1ILYA

Solution structure of ribosomal protein l18 of thermus thermophilus
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
RLRLSVFRSLKHIYAQIIDDEKGVTLVSASSLALKLKGNKTEVARQVGRALAEKALALGIKQVAFDRGPYKYHGRVKALAEGAREGGLEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Rna binding protein
molecule keywords RIBOSOMAL PROTEIN L18
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Thermus thermophilus reveals a conserved RNA-binding fold.
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 18
structure length 90
sequence length 90
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ilyA00
5DM6L 3CC7N 1VQ7N 3CCVN 1VQ9N 3PIPL 1KD1O 1VQ4N 3I55N 4IO9L 1YI2N 1W2BM 3CCRN 5GAHP 1Q86O 3CMEN 1Q82O 3G71N 1YHQN 4WFNL 3CCQN 1YJWN 1ILYA 3CCEN 5GADP 3CCUN 1VQLN 3G4SN 1VQON 1YJNN 3CMAN 1K73O 5DM7L 3CC4N 1VQ8N 1YJ9N 1YIJN 1K9MO 3CCJN 1N8RO 2OTLN 4WCEL 1Q81O 3CXCM 2ZJPL 4U67L 1KQSM 1KC8O 2ZJQL 3I56N 1NJIO 1OVYA 4WFBL 5GAEP 1QVGM 2ZJRL 3OW2M 1VQ6N 2QEXN 4IOCL 3CC2N 1S72N 1QVFM 2OTJN 1M1KO 1YITN 4UY8O 5JVGL 1VQ5N 2QA4N 3CCMN 4IOAL 3J7ZO 3G6EN 3CD6N 5H1SQ 1M90O 5HL7L 5JVHL 1VQNN 1JJ2M 1VQMN 3PIOL 3DLLL 3CF5L 4WFAL 5GAGP 1K8AO 5MLCQ 3CCLN 1Q7YO 4WF9L 3CCSN 1VQPN 1VQKN 3CPWM
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3F73A 1QQMA 3HPHA 1T44A 3O9SA 3CG7A 4Q0BA 1TAUA 1TYQB 2ZGZA 5BR9A 5AR0A 2A5XA 3KVGA 1YVUA 4CEDA 1RT4A 2UXDK 3K0SA 4IFYA 3AVAA 3VQBA 3VF6A 2ATQA 3HVTA 4YY3K 3L2VA 4X64K 4KI6A 2HHVA 3O1BA 4FZXC 4ID5A 5AQJA 2A6AA 5AQVA 3VQQA 1EQYA 3F2KA 2VQEK 2GV9A 4Z94A 1TK8A 2OPQA 1ATRA 4NXNK 3ZSWA 3CC4N 1EETA 3PUFA 3IRXA 1EWQA 4O4GA 4BE0A 2IIRA 2OPPA 4YOVA 4JS4A 2OTLN 4DSJA 4H5RA 3TARA 3O1WA 4FJ5A 3I0RA 3S41A 4MFBA 4DR6K 3AVGA 1YF5L 3A5NC 3SQ4A 3AA2A 1BA1A 2QKBA 3NDKA 1CZBA 4DF8A 2CGJA 4Y1DA 1RBTA 