3ULEA

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869 and atp
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
415
structure length
400
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Structure of Bos taurus Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869 and ATP
rcsb
total genus 129
structure length 400
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3uleA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3uleA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3uleA04
2YJFA 1EQYA 2E2PA 2QWRA 3VESA 2YHXA 3HM8A 4BR9A 4RCHA 1ATNA 4XH4A 5AQJA 3JS6A 3R8EA 3W3DA 5AQOA 3UKRB 3LDOA 2IVNA 2F9WA 4EHTA 2A6AA 3M1FA 1JCEA 2YHWA 3BUZB 3O6WA 1NGCA 2Q97A 3VPZA 5E84A 2A3ZA 1TYQB 3VEZA 3O4WA 4CZGA 4BREA 4MO5A 4DCHA 4BQLA 3IUCA 4BC2A 2GWKA 1X3MA 2V51B 3I8BA 4HTLA 4K41A 5LJVA 3JXUA 3DAWA 1GLFO 2QWNA 3CJAA 1E4FT 3VETA 4CZMA 4EAHD 5AZIA 4I6MA 2E88A 2Q0RA 2P9UA 4FWLA 4CBWA 4PL8A 1XC3A 3BP8A 4K42A 4F9OA 5AQZA 3BEXA 4M63C 1KXPA 3O5BA 4FO0A 5AQHA 4B1UB 1C0FA 3EZWA 3HSCA 2FF6A 3G25A 4BR4A 4A62A 2CGKA 2P9KB 3D2FB 3GL1A 3TU5A 2PAVA 4CZLA 2ZWHA 4H0OA 4CZFA 1TUUA 2HMPA 5EY4A 5AQUA 2FF3B 1G99A 2V52B 2GELA 4B1XB 1JCFA 1NGIA 3H6EA 5AQSA 1ZBSA 3EL2A 1DKGD 5AQMA 5LJWA 3M3ZA 2QWOA 3EN9A 1QZ5A 2Q31A 5I9EB 3LL3A 4FWNA 5AQTA 3RSEA 3L4IA 5ADXH 4CBXA 3U4LA 1IJJA 3C7NB 1NGEA 1S3XA 3MCPA 2QWMA 1YVNA 1X9JA 3UKUA 1HJOA 3OHRA 3DJCA 4FOIA 2P9IB 3H3OB 4QS7A 3O08A 3FFKB 4BRDA 5EVZA 4BGBA 4B1VA 5AR0A 1CZAN 4IJAA 3SMPA 3QFPA 3B8AX 2NZTA 2QWLA 5JMVA 3H1VX 4MLHA 2CH6A 1V4TA 4H5TA 1DGKN 3HBTA 4DHYA 2Q1NA 3CJ9A 3D7EO 5BPLA 3CQYA 3CJ7A 4E1JA 4H0PA 2NRHA 5ADXA 5KQ8A 1XQSC 3CQXA 1QZ6A 4IJNA 3SLCA 1HX1A 3H46O 4B1YB 1JCGA 3R9PA 4BR0A 2E1YA 3WEEA 2W41A 3ENHA 3UB5A 3MN7A 2FSNA 5AQGA 3QICA 4FL9A 4XH5A 3GOIA 5AQQA 3H45C 4H03B 5E26A 3HZ6A 5AZIB 3HI0A 1NM1A 4I6MB 2P9UB 5AQXA 3WT0A 5BPNA 1T6CA 2A42A 4H5NA 4JAXA 4BRNA 1NGDA 1HPMA 3TPQA 3WQUA 3LDNA 4FWSA 3IMXA 5FPNA 4BRIA 5AQNA 2E20A 3VF6A 3MDQA 4BC3A 5F2RA 4BGAA 1GLBG 3EKUA 4BRKA 