3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
5AQXA 3HI0A 5AQIA 3HBTA 2Q36A 4JHDB 4BC4A 1GLCG 3WEEA 5AZJB 1K8KB 4MO4A 2AP1A 3FZLA 1XQSC 3H3NO 4HWIA 5AQJA 1YXQA 5I9EB 4FOIA 3MN5A 2YHXA 5AFUA 3H45C 5AQOA 5KQDA 4IXCA 1D4XA 3DJCA 1MDUB 5BRHA 4H5TA 3VPZA 4A2AA 4MLHA 2IIRA 1ESVA 1NGFA 4IO8A 5KPRA 1ZC6A 5EXWA 3C7NA 4B1WB 2IVNA 3M6GA 3F9MA 3ZX0A 4JN4A 3CJCA 2BUPA 4H0PA 1S3XA 3RSEB 1KAXA 2CH5A 4BRNA 3D2FB 4RTFD 5BREA 1GLAG 2H3GX 3LDNA 2P9LA 1NGDA 5E84A 4BVOA 5JLFA 2P9KB 1C0GA 4IWVA 3QFPA 4MLEA 2P9IB 3VEWA 4PL8A 5FPDA 4CZKA 3CJBA 4WQ5A 1X3MA 4AM7A 4BQLA 3ENHA 3M1FA 1DEJA 3CJ1A 5FPEA 4J8FA 1ATNA 1BG3A 1Y64A 4CZFA 4FWMA 2P9IA 3FZFA 3SJHA 3O80A 3UKRA 1DKGD 3O1BA 2I7PA 1ZBSA 2QWOA 3QDKA 2NZTA 3SK3A 4B1ZA 4H0YB 2OANA 3DXKB 4C23A 1S22A 1BO5O 5AQTA 4BVPA 1GLFO 4FSVA 4I6MA 1P8ZA 2E1YA 5ELZA 3LDPA 5AQGA 4YDUC 1J6ZA 1LOTB 3L6QA 4H5WA 4EAHD 2E88A 1WUAA 3VEVA 2QWNA 3VOVA 2Q97A 1GLLO 1QZ5A 2V7YA 5BPMA 4H0TB 3FZKA 2P9UA 3ULEB 3U4LA 2YCHA 2ASPA 3QICA 1QZ6A 5F1XA 2I7NA 1NGHA 3JS6A 4CI6A 1KAYA 4Y0WA 3VEOA 2GELA 3UKUB 2E2PA 2GEMA 5FPMA 1TYQA 4CD3A 4BRFA 3R6MA 4A62A 3CQYA 5F2RA 2PBDA 2QWMA 3VENA 1QQNA 3VEYA 2DPNA 5AQFA 1HKGA 3ATUA 2A3ZA 3WUHA 1Z05A 3TU5A 4BR9A 4CJ7A 4CZHA 2E1ZA 2E20A 3O6WA 3JXUA 1BUPA 2F9TA 2ZGYA 4MO5A 1WOQA 1RFQA 3VF2A 4BC3A 3EKSA 4K25A 4LC9B 3ZEUB 4A61A 4BR7A 4CD1A 5BRFA 2FXUA 5LJVA 1JCFA 2HF3A 2P9PB 3A8YA 2D1KA 1SQKA 3AAQA 2D0PA 3CJ9A 3VF6A 3D2EA 5AQPA 2Q0UA 2CGLA 3AARA 3SLCA 3VEZA 4F9OA 3FE1A 1C0FA 5KQ8A 1HKBA 1SZ2A 3BP8A 3VEXA 1QQMA 3M3ZA 1NGEA 3WQTA 2Q0RA 4CZJA 3O8MA 4JHDA 5EY4A 2CH6A 4NO7A 5AQUA 5AZJA 1BA0A 1K8KA 1EQYA 2A42A 3O08A 2FF6A 5BRDA 3R9PA 3HZ6A 3UB5A 4FWPA 2BTFA 1NGJA 4A2BA 4H0VB 4CZMA 1KAZA 1ZXOA 3DWLA 4PKIA 2QXLA 2YI1A 5AZIB 4FPBA 3C0BA 3VGLA 1RDWX 3GOIA 3ZX2A 1NGBA 4WQ4C 1T6DA 2GTDA 4PKHA 2QM1A 3A5MC 1HLUA 1SAZA 4H03B 5ADXA 4PL7A 1X9JA 3LM2A 3ENOA 3A5LC 4BR2A 1YVNA 3QBWA 