5BRDA 2YJFA 5CY4A 1IH7A 4RG8A 4CK2A 3ZT0A 3TABA 2IVNA 3TTCA 4Y0WA 1BIUA 3RMDA 2KZMA 5JVGL 3WUHA 3QERA 3A0IX 4BRLA 4FK0A 3AO4A 1S1TA 2DFHA 1RBVA 1IG8A 2QTDA 4LSLA 4IEIA 3TPQA 1N33K 1KLNA 3IDHA 5HP1A 4CEBA 3ULEA 3LPUA 4HCBA 3QO9A 2DFFA 3LDLA 4FWQA 3CM5A 3SAHA 3DXKA 3KWGA 1KXPA 4QS7A 4KTWA 2Q0RA 4FZZA 4CZGA 3CCSN 1VQPN 3LP2A 2P9NB 1ATNA 3RRHA 4WQ4C 4DV2K 3KD1E 3SUNA 5BRHA 4A57A 3OBWA 3C6HA 4PA1A 2ASOA 1HYZA 1IKXA 4GMJB 4F2RA 3V1OA 2WUSA 4CF1A 3SAGA 2VWJA 2KTQA 5FPMA 2HHHK 4CJEA 3OYJA 3CCUN 4DTJA 2VG5A 2G8FA 3DI6A 2VGNA 4LH5A 4K41A 4B1ZA 1WUAA 5LMNK 1P90A 3FR0A 4ILHA 4FSVA 5HRNA 1BOTO 4CGGA 4KREA 4DR7K 4QCLA 3D6RA 3AY9A 4CIEA 1SL0A 1XC3A 3QMLA 4DV7K 3VGLA 1J5OA 3J8AA 4WCEL 4M3TA 3MCPA 3KLHA 4AHSA 3THVA 4BWMA 1C0UA 4KPYA 3KK2A 3NE6A 4JI3K 2NZTA 4BRHA 5AQWA 4G9ZA 1D4XA 3MX5A 3D2EA 5M1NA 3G0ZA 3DLKA 3G25A 4BR4A 1ASUA 3OHRA 3O4QA 3AVMA 1XNRK 1U48A 2E4LA 4LF4K 1NOZA 3D7EO 4BR9A 1CXUA 3OS0A 4CEAA 2ZE2A 1RDAA 3HL8A 2QI2A 2NRXA 2HBJA 4CJUA 1HNVA 5AQOA 3ZEUA 3NGYA 4FM1A 4NCAA 2W42A 4FLVA 1VQNN 5IWAK 1TVRA 3QICA 1BA0A 4OPAA 3DLLL 3CJ7A 1WAJA 3QBWA 3THXA 1SV5A 4W5QA 1RTHA 4XH4A 3HT3A 3S3OA 3VQDA 4FL9A 3MMVA 3KJVA 3RSEB 3TAMA 4AH9A 1LWCA 5HRPA 4M42A 3SNNA 4DQRA 3SBTA 1MDUB 4DR5K 3PX0A 1XI1A 5J2MA 1U4BA 1GLEG 1VQ9N 4IWVA 3S3MA 2NUBA 5JS2A 4DQPA 3ENOA 1JLGA 2PFUA 4K0KK 3LDSA 4M3ZA 4DTOA 3KKRA 1SAZA 3NF7A 5LL6Z 4DFMA 1B92A 2WFBA 4CHYA 3VF4A 1VSMA 2PY5A 4DWIA 4FJ8A 1HKGA 2WTUA 2IVOA 5AJ3K 5BREA 5AQQA 4M7YA 4JI5K 1BG3A 5FROA 1YUWA 4H8KA 4AHCA 1KCFA 5J1EA 5KTQA 4XEIA 2AA4A 1VSEA 5CHIA 3SK3A 2X6SA 4I6MB 1YVNA 4KHUA 5FRMA 4CZHA 4H5NA 4IG0A 4CHNA 4DTRA 1NGEA 1LWEA 3QEXA 4F8RA 2EX3A 1ASVA 1EKEA 4OKKA 4CJ4A 2BANA 4KB1A 5AQRA 4PQUA 3F5TA 3H6EA 3SPZA 3KLGA 4N76A 2FBTA 3HVRA 5JMVA 4KAZA 3UKUB 4JHDB 1R59O 4IG3A 