The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
117
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structure length |
117
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Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
|
| molecule keywords |
16S rRNA
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| publication title |
A structural basis for streptomycin-induced misreading of the genetic code.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
28
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| structure length |
117
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| sequence length |
117
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GKK K; 4DR7 K; 4LF4 K; 2UXB K; 1J5E K; 4DUZ K; 4X64 K; 4DV7 K; 5LL6 Z; 4LF7 K; 4LFA K; 4JI8 K; 4JYA K; 5BR8 K; 3J7Y P; 4JI1 K; 4AQY K; 4GKJ K; 1HNZ K; 2VQE K; 4LF9 K; 4DR6 K; 3J80 O; 1XNR K; 2VQF K; 1N32 K; 4DR1 K; 3J7A P; 2HHH K; 4DV4 K; 5FLX O; 1XNQ K; 1XMO K; 4B3T K; 4DR2 K; 4DR3 K; 4DV3 K; 4KHP K; 2UUC K; 4JI6 K; 4DR4 K; 2UUA K; 4B3S K; 4OX9 K; 4X65 K; 4JI3 K; 4X62 K; 1IBK K; 4DV5 K; 1HNW K; 4V19 S; 4YHH K; 2UXC K; 4JV5 K; 2UU9 K; 4DV2 K; 4X66 K; 4B3R K; 2ZM6 K; 5IWA K; 1N34 K; 4LF6 K; 4LFB K; 1I94 K; 4DR5 K; 4JI7 K; 3T1Y K; 3T1H K; 3OTO K; 1IBL K; 2UUB K; 3JAM O; 3J81 O; 4LF8 K; 1HR0 K; 4YY3 K; 4CVN E; 4DV0 K; 4JI5 K; 5IT9 O; 5A2Q O; 1N36 K; 2UXD K; 4JI2 K; 2E5L K; 4JI0 K; 4K0K K; 4DV1 K; 4NXM K; 5AJ3 K; 1IBM K; 4JI4 K; 1FJG K; 4CW7 B; 5LMU K; 4LF5 K; 1HNX K; 4LFC K; 4DUY K; 1XMQ K; 1N33 K; 5LMN K; 4DV6 K; 4B3M K; 2F4V K; 4NXN K; #chains in the Genus database with same CATH topology 4C1N K; 4FM1 A; 1BL3 A; 4H0Y B; 2B5J A; 3ZT3 A; 3G71 N; 1UOC A; 3M8R A; 4KKO A; 3LDN A; 3MEC A; 4HWI A; 3LL3 A; 4H0O A; 4BC2 A; 4Z4I A; 4B9U A; 4ELU A; 3I55 N; 4LFA K; 4JI8 K; 1K8A O; 2KFN A; 3AVG A; 4QS9 A; 1I39 A; 3A5L C; 1HJO A; 4I2Q A; 3TTD A; 1S1U A; 1S1W A; 3NF9 A; 4A2B A; 1BCO A; 1B9F A; 3VA3 A; 4WYB A; 1L3V A; 3HPG A; 4CGI A; 1HNV A; 3TAN A; 4IG0 