3H1VX 4FPAA 1HX1A 4PKGA 3RSEA 3SMPA 3WXKA 4DQ8A 4GY2B 4BRCA 3DXMB 3EKUA 1Q18A 4QS7A 3D2FA 4B1UB 3MN6A 5AQHA 4BRLA 5AQYA 3BUZB 4CBXA 1XC3A 5EVZA 3FZHA 3MCPA 4HTLA 2P9KA 1NGIA 4H5NA 3MDQA 3DXMA 4RCHA 5FPNA 2IVPA 5AQQA 4BROA 2A6AA 3I8BA 2WUSA 4CZEA 3IDHA 3QFUA 3I33A 3KZBA 1YUWA 3CETA 4FWKA 3KHYA 4ISGA 5AFUH 2UYTA 2ITMA 3FZMA 3WXIA 5AQLA 5BPLA 3L0QA 1BOTO 1XUPO 3H3OB 2FSJA 3QB0A 4BC2A 2P9SB 3FR0A 2V52B 4CZIA 2D0OA 2YHWA 3DXKA 2ZGZA 1OKJA 5AQRA 4WQ5C 3HTVA 3LL3A 1MWMA 4GNIA 4EFHA 2ZWHA 2PAVA 3OHRA 4XEIA 1NGCA 3ZX3A 2FLOA 5BR9A 3GBTA 3MMVA 5TKYA 3ULEA 4ISFA 3GDQA 1TUYA 3O1WA 5E26A 4Z94A 3FLCO 3VF4A 3CJAA 4M7XA 3CERA 2ASOA 4K43A 3A0IX 4BRGA 3ZETB 3UKUA 3U9ZA 3MK6A 1DGKN 4H0OA 4FWQA 2NRHA 4BRKA 4K41A 2CGJA 2E2QA 3LDOA 2NLXA 2P9NB 5AQMA 4AM6A 4H5RA 4BRAA 1NGAA 3IUCA 2IVOA 1V4SA 2CGKA 2ZF5O 4DHYA 4FWRA 4IJAA 3ATVA 3KVGA 2P9NA 3BF1A 4BG8A 4NB4A 2QW9A 1U2VB 1T44A 2V7ZA 3BF3A 3ID8A 2HMPA 4BRIA 3AAPA 1U6ZA 5BPNA 5KPZA 3ZEUA 1U2VA 2A41A 1HJOA 1H1VA 1JCEA 2P9PA 4BRDA 2GUPA 3WEEB 3WXLA 4IJNA 5KPTA 2AA4A 4WQ4A 3HM8A 1TUUA 2F9WA 2QWLA 3WT0A 2FF3B 4FWSA 3QMLA 4FL9A 4QS9A 3P4IA 5CE3A 4CZGA 3QBXA 3HSCA 1QQOA 1QHAA 3R8EA 3C7NB 3EO3A 5BN9A 4CBUA 5JICA 1BDGA 5JLHA 2VYPA 5AQSA 5LJWA 1GLDG 5AZIA 2Q1NA 4DCHA 2D4WA 1GLJO 3VERA 3L4IA 5EOYA 3B8AX 4BRHA 3A5NC 1E4FT 5JMVA 3DAWA 5EX5A 2P9LB 2GWKA 1YAGA 1IG8A 3H6EA 3U8XA 3G25A 2Q31A 3LDLA 4H5VA 4XH4A 2QWQA 4O5FA 4YDUA 1NMDA 1V4TA 1NGGA 1Z6RA 3GE1A 1HUXA 1IJJA 4FWOA 4JD2B 2A40A 4DB3A 2HOEA 3FGUA 4FO0A 3GL1A 4M63C 1E4GT 2YJFA 3UKRB 1NBWA 1HKCA 4B1XB 1R59O 4WYBA 5AQVA 4BR0A 3CIPA 3CQXA 4FOEA 1GLBG 4JD2A 4BREA 3W3DA 4XH5A 3UE5A 3LDQA 4M7YA 5BN8A 2E2OA 3H1QA 1KXPA 4FWNA 3SMSA 4I6MB 1BU6O 3W0LA 1NWKA 4B9QA 4KBOA 3VGMA 3U9DA 1JCGA 1T6CA 1LCUA 3CHWA 4CZLA 3EZWA 2Q2RA 3IMXA 1MA9B 4BQZA 2P9SA 3D7EO 1HPMA 5F0XA 3S41A 4XH1A 1ATRA 5ADXH 2P9UB 4BC5A 3EL2A 4RWTA 1CZAN 2V51B 3O4WA 3EN9A 1NM1A 