4PL7A

Structure of komagataella pastoris actin-thymosin beta4 hybrid
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
425
structure length
382
Chain Sequence
VAALVIDNGSGMCKAGYAGDDAPHTVFPSVVGSFVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRLAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYTFSTSAEREIVRDIKEKLCYVALDFDQELQTSSQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLEASGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYSNIVMSGGTTMFPGIAERMQKELTALAPSSMKVKISAPPERKYSVWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYDESDMAEIEKFDKSKLKKTETQEKNPLPSKETIEQEKQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein, contractile protein
molecule keywords Actin,Thymosin beta-4
publication title Structural basis of thymosin-beta 4/profilin exchange leading to actin filament polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Komagataella pastoris
total genus 126
structure length 382
sequence length 425
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01290 Thymosin Thymosin beta-4 family
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4pl7A01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4pl7A03
3LM2A 3LDNA 3VESA 3S41A 3VEXA 4IJNA 1S3XA 1IG8A 4ISEA 4XEIA 2AA4A 2HF3A 2QWLA 3FZKA 3WXKA 1XUPO 4F9OA 3LDPA 3D2FB 3QBXA 1V4SA 3A5NC 4RTFD 5KPZA 3D2FA 5BN8A 1HLUA 4WQ5A 3M1FA 5JLFA 5FPNA 4FWMA 1SQKA 4Y0WA 2YHYA 1EQYA 3MCPA 4IJAA 2YJEA 4M7YA 5EXWA 2HMPA 3CQYA 2HF4A 5E26A 1KAYA 2OANA 5AQIA 1Z05A 5E84A 1RGIA 4B1WB 3VOVA 5BPNA 2GELA 3SK3A 3JXUA 3G25A 2E2OA 4PL8A 2D4WA 3MK6A 3BF3A 4MO4A 1BOTO 1NGJA 3BP8A 5AQXA 3ZETB 4A2BA 1GLAG 2E2PA 3ZETA 4B1VA 3BUZB 4A62A 2Q1NA 3AAQA 2I7PA 2QWMA 1HUXA 5F0XA 1E4GT 2E2NA 1GLEG 1T6CA 2ZGYA 4DB3A 3LL3A 1BA0A 4BG9A 1SZ2A 4BRNA 3LDQA 3IUCA 1KAZA 3O1BA 4IXCA 4YDUA 5BR9A 3ZEUB 4MLHA 2ASPA 1BO5O 2V52B 3ZEUA 3WT0A 1HJOA 2P9UB 3QMLA 2QWQA 2P9KB 3FZHA 4H03B 2P9KA 5EOYA 1NLVA 5LJVA 3HZ6A 4FWLA 1NGHA 1NWKA 2I7NA 3H1VX 4H0PA 4H0XB 5JICA 3BF1A 3M3ZA 3CI5A 1XQSC 5AQTA 4HTLA 1MA9B 4CZHA 2E20A 3L0QA 4FL9A 3F9MA 2E2QA 3CJ7A 4BRGA 3AAPA 2CGKA 4B1YB 2IVPA 2IIRA 2J4RA 3A5OC 4BC4A 2BUPA 5AQWA 4H5RA 5AQNA 2A42A 3VGLA 3IFRA 