3WEEA

Structure of the full-length yeast arp7-arp9 heterodimer
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
462
structure length
425
Chain Sequence
QDSILIIYPRSQTTLVQFGLNEETFTVPELEIPTQIYRTTRQDGSYTYHSTNKDNKAELIKPIQNGEIIDISAFTQFLRLIFVSILSDRSNIPLLLITHHSWSQSDLEIITQYVFESLEINNLIQLPASLAATYSMISLQNCIIDVGTHHTDIIPIVDYAQLDHLVSSIPMGGQSINDSLKKLLPQWDDDQIESLKKSPIFEVLSDDAKKLSSFDFGDEGTLNVAEIITSGRNVKNSDLEFNTFWDEKGNEIKVGKQRFQGNNLIKNISNRVGLTLDNIDDINKAKAVWENIIIVGGTTSISGFKEALLGQLLKDHLIIEPEEEKSKREEEAKSVLPAATKKKSKFMTNSTAFVPTIEYVQPTVIKLAKYPDYFPEWKKSGYSEIIFLGAQIVSKQIFTHPKDTFYITREKYNMKGPAALWDVQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Actin-like protein ARP9
publication title Structure of the full-length yeast Arp7-Arp9 heterodimer
doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 111
structure length 425
sequence length 462
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3weeA01
3.90.640.60 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3weeA03
1CZAN 3A5NC 1JCEA 3DXMA 2IIRA 5AFUH 4CZMA 5BPNA 3MN7A 2AP1A 3R8EA 2P9UB 4GY2B 5KQ8A 4B9QA 1RGIA 3CJ7A 3UKRA 3ATUA 2D0PA 3BF3A 4FPAA 1DGKN 1WOQA 4BGBA 2Q31A 5KPZA 3DXKA 2YHYA 2VWBA 1JCGA 5E26A 4MO4A 3A5MC 4A61A 3DXMB 5AQHA 2IVNA 4H5TA 5FPNA 2Q2RA 4BRPA 2Q1NA 3SLCA 3FZMA 4NO7A 2A5XA 5AQLA 4GNIA 4A2BA 3LM9A 5FPMA 2HF3A 2E2QA 4H0TB 4FO0A 5I9EB 3UKRB 4PKIA 4BRIA 1QQOA 3CIPA 3VEOA 1GLDG 5E84A 3DXKB 4JD2A 4BRGA 3L4IA 3FLCO 1BWFO 5AZJA 2PAVA 3CQYA 2E8AA 5AQYA 4M63C 3H46O 4CZIA 2QWRA 3I8BA 3H3NO 1HLUA 4PL7A 3F9MA 4I6MA 1C0FA 4IO8A 2YCHA 4JN4A 3HTVA 1QHAA 4Y0WA 1TYQA 2GUPA 1LCUA 4KBOA 1X3MA 4NB4A 3GE1A 3VEZA 2P9KA 3JS6A 3FFKB 3MDQA 4JD2B 4PKGA 3U8XA 2A42A 2UYTA 4C23A 1ESVA 4H5NA 3A0IX 4FWRA 3RSEA 5AQGA 3FR0A 3O80A 5AZJB 4QS7A 5EOYA 4FWOA 3O8MA 4K25A 3M1FA 3IUCA 1NGHA 3SJHA 4CBXA 3TU5A 1BG3A 4XH4A 4BR0A 2YJFA 4QS8A 4I6MB 3D2FA 3OHRA 3R9PA 4CBWA 4HWIA 1R59O 3WXIA 4B1ZA 1TYQB 2GTDA 2Q97A 4BG8A 2QM1A 5FPEA 2D1KA 1HPMA 1MDUB 2P9KB 3LDOA 4CD3A 4BROA 2HOEA 1GLLO 5BN8A 2QW9A 3ZEUA 5JLHA 1OKJA 4BC2A 3KHYA 2FF6A 3O4WA 3RSEB 4E1JA 5AQVA 5AQWA 4AM7A 3WXJA 5AQQA 4DHYA 3A5LC 2ZGZA 5AZIA 