4HTUA

Structure of 5-chlorouracil modified a:u base pair
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
EEIIWESLSVDVGSQGNPGIVEYKGVDTKTGEVLFEREPIPIGTNNMGEFLAIVHGLRYLKERNSRKPIYSNSQTAIKWVKDKKAKSTLVRNEETALIWKLVDEAEEWLNTHTYETPILKWQTDKWGEIKADYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/dna
molecule keywords Ribonuclease H
publication title Structure, stability and function of 5-chlorouracil modified A:U and G:U base pairs.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus halodurans
total genus 43
structure length 134
sequence length 134
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2012-11-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4htuA00
5J2MA 3OYFA 4CGFA 2HHWA 1Z26A 4FLZA 3QLHA 3KD5E 3AVHA 3OYCA 2JGUA 5HRNA 3LANA 3LAMA 4IG0A 3L2RA 4DSEA 3OYLA 4HCBA 4J2BA 4DU3A 4NCBA 2HNZA 4FLYA 2FBYA 1TAQA 4EZ6A 1VRUA 3KJVA 3CM5A 3SV4A 1S1VA 2KQ2A 2X78A 2GUIA 2IS3A 2YKNA 4CF1A 3D0PA 3MXJA 4CJLA 1LWEA 4CCHA 3ISNC 4FM0A 3SI6A 3H08A 3HP9A 3OS2A 1C1BA 3KD1E 4NCGA 2ZQBA 5EU7A 1D5AA 4N5SA 5J2PA 1SKRA 3F9KA 3O4NA 2EHGA 4DLGA 1L3TA 2G8WA 4DS4A 4FJ8A 4CEQA 4FZXC 4E7HA 4C8OA 4CK1A 4EP4A 3DOLA 4DTSA 3AO5A 1B9DA 4KHSA 3AA3A 4RW9A 3IRXA 4KHUA 4F2SA 4M3XA 4CEOA 1C1CA 1JLFA 2RPIA 5KRSA 3SYZA 2XHBA 5FROA 5HP1A 2WONA 4Y1DA 4CHQA 4RG8A 3L3UA 4AHUA 1BL3A 4DF4A 4FJKA 4M3RA 4FLTA 4CHYA 1SL1A 4HHTA 4O0JA 4KTZA 2P5GA 3HSTB 3V4IA 3HPOA 3C94A 4MQ3A 1ZBFA 3O3HA 3L2UA 4I2QA 3ZT2A 4FLVA 1IG9A 4I9LA 4CGIA 2HHSA 3VA3A 3ZSWA 3LP1A 1I3AA 1HRHA 4M3UA 4OJRA 3AO1A 4DFKA 3NF9A 2HHUA 2F96A 5J2NA 2A1SA 4IG3A 2PZSA 4DQSA 1WSJA 1BISA 3S3OA 4OLBA 1XI1A 3QESA 5FDLA 1TL3A 2IOCA 1RBRA 4M45A 3VQCA 2BE2A 2OPQA 3TABA 4IDKA 3B6PA 4BDZA 1I39A 1G15A 4FJMA 3AO4A 4BWMA 1SL0A 5CY4A 1D9DA 1W0HA 