4EFHA

Acanthamoeba actin complex with spir domain d
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
370
structure length
364
Chain Sequence
VQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMHTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMQKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein/transport protein
molecule keywords Actin-1
publication title Multiple Forms of Spire-Actin Complexes and their Functional Consequences.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 127
structure length 364
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4efhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4efhA03
3DJCA 1BA1A 4BRNA 1XUPO 4BRLA 2P9SB 2P9UB 5F1XA 3VF2A 5AQYA 1HKGA 1IG8A 2QWOA 4HWIA 1HKCA 1KXPA 1V4TA 4BQLA 1HPMA 3L4IA 4FPAA 4CZHA 4PKGA 3H6EA 4BR0A 4MLHA 2EWSA 1QZ5A 4QS7A 4BREA 3BF1A 2A41A 1YUWA 3EKSA 4ISFA 4O5FA 3B8AX 3CJ7A 4EIAA 1MDUB 4BVPA 3QB0A 4LC9B 3ID8A 3CJCA 1OKJA 1YXQA 2CGKA 3CI5A 3U9DA 5KQ8A 2E2NA 4WQ5A 5I9EB 1GLCG 3UKUA 3D2EA 4EAHD 1NGDA 4IJNA 4F9OA 4BR2A 2WUSA 3CQXA 2QM1A 3FZFA 2BTFA 5AFUH 4JNEA 3WXKA 3ZEUA 2CH5A 4QS8A 3KHYA 3FZMA 2FXUA 3EN9A 3IDHA 5AR0A 3HM8A 4CI6A 3RSEA 1NGFA 5BRHA 2CH6A 3WEEB 3VEWA 4NB4A 3QFUA 1J6ZA 2P9LA 1SAZA 1NGCA 2VYPA 5E84A 4B1WB 4MO4A 2YCHA 1ZXOA 1EQYA 2ZF5O 3U8XA 2IVPA 1BA0A 3VPZA 4CZFA 1RDWX 4EFHA 5AZJA 1HJOA 3QBXA 4BR4A 1NBWA 2VCPA 2P9PA 4K43A 4IZ9A 4BR7A 3QMLA 2ITMA 5ADXH 5BPLA 4IWVA 4XH5A 4BR9A 2Q31A 4K42A 4O8KA 5AQRA 5JLHA 1NLVA 3ENHA 3A5LC 4KBOA 1KAXA 1IJJA 3I33A 4XH4A 3DAWA 5FPMA 4GY2B 4FL9A 3O5BA 2GWJA 3G25A 3CJAA 3VOVA 5B8HA 4FWSA 4E1JA 3MCPA 3FZKA 1X3MA 1YAGA 4BRAA 4CZMA 3FZLA 3IMXA 4B1VA 4FOEA 3H3NO 3J8AA 3WXLA 2GTDA 4B1UB 2V52B 1KAZA 3C7NA 3SMSA 4A2AA 3LL3A 2OANA 3A5MC 4H0XB 2W41A 3ZETB 4BRDA 1QQMA 4K25A 5AQIA 4H5TA 3UKRA 4WQ4C 4JHDA 4AM7A 3CJ9A 4H5NA 4H5RA 5AQVA 2NRHA 4PKIA 3GL1A 4BRKA 2H3GX 3GG4A 3UKUB 5AQZA 3D2EB 1JCFA 1BG3A 3VENA 3FZHA 3LDPA 1LOTB 5AQXA 1R59O 3VF6A 1CZAN 2QWNA 3WT0A 4CZGA 5KQDA 3SMPA 3GOIA 1BU6O 4CJ7A 2QWPA 1T44A 3DXKA 4A2BA 