4CBUA

Crystal structure of plasmodium falciparum actin i
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
365
structure length
357
Chain Sequence
EDVQALVVDNGSGNVKAGVAGDDAPRSVFPSIVGRPKNPKDAFVGDEAQTKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRAAPEEHPVLLTEAPLNPKGNRERMTQIMFESFNVPAMYVAIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTEYLMKILHERGYGFSTSAEKEIVRDIKEKLCYIALNFDEEMKTSEQSSDIEKSYELPDGNIITVGNERFRCPEALFQPSFLGKEAAGIHTTTFNSIKKCDVDIRKDLYGNIVLSGGTTMYEGIGERLTRDITTLAPSTMKIKVVAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQQMWITKEEYDESGP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Motor protein
molecule keywords ACTIN-1
publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 119
structure length 357
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbuA03
3SMSA 3BF1A 3WXIA 5CE3A 4IXCA 2QWOA 3ULEB 1U2VB 3MMVA 1HKGA 2Q36A 4CI6A 3EKUA 4F9OA 3A5OC 5BRFA 4JN4A 4CBWA 1XC3A 3B8AX 2F9TA 4IJAA 3ENHA 3HSCA 1QQMA 3EKSA 1GLCG 4BGBA 2NRHA 4IO8A 5AQNA 3LDOA 5LY3A 2KHOA 4B1XB 4CZJA 3CJBA 4H0PA 1S3XA 1ATNA 5AFUH 4EHUA 3H45C 4BC3A 5BPNA 1NGDA 2QWQA 3CJAA 4QS7A 4PKGA 1ATSA 4QS8A 3C0BA 5JLHA 1ZBSA 3MN6A 4KBOA 3VEVA 4BC5A 4BR4A 2A3ZA 1C0FA 3EZWA 1BWFO 1X9JA 4BR7A 3BEXA 5AQFA 5AQYA 3DXKB 3FZKA 2BTFA 5BREA 2D0OA 3U4LA 4JHDA 1HKBA 1NGGA 4ISEA 2P9KB 1MA9B 1IJJA 2IIRA 1LOTB 3BF3A 4J8FA 5FPDA 4B9QA 2YCHA 3OHRA 3MN5A 1U6ZA 4CD1A 1K8KA 2P9LA 3AAQA 5E84A 2Q0UA 1NGEA 2HMPA 3SMPA 3UKRB 4C23A 2CH5A 1TUYA 4K42A 1SZ2A 3A8YA 4M63C 4BG9A 5F0XA 1CZAN 1S22A 2CH6A 1G99A 4FWPA 3UE5A 1OKJA 1XUPO 1HUXA 2ZWHA 4H03B 1NGFA 4MLEA 4CZMA 1GLBG 3U9ZA 5AFUA 2E20A 4NO7A 3VENA 2VYPA 3QBXA 3VOVA 3DXMB 2YHXA 4FWSA 3R6MA 1QHAA 5KPTA 3H3NO 4CBUA 3WUHA 3ENOA 4FWOA 3ZX2A 2P9UB 4DCHA 1NMDA 3GL1A 4H5WA 3W3DA 2F9WA 2UYTA 3O08A 3VGKA 1H1VA 2HF4A 5EXWA 3DWLA 3HI0A 3O6WA 1P8ZA 5F2RA 1Z6RA 4H5NA 1QZ6A 3ZEUA 5AQIA 3TU5A 1NGJA 4BR9A 1RGIA 5ELZA 2HOEA 4BRLA 1R59O 1TYQB 4FPBA 2HF3A 2A40A 4I6MA 3WXKA 3WQTA 5BRHA 3D2FA 4O8KA 2E2NA 5AQOA 3L6QA 1YXQA 2IVPA 1T6CA 4FPAA 2P9NA 3EN9A 5AQMA 3TPQA 4FOEA 1SQKA 4BRIA 