4BRLA 2PBDA 1BA0A 3U9ZA 5CE3A 4BRCA 2HOEA 1GLDG 4BRAA 3WXJA 3QBWA 3ULEA 2EWSA 1ZC6A 4FPAA 1HLUA 1X3NA 4CZEA 4CJ7A 4CZJA 2QXLA 5KPTA 3CIPA 2D0PA 1QQOA 3KHYA 3CJBA 3O80A 3SJHA 3A5LC 4CBUA 2IIRA 3RSEB 3A5MC 4CI6A 5JLFA 1MWMA 4L3QA 4FWKA 4WQ5C 4H5RA 3VEYA 5BN9A 2A5XA 2J4RA 3UKUB 5FPDA 1NWKA 2QM1A 1QHAA 3AAQA 3MMVA 4IO8A 2BUPA 5EOYA 3BF3A 4JN4A 4CD1A 2ZGZA 5AQLA 1V4SA 1D4XA 3CETA 3VOVA 3A5OC 4FWRA 3IFRA 4DQ8A 3DXMA 4BROA 1E4GT 3SK3A 1GLLO 2P9LA 3ZX2A 2AP1A 2YI1A 3L6QA 2YHYA 4IZ9A 1MDUB 5AQKA 2HF4A 3MN6A 5BRFA 1SZ2A 4WQ4A 2A41A 4FWMA 5AQVA 1BOTO 4A2BA 5KPZA 2CGLA 3O1BA 3WEEB 1MWKA 4M7XA 5AQWA 1BA1A 4H5WA 3I33A 4YDUA 4H0VB 4MO4A 3QBXA 4PKHA 2IVPA 3VGMA 4JHDA 4K43A 4BVOA 3FZKA 1KAXA 1U6ZA 3KVGA 3MN5A 2P9NA 4O5FA 1Z6RA 2E2OA 1NLVA 1QQNA 1WOQA 2H3GX 4NO7A 3GG4A 4A2AA 5AQFA 3WQTA 3CJCA 2Q0UA 2P9PA 4LC9B 3ZX0A 1GLEG 5FPEA 2YJEA 3ATUA 3H3NO 4MLEA 5F1XA 1C0GA 4BRFA 3C0BA 3M6GA 4XH1A 3WUHA 1T6DA 4FPBA 3QDKA 4CZHA 4K25A 4GNIA 3FZHA 1YUWA 3CERA 3ULEB 3GE1A 3CI5A 1HKGA 1SAZA 1OKJA 2I7PA 3VENA 3VGLA 3FZFA 1TUYA 1IG8A 3R6MA 4B1WB 2I7NA 3A8YA 2YCHA 4FWQA 4FSVA 1BO5O 4H0TB 3WXLA 4CZIA 5AQRA 2IVOA 4JNEA 5BPMA 1ATRA 1BU6O 1WUAA 5EX5A 1BG3A 4WQ4C 4BC4A 4BVPA 3LM2A 4H5VA 4NB4A 4DB3A 2CGJA 3O1WA 3VGKA 3D2EA 3VEWA 1BDGA 3ZETA 3H1QA 3FZMA 4YDUC 3VERA 4PL7A 5JLHA 2QW9A 4BQZA 2P9SB 3ENOA 2GTDA 4B1ZA 1K8KA 3LDLA 4BRPA 4EIAA 4IXCA 5EXWA 5B8HA 4BRGA 1Y64A 3LDPA 3QMLA 3DXMB 1ATSA 3AY9A 3HTVA 4AM6A 1P8ZA 1J6ZA 2F9TA 3QFUA 4EHUA 5KPRA 2P9LB 3GBTA 3VEOA 3U8XA 5BR9A 5ELZA 3FGUA 1YAGA 1NGBA 1Q18A 2ZF5O 2VWBA 3DXKA 2KHOA 4B9QA 5LY3A 4PKIA 4EFHA 5AQPA 3SMSA 1HKCA 4JD2A 4BR7A 1NGHA 2VYPA 2Q36A 2QWPA 3U9DA 2V7YA 1GLJO 3AAPA 1DEJA 3VEVA 3ATVA 3VF4A 1YXQA 3MK6A 4JHDB 3WXIA 3FR0A 2QWQA 4Y0WA 2P9NB 2P9SA 2ASOA 4FWOA 4BC5A 4QS8A 4BR5A 4GY2B 5JICA 1XUPO 4H0XB 4BRHA 3ZEUA 1H1VA 3CJ1A 5AZJA 3EKSA 3FLCO 2VCPA 2P9PB 4BG9A 1U2VB 1ZXOA 1NGGA 5AFUH 4C23A 3UKRA 1R59O 5AQIA 4ISGA 4CD3A 3ZX3A 3IDHA 3S41A 5FPMA 1S22A 4BR2A 4Z94A 3MN9A 3UE5A 3BF1A 1NBWA 1MA9B 1TYQA 