A; 3NFA A; 2D5R A; 5MLC Q; 3K59 A; 2HST A; 4FPA A; 3WXI A; 2V52 B; 4B3T K; 2WUS A; 4DSE A; 4H0P A; 2OAN A; 1OKJ A; 1TL3 A; 2UUC K; 4JI6 K; 3ENH A; 3FGU A; 1JLA A; 2HBJ A; 2HBK A; 4O4G A; 2UUA K; 2BGG A; 1RT6 A; 1NJY A; 3SAF A; 1BWF O; 3F5T A; 5D3G A; 2ZE2 A; 4JNE A; 1GLC G; 1CXU A; 1EKE A; 4DQ8 A; 4QOZ B; 3CJA A; 4EZ6 A; 1GLA G; 2OPP A; 3V6D A; 3BEX A; 5F2R A; 1QSY A; 1S3X A; 3EKU A; 3G0Z A; 4WCE L; 3FZM A; 2PYJ A; 3AAQ A; 1EP4 A; 2D4W A; 3KLF A; 1X1P A; 4WQ4 C; 1I94 K; 5AQL A; 3VQ5 A; 4CF9 A; 3OYB A; 4NCG A; 2HMI A; 5AR0 A; 1NGC A; 1IBL K; 4FM0 A; 1WSE A; 4CD3 A; 5AZI A; 3KK1 A; 1NJW A; 3RVC A; 1BIZ A; 2QA4 N; 4H4M A; 1WSH A; 3S9H A; 5M1Q A; 3I0S A; 4JI5 K; 1ZBF A; 3K57 A; 5IT9 O; 4DTR A; 2QI2 A; 3KVG A; 3HZ6 A; 1X9W A; 4KV8 A; 3WNF A; 2F7T A; 5C15 A; 5JS1 A; 1S9G A; 5TKY A; 4KO0 A; 4AM7 A; 3ALY A; 3GOI A; 1XC3 A; 4PKG A; 1HYZ A; 1QVF M; 4H5V A; 2IS3 A; 3R8E A; 1JLB A; 3FZK A; 4CGD A; 1T7P A; 3BDP A; 3ZSW A; 3CJB A; 4H0V B; 1N33 K; 2YCH A; 3DLG A; 3QML A; 4GV6 A; 1KQS M; 3VQQ A; 3O1W A; 1KAX A; 3SUP A; 4FPB A; 3KD1 E; 2I7N A; 4CI6 A; 3LWM A; 4BC3 A; 2YHW A; 4EIA A; 1N8R O; 1GLJ O; 3K9J A; 1KSP A; 4E89 A; 4W5R A; 5CR4 A; 2HF4 A; 3EN9 A; 4PHT X; 3OYH A; 1EO1 A; 4JI1 K; 2UYT A; 4K41 A; 5AQK A; 1JXE A; 4O5B A; 1F21 A; 4XIU A; 4DCH A; 5BR9 A; 4M42 A; 5E41 A; 3AY9 A; 1BCM A; 3AO5 A; 2JGU A; 2GV9 A; 1M90 O; 4RW7 A; 3MEE A; 3QEP A; 1C0G A; 3TAG A; 4A5A A; 3RMD A; 2O4I A; 3VF6 A; 4DFJ A; 1YTU A; 4B3S K; 1RDU A; 3KLE A; 1IKX A; 2KLA A; 4Z4C A; 1SUQ A; 3LPT A; 4XH5 A; 1ZBL A; 1IJJ A; 1K8K A; 3BUZ B; 1YTA A; 1VQ4 N; 4OPA A; 4WFA L; 1C1A A; 2HNY A; 4CEZ A; 2UXC K; 3ZSR A; 4B1V A; 2VG6 A; 3KTQ A; 3UB5 A; 2IGI A; 3H46 O; 2YJE A; 4YOY A; 5KRS A; 4J2A A; 3AVL A; 3HPH A; 3ATV A; 2KHO A; 1EWR A; 4YNQ A; 4DFK A; 5CHI A; 2O8C A; 3H45 C; 3R9P A; 4OGE A; 1EWQ A; 2F8S A; 3D0P A; 3SJH A; 4FLT A; 4JK8 A; 1MA9 B; 4CHQ A; 4JD2 A; 4N76 A; 3O4Q A; 4FK0 A; 2GWJ A; 3VTH A; 1BIU A; 3O9Q A; 4JKB A; 3DI6 A; 1V4T A; 4JI4 K; 3CG7 A; 4O44 A; 5LJV A; 