3UKUA 1BOTO 2ZGYA 2V7YA 1ATRA 4K41A 4BRNA 2GTDA 4LC9B 3WEEB 4BRCA 4MLHA 1QZ5A 4BGAA 4BC2A 3DAWA 4IJNA 2P9SB 3FZHA 2YJEA 4A2BA 4FWMA 4DB3A 2ASMA 5AQXA 3VGMA 1NLVA 4A62A 4EFHA 3ZETB 4BRPA 3WXJA 3M3ZA 4CZHA 3O1WA 2QM1A 4CZKA 3JS6A 2OANA 3GOIA 3A5MC 2DPNA 1U2VA 2E8AA 3QDKA 2ZF5O 2YHYA 1QQOA 1KXPA 4WYBA 5E26A 4XEIA 2PAVA 3IFRA 2NZTA 1KAZA 2J4RA 3A0IX 4PKIA 3GG4A 4XH4A 4WQ4A 4BRQA 3MN7A 2QWLA 2GWJA 4FSVA 4ISFA 1ZXOA 4PL8A 2E2PA 1E4GT 2E2OA 4H5TA 2P9IA 4CJ7A 2ZGZA 5BPMA 4H5VA 3QB0A 4BVPA 1GLAG 2GEMA 2W41A 5AZIB 2FSKA 1GLLO 1EQYA 5BN8A 4BRHA 3I8BA 3C7NA 3MCPA 2V52B 5AQJA 5KPRA 3CHWA 1V4SA 2WUSA 5EVZA 1MDUB 2CGLA 3D2EA 3I33A 4JHDB 4YDUA 3MDQA 2FSJA 1DKGD 2P9KA 1ZC6A 2BUPA 3L4IA 3VEZA 4XH1A 5BRDA 1NGAA 5LJVA 3P4IA 3VF4A 2QWPA 1X3NA 3AAPA 4MO4A 4BROA 2P9LB 2GELA 4M7YA 3EO3A 5F1XA 2AA4A 3VETA 2QW9A 4JNEA 4IWVA 3ZX0A 3H3OB 3QFPA 1BU6O 2QWMA 3CERA 3FZFA 3HTVA 1RFQA 5AQVA 3L0QA 5I9EB 3O1BA 1GLEG 2VCPA 4JAXA 3W0LA 3HM8A 3KVGA 4FWKA 3G25A 1DEJA 5AQKA 5FPEA 4H0VB 3DXMA 4PKHA 3CJCA 2GUPA 3CQYA 5JLFA 3U9DA 1BDGA 3H1VX 2GWKA 3IDHA 1T44A 2IVOA 4H0YB 3UB5A 2VWBA 5EY4A 4BQLA 1X3MA 2D0PA 2Q2RA 5AQPA 3GE1A 1HLUA 2P9UA 3MK6A 1BA1A 3LDNA 4Z94A 2FXUA 2I7PA 4MO5A 3LM9A 3VGLA 1NGCA 3QMLA 3ATVA 4BVOA 1BO5O 4B1YB 1NGHA 4JD2A 5AQSA 1JCGA 1HKCA 2QWRA 2Q1NA 4IZ9A 4FO0A 4BREA 3BP8A 2P9PB 2QWNA 3ZX3A 3CJ9A 2QXLA 3LDQA 4BC4A 3FFKB 3FLCO 3RSEB 2E2QA 4I6MB 1TYQA 1HPMA 3A5NC 2YJFA 2ASPA 4FOIA 1QQNA 3D2FB 1YUWA 3S41A 4EIAA 5AZJA 5B8HA 3R8EA 2P9NB 2E1ZA 1ESVA 1BUPA 4BRGA 2Q0RA 1J6ZA 1JCEA 1LCUA 3WEEA 2A5XA 4RCHA 3VESA 2Q31A 3LL3A 5AQGA 4WQ4C 4FWNA 3VF6A 3GDQA 4WQ5A 4FL9A 4CZGA 3ULEA 4BRDA 5BPLA 4BRKA 3ZETA 2YHWA 3IMXA 3ATUA 1MWKA 4B1VA 3H1QA 3BUZB 4NB4A 3VEWA 3O4WA 3KZBA 4BR2A 2V7ZA 3LM2A 4RTFD 3AY9A 4EHTA 2ASOA 2V51B 3WQUA 1NBWA 4Y0WA 5AQRA 4BRFA 1D4XA 4QS9A 1E4FT 1MWMA 4FWRA 2CGJA 3MN9A 5AQQA 3VPZA 4H0OA 4YDUC 4GNIA 1SAZA 2ITMA 4B1UB 1WOQA 3O8MA 3VEXA 1Z05A 4CZIA 1WUAA 3HZ6A 2E1YA 3LDPA 2PBDA 4FWQA 4B1ZA 3CIPA 3KHYA 5KPZA 3O80A 2P9IB 5TKYA 3DXKA 3SJHA 2I7NA 2W40A 5FPMA 3CQXA 2Q97A 5AZIA 3R9PA 4B1WB 1YAGA 4O5FA 3VERA 