3TU5A

Actin complex with gelsolin segment 1 fused to cobl segment
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
ETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/actin-binding protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Structural States and dynamics of the d-loop in actin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3tu5A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tu5A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tu5A04
5I9EB 2ZF5O 3MN5A 1Z05A 4JN4A 5AR0A 3WXLA 4BRAA 1ZBSA 5CE3A 3RSEB 1XUPO 3LDOA 1NGJA 3QB0A 3VENA 3LDPA 3CI5A 4XH5A 3UKUB 4CJ7A 5F1XA 2CGKA 4BRQA 1S3XA 5FPEA 4K42A 4M7XA 5AQTA 1HPMA 2NRHA 3IFRA 2CGLA 5AQSA 2E2PA 4CBXA 3B8AX 2YHYA 3VEWA 2GWJA 4O8KA 3IUCA 4PKHA 5KPZA 2IVNA 1BG3A 3FZLA 2DPNA 2Q97A 3BF1A 2Q2RA 5JMVA 4FWKA 5AFUA 2FXUA 1T44A 1V4SA 4M7YA 3AY9A 3EN9A 1YVNA 1QZ6A 1GLEG 4O5FA 2W41A 1YXQA 4FSVA 1ESVA 4BR4A 4LC9B 2QWNA 3FZFA 2W40A 3VETA 4IJNA 1KAXA 3ZX2A 1NGBA 3M1FA 4WQ5A 3VF4A 2GEMA 3D2EB 4FPBA 5ADXH 4H5WA 4BG8A 3ID8A 1C0FA 3VEOA 4EAHD 4CZFA 1NMDA 1RDWX 2VCPA 5BN9A 4FL9A 1S22A 1BUPA 2BUPA 2P9NA 5AQQA 3DXKA 2GTDA 3OHRA 4B1UB 4CBWA 2HOEA 5AQHA 4FWNA 1GLAG 1RFQA 2Q0UA 4CD1A 2I7NA 3VERA 1NGDA 5BPLA 3O80A 2D4WA 2IVOA 3LDNA 1P8ZA 4WQ4A 3ZX3A 1U2VA 3A5LC 2YJEA 4IWVA 5AZIB 4BRPA 4FWPA 1LOTB 3HZ6A 5E84A 2UYTA 4CD3A 1ATNA 3H45C 3QICA 1BA1A 5BRHA 2QW9A 5JLFA 4BRKA 1NGHA 1LCUA 5EX5A 1XC3A 3O1WA 4H03B 4PKGA 3UE5A 1GLCG 1NGEA 1U2VB 3O5BA 3JXUA 5AQYA 2ASMA 5BPNA 1CZAN 3O08A 2CH5A 3DXMA 1Z6RA 3QFUA 3D2FA 4H5NA 3VGMA 4AM6A 4CZLA 5AQIA 3SLCA 2P9UA 3ENOA 1BOTO 3C0BA 5AQWA 1TUUA 5AQFA 1ZC6A 1RGIA 2BTFA 4B1YB 2CH6A 4H0XB 2CGJA 3DJCA 3ENHA 5AQZA 4BC2A 2IIRA 5AQPA 4NO7A 3DXMB 2YHXA 1DKGD 4E1JA 3D2FB 4BQZA 1QQOA 3AAPA 4BRIA 1XQSC 2AP1A 1ATSA 3FZHA 3H46O 2E1ZA 5BREA 2P9UB 5KQDA 4CZHA 1Q18A 3EKUA 4BRHA 1NM1A 4GY2B 3FZMA 2ASOA 1QHAA 3LDLA 4BRMA 1BU6O 1WOQA 5LJVA 2VWBA 1BWFO 3ATVA 4IXCA 4JNEA 3JS6A 3GBTA 3MN6A 4HTLA 3MDQA 1MDUB 3CHWA 1GLFO 3O4WA 4RCHA 