2V52B 1NGJA 3UB5A 2PBDA 3D2FB 3AAQA 3ZX3A 4H0OA 3J8AA 5AQMA 3BUZB 4PL8A 1C0GA 1ATRA 5FPDA 4XEIA 4XH5A 4BRNA 5AQSA 1Q18A 3O1WA 4FWKA 3CJCA 3ZEUB 2BTFA 4B1YB 3FE1A 1HUXA 4MLHA 1YVNA 2Q0RA 3MN5A 4BRDA 4RWTA 4ISGA 3LDPA 3QMLA 2IVPA 4BRKA 4CJ7A 5AZIB 2EWSA 2NLXA 5LJVA 4FOIA 3D2EA 4HTLA 3VF6A 3VEVA 3HZ6A 4O8KA 5KQDA 1NBWA 2BUPA 2YI1A 1XQSC 2QWPA 4BC4A 4H5RA 3BEXA 4O5FA 3CHWA 2ZF5O 1BUPA 1IJJA 4FWMA 2QWLA 4BR2A 3WQTA 2A41A 3CJAA 3DAWA 4K42A 4BC3A 4FWSA 2E2NA 3GBTA 2E1YA 4WQ5A 5AQIA 3EN9A 4WQ5C 1LOTB 2DPNA 4B1VA 4IWVA 5AQNA 1NGIA 4CD1A 5BPLA 2CH5A 2Q36A 4BQZA 1YXQA 3D2EB 3VETA 1J6ZA 2E88A 5TKYA 3H1VX 1Z05A 1GLCG 3EKUA 4DQ8A 1YUWA 1ZBSA 1E4FT 4BRAA 3ZX0A 1E4GT 5JICA 3FZKA 3TPQA 4CI6A 1BU6O 3S41A 2CGLA 2OANA 3MMVA 2NZTA 1NGAA 3VGLA 5BRHA 3IFRA 3G25A 5AQTA 3VPZA 5BPMA 1G99A 4M7YA 5AQOA 3QFUA 3R6MA 1EQYA 1NGCA 3D7EO 3KZBA 5JLFA 4IXCA 1T6CA 4EHTA 2V51B 3O1BA 3VESA 4BR5A 4BQLA 4IJNA 2AA4A 3MCPA 2CGKA 1X9JA 1NWKA 1BA0A 4EHUA 3AARA 2CGJA 3O08A 2ZGYA 4BVPA 1U6ZA 1TUYA 3B8AX 1KXPA 3GOIA 4B1XB 4B1WB 1BDGA 1MWKA 2FXUA 2VCPA 3SMSA 4DCHA 3O5BA 2P9NA 3BF1A 2E2OA 3EZWA 3VF2A 4FWNA 4BRLA 3W3DA 5F0XA 1BO5O 3VF4A 3VENA 1NGGA 4PKHA 3CJ1A 3C0BA 2VYPA 5AQJA 2FSNA 2QXLA 3AY9A 2GELA 2P9SA 5AQRA 1YAGA 3WEEA 2YJEA 1ATSA 4FOEA 4M7XA 3VEXA 1NMDA 2F9WA 2ITMA 3O6WA 4BC5A 1BA1A 2A3ZA 3DWLA 2W40A 2P9NB 4DB3A 1MA9B 1QZ6A 4IZ9A 1QQMA 3W0LA 4Z94A 3FZFA 4A62A 4BRQA 1Y64A 1HKCA 5AQFA 4CZEA 3ATVA 3BP8A 2GWJA 3MK6A 5AQZA 1HKGA 3QDKA 5ADXA 4ISEA 5EY4A 1SAZA 4BR4A 2P9SB 3QFPA 3WEEB 2YHWA 3CJ9A 3I33A 4JNEA 3WXKA 1HJOA 1BOTO 1KAYA 1TUUA 4H0VB 1D4XA 3ULEA 5CE3A 4FPBA 3U9ZA 3IMXA 4F9OA 1KAXA 5BN9A 1GLBG 2GWKA 1RDWX 3WQUA 4H0PA 2P9PA 2V7YA 1XC3A 2P9LA 3UKUA 4YDUA 5AQPA 2FSKA 3GG4A 3LM2A 4MO5A 4YDUC 3QICA 1P8ZA 1NLVA 3U9DA 3H45C 1K8KA 3HSCA 1NGBA 3C7NA 5EXWA 4JHDA 3LDLA 5AQUA 5JMVA 4BR7A 4QS9A 5AQXA 3WXLA 3ULEB 5F2RA 3ZETA 3LDNA 5KPRA 2F9TA 2W41A 4J8FA 1RFQA 4MLEA 3WT0A 3KVGA 2E2PA 3VGMA 4CZJA 3VGKA 1GLFO 2H3GX 2P9PB 2WUSA 4IJAA 2P9LB 2E1ZA 3UKUB 4CBUA 3EO3A 1SQKA 3HM8A 2ASMA 4CZFA 3SK3A 1HKBA 1MWMA 3FGUA 2KHOA 3VERA 3VOVA 3WUHA 3U4LA 1K8KB 4CZLA 1V4TA 4CZGA 3C7NB 2GEMA 