5ELZA 5AZIA 3U9ZA 2ZGZA 3ULEB 2E88A 2Q1NA 1Z05A 3MN6A 4JD2A 4CD3A 4H0PA 3JS6A 1QQOA 3LDOA 3GE1A 4C23A 3LDLA 4DQ8A 5KPZA 4NO7A 2V7ZA 2E20A 4H0OA 5AQKA 1HKBA 3QBWA 4DCHA 3LM2A 3VGLA 3L0QA 5AQFA 2P9PB 3VGMA 1JCGA 1QQNA 1GLFO 4FPBA 4I6MA 5AFUA 2CGLA 2E2PA 1U2VA 4RTFD 1HUXA 3O6WA 4IXCA 5F2RA 5KPRA 2E1ZA 2FF6A 3WUHA 4CZLA 3DWLA 3O80A 3A8YA 5TKYA 3MDQA 3H1QA 1E4GT 2P9NA 1TYQA 3P4IA 4YDUC 5JLFA 1DEJA 3D2FB 4B9QA 4BGBA 4FWQA 5LY3A 2A3ZA 2YJEA 2P9IB 2GWKA 3AAPA 4AM6A 5FPNA 1GLLO 3SK3A 4BC3A 3CERA 2FSKA 2FSNA 4FOIA 2ASOA 4PL8A 3SLCA 4DHYA 2YJFA 3C0BA 1E4FT 3DXMB 2F9WA 1BUPA 2QWMA 1BOTO 2VWBA 2IVNA 1K8KB 5ADXA 4BRHA 5BPNA 5BN9A 1GLEG 1HLUA 3BUZB 2GEMA 4GNIA 3R9PA 4CBUA 5LJVA 1HX1A 2IIRA 5FPEA 3CIPA 2P9UA 2PBDA 5E26A 4FWKA 3O1WA 5AQGA 2A40A 5AQOA 5AQMA 2A42A 2AA4A 4PKHA 5KPTA 2V51B 4WQ4A 3VEOA 2QW9A 3ZX2A 3HTVA 1BO5O 3IFRA 3MN5A 1ATNA 3VF4A 3LDNA 4IJAA 4A61A 4B1XB 1GLDG 4QS9A 2YHWA 4K41A 3FFKB 4JD2B 4WQ5C 1MA9B 3OHRA 3FLCO 4B1YB 4BC2A 5CE3A 1KAYA 5EVZA 4JN4A 1X3NA 1SQKA 4BVOA 1MWKA 4BRGA 4FO0A 3H45C 4H03B 2GUPA 3HBTA 3H46O 2HOEA 2AP1A 3UE5A 3O4WA 5BR9A 4CBXA 3A5NC 2P9KA 1XQSC 4Y0WA 4I6MB 3LM9A 4FWMA 4RWTA 1DGKN 3MK6A 1U2VB 5AQHA 1NGJA 5AQUA 2KHOA 5AQJA 5EOYA 3UB5A 1NGBA 4BQZA 1XC3A 1S22A 3HI0A 4CZEA 4FWNA 2D0PA 5BREA 1C0FA 3GDQA 4H0TB 3VESA 1ZC6A 3QDKA 1NMDA 3R8EA 3WXJA 3ZEUB 2QXLA 1MWMA 3D7EO 5BPMA 4BGAA 1BWFO 4JAXA 2YHYA 1U6ZA 1ESVA 2E1YA 1JCEA 5AQNA 5LJWA 2HF3A 3W0LA 1P8ZA 2FF3B 3RSEB 3ZX3A 3H3OB 4ISEA 4DB3A 3MN7A 1NM1A 1GLAG 2P9LB 3ATUA 1H1VA 3CJBA 2ZWHA 1Z6RA 3MMVA 2CGJA 5AZJB 3KVGA 3M3ZA 4FSVA 1NGGA 2W40A 1D4XA 2Q36A 3A5OC 3BF3A 3FE1A 3BEXA 2Q2RA 1RFQA 2Q0UA 3O1BA 1ZBSA 2QWRA 2HMPA 2YHXA 4BG8A 2QWLA 1X9JA 1YVNA 2Q0RA 2QWQA 4CD1A 3EL2A 4FWRA 3WQUA 4BR5A 3LDQA 2J4RA 1NGAA 2ASMA 1GLBG 1QHAA 2D1KA 1DKGD 3U4LA 1C0GA 2Q97A 5F0XA 3QICA 1S3XA 3ZETA 1G99A 2NLXA 1V4SA 4BRFA 2I7NA 2D4WA 5FPDA 3CQYA 5BRDA 4Z94A 1WOQA 3I8BA 4MO5A 3WQTA 1LCUA 3C7NB 3F9MA 2E2QA 3O8MA 4B1ZA 4BRPA 2E8AA 2P9KB 5AQTA 2A5XA 1NGEA 3UKRB 4JHDB 3L6QA 5EY4A 2P9SA 4RCHA 4BRMA 5JMVA 