4HTU A; 2YX6 A; 1NGF A; 2JWK A; 3P4I A; 2PAV A; 1KD1 O; 1HNX K; 4CF8 A; 5E26 A; 4FJ8 A; 3GL1 A; 4NXN K; 3WXL A; 3KLG A; 4KB1 A; 3P38 A; 4IBN A; 3TPQ A; 4BRF A; 3ZT4 A; 1CZ9 A; 2A6A A; 3OJS A; 1RTJ A; 2O8E B; 3NAE A; 1C6V A; 3ZT1 A; 5GAH P; 3QIP A; 3MXI A; 3B8A X; 2YKM A; 4EHT A; 3LP3 A; 3EY1 A; 2IIR A; 4KAZ A; 1RBR A; 3EO3 A; 2VQE K; 1TKZ A; 3CJ7 A; 1RTI A; 3OS0 A; 3CCV N; 5EX5 A; 2FXU A; 3ID8 A; 3IDH A; 1QHT A; 4CF0 A; 3L4Q A; 3DLB A; 5KGX A; 2GX9 A; 3QNN A; 1RDW X; 1CXQ A; 3TAQ A; 4F2R A; 5C24 A; 1YI2 N; 1TL1 A; 3ZX3 A; 4DR3 K; 4DSJ A; 4KRE A; 2ASM A; 1MWM A; 4FOE A; 3VQ4 A; 1NM1 A; 4FJX A; 4CGF A; 3EEQ A; 4Z0U A; 2XRI A; 4KH4 A; 4DV5 K; 3PSI A; 3R6M A; 3L2W A; 2P9S A; 4H0T B; 1GLE G; 3L2U A; 5C2D A; 3VTI A; 4C8K A; 3QB0 A; 1TK8 A; 4A62 A; 3E01 A; 2F96 A; 4CJK A; 1ATN A; 1HLU A; 3VQ6 A; 3EZ5 A; 4B1Y B; 3VQ8 A; 4IO8 A; 3FE1 A; 4L8R B; 3LPU A; 1IV0 A; 1VQ8 N; 3NF7 A; 4DTX A; 3TTC A; 1SAZ A; 4CK2 A; 4ZHR A; 1K9M O; 4YY3 K; 2ATQ A; 3AVI A; 1VSM A; 1T44 A; 4B9V A; 2IAJ A; 3O6W A; 3R1X A; 4CJL A; 4BR9 A; 1WSI A; 3WQU A; 2FBY A; 2OTJ N; 2QWP A; 3RMB A; 3LP0 A; 4KTZ A; 3HL8 A; 4BGA A; 5HRR A; 1VQO N; 4FJ7 A; 4KHN A; 3HO1 A; 2Q2R A; 2Q3S A; 4BGB A; 2IOC A; 1S1V A; 1X9J A; 4GV3 A; 4FJG A; 3LAM A; 4R5P A; 2P9L B; 3MED A; 3HM9 A; 1REV A; 4CGG A; 3RSE A; 3TSP A; 4FWQ A; 3C6A A; 1RBV A; 3OYK A; 1JLQ A; 3CCQ N; 1EXQ A; 2IVP A; 1WUA A; 1HRH A; 2PBD A; 1VQL N; 1S22 A; 2A3Z A; 4BDY A; 4JKD A; 3Q7C A; 4BR4 A; 2G8U A; 1NOZ A; 5GIP A; 3ITH A; 5BR8 K; 1NJI O; 2XO7 A; 4ID5 A; 3P1G A; 3B6P A; 1VQK N; 4A57 A; 3FZL A; 2HVI A; 4L3Q A; 3F73 A; 3CCM N; 3VQP A; 4CEC A; 1ZBI A; 3JSM A; 1TVR A; 3CD6 N; 3NH1 A; 1HX1 A; 5FRM A; 4I6M B; 4OPK A; 5KRT A; 1JLG A; 2NRX A; 1VAZ A; 1IH7 A; 2IVO A; 2KQ2 A; 4QS7 A; 5LY3 A; 2P9L A; 1LWE A; 4OX9 K; 3BZK A; 3DOK A; 4ILH A; 3FFK B; 3MDQ A; 1RBS A; 5HLF A; 2O8F B; 4IG3 A; 3PV8 A; 3ZEU A; 2FF3 B; 3ULE B; 3ASM A; 3MCA B; 4B08 A; 4JV5 K; 2KZM A; 4B9S A; 5BRF A; 2JWL A; 4JLH A; 2OPQ A; 4OJR A; 3ZX2 A; 3CMA N; 3CF5 L; 