3W3DA

Crystal structure of smooth muscle g actin dnase i complex
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
EEETTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, gamma-enteric smooth muscle
publication title Refined structure and solvent network of chicken gizzard G-actin DNase 1 complex at 1.8A resolution
rcsb
total genus 122
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3w3dA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w3dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3w3dA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3w3dA04
3HSCA 4MLEA 3LDNA 3O1WA 4NB4A 4FO0A 2CGJA 2A42A 3H3OB 1ATRA 4B1WB 2F9WA 4A61A 3VPZA 4CZKA 5AQNA 4L3QA 4IWVA 3ATVA 5EXWA 5AZIB 2A41A 1NGDA 2ZWHA 2FF3B 5AQZA 3LDOA 1BOTO 4K41A 2E2PA 3O80A 3CJBA 2I7NA 4BR7A 3L0QA 5AQLA 3SMPA 3VESA 4BQZA 2FSNA 2IVOA 1QQNA 4B1VA 2F9TA 3QFUA 4DQ8A 2ZGYA 5AQOA 3W0LA 2V7ZA 5ADXA 2Q1NA 1ZC6A 4RTFD 4BROA 3CERA 1BUPA 3HBTA 4JD2B 4JD2A 5AQXA 4MLHA 4PKHA 2D0PA 3ZX3A 3JS6A 3WUHA 3W3DA 2VWBA 3C0BA 5EX5A 2KHOA 3MCPA 4CD1A 5E26A 3GE1A 3RSEB 3RSEA 2BUPA 1GLFO 3A5LC 5AQFA 3DXKB 3VEWA 3DXKA 4EHTA 2QXLA 5AQKA 2D1KA 2Q2RA 3AAPA 4FWLA 5KPRA 4H0TB 1BU6O 3WEEB 3FZLA 3VEXA 5LJVA 3D2FA 2HOEA 2DPNA 3C7NB 3C7NA 1NGCA 1SQKA 4YDUA 2QW9A 1BA1A 4LC9B 5AQRA 3VEOA 5AZJB 2V52B 1C0GA 4J8FA 3IFRA 1XUPO 2OANA 3U9DA 5LJWA 2GTDA 2YHYA 3R9PA 3F9MA 4CZEA 4H5NA 5AQJA 4BC3A 4QS8A 3VGLA 1GLEG 3M3ZA 1NWKA 4H5RA 2HMPA 4FWOA 1U6ZA 1QQOA 3GDQA 4PL8A 3ENHA 2ASPA 4EIAA 2E20A 4K42A 2GEMA 3QMLA 3SJHA 2FF6A 1NGBA 2QWLA 2QWPA 1T44A 2P9SB 1RGIA 1YUWA 4HWIA 4FSVA 1TUYA 4IO8A 1P8ZA 1G99A 3R8EA 3O4WA 3MN7A 2QWQA 3P4IA 5KPZA 3GG4A 4A2BA 4BG8A 3A5NC 3CJ1A 4RCHA 2IVNA 4FWQA 3AARA 3G25A 1ZBSA 3GBTA 5E84A 3A5OC 4XEIA 2ASOA 4FL9A 3WXIA 2P9KA 3LM9A 3VOVA 3H1QA 3TPQA 4PKIA 4PKGA 2P9IA 3A8YA 3FE1A 4KBOA 1DGKN 3LDQA 3ZETB 3ZETA 3R6MA 3OHRA 1D4XA 2HF4A 5FPMA 3L4IA 1V4TA 3FZHA 4EAHD 3ZEUB 3VF4A 3CQXA 3ZEUA 5AQIA 2GELA 3LDPA 3MN5A 3VF2A 1KXPA 3CJCA 4FWNA 1BWFO 1NGIA 2V51B 1TUUA 2A5XA 1EQYA 