2D0OA 2QWPA 3A5MC 2P9LB 3O1BA 4IZ9A 3W0LA 3D2EA 2F9WA 3H3NO 1MA9B 4BC3A 1GLLO 5AQUA 3FZKA 4BRLA 1E4FT 3U8XA 2V52B 5KPTA 4I6MB 5AQKA 5AQLA 3LM9A 4M63C 3VF2A 4BC4A 3VPZA 3L4IA 1HJOA 4H5VA 4FWOA 4BGAA 1U6ZA 5AQXA 4BROA 4BR2A 1MWMA 3BF3A 2YI1A 2ZGYA 4DB3A 4FWMA 2FF6A 1NWKA 1MWKA 3R8EA 3WXKA 3CJCA 3IMXA 4PKIA 5F0XA 5AZIA 3ATUA 3W3DA 5BRDA 1HUXA 3AARA 3WEEB 4J8FA 5KPRA 5LY3A 2NZTA 4BR0A 3R6MA 3R9PA 3QFPA 4BG9A 4JAXA 2A41A 3VEXA 3F9MA 3VEVA 2PAVA 3DWLA 5AQMA 4BRDA 3CQXA 3QMLA 1NGCA 2H3GX 3M3ZA 1BDGA 4HWIA 2E20A 1YUWA 4FWSA 4NB4A 5AFUH 5E26A 4WQ5C 5BRFA 1C0GA 3VGLA 4EHTA 3ZETA 3A5NC 1R59O 2IVPA 3O6WA 1G99A 2QXLA 3U9DA 4CZMA 5FPMA 3FFKB 3VF6A 4CZEA 3HSCA 3CJ7A 3IDHA 4FPAA 3KVGA 2QM1A 1KXPA 4A2AA 4JHDA 1NGIA 3KZBA 3FGUA 4H5TA 4KBOA 4FO0A 3SK3A 2HF4A 4BC5A 1EQYA 5EY4A 3WQUA 1GLDG 2E2NA 1QZ5A 3KHYA 4B1VA 3U4LA 2ASPA 1JCGA 3BEXA 3GE1A 3QDKA 4A62A 1X3NA 4ISGA 2P9IB 4MO5A 3GOIA 5TKYA 4BREA 1X9JA 4ISEA 3ZETB 1GLJO 1ZXOA 4B1XB 2GWKA 4BR5A 1NGFA 4B1ZA 2A42A 2P9PB 3MK6A 4ISFA 1D4XA 3H1QA 4CI6A 1QQMA 2QWQA 3TPQA 4Y0WA 3VESA 4JHDB 3UB5A 4WQ4C 3CETA 4K41A 3WQTA 4BVOA 3ZEUB 4EFHA 3VEZA 2Q1NA 2QWRA 4CZJA 2ZGZA 4A2BA 1T6CA 1TYQB 2E2QA 2P9KA 1K8KB 2V51B 2P9LA 3M6GA 4QS8A 2KHOA 2QWOA 4CZKA 3U9ZA 3WUHA 3HI0A 4L3QA 2VYPA 3ULEA 1Y64A 4BR7A 2ITMA 1J6ZA 4I6MA 3VOVA 2YCHA 3C7NB 1DEJA 1NGGA 5BN8A 2A6AA 3MCPA 5ADXA 1WUAA 1ATRA 1TUYA 2FSJA 3CIPA 2ZWHA 2P9KB 4FOIA 2FF3B 4DHYA 3A0IX 2F9TA 5AZJB 2GUPA 5AQNA 3EKSA 3ULEB 1HKCA 4BRCA 4H5RA 5ELZA 2EWSA 4RTFD 4AM7A 1YAGA 4XH1A 1DGKN 4H0VB 4MLEA 2P9SB 2Q0RA 5EXWA 2PBDA 1HX1A 2E1YA 3WEEA 3P4IA 3BUZB 3CJ1A 4YDUA 4FWRA 2AA4A 4H0YB 1BO5O 1H1VA 2GELA 3MN7A 5F2RA 3WXIA 4BR9A 4BRNA 1OKJA 1IG8A 3LDQA 3UKRA 1BA0A 2Q36A 4FOEA 5EOYA 3S41A 2E8AA 1NBWA 3A8YA 4MO4A 2QWMA 2E2OA 2QWLA 4MLHA 3CJAA 3WT0A 1SAZA 1NGAA 3GL1A 2HF3A 1KAYA 1KAZA 2OANA 5LJWA 4CZIA 1NLVA 2YJFA 4BRGA 1JCEA 3HTVA 3I8BA 4BRFA 5JICA 2FSKA 3SJHA 3UKRB 3MN9A 2A5XA 2Q31A 4XEIA 4DCHA 4BVPA 4K43A 1SZ2A 2J4RA 3I33A 4JD2A 3J8AA 4QS9A 4YDUC 