1JCFA 4H0TB 4CZEA 2CGKA 3C7NB 3GBTA 4XH5A 3U8XA 1IG8A 4BR0A 5AQZA 1XQSC 3D2EB 1NGBA 4H0XB 4AM6A 2NLXA 3M6GA 1K8KB 2FF3B 2A41A 1Y64A 4A61A 4CBXA 2A42A 3DJCA 3UKRA 3F9MA 4DQ8A 5BR9A 1BG3A 3FZLA 1TUUA 2FLOA 5LJWA 4AM7A 3QFUA 5EOYA 4ISGA 4K43A 4E1JA 3FR0A 5ADXH 3FZMA 4BRAA 3CETA 1YVNA 3QBWA 5FPNA 1NWKA 4DHYA 4EAHD 2EWSA 2FSNA 4BG8A 1KAXA 3WT0A 3VF2A 1T6DA 3A5LC 4BR5A 3QICA 4BRMA 1Q18A 3D7EO 2H3GX 3SK3A 3H6EA 5AQLA 4CD3A 1NM1A 3ID8A 3LDLA 5AR0A 4K25A 3VEYA 1NGIA 4H5RA 5AQHA 5AQWA 2FF6A 3CJ1A 3HBTA 5KQDA 3SLCA 3FGUA 5BN9A 3M1FA 3EL2A 3ZEUB 1BA0A 3CJ7A 4CZLA 1V4TA 1HX1A 2D1KA 2IVNA 2E88A 4HWIA 3AARA 5AQTA 4A2AA 4JD2B 3J8AA 4RWTA 5AQUA 4WQ5C 1GLDG 1C0GA 1HJOA 5ADXA 2YI1A 2P9PA 2A6AA 5EX5A 3UKUB 5JICA 3O5BA 3RSEA 1KAYA 1GLFO 4L3QA 2AP1A 1RDWX 4BQZA 3IUCA 3CI5A 4HTLA 5AZJB 5KQ8A 3WXLA 1DGKN 1GLJO 3H46O 4CZFA 3FE1A 2P9SA 4FWLA 4GY2B 5JMVA 4M7XA 3VEOA 3JXUA 2D4WA 4PL7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D45A 3SMSA 3SUQA 1HYSA 3QNNA 4IXCA 3HK2A 1XNRK 3U3GA 4CGHA 4IOCL 1U2VB 3HP6A 4FVUA 2NRTA 4OPAA 5JENA 3ALYA 5BRFA 4DF4A 1IBLK 4FLWA 4JN4A 5GINA 4BE2A 3AV9A 5C42A 1Z26A 1JXBA 3N4PA 4JK8A 2O4IA 3HSCA 3EKSA 2D0CA 4LSLA 1JLAA 4BGBA 4F3OA 4IO8A 5AQNA 3DRSA 2KHOA 3E1YA 1N8RO 4CEQA 1RT6A 4H0PA 1S3XA 1ATNA 3IKMA 4YY3K 2YNHA 4OVLA 2E6LA 4AHSA 3CJAA 4PKGA 2A1SA 5FLXO 2OPSA 3RR7A 5JLHA 1ZBSA 3CC2N 3OBYA 2X6SA 4BR4A 4KKOA 1LWFA 4CF1A 2G8HA 1BL3A 1BWFO 2GBZA 2IGIA 3ZSZA 1XC9A 2D0OA 2Z1JA 3DYAA 3U4LA 3EY1A 1XMQK 1JLEA 4ISEA 1P90A 2P9KB 4O0JA 1IJJA 2DFFA 4JKCA 4AHRA 4B9QA 3H08A 3OHRA 4HUGA 3V9XA 4ILJA 3BDPA 1BQNA 1K8KA 3AO5A 5E84A 4KHWA 1JJ2M 3QO9A 3AVCA 1TUYA 2O8CB 4BG9A 3KD1E 3SBGA 1J54A 4CF0A 2CH6A 4QAGA 4DG1A 4A5AA 2F4VK 3OYDA 1D9DA 1GLBG 2VQFK 3U9ZA 5AFUA 3SQ0A 3IRXA 4FLXA 2VYPA 1WBBA 5DMRA 2YHXA 4CJRA 2ZJRL 4DTPA 4JKBA 5KPTA 3THYA 2UXDK 5HLFA 2G8IA 4FWOA 3O9QA 1LW0A 2KQ2A 2P9UB 3IG1A 4DCHA 3GL1A 3SQ2A 3IAYA 2UYTA 3O08A 1H1VA 4O4GA 1VQ7N 4CJVA 2QEXN 4BDYA 4FZZA 1P8ZA 1Z6RA 3HJFA 4DFMA 4X66K 4H5NA 2BGGA 2WTUA 3CCSN 1TAUA 2KZZA 1XI1A 4E89A 5AQIA 3NHGA 3TU5A 1NGJA 3SUNA 2HOEA 4BRLA 