3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
3U8XA 4BC4A 5F2RA 3W3DA 2BTFA 2GELA 2P9SB 3GOIA 5F0XA 4HWIA 3VOVA 3D2FA 1C0GA 3QFPA 4K41A 3CERA 2YHXA 4FSVA 1RDWX 4A2AA 4JN4A 4JHDA 1HPMA 1GLCG 2FF6A 3BEXA 3JS6A 2FSNA 3UB5A 2NZTA 4FOEA 4J8FA 4A62A 3UKUA 3ENOA 2P9IB 3WEEA 5TKYA 4L3QA 2HMPA 4B9QA 1GLEG 3HZ6A 3WQTA 4YDUC 4BRMA 3C7NA 3CHWA 1KAXA 3CI5A 3FLCO 3EZWA 3ZEUA 2F9TA 3U4LA 5FPEA 2NRHA 5FPNA 3F9MA 1NGIA 4FWOA 4H0PA 2KHOA 3D7EO 4BRGA 1QHAA 4B1ZA 3LL3A 5ADXA 3W0LA 4CZMA 4JD2A 4CZGA 5AQHA 2GEMA 4MLHA 4I6MA 5KPTA 1ESVA 1NBWA 3DXMB 3C0BA 5AQQA 1U2VA 3DXKA 5AQOA 3M3ZA 4BRQA 3ZX3A 2A40A 5AQTA 4B1UB 5KPRA 2QWNA 2CH5A 5AR0A 1RGIA 3FZKA 1BU6O 1E4FT 1T44A 4CD1A 5EVZA 1KAZA 3U9ZA 1WOQA 4H03B 5AQZA 2V7YA 3SMPA 3MN7A 2PBDA 2A6AA 1S3XA 3VPZA 4CZKA 3ZETB 3VESA 1ZXOA 2P9LA 3GE1A 3ID8A 4YDUA 5JLHA 1BWFO 2E2PA 3A5LC 3ENHA 4ISFA 1GLJO 2IIRA 3AAPA 2W40A 3J8AA 5AZIB 4K43A 3D2EA 5BN8A 1X9JA 2E1ZA 2AP1A 4FWNA 2E20A 1GLAG 1NGAA 4FO0A 1U6ZA 3HSCA 3SLCA 5AQXA 2V51B 3A5MC 4XEIA 3FR0A 2HF3A 5EXWA 2GWKA 2VCPA 3A8YA 4JAXA 4M7XA 3MN6A 2Q36A 3UE5A 1J6ZA 3CJ9A 3LM9A 5ELZA 5AQMA 5AQSA 2P9NB 2V7ZA 1T6DA 1S22A 4MLEA 4NB4A 1TYQB 2IVPA 1C0FA 2ZWHA 3EKUA 2QM1A 1NGBA 1MWKA 1NMDA 1XUPO 3MN9A 3A5NC 4BGAA 4PL7A 1XC3A 3KHYA 4WYBA 3KZBA 4FWQA 4H0TB 3WXIA 5BPNA 2E8AA 2WUSA 3H6EA 3P4IA 1JCEA 1NWKA 1P8ZA 3R9PA 5BPMA 4BR4A 4WQ5C 3QBXA 1TUYA 3H3OB 3L4IA 4BC2A 4BRIA 3HI0A 1QZ5A 1HJOA 1KAYA 4A2BA 4B1VA 2FSJA 4BRCA 3WEEB 1BDGA 5EOYA 5AZJA 1SAZA 2YCHA 1ATSA 3H46O 2A42A 3ZX2A 3BP8A 4H0XB 3C7NB 4CD3A 4DCHA 3VF2A 4BVOA 3ZEUB 3QDKA 5LJWA 4CZFA 3VEWA 5F1XA 1XQSC 2D1KA 4AM6A 1OKJA 1R59O 4JD2B 5AQFA 1GLDG 3AARA 5KQDA 3VGMA 4EHTA 4FWKA 3FZHA 3IUCA 1U2VB 3DXKB 1NM1A 1ZC6A 2P9KA 4EAHD 1QQMA 3QBWA 4CBUA 4WQ4A 1ATNA 3KVGA 5E26A 4O8KA 2QWOA 4FWRA 3EO3A 1Y64A 5FPMA 4EHUA 2Q31A 4BRHA 5JMVA 4BG8A 3AY9A 4WQ5A 4H0YB 3EN9A 2CGKA 3O1BA 3ULEA 1WUAA 4K42A 