3U4LA

Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 a
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
370
structure length
353
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGDSYVGDEAQSKRGIKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 353
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u4lA03
4F9OA 3CQXA 1QZ6A 1ATSA 5AQKA 4H5WA 2V7ZA 2YHYA 2PBDA 3VPZA 2FLOA 4BGBA 2HOEA 2V51B 4FWOA 2ZGZA 3IFRA 3WXLA 2FXUA 1DKGD 1GLAG 4EIAA 3SLCA 1NLVA 1HPMA 5AQHA 1BA1A 2J4RA 2HF3A 5BPMA 2E2NA 5CE3A 2CGLA 2QWNA 2FF3B 1QHAA 2ASPA 4MLHA 3WUHA 5KQDA 1MA9B 5FPDA 2ZF5O 4XH1A 1Y64A 2ITMA 4PL8A 1SZ2A 3CJ1A 1XQSC 4CZGA 3HZ6A 2F9WA 4CZHA 3D2EA 3TPQA 4FWSA 3EO3A 2Q0RA 3CJBA 2NLXA 3KVGA 4FL9A 2YHXA 3BF1A 4WQ4C 5BPNA 3CHWA 5EY4A 4RTFD 4A2BA 4Z94A 3L4IA 3MK6A 3I33A 4BR7A 5F2RA 2E2PA 5AQPA 4CZEA 1BU6O 3FGUA 1E4GT 1NGHA 1BO5O 2AP1A 2Q1NA 3C7NA 5AQLA 2Q31A 3LM2A 3ZETA 1GLFO 4H5NA 3CETA 1WOQA 2HMPA 3D7EO 1XC3A 2YI1A 3FZHA 5EXWA 3WQUA 4E1JA 4H5VA 4H03B 2A41A 1DEJA 2I7PA 4WQ5C 4WQ4A 2VYPA 3CQYA 4AM6A 2NZTA 2D1KA 2I7NA 3KHYA 4ISFA 2IIRA 5EVZA 3MN7A 3FZFA 4IO8A 4B1UB 4CBXA 3SMSA 2IVOA 2FSJA 5BREA 2ZWHA 3EN9A 2E1YA 2P9UB 4I6MA 1MWMA 1OKJA 1GLDG 3O5BA 5AQJA 3EL2A 2BTFA 4M63C 4BRQA 2FSNA 3LDLA 3UKUB 3QB0A 4BR0A 3SMPA 1HX1A 1NGBA 3I8BA 5AR0A 4FPAA 4WQ5A 1S22A 1YUWA 3SJHA 3A0IX 3FZLA 4K43A 1NBWA 1HUXA 5AQQA 4BG8A 4BQLA 3F9MA 4JN4A 3BUZB 1U2VB 4IXCA 3A5NC 2P9NB 3RSEB 5JLHA 1MDUB 1GLEG 1GLJO 3WXKA 4M7YA 4XH5A 5KPTA 3WXJA 3DJCA 1YXQA 5AQTA 4B1XB 2YJEA 4BR9A 3MN6A 1YAGA 2A40A 1BDGA 3FZKA 4EHUA 1ATNA 4BC2A 3DWLA 3EKUA 2CH6A 4A2AA 4H0YB 3VEWA 5BRDA 4BRDA 4BRIA 2KHOA 4A61A 2GELA 3D2FB 2A5XA 3EKSA 4A62A 1K8KB 4IWVA 1YVNA 4MO5A 4JD2A 4FOIA 4O8KA 1JCGA 2QWMA 4CZFA 1EQYA 1JCEA 3VENA 1GLCG 3A8YA 3ENHA 1SAZA 3AARA 1NM1A 3H1VX 2V52B 3GG4A 3R9PA 3L0QA 4ISEA 3FZMA 3WEEA 4WYBA 3U8XA 4B9QA 5JLFA 4BREA 1K8KA 1NGDA 1BA0A 4FPBA 2VWBA 3VERA 4CZMA 2P9LA 3ZEUB 4MO4A 4CBUA 2Q36A 4IZ9A 5LJWA 