4CZLA

C. crescentus mreb, monomeric, adp
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
339
structure length
333
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPADGEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELADDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLESTLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
total genus 100
structure length 333
sequence length 339
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czlA03
3LDQA 1GLAG 1IG8A 5AQMA 5AZIA 2OANA 5FPNA 4FSVA 2P9LB 3FR0A 2QWQA 2ZGZA 5ELZA 4F9OA 3D2EB 3VPZA 5BN9A 2GUPA 4H0PA 1JCGA 2BUPA 3VERA 2GELA 3QDKA 4K41A 5KQDA 2GTDA 3HZ6A 3S41A 2I7PA 3O08A 3O5BA 1V4TA 1CZAN 3QMLA 5ADXH 4K25A 3WXLA 1Q18A 1K8KB 2F9WA 3H3OB 2F9TA 5AZJA 5EVZA 2QWOA 3VF4A 1JCEA 3GE1A 3SJHA 2ZGYA 3UKUA 2Q36A 4XH4A 4B1UB 1RDWX 3VF2A 1RGIA 5BPLA 5JLHA 4H5RA 3KVGA 5AFUH 3TU5A 4H5WA 5AQXA 5B8HA 1J6ZA 4BGAA 2W40A 2BTFA 1MWMA 1QZ6A 2D1KA 3C7NB 4IXCA 3SK3A 1S22A 1BDGA 2IVNA 1C0GA 1U2VB 2A3ZA 4I6MA 4DCHA 3KZBA 3C0BA 1YUWA 4FWPA 3CETA 3ZX0A 5E84A 2IVPA 2FSJA 1LOTB 4BG8A 2A42A 3LM2A 2ITMA 2WUSA 3QFUA 4DHYA 4PL8A 2YCHA 1C0FA 1JCFA 4MO5A 3DXMA 3VETA 4EIAA 4CZEA 1ATRA 3D7EO 1QZ5A 3QFPA 3LL3A 3BP8A 4CI6A 1XQSC 3M3ZA 1T44A 3VGKA 4H5NA 3ZETB 2IIRA 2FF3B 4BR5A 3VEYA 4KBOA 3WUHA 4BC4A 4BR4A 3HI0A 3B8AX 4A61A 1QQOA 2ZWHA 3L4IA 1NGIA 5AQRA 3HM8A 5BRFA 4BRMA 2P9SB 3WXIA 4BRQA 2VYPA 4Z94A 3O6WA 4B1XB 5AQQA 3ULEB 3M1FA 5AFUA 4B1WB 1T6CA 1QHAA 3O1WA 4BREA 3MMVA 3UKRB 4YDUC 4CZIA 3WXJA 2GWJA 4WQ5A 4FL9A 5AQZA 1SAZA 4FWOA 4RWTA 3OHRA 3EZWA 3CQXA 5EY4A 2I7NA 2HF4A 3F9MA 4C23A 4B1ZA 2YHXA 3LDNA 3C7NA 3CJ7A 2J4RA 4XH5A 5EX5A 4BRGA 1V4SA 5JICA 4EFHA 3FZFA 1TYQB 1BU6O 1U2VA 3DXKA 1HJOA 2FF6A 3L0QA 4PKGA 4IWVA 4XH1A 4HTLA 4EHTA 1DKGD 3VGMA 2HOEA 3FZHA 4B9QA 4DB3A 3HBTA 3CI5A 3FFKB 3H3NO 3TPQA 4BROA 4CBUA 4DQ8A 4M7XA 5F1XA 1GLBG 3A5MC 3WEEB 4WQ4C 1BO5O 1NGBA 3DWLA 4BRIA 3U9ZA 3H46O 2CGJA 4CJ7A 2D4WA 3MN6A 3RSEB 4BRPA 1Y64A 4PKIA 4JD2A 1MWKA 2EWSA 3IMXA 3EKSA 