5BRHA 3MMVA 3VEZA 3FGUA 2FF3B 4B1YB 2P9LB 2ZF5O 3HBTA 5AQWA 3QFUA 4ISEA 1IJJA 3MK6A 5BPLA 3IFRA 3LDPA 1MWMA 4CZLA 3D2EB 4EIAA 3MDQA 3GL1A 2HOEA 2YJFA 5JLFA 3CQXA 2IVNA 5BN9A 3TU5A 2F9WA 5AQNA 3VENA 3O5BA 1BUPA 1NGCA 1NGHA 5AQJA 2P9IA 4M63C 3WQUA 2GTDA 1LOTB 3A0IX 4BRPA 3GBTA 3ATUA 1NGEA 1JCGA 2Q0UA 3IDHA 2UYTA 3VEVA 1DEJA 4PKIA 2DPNA 3MN5A 2Q97A 3HTVA 3LDQA 4CZEA 1V4SA 3FZFA 4FWMA 2OANA 4BRDA 2VWBA 4FPBA 4FPAA 4H5WA 1NLVA 3EKSA 4B1XB 4FL9A 4CBWA 3S41A 3RSEB 2A5XA 2E2OA 3L6QA 3UKRA 2Q1NA 2FSKA 1Z05A 1QQOA 5AQLA 3SMSA 1SZ2A 2NLXA 1Q18A 3QICA 5AZJB 3VEOA 2QWQA 5AQPA 3AAQA 1V4TA 2QWLA 4AM7A 4BRKA 1MDUB 3FE1A 3FZMA 4QS7A 5CE3A 1MA9B 3CJAA 3D2FB 3O4WA 4IWVA 4WQ4C 4C23A 2E88A 3ZETA 1DKGD 1X3MA 2FXUA 3VEYA 3DJCA 3VF4A 1X3NA 4JHDB 3SJHA 3G25A 5AQUA 5B8HA 4IJAA 3R6MA 4BREA 3BUZB 3M1FA 4HTLA 5AZIA 4CI6A 2QW9A 3CJBA 2ZGYA 3UKUB 3CIPA 3CJCA 4H5VA 2ITMA 3DWLA 4M7YA 2P9KB 3MCPA 3WXKA 3SK3A 3BF1A 5AQIA 1NGJA 2ASMA 2GWJA 2H3GX 4E1JA 4H5TA 1LCUA 2P9PA 5EY4A 2QWMA 3R8EA 3WT0A 3H3NO 4DQ8A 1G99A 2P9UA 2P9NA 4BG9A 3JXUA 5JICA 1TYQA 2D0OA 5BRFA 4CZIA 3LDLA 4I6MB 3GG4A 2GUPA 3OHRA 3QB0A 2A41A 1NGGA 4BRAA 5AQGA 1EQYA 1GLLO 3EL2A 2CGLA 4K25A 1NGDA 1ATRA 5BRDA 4RTFD 3LM2A 3LDNA 3H1VX 5AQVA 4BRNA 4BVPA 1HLUA 3FZLA 3VERA 1K8KA 1BO5O 2J4RA 2V52B 4H0OA 4QS9A 2Q2RA 2FLOA 3H1QA 4NO7A 4H5NA 4DB3A 3I8BA 2YHYA 4FWLA 4PKHA 2IVOA 4DHYA 4RCHA 3I33A 5AQYA 1JCFA 2D0PA 2P9SA 4F9OA 4BQLA 1HX1A 4QS8A 4A61A 3O08A 4BROA 2Q0RA 5EX5A 1CZAN 1TUUA 5AQKA 4MO5A 4RWTA 1BG3A 1E4GT 4XH1A 4XH5A 2EWSA 5AFUH 3H45C 2AA4A 1HKBA 2VYPA 3A5OC 3GDQA 4FOIA 3FFKB 3O80A 4BRLA 3VGLA 3QMLA 4FWSA 4BGBA 3ZX0A 1HKCA 2E1YA 1RFQA 3WXJA 1H1VA 1BOTO 3CJ7A 5AQRA 3UKRB 3VETA 3O1WA 3ATVA 2W41A 4XH4A 4GNIA 5LY3A 4H0VB 2ASOA 1BA0A 4PKGA 3WUHA 1GLBG 1HKGA 4Y0WA 3VF6A 2E2NA 1YUWA 2ASPA 3DAWA 4IJNA 3DXMA 3CQYA 3BF3A 2D4WA 4BRFA 1QQNA 2I7NA 2CH6A 3U9DA 3M6GA 2QXLA 4CBXA 2QWRA 