3C95A 1BCMA 1QS4A 1YT3A 2XRIA 3QIOA 4CIEA 4C8LA 4KREA 1WSHA 2GBZA 3HM9A 1EP4A 2Z1JA 1HJRA 1VSLA 1VSIA 4CF2A 4DTJA 1TKDA 2O4IA 1QTMA 1NKCA 1FXXA 3DLHA 4KRFA 2KZZA 3ZT3A 4B3OA 1BGXT 3NGIA 4DU4A 3TAPA 3ASMA 1VSKA 3PX0A 1TL1A 3LPTA 2A1RA 4ZTFA 1MU2A 4M3YA 2I5JA 1NJXA 4KI6A 1A5VA 2XY8A 3L2QA 1TK0A 2RN2A 4F8RA 3LZIA 3DLEA 3LP3A 4QOZB 4KPYA 3MEEA 4CGDA 1HYVA 2YNHA 3O3FA 2HVIA 3D45A 3AVCA 3JSMA 3F73A 3P83D 1QE1A 3I0SA 4G1QA 1VSHA 1EX4A 3QETA 4PQUA 4ID5A 4CFBA 3TANA 1QSSA 3TAQA 4FLUA 3BDPA 1EETA 2Z1IA 2P5OA 4CJQA 1TKTA 3OY9A 4CF8A 4DMNA 1VSFA 3VQPA 3KLHA 3TWHA 3G10A 4CECA 4AH9A 4DSIA 1UA1A 4DTNA 3S9HA 4FJNA 1CZBA 2IC3A 4UQGA 1F21A 3QEPA 1TKZA 1NKBA 1LAVA 5KGXA 2KFZA 4GMJB 1QQCA 3VQ8A 3NF8A 3LDSA 4L8RB 1RDDA 4CEZA 4B9MA 3DRRA 1RT1A 1FKOA 1LWCA 3CQ8A 4CIGA 5KTQA 3HK2A 3LAKA 2P1JA 3ZSRA 1U49A 1JL1A 4CIFA 1K6YA 2Y1JA 3ZT4A 3DLKA 1ZBIA 4RW6A 3OYKA 1NJWA 4LH5A 1NOZA 3AVJA 1DLOA 4CGGA 1NK0A 3NF7A 3VQ9A 1R0AA 2LSNA 3K2PA 2QK9A 4CESA 1JXEA 1HMVA 1RBTA 3HVRA 3PY8A 5JS2A 4M3WA 4O44A 3VQ4A 3VQAA 2FBVA 4CGHA 1S9GA 1BIZA 3V9UA 2HNDA 3SZ2A 1A5WA 1A5XA 4H8KA 1SV5A 5KI6A 4CERA 3T3FA 2E6MA 1NOYA 2ATQA 4OKEA 2B6AA 3NH1A 1S1XA 4Z4EA 4JS5A 3K5LA 3ZSOA 1UA0A 1ITGA 4CJKA 1GOBA 4B08A 4NCAA 3LP0A 1J5OA 3KK3A 4KKOA 2EX3A 3B6OA 3OYJA 3WNFA 2D5RA 3WNHA 4CHPA 3NHGA 4E0DA 2VWJA 2HB5A 4DTUA 3V6DA 1VK0A 3LP2A 5DMRA 4N56A 4BACA 3HVTA 1RBVA 3WNEA 4DQIA 3CFPA 4M3TA 4H4MA 3TAMA 4CK3A 3QEIA 3V1OA 4LH4A 1SUQA 3M8RA 1C0MA 1YTAA 1D9FA 4F3OA 1WSFA 4E7IA 3TARA 4HCCA 4JRPA 2G8FA 4CJPA 1RDAA 2D0AA 3MXIA 1JLAA 3K5NA 3VQDA 4CFAA 3VA0A 4BE0A 4DTMA 1Q9XA 4M42A 5C25A 4M3ZA 1HNVA 3VQBA 1LWFA 4R5PA 1S6PA 3KLGA 3L2VA 5E41A 3AO2A 4KFBA 4FCYA 5I3UA 4M41A 1L3SA 4DFJA 1X9SA 4FYDA 4PA1A 3HT3A 1S9EA 4Q0BA 3RTVA 4LSLA 3HYFA 3OYIA 