2PAVA 3CETA 4IO8A 1TUUA 5EXWA 4CZKA 3A0IX 4M7XA 1NWKA 2V7YA 1ATSA 1T6CA 3ULEA 4H5VA 3M6GA 4FWLA 3VERA 2A6AA 3FGUA 4PL7A 2YI1A 4HTLA 5AQPA 3IUCA 1BDGA 1NGIA 2I7PA 2UYTA 1ATRA 3AAQA 3DXKB 5AZIB 2DPNA 1Q18A 3M1FA 4FWPA 4J8FA 2GELA 2ZGYA 3GBTA 3AY9A 4BC5A 3HSCA 4BRIA 1SZ2A 2E2OA 3ATVA 4L3QA 3FR0A 3KZBA 4H5WA 3SJHA 3TPQA 3EO3A 2BUPA 4FWOA 2D0OA 1RGIA 4EHTA 3QFPA 3S41A 3H1VX 3MN9A 1NGHA 5JICA 5AQSA 2FSJA 3D2FA 3VEVA 5AQWA 2HF4A 5BN8A 5AQQA 1QZ6A 3VEYA 2FLOA 4EHUA 2P9IA 1Y64A 4M63C 2ASPA 4H0YB 4CZJA 4BRCA 3WXIA 3ZX0A 4XH1A 2F9TA 4CBWA 3VEZA 3VEXA 3ENOA 2P9NB 4WYBA 1TYQB 3HZ6A 4H0VB 3DXMA 3R6MA 3CHWA 4BC4A 4BRQA 3EKUA 1T6DA 4BROA 1WUAA 3WEEA 1K8KA 5EX5A 3O08A 3VGKA 2IVOA 1TUYA 3JXUA 5AQLA 3TU5A 4M7YA 1GLJO 3BP8A 5BRFA 4XEIA 4YDUA 3EZWA 3VETA 4ISGA 4MLEA 4CZIA 3W3DA 3AARA 2NZTA 4A62A 4BG9A 3CJ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WLJA 3RTVA 3PX0A 3DLBA 2P9SB 3CFOA 3PO5A 5T7BA 3OBYA 4RW8A 5F1XA 1VQ7N 4K8XA 3VF2A 3KTQA 3LALA 3TTCA 4BQLA 3OYDA 4UY8O 3L4IA 4CZHA 4CJ4A 4B9MA 3SAHA 1W97L 3BZKA 1BIZA 4MLHA 1XNQK 3NGIA 2EWSA 5KTQA 2DFFA 1KLMA 1QZ5A 3OYIA 3CPWM 1M90O 3BZCA 4IFEA 1N34K 4EZ6A 2NRVA 2BGGA 2A41A 2D0CA 1TAUA 4BEBA 3NBPA 4C8NA 3TWHA 1SKSA 4FJXA 2VWKA 3HT3A 2YX6A 3DLKA 3SPYA 5EU7A 3CJCA 4OPJA 3OJUA 3V6DA 3HM9A 5I9EB 3U3GA 4YNQA 4EAHD 2RKIA 4JS5A 2HMIA 1SV5A 4BR2A 1HNWK 3CQXA 4OJRA 3LPUA 4JNEA 3ZT2A 3CC4N 3KHYA 3FZMA 2FXUA 3QIPA 3EN9A 5D3GA 5AR0A 3O3GA 2B4JA 2X6NA 5FDLA 3WEEB 3VEWA 4NB4A 1TL3A 1J6ZA 2QK9A 4FZZA 2O8CA 2O8FB 2VYPA 5E84A 4DSKA 3CCSN 1Q86O 1ZXOA 2FBTA 1HNVA 4AHSA 2O8DB 3ENBA 3VQQA 4JKGA 2ITMA 3M8RA 4IWVA 4XH5A 3VQ6A 2Q31A 3OY9A 4O8KA 5AQRA 4KBOA 1SL2A 1HYSA 3NE6A 1KAXA 4DTXA 4KI6A 1RT5A 3I33A 3OTOK 2HHVA 1O13A 1KVCA 5B8HA 3NMUA 3FZKA 1X3MA 4CZMA 4B1VA 2YV0X 5MLCQ 4FOEA 4DF4A 2OZMA 4CIFA 4KB0A 3SAFA 2V52B 1ZBHA 3C7NA 3SMSA 4A2AA 3AVHA 2HVIA 2OANA 3ZETB 2FBXA 2G8KA 4BDZA 4H5TA 4JHDA 3CJ9A 1TAQA 3OW2M 4H5RA 2NRHA 4CEQA 3NH2A 3WXMB 3GL1A 4BRKA 4O5BA 4W5RA 2H3GX 3VQ7A 3KJVA 3MECA 5J2PA 1JCFA 2ITGA 3LP3A 3I8DA 2IS3A 3VENA 