3TPQA

Crystal structure of wild-type mal rpel domain in complex with five g-actins
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
346
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVVGDEAQSKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/transcription
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Sensing actin dynamics: structural basis for G-actin-sensitive nuclear import of MAL
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 120
structure length 346
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tpqA03
4H0XB 2QW9A 4MO4A 1TYQA 1QQOA 4CBUA 1BOTO 2P9NA 2VWBA 2ASOA 4F9OA 1JCFA 1Z05A 1GLBG 4EHTA 1BDGA 3VF6A 5AQUA 3BEXA 3KVGA 1GLEG 4FWSA 2P9UB 3H46O 3SMSA 3WUHA 1DKGD 3DXKB 2ASMA 5LJVA 4M7XA 2PBDA 4IO8A 1TUYA 5B8HA 5EY4A 5AQSA 5FPDA 2P9UA 3LDLA 3BP8A 4BQZA 4FO0A 5AZIB 3DXKA 5EVZA 1V4SA 3IDHA 4K43A 2QXLA 1J6ZA 3L6QA 3R6MA 4MO5A 3C7NB 3QBXA 4IWVA 1QQNA 4CZMA 3HTVA 1IJJA 4BC3A 2CGLA 2QWLA 3F9MA 4QS8A 3LDNA 3ZETB 3C7NA 4CBXA 5AFUA 3FR0A 4WQ4C 1SQKA 1OKJA 2CGJA 4RCHA 4DCHA 4FWOA 5KPRA 2YJEA 3A5LC 2ASPA 3VEOA 3ZETA 5KQ8A 5AFUH 1E4GT 1WOQA 2ZGZA 3ZEUB 3I33A 5AQZA 4CD3A 4O5FA 3GE1A 4A2BA 2CH5A 1ZXOA 5BPMA 3O1WA 4FWPA 2VYPA 1Z6RA 5ADXA 5KPZA 1BG3A 1DGKN 4I6MB 4Y0WA 2GUPA 2E2PA 1NGEA 2D1KA 3CHWA 5CE3A 3MN7A 4IXCA 4KBOA 4BG8A 5KPTA 3MN6A 1NLVA 3FZHA 4BQLA 1T6CA 3MCPA 4I6MA 3EL2A 2P9LB 5ADXH 2YJFA 4JNEA 4IJNA 2QWPA 2F9TA 4CZHA 4BRHA 1XQSC 3FFKB 4FWKA 2NRHA 5BR9A 2KHOA 3CIPA 1NBWA 1NGGA 5EXWA 4H5RA 3FLCO 1HJOA 5AQRA 2GWKA 3FZFA 2H3GX 4CBWA 1BO5O 1KAZA 3D2EB 3QFPA 2Q0RA 2VCPA 4BRFA 3EKUA 3UKRB 3W0LA 1BU6O 2UYTA 3D2EA 2Q0UA 4YDUA 1KXPA 3MN9A 2QWQA 3WT0A 4BGBA 4QS9A 1XC3A 3UKRA 3BF3A 2FSKA 2P9PB 5AZJA 3FZMA 5AQNA 4BR0A 3QICA 4BRLA 5ELZA 3CJ9A 1YXQA 3A8YA 1MA9B 3O5BA 4FSVA 2HF3A 4BR9A 3QB0A 2P9PA 3O8MA 3TPQA 1X3MA 4A2AA 4CD1A 4NB4A 2GELA 1BWFO 1GLJO 4WQ5C 4NO7A 2I7NA 2OANA 4JAXA 4EHUA 3H45C 2FF6A 4IZ9A 4ISGA 3WEEA 1HUXA 2DPNA 4CZGA 3CJ1A 2ZGYA 4MLEA 3H1VX 2Q36A 5AQQA 4Z94A 1BA0A 4H5VA 5AQKA 