5K14A 2G8IA 3AVNA 4B9LA 4Z4FA 2FBXA 4O4GA 3HP6A 3MEGA 2YHAA 1KFSA 4LD0A 3RR8A 3OYMA 2XY7A 3V1QA 3V9WA 4F3TA 2KZMA 4KV8A 4CJSA 2X6NA 3AO3A 3ZSZA 4GW6A 4CJTA 1S1WA 3IG1A 2RF2A 4OVLA 4DQRA 2W42A 2OYQA 3VQ7A 1RT7A 2OPSA 1J54A 2BANA 1XC9A 3DLGA 3NH0A 4JS4A 2B4JA 4QCLA 1ASWA 3OYAA 3U3YA 3AVMA 1B92A 4OLAA 3C6TA 3MEDA 4IFYA 4W5OA 3DYAA 4B9TA 2PYJA 3NAEA 4QAGA 3QEXA 3K5MA 3CG7A 3PX4A 3NCIA 3OYGA 2JLEA 4OKKA 5FRNA 4CJ5A 3RR7A 5CYMA 5D3GA 2O4GA 3AVIA 4CEEA 3NGZA 1FK9A 2PY5A 4HVJA 3VQQA 4FLXA 4AHRA 4DTOA 1TK8A 3I0RA 1N5YA 3TI0A 3K57A 4FJLA 1ZBUA 5HBMA 4W5QA 2VWKA 1J9AA 4C8NA 1FKPA 1RT3A 1T03A 2G8UA 4W5NA 4K8ZA 1YVUA 5CYQA 2QKKA 2YNIA 3RMAA 2HW3A 3NE6A 2P51A 4CJVA 4C8KA 2F8TA 3V81A 1BI4B 4KO0A 1JLCA 1O1WA 5HLFA 4LY7A 4CEAA 1N6QA 4FJ7A 3OS1A 1WAJA 3V9SA 2Z1HA 4GVMA 1XHZA 1U45A 4CE9A 4NYNA 1IKXA 4E19A 1RTHA 1NJYA 1BHLA 4KTQA 4FK4A 1T8EA 3K58A 3ZSVA 3O4QA 3U6FA 4KI4A 4CEFA 4E1MA 3L8BA 1NK7A 1GOAA 1KVBA 1KSPA 4AHTA 4J2AA 3HL8A 4CF9A 3TAFA 4Z4CA 3U3GA 4K8XA 3S3NA 1ZBLA 1TVRA 1UAXA 3SUQA 1UOCA 4CHOA 1NJZA 1KRPA 3RRGA 2KW4A 4ELTA 3OVNA 4ID1A 2OA8A 4AHVA 4N41A 4ZHRA 3CYMA 3ITHA 3KLEA 1WAFA 4ELVA 5SZTA 1KCFA 3JYTA 1XHXA 3RRHA 1ZYQA 1KVCA 1TGOA 4Z4HA 2B5JA 3M8PA 4AHSA 4JLHA 2RKIA 4YFUA 4FVMA 3SCXA 3VQEA 1RBUA 1U48A 1RTJA 1U04A 3QNNA 3RMBA 1DTTA 1QSLA 3AA2A 2YHBA 4OKJA 1KVAA 1KTQA 1KLMA 4B8AB 4BE2A 2Y1IA 3SNNA 2PYLA 2HMIA 4KB1A 3AA5X 3DRSA 3C6UA 3KK2A 3EYZA 4RW8A 3P5JA 4CEBA 3NDKA 3TAEA 4BDPA 3VN5A 1NKEA 3AVGA 1QHTA 1X9WA 1LW0A 1KFDA 4CGJA 3OJUA 1X1PA 4H4OA 4KHNA 1D8YA 2NUBA 3M8SA 3OYNA 3MXMA 1NK8A 4CHZA 4F2RA 2Q3SA 2ETJA 1L3VA 1HYZA 3LPUA 2DY4A 2XY6A 4N76A 3SQ1A 1HNIA 3DRPA 4O55A 3SQ0A 2Z1GA 1NK5A 2HHQA 1SL2A 4DSFA 4NYFA 4FJIA 4RW7A 4CJRA 4WE1A 1L5UA 3SQ4A 1TV6A 2ZD1A 4FZYA 2HVHA 4FW2A 