4JHDB 5EX5A 1NGFA 4AM6A 3M3ZA 3ZETB 4BGAA 2D0OA 4BG9A 1QQNA 5ELZA 5LY3A 1T44A 4BREA 1H1VA 1XUPO 2IVOA 2E20A 4ISFA 4BR9A 1ATNA 4H5VA 3SMPA 4A2AA 3GDQA 3FZHA 4H0YB 4K41A 3QBXA 2D4WA 5AFUA 2HMPA 1T6DA 4FWLA 5ADXH 4XH1A 5B8HA 5BRFA 3UE5A 4FWPA 4WYBA 1ZC6A 2I7NA 3LDQA 1DKGD 3EKSA 3EL2A 4JAXA 4BRHA 3QB0A 2ASPA 3CERA 1S3XA 2FSJA 5LJWA 1WUAA 1X3NA 2V7ZA 3CETA 1V4SA 3DJCA 5EVZA 2FF3B 4BRCA 3H1QA 1NGDA 4EAHD 4CZKA 1HX1A 3LL3A 1DEJA 3VEYA 4LC9B 1SZ2A 4H03B 4WQ4A 3HBTA 5KPTA 4WQ4C 4K43A 4L3QA 2CH6A 3A8YA 4H5WA 4RTFD 3VEWA 4CZHA 5BREA 3L6QA 1NM1A 3CI5A 2P9IA 1Z6RA 1S22A 4H0XB 3HI0A 3MN6A 3ID8A 1U2VA 2J4RA 1GLJO 1GLAG 4FL9A 1NGEA 3A5OC 5BRDA 2FLOA 2Q0UA 3AAPA 4BVOA 3L0QA 2I7PA 3P4IA 2ASOA 2YHXA 1JCFA 2NRHA 4RCHA 4FSVA 1ZXOA 3H6EA 3CQXA 1IG8A 3QBWA 3IDHA 5AQKA 2QWNA 1GLEG 2A40A 2A6AA 3ENHA 3H3OB 3ZX2A 2P9UA 2QWOA 5AR0A 4BRFA 2ZWHA 2HF4A 2P9IB 3MN9A 4BRMA 5BR9A 3M6GA 2QWMA 4B1UB 4EFHA 3JXUA 1U2VB 3GL1A 1QZ5A 4FWQA 3ENOA 4EIAA 1KAZA 3FZLA 5F1XA 2QWQA 3CJBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5SWMA 1SKSA 4IEIA 4CZMA 2HHVA 2XO7A 5BPNA 4DG1A 3OYBA 2P9UB 3VN5A 5KQ8A 1RGIA 2DFHA 3L4QA 1BCMA 3M8PA 4DV7K 1U47A 2YHYA 3TANA 3VQ8A 1CZ9A 4BE2A 5E26A 2B5JA 2IAJA 3OYKA 4JKCA 3DXMB 1BIZA 3V9ZA 4H5TA 5FRMA 3VQ7A 2Q2RA 3SLCA 3FZMA 4NO7A 3E9PA 4CCHA 3NHGA 3SZ2A 4E7JA 2UU9K 3RMCA 4B9TA 4FO0A 1QVGM 4CIGA 1JL2A 4FJ8A 3P1GA 1QQOA 3VQ5A 4BRGA 1BQMA 3FLCO 3AO4A 5GAHP 3LALA 1BWFO 3VQPA 4DR3K 1HNZK 5AZJA 4FM0A 2PAVA 3CCQN 5KGXA 3WNEA 3H46O 1UA0A 2HHSA 2QWRA 4JI0K 1T8EA 4K8ZA 1C0UA 4BWJA 2RKIA 2YCHA 3O9SA 1WN7A 2GUPA 3R1XA 4FJLA 4YOVA 3FFKB 4JD2B 4KH6A 4CEBA 5C42A 4CJVA 4HUEA 4H5NA 3A0IX 5HRPA 4F3OA 4QS7A 1KVAA 3L3UA 1S5JA 4Z0UA 3HP6A 2G8FA 4BR0A 4DV1K 3MEEA 4RW6A 1NG9A 3B6OA 4E1MA 2NNWA 3R9PA 4OKEA 1IKYA 2Y1JA 5JENA 3CPEA 4B1ZA 2G8WA 2BDPA 2GTDA 2Q97A 3AO5A 4BG8A 1X9SA 3E9OA 5C2DA 2P9KB 5BN8A 1GLLO 3HP9A 2ETJA 5AQVA 5CYQA 4DS4A 3J7AP 4DHYA 4A59A 3PUFA 1IO2A 4IFVA 5AZIA 3UB5A 1K6YA 1JLGA 2XY8A 3K5LA 4HTUA 4KV8A 3J8AA 4KHPK 5FPDA 2ZE2A 3U3GA 4XH5A 3Q7CA 4PHTX 2HHTA 1VQ7N 3SAFA 2HHWA 3FE1A 4KH4A 3PLAA 4ISGA 3U6FA 3TAQA 3CF5L 3LDPA 3QMLA 1RTJA 