3EL2A 5BRHA 3LDLA 4QS8A 4CD1A 1D4XA 1RFQA 4BR0A 1NM1A 2V7ZA 4WQ4C 5EX5A 3O4WA 5AQPA 5BREA 4H5VA 1QZ6A 5AQSA 4FPBA 4XH4A 2CGJA 1DGKN 3DWLA 2D1KA 3UE5A 4CZKA 1GLBG 3GL1A 2WUSA 3FGUA 2V7YA 4AM7A 5AQMA 3C7NB 1MWMA 4H0TB 1ZBSA 3ID8A 1DEJA 3WEEB 1ATRA 3I33A 1GLFO 3I8BA 3FZLA 2ZF5O 3WEEA 1GLDG 4ISGA 1ESVA 4BG8A 5KPTA 4BC2A 4EHTA 1TYQB 1V4TA 2P9PB 3W3DA 1TYQA 3ENOA 2P9PA 3WQUA 4CZJA 3UKRB 3R8EA 3CJCA 3UKRA 1X3MA 3QB0A 1OKJA 4QS7A 5ADXH 1HKCA 2A3ZA 4PKIA 3O6WA 3MN5A 3FE1A 4BREA 2F9TA 4H0YB 5AQOA 5JMVA 5LY3A 4FOIA 2ITMA 1BWFO 3EN9A 3L6QA 1G99A 3AY9A 4BC5A 3D7EO 5AQQA 4BGAA 4KBOA 2FSNA 3FFKB 3O8MA 2HOEA 3W0LA 5AQLA 4DHYA 4AM6A 5AQKA 4I6MB 2E88A 4I6MA 4WYBA 4BR4A 4BRLA 2Q31A 4H5TA 2A6AA 3CQXA 4A61A 2Q0RA 5AQHA 2E1YA 4H5NA 3VERA 5FPEA 2F9WA 4BRFA 1BU6O 4CZFA 1NGAA 2FSJA 3WXJA 2VYPA 2P9IB 2FF3B 5LJWA 4ISFA 5FPMA 2P9IA 1CZAN 3U9ZA 2GTDA 1NGIA 3D2EB 5BN9A 2ZGZA 3D2EA 3HSCA 4FWQA 4CJ7A 3ENHA 3U8XA 2GWJA 3H3NO 1YUWA 3ZX2A 3P4IA 1NGDA 4FWOA 5AR0A 3WQTA 4BR9A 4E1JA 4CI6A 1NGFA 3OHRA 3SMPA 1JCFA 4B9QA 4EFHA 4BRHA 4IZ9A 5AQVA 5AFUH 4XH5A 4JHDB 3B8AX 3O80A 2GEMA 1QHAA 4JHDA 3MN7A 1IJJA 2VWBA 5BPLA 1U2VB 5AQFA 3WXIA 4JD2B 4J8FA 3LM9A 5ADXA 1ATSA 1U2VA 3QFUA 2YJFA 4JD2A 5CE3A 1TUYA 3CIPA 3ATUA 4BR2A 2FLOA 1GLLO 1TUUA 3WXLA 1KAXA 1NMDA 2QWNA 3HI0A 2Q2RA 1KXPA 3CJAA 4XH1A 1LCUA 4CZLA 3IMXA 4MLEA 4BGBA 3CHWA 3M6GA 2NZTA 3GE1A 4QS9A 4BQZA 3JS6A 4GNIA 2QWPA 2PAVA 5I9EB 3EKUA 2YCHA 3O08A 4FWKA 5ELZA 4BRIA 1MDUB 1YXQA 3FZFA 3H1QA 1NGGA 3H45C 4LC9B 3CERA 3R9PA 1C0GA 3VPZA 2KHOA 4BRAA 4JNEA 5BPMA 1ZC6A 2Q97A 4MO5A 5AQYA 5JLHA 5EVZA 1XC3A 3ULEB 3MN9A 3VF4A 1Z6RA 2IVOA 3DJCA 3H46O 3ULEA 4CD3A 5AQGA 1K8KB 1GLJO 4CZGA 4WQ4A 1K8KA 4O8KA 5F2RA 4CBWA 4FOEA 5B8HA 3A0IX 4Z94A 3H6EA 4CBXA 2PBDA 4PL7A 2E1ZA 1NGBA 4BRKA 4WQ5C 5F1XA 1Q18A 3AARA 5AFUA 4RWTA 1C0FA 2W41A 3A5MC 3A8YA 4BRPA 3BEXA 3QBWA 4JAXA 2D0OA 3U9DA 5AQRA 1T44A 2CH5A 2FXUA 4B1ZA 1NBWA 1X9JA 4BROA 5KQDA 2P9LB 4BVOA 4EHUA 3FLCO 2P9LA 2A5XA 4A2AA 2A41A 3HM8A 3GOIA 1H1VA 4DCHA 1BDGA 1BUPA 2Q36A 4BR7A 3VEWA 4O5FA 4B1XB 3SMSA 2GWKA 1BG3A 3WUHA 1P8ZA 1HKBA 1WUAA 4H0OA 4RCHA 3TU5A 2P9NB 2H3GX 3HBTA 4HWIA 3ATVA 3VEZA 2P9NA 3VETA 4NO7A 4YDUC 4GY2B 