3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
5JLFA 2E2QA 4A2AA 4B1YB 3WQUA 4B1UB 4CZGA 4B1ZA 3BEXA 4H0YB 3AAPA 3FZFA 5FPDA 3TPQA 3ZEUA 4BQLA 5AZIA 4RTFD 1E4GT 2QWQA 3H1QA 4BC3A 5KQDA 3M6GA 5AQLA 4CD1A 5ELZA 4HWIA 2QWNA 4XEIA 4WQ4A 3ZX3A 3WXIA 5TKYA 3VPZA 4RWTA 3QDKA 5F0XA 2QWMA 5BN9A 4ISGA 2F9WA 3CJBA 4BG8A 4CBUA 5AQFA 1QZ6A 2CH6A 2P9LA 3UKUB 4IO8A 1QQOA 2V52B 3CJAA 3VENA 5BREA 5FPNA 4DB3A 3R9PA 2DPNA 3EL2A 4DHYA 4BRNA 4H0XB 2PAVA 2FXUA 3H46O 1Q18A 3MN5A 4O5FA 4KBOA 4H0VB 1G99A 1ATRA 2YI1A 3VEWA 4BR4A 4XH1A 3FE1A 1SQKA 4LC9B 2E1YA 3IDHA 4CD3A 1TYQA 3VESA 3BF3A 1XQSC 3D2EA 3MDQA 1RDWX 2ITMA 5EXWA 2FLOA 3R6MA 5AQHA 2GELA 3WEEA 3EZWA 3DXMB 1HKCA 3CHWA 1R59O 1DGKN 4BRAA 4H5VA 3FZHA 1GLAG 3W3DA 5AQYA 1NGJA 4AM6A 4BG9A 3WT0A 2Q31A 4NB4A 3U8XA 2A3ZA 3IUCA 1NGCA 4BRDA 1ESVA 2NZTA 2CGJA 3VEOA 1KAXA 5AFUA 4H0TB 2CGKA 2Q97A 3EN9A 1NBWA 2ZF5O 4FWQA 1HUXA 3GG4A 1SZ2A 2YHWA 2P9PB 4EAHD 2Q0UA 3QFUA 4K43A 4GY2B 4FOEA 1MDUB 3IMXA 4CZFA 5AZJB 3SMPA 5BRHA 3G25A 4RCHA 3JS6A 4BGBA 4I6MA 2QWRA 1BO5O 3KHYA 3EKUA 4A61A 1YAGA 4HTLA 1QZ5A 1V4TA 1KAZA 3D2FA 5AQTA 1IJJA 1QQNA 3BUZB 1XC3A 3F9MA 3A8YA 2HMPA 4PKHA 3RSEB 3L4IA 2A6AA 5AQSA 1GLJO 3WQTA 1NGAA 1HLUA 1T44A 3BP8A 3CJ7A 1NGHA 3KZBA 4FWKA 3SMSA 4FWLA 3VOVA 3DXKB 4EFHA 3FFKB 2PBDA 1YXQA 5EOYA 5BPLA 2ASMA 3O08A 3VGLA 2AP1A 5KPTA 3WXJA 2IVOA 2VWBA 3D7EO 3QFPA 5EX5A 2D1KA 3DWLA 3SLCA 1KXPA 5KPRA 4FPAA 1BOTO 4MO5A 1T6DA 4BGAA 5AR0A 5F2RA 2HF3A 3A5MC 2W40A 3L6QA 4IWVA 3MCPA 3VGKA 4BR9A 4CZKA 4BRFA 4IJAA 4YDUC 2E2NA 2BTFA 3UKUA 5BPNA 4IZ9A 3VEYA 3VETA 3ZETB 3A5OC 1HKBA 2W41A 1NGFA 3MN9A 3R8EA 5KQ8A 2NRHA 4MLHA 3EO3A 3GE1A 1X9JA 1CZAN 2WUSA 4BRQA 1ZBSA 3S41A 4JAXA 4M63C 4JHDB 5BPMA 2YCHA 3ULEB 4M7YA 4H03B 4PL7A 4H5NA 4ISEA 3DXMA 4QS9A 3M1FA 3QMLA 2OANA 1MWKA 2Q2RA 4FWPA 3QB0A 1GLEG 2HF4A 4K25A 2ASOA 1HX1A 5KPZA 1Z05A 1Z6RA 5BN8A 4ISFA 2P9KA 4YDUA 2P9SB 5EY4A 