4FJ9A 1ZBFA 2YV0X 3O1WA 2HMIA 4B9VA 2HSTA 3T69A 1J9AA 1IBMK 3SQ2A 4YOVA 1RTJA 4IO8A 4FK4A 3VQDA 3D2EA 4UQGA 4FJLA 1ZXOA 3O9TA 4FCYA 3THXA 4AHUA 2ZF5O 2IOCA 2WBNA 1VSFA 4FVMA 3R1XA 1NGBA 3EY1A 4DU1A 3CFOA 2QEXN 3IFRA 4H4MA 1C0MA 2E6LA 2G8HA 1WAFA 3S3OA 1EWRA 4KAZA 3QETA 3KK1A 4Q5VA 3UIQA 2NRZA 3QEPA 4O4GA 4BE0A 1JJ2M 1YF5L 3AGKA 1TK5A 3KD5E 4J2AA 1NK4A 1WSHA 3H45C 3CCEN 1HQEA 1CXQA 4RW4A 5LL6Z 3KHYA 4LH5A 2HBJA 2E2OA 3CJ9A 3O4NA 4DV3K 4B3RK 2ASMA 3H3NO 3OHRA 3MXMA 3WXJA 1C1AA 5D3GA 1NGGA 1BI4B 5AQKA 4F9OA 3OS1A 1YIJN 3ISNC 2OPSA 1S72N 4CK1A 4H5NA 1S6PA 4OPHA 4M3RA 4DF8A 3EZ5A 4M3ZA 4CK2A 1QHAA 3M1FA 1T05A 4DV6K 1U45A 2GWJA 4B9TA 1RDWX 3RVCA 3H1VX 4X65K 1SZ2A 4N56A 1O13A 3GBTA 1X3NA 4BR0A 1S5JA 1NK6A 5KTQA 4XH4A 2RF2A 4IEEA 3BDPA 3HOSA 2ZJPL 3AVMA 4B9LA 1RFQA 2GTDA 3JYTA 4GV9A 1VHXA 1L3SA 4FWQA 2YJEA 3AA4A 3MN5A 4WF9L 3DLEA 2FLOA 3LDOA 3UKRB 3M6GA 1A5XA 4A2BA 4DSEA 4BWMA 3H1QA 2DFFA 3HBTA 2A5XA 3KK2A 4MQ3A 4JI6K 1YJWN 4C8NA 1VQLN 4BG8A 4PQUA 1WBDA 3KD1E 3CFRA 4YOWA 4CEZA 1HNIA 5BPMA 3MMVA 4MDBA 1E4FT 3LALA 3OYJA 1FKOA 3THWB 1X9MA 1IJJA 1NJYA 2OA8A 3NBPA 1Q8IA 1RCHA 3HP9A 4CW7B 4IWVA 3AA2A 4CERA 4CJPA 2Y1IA 4IBNA 3KLGA 3T19A 1QZ6A 3NAEA 4KFBA 1W7AA 3ZT0A 3VMFB 3HXMA 3O9SA 3C65A 3O9RA 3NF9A 4DUZK 4NLBA 5GAGP 4HWIA 2X74A 3K9JA 4FWKA 3O4QA 4BREA 2E5LK 1W2BM 3CG7A 2E8AA 1XWLA 3U9DA 3HP6A 3C7NA 4MO4A 3HPHA 1VQ8N 5AQFA 3VGMA 3OS2A 1WSGA 3V1QA 4BRQA 3M5RA 4PKIA 1BIZA 3TPQA 4O8UA 3QMLA 4EZ9A 4JRPA 3CM6A 3SJJA 1WAJA 1VSJA 4RCHA 2XRIA 4B8CA 3OYBA 2NUBA 1W0HA 1UAXA 1N6QA 1JLFA 2XY7A 4QS8A 1T6DA 3ZT1A 2FXUA 5HRRA 4E3SA 5CYMA 1NGAA 5J2PA 4O0IA 1E4GT 2HBLA 3A5LC 1XC9A 1VQKN 2VGMA 3EE8A 2A41A 2XY6A 4WFAL 4DQ8A 4CHOA 3WEEB 4GV6A 4ILGB 1FJGK 5JVHL 1RT7A 5E41A 4B9NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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