4BG9A 4IZ9A 2YHYA 2VCPA 4E1JA 2GWJA 3BEXA 3AY9A 3MN7A 5AR0A 5AQNA 3VESA 4BRMA 1BA1A 3O5BA 4ISEA 4O8KA 1NLVA 1RGIA 5LY3A 4BR4A 1TYQB 5AQWA 3VETA 2E2NA 4CBWA 2KHOA 2FSNA 1ATSA 3LM9A 2HF4A 4FWLA 2QWRA 1G99A 4BRPA 3CJ7A 5AQKA 2FSKA 2QWPA 3MN9A 3FFKB 3J8AA 3ZETA 3VGKA 4QS8A 4EIAA 1BWFO 4B1VA 4H0XB 3GG4A 3H46O 1X3NA 3CI5A 2VWBA 4EHTA 4BGBA 1MWKA 4BRQA 4EHUA 5AQZA 3IFRA 2W40A 4JAXA 3WQUA 3WXJA 4BR5A 4JNEA 4BGAA 1GLEG 5B8HA 3TPQA 2E8AA 2A5XA 2W41A 4L3QA 3D2EB 3A5OC 2YJEA 2J4RA 4B1YB 4K42A 2EWSA 2ASMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQXA 2Q36A 3WNFA 1BQNA 3AO2A 3WEEA 4MO4A 3L2VA 4AHVA 3F5TA 4BWMA 3HRGA 4HWIA 5AQJA 5AFUA 1OVQA 1SKWA 4NLBA 4LF5K 3WNHA 4IXCA 3CYGA 4B08A 4MLHA 3HL8A 1W97L 4IO8A 4A5BA 4E7KA 2VG7A 3M6GA 3F9MA 3SZ2A 4JN4A 3V1RA 2QKKA 1NK0A 3RSEB 4J2DA 5H1SQ 1NU0A 3LP2A 3T7ZA 4FJGA 4BRNA 5HROA 4JI4K 3RMBA 4IBNA 1RTIA 4JKEA 2H3GX 1B9DA 1EKEA 3NVKA 5JLFA 4BVOA 4I7FA 4PL8A 3ZSYA 3CJBA 4WQ5A 4AM7A 4BQLA 3CJ1A 4J8FA 4Z0UA 5KRTA 3T3FA 3SUPA 1CZBA 4JKGB 3OS0A 5A2QO 4CEEA 1N33K 3O1BA 3I56N 2I7PA 3CFRA 2QWOA 4DSLA 4Q5VA 1GOAA 4CHNA 3DXKB 4C23A 1TL1A 5ELZA 1WAFA 4DQPA 5AQGA 3ENBA 1S6PA 2P5GA 4M3ZA 1WAJA 1LOTB 3L6QA 4CJPA 3TWHA 4Z4EA 3LAKA 3VOVA 5HRNA 1QZ5A 3TABA 2G8UA 3HP6A 1RDBA 3O3HA 4FLVA 5F1XA 4BE7B 1LAWA 3CF5L 2B4JA 2I7NA 4FJLA 2DTUA 4FLYA 4CI6A 4KO0A 1KAYA 1U45A 4HUGA 4B9SA 2GELA 3UKUB 2B5JA 1OH7A 3VTHA 4IG3A 3AO3A 4CJUA 2O8CA 4A62A 3CQYA 5F2RA 4E7LA 1VRUA 4JI6K 3VENA 1X9MA 1HKGA 2QEXN 3M8PA 2PZSA 2A3ZA 3DLGA 1RTHA 3DOKA 4M3WA 3KLIA 4WFAL 4RW8A 1TKXA 3JXUA 1HYZA 2HNDA 3G4SN 1ZBHA 4K25A 4KB0A 2HHIA 4GV6A 1SQKA 1VSJA 5AQPA 2CGLA 3FE1A 1HKBA 3CCEN 3L2WA 1RBTA 3VEXA 3M3ZA 1NGEA 1RDAA 4PQUA 3HOSA 3TTCA 1HYSA 4A59A 2B6AA 1QSLA 5EY4A 4KI4A 1RILA 4BE0A 5AQUA 4DV0K 3TSPA 3O08A 4DTMA 1XHZA 1P90A 3HZ6A 2VWKA 2BTFA 3RRHA 1W2BM 4H0VB 1ZXOA 3TSQA 3DWLA 3I55N 2D0AA 3AA4A 4CJWA 2YI1A 5AZIB 