3VGMA 2CH6A 4BVPA 3ZX0A 4IO8A 3CJ9A 3MMVA 2ASOA 5BRDA 1MWKA 2V51B 2NRHA 3RSEB 2FSKA 4DQ8A 4FO0A 3RSEA 2CGLA 1WOQA 4BC3A 2QWRA 3VF2A 1YAGA 4M7XA 4FWSA 3UB5A 4CBUA 1HKGA 4CZMA 3C0BA 3VEVA 3O1WA 3R6MA 2ZWHA 2QM1A 4FSVA 3EO3A 2YHWA 2UYTA 4JN4A 4C23A 2A40A 4K43A 3TPQA 1X3NA 2DPNA 4K25A 3DXKB 3O5BA 2BTFA 3EKSA 2YI1A 2P9UA 3DXKA 3QICA 1QQMA 4CZEA 1J6ZA 1S22A 2VCPA 2QW9A 3CETA 4B1UB 5FPDA 1NGEA 3MN6A 4BRQA 3L4IA 4CZIA 3SJHA 1YVNA 1JCEA 5AQUA 4PKHA 5AZJB 4FWPA 3CJ1A 5AZJA 1HX1A 4BQLA 4L3QA 3A5LC 1QQNA 1JCGA 5AZIB 1NGCA 1LOTB 2IVNA 4FWRA 5TKYA 5AZIA 2AP1A 1QZ5A 1R59O 5EY4A 3J8AA 4BRMA 1U6ZA 1ZXOA 4H5WA 3UKUB 3FZMA 1SAZA 5AQZA 4BRCA 3EZWA 4FPAA 2ASMA 3KHYA 4PKGA 3UKUA 3GDQA 3GG4A 3DAWA 1Y64A 3VF6A 3QFPA 1BA1A 2QWOA 2Q0UA 4H0VB 4NB4A 3QDKA 2EWSA 3CJBA 3VENA 2FF6A 4EAHD 1RDWX 3MDQA 4EIAA 3DXMB 3FR0A 4K41A 1QQOA 1ATNA 2QXLA 3DXMA 3GBTA 3KVGA 1GLCG 2YHXA 4BR5A 4FWNA 1HPMA 2D0PA 2E8AA 4K42A 1DKGD 3VEOA 4IWVA 2P9SB 3SLCA 4M63C 2P9SA 3H3OB 3IDHA 3LDOA 4BRDA 2W40A 2GUPA 2NLXA 3C7NA 3ZX3A 3VGKA 5KQ8A 5BRFA 1T6DA 1E4FT 3KZBA 3U4LA 3VEYA 5KPRA 5AQJA 3HTVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XC9A 3LDNA 3P83D 3VEXA 4IJNA 3M8RA 2DFHA 1Q86O 2A1RA 2QWLA 4F9OA 1XUPO 4FW1A 1V4SA 4RTFD 4LY7A 4YOWA 1HLUA 4KHNA 3AVAA 1TKXA 5JLFA 2P5GA 4RW6A 2G8WA 3K5MA 4X65K 4KHWA 5DM7L 2OANA 3KLIA 5DMRA 1Z05A 1KC8O 1RGIA 2O8DB 2GELA 3SK3A 3DLRA 3G25A 4CECA 4MO4A 1BOTO 1NGJA 5AQXA 5C25A 5C2FA 1LAVA 4B1VA 5LMUK 2I7PA 2VG7A 1VRTA 2QWMA 2E2NA 1JLFA 3LPUA 2KQ2A 3OVNA 1B92A 1SZ2A 4E89A 4KHQA 4CJSA 4FZZA 4DG1A 3LDQA 3IUCA 1KAZA 3O1BA 4IXCA 4YDUA 4BY9C 1VQ4N 2V52B 3ZEUA 4ZHRA 3WT0A 3KWIA 5HRPA 3SUQA 3QMLA 2QWQA 5M1KA 3FZHA 1TV6A 5EOYA 3HXMA 3HPHA 1NGHA 2WOMA 4CJTA 4IDKA 4AHUA 4FK0A 2IGIA 3OYNA 3M3ZA 3CI5A 4FVMA 3PUFA 1C0TA 3AVJA 3M8QA 4CZHA 3L0QA 4O44A 1KVBA 1YJ9N 3Q7BA 5FLXO 2HHIA 2J4RA 4M3WA 3A5OC 2A42A 4J2EA 1EWRA 3EL2A 4FK2A 4JKCA 2UXBK 4JKGA 1W7AA 3K5NA 1RBUA 3VQ6A 3AVMA 3L2RA 3O4WA 3HPOA 4Y1CA 4DR3K 4OLAA 3V4IA 2GUIA 2D1KA 3UE5A 5HOOA 1QS4A 1RBSA 4DTXA 1GLBG 1L3VA 2WUSA 3FGUA 3CCSN 2G8HA 5AQMA 3C7NB 1MWMA 4H0TB 4OGCA 1OH6A 3L3VA 3CFPA 3OBYA 2PFUA 3WEEA 4CEOA 3TAPA 5KPTA 1ESVA 3O9SA 5SWMA 4JV5K 