4Z94A

Actin complex with a chimera of tropomodulin-1 and leiomodin-1 actin-binding site 2
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
371
structure length
370
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How Leiomodin and Tropomodulin use a common fold for different actin assembly functions.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 110
structure length 370
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 4z94A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4z94A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4z94A04
3EZWA 3O4WA 3QICA 3FZLA 4KBOA 3L4IA 3A0IX 5ELZA 2QWNA 4E1JA 5EXWA 4HTLA 5AQWA 2FXUA 2A3ZA 2QM1A 3MK6A 2GELA 2YJFA 4NO7A 3SMPA 4CZGA 4DQ8A 3ZX3A 4CD1A 4ISEA 4MLEA 1R59O 1BA1A 2AA4A 5AQUA 1GLDG 2P9NB 3FFKB 3WT0A 3H46O 1KXPA 1GLCG 4H03B 4CBWA 1S3XA 3C7NA 4Y0WA 5JMVA 4DHYA 5AQTA 5EVZA 5AZJB 4MO5A 4FO0A 1NGHA 1JCGA 2Q0UA 3A5LC 4BG9A 4EAHD 4JNEA 1YAGA 1JCFA 4A2BA 3A5OC 5JLHA 3IUCA 3H45C 4FPAA 4IWVA 5AQOA 5B8HA 4CZFA 3ZETA 4CI6A 2GWJA 1ATNA 1Y64A 5AQXA 4BQZA 3C0BA 2P9KA 2OANA 3LDNA 4O5FA 2E2OA 4IZ9A 4BRNA 2NLXA 2J4RA 2Q36A 4FWRA 2V7YA 1H1VA 1HLUA 5AZIA 1MWKA 4F9OA 4BR2A 3DAWA 2D4WA 3CJCA 2NRHA 2YJEA 3WUHA 3O6WA 5E84A 3IFRA 4BR0A 1QZ5A 2E2PA 3HSCA 4CZMA 1NGAA 2IVOA 1BOTO 1ZBSA 1RDWX 3CETA 3H1VX 4BVOA 4CZJA 4CZLA 2P9NA 3I8BA 4NB4A 2P9LA 1YVNA 4A2AA 2H3GX 4BREA 4B9QA 4BQLA 3SK3A 1S22A 2ASMA 3VERA 5BRFA 3R8EA 2E88A 3VEWA 2Q31A 2W41A 4L3QA 5AZJA 3H6EA 4BC4A 3LDPA 3MN7A 3LL3A 4BGAA 2IVNA 4MLHA 4BRCA 2CGLA 1TUUA 2D1KA 4I6MA 5I9EB 3CI5A 3CQXA 1BWFO 3R9PA 3VF2A 3VEZA 3VGLA 3C7NB 2CGJA 1CZAN 2F9WA 4H0TB 3M1FA 3QB0A 4YDUC 3F9MA 1WUAA 3CJBA 2WUSA 5F1XA 1NBWA 3DXMA 3EO3A 2VWBA 5AQYA 4IJAA 5AQGA 5LJVA 1TYQA 2IVPA 3DJCA 1GLEG 3W0LA 3ZETB 3H1QA 1T6DA 3O1WA 2P9KB 5BPLA 2E8AA 4FWPA 4BC2A 4DB3A 5AFUA 1HJOA 2FSKA 3LM2A 5BPNA 3FZFA 1GLAG 2Q2RA 3KZBA 3ATVA 3VOVA 