4IOAL 3ZT3A 4H4OA 1XHXA 4G1QA 1RTJA 3VQAA 4JI8K 5H1SQ 1E4GT 4MQ3A 3HK2A 3AO2A 3WEEB 3R9PA 3MAQA 4QS8A 4FWLA 3PIOL 4BC4A 1O1WA 3FGUA 4H0YB 1NGCA 1XUPO 3NF6A 4EAHD 4FJLA 1HYSA 3JXUA 1RT6A 3QETA 4JRQA 1Q7YO 2YNHA 4DV5K 1JL2A 4PY5A 4CGJA 3O8MA 4YNQA 2HHTA 3QBXA 3VQCA 4M3WA 5AZIA 2QWPA 4DV0K 4CF8A 3KLEA 2PYJA 2HMPA 2KZZA 4CGHA 4EHUA 4IOXA 1HNZK 5HROA 3SAFA 2OPRA 3VEZA 3WXLA 3HZ6A 2ZF5O 3I33A 4IKFA 1S6QA 4CJ7A 4JKBA 1OKJA 2JGUA 1VQ8N 2P9NA 3OVNA 2UUCK 5AQKA 1RT2A 3LAKA 4A5AA 2YKNA 1KC8O 3QFPA 2YHBA 4E7LA 1L3SA 5D3GA 1UAXA 2E2NA 4C8LA 1NJIO 2P1JA 1L3TA 4JYAK 3CFPA 1N32K 3CPEA 4C1NK 1IKVA 5FPEA 4KHWA 4DS5A 2NLXA 3S3NA 4KB0A 1HJOA 3R8EA 1BCOA 1TUUA 1VQ6N 5J2PA 1QSSA 3EL2A 4K8XA 3FZLA 4IDHA 4HUEA 4O5BA 4GVMA 4HUGA 4GV3A 2ITGA 4DSEA 3U3YA 3L8BA 1T8EA 1A5WA 1NJWA 3JSMA 1HRHA 3DLBA 3J7ZO 3KK1A 4MLEA 2QM1A 3ENBA 1NM1A 5I9EB 3L2RA 1XMQK 1SS6A 3PY8A 2G8UA 4O8KA 4WE1A 1A5XA 2BTFA 2Q97A 4B9LA 5E41A 4OPHA 2P9SA 4AHUA 3AVHA 5MLCQ 5KPRA 5LJVA 4BRMA 2HNZA 2GEMA 3VQ6A 3FE1A 4BACA 3C7NA 1KAZA 4LF5K 1C1BA 4KHNA 2GTDA 5LMUK 1NJYA 3LWMA 3CQYA 1Q8IA 1KSPA 5F1XA 5C2DA 1ZXOA 1YI2N 2ETJA 3IG1A 1GLLO 3RMBA 3OA9A 1B9DA 5GIOA 1N36K 4RCHA 4FJGA 1NK8A 4I2PA 1LCUA 4JKGB 4CJTA 3DWLA 1G99A 1QSYA 3J81O 2VYPA 1YJNN 4RW9A 5C15A 4UQGA 1OH7A 3KHYA 4JKDA 3FZKA 3L4IA 1NWKA 3M1FA 4MDBA 1CLQA 3OYKA 1EWRA 3TAGA 1N8RO 3SMPA 2QWMA 2GBZA 4CK1A 1KQSM 4BGAA 4H0TB 4XH1A 4CJKA 1XQSC 5GINA 4BQLA 1QQCA 5AQUA 4RWTA 5DK5A 1IBLK 3MEGA 4DMNA 5C25A 2Y1IA 4OVLA 3ZETB 2FSJA 4CZMA 3MN6A 2W6LA 4ZTFA 3MEDA 4E7HA 4A61A 3AA4A 1RT1A 3H3OB 1WSHA 3MK6A 2X74A 1NJXA 3MXJA 4TSXA 4BWJA 1T03A 1NU0A 4EZ6A 2O8CA 1U49A 4KBOA 4O5FA 4N41A 1VSKA 4FJKA 4I6MA 3U9DA 1XHZA 3Q7CA 5AQXA 4DSFA 2I7PA 2KKZA 3LDNA 4FXDA 4LD0A 3K5OA 3VQEA 3IUCA 5CYMA 4ELUA 2OPSA 1GLFO 4AF1A 