2P9IA 3LM2A 1HKBA 5EVZA 4FWQA 3D7EO 2P9PA 2FSNA 4B9QA 5FPNA 4C23A 5BPMA 2V7YA 4H0TB 5JLHA 3AAQA 2NLXA 1HLUA 3O8MA 4FWLA 3BP8A 4JD2B 4K25A 4XH4A 3LL3A 3ZEUA 4GNIA 3QBXA 3CJBA 3SMSA 3WXJA 4PL7A 2D1KA 3L6QA 2P9NB 1TYQA 3HBTA 1K8KA 3DXKB 1GLBG 1JCFA 4H0PA 4IO8A 3EZWA 2V7ZA 1QQNA 3G25A 4DQ8A 2YHWA 5AQJA 4BGBA 3HM8A 5AQOA 5BR9A 3TU5A 3C7NA 3FR0A 1SQKA 5AQRA 4EHUA 4A61A 3FE1A 1IJJA 5KQ8A 4CBUA 2E88A 1HKGA 3L0QA 1V4TA 2D0PA 4H0OA 2A40A 3CERA 4IJAA 2FLOA 5AZJA 3EO3A 3GDQA 4BQLA 3CJ9A 4Z94A 3RSEA 3H1VX 5AQGA 4CZGA 5FPDA 3QBWA 3CQYA 4B1WB 3VGKA 4EIAA 2HMPA 3FLCO 3UKUA 3DAWA 3GG4A 5AQVA 5B8HA 2P9SA 2A3ZA 1T6DA 2WUSA 1E4GT 4RWTA 3ZX0A 4WYBA 4PL8A 2I7PA 3SMPA 3EL2A 3H6EA 3H3OB 4QS7A 4F9OA 3VEYA 1X3MA 3A5OC 3MMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I9EB 4R5PA 4CF9A 4W5TA 1Q7YO 4KH5A 4FJ5A 3WXLA 4BRAA 1ZBSA 2DFHA 3NF8A 1OH6A 1NGJA 4NLCA 3VTHA 1JXBA 3CCUN 3UKUB 3J80O 3O9SA 4XJXA 5F1XA 5FPEA 5AQTA 1HPMA 4BACA 3S3NA 4A5AA 3TWHA 4O8KA 3TABA 4B3SK 4FZXC 4U67L 4CF8A 5JMVA 4KREA 5KRTA 5AFUA 4JKGA 4PUOA 1Q9XA 4IKFA 4KKOA 4M7YA 4PY5A 3CFRA 1VQ4N 3AY9A 3EN9A 4PWDA 1QZ6A 2G8VA 1VQON 4FSVA 5HP1A 4GKJK 2HB5A 4LC9B 3ZSQA 2P5OA 1KAXA 3JAMO 2O8DB 1NGBA 1BHLA 1OH8A 3D2EB 5ADXH 3ZLJA 1CLQA 4H5WA 4YFUA 1KRPA 3VEOA 4EAHD 1TAQA 1NMDA 3F2KA 4IFEA 4OKJA 3N4PA 3LP1A 3D45A 4RW7A 2DTUA 3VQEA 4Y1DA 4DFMA 4FLTA 4JYAK 1C1BA 4YORA 3TTFA 3G71N 2HOEA 3KIOA 1NU0A 3OVNA 4CD1A 2I7NA 5BPLA 4CF2A 1EWQA 3LDSA 3VQBA 1RT6A 1RBTA 3B6PA 4AHUA 3KJVA 1LOTB 4JKHA 2OPSA 2HHTA 3VQAA 4CD3A 2JGUA 1YJ9N 1BA1A 1S1TA 1DT9A 2BH1A 2QW9A 1FJGK 1TL3A 1YTAA 4ILGB 2O8FB 5EX5A 3O1WA 4H03B 4DKWA 3UE5A 5GAEP 1NGEA 3JXUA 2ASMA 2KLAA 4B8CA 1OVQA 4KHSA 3CYGA 4I7FA 4CHQA 4DQIA 4H5NA 2UXCK 3EYZA 3DLBA 2HHQA 3KKRA 2HHWA 3AVHA 2P9UA 3BDPA 3C0BA 3SUOA 1TUUA 3AA4A 5FDLA 2HVHA 1CZBA 5AQFA 1ZC6A 1J5EK 4B1YB 3L3VA 2NRXA 2CH6A 4AHSA 2F7TA 2G8IA 3KK7A 2IIRA 3DXMB 3RMDA 2BANA 2GBZA 4WFNL 1DKGD 3AAPA 3MWPA 3PSFA 5BREA 3H46O 5KQDA 1VQ6N 4HHTA 3QIOA 3E1YA 5GADP 3ZT2A 1RBSA 