3ULEB 3VENA 2YHYA 4M63C 3HM8A 2E8AA 1JCGA 1YUWA 3LL3A 2FSNA 4DB3A 4O8KA 2CGKA 4GNIA 1ATRA 2HMPA 2P9IB 2P9KB 3GBTA 3ULEA 2A3ZA 4BC4A 3SJHA 4WQ4A 2NLXA 3VEYA 5BRDA 3I8BA 4H0VB 4B1UB 3A0IX 4PL8A 4CZJA 1MWMA 2P9IA 2P9KA 3O80A 2D4WA 4LC9B 4BRDA 2QWOA 3UKUA 3W3DA 5FPMA 4XH5A 5FPEA 2BUPA 4H5TA 3MK6A 2YHWA 1V4TA 3QMLA 4BGAA 4BRGA 4CZFA 1X3NA 3CERA 4EIAA 4CI6A 3MDQA 1BUPA 4BC2A 1KAYA 4IJAA 4CJ7A 4H5WA 4FOEA 1WUAA 2FF3B 2Q1NA 2YHXA 3H6EA 1NGBA 3C0BA 3EKSA 3VEZA 1NGJA 4PL7A 3D2FB 3FE1A 1RDWX 2V7YA 2P9SB 4B1YB 3KZBA 2E88A 3VF4A 3LDOA 4PKHA 2AA4A 3G25A 4CZEA 5JMVA 2A41A 4WYBA 3D2FA 4H5NA 5FPNA 5JLFA 2FLOA 2P9SA 3M3ZA 1IG8A 4XH4A 4H0YB 1SAZA 3ZX0A 2D0OA 1GLFO 2Q97A 3ZX2A 3JXUA 1RGIA 4BROA 4PKGA 3WQUA 5EX5A 1T6DA 1NGDA 2YI1A 3IUCA 3BF1A 4FPBA 2W40A 4A61A 3WXKA 1S3XA 3R9PA 3H3NO 2A5XA 3QDKA 3B8AX 5AQIA 2EWSA 3GDQA 4FWNA 4BR7A 1RFQA 3DXMB 2J4RA 2QWRA 3VGKA 1HKBA 4RWTA 5AQMA 3DAWA 4GY2B 2IVNA 4H0TB 4CZLA 5BN8A 2ZWHA 4BG9A 3DXMA 1JCEA 3A5NC 3RSEB 3AAPA 4WQ5A 2ITMA 5BPNA 5AZJB 2IIRA 1U2VB 2E2NA 4FWQA 2GTDA 4BRAA 1KAXA 5AQOA 5EOYA 3M1FA 3VERA 1GLLO 1MDUB 3RSEA 1X9JA 2QWNA 5AQXA 3VF2A 2V7ZA 1GLAG 1U2VA 1Q18A 2A6AA 5AR0A 5KQDA 4DQ8A 4BC5A 2PAVA 3VESA 4K25A 3ZX3A 2I7PA 4BVPA 3IFRA 3MMVA 1EQYA 3WEEB 5BPLA 1QZ6A 3GL1A 1CZAN 1C0FA 3J8AA 3IMXA 3O6WA 3P4IA 5AQGA 5BREA 3CJBA 3HI0A 3VEWA 1ATNA 3WXLA 3AARA 3CJCA 5F2RA 4BRKA 5E26A 3O08A 3CI5A 4FWRA 4K41A 5BRHA 3CJ7A 3ID8A 2YCHA 3LM2A 4DHYA 2V52B 3ENOA 4BR5A 3CQYA 3D7EO 3UKUB 4FL9A 3EO3A 4AM7A 4BRCA 3GOIA 5LJWA 5E84A 1BA1A 1P8ZA 4JHDB 3SMPA 2F9WA 2A42A 3L4IA 3EZWA 3SLCA 3OHRA 4FOIA 1ESVA 4B9QA 4BR4A 3MN5A 1D4XA 2W41A 4JHDA 5BN9A 2E20A 4C23A 3QFUA 1HKGA 1Y64A 5LY3A 3A5OC 4EAHD 4BRPA 3A5MC 2FXUA 3M6GA 4B1VA 2QWMA 2Q31A 3HSCA 5AQHA 1QHAA 3WXIA 3VGLA 4FWMA 1R59O 3TU5A 1XUPO 4HTLA 1HLUA 2HF4A 3H3OB 2WUSA 5AZIA 1NM1A 4FPAA 3DWLA 3ENHA 5AQWA 4BVOA 3VETA 2V51B 5AQPA 2E2OA 1T44A 4EFHA 4J8FA 4XEIA 1DEJA 3SK3A 3AAQA 3LDQA 1TUUA 2GEMA 3VOVA 3LDPA 1ATSA 2CH6A 4BREA 2QM1A 4MLHA 3EN9A 4B1ZA 4BRIA 3U9DA 3UE5A 