5LJVA 2YHWA 4H5RA 3O6WA 4BC5A 4BR2A 1D4XA 5I9EB 3TPQA 4BR9A 5E84A 4LC9B 1YAGA 1DGKN 2CGJA 4PL8A 4CZHA 2BUPA 2P9PB 4JNEA 1T6CA 1ZBSA 1Z6RA 5BREA 2ZGZA 1KXPA 4ISGA 2P9UB 4B1WB 2YJEA 3O8MA 5BR9A 4BC3A 4GY2B 5KQ8A 1YXQA 4BR5A 5AFUA 5ADXH 2E2QA 4O5FA 1GLFO 3VEXA 5KPZA 2I7PA 1BA1A 2PAVA 3HM8A 2QWPA 4BR0A 3CETA 4IXCA 4IO8A 3IMXA 3LDOA 3L0QA 4Z94A 1HUXA 1SQKA 1QZ6A 3VGKA 4EFHA 2HF4A 1YVNA 4BR7A 1K8KB 3RSEA 4FWPA 1NGFA 2A3ZA 4IZ9A 5FPDA 3B8AX 3CJ1A 3WXLA 3ULEB 4MO4A 4CZJA 4BQZA 4CJ7A 1IG8A 2YI1A 4KBOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U8XA 3GOIA 4HWIA 4KKOA 3VOVA 3D2FA 3QEIA 1RBUA 5KTQA 4GV3A 4DTUA 5D3GA 3ID6A 2YHXA 1NK7A 2X6SA 4JN4A 3BEXA 4C8OA 2FSNA 4JI0K 3NF9A 1JLBA 4F3OA 1KLNA 5TKYA 1RT1A 1DTQA 3L4QA 1GLEG 1RTDA 4CCHA 1TL1A 3C7NA 4JKBA 1RDBA 3K5NA 2OZSA 1XI1A 3C6HA 3ZSZA 3EZWA 5FPEA 1VSFA 2NRHA 3Q7CA 2G8KA 1FXXA 4FWOA 1NK6A 3AVKA 4BRGA 4B1ZA 5ADXA 4LF7K 4MLHA 5M1FA 3DOLA 4CEDA 5AQQA 3DXKA 2GBZA 3M3ZA 3R1XA 2A40A 3HJFA 2QWNA 3TTCA 3CYGA 1TV6A 5KGWA 3NVKA 1RCHA 4QCLA 3E9OA 4HUGA 3NDKA 1S6PA 3MN7A 4YORA 1T05A 4EP4A 3GE1A 4CGDA 3QEXA 3DMJA 1IKXA 2O8FB 4ISFA 1GLJO 5DK5A 5CYMA 2O4GA 2IGIA 1YF5L 4L8RB 2E20A 3AVCA 3CC4N 3PO4A 4CJQA 4DTMA 2GWKA 3RRGA 2VCPA 3AV9A 3L3VA 4M7XA 3HSTB 1SL2A 2Q36A 2O8EA 3CJ9A 3EYZA 4AH9A 1IKYA 4KFBA 5AQMA 3RVCA 1T6DA 1VSKA 4NB4A 4AHTA 1C0FA 1YTUA 3EKUA 4TSXA 3PSIA 4DU1A 2YNFA 5GAEP 3A5NC 1SV5A 1XC3A 3KHYA 3K9KA 4QAGA 3KZBA 4GW6A 4CE9A 1JLAA 2UUAK 3WXIA 5I42A 5BPMA 1JCEA 4FLVA 4O44A 4YHHK 1JKHA 3CFPA 2HHIA 3K57A 5J2NA 4CFCA 5GIOA 4R79A 4F4KA 3SV4A 1HJOA 4BDPA 3AVMA 2HMIA 3O9UA 5EOYA 5M1NA 1SAZA 2UXBK 1ILYA 1ATSA 3H46O 2A42A 4OLAA 2KW4A 4KHSA 4M42A 5I3UA 4B3MK 3QNOA 4KHNA 1JLGA 2E5LK 5F1XA 2YKNA 2D1KA 1OKJA 4JD2B 5KQDA 1QQCA 3AA2A 4EHTA 3SQ2A 3IUCA 1U2VB 2OPRA 4MFBA 1QSLA 4ICLA 4WQ4A 4FW1A 1L5UA 2VGNA 2XRIA 4CIFA 2Y1IA 2QWOA 4NCBA 4EHUA 4C8NA 4BRHA 4CGIA 3D6RA 