4X65K 4MO4A 1S1VA 2DFEA 3EE9A 1VSDA 3BP8A 3O9QA 3CCVN 4JI6K 3J7AP 4Z4HA 4JHDA 1VK0A 4PWDA 2D1KA 4DU1A 3A2FA 4DV4K 1ZC6A 3BY5A 1IBMK 1LWFA 2D0BA 2YJEA 4KHSA 3DLRA 4YOXA 4YFUA 4E1MA 4B9NA 3DOKA 4LFAK 3QEIA 3G4SN 5M1QA 2O4GA 2YNGA 3N4QA 4O8UA 1R0AA 2W40A 2V52B 1K6YA 3JS6A 4E1NA 2YHAA 5LY3A 3ISNC 4CGDA 4FZYA 2V51B 2IVPA 2NRTA 3VESA 1TGOA 3EN9A 4OKEA 2KFNA 3AVBA 1WB9A 4KHQA 2RKIA 4B3SK 2HB5A 3A5MC 5CE3A 2Q31A 3ZSZA 2G8VA 4FPBA 2I7NA 3FFIA 2G8HA 3ZYYX 3OW2M 4AHRA 3ULDA 3SUPA 4HWIA 4IOCL 4EHTA 3IMXA 3LP3A 3ID8A 1FK9A 4O0IA 5LJWA 3VERA 2GWKA 3OJSA 2Z1HA 4ICLA 5J2NA 5BPLA 5AFUA 3QIPA 4CI6A 4JI0K 2HBKA 1FW6A 3OYMA 1NK9A 3O9UA 3H46O 4IDKA 3ZCMA 3KTQA 5EXWA 1NKEA 2HF3A 4WQ5C 3THYB 3SYZA 3RR8A 4OKJA 4WFAL 3NF9A 1GLBG 1NG9A 3WXJA 3ALYA 1YXQA 2QK9A 2E6LA 2P9LB 1BGXT 4F3TA 2HOEA 4AM7A 3M3ZA 4N56A 4H4MA 4FCYA 1O13A 3KK3A 2NRHA 4CFAA 4EZ9A 2KHOA 4YHHK 1ZBUA 2DPNA 3UE5A 3MWPA 3HM8A 4OLAA 4JKAA 4CJPA 4C8NA 2P9IB 1WLJA 3I55N 4J2DA 3H1VX 5GAHP 4YOTA 3V9WA 4BR0A 1VSJA 4Z4FA 3QB0A 1HKBA 2E2PA 1S1WA 3O5BA 4WFNL 4CBXA 4BREA 4CHOA 1QZ5A 3K58A 2F4VK 3MN7A 1WSEA 4JD2B 4CECA 2WBNA 4JI7K 5KQ8A 1NOYA 3QNNA 1X9SA 4IFVA 1S6PA 2E5LK 3L2QA 4CBUA 4JKEA 2CH5A 3V1RA 2O8BB 5C42A 3RWUA 3SBGA 1WSFA 1WSGA 4BR2A 3CCJN 2OZSA 3E01A 1G15A 1JXBA 4CEQA 4DFKA 1HNWK 2IAJA 4FWOA 1KFSA 1FJGK 4ZTJA 3OYLA 2HSTA 1IKWA 4DTMA 5EX5A 2ZJRL 3U8XA 4KHYA 2HHQA 5FRNA 1KTQA 2QWLA 2QKKA 4YDUA 4ELTA 3MEEA 4JKGA 1HX1A 1HJRA 3VETA 3HM9A 1QVFM 2FF6A 3HTVA 3ATUA 1NK4A 4KTQA 1QZ6A 1ASWA 2P9UB 4CESA 4BDYA 3NH0A 4CHZA 1WNSA 3O08A 1HNIA 2GUPA 3KK7A 4RTFD 3V81A 2GWJA 5AQLA 1TUYA 5KPTA 1HQUA 4ID1A 3KD5E 4BDPA 3SJJA 1ZBLA 4OO1J 1KLMA 5CZ2A 5SZTA 3ZETA 1C6VA 3VTHA 1JLCA 3WNFA 4GY2B 3MXIA 2FBXA 4WF9L 1Q9YA 1JCGA 3CI5A 2P9KB 4JK9A 1N34K 1N5YA 1GLAG 1SKSA 1D9DA 3QINA 