2W40A 3KZBA 4KBOA 2A40A 4XEIA 2D1KA 4IWVA 4RTFD 2DPNA 1KAYA 2ASMA 1BWFO 3VF2A 2OANA 5BREA 3FZLA 1LCUA 2E2NA 3P4IA 4PKGA 1NMDA 1BUPA 4FWPA 1U2VA 5AFUA 3D2EB 3LM9A 4AM7A 3LDQA 3J8AA 3ZETB 4BRMA 1LOTB 4H0YB 3DWLA 4FOEA 4ISEA 2NLXA 3ID8A 5TKYA 1K8KB 2E8AA 2ITMA 3O8MA 1T44A 4WYBA 5BN8A 2P9KA 3D2FA 2D4WA 2GEMA 4HWIA 1GLAG 5BRDA 4QS9A 1ESVA 1NGAA 5BRHA 2D0OA 3VEXA 4A61A 3FE1A 2GWJA 2Q2RA 4CZKA 2E1ZA 1Z05A 2FSKA 3DXKB 4M7YA 4BRQA 3GDQA 4WQ5A 5AQYA 1SQKA 3CHWA 1NGJA 1QQMA 4JD2B 3AARA 3A5NC 1NGFA 2GUPA 2BTFA 2WUSA 1RFQA 2HF3A 1HKBA 2E2QA 3C7NA 2ASPA 1HUXA 4ISFA 3F9MA 5F0XA 1GLCG 3L0QA 4J8FA 4BG8A 2V7ZA 4O8KA 2P9IA 2FSJA 2FXUA 1KAZA 2CH5A 2UYTA 5KQDA 4RWTA 3A0IX 2ZGYA 1RGIA 3W0LA 3EO3A 3WXKA 2AA4A 3ZEUB 3QB0A 5AZJB 1RDWX 2FLOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YJFA 2QWRA 3KLEA 1KLNA 3EE9A 4OKKA 4RCHA 1ATNA 3THWA 3JS6A 5TKWA 1X1PA 3R8EA 5AQOA 3G4SN 1EKEA 1KSPA 4IFEA 4JLHA 2IVNA 4EHTA 2A6AA 4DLEA 4DV2K 1VAZA 1JCEA 3NH2A 3BUZB 3QIOA 3VQDA 4DR7K 4E1MA 4DU3A 2Q97A 3VPZA 3AVFA 4JI6K 3DLKA 2G8FA 3J80O 1VQMN 2A3ZA 1TYQB 3VEZA 4KHNA 3O4WA 4K8ZA 4E0DA 3V6DA 1WSFA 2V51B 4K41A 5LJVA 3JXUA 1BHLA 3TR8A 2G8HA 1E4FT 3S3OA 2P9UA 4DFPA 1KQSM 4YFUA 1EWQA 1S1XA 5AQZA 1IKXA 4FO0A 3QO9A 1VHXA 3EZ5A 3QEXA 1Z26A 4CIEA 3HSCA 4KI4A 3LPUA 1NMNA 3TWHA 2BANA 2YHAA 4A62A 3HVRA 2PAVA 4CZLA 4KHYA 2ZWHA 2W00A 3PIOL 1OH6A 1DTTA 4DR1K 4CJSA 1G99A 3NVKA 4B1XB 3EL2A 4EZ6A 2UUBK 5AQMA 5LJWA 3M3ZA 3EN9A 2Q31A 3LL3A 5AQTA 3RSEA 3AO3A 4QCLA 3T3FA 2KTQA 2YNIA 3JAMO 3C7NB 3KWGA 1IV0A 2DFHA 1QVGM 1C0UA 1X9JA 3ZSOA 3UKUA 4DFMA 3E01A 3T1HK 4LFCK 4QS7A 3NCIA 3O08A 5EVZA 1CZAN 2JGUA 4IJAA 1BIZA 3CF5L 5LL6Z 1EETA 2XY6A 4KH6A 4LF9K 5JVGL 2I5JA 4M3YA 5FDLA 1OH7A 1XI1A 4E1JA 1QVFM 5ADXA 4GV6A 3CCJN 1QZ6A 4E7IA 3R9PA 4BR0A 3M8QA 3ENHA 4F2RA 2X74A 4ZHRA 4KTWA 4Z4EA 2FSNA 4LSLA 5KGWA 4KHUA 3QICA 1WSJA 4XH5A 3PSFA 4CK2A 1QSSA 2WFBA 4CF0A 1VRUA 4CF1A 3NF8A 3HI0A 5GIPA 3VQAA 3CD6N 2OPSA 1T6CA 4H5NA 4KH4A 1NGDA 3LDNA 4NXMK 1EP4A 3ITHA 3MX2A 1QQCA 3NMUA 