3UE5A

Ecp-cleaved actin in complex with spir domain d
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
371
structure length
364
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/transport protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 121
structure length 364
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ue5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ue5A03
5EX5A 5CE3A 4Z94A 1DKGD 3U9DA 3ULEB 4XEIA 4BQLA 1GLEG 1ATRA 2E8AA 3O80A 1HKGA 1TYQA 3DAWA 1BWFO 5AFUA 2Q0RA 1HLUA 3FFKB 3L4IA 4GNIA 3VPZA 2FLOA 1LOTB 3D2EA 3FZKA 3CJCA 5AQPA 5AQRA 2ASOA 3FLCO 4K25A 5KQ8A 2QWNA 5KPTA 1YXQA 4ISGA 3LDNA 4H0XB 3C0BA 4BR7A 4FPBA 3HI0A 1C0GA 2FF3B 3ZEUA 4IXCA 4CD1A 3SMPA 3H1VX 5ADXA 3EKSA 5AZIA 2QXLA 4DHYA 3W0LA 4IJNA 3CJ1A 3WXKA 2V7ZA 2QWLA 4BROA 4CI6A 3M6GA 1BO5O 5AQSA 3IUCA 3J8AA 1HX1A 3QDKA 3WT0A 1NGHA 1KAYA 3S41A 2FXUA 2A40A 1QZ5A 2I7NA 1K8KA 4H5VA 1X9JA 1JCEA 1XQSC 2ZF5O 3VOVA 4XH1A 3SK3A 4CJ7A 2D0OA 3CJ9A 1ATSA 4BRLA 1K8KB 1NM1A 4BC4A 4FWRA 3VF2A 4I6MA 3WXJA 1NGIA 4WQ5C 2QWRA 3WUHA 4MO4A 2HF3A 3A5OC 2YCHA 4FWKA 3WXIA 3JXUA 4BRGA 3WQUA 2CGJA 3CHWA 3JS6A 4PL8A 3I33A 3H6EA 2AP1A 4J8FA 3IMXA 4B1XB 4FWMA 4CZIA 3ENOA 3CQYA 1QQMA 2P9IA 5TKYA 5B8HA 4BGAA 1GLAG 3EL2A 3MN9A 2CH5A 4BGBA 4BR4A 3CI5A 5FPMA 1XUPO 2I7PA 4RTFD 4CZKA 1BDGA 1BA1A 1RFQA 3HZ6A 3VGKA 2V52B 4A2AA 2WUSA 4ISEA 4PKHA 4BQZA 3QB0A 3GBTA 3ZX0A 4CZFA 2PBDA 3RSEA 3AARA 5FPNA 2GUPA 4BREA 2ZWHA 3VEVA 4RWTA 3GOIA 4CZGA 1QZ6A 3RSEB 4B1UB 4F9OA 5AQFA 3VESA 2E20A 3ID8A 3DXKA 2QWPA 1X3NA 3MCPA 5F2RA 4AM7A 3O4WA 5AQTA 4H0TB 3D2FA 3EKUA 3DXKB 2FSNA 2GEMA 2Q1NA 4H5WA 2HF4A 2Q2RA 5EOYA 4FOIA 3VGLA 2ASMA 3D2FB 4BRIA 1V4TA 2GELA 3H3NO 2P9UA 1DEJA 1MWMA 4H0PA 5AQNA 5AQGA 5FPEA 3BUZB 5AQHA 1YUWA 4RCHA 5AQMA 2BUPA 2P9UB 3OHRA 2A5XA 2E88A 3GE1A 4BR2A 3WEEA 2P9KA 4XH5A 4YDUA 2YHXA 4NB4A 3M3ZA 3H1QA 2V7YA 3O1BA 4A2BA 1HUXA 3UKUB 3WEEB 4EFHA 2P9KB 1NGGA 4H5RA 3DXMB 1ZBSA 1U2VA 2FSJA 5BREA 2A3ZA 1NBWA 3L6QA 4BRQA 1BU6O 