1RNHA 4FLWA 2VG6A 4E7KA 4EZ9A 4DF8A 1WN7A 3RMDA 1RDCA 3SQ2A 3QINA 3QO9A 3ALYA 3NFAA 4OGEA 3OJSA 1Z25A 4Q5VA 3KLIA 1BIUA 3DLBA 3DMJA 1DTQA 4W5TA 1C0TA 1RT6A 1HQEA 2DFFA 2IDOA 1BCOA 3DLRA 1JLEA 2FBTA 1W9HA 4FW1A 5CZ2A 1WNSA 1TK5A 1NK9A 4KB0A 4HUFA 3SPZA 4KTWA 1WSEA 2X6SA 5HRPA 4DTPA 4DQPA 5T7BA 1RT4A 3ZSXA 3OS0A 3PO4A 2KFNA 1SKWA 3T1AA 4CJ4A 1RTDA 2G8HA 4TSXA 3V1RA 1UWBA 3I8DA 1TAUA 3DI6A 3P1GA 3LWMA 4E7LA 3AV9A 3CM6A 4I2PA 3V9XA 4DQQA 4CJUA 5KGWA 2YNGA 3WNGA 5C24A 4W5RA 5HROA 4Z4GA 1RCHA 3AVAA 4Y1CA 1TKXA 3HPGA 3L2WA 3HO1A 2HHTA 1WSGA 4ZTJA 3CFRA 1Q8IA 3NGYA 1VSEA 4BDYA 1CLQA 2IAJA 2XY5A 4FJGA 4Z4IA 3SPYA 4HUEA 4KHYA 2DFEA 1ASVA 3EZ5A 3O3GA 3HJFA 1YTUA 2QXFA 2DTUA 1IKVA 1JLGA 1JLQA 4BE1A 3KTQA 5JS1A 2OZMA 3OYBA 3OYHA 2F8SA 1VRTA 4MFBA 4ELUA 4FJHA 5HRRA 4YNQA 3ZSQA 1CXUA 3KKSA 3V9ZA 4N47A 4BWJA 1HPZA 3AVKA 1HQUA 1RTIA 3K59A 4FM2A 1LW2A 1RILA 3LWLA 1KLNA 2E6LA 4CJWA 4B9UA 3KK1A 3SV3A 4OPJA 4KAZA 4AHCA 4E7JA 3TR8A 4LSNA 4ICLA 3NF6A 3QEVA 5CZ1A 1VSDA 3CFOA 4CHNA 1L3UA 4DFMA 3KLFA 4IKFA 4FXDA 1ASUA 2ITGA 3DM2A 1JL2A 3M8QA 4CF0A 4CJ3A 4FM1A 3QEWA 1Q9YA 4B9NA 3QIPA 3QNOA 3PV8A 1NK4A 1IH7A 1J53A 1QSYA 3T19A 2R7YA 4C8MA 3S3MA 3OYDA 4DTRA 3PO5A 4F4KA 2X74A 4OPKA 3TAGA 3PUFA 3RWUA 1C6VA 4O0IA 2D0CA 1S5JA 1JKHA 2YNFA 2VG7A 4CJFA 5I42A 1CXQA 4CK2A 2ZE2A 3E01A 1U47A 4KHQA 2XO7A 4DSLA 3LALA 1C0UA 2DFHA 3VQ5A 3ZT0A 4EP5A 1SKSA 4I9QA 3A2FA 3AVBA 4XIUA 3RMCA 4FK2A 2QKBA 3HPHA 1ZBHA 3ZCMA 4E1NA 2OPPA 3KIOA 4E89A 1HYSA 1RT5A 4B8CA 3NBPA 4E3SA 1LAWA 3DOKA 3L3VA 4O5BA 3VQ6A 1C1AA 2VG5A 5J1EA 3HXMA 3THVA 1U4BA 4DSJA 2BGGA 3LZJA 4JRQA 5FRMA 2OPRA 2OZSA 3KKRA 4IBNA 1WSIA 3ULDA 4HUGA 4DFPA 2WOMA 4DSKA 4RW4A 4FJ5A 1IO2A 1T05A 1RT2A 3SUNA 2HHVA 2HNYA 4DG1A 2BDPA 4B9VA 2KTQA 2YV0X 4CFCA 4FZZA 