4CGJA 4FJNA 1TYQB 3BY5A 1VQKN 2P9PA 3WQUA 3UKRB 2RF2A 1ASUA 4M3ZA 1JLCA 4I9LA 2HVHA 4DF4A 5ADXH 1CLQA 4PKIA 3FE1A 3WNGA 2F9TA 4H0YB 2ZJQL 1C1CA 4CFCA 1RT2A 3DRPA 2RHKA 3MECA 4BC5A 4UY8O 2VG6A 1NKCA 3ENBA 3AVLA 3KKRA 5KTQA 4JI4K 5AQKA 1T7PA 2FBVA 2RPIA 2E88A 4DU1A 4DV4K 5HL7L 1Q82O 4HHTA 3NF8A 3THWA 3K5LA 3CQXA 4A61A 4H5NA 3VERA 3LWLA 1TKTA 2PY5A 4JI5K 1S1TA 1YIJN 4CZFA 2NRRA 3BDPA 4JKHA 2FSJA 3WXJA 1TL3A 5FRNA 2P9IA 1NK6A 3KK3A 1S1WA 1NGIA 2XY5A 4B8CA 2HHSA 1HNVA 4DTJA 3D2EA 1W0HA 4CJ7A 2GWJA 2NRWA 4YOVA 3P4IA 4AHRA 4BR9A 4NXNK 5JS2A 4FM0A 4NYFA 1JCFA 4EFHA 4BRHA 3THYB 4IZ9A 5AQVA 4YOXA 4ELUA 4MFBA 4BEBA 4RW9A 2GEMA 1LW2A 3VMFB 3MN7A 1WSGA 1N33K 2VWBA 5BPLA 4KB0A 1U2VB 4KREA 3LWMA 5ADXA 4DSJA 3QFUA 2YJFA 1XHZA 3L2VA 1TUYA 2QK9A 3CIPA 3R3LA 2HHWA 3HPGA 1GLLO 3VQ7A 5FROA 1RILA 3SZ2A 3CC7N 3HI0A 1IBKK 2Q2RA 1ZBUA 1N5YA 1JJ2M 4XH1A 1LCUA 3C95A 3IMXA 4MLEA 3VQQA 4BWMA 3OA9A 3OTOK 4CJ4A 1BGXT 3ITHA 1K8AO 4DTNA 2PAVA 5I9EB 1HQUA 3O08A 4CIGA 3OBWA 1NJIO 2O8FA 4CK1A 1YXQA 5GIPA 1NGGA 1C0GA 3TANA 2KHOA 4DFKA 3THXB 4JNEA 1ZC6A 1LAWA 2JLEA 1ASWA 2HHQA 2Y1IA 5AQYA 2HSTA 1D8YA 3DLGA 3ZSWA 2HNYA 1DT9A 2YNFA 5CYMA 1Q81O 3HSTB 4H4MA 3AO1A 3P31A 5B8HA 3A2FA 1QVGM 4KH6A 3HYFA 3NDKA 4DTPA 4BDPA 2PBDA 4HCBA 3D45A 5H1SQ 3KKSA 4KHSA 4AHTA 2P51A 4CJUA 3UIQA 3A5MC 1WBDA 1SL2A 3A8YA 3MAQA 3O3GA 1VHXA 3V9ZA 4JAXA 5AQRA 4M45A 4B1ZA 4PY5A 4DS5A 4F3OA 2ETJA 3LP2A 1T05A 2B5JA 3HVRA 1TKDA 2A41A 4WE1A 3TTDA 1JLEA 4BR7A 4O5FA 4B1XB 5D3GA 4ELTA 1BG3A 3CCQN 4H0OA 3CCMN 5JVHL 4RCHA 1W97L 2P9NB 2H3GX 5CHIA 4HWIA 4FJJA 3ATVA 4JKAA 3VEZA 2KFZA 4YDUC 4GY2B 3Q7CA 3MMVA 2ASOA 1MWKA 2ZJRL 1YF5L 3DOLA 4CK2A 3RSEA 4DQ8A 3F73A 2B4JA 3RVCA 1WOQA 4BC3A 2KZMA 3VF2A 1T03A 2YX6A 3NE6A 4DQIA 4DQRA 1K73O 2F8TA 4FWSA 3RRHA 4M3YA 2EX3A 1SL0A 4F4KA 4DLGA 3TTCA 4CBUA 2D5RA 1VSLA 3C0BA 2HVIA 1BCMA 2ZWHA 2YNGA 1VAZA 3EO3A 3V9SA 4OLBA 3ZSQA 4Q5VA 4LD0A 3DXKA 3QIPA 2QW9A 3CETA 3ZLJA 1VQLN 3SUPA 5FPDA 3MN6A 4BDZA 3CCEN 1JCEA 5AZJB 3O9TA 4RG8A 2P5OA 4FWPA 1RCHA 1HX1A 1FXXA 4BQLA 4L3QA 3A5LC 1VQON 5AZIB 3QEXA 1RNHA 4E19A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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