4CZKA 1SZ2A 1NGIA 4PKIA 3FZLA 2D0PA 1G99A 2AP1A 3LM9A 2GWJA 1NGAA 4H03B 4BRMA 4AM6A 1HKCA 1K8KB 4H0OA 1NWKA 3ZEUA 1E4FT 3FZKA 2E1YA 3H1QA 3GG4A 1QZ5A 3BUZB 5JICA 1ZBSA 4QS7A 3U9ZA 4A62A 4L3QA 1ZC6A 3CETA 1K8KA 4K42A 2HOEA 3O4WA 4H0PA 1U6ZA 3QBWA 5AQLA 1HPMA 1QQMA 1NGFA 3UB5A 5JLHA 3FGUA 3CQXA 4JD2B 1HX1A 5TKYA 3O1BA 5F0XA 2P9LA 2E2QA 1GLDG 5I9EB 2FSJA 4JD2A 4M7YA 4BR2A 1LOTB 2IVOA 4B1XB 1YAGA 1NGHA 3WXJA 1H1VA 3VGMA 2BTFA 4FWLA 1YVNA 1GLCG 4XH1A 5AQYA 3U4LA 5AQVA 4B1WB 5F1XA 3AY9A 2Q2RA 5AQFA 5AQJA 3S41A 3VPZA 4ISEA 4BRNA 1NGCA 4ISFA 1NMDA 3KHYA 1C0GA 3ATVA 3HBTA 4RTFD 1S22A 3WQTA 4CZIA 2A40A 3R8EA 4E1JA 4HWIA 3U8XA 1LCUA 5AQTA 2ZF5O 1MWKA 2IVPA 5BRFA 3DJCA 2NZTA 3VEVA 3JS6A 3CJAA 1TYQB 4JN4A 2P9NB 4YDUC 3ATUA 2E1ZA 4BRQA 3VEXA 3HZ6A 3L0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QW9A 5KTQA 1QQOA 2ASOA 3KJVA 4FJ8A 3THXB 3E9PA 1BDGA 4PA1A 3KVGA 4NLBA 2BE2A 3ITHA 3K59A 2IOCA 1U48A 1L5UA 3THXA 1S9EA 1UA1A 1C1CA 1VSMA 3TANA 4M7XA 5B8HA 5FPDA 2G8HA 3CD6N 4FO0A 5AZIB 4K43A 4BE1A 3V9UA 2QXLA 1WNSA 4FK4A 2DFHA 3QBXA 3VQ8A 4CZMA 1IJJA 4DUZK 1XNQK 3VQEA 3HOTA 4QS8A 1D8YA 2HHWA 1IV0A 1JLGA 1CZBA 5HP1A 2LSNA 1KVBA 3CMEN 1EETA 4DCHA 4PQUA 5KPRA 4AH9A 4RG8A 3A5LC 3VEOA 2ASPA 4I2QA 1RBTA 4WFBL 4LH4A 1WOQA 3IS9A 5AQZA 3VA3A 3GE1A 2YHAA 4A2BA 2CH5A 1FKOA 1ZXOA 3JAMO 4GVMA 3O1WA 4IOXA 3DLRA 1Z6RA 3WNEA 3WNHA 1DGKN 3QERA 4Y0WA 2GUPA 2E2PA 1NGEA 5CE3A 1HPZA 3MN7A 3VTIA 4ZTJA 5KPTA 1C1BA 1NLVA 1IG9A 4GV9A 3OJUA 3LWMA 4M41A 2HNDA 4FVMA 4OPHA 1N32K 4OPKA 1RDUA 1VQMN 4RW4A 1NBWA 3G10A 5EXWA 3CC4N 3CMAN 5AQRA 4JI3K 4FK2A 1BO5O 3D2EB 3QFPA 1XC9A 3MXIA 4BRFA 3HO1A 3UKRB 4B3OA 3HPHA 4DQPA 4QCLA 4LF9K 4CHNA 3D2EA 3M8RA 2QWQA 2F96A 3WT0A 4OO1J 1XC3A 4CK2A 3KKSA 3Q7CA 3UKRA 3SUPA 2FSKA 1K8AO 1T3VA 1WB9A 1TAUA 2KFNA 5AQNA 1Z26A 1EWRA 4YORA 2HW3A 3MECA 5M1QA 3QNNA 4Q5VA 3DLKA 2W42A 1N6QA 1BWFO 1GLJO 4NO7A 3LAMA 4EHUA 4K8XA 4ISGA 1ZBUA 3TARA 4DR7K 5AQQA 3AVLA 3OYCA 1BA0A 4H5VA 3VQPA 3ULEB 3VENA 3V4IA 4M63C 2DTUA 1NK4A 2NRWA 4O8KA 2Z1IA 