1Z25 A; 4IO9 L; 2Z1G A; 2CH5 A; 1KLM A; 4H5T A; 1U2V B; 1QE1 A; 1QHA A; 2QW9 A; 4I6M A; 4N47 A; 2X74 A; 3EZW A; 3LDQ A; 5EU7 A; 4AHR A; 4B1X B; 3PX4 A; 3KK2 A; 3AVB A; 3VF4 A; 4B8A B; 5SZT A; 3PX0 A; 1Q9Y A; 3C94 A; 4CJ5 A; 2NRH A; 3LAK A; 3DXK B; 3WXJ A; 1LV5 A; 3V1O A; 4E7J A; 3S3O A; 2GTD A; 3LAL A; 3PO4 A; 1DEJ A; 4B9T A; 4C8L A; 3AAR A; 5AQF A; 4IKF A; 2O8F A; 1JXB A; 4DWI A; 4KTW A; 1ATR A; 2HBM A; 2CGK A; 3QIC A; 3ULE A; 4J2B A; 3IAY A; 3SZ2 A; 5AQZ A; 1GLL O; 3EYZ A; 1ZXO A; 4B3M K; 3HT3 A; 2H3G X; 1XUP O; 4XEI A; 2YHA A; 1TAQ A; 4W5Q A; 3H1V X; 5FRN A; 4CJT A; 2HHT A; 3C6T A; 1NK7 A; 4IWV A; 4JYA K; 2KW4 A; 3P5J A; 2D0O A; 2NNW A; 3LM9 A; 3TWH A; 2ASO A; 5HRP A; 1ZC6 A; 3AVN A; 3VQD A; 3T19 A; 2G8V A; 2WON A; 3QBX A; 4AIL C; 1LW2 A; 1SV5 A; 1IKV A; 3VEN A; 1S5J A; 3CHW A; 2V7Z A; 4OPH A; 1Z6R A; 4UY8 O; 4GW6 A; 1YUW A; 3SUQ A; 2YV0 X; 3ZCM A; 3L8B A; 4CZI A; 3CM6 A; 3LDL A; 2O4G A; 5CZ1 A; 2O8B B; 2VWB A; 1NGE A; 5F0X A; 3N4P A; 3O3G A; 4CIE A; 3AVC A; 4BC4 A; 3RRH A; 5AQX A; 1LOT B; 2Q1N A; 4CBW A; 1R0A A; 3LWL A; 1U6Z A; 1FW6 A; 2O8D B; 1RTD A; 2VWK A; 4HUG A; 5M1P A; 1ZBH A; 1Q7Y O; 1BI4 A; 4HHT A; 4GMJ B; 1P90 A; 4FW2 A; 1YXQ A; 4B3R K; 3HVT A; 3R3L A; 5KI6 A; 4BG9 A; 2FC0 A; 2I7P A; 4LH5 A; 4LF6 K; 3HSC A; 3NGY A; 1NK4 A; 5JLF A; 1TKT A; 4FWP A; 5AQU A; 3AA5 X; 3CQX A; 4C1N I; 4DFP A; 1NGJ A; 2O8B A; 2OCE A; 4FJK A; 2UXD K; 4EP5 A; 4M45 A; 5JMV A; 3UE5 A; 2HHX A; 3OYE A; 4LD0 A; 3DYA A; 5EVZ A; 1VSL A; 1JKH A; 3ZX0 A; 4E19 A; 3M8Q A; 5AQJ A; 1WN7 A; 3BP8 A; 4CHN A; 1EET A; 4FJL A; 4IZ9 A; 4HUE A; 1WLJ A; 4DUY K; 1XMQ K; 4AHV A; 4YOU A; 1WSG A; 4JS4 A; 2GEM A; 4CGH A; 2E2Q A; 4NYF A; 3U3Y A; 3K0S A; 4OLB A; 2YKN A; 1TUY A; 3F9M A; 1T3V A; 2GUI A; 4B8C A; 2NRR A; 1T8E A; 1KTQ A; 4KHQ A; 2X6S A; 5AQQ A; 1QQM A; 3OYF A; 3OYI A; 4NLB A; 3UKR B; 4BDP A; 3M6G A; 3THY B; 4CJE A; 3EE9 A; 1GOC A; 3L6Q A; 4J2D A; 3CXC M; 3D2F B; 4A61 A; 5M1F A; 3FFI A; 3KJV A; 2ITG A; 1DTQ A; 1NMN A; 1Q18 A; 3LDS A; 4DTU A; 1N32 