4CBXA 2Q0UA 4JNEA 3O1BA 4YDUC 1LCUA 2YJEA 3SMSA 5AZIA 1U2VB 2W41A 3WT0A 4BREA 2Q0RA 3FR0A 4M7XA 4JN4A 3VEVA 1KAZA 2QWMA 3O8MA 1GLLO 3EZWA 3IMXA 4O5FA 2CH6A 4QS9A 5EOYA 3VGKA 4BRNA 4FOIA 4WQ5C 4Z94A 4H0VB 1QZ5A 2E8AA 5AQHA 3I33A 2I7PA 3H45C 1HKGA 1ZXOA 3CJAA 4BRKA 4DCHA 3MMVA 2YCHA 1V4SA 2E2OA 1Y64A 4MO4A 3U8XA 4FWKA 3LM2A 1NMDA 3VGMA 3VERA 4BC4A 3A5MC 1NGEA 2BTFA 2ZGZA 4BR9A 2QWOA 4ISEA 4DB3A 3CETA 4EHUA 4CZGA 3WXLA 1NM1A 3QICA 4I6MB 1YXQA 1GLDG 4I6MA 5FPDA 1HPMA 4BRHA 1SZ2A 5JICA 4B1YB 1BA0A 3WEEA 5AQYA 4FWMA 4BG9A 1HJOA 5AQMA 2E2NA 4B1UB 3M1FA 5KQDA 4FOEA 1E4GT 1TYQB 3D2EB 1TYQA 3D2EA 5KQ8A 4FWSA 3VEZA 3BF1A 3KZBA 1HUXA 5AQVA 1QHAA 5AZJA 4K25A 2PAVA 3CI5A 3VETA 1MWMA 1NGFA 2Q31A 4BRDA 2GWJA 2E2QA 3A0IX 2YI1A 4A2AA 4H0XB 3BF3A 4CZMA 1WOQA 3D7EO 5AQPA 5FPEA 2H3GX 5FPNA 1NGHA 2NZTA 3FZKA 1XQSC 1S3XA 1IG8A 2Q36A 4EFHA 4BRIA 1Z05A 1T6CA 4F9OA 4WYBA 1BO5O 4FWRA 4HTLA 2AP1A 3BEXA 4XH4A 4H0PA 2P9SA 1QQMA 3BP8A 3O08A 3MDQA 3H3NO 4WQ4A 4BGAA 4JHDB 4C23A 2CGLA 3U9ZA 2YHXA 2UYTA 3MK6A 3FFKB 4CD3A 3J8AA 1BG3A 2W40A 3EO3A 4BRMA 2E88A 3KHYA 3VF6A 1H1VA 1NGAA 4BVPA 4FWPA 2EWSA 3BUZB 2D4WA 2J4RA 3EL2A 4H5WA 4H0YB 4BR5A 2GWKA 2YHWA 4BRQA 3JXUA 1OKJA 5KPTA 3GL1A 1NGGA 5TKYA 1GLCG 3H1VX 2WUSA 4IJNA 2FSJA 5EVZA 4BRPA 2A40A 1GLAG 2E1YA 1HKCA 1RDWX 4BR4A 4ISFA 4B1XB 5B8HA 4QS7A 2FLOA 1ESVA 3LL3A 2GUPA 3LDLA 3CJ7A 3UB5A 1SAZA 2IVPA 4BRAA 3QFPA 1DKGD 2P9LB 4GNIA 2P9LA 3H46O 2P9UB 3HTVA 1WUAA 2YJFA 4BQLA 1U2VA 5AQSA 4CZFA 2NRHA 3DWLA 2NLXA 3CJ9A 2FXUA 4RWTA 3VENA 1C0FA 4H0OA 4BR2A 2IIRA 1YVNA 4NO7A 4IXCA 1NLVA 3ZX2A 1MDUB 4M63C 3DJCA 4H03B 5AQUA 1X9JA 1JCEA 4O8KA 1HKBA 3HM8A 3WQTA 1J6ZA 3FZMA 2QWNA 4AM7A 3UKRB 4E1JA 3UKRA 3I8BA 1DEJA 4B9QA 5F0XA 3UKUB 3UKUA 4JAXA 3CHWA 3WXJA 5BR9A 3MN6A 2Q97A 2VCPA 3CIPA 2ASMA 4WQ4C 5AR0A 3IUCA 4FPBA 3WQUA 2D0OA 5AFUA 1R59O 5BRFA 1HX1A 1MA9B 3FZFA 3QB0A 1QZ6A 1YAGA 4XH1A 5BN9A 2A3ZA 1Z6RA 4GY2B 1KAXA 2HF3A 4BC2A 1KAYA 4BRCA 3ID8A 5BN8A 4K43A 4CZHA 1GLBG 3FGUA 3ENOA 3AAQA 3FLCO 2CGKA 2V7YA 3O5BA 3QBWA 3AY9A 