4FOEA 3GBTA 5AQUA 2VWBA 2Q2RA 3G25A 2E2PA 4H0YB 2CGLA 3CJBA 5JMVA 2A41A 4Y0WA 4BR9A 5JLFA 3IFRA 1NWKA 4H5VA 4WYBA 3P4IA 1Z05A 5F0XA 1X3MA 3L6QA 5CE3A 1NMDA 2QM1A 2QXLA 1GLJO 4FWSA 2P9IA 3I33A 1NGGA 2P9NA 2V7ZA 2P9UA 1BG3A 4H0VB 1TUUA 4H0TB 2FLOA 4BC2A 1QQNA 3DAWA 5EOYA 5LJVA 5TKYA 2QWRA 3ID8A 3EO3A 2E8AA 1XC3A 2UYTA 3HTVA 4PL7A 5FPEA 4E1JA 4JHDA 1NM1A 4CD3A 2HMPA 1U6ZA 4MLHA 1ESVA 3MN5A 1MDUB 1WUAA 4FWNA 4AM6A 3UB5A 3ZEUB 2QWMA 3FZLA 2P9PB 3JXUA 5AR0A 2E20A 5ADXA 3QBXA 4HWIA 3J8AA 4CZMA 4FWLA 2P9LA 3WEEA 4CBWA 2E1YA 3BUZB 4ISFA 1KAZA 3D2EA 3O4WA 5KQ8A 1KAXA 5AQHA 2CGKA 2YHWA 5AQOA 2ZF5O 3IUCA 1TUYA 2QWLA 2GWKA 3BF1A 3RSEA 1NGEA 4BG9A 1HUXA 2Q97A 1T6DA 4EAHD 5FPDA 1NGAA 2P9KB 3MN9A 3VENA 1OKJA 3SLCA 5KPTA 4O8KA 3CERA 4IJNA 2KHOA 4GY2B 3MDQA 4CZJA 1ATNA 2FXUA 3A0IX 5E26A 4IZ9A 3EKUA 1K8KA 3M6GA 1RFQA 3AARA 1BA0A 1HX1A 4YDUA 4BGBA 4CD1A 3CJ1A 2ASMA 5AQFA 4BVOA 4GNIA 2AP1A 4NB4A 1ATSA 3AAQA 4H0OA 4BRNA 4FWQA 4FWRA 2NRHA 3ZX3A 5BPNA 1S3XA 1DEJA 4CBXA 4B1VA 2ASPA 2D0OA 2H3GX 4QS9A 4FPAA 3O80A 3A8YA 3AY9A 1DGKN 3CQYA 5AQIA 5AZJB 4BRLA 4CZGA 5LY3A 5AQVA 2Q0UA 3LM9A 5BR9A 3FGUA 4A62A 2AA4A 3FE1A 4BVPA 2FSNA 3WXKA 2PBDA 1Z6RA 4BRAA 3HSCA 3FZKA 5BRHA 3VEVA 2E88A 1NGHA 1ZC6A 3ENHA 3VEZA 1X3NA 3ZX2A 3VEOA 4BR0A 1E4GT 1HKGA 3ZETA 4JAXA 4AM7A 4CZKA 2E2OA 4WQ4A 4QS8A 4CZLA 3SMSA 4CZFA 3AAPA 1BUPA 3GG4A 5AQGA 2QWPA 3CJAA 2PAVA 3A5LC 2P9SA 3U4LA 4FPBA 3ULEA 4L3QA 1NGFA 1NGCA 1GLCG 1P8ZA 3DXMB 4PKHA 4MO4A 3W3DA 3U9DA 4IO8A 3A5OC 1BA1A 4MLEA 5I9EB 4LC9B 3UKRA 1G99A 4NO7A 4BQZA 4H0XB 5F2RA 1KXPA 2A6AA 3LDPA 1ZBSA 4BRCA 5BREA 1E4FT 3H1QA 4BRDA 3EL2A 3U8XA 3KHYA 3VEWA 2DPNA 2NLXA 3I8BA 4JNEA 2E1ZA 5AQJA 2CH5A 1TYQA 4ISEA 5AQKA 4BRHA 3D2FB 3CHWA 4BC3A 1BOTO 2W41A 5AQWA 3FZMA 5FPMA 4J8FA 3VESA 4QS7A 3WQUA 3BEXA 4K43A 1NGJA 1SZ2A 4FOIA 5AQSA 4BR7A 4BQLA 1EQYA 1X9JA 2GEMA 3H1VX 1HPMA 2VCPA 3CJ9A 3QICA 4JN4A 3BF3A 1HKCA 3H45C 2E2QA 3ENOA 5EXWA 1HKBA 2FSKA 5AQPA 2YJFA 2A5XA 3DJCA 1NGDA 2CH6A 5AQNA 5KPRA 3R6MA 1MA9B 