3VGMA 4CZJA 3VGKA 1ATRA 2GUPA 4DHYA 3S41A 4RCHA 3JS6A 3O80A 3UE5A 5ELZA 1J6ZA 4H0XB 1ZBSA 4H0PA 5AQGA 1NGAA 3AAPA 2QWRA 3FFKB 3MDQA 1NGCA 5ADXA 1HKGA 4BRLA 3MCPA 3U9ZA 5AZIB 3IMXA 3M6GA 3VOVA 2P9PB 3U4LA 3O08A 3QICA 5I9EB 5E26A 1BWFO 2IVNA 4J8FA 4CI6A 4BRCA 4FWPA 1KAXA 3WQTA 2YJFA 4M7XA 1HJOA 1X9JA 1QQNA 2ZGYA 2E20A 4RWTA 5LY3A 5BN9A 1NGIA 4DCHA 4PKHA 1G99A 3VESA 1Z05A 3TU5A 3CJCA 1QZ5A 2CGJA 2PAVA 3H1QA 4H0TB 3O1WA 2D0PA 3O4WA 3ZX3A 3GBTA 1Q18A 4K25A 2FSKA 3QBXA 4BROA 2GWKA 1C0FA 2GEMA 2P9SB 5BPLA 4K41A 2Q2RA 5KPZA 2QW9A 2UYTA 5AQMA 3HTVA 4FWQA 5BRFA 4FWRA 2QM1A 3L6QA 1NWKA 3CERA 3QBWA 3UB5A 4O5FA 2EWSA 3FLCO 4H5TA 2P9KB 4XEIA 1LCUA 1X3MA 1KAZA 2W41A 4DQ8A 5AZJB 1BUPA 4QS7A 3J8AA 4XH4A 5AQVA 4EHTA 2E88A 3EZWA 5E84A 4BVOA 5AFUA 2DPNA 5BR9A 4KBOA 3OHRA 3VEYA 5AQWA 4BR5A 1GLBG 1RGIA 2CGKA 2P9UA 3DXMB 3LM9A 3VEZA 4B1WB 2P9IB 4B1VA 2QWQA 3UKUA 4BC4A 3BEXA 4JAXA 2GWJA 4C23A 1H1VA 2ASMA 1R59O 3UKRB 2NRHA 2Q97A 3DXKB 4H0OA 1S3XA 3LL3A 3MN9A 2Q0UA 4PKIA 3IUCA 5AQSA 4JNEA 3ZX2A 1HKCA 1HLUA 4DB3A 3GDQA 1U2VA 3A5LC 2P9NA 4HWIA 4MLEA 3RSEA 5EOYA 3VETA 3WT0A 4CD3A 3JXUA 3ULEB 3DXKA 3VEOA 1IG8A 3QFUA 4QS9A 4JHDB 1V4SA 4BRMA 3IDHA 3HM8A 4NB4A 1KAYA 1GLLO 3VF4A 5AQYA 2QWPA 1LOTB 3D2FA 4H5RA 1D4XA 4L3QA 3O1BA 4BR4A 2E2OA 3H45C 4GNIA 1Z6RA 3CJAA 3VEXA 3H46O 5TKYA 3ATVA 1E4FT 3KZBA 1QQMA 1KXPA 5LJVA 1RFQA 4YDUC 4CZIA 5FPMA 2WUSA 3D2EB 3MMVA 4B1YB 5ADXH 5BRHA 2FF6A 2YCHA 2D4WA 5JICA 4FWLA 1T44A 3ZEUA 4BRAA 3AAQA 3GE1A 2QWLA 1XUPO 5EX5A 2A42A 4FSVA 4FO0A 3W0LA 1ZC6A 1IJJA 5FPNA 3VF2A 4PL7A 3G25A 3VF6A 1X3NA 1TUUA 2A6AA 3C7NB 2V7YA 3ZX0A 1P8ZA 3ZETB 4YDUA 3MN5A 1CZAN 4CD1A 1T6DA 3BF3A 2HF4A 4BRKA 1MWKA 3WXIA 4Y0WA 1DGKN 3A5MC 3ATUA 5AZIA 2P9PA 5F0XA 4ISGA 2IVPA 3O8MA 3VGLA 3HSCA 2AA4A 3H6EA 2E2QA 5JMVA 1NGFA 3LDOA 3QFPA 1NGGA 3O6WA 1NGJA 3A5OC 1V4TA 4PKGA 4HTLA 3M1FA 3H3OB 4EFHA 1ZXOA 1TUYA 4BRFA 2BUPA 1TYQB 3H3NO 5AQRA 1JCFA 1SQKA 3GL1A 4I6MB 3U9DA 4IJAA 3HBTA 1RDWX 3CJ9A 3R8EA 