1SKRA 2BDPA 5J2MA 3GOIA 1NGBA 4E3SA 2GTDA 1TK0A 5CYQA 3BZKA 4CF9A 4UQGA 3S3NA 1YVNA 1EXQA 3H1VX 3QLHA 1HX1A 4PKGA 4AF1A 3K58A 1M90O 4DQ8A 4LFBK 4GY2B 3DXMB 1IBKK 2RPIA 3LZIA 5FDLA 4CBXA 5HRSA 3ZLJA 3FZHA 3MCPA 3V9SA 1NOYA 4YOXA 2YNIA 1JLAA 5LMUK 4HHTA 3THXA 1UA0A 5FPNA 1RT7A 4LSLA 5AQQA 4CF0A 4DQRA 1OVYA 3I8BA 4CZEA 4CHYA 2WBNA 3QFUA 4ID1A 2KTQA 3KZBA 3KHYA 3D0PA 1UAXA 4GV3A 2ITMA 1JLEA 1IBLK 5AQLA 5BPLA 1XUPO 3VQQA 1NK6A 3Q7BA 3TAPA 4JKDA 4FJJA 3FR0A 4XJXA 4CZIA 2YHWA 1VQLN 1OKJA 4AHSA 5JS2A 3B6OA 4EP4A 1TVRA 1N6QA 3LL3A 3PLAA 2G8FA 4YOWA 3PO5A 3SAFA 4NCAA 3OHRA 1Q8IA 3VQPA 3VQ9A 3ZX3A 4WF9L 3ZT3A 4LD0A 3GDQA 1TUYA 5E26A 4CGDA 4CJTA 4CEQA 3VQDA 1FK9A 3CJAA 4M7XA 4CCHA 1WSFA 4BRGA 3AA2A 1RTDA 3KK3A 1RNHA 2NRHA 1NK7A 2FC0A 3DLEA 3NMUA 4CHZA 3SI6A 4CJRA 3LDOA 1TKZA 4YY3K 2P9NB 1RDUA 2IOCA 4LH4A 2QTDA 4I2QA 2CGKA 4JI0K 2P5OA 1IO2A 4BG8A 4NB4A 2D5RA 1U2VB 4WE1A 4E7HA 3BF3A 2HMPA 4IOXA 3CCMN 3G0ZA 4OPKA 3SUOA 4DSKA 1L3SA 1ITGA 3WXLA 3WNGA 1E3MA 1C0UA 4HCBA 1TUUA 2X74A 3H08A 3WT0A 1S1TA 2HHVA 3NGYA 4YHHK 4QS9A 5JVHL 1VSDA 3F73A 3K57A 3KD1E 2PYLA 3HSCA 1QQOA 3R8EA 3NF8A 3S5TA 3EO3A 4LFCK 3HM9A 3CG7A 5AQSA 5M1FA 3QETA 4DCHA 4FVUA 2O8EB 3L4IA 4BRHA 4K8XA 5GIPA 2OPSA 5EX5A 2GWKA 4JI5K 1XHXA 1YAGA 3H6EA 4U67L 3KLEA 1T03A 4J2BA 4H5VA 4XH4A 3CCVN 1NMDA 5J2NA 1V4TA 1Z6RA 3EZ5A 4JI2K 1IH7A 1SL2A 3OS2A 5DM6L 4M63C 3OW2M 4FJ9A 1NBWA 3AVKA 5AQVA 3MWTA 4KPYA 3ZSRA 1GLBG 2IC3A 4E0DA 3RWUA 4B8AB 3W3DA 3H1QA 4I6MB 1BU6O 2OZSA 3TTDA 1LWCA 1HPZA 3AVIA 3VGMA 1JCGA 3V1OA 3VQBA 1FKPA 4CZLA 2HHTA 1RT3A 1MA9B 3MAQA 2P9SA 4N47A 4OPJA 4XH1A 1ATRA 3P39A 1DT9A 2P9UB 4RWTA 5CHIA 4OKKA 5KRSA 4IZ9A 4E1JA 2G8WA 1N32K 3B6PA 3MN7A 5AR0A 4CJ3A 4BDYA 3ULDA 3O5BA 4DR2K 4ISEA 1NLVA 3TR8A 4BR4A 4LF9K 4DR3K 1J5EK 2E2NA 2HBLA 5J1EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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