3C6UA 2HW3A 4BC3A 4RW7A 1GLBG 3EKUA 4BRKA 1SKRA 2E6LA 4B3MK 4CECA 2KKZA 3WXJA 3CCLN 1BI4A 1X3NA 5GADP 4CZJA 2QXLA 1JLGA 5KPTA 1YIJN 3CJBA 1CZBA 4CI6A 2GBZA 4L3QA 3O9RA 1FKPA 4FLZA 1RTDA 4DQQA 3LPTA 4WQ5C 3PLAA 4WFAL 4DFJA 2A5XA 2J4RA 4RW4A 1TL1A 5HRNA 2QM1A 1VSMA 3MMVA 4IO8A 3HOSA 1W97L 3FFIA 4B9TA 1RDAA 1C1CA 4CHYA 1WBDA 4EZ9A 3K57A 4B08A 4DR6K 1NKEA 4CEZA 4CEOA 3IFRA 3DXMA 4Y1CA 3DLBA 3NAEA 1ZYQA 4CCHA 3SK3A 1GLLO 3E9LA 2YKMA 3V9UA 2P9LA 3ZX2A 3BY5A 2RF2A 5M1PA 3SAFA 4GKKK 1BCOA 2P5GA 1UOCA 2HF4A 5BRFA 1SZ2A 4WQ4A 3SQ2A 1BOTO 3E1YA 4KFBA 2ATQA 2HHUA 4M42A 1MWKA 4M7XA 4DUYK 3AVBA 4YDUA 3OYIA 2VQFK 2IVPA 3BZCA 4DSEA 1U6ZA 2OYQA 1JL2A 3MXIA 1Z6RA 4DF8A 5C2DA 1N34K 3P83D 3GG4A 1IG9A 3CCSN 4JS4A 1RT2A 1XMOK 3ATUA 4CERA 5CYMA 1G15A 3Q7BA 3T1AA 2NRVA 3M6GA 4CGHA 1QTMA 4CEDA 4JKGB 1FKOA 4E7KA 1ZBIA 3QEVA 4CZHA 1VQ5N 4FLTA 4K25A 3ULEB 1WN7A 3BDPA 2I7PA 4XIUA 5GIOA 1NK7A 1P90A 2VGNA 3CCVN 4RW6A 1IG8A 3S3NA 1S9GA 4FWQA 1D8YA 4IFVA 5BPMA 3NDKA 1BU6O 1WUAA 5EX5A 1BG3A 4WQ4C 3QEPA 1YITN 4JKCA 4H5VA 5M1NA 2HHHK 2CGJA 1KTQA 3JYTA 5GAGP 1VK0A 3ASMA 5KI6A 4YDUC 4DS5A 4KHPK 4BQZA 4B9VA 3ENOA 2OZSA 2GTDA 4B1ZA 1LWFA 3LWMA 1HR0K 5EXWA 4YOTA 4JV5K 1Y64A 2O8BB 4JKHA 4LF8K 4O0IA 1W2BM 1P8ZA 2F9TA 2PY5A 3O3FA 3G0ZA 5KPRA 1N8RO 1RTHA 4OPJA 3VEOA 1JXEA 3HSTB 1NGBA 1Q18A 2YNGA 3PX6A 2HHIA 2KHOA 1B9DA 4B9QA 3PSIA 1NK5A 1M1KO 1SS6A 4GW6A 4JD2A 3VTIA 4FM0A 3K5NA 1NGHA 2VYPA 4GV9A 3U9DA 4BE0A 3VTHA 3AAPA 4BE1A 1YXQA 4JHDB 4U7BA 4CJ4A 1K9MO 3CC7N 4FWOA 2HBLA 1H1VA 3DOLA 1QE1A 3FLCO 4DF4A 2P9PB 3HJFA 3DRRA 4CVNE 1ZXOA 1J5OA 3OYHA 3QLHA 2PFUA 1S1WA 5AFUH 1C6VA 1REVA 3CPWM 2UU9K 4FK0A 4CD3A 5KTQA 3PIPL 4IOCL 2IGIA 4Z94A 3V81A 3MN9A 1X9MA 1S5JA 4OGEA 4B9NA 1S1UA 2HHWA 3HRGA 4IWVA 1RCHA 4DQPA 3NHGA 3WNEA 3ZT3A 3TAPA 2E2NA 3OYEA 4PKGA 3ZT0A 4X62K 4FWPA 4HUFA 3D2EB 3LM9A 2Q3SA 5H1SQ 1F21A 4NLCA 4WCEL 2NLXA 4ZTFA 4LF5K 4Y1DA 1RT4A 1EX4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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