4KRFA 2HF3A 2A40A 4W5NA 5AQOA 5KRTA 5GAHP 1LAVA 5AQMA 1XMOK 3TPQA 1E3MA 1SQKA 3VQCA 4BECA 1TKTA 3UKUA 2ZGYA 1C1AA 4K41A 2QI2A 3OYKA 2FBVA 3WEEB 1RT4A 4ILGB 3KIOA 4BGAA 5GIPA 4BC2A 4DSKA 2ZM6K 3CFRA 1VSDA 4GKKK 3CCLN 5AQXA 4FK4A 4A62A 3TTDA 4FM2A 4CHQA 4DR6K 1DTTA 1BI4B 1RTDA 2HVIA 2OANA 3GOIA 2HHIA 3HPOA 1VQ5N 3A5MC 4OKKA 1U2VA 2D0BA 5CR4A 3QDKA 2ZF5O 1QQOA 4WYBA 5JS1A 3IFRA 3K5MA 3RR8A 3A0IX 5FRMA 4PKIA 4XH4A 1C1CA 4WQ4A 4DV5K 4Z4EA 3L3VA 3MN7A 2FBYA 3OYJA 2QWLA 3UIQA 4RW4A 4PL8A 2E2PA 1SKRA 4OLAA 2E2OA 3VQ7A 4A57A 5BPMA 4H4OA 4ZHRA 3K58A 4FJ5A 2VGMA 5AZIB 1GLLO 3SQ4A 2E4LA 5HRSA 4Z4GA 4OGCA 4JKDA 3WXMB 4OJRA 3CHWA 5EVZA 1MDUB 2CGLA 4JHDB 3DLGA 1EETA 4JYAK 4X65K 2P9KA 4PA1A 1Q81O 2HNYA 3L4IA 2HHXA 3AA5X 5BRDA 1WAJA 5LJVA 3VF4A 4E0DA 1NK5A 5HOOA 3CYGA 2UU9K 1TL3A 4M7YA 4DV6K 3EO3A 3O4QA 2AA4A 1S6QA 3VETA 4CHPA 1RBRA 3ZX0A 3S3NA 4DV4K 4IOXA 2O8CA 3ZT2A 2QWMA 4CEBA 3CERA 1U47A 4O5BA 5AQVA 4Y1DA 3O1BA 4DFKA 1GLEG 4Z4CA 3G25A 3NF8A 2OYQA 5EY4A 4ICLA 3GE1A 2P9UA 4JV5K 1TV6A 2FXUA 2I7PA 2HHWA 1NGCA 1RDDA 3FFIA 2VG7A 1JLCA 4BVOA 4KI6A 1BO5O 3AVGA 1NGHA 4JD2A 1TK5A 2QWRA 3K2PA 1NNEA 3MECA 2OTJN 3AGKA 2O8FB 4F2RA 4JKHA 1WSGA 4MDAA 2Y1JA 3CJ9A 2E2QA 3KLHA 3A5NC 2ASPA 4FOIA 4UY8O 4CJQA 4F2SA 3HVTA 2E1ZA 4BWMA 1ZBUA 1D5AA 1VQ9N 4CHYA 1EKEA 4FW2A 3WEEA 2A5XA 4RCHA 3VESA 3CCUN 1K6YA 3VF6A 3QEVA 5BR8K 4DQIA 4BRKA 1IKYA 3V9SA 5IT9O 4NB4A 1BI4A 3LALA 3O4WA 1K8AO 2V7ZA 3AY9A 3I55N 3WQUA 3U3YA 4A5BA 4E1NA 3ENBA 3E9LA 1D4XA 1E4FT 4FWRA 5AQQA 3TI0A 1GOBA 3VPZA 2ITMA 3CCJN 4IFYA 3VQ5A 3VEXA 1Z05A 2XY7A 1X9SA 3LDSA 1NU0A 2E1YA 3LDPA 1J9AA 1FKPA 4FLTA 2YX6A 3AVNA 4GKJK 2ATQA 3DXKA 3KLFA 3O3GA 4DUZK 5AZIA 4PWDA 1YAGA 4CZEA 1RBUA 4IG3A 4JI3K 2X6NA 3GBTA 1VQMN 4H8KA 4BR0A 5AQZA 4AHUA 4JLHA 2PZSA 3R1XA 2F7TA 4AM6A 3M6GA 2A41A 3UKRA 1OH5A 2NRWA 3I56N 4DR2K 1TUUA 3QFUA 4HCBA 4KHPK 4DR5K 3SPZA 3K0SA 4ISGA 3ZT4A 4E1JA 1Q82O 4FVMA 3LANA 1ZBIA 3KWGA 4EAHD 4BG8A 1KFDA 2NRZA 4DQSA 5J2MA 5HRNA 4E7IA 5DM7L 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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