3OYAA 3U4LA 5AQHA 1JCFA 1KD1O 2E1YA 1W97L 1HPMA 1SUQA 3CJCA 1QHTA 3O9TA 4DSIA 4IXCA 2Q36A 1D8YA 3OYCA 2O8FB 4BRQA 4DLGA 3K9KA 1U2VB 2LSNA 2YX6A 3QIOA 1SL1A 4DQIA 3VGKA 5C0YA 2XRIA 3O4WA 2QW9A 4DCHA 3HOSA 4E7IA 4BGBA 4DTPA 1HR0K 4V19S 1NGFA 2B5JA 1KAYA 5FPDA 5KRTA 1BI4B 1Z05A 2J4RA 1K73O 3LP1A 2QWQA 5HOOA 4CFDA 2HVIA 3H1QA 4FVMA 4OLBA 1FXXA 4A5BA 5B8HA 4CZKA 3QNOA 1Q81O 1EP4A 4CF9A 2H3GX 1ZYQA 3KZBA 4U67L 4GNIA 4LF9K 4FJJA 2A1RA 4H5TA 1BWFO 3LANA 3ZT1A 3K57A 3U6FA 3P38A 3CHWA 4W5RA 1XMOK 3P39A 3LP0A 4ISGA 4B8AB 5M1OA 3V9UA 4DR1K 3K5NA 4HCCA 1KVAA 3HI0A 1X1PA 1Y64A 4OGEA 3NAEA 4JS5A 4KTZA 2OTJN 3NGIA 1E4FT 1TYQA 2QA4N 3LZIA 4LF7K 1MWMA 2VWBA 4QAGA 4OGCA 1K8KB 4GV9A 2BUPA 4NCGA 4CF0A 4CHQA 1M90O 5HLFA 3LDQA 4BY9C 4LC9B 1RT3A 3GG4A 1RT5A 2E1ZA 1ATSA 1H1VA 1JL1A 3CERA 3D45A 4FJNA 1UWBA 2OZMA 1DT9A 3M8PA 4XH5A 3H08A 1NK7A 1NMDA 2HHWA 3THWB 1QE1A 1FKPA 3AO3A 4CJLA 4LFBK 1Z26A 3BF1A 3BZCA 3GBTA 4FO0A 4AHVA 1RTIA 1VQKN 3CPWM 3NVMA 4BRGA 2YHXA 4DHYA 3PIPL 3HSTB 5JLFA 3M8QA 1I39A 4FWNA 2E2QA 2FC0A 4ISFA 3LWLA 1SL2A 3BF3A 5ELZA 3EEQA 1YHQN 4PKGA 4BRCA 1WBDA 4WQ5A 2NRRA 4Z4GA 1VQLN 3DOLA 2VGMA 1HKCA 3IS9A 3ZX2A 2ZD1A 4CIGA 4HTUA 3O3FA 2P9LA 2Q3SA 2VG7A 3IFRA 3L0QA 4K42A 1L5UA 4CJSA 4GV6A 1TK0A 3NVKA 2RHKA 1T3VA 1OH6A 2QXFA 4JK7A 3ZSQA 1K9MO 1XNQK 5BR8K 4DF4A 3K2PA 5DMRA 4KI4A 4I2QA 4B9UA 3CXCM 4F3OA 4CZEA 2P9IA 3R1XA 4H0VB 3Q7BA 3RR7A 4O0JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DM6 L;  3CC7 N;  1VQ7 N;  3CCV N;  1VQ9 N;  3PIP L;  1KD1 O;  1VQ4 N;  3I55 N;  4IO9 L;  1YI2 N;  1W2B M;  3CCR N;  5GAH P;  1Q86 O;  3CME N;  1Q82 O;  3G71 N;  1YHQ N;  4WFN L;  3CCQ N;  1YJW N;  1ILY A;  3CCE N;  5GAD P;  3CCU N;  1VQL N;  3G4S N;  1VQO N;  1YJN N;  3CMA N;  1K73 O;  5DM7 L;  3CC4 N;  1VQ8 