4FM2A 2D5RA 3TTFA 4BE0A 4DSJA 3LDPA 4EP4A 5DM6L 1R59O 1C0TA 4XIUA 3N4QA 2KKZA 4CZGA 4E89A 3PX4A 1BU6O 4JI6K 2QWPA 3QLHA 5AZIA 1YF5L 1J5OA 4LY7A 4YFUA 3WNFA 3L8BA 2BH1A 1YTAA 4CJFA 4W5OA 3THYA 1QQOA 3LDOA 4C23A 4FYDA 2O4GA 4KFBA 4DWIA 4MFBA 4X66K 4KH4A 3SUOA 4N56A 3ZSVA 3EEQA 3SV3A 3QEIA 1J5EK 1S1TA 3AVGA 1VQ8N 4ILHA 5CYMA 1JKHA 4DCHA 3O3HA 3VQCA 2VG5A 3RRGA 5C0YA 3K9JA 4JKGB 4QCLA 1LW0A 4LFCK 4LH5A 3O6WA 4IXCA 3LWLA 4CGJA 4NYNA 4CF9A 4LSLA 5TKYA 3H1QA 4OPAA 1E4GT 1DEJA 4B9QA 5LY3A 3S9HA 3MXMA 4KPYA 1YT3A 3NH1A 1TKXA 2P9IB 1YVUA 1YJNN 4RW7A 5GAEP 1D8YA 1LWCA 4PL8A 4ELTA 1WAFA 1E4FT 4O44A 2F9WA 4JKHA 1BL3A 1BUPA 2QWMA 4KTQA 5M1PA 5BN9A 3AV9A 5LMNK 2GEMA 4GNIA 4FLXA 4CBUA 3THVA 1HX1A 3C94A 1C1AA 3CPEA 2P9UA 5A2QO 1NK0A 5CYQA 4YOWA 4NYFA 2PZSA 3SBGA 1U45A 1Q9XA 4FJ9A 3VEOA 3ISNC 2QW9A 1BO5O 2Y1IA 1ATNA 3TANA 2HW3A 2DY4A 1SS6A 4C8LA 5M1FA 2VGNA 3CCVN 4WQ5C 1MA9B 3FLCO 5CE3A 4JN4A 1SQKA 1MWKA 4FO0A 3I56N 1JXBA 4PY5A 3HYFA 1REVA 2HOEA 3F73A 4KO0A 4C8MA 1ILYA 1WSIA 1IKYA 3CC2N 3A5NC 3QESA 4E7HA 1XQSC 5K14A 3CFPA 3PSIA 3CCQN 3HOTA 4Y1CA 4FWMA 4GVEA 1DGKN 4N41A 5AQHA 5AQUA 5EOYA 2KHOA 1BI4A 2OCEA 3C6HA 4CZEA 1S22A 4B3OA 4LF7K 5I3UA 4F3TA 4I2PA 2IGIA 3ZYYX 2YNGA 2QXLA 1MWMA 4JV5K 1RTDA 4NXNK 3TSUA 3DRRA 1RBTA 5LJWA 3OYNA 3NVMA 1P8ZA 3CFRA 3HPOA 1GLAG 3ATUA 4EP5A 1H1VA 3CCMN 5LMUK 2KZMA 4FM0A 1UA1A 3PV8A 3LP0A 2W40A 3DLRA 1D4XA 4CIEA 2Q36A 3FE1A 5AJ3K 1S1XA 1ZBSA 2QWRA 3G10A 4HUGA 4DR3K 3V9XA 4WFNL 1SL0A 3VQPA 2QWLA 4CFDA 4DSLA 2W6LA 4CD1A 3KKSA 4CJQA 3ZSQA 4PA1A 1NGAA 1JLGA 1GLBG 4IG0A 1S9GA 1T03A 4CHNA 2D1KA 1NOYA 1S3XA 1RT3A 2NLXA 1V4SA 3OYMA 3DLHA 3CQYA 4F8RA 4K8ZA 4A5AA 1WOQA 3I8BA 4CEZA 4Z4CA 2OPSA 4CESA 2FBVA 4ZTJA 5CZ1A 4CECA 3O8MA 4B1ZA 4JYAK 2E8AA 1SL1A 2A5XA 4OPHA 3F9KA 4BRMA 5HRSA 1HR0K 2PAVA 2HHTA 2X78A 2D0AA 4DFKA 5HRRA 4JI1K 5IWAK 3AVBA 4EZ9A 1U47A 1QQCA 3K5NA 3ULEA 4CJ3A 1YIJN 4J2EA 1EP4A 2GX9A 4DR7K 4NCBA 3L4QA 4C1NK 1NJWA 3LP1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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