1QQNA 4IWVA 4CBXA 5JLHA 4BRHA 2YJFA 3MK6A 1U2VB 4Y0WA 5LY3A 3CETA 2VCPA 2IVNA 4FOEA 3EO3A 1QQOA 5F0XA 2BTFA 3ZX2A 4BC5A 5BN9A 1R59O 2E2OA 3HSCA 4M7YA 3C7NA 4PKIA 1JCFA 1X3MA 5BN8A 4BR5A 4BC2A 2VWBA 4BRKA 4EHTA 3CJ7A 3A5MC 3BF3A 4WQ4A 3C7NB 5AR0A 1T6CA 1GLLO 2QW9A 3A8YA 5BPLA 4BRFA 3GG4A 4PKGA 3ATUA 4O8KA 1GLJO 4DB3A 3FR0A 2VYPA 5AQVA 1T44A 2V51B 1OKJA 3EZWA 3VF4A 3HTVA 4O5FA 4BRAA 3A5LC 4DQ8A 3QBXA 4JD2A 4BR9A 2GWJA 3BEXA 3FZMA 1NGBA 3FZHA 5AQYA 3UE5A 4BVPA 5AZJA 3VF6A 4H03B 3L0QA 3BF1A 4JD2B 1HJOA 3I8BA 1MWKA 2H3GX 3CQXA 3MDQA 4JHDA 4BRDA 3GL1A 3W3DA 1MDUB 1Q18A 4FWQA 5AZJB 3TU5A 1MA9B 3F9MA 3MN5A 4B9QA 2KHOA 4H5NA 3FE1A 4JHDB 3UKRA 1RGIA 3WQTA 4MO5A 2J4RA 4M63C 4FWSA 2CH6A 3QMLA 2QWOA 4C23A 2CGKA 3QICA 3UKRB 2YI1A 4FPAA 3G25A 1TUYA 1E4FT 4PL7A 5AQUA 1ZXOA 4EHUA 5ADXH 4BG9A 1J6ZA 2W40A 4GY2B 4JN4A 1NWKA 4DCHA 2HMPA 2F9TA 1Z6RA 1C0FA 1NGFA 3CJBA 1GLBG 4JNEA 1KAZA 1Y64A 1G99A 1KAXA 2YJEA 4YDUC 2E2PA 4FO0A 4FL9A 5JMVA 4FWNA 2GWKA 3H45C 4CZJA 3LDOA 5AQWA 4K43A 1HPMA 4CZMA 2E2NA 4B1YB 1NMDA 1DGKN 4AM6A 2ASPA 4CZEA 3O08A 2D4WA 4L3QA 4BR0A 5JLFA 5ELZA 2P9LB 2P9SA 3ZETB 3UKUA 5AQZA 4BRMA 3B8AX 3GDQA 3U4LA 3DXMA 3AY9A 2NZTA 3CJAA 3LL3A 2A41A 4H5TA 3O5BA 4FWPA 2P9SB 1S22A 2EWSA 5AQKA 4CZLA 5EY4A 5KQDA 5E26A 3M1FA 2ITMA 3AAPA 4H0YB 5E84A 1IJJA 3D7EO 4CBUA 3LDQA 2AA4A 2E2QA 3ZX3A 4EIAA 4WQ4C 1CZAN 3VEOA 3TPQA 5AQOA 5LJVA 1HKCA 1Z05A 2Q0UA 1NGAA 3O1WA 2IVPA 1ESVA 2QWQA 4HTLA 3VEXA 3QFPA 4B1VA 1SAZA 5KPRA 2FSKA 2YHWA 1TYQB 5AQQA 2NRHA 2OANA 3QFUA 1H1VA 1NGEA 2P9NA 5BRFA 4ISFA 5BPNA 3VERA 3D2EB 5KPZA 4FSVA 3UB5A 1KXPA 3A5NC 2P9NB 3R6MA 1NLVA 2IVOA 3DWLA 4KBOA 5I9EB 1BOTO 2ZGZA 4K41A 3ZEUB 2D1KA 4XH4A 4WYBA 5AZIB 2UYTA 2E1YA 4HWIA 3BP8A 3LDLA 4JAXA 3WXLA 4BVOA 1QHAA 1HKBA 3ATVA 2IIRA 2QM1A 5AQIA 4IZ9A 2Q36A 4MLEA 4B1ZA 4BRPA 4BRNA 2PAVA 4FWOA 5FPDA 3ENHA 5AQLA 1EQYA 2YHYA 1SQKA 4FWLA 2W41A 1XC3A 4QS8A 5AFUH 1JCGA 1NGDA 2FF6A 4LC9B 5F1XA 3U9ZA 3AAQA 4NO7A 3LM2A 3CERA 3SJHA 1NGCA 1V4SA 