3NCIA 4DTXA 3LPUA 4JKHA 5LJVA 3K2PA 3V1QA 3AO1A 5J2QA 2YI1A 1XQSC 2QWPA 2F7TA 2LSNA 4BC4A 1XHZA 4B9VA 5IT9O 3CHWA 2ZF5O 4FWMA 1QSYA 1B9DA 3MXMA 4UY8O 5AQIA 4WQ5C 2OZSA 1NJYA 2O8EA 4E72A 2CH5A 2D0AA 2Q36A 1NU0A 4QCLA 1RTHA 3CYMA 1WB9A 2ZQBA 3NH2A 1Q86O 2YV0X 4Z4HA 3L2RA 1S1WA 4M3WA 1GLCG 3EKUA 1XWLA 1ZBUA 4HUGA 1YUWA 2HBLA 4H8KA 3PX4A 4PUOA 1E4GT 5JICA 3FZKA 2BANA 3WNGA 3TTFA 4CI6A 5GAEP 2CGLA 2OANA 4CJRA 2DTUA 3VGLA 1VQ4N 2W42A 1D8YA 1G99A 1FJGK 3C6AA 3VMFB 1EQYA 5E41A 1T6CA 4EHTA 1XMQK 4YY3K 2NRVA 4BR5A 4BQLA 2AA4A 4F3TA 4DUZK 1BL3A 2ZGYA 1S72N 1SS6A 1IV0A 4FJNA 3F73A 2OCEA 1BDGA 3SMSA 3CCVN 4F4KA 3EZWA 4BRLA 1VQNN 1BO5O 1NJWA 2QEXN 2UXDK 3VENA 3DI6A 4FJMA 1T05A 5AQJA 2FSNA 4BWMA 3MWPA 1YAGA 4DV2K 4OLBA 4DR6K 1O13A 1NMDA 3NGIA 2ITMA 5I3UA 3O6WA 1RTDA 3K5NA 4DFMA 2A3ZA 1TKZA 3TAGA 3THVA 1N32K 4DB3A 1Y64A 4CZEA 4K0KK 3ATVA 3AVKA 3MK6A 3U3YA 4B9SA 2HHXA 3MX5A 1RCHA 3QDKA 4B3TK 4OPHA 5GADP 1HYSA 2P9SB 3QFPA 3OYMA 3WEEB 2YHWA 3CJ9A 4E7KA 4ELVA 5CE3A 3PSIA 3QO9A 4FPBA 4JYAK 4CHZA 1WNSA 3IMXA 3NGYA 5CHIA 2GWKA 3SQ4A 4OJRA 4AILC 3WQUA 4O44A 1XC3A 3UKUA 2FC0A 4JRQA 1W97L 3VA3A 3NF6A 1LWEA 3QICA 3TABA 5K14A 2RE2A 4JS5A 4BE1A 3AVNA 4NXNK 3HM9A 5TKWA 2ATQA 3H45C 1NGBA 3C7NA 5JMVA 5JVHL 3PIOL 4JI7K 4W5QA 3ULEB 5F2RA 3ZETA 1XHXA 3LDNA 4KHUA 5KPRA 4M41A 4YNQA 5M1OA 2E2PA 4C1NK 1ASWA 1ZBLA 3DLKA 1J53A 4KTZA 2P9PB 1U4BA 4IJAA 3THXB 4CF0A 2JGUA 2X74A 2ASMA 1DLOA 1LAVA 3VQ6A 3VERA 3SUPA 1P90A 3G10A 3RMAA 1X9MA 1E3MA 4OGCA 3KWGA 5ELZA 4BREA 1IBLK 4CGIA 1C6VA 4XIUA 3HO1A 5HRNA 2JLEA 3ZT3A 4CEEA 1LW0A 3SMPA 3GDQA 3FZHA 4R5PA 3Q7BA 1W7AA 4CW7B 3AA3A 1S1XA 1T6DA 1VHXA 2YNGA 5B8HA 1DTQA 2VGMA 3LDQA 3THWB 1DKGD 4RW4A 3QB0A 3S3NA 2ASPA 1S3XA 2HNDA 4GV6A 5CYMA 1X3NA 1FKPA 3CETA 5HP1A 3LP3A 5EVZA 4CJWA 3EYZA 5HROA 4DFJA 3I0RA 1FKOA 3KTQA 4MFBA 3H1QA 1NGDA 4KB1A 2NRRA 2PYJA 4CZKA 3KLFA 3LL3A 3CCMN 1S6QA 4LC9B 4IOXA 3J80O 1JXBA 1VAZA 4H03B 2FBXA 3LP1A 4CIFA 4L3QA 3VEWA 1VRTA 4RTFD 2OZMA 5T7BA 1S22A 3TWHA 1GLJO 2RN2A 3SV4A 3B6PA 2Q3SA 4CK3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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