2D0OA 3ENHA 1GLDG 4QS7A 5E84A 3CQYA 3ZEUB 2P9UA 2V7ZA 3ID8A 1GLCG 3AAQA 3DAWA 2A42A 5ADXH 2P9NA 4H5TA 1GLFO 3VEXA 2GWJA 3H3OB 4B1VA 3TU5A 3VEVA 4JD2A 4AM7A 4C23A 1C0FA 3ATVA 1BUPA 1GLLO 3CQXA 2P9PA 5AQPA 4BRGA 3HM8A 3VERA 1LOTB 3UKRA 5LJVA 2P9LB 3FZMA 3HZ6A 2FF6A 2CGLA 3JXUA 4L3QA 1C0GA 3KVGA 2F9TA 3QBWA 4O8KA 5AQNA 2E1ZA 4FWRA 1U2VB 2E20A 4BVPA 2VYPA 2ASPA 3VGMA 5BRFA 3O80A 2YJFA 3CIPA 1P8ZA 1TYQB 4BRCA 4CI6A 1BWFO 5AQMA 2IVNA 4H5WA 3LDLA 1YUWA 1HJOA 3CJ1A 3ATUA 3H45C 1TUYA 4B1WB 4Y0WA 2QWOA 1NGIA 3QBXA 3O5BA 4BROA 3CJ9A 4MO4A 4CJ7A 3LL3A 1ZXOA 4F9OA 5ADXA 1MA9B 3L0QA 1YVNA 4BC4A 2QM1A 4BRHA 2GUPA 4A2BA 2ZGYA 4WYBA 4XH4A 1BG3A 1S3XA 1J6ZA 3LDPA 3UE5A 4CZIA 1NGDA 1T6CA 4H5RA 1IG8A 4BVOA 1MWMA 3GOIA 1K8KB 3O4WA 1LCUA 3H1VX 3FGUA 4BRPA 1EQYA 4NO7A 3I8BA 1NGBA 3CERA 2E2OA 3MN7A 4CZEA 2Q1NA 3DJCA 4PL8A 4BR2A 3C7NB 2E8AA 4FWSA 3AY9A 1NGGA 2E88A 1HPMA 4GNIA 3D2FB 3VF4A 1NGEA 1D4XA 1RGIA 4DCHA 1JCEA 3QICA 4BRIA 3LDNA 4EIAA 3B8AX 1ZC6A 1BU6O 4FSVA 4FPBA 2Q36A 3FZKA 4H0OA 2VCPA 2P9SA 4IXCA 3SK3A 2GEMA 4FWOA 4JNEA 3U4LA 5BR9A 1S22A 2P9IB 4FO0A 3CJCA 2IIRA 5AQIA 1U6ZA 2A40A 5AQOA 1X3MA 2HOEA 3H6EA 4BQZA 3HBTA 1SAZA 4CZLA 4WQ5C 1RFQA 2AA4A 3LM9A 5AQXA 4E1JA 3GBTA 1E4FT 3A5NC 2BUPA 2D4WA 5AQWA 2YJEA 5AFUH 4CZMA 5AZIB 3FR0A 3SJHA 3WXKA 3VEZA 3I33A 3BF1A 5LY3A 5AQQA 4A62A 4EHTA 3OHRA 3O8MA 5LJWA 4FWNA 4B1XB 1U2VA 3HTVA 2E2PA 4XH5A 5EVZA 3M3ZA 4BREA 3ENOA 2QWLA 3O1BA 2GTDA 1NM1A 5AQZA 3ZX2A 3LDQA 2FSJA 3CETA 2V51B 2A5XA 1DKGD 5FPMA 4CZHA 5AQUA 1OKJA 5AZJA 4FL9A 3WUHA 4EHUA 3U9DA 4WQ5A 1V4SA 1NMDA 3VF2A 1WOQA 3ZX0A 5E26A 5AQGA 2Q0RA 3RSEA 2P9KB 1NWKA 2QWPA 3AARA 4BRLA 5F1XA 3D2EB 1XUPO 3IFRA 2P9UB 1DEJA 4K41A 3WEEB 4BRMA 3DXKA 4FWMA 2P9NB 4BRKA 3FLCO 3O1WA 2QXLA 4IJNA 4JD2B 1K8KA 2J4RA 2A41A 3P4IA 2ZWHA 4H0PA 3LM2A 3FZLA 2UYTA 2CH5A 4BR0A 4M7XA 2QW9A 3UKRB 1NLVA 5AQKA 1BA1A 3HI0A 5AQRA 5AQJA 5B8HA 3C0BA 2FF3B 