4AM7A 4BRGA 4BC3A 3CJ7A 3W3DA 4K42A 5AFUH 4B1ZA 3FE1A 4BR2A 4BRHA 4CBWA 2YHWA 5AQZA 4FOEA 4BGAA 4LC9B 2P9SA 5B8HA 3VEVA 5AQOA 1TYQA 3GOIA 2H3GX 4BRPA 5FPEA 2QXLA 3LDPA 4BVPA 5BN8A 3ENOA 3CIPA 4BC5A 2P9KA 2D0OA 4IJNA 3DAWA 4BRNA 5KQ8A 5AZJA 5AQFA 3R6MA 2E1ZA 3HI0A 1NGEA 2OANA 2F9TA 1NMDA 4H0VB 4EAHD 3DXMA 3P4IA 5AQNA 4FWMA 1BOTO 1C0GA 2P9IA 4FWNA 1QQOA 1HKBA 3M3ZA 2ASOA 3C0BA 3QMLA 4CZKA 1BG3A 3LDQA 4BQZA 4CZLA 1T6CA 3CI5A 5AQUA 4JD2B 2W40A 3UKRA 3SK3A 1U6ZA 4BG9A 2QWOA 4FWKA 2VCPA 1ESVA 3FR0A 4NO7A 5KPRA 3QDKA 2E8AA 2CH5A 4GY2B 4QS8A 3AY9A 5F1XA 3WEEB 3ID8A 4CJ7A 3B8AX 3BP8A 5AQXA 3ULEA 2GTDA 3LDNA 1WUAA 2P9LB 5AQIA 2A3ZA 4JHDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CQXA 1BI4B 1ATSA 4H8KA 3LP0A 3T19A 4UQGA 4ZHRA 2G8KA 2ZGZA 4IOXA 5HRNA 2HVHA 1ASUA 3WNHA 1ZYQA 2Y1IA 3TTCA 4AHUA 1NLVA 1BGXT 1RNHA 3LDSA 5D3GA 2QWNA 1QHAA 1S9GA 3WUHA 4I9QA 4H4MA 4FJ9A 3TSPA 1MA9B 5DK5A 5K14A 4CERA 1NK6A 1SZ2A 1UWBA 4CZGA 3KLGA 3D2EA 3KK1A 3C94A 3CJBA 4FVMA 3BF1A 4YOUA 4CIFA 1BHLA 1T8EA 3V4IA 3HL8A 4WFAL 1TGOA 1E4GT 1NGHA 2Q1NA 2ZJRL 3T69A 1WOQA 2HHXA 2QI2A 4CHQA 2HHHK 4CEFA 4NLCA 4FZZA 1NK9A 1BQMA 1KFDA 2I7PA 4BDYA 4DSFA 4BE7B 2HHIA 1VSDA 4CESA 3EY1A 3KHYA 3OYAA 1YJNN 2ZM6K 3MN7A 3FZFA 4IO8A 4CBXA 4NCBA 2HBLA 3VQBA 1GLDG 3WNFA 2HW3A 5AQJA 3T1YK 4BRQA 4K8XA 4O5BA 1L5UA 4I2PA 3SMPA 1VQ9N 1HX1A 3S5TA 3OVNA 4B9TA 3SJHA 4LF6K 2UUBK 3A0IX 3FZLA 4KAZA 3AO4A 1NBWA 4BQLA 1NKCA 3TI0A 1XWLA 5M1OA 2G8UA 3F9MA 3BUZB 3HP6A 3A5NC 3HPOA 4ZTJA 1Q8IA 4NLBA 3WXKA 4M7YA 5KPTA 3DMJA 3OYDA 2JWKA 4DV7K 1JXEA 3C95A 1XNRK 4X66K 3RR7A 1ATNA 3EKUA 4DLEA 3CM6A 4AILC 3VEWA 1VSFA 4BRDA 4J2DA 3SQ2A 4A61A 2ZJQL 2WC9A 5IT9O 1QSYA 2OPRA 1YVNA 3AGKA 4JD2A 2QTDA 4FJ8A 1KFSA 2QWMA 4CZFA 4HVJA 5JVHL 3ZT2A 3A8YA 2VGMA 3TAGA 1SAZA 4KHPK 3AARA 1NM1A 4DS4A 3LP2A 3F2KA 2PYJA 1W9HA 1RT2A 5M1QA 1OVYA 3U8XA 4C8LA 3QESA 4CHOA 3KK2A 4BREA 1QVGM 1DT9A 4OGCA 1TV6A 1BQNA 4X65K 2HHSA 2VG6A 2FBVA 4LF5K 2IGIA 4CZMA 