K; 3I0R A; 3J7A P; 4YOV A; 4GVM A; 1FXX A; 1JL1 A; 1TK0 A; 2E8A A; 1J53 A; 3AA2 A; 4DR2 K; 4CF1 A; 3G25 A; 3HXM A; 1RT5 A; 1S9E A; 1S6Q A; 1RBU A; 2F8T A; 4IJA A; 4M7Y A; 3ENB A; 3IFR A; 3DLR A; 4JN4 A; 4JRP A; 4DLE A; 2W41 A; 3UKR A; 5LJW A; 3THY A; 3IMX A; 4WQ5 C; 1UA1 A; 2FBX A; 4CHZ A; 4E0D A; 4M7X A; 5T7B A; 5ADX H; 3D2F A; 3AA3 A; 2P9P B; 4JAX A; 3VEW A; 3MX5 A; 2VCP A; 3HBT A; 3CCU N; 1RTH A; 4F9O A; 4FLY A; 4DSI A; 3S3M A; 3HOS A; 3V81 A; 3MN7 A; 3CC2 N; 4G1Q A; 1QTM A; 4M63 C; 1FKP A; 3M1F A; 2E4L A; 3HI0 A; 1N36 K; 1NG9 A; 4O0I A; 1WAJ A; 1NGI A; 4IDH A; 4YOW A; 5CYQ A; 4K0K K; 3VOV A; 2OTL N; 3V1R A; 3DAW A; 4BDZ A; 1BUP A; 3KHY A; 3O80 A; 4CW7 B; 5J1E A; 4CZJ A; 1JLF A; 5BN8 A; 3L3U A; 1A5V A; 1ZYQ A; 1VSE A; 4CJV A; 4GKK K; 3VEV A; 4CEA A; 3CFO A; 1DLO A; 3WEE B; 3VPZ A; 4CFC A; 3A5N C; 4PKH A; 3A5O C; 4DV7 K; 3OBY A; 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3ISN C; 1VSH A; 5AQY A; 1E4G T; 3SLC A; 1MWK A; 3CME N; 1YT3 A; 3CC4 N; 4E1N A; 3NH2 A; 2EHG A; 2Q36 A; 3UKU A; 5JS2 A; 4DMN A; 4JHD B; 1IG9 A; 2NRW A; 2QWO A; 1VK0 A; 4U7B A; 3PSF A; 3U6F A; 5EOY A; 2KKZ A; 3IUC A; 1Q8I A; 4U67 L; 4DR6 K; 4B9Q A; 2HF3 A; 2BTF A; 2B4J A; 1C0F A; 3QFP A; 4BRC A; 1T03 A; 4C8N A; 1NGA A; 3MN6 A; 4KHW A; 1BG3 A; 1IKW A; 2ZGY A; 3THV A; 1WBB A; 4DR4 K; 5B8H A; 3OY9 A; 4FK4 A; 4AHS A; 2VGN A; 1KAZ A; 4YOT A; 5GIO A; 1JLC A; 3GBT A; 3OYA A; 2AJQ A; 3CCR N; 1NKC A; 3J8A A; 1L3U A; 1Z26 A; 5AQH A; 1JCF A; 4V19 S; 2D0B A; 3P39 A; 2UU9 K; 1X3M A; 4PQU A; 4JHD A; 2QWQ A; 2ZQB A; 1W97 L; 3MK6 A; 2RPI A; 2HND A; 3K5O A; 3FLC O; 2O8E A; 4BRK A; 1SS6 A; 3VGK A; 5EY4 A; 4FYD A; 1BA1 A; 4H8K A; 2QWN A; 3HK2 A; 3NGI A; 2WBN A; 5FRO A; 5GAE P; 4BR7 A; 1D5A A; 4IDK A; 4ISG A; 3AVH A; 4JI0 K; 4DV1 K; 2NZT A; 1E4F T; 2RHK A; 4C23 A; 1RBT A; 3HYF A; 4CZF A; 2QWL A; 3TR8 A; 3HM8 A; 3K5L A; 4BRI A; 1U48 A; 3CC7 N; 3M8S A; 1U04 A; 4PY5 A; 4CJS A; 4PUO A; 3NVK A; 3AVF A; 4DR7 K; 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