1JCFA 4CBWA 5FPEA 3C7NA 1KAYA 4PKGA 1ATSA 3WXLA 2D0PA 4PKIA 3O6WA 4DQ8A 4B9QA 3W0LA 3J8AA 2FSKA 1TUUA 4MLEA 2IVPA 4K42A 3EKSA 2V7YA 4JN4A 4J8FA 4FOIA 4BC5A 2YHYA 3HSCA 5JICA 3ZETA 1ATNA 3GL1A 2FSNA 3VF6A 2KHOA 3A0IX 4CZJA 1JCGA 3MMVA 3GDQA 3H3NO 3MN6A 3U9ZA 5JMVA 4Z94A 4WQ4C 4I6MB 4BC2A 5I9EB 2NLXA 4BR5A 5JLHA 4CBXA 2EWSA 4JHDA 1X3NA 5CE3A 1BA0A 4QS8A 3ULEA 1H1VA 2ZGZA 1QQMA 1QHAA 3CI5A 2I7NA 2P9IA 2YHXA 5AQVA 2I7PA 4BR7A 3LDOA 2H3GX 1Y64A 1WUAA 3A5LC 3MK6A 1HKGA 5BRDA 1BDGA 1GLBG 3UB5A 2GWKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3L2WA 2E2QA 4A2AA 3BDPA 4B1YB 1WSIA 3WQUA 1VQ8N 4W5TA 2Y1JA 1QHTA 1YF5L 2D0AA 3BEXA 4H0YB 3KKRA 4J2AA 4KRFA 3OYBA 2RN2A 2QWQA 1NJXA 4IOAL 3H1QA 5KQDA 5AQLA 3QEWA 4Z4HA 2QWNA 3ZSVA 3QO9A 5C15A 3ZX3A 3LPTA 3WXIA 3THYA 4DR7K 2YV0X 3ZT1A 1LAVA 5BN9A 1RBUA 2OCEA 1HJRA 5CZ2A 5GIOA 1BQMA 2QXFA 4PUOA 4DQRA 3UKUB 2GBZA 4FLYA 3SI6A 2G8IA 2YHBA 4FLUA 5FPNA 4B8CA 4BRNA 4KKOA 4JI2K 1LW0A 4H0VB 3VEWA 4XH1A 1BGXT 4CJTA 4BWJA 4B08A 4LC9B 3S5TA 1C1BA 1TYQA 3BF3A 3SV4A 1XQSC 3TAPA 1RDWX 2XRIA 4A57A 1U47A 5EXWA 4F2RA 4CEOA 1QS4A 3EZWA 4WE1A 1HKCA 1QQCA 1DGKN 3FZHA 4JI3K 3F2KA 3WT0A 4NLCA 3BGRA 1C6VA 3U8XA 3T1YK 3IUCA 1WNSA 1Q86O 4WFBL 2NZTA 2CGJA 3LP1A 5AFUA 2JWLA 4Z4EA 1XHZA 1JXBA 1YJWN 3BZCA 3DRPA 4Z4GA 4EAHD 2PYJA 2YKNA 3QFUA 4DR4K 1T03A 3LDSA 3VTIA 4BDPA 3SMPA 3SUOA 1NJWA 4BGBA 3WNEA 3EKUA 2BGGA 3ISNC 4B3SK 4HTLA 1QZ5A 1KAZA 4E72A 2O8CA 4KHYA 4PKHA 3AVFA 1HQUA 1U48A 1FJGK 3P39A 3ZYYX 1NK6A 1EO1A 1HLUA 2NRZA 4CEFA 3RMCA 2NRRA 3CF5L 1TKDA 2KKZA 1T7PA 5EOYA 3RWUA 5BPLA 4CK1A 1J53A 4NCAA 4CJPA 2AP1A 4UQGA 2FBXA 1KVBA 4E3SA 3P31A 4HVJA 2VWBA 4ILHA 5EX5A 2D1KA 1FXXA 5KPRA 4JKGA 2OTJN 4FPAA 1BOTO 3MEGA 3HSTB 4CF0A 1KLMA 1VSEA 2YNGA 4MO5A 2Z1JA 1OH6A 2HMIA 4BGAA 4IEEA 3KLFA 3S9HA 3M5RA 4BRFA 3U3GA 1ILYA 3S3NA 4DLEA 4KAZA 4DSLA 4IZ9A 1IG9A 3SUNA 3VEYA 3VETA 3ZETB 4DU1A 2UXDK 