2YKMA 3D45A 4GNIA 3HRGA 1ATRA 3ULEA 3RVCA 3THYB 1B92A 1JXBA 4JI1K 3SJHA 5FROA 3VEYA 3ASMA 3I8BA 4B1UB 1Y97A 4OPJA 3A0IX 1VSKA 1MWMA 4CZJA 1ASVA 1BI4A 3TSPA 1TKTA 3G0ZA 4WCEL 4CHPA 5HRPA 1RT1A 3OBYA 4BGAA 4JLHA 4JKHA 1X3NA 3CERA 2VG7A 2DFEA 3S3MA 4BC2A 3RR7A 1KAYA 5J2PA 1BIZA 4FOEA 2Q1NA 4YOUA 3MAQA 1C0UA 3EKSA 5KGWA 2ITGA 1ZBIA 2V7YA 1NJYA 1WBDA 4PKHA 3S5TA 4CZEA 2ZJRL 2A41A 4WYBA 4DV3K 1FXXA 5J2NA 5JLFA 4B9NA 4KV8A 3M3ZA 1IG8A 4WE1A 3DRRA 3ZX0A 3CQ8A 4CGJA 5M1OA 3I56N 1VQNN 2D0CA 4DV1K 1VQ7N 4CJUA 3WQUA 2Z1JA 3I0SA 4DFJA 4CHZA 3VQ4A 3WXKA 2W6KA 3RRGA 2WBNA 5H1SQ 4CHOA 2EWSA 3AVIA 5LL6Z 4DV6K 1YHQN 1TK8A 2ZJQL 4YOVA 1S1WA 4JKDA 5HRSA 3ZSVA 5BN8A 3CCRN 2ZWHA 1N5YA 3A5NC 5HROA 3SUOA 3VQCA 1RTDA 2GTDA 4A59A 4BRAA 4DV0K 4DSFA 1VSEA 4ELTA 4FZZA 5AQOA 5EU7A 3OYMA 1N8RO 4F8RA 1X9JA 3OYGA 3SBGA 5I3UA 1UA0A 1GLAG 1TL3A 3C6HA 3LZJA 2NRRA 1RBRA 4O5BA 4DQ8A 4BC5A 3VESA 4K25A 2YX6A 1REVA 4V19S 3WEEB 1BISA 3M8PA 4FLTA 5BPLA 2XY8A 1QZ6A 4HUFA 4W5NA 5AQGA 4CGDA 3CJBA 4CIEA 2VG5A 3PSFA 3HI0A 3PY8A 4KTZA 1YTUA 2HB5A 3QEXA 3O08A 1RCHA 3OS1A 3V9XA 3N4QA 4CJWA 5SZTA 4ILHA 2HBJA 3DYAA 2HNZA 3EO3A 5E84A 3SMPA 2HHSA 3L4IA 5K14A 4DV5K 1VQ4N 3NBPA 3T69A 2O8DB 3V9SA 4B9QA 4PY5A 3AA5X 3O9SA 1D4XA 4BE7B 1DTTA 1VSJA 4DG1A 2O8DA 3OYBA 1HYVA 3A5OC 1YIJN 3K57A 3SBTA 4B1VA 1I3AA 3CCQN 3HVTA 1K73O 1KC8O 2Q31A 4DSEA 5CYQA 3ZYYX 4CJ3A 4BE0A 3DLEA 3QIPA 3P31A 4FPAA 3DWLA 3ZT1A 1VSLA 4Y1DA 3VETA 1FK9A 1P90A 1T44A 4XEIA 4KHYA 5HLFA 4WFNL 1Z25A 3HT3A 4H8KA 1TKZA 1HYSA 4MLHA 4B1ZA 4Z4FA 2YHBA 1NGIA 4PKIA 3FZLA 2C1GA 2AP1A 1SL1A 2RHKA 4X66K 4BRMA 2VG6A 4JEPA 1HKCA 3ZEUA 4IO9L 2E1YA 3KWGA 1EP4A 2Y1JA 3GG4A 3U9ZA 1WSFA 3SQ0A 3AVCA 3S3OA 3HM9A 3MCAB 5JLHA 4CFDA 3FGUA 4DF8A 3U6FA 3CQXA 2OA8A 4GW6A 2UUBK 1A5XA 1HQEA 4FLUA 1HNXK 4F2SA 4Z0UA 5F0XA 2P9LA 3RWUA 4B3MK 1GLDG 5I9EB 1DTQA 3PX0A 2FSJA 3VQ7A 4CJVA 1KLNA 1VRTA 2UXBK 1Q9YA 1EX4A 1KLMA 1XHXA 3E9LA 3HPOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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