N;  1YJ9 N;  1YIJ N;  1K9M O;  3CCJ N;  1N8R O;  2OTL N;  4WCE L;  1Q81 O;  3CXC M;  2ZJP L;  4U67 L;  1KQS M;  1KC8 O;  2ZJQ L;  3I56 N;  1NJI O;  1OVY A;  4WFB L;  5GAE P;  1QVG M;  2ZJR L;  3OW2 M;  1VQ6 N;  2QEX N;  4IOC L;  3CC2 N;  1S72 N;  1QVF M;  2OTJ N;  1M1K O;  1YIT N;  4UY8 O;  5JVG L;  1VQ5 N;  2QA4 N;  3CCM N;  4IOA L;  3J7Z O;  3G6E N;  3CD6 N;  5H1S Q;  1M90 O;  5HL7 L;  5JVH L;  1VQN N;  1JJ2 M;  1VQM N;  3PIO L;  3DLL L;  3CF5 L;  4WFA L;  5GAG P;  1K8A O;  5MLC Q;  3CCL N;  1Q7Y O;  4WF9 L;  3CCS N;  1VQP N;  1VQK N;  3CPW M; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3F73 A;  1QQM A;  3HPH A;  1T44 A;  3O9S A;  3CG7 A;  4Q0B A;  1TAU A;  1TYQ B;  2ZGZ A;  5BR9 A;  5AR0 A;  2A5X A;  3KVG A;  1YVU A;  4CED A;  1RT4 A;  2UXD K;  3K0S A;  4IFY A;  3AVA A;  3VQB A;  3VF6 A;  2ATQ A;  3HVT A;  4YY3 K;  3L2V A;  4X64 K;  4KI6 A;  2HHV A;  3O1B A;  4FZX C;  4ID5 A;  5AQJ A;  2A6A A;  5AQV A;  3VQQ A;  1EQY A;  3F2K A;  2VQE K;  2GV9 A;  4Z94 A;  1TK8 A;  2OPQ A;  1ATR A;  4NXN K;  3ZSW A;  3CC4 N;  1EET A;  3PUF A;  3IRX A;  1EWQ A;  4O4G A;  4BE0 A;  2IIR A;  2OPP A;  4YOV A;  4JS4 A;  2OTL N;  4DSJ A;  4H5R A;  3TAR A;  3O1W A;  4FJ5 A;  3I0R A;  3S41 A;  4MFB A;  4DR6 K;  3AVG A;  1YF5 L;  3A5N C;  3SQ4 A;  3AA2 A;  1BA1 A;  2QKB A;  3NDK A;  1CZB A;  4DF8 A;  2CGJ A;  4Y1D A;  1RBT A;  5BRD A;  2YJF A;  5CY4 A;  1IH7 A;  4RG8 A;  4CK2 A;  3ZT0 A;  3TAB A;  2IVN A;  3TTC A;  4Y0W A;  1BIU A;  3RMD A;  2KZM A;  5JVG L;  3WUH A;  3QER A;  3A0I X;  4BRL A;  4FK0 A;  3AO4 A;  1S1T A;  2DFH A;  1RBV A;  1IG8 A;  2QTD A;  4LSL A;  4IEI A;  3TPQ A;  1N33 K;  1KLN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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