3KHYA 1S3XA 2DPNA 4M7XA 1NGJA 3LM9A 4I6MB 4A62A 3H46O 1TUUA 2P9PA 5JICA 4H0VB 4BC3A 3VEWA 3HM8A 3HBTA 3IFRA 2P9PB 2P9IB 2HOEA 4WQ5A 3FGUA 4BG8A 2E1ZA 1U6ZA 4QS7A 4CZHA 1YAGA 2A6AA 2Q31A 3KZBA 3QBWA 5AQJA 3IDHA 5LJWA 4IO8A 3MN7A 2NLXA 3VGMA 3FZFA 3R9PA 2D0PA 3VETA 4IJAA 1P8ZA 2ZGYA 2GTDA 3SLCA 3VEZA 5AQXA 1D4XA 1YVNA 3P4IA 3VENA 5BRDA 1WUAA 5BR9A 2P9LA 3KVGA 1GLFO 3DJCA 3ZETA 4CD3A 4MLHA 3MN6A 2Q97A 3CIPA 1T6DA 3A0IX 1ATNA 1WOQA 1ZC6A 3O8MA 1SZ2A 2A42A 2CGLA 5EVZA 5BRHA 2F9WA 1IG8A 5EXWA 1E4GT 4A61A 3SMSA 4QS9A 3O6WA 1LCUA 1BA0A 4E1JA 4B1WB 4BRCA 3U8XA 1RDWX 1BG3A 3VEYA 3EN9A 3LDPA 4EAHD 4H0OA 3FZLA 5BPMA 1BUPA 4CBWA 4K42A 3ULEA 1GLCG 3R8EA 3H3OB 1GLDG 3MMVA 2QWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K8XA 5CE3A 1XNQK 1EX4A 4BDYA 3BZKA 4XEIA 3C95A 1ATRA 3KKRA 4RW4A 2HVIA 2Q0RA 3FFKB 1S6QA 1C6VA 1LOTB 3FZKA 3CJCA 4JKGA 4FJKA 1S1TA 4KHYA 3FLCO 4NXNK 3L4QA 4Z0UA 2FBVA 3QERA 4BR7A 2FF3B 2NRVA 3OYJA 5FRNA 4CD1A 3EKSA 5AZIA 4BE1A 1KLMA 4IJNA 1JXBA 2ZM6K 1S1VA 3CC4N 3DLKA 3ZSRA 4IFYA 4FK0A 4ELTA 3LP1A 1BO5O 2UU9K 3V81A 3QDKA 1RT4A 2E5LK 2FXUA 2A40A 2I7NA 3KK7A 1BQMA 3OS1A 1YT3A 4H5VA 1X9JA 1JCEA 1XQSC 1ITGA 3P5JA 1SKWA 3SK3A 4NXMK 4CJ7A 3AO4A 1ZBLA 1ATSA 3L3VA 1YIJN 4FK4A 4IFVA 2ZD1A 4N41A 1K8KB 4BC4A 4ELUA 2HNDA 3VN5A 4I6MA 1NGIA 4L8RB 3HPHA 3A5OC 4CCHA 3WQUA 3AO3A 4DMNA 4LF9K 4GVMA 2AP1A 4J8FA 3IMXA 4B1XB 4FWMA 3PX0A 4BGAA 3SQ4A 2F7TA 5CHIA 4W5OA 3VQAA 3I8DA 2I7PA 1TVRA 4CZKA 1NOYA 1BDGA 3ID6A 2YHAA 2RKIA 3IRXA 3QESA 3VGKA 4HCBA 3KWIA 2WUSA 4CFCA 1RBTA 3GBTA 1ZBIA 1SV5A 3RSEA 4CJUA 5FPNA 4AILC 2GUPA 3MX5A 3TAGA 4IG0A 1X9SA 2E20A 3O9QA 1OH5A 1CLQA 3DLEA 4B9SA 3MCPA 2VQEK 3CFRA 1VSLA 4H0TB 3D2FA 3EKUA 3O3FA 3CYGA 2FSNA 4H5WA 4GKJK 5TKWA 4FJNA 2IC3A 4BRIA 4W5QA 1G15A 1V4TA 4JLHA 4LF8K 3CD6N 4OGCA 3OJSA 5AQNA 1QSLA 5FPEA 4DV1K 1J5EK 5K14A 2KKZA 2P9UB 3NGZA 4KB1A 2A5XA 3RVCA 2OTJN 4I2PA 3GE1A 1FKOA 4XH5A 3H1QA 4DSLA 4A2BA 4FCYA 2QKBA 3F9KA 2G8HA 2P9KB 4FZZA 3OY9A 3AO1A 3MX2A 