3DXKB 4A2BA 1IJJA 3QB0A 4RTFD 4H5TA 5BPMA 1WOQA 3W0LA 3MN7A 1GLLO 2YHYA 4O5FA 2V52B 4FWMA 3A5NC 1D4XA 5AQYA 1H1VA 5AZIB 3MK6A 3R9PA 3VGLA 2IVOA 4M7YA 2YJEA 3VEXA 1SQKA 2QWNA 3FLCO 3WT0A 4IJAA 4M63C 1YVNA 1NBWA 1QQMA 4BRKA 4FWKA 3LDLA 2QW9A 4BR2A 2D0PA 2Q0RA 3H6EA 1GLEG 2E2NA 3MCPA 4BRFA 5KPZA 4RCHA 4K42A 4JD2B 3EN9A 3QBWA 3GOIA 5BRDA 3SMPA 1GLDG 4B1YB 3LDOA 2V51B 3IDHA 4ISGA 2Q31A 3D2FA 4WQ5C 4A2AA 2HF3A 1KAYA 2A40A 3CIPA 3VF6A 1NLVA 3VOVA 3GL1A 3UKUB 4BC5A 1YAGA 1YXQA 1R59O 4H03B 2Q1NA 2P9PA 2NZTA 1ZXOA 3ZEUA 2P9IB 3O8MA 3UE5A 2P9NB 2P9UB 2ASOA 1HLUA 4FO0A 5AQLA 4CZHA 1BWFO 4EHUA 1LCUA 2V7YA 5BN8A 2YI1A 5AQTA 4I6MB 3R8EA 3WQTA 4JHDB 3JS6A 1GLFO 3ATVA 3CJCA 4XEIA 2P9KA 1XUPO 3O1BA 3ATUA 5LJWA 3GDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5M1KA 3P1GA 4FSVA 3OYKA 2QWQA 2ZGZA 5ELZA 3TAFA 1RBRA 5BN9A 2UUAK 3O9SA 1JCGA 3QEXA 2YNGA 4EP5A 2I5JA 3VERA 2GELA 4QOZB 4RW4A 1RDDA 3S41A 4M45A 1V4TA 3HOSA 3QMLA 5ADXH 1U4BA 4B9SA 3WNHA 1J5EK 4K25A 3CCJN 1K73O 4DS5A 4DG1A 4BDZA 3ZT4A 4DS4A 2F9TA 1YJWN 2B5JA 3THYB 2HW3A 3GE1A 1VSIA 1D9DA 4X62K 3KLFA 2YNFA 3THXB 3RMAA 4FJHA 2EX3A 4CJ5A 1RDWX 5BPLA 5AFUH 3PSFA 4CHPA 1TGOA 4H5WA 1RT6A 5M1OA 1ASWA 2IVNA 1U2VB 3ZT0A 2A3ZA 4I6MA 1HNXK 5C15A 1W9HA 3CETA 5E84A 2X74A 3E9OA 2FSJA 4O4GA 1LOTB 4RW7A 4E19A 3OYGA 3RRGA 3QFUA 1IBKK 2P5OA 4FLTA 3SQ1A 4DTUA 3AV9A 1KSPA 2NRZA 4CECA 4EP4A 1ATRA 2OPRA 1QZ5A 2UXDK 3M3ZA 3VGKA 2YV0X 1GOBA 4K8XA 3VEYA 4BC4A 1LWEA 3HI0A 4L8RB 1QQOA 4UY8O 5AQRA 1A5XA 4BRMA 3L2WA 2P9SB 2VYPA 1RTHA 4Z94A 3O6WA 5AQQA 3PSIA 4JK7A 1QVGM 1JXBA 5M1NA 2O8EB 1T6CA 1QHAA 2P1JA 4JI1K 4KHNA 3UKRB 3TWHA 3ZSWA 4QAGA 3HPHA 4B08A 4CZIA 2GWJA 1TKZA 1BCOA 1WB9A 3C6HA 1IV0A 1S1XA 4RWTA 3M5RA 3OHRA 1YVUA 1BQMA 3U6FA 4E1MA 3CM5A 1KD1O 4IFEA 4B1ZA 4CW7B 2UXBK 3VQ5A 3S9HA 3CJ7A 2J4RA 4RG8A 4XH5A 4DV1K 3ALYA 1BU6O 3KWGA 1HJOA 2ZJQL 3DRPA 3DM2A 4GVMA 4EHTA 4DV6K 3SAHA 3V9WA 2YNIA 3VGMA 3TANA 4MFBA 2QA4N 1RDBA 3HP9A 4KHYA 2QXFA 4IDHA 3TPQA 1S72N 1B9FA 1RT2A 4CJSA 4CF8A 