3D45A 1N32K 1NGFA 1RILA 2NRHA 4MLHA 3EO3A 4LFBK 5TKWA 4I9QA 4DR2K 4HHTA 1X9JA 1TVRA 5JS2A 4F8RA 4BRQA 3S41A 2F7TA 4JAXA 1IKWA 4ELTA 4JHDB 5BPMA 2YCHA 3CCVN 3QESA 1UA0A 4FZZA 3DXMA 4QS9A 4N41A 1MWKA 5FDLA 4FWPA 3QB0A 1S1TA 3TR8A 1GLEG 2HF4A 3DLEA 3F5TA 4ID1A 3L2QA 1Z05A 4B8AB 1QTMA 1U04A 4YDUA 5E84A 2VG5A 4C8MA 2V7ZA 4FVUA 4F4KA 3WXMB 2GWJA 3THYB 4OLAA 4FJ7A 4J2BA 2QI2A 2P9PA 2NRTA 3K58A 2DY4A 3HM8A 3G6EN 4JK8A 3AVKA 3UKRA 3HZ6A 3AA3A 1JLEA 1RCHA 4L3QA 3DYAA 1XNRK 3O9RA 1C0GA 4FJ5A 3KVGA 4JS5A 3V1QA 1RDCA 5FROA 4DUYK 2E1ZA 2Z1GA 1NKCA 4X65K 1HYZA 3VGMA 4FM2A 3ZSZA 1TYQB 4DR6K 1HQEA 4KHUA 1QSSA 4H5WA 3PO4A 1TAQA 4W5NA 3CJ1A 4H4MA 3ATUA 1TUYA 4R79A 3VTHA 4X66K 3NH2A 1RT1A 4E89A 4CJ7A 3MEEA 4LH4A 4PWDA 4CJ3A 1L3TA 3THXB 3CC2N 1L3SA 4BC4A 2WFBA 3T1AA 1QVFM 4JS4A 1N6QA 3AO4A 4BRHA 2B6AA 4FJLA 2F8SA 3Q7BA 2OPPA 5J2QA 4LF5K 1S3XA 1WLJA 4ID5A 4CZIA 3OYAA 5MLCQ 1NGDA 2RE2A 3E1YA 1IG8A 3OYFA 2O8BA 1JLCA 3VQQA 5FRMA 3FGUA 4BRPA 4NO7A 5LMNK 1NGBA 3CERA 3SNNA 4CJEA 1NK9A 1OH5A 2OZSA 3AY9A 1NJYA 1ZBIA 1NGGA 1D5AA 3VQAA 1HPMA 2HHTA 4GNIA 3K59A 1NNEA 3VF4A 1NGEA 4Q0BA 3HOSA 2O8CB 3V9WA 4DTOA 1JCEA 1RDDA 4BRIA 3LDNA 1SKRA 4EIAA 1ZC6A 2LSNA 1JL2A 4FPBA 3FZKA 4OPJA 3P38A 4E1NA 4YHHK 3NH0A 2DFHA 2VCPA 3OYIA 2RHKA 4FVMA 4IXCA 3OYJA 3RMAA 4JNEA 4O4GA 4IG0A 2O8DB 1O1WA 4FO0A 3CJCA 4DS4A 2DTUA 3G71N 5AQIA 3NF8A 4A5BA 3PX6A 4JKGB 3D6RA 1W97L 1TL1A 3NCIA 3LM9A 4QOZB 2HBMA 5AQXA 3AVAA 3GBTA 1E4FT 1M90O 2D4WA 3U6FA 3CXCM 4CZMA 4GV9A 4M42A 4LF7K 1KSPA 3OYCA 3VEZA 4C1NK 5AQQA 4A62A 1VSMA 3O8MA 5LJWA 4FYDA 4FWNA 3OYLA 4B1XB 1Q81O 2QA4N 3M3ZA 4BREA 4HUFA 3ZX2A 5CZ1A 3TARA 1HNVA 4DTNA 2A5XA 3TSQA 4CHYA 4FLXA 1HNIA 5AZJA 3IKMA 3QEXA 4KB1A 4L8RB 3WUHA 4EHUA 3SAHA 3TABA 4NXNK 4NYFA 1BCMA 3L4QA 3CMAN 4FM0A 4M3ZA 5E26A 3RSEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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