1WLJA 1XWLA 3AVFA 1X9MA 2YKMA 2G8KA 5C42A 4J2EA 1Y97A 3K5OA 4DLEA 5HRSA 3FFIA 3ZSYA 4DU1A 3UIQA 4CEDA 5J2QA 4PY5A 3G0ZA 3AA4A 5KRTA 3BGRA 4CJEA 3ZT1A 4DTXA 4DWIA 4FK0A 3NH2A 5SWMA 4FJ9A 2IGIA 1NK6A 4OGCA 1VSMA 3IAYA 4I7FA 4PUOA 1BQMA 2E4LA 3MECA 1IKYA 1JLBA 3SUOA 4FJJA 1RBSA 4DS5A 4AILC 2G8VA 4IFVA 1B9FA 2D0BA 1BI4A 1REVA 4Z0UA 3EY1A 4CFDA 3IS9A 1S1TA 3MAQA 1S1UA 3QERA 3SJJA 1LV5A 3OYEA 5DK5A 4B9SA 4J2DA 1GOCA 4KHWA 2AJQA 3AVLA 4FJXA 2HHXA 2GV9A 2FC0A 1IKWA 4HTUA 3SUPA 1EXQA 1EKEA 1CZ9A 1VSJA 4PWDA 1RDBA 1BQNA 3PX6A 1S6QA 1T7PA 1JXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CMAN 4Y0WA 5FLXO 5JLFA 2JGUA 1LCUA 4IG0A 4HCBA 4MDAA 5AQGA 5M1PA 3OYLA 3BZCA 1GLBG 1XNRK 3CJ9A 1VRUA 4FSVA 5M1QA 3G71N 1Q81O 2E2NA 1J6ZA 2IS3A 2YKNA 4PKGA 3H08A 4IXCA 1C1BA 3WQTA 4NCGA 5IT9O 2NNWA 1D5AA 2EHGA 4O5FA 4E7HA 4CK1A 4FO0A 3L4QA 2RPIA 5KRSA 1EWQA 4Y1DA 4AHUA 1K8AO 3LDQA 3E9LA 1KAXA 4B1WB 3CCUN 4KTZA 3O5BA 3HPOA 4I2QA 3ZT2A 3C6HA 4I9LA 2HHSA 2E1YA 4JI2K 4BRCA 4BG9A 4OJRA 3AO1A 3VF4A 4JKGB 1E4FT 4LF7K 4IG3A 3QFUA 3LM2A 1BISA 5FDLA 4FWNA 2P9SA 4M45A 3CPEA 3O8MA 3AGRA 4IDKA 4BDZA 4KH6A 2YHWA 4FJMA 4BC2A 1SL0A 1XMOK 5JVGL 4CF2A 2O4IA 1QTMA 3DLHA 4KRFA 1KD1O 4JKDA 3NGIA 3KK7A 3THWB 3CC7N 1NJXA 1A5VA 1CZAN 1Z6RA 5BPLA 5F2RA 1ATSA 3ZX0A 4CGDA 3W0LA 1TUYA 1HYVA 2YNHA 5JICA 3AVCA 4M63C 5AQWA 3JSMA 3P83D 3I0SA 5A2QO 4JKGA 1VSHA 3QETA 4BR4A 4PQUA 4BROA 3TANA 2FSNA 3TAQA 4FLUA 3M6GA 4CF8A 1VSFA 4FJNA 4AH9A 3ID6A 4CI6A 3QEPA 1TKZA 3KWIA 3LDSA 3VQ8A 4KHPK 4B9MA 3CQ8A 1LWCA 5AQSA 5KTQA 3LAKA 4KBOA 2P1JA 1ZBIA 4RW6A 1NOZA 2P9LA 3NMUA 1VQ4N 1NK0A 1OH5A 3VQ9A 1R0AA 4C23A 3D6RA 1HMVA 2QEXN 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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