5F2RA 3S41A 3B8AX 5ELZA 5JMVA 3D2FB 1NGJA 3DXMB 3QDKA 3DXMA 1ATNA 1JCFA 4AM6A 1NBWA 1RFQA 4CBUA 3EN9A 4DHYA 1S22A 2P9NB 2P9NA 4MO5A 5AQTA 3L6QA 4BRLA 4ISGA 4BC5A 1XC3A 2CH5A 3IDHA 5I9EB 4A62A 5BPLA 4WQ5A 3HI0A 5AQWA 1LOTB 3EKUA 3GOIA 3H6EA 2FSKA 3HZ6A 4IZ9A 4CJ7A 4CZIA 4H5VA 3VEYA 5BREA 4JHDA 3MN9A 3UE5A 2AA4A 5BPMA 3CQYA 5AFUH 3SK3A 4BRGA 1Q18A 5ADXH 1BDGA 5JLHA 2QM1A 3KVGA 5CE3A 4BGBA 1HLUA 3QBXA 2A6AA 2ZF5O 1K8KB 4BR0A 1K8KA 4BVOA 5AQQA 4CZLA 1JCGA 3O6WA 3SLCA 1GLJO 3U4LA 4B1ZA 4CZJA 5F1XA 2ITMA 2VYPA 3DAWA 1IJJA 5EY4A 3TU5A 2E1ZA 5BRDA 3EKSA 1CZAN 4IJAA 1X3NA 4PL7A 5LY3A 1ATSA 4BRFA 2P9KB 5JLFA 1MWKA 5AQGA 3ULEB 5BPNA 3ULEA 2PBDA 1E4FT 4H5TA 1T6DA 5BRHA 2P9IB 4FPAA 4CI6A 4XH5A 2P9UA 4Y0WA 2QWRA 4CBWA 3WXKA 2P9PB 2P9PA 4M7YA 3ATUA 1X3MA 3ZX0A 3M6GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YKNA 4B8CA 2OTJN 4Z4EA 2KFZA 1KC8O 2A42A 4DR4K 3KLHA 1W7AA 3CYGA 3BY5A 3C6HA 3CC7N 3VPZA 4PHTX 4FJ7A 1YJ9N 5EXWA 2KW4A 1NGDA 3TSPA 5AQZA 3LDOA 1IBKK 4K41A 4EP4A 3O80A 1VSEA 2Y1IA 2QXFA 3VQ4A 2IVOA 1QQNA 1RBTA 4B1VA 1RT7A 3O3HA 3D0PA 4KREA 1NK4A 3AVGA 4OGEA 2O8EA 1LW0A 1W0HA 2P5OA 2KFNA 1L3TA 4FZXC 1ZC6A 4RTFD 3R3LA 1BUPA 4JD2B 4MLHA 3WUHA 2VWBA 2KHOA 5E26A 3GE1A 3RSEA 3VEWA 3DXKB 4O4GA 2UXCK 3AAPA 3PX4A 3VEXA 3ZLJA 2O4IA 2B5JA 3D2FA 4TSXA 2HOEA 1ZBIA 3NH0A 3TI0A 3HO1A 1NGCA 1SQKA 2HHXA 1IKWA 1CXUA 2HHTA 1SL1A 3VEOA 4JKAA 1T03A 1ZBLA 4WCEL 2E4LA 3CCUN 1W97L 4E0DA 2NRRA 4H5NA 1ASWA 5AQJA 4BC3A 4W5RA 1GLEG 3M3ZA 1NWKA 4CCHA 5TKWA 3WXMB 3SPZA 1QQOA 4DS5A 3GDQA 4LFBK 3OYIA 3ENHA 2ASPA 4EIAA 2UU9K 2GV9A 4K42A 3QMLA 3O3GA 2YNGA 5M1NA 3P1GA 1IG9A 3NBPA 3WNHA 2O8BB 1TUYA 4IO8A 1ZBUA 3NVKA 4CK2A 1T3VA 3R8EA 1JJ2M 1CLQA 2QWQA 3D6RA 2UXDK 1NMNA 4H4OA 5H1SQ 3PIOL 4LH5A 4DG1A 4FWQA 5SZTA 3AARA 4CJUA 4O44A 4XEIA 4FL9A 4FJMA 3L3UA 3NH1A 3V6DA 1VQ8N 2F7TA 3V1RA 4PKIA 4PKGA 3WNEA 1WSIA 3FE1A 4IFYA 2VG7A 1KLNA 3ZETB 4FJ5A 2HF4A 3HPOA 1U48A 3L4IA 3KKRA 4CEEA 1O13A 3CQXA 3ZEUA 3KLFA 3LDPA 3V9WA 4FWNA 1NGIA 3SPYA 2V51B 4AQYK 3F5TA 1C0UA 3TANA 