4KH4A 4O55A 3AY9A 3MX5A 2BH1A 2O8CA 5LMNK 3EN9A 3O1BA 2HHWA 5BRHA 3O3FA 3FGUA 4OKEA 1W2BM 4HTUA 4DKWA 1TKTA 2P9LB 4ELUA 2DFFA 5CZ2A 4ILJA 3LDPA 3LPTA 3D2EB 2Z1HA 4NLCA 3MDQA 3F73A 4FCYA 5AQNA 1S72N 3KLGA 1NGCA 4LH5A 5AQJA 1RT5A 1KRPA 1X9WA 3SYZA 3AO5A 5J2MA 1ZBHA 4YFUA 2Q3SA 1L3UA 3CXCM 1LOTB 3A0IX 4E19A 4BRPA 3OYIA 5AJ3K 1NK4A 1CLQA 3TWHA 3AVGA 3ATUA 3VQ8A 1F21A 4FM1A 5J2QA 4A5BA 3ZLJA 4IDHA 3ZT3A 2KKZA 1EP4A 3AA4A 3VEVA 4DTRA 2DPNA 3AVAA 1D8YA 3LDQA 4CZEA 4OX9K 4J2BA 3EE8A 3DLBA 1DT9A 3EE9A 2VWBA 3ZSXA 3ZT0A 5BR8K 4FPBA 3QINA 4Y1DA 3SQ0A 1NLVA 1XNRK 1C0TA 4CF2A 3CMAN 4JI1K 5JENA 2A5XA 2E2OA 2E4LA 3L6QA 4IG3A 4IFVA 3ISNC 1QQOA 5AQLA 1Q18A 3LAMA 4IFEA 4OLBA 1VRTA 3VQAA 3OJUA 5AQPA 4RW9A 1QE1A 4EZ9A 4R5PA 3NH1A 4ZHRA 3O4WA 1KLMA 4GV9A 4C23A 1DKGD 1T3VA 3KLIA 2R7YA 3HXMA 1QVFM 4FJ5A 3HT3A 4JRQA 1X3NA 3TAGA 3IRXA 3G25A 2YHAA 5B8HA 4IJAA 1KVBA 4BE2A 2UUCK 3KTQA 3UKUB 3RWUA 4DLGA 3A2FA 1UA0A 3CIPA 3OYLA 4CJFA 4M7YA 3WXKA 1RBVA 1NGJA 3CG7A 4PQUA 4CJPA 3AVNA 2H3GX 2YV0X 2P9PA 2HHUA 3R8EA 3VTIA 1QSYA 3L3UA 4IEIA 2P9UA 1Q9XA 3JXUA 3TR8A 3VQ5A 5CZ1A 3P31A 3LDLA 3T7ZA 3OYEA 5C24A 1NGGA 4WFBL 3EL2A 1J53A 1IBLK 4CJ3A 4RW6A 3PX0A 3LM2A 3HRGA 3O3GA 4ZTJA 2P5OA 3TI0A 1HYVA 4CJKA 5JVGL 4H0OA 3DLGA 3VA3A 2HSTA 3I56N 4B3RK 3H1QA 4FVMA 4H5NA 2YHYA 4PKHA 1S1TA 4DHYA 5HOOA 5HLFA 4E1MA 3ZSVA 1SUQA 1JCFA 3HP6A 2D0PA 2P9SA 3TSQA 4IKFA 5CY4A 4CJSA 2KZZA 3ITHA 5EX5A 1CZAN 4MO5A 3LWMA 3PX6A 2DTUA 4DTOA 4NCGA 4HCBA 4HVJA 3JAMO 3H45C 3TSPA 2FBVA 1TVRA 4BACA 5SZTA 4CGFA 3FFKB 3THWA 2FBYA 4BGBA 1HKCA 4DFMA 4FM0A 2ZJQL 3QO9A 4CIEA 3J7AP 3ATVA 2W41A 3HP9A 3D0PA 3WUHA 1GLBG 1HKGA 2VG5A 3VF6A 3J7ZO 3NH2A 3DXMA 4QOZB 3CQYA 3BF3A 5EU7A 4YOXA 1QQNA 2KQ2A 1KVAA 4CW7B 3THYB 3AVBA 4DR1K 2QXLA 4CBXA 4AHCA 4CJ4A 3SNNA 4H5RA 4YOTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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