4M7XA 3QEIA 1GLBG 3SV3A 2NRXA 2KW4A 1VQ7N 3H46O 2CGJA 3M8PA 2WBNA 3HXMA 1HPZA 3WNFA 3MN6A 4BRPA 4IFYA 5JVHL 3LALA 1Y64A 1T3VA 4Y1CA 1MWKA 2IAJA 1VSMA 3AO2A 2Q2RA 2E2PA 4IFVA 4JYAK 4MDBA 5JMVA 4W5OA 3SZ2A 4GMJB 3LWLA 1VQ4N 3AA4A 4DLEA 3SUNA 1M1KO 4FJLA 2BE2A 1GLJO 4Y1DA 2NRVA 1D8YA 1BCMA 3DLLL 2P9NA 1TUUA 4H0TB 3G0ZA 4O8UA 5CYQA 3EO3A 3OY9A 1RDCA 1BISA 2HBMA 4GKJK 4MDAA 4MLHA 4FK4A 3ZEUB 3FZLA 1N8RO 5ADXA 5KGXA 4FM0A 1S6PA 3WEEA 4CBWA 3PX0A 4CJUA 3O4WA 1UAXA 2YHWA 5AQOA 2NUBA 2ZF5O 3IUCA 3IG1A 4DU1A 2F8TA 1NK5A 3V1RA 3HSTB 4GY2B 4CZJA 2G8IA 3VQPA 3S5TA 3EKUA 4CVNE 3M6GA 4F3TA 5DMRA 3THYA 2PFUA 1C6VA 3QNOA 3THXA 3V6DA 3PO4A 3CG7A 4JI3K 3WXMB 3BZKA 3TSPA 4H4OA 3P31A 4FLWA 4OKKA 4FPAA 1C1AA 4KTWA 1S6QA 3A8YA 3AY9A 3G4SN 3U3YA 3N4QA 3LAKA 3LM9A 4JKBA 4M3TA 3FGUA 3MEDA 4A62A 3FE1A 1P90A 3LPTA 3HSCA 3VEVA 4GW6A 4CIEA 1WAJA 1Q86O 4M3WA 3VEZA 1ZC6A 3ENHA 3ZX2A 4OPKA 1E4GT 4JAXA 4AM7A 2G8WA 4JKGB 1U04A 3SMSA 1ZBIA 3TTFA 3VQ7A 4CZFA 1N36K 3KK2A 2PAVA 2P9SA 3V4IA 3CC7N 2RHKA 1Z26A 3K9JA 1XHZA 4FPBA 4YOYA 4GVEA 1OH7A 4F2RA 4AF1A 2HNZA 1GLCG 3DXMB 2O8EA 4C8MA 3LANA 2QKBA 4MLEA 4C1NK 4LC9B 3UKRA 3MAQA 4DSIA 3ZT3A 3IS9A 2QTDA 3B6OA 1HYZA 3LDPA 1WLJA 4A59A 4Z0UA 1VSHA 1NOYA 4BRDA 3VEWA 3CC2N 4JS4A 1HR0K 4E0DA 5LL6Z 4JNEA 1VSFA 2E1ZA 5AQJA 3D2FB 2KLAA 3QO9A 5AQWA 5FPMA 3VESA 4QS7A 4DUYK 5JS1A 4BR7A 3CYMA 5GIPA 4BWJA 4O0JA 3VMFB 2VCPA 3PLAA 2G8UA 3KKSA 4AH9A 4AQYK 1HKBA 1IBMK 2FSKA 4IKFA 3V9UA 2RF2A 3AVNA 1C1BA 2E6MA 3OVNA 1N6QA 4A2BA 1IJJA 3D0PA 4H5TA 3SBTA 4HHTA 4FLUA 1QSYA 1TKTA 3MN7A 2V52B 3J80O 3K5LA 4FWMA 4C8OA 4DFPA 2IVOA 4M7YA 4FJMA 4IJAA 5KGWA 4CJVA 1QQMA 4FWKA 3LDLA 3VQ4A 4B9MA 2QW9A 2Q0RA 4JKFA 5C10A 2OZMA 1VSDA 1JLQA 1KVBA 1GLDG 3C94A 1RBSA 4B3MK 4ISGA 4LFCK 1ASUA 3ZSZA 4CERA 2HF3A 3OJSA 1FJGK 1KAYA 4FW1A 4WFNL 4KTQA 1S1VA 3CQ8A 2HHTA 4FJ5A 1FXXA 3QINA 1YXQA 3AVIA 3ZEUA 3UE5A 3VQ9A 2UU9K 4G9ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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