5GAGP 2KTQA 1XMQK 4F4KA 4FJJA 1LCUA 2YJEA 2W6KA 3WT0A 3E9OA 4BREA 2Q0RA 4YNQA 4JN4A 1BL3A 3TTCA 3VEVA 4O5FA 1GLLO 3VGKA 2FBYA 2IC3A 4WQ5C 5I42A 1HYZA 2HBMA 4DMNA 1TAUA 2VGNA 1NNEA 3HPHA 5KRTA 1V4SA 4OKJA 4JK8A 4AHTA 1Y64A 3NDKA 5HRPA 2D5RA 1NGEA 3K5NA 4B3OA 3AA3A 4BR9A 3OS0A 1X9MA 1NM1A 3AA5X 4I6MB 1GLDG 4RW4A 5FPDA 1YJNN 4BRHA 3VQEA 1SZ2A 1JLQA 4CEOA 5JICA 4B1YB 1TKZA 2YKMA 4DV6K 4BDYA 1HJOA 1YI2N 4B1UB 3D2EB 3KIOA 1NJYA 4XIUA 4LSNA 3BF1A 3KZBA 3J80O 4CFAA 3VETA 1MWMA 1NGFA 4FVUA 2GWJA 2F4VK 3SBGA 1IO2A 3V9ZA 1CZBA 3KWIA 4CFBA 5FPEA 3DRRA 1NGHA 4CJFA 1XQSC 1CZ9A 3V9XA 4MFBA 1VQ9N 2PYJA 1T6CA 3OYBA 4F9OA 4FJLA 5GADP 1C1BA 4XH4A 3O08A 4YFUA 3OYJA 5HRSA 3H3NO 2O8BA 2IOCA 4NYFA 3OYDA 3EYZA 4BE1A 4JHDB 1VQON 3MK6A 1WLJA 1IBLK 2O8CB 1BG3A 1NKBA 5M1OA 4BRMA 2E88A 2OPRA 5KRSA 4Z4IA 4FWPA 2EWSA 3NGIA 1LWCA 5M1QA 4BRQA 1N33K 1NKEA 4CJSA 3J7YP 3L2QA 3AVKA 3H1VX 1YHQN 4E7IA 3SV3A 4IJNA 2FSJA 4DTPA 1FKOA 3B6PA 4BRPA 4WFAL 2HVHA 3TTDA 3SAHA 5B8HA 1ESVA 3LL3A 3PX6A 1IKXA 4CGFA 4W5QA 2IVPA 1SV5A 3QEVA 2O4GA 3C6UA 1DKGD 4GNIA 4C8LA 5CHIA 4JI3K 3HTVA 4FJHA 4CIFA 2X78A 1XMOK 5GAHP 3NAEA 2FXUA 3RR7A 3VENA 4FM2A 4H0OA 4E7KA 4N5SA 1RBVA 1WAJA 1MDUB 2GBZA 3LDSA 1LWEA 1WSGA 1X9JA 3AVMA 1ZYQA 3HM8A 4I2QA 3UKRB 4E1JA 1DEJA 4CGIA 5F0XA 3UKUA 1VK0A 4FYDA 2VGMA 3LZJA 4FLTA 2Q97A 3AVJA 2ASMA 1HRHA 1NOYA 3WQUA 4FPBA 3VQBA 2W6LA 2DTUA 4JK7A 4NCGA 2RKIA 3CCRN 1G15A 1U04A 3DLBA 1MA9B 1RDBA 4FK2A 1YAGA 4N56A 3CXCM 3OYFA 3QETA 3CD6N 1KAXA 3THVA 2FBVA 5BN8A 4DU3A 4ELUA 1S6PA 4M3WA 1GLBG 3ENOA 2PZSA 2KLAA 4LF4K 2V7YA 3O5BA 3QBWA 3AY9A 5HOOA 1RT1A 1NGJA 4JRQA 3MXMA 4IKFA 1RFQA 3MEDA 3EN9A 4CBUA 4DHYA 3ZSRA 3IRXA 1YT3A 1RDDA 3SAGA 4BRLA 1XC3A 4GV3A 3VQQA 1VRUA 3HI0A 3GOIA 2ETJA 2FSKA 4DV0K 4ILGB 3MEEA 4NXNK 2HHVA 5BREA 4JHDA 1ZBHA 4BWMA 3MN9A 3MWPA 1N6QA 3Q7CA 2O8CA 1K6YA 3TR8A 1Q18A 5CYMA 1K8AO 5JLHA 1VRTA 4BGBA 4CJTA 1ASVA 4IBNA 4GV6A 2A6AA 4BR0A 4I9QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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