1NK0A 3O9TA 2FSJA 2OYQA 2A3ZA 2Q3SA 1NBWA 1QSSA 3MCAB 5JLHA 1VQMN 4FXDA 4AHUA 2DFFA 5LY3A 3THVA 4DG1A 4CJSA 3HM9A 1TK5A 3MXMA 2IVNA 2HNYA 3CG7A 4FOEA 1QQOA 3M8SA 3S3OA 4BC5A 5BN9A 2VGNA 3THXB 3HSCA 5HRRA 1JCFA 1X3MA 3N4PA 3LWLA 3SQ0A 1Q8IA 3JAMO 4X66K 3TI0A 2NRRA 4LSNA 3SAGA 4GVEA 3CJ7A 4X64K 3SAHA 3OA9A 3A5MC 5GAGP 1RNHA 1T6CA 4GV3A 5BPLA 4FJLA 1S9GA 3SUQA 4DTNA 2WC9A 4JI8K 4PY5A 4BRAA 2AJQA 2KW4A 2GWJA 3QLHA 3UIQA 4M42A 4ILGB 2C1GA 1NGBA 1U04A 2HHTA 1SS6A 1B9FA 3UE5A 5AZJA 4FZXC 3AGKA 3I8BA 3NHGA 3OYGA 2H3GX 3MDQA 1LV5A 3W3DA 1MDUB 4BWJA 1K73O 4KH4A 4B9QA 3V9WA 1LWFA 4DFPA 4DU1A 3CCEN 2HNZA 1U4BA 5GIPA 1EP4A 3ZT2A 3VTIA 2CH6A 1VQ5N 3QMLA 2QWOA 5GAHP 3QICA 3CCVN 3NFAA 1TUYA 4QCLA 4CJEA 4PL7A 4BG9A 4KFBA 3NH2A 3QO9A 3CF5L 1S1UA 4GY2B 3KLHA 1M90O 5GIOA 4CEQA 3S5TA 3CJBA 1GLBG 1KAZA 4G9ZA 5JVGL 4RW8A 1NOZA 3CPWM 4DFKA 3MXIA 5C15A 2O8BA 3RMDA 4I9QA 2UXDK 1C1CA 2E2PA 1T03A 5JMVA 5CY4A 4CZJA 5AQWA 4DR6K 3IKMA 4B1YB 1NMDA 1NNEA 3RR7A 4AM6A 2ASPA 3DRPA 3DYAA 4J2BA 3O08A 4L3QA 4BR0A 1TL1A 5CZ1A 4B9VA 4DTOA 3UKUA 4JRPA 1S72N 1KC8O 3B8AX 4NCBA 3PX6A 3DXMA 4J2EA 4DSIA 3P39A 3NF8A 3L3UA 1GOCA 2EWSA 5AQKA 3PX4A 5KQDA 1JLQA 3NH1A 1VSKA 1WSGA 4H0YB 1TKZA 1IJJA 2HSTA 4KH5A 2E2QA 3ZX3A 2NNWA 1CZAN 3SQ1A 4C8LA 4CE9A 2Q0UA 3O1WA 2BE2A 1ESVA 4W5RA 3VEXA 3THYA 2Y1IA 4KAZA 4K0KK 2YHWA 1CXUA 3WNFA 3OYHA 1UWBA 2FC0A 3E01A 3MXJA 5BRFA 4FM0A 3SNNA 4CK3A 2O8FB 4FJGA 1W9HA 2YX6A 1C0TA 2P9NB 1NLVA 3HJFA 3DWLA 2P51A 1YI2N 4KPYA 1RT7A 5J2NA 3T1HK 2ZGZA 3RMBA 4WYBA 1L3TA 1L5UA 1ZBHA 3THWA 2UYTA 3AA4A 2YKMA 3B6OA 4BVOA 1HKBA 3U3GA 3AA5X 3AA2A 4CJ3A 4IEEA 2PAVA 2VG6A 4FWOA 3TSPA 1DLOA 5A2QO 1EQYA 4KHPK 4CECA 1DTTA 1XC3A 4QS8A 3TWHA 3K0SA 1NK4A 3U9ZA 4NO7A 4K8ZA 4LF6K 4RW9A 4A57A 4IOCL 5JS2A 4A59A 4DV6K 4KRFA 3H46O 4CGDA 1YJNN 3RMCA 3NF9A 2WTUA 1I39A 3O9RA 2QKKA 4BE7B 4C1NI 3IFRA 3V6DA 4B3OA 4CGIA 1Q81O 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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