5JS1A 2ASOA 2Z1IA 1QHAA 3L3UA 3P31A 5LJVA 2VWBA 2PZSA 3MN6A 3QETA 1N5YA 3CHWA 1S1UA 3LPUA 2GUIA 3TSQA 1QQCA 1I3AA 2P9LB 4JI8K 4CW7B 3V81A 3O3FA 1SV5A 2X78A 3H3NO 1MA9B 4BC3A 3FZKA 2O8BB 3U8XA 1EX4A 4IOAL 5AQLA 1EXQA 1XMQK 3SAFA 3OYJA 4FWOA 1U6ZA 1QSLA 2F8SA 1MWMA 5HRSA 4F2SA 4FWMA 4CEOA 4FK4A 1CXUA 2XO7A 3KLIA 5M1OA 3PY8A 3S3OA 3KD1E 1HUXA 3AARA 1VAZA 3WXMB 3HRGA 4L8RB 3AO2A 5LY3A 3THXA 3R9PA 3TARA 4KTZA 3VEXA 1HRHA 4NXMK 3DWLA 4BWJA 1JLFA 3SPZA 1LV5A 3ZCMA 4OPHA 1NGCA 3IKMA 1BDGA 4HWIA 1DTTA 1X1PA 4CJ5A 3HOSA 3NHGA 4J2EA 3T7ZA 3NVKA 1CXQA 4FJLA 1C0GA 3VGLA 4NCBA 2BGGA 3A5NC 4KRFA 1R59O 2IVPA 3O6WA 1Y97A 4CZMA 4LH4A 5FPMA 5HRPA 3FFKB 4CZEA 2XY7A 3HSCA 3IDHA 4A2AA 3FGUA 4FO0A 2HF4A 1EQYA 4WFBL 3AA5X 1FKOA 5EY4A 4CJEA 5GAHP 3K0SA 4CHPA 3F5TA 3QDKA 4ISGA 4MO5A 4BREA 3ZETB 2GWKA 4AF1A 4DU1A 3CCSN 1D4XA 3H1QA 3THWB 4KB0A 4GV9A 4JHDB 3S9HA 1KVBA 2ZJRL 4EFHA 2XY6A 3DLGA 3HSTB 3T1YK 1T6CA 1NKCA 4CEFA 2HMIA 4QS8A 3M6GA 4Z4CA 2KHOA 3O3GA 4YY3K 3CF5L 1KCFA 4CZKA 2RN2A 4O5BA 3AA2A 4FCYA 2VQEK 2HNYA 1U48A 4DV7K 1VRTA 3C7NB 3DRPA 2OPRA 4Z4GA 4I9LA 3CMEN 2A6AA 1TAUA 3MCPA 3MECA 1WUAA 2FSJA 5M1KA 4K8ZA 3MXIA 3QNNA 2P9KB 2FF3B 3AO3A 1I39A 2A1SA 2QA4N 1WBBA 2GUPA 3PO4A 1Q82O 4E3SA 5AQNA 1IH7A 4H5RA 5ELZA 4OGCA 4RTFD 4AQYK 1XMOK 2P9SB 2PBDA 4YOTA 5BR8K 4EP5A 3BUZB 3VN5A 1VQ5N 1S1WA 4H0YB 4JKFA 4FJHA 3JYTA 3K57A 3MN7A 3OYKA 4BE1A 3UKRA 2Q36A 5EOYA 1XNRK 1NKBA 3P39A 4E72A 2R7YA 4BE2A 3LANA 4JK9A 3CJAA 3GL1A 1KVCA 1KAZA 4LFBK 3MWTA 2OANA 5LJWA 4KTWA 2YJFA 4CIFA 2NUBA 1D8YA 3P5JA 1JCEA 4DS4A 3CCVN 5JICA 3H08A 3MXJA 4JKGB 3MN9A 5JVHL 4XEIA 4K43A 1NNEA 4DTXA 1RT1A 3J8AA 1IKXA 4AILC 1KFDA 4DTSA 4IFVA 1S1XA 3VQCA 2O8CA 3LM2A 4LF6K 4KO0A 3J7YP 4B3RK 4E1MA 4K0KK 2QXFA 2IS3A 3VQ8A 5FLXO 2ZQBA 4HUFA 4B9QA 4FW2A 3KTQA 3NBPA 5BPMA 1NK7A 4FLZA 4H0TB 1HYZA 2IGIA 3BP8A 1E3MA 3LL3A 3OYNA 3HP9A 4GNIA 4LSNA 3WXJA 3DM2A 2OTJN 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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