1NJIO 4DR7K 2P9LA 1N6QA 5FDLA 2Q36A 3CCRN 5LJWA 2KFNA 1UA0A 3VGMA 4YY3K 3CC2N 2GX9A 3O9SA 4IG0A 4DHYA 1S6QA 5ELZA 1J6ZA 4Z4IA 3NGZA 2B4JA 1NGAA 2RHKA 4YOWA 3V6DA 3FFKB 5HOOA 1HKGA 3MCPA 3U4LA 4PWDA 5I9EB 1LWFA 4FJIA 1XMOK 3OW2M 4CI6A 3WQTA 1HNXK 4OO1J 2YJFA 5GINA 3OS0A 4DTRA 3OS2A 1LAWA 2W42A 2ZGYA 3G71N 1O13A 2AJQA 4DTXA 4KRFA 4PKHA 1G99A 4C8KA 3KLIA 3CXCM 1QZ5A 2CGJA 1WAJA 4H0TB 3O1WA 2HNZA 2D0PA 1Q18A 2QKBA 4CJFA 4B9VA 2IOCA 3AO2A 4BROA 1EO1A 3HT3A 4K41A 5BR8K 2UYTA 2VQFK 3V9UA 5BRFA 3E9OA 3LANA 5GIOA 3LALA 1REVA 1KC8O 4FWRA 3CERA 3QBWA 3UB5A 3J7YP 4O5FA 5M1PA 3FLCO 4H5TA 1RCHA 3LP3A 1KAZA 5EU7A 4B8AB 3HXMA 5E84A 4KBOA 2G8VA 3VEYA 3TSQA 5AQWA 4BR5A 4IEIA 4OPJA 1GLBG 3F5TA 4DTNA 2HNDA 3DLHA 3O3FA 5KGWA 4CJ4A 4E7IA 3CPWM 2JGUA 3BEXA 4BC4A 4CFDA 1Y97A 2ASMA 4OLBA 4AHTA 2W6LA 1S3XA 4OKEA 2KFZA 3NGIA 2QEXN 4FLYA 5C24A 4FYDA 1C1CA 2HNYA 4O8UA 4WE1A 5J1EA 3CPEA 3S3OA 4JK7A 2JWLA 1RDAA 1P90A 1GOBA 3ULEB 1VQNN 1KVCA 2HHUA 3VEOA 1KVBA 5LMUK 1IKXA 4IFVA 3HM8A 4J2BA 1KAYA 1IKVA 3QIOA 4Y1DA 2UXBK 3E9PA 4KKOA 3K5MA 4H5RA 4O4GA 1N36K 3H45C 4GNIA 3OYMA 4PQUA 3AA2A 1Z6RA 5GIPA 5C2FA 3CJAA 3ZSWA 1JL2A 4GW6A 4DR5K 2O8EB 4J2AA 3AVBA 5KGXA 2D5RA 3MXJA 4M3XA 4DR2K 3CYMA 4YDUC 2NRVA 1C0MA 2KW4A 2E4LA 3CF5L 3SV4A 5BRHA 4DV2K 3MX5A 5JICA 4HUFA 4JK8A 3NDKA 4HCCA 3K58A 4E7JA 3AAQA 4JRPA 1VQPN 1N34K 4IO9L 5HROA 1S1UA 3RVCA 1KSPA 3G25A 4DR4K 4W5TA 1P8ZA 3ZETB 4CD1A 4DG1A 4CCHA 5KI6A 3ZSOA 4BRKA 4G9ZA 1MWKA 3WXIA 4LF4K 2GUIA 1YIJN 2IVPA 1SKSA 1EP4A 2YNFA 2XHBA 2A1SA 2QA4N 3THYB 1NGJA 3H3OB 3LAKA 3OYFA 4JKCA 4CJVA 4CEQA 4BRFA 3AVKA 3GL1A 4I6MB 4OPKA 4IFYA 3EE8A 3HBTA 3LAMA 1RDWX 3CJ9A 1ZBIA 1IBMK 4QCLA 4ILHA 4BC3A 3W3DA 1M90O 1T3VA 4H4OA 4DF4A 2F8SA 2YNIA 5AQZA 4F8RA 1TAUA 4C8NA 5C12A 2HHVA 2VWKA 4KHYA 4DR6K 3LDPA 1I94K 3C6AA 3F73A 1RTJA 4BC5A 4DFJA 1J53A 4CFCA 3DAWA 3A2FA 2LSNA 3VTHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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