1ATSA 3MN9A 3GOIA 1NGJA 1K8KA 5AZIB 5AQSA 4DCHA 3CQYA 4BRIA 1P8ZA 4PL8A 1BO5O 5ADXH 4FWSA 1GLFO 3ZEUB 1D4XA 5AQRA 4WYBA 2F9TA 3U9ZA 4FL9A 3WXLA 2AP1A 5CE3A 5AQJA 1T6CA 3FZMA 3IMXA 1OKJA 4FPBA 1U2VA 4H5RA 2P9LB 3ZX0A 4IJNA 3ULEB 3HBTA 2BTFA 4B1VA 2ASOA 2Q1NA 3UKRA 1JCEA 3HI0A 3FLCO 4H5WA 2NZTA 5BREA 2FLOA 3AY9A 5AQFA 3A5NC 3ENHA 2QWLA 5JICA 3A8YA 5FPNA 1BDGA 2E2QA 4I6MB 3VPZA 1BG3A 3KVGA 4B1ZA 1E4GT 3M6GA 1BA0A 3GG4A 1KAXA 5AQPA 3VESA 4BRLA 3WXIA 3D2FA 5EOYA 3VGKA 1DEJA 4BRQA 3MDQA 2P9UB 4QS7A 4FOIA 5JLFA 2QWMA 4EHTA 5EY4A 3AAPA 5AQHA 2EWSA 5BN8A 4FOEA 3U8XA 2P9SA 3DXMB 5AQNA 3JXUA 4H0OA 4JD2A 4JAXA 3GL1A 4EHUA 4H0PA 1TYQB 3VEOA 4PL7A 4M7YA 4JHDA 1X3NA 1HPMA 3ZEUA 1G99A 3ID8A 2I7PA 4BVPA 1Z05A 2A42A 3RSEA 1C0GA 4M63C 2QXLA 4M7XA 4IO8A 2PAVA 1XUPO 1K8KB 2ITMA 3ULEA 5AQMA 3HZ6A 4EFHA 3O08A 1NGIA 2A40A 1Q18A 4FSVA 2P9IA 3BF3A 2DPNA 4B1YB 2E20A 1Z6RA 4FWOA 4WQ5A 5BRHA 3CIPA 3VETA 5AQKA 4H0XB 5FPMA 2HF4A 4GNIA 3MN5A 5KQ8A 5FPDA 5AR0A 3VF4A 2D0OA 3BEXA 2ZF5O 2QWRA 4MO4A 3SLCA 3LDQA 3HTVA 4BRKA 1ATRA 1U2VB 3O80A 4BGBA 3LM9A 3UKRB 4HWIA 2A41A 3WQUA 2P9UA 5AQIA 5KPTA 2YHYA 3CJ1A 1V4TA 2ZGZA 3KHYA 1NWKA 4K41A 3B8AX 1HUXA 2V7ZA 4GY2B 2HF3A 4CZKA 5KPRA 4H0VB 3D7EO 2YI1A 3ENOA 4H0YB 5BPMA 1NMDA 4CZEA 1NGEA 3D2EA 3L0QA 3D2FB 3VEXA 4BRAA 1NGBA 3BF1A 4H5TA 4Z94A 4ISGA 1IG8A 3I33A 1LOTB 1WOQA 4B1WB 2I7NA 2CGKA 3EKUA 4ISFA 4WQ4A 2FSNA 1E4FT 1MDUB 3EKSA 2P9SB 2Q97A 2VCPA 4CBXA 1NGCA 4AM7A 4BR4A 4LC9B 4JD2B 2IIRA 3M3ZA 3O8MA 1U6ZA 1ESVA 4BRFA 4QS9A 5AQVA 4JHDB 2V51B 3G25A 4EIAA 3U4LA 4CD3A 4K42A 3RSEB 1C0FA 5BN9A 3TU5A 3MN6A 1GLBG 3EL2A 3VGMA 3MCPA 2GEMA 3GBTA 4B1UB 3H3NO 5TKYA 3EN9A 4CJ7A 3A5MC 4FWLA 4J8FA 5BRDA 1EQYA 5E26A 1HX1A 3CJAA 4C23A 2VYPA 4AM6A 1XQSC 2P9IB 3VENA 1HKGA 3O5BA 5ADXA 4QS8A 2HMPA 4FWNA 4BR9A 4XH5A 4A62A 1NGFA 1MWMA 3UKUA 4B1XB 4JN4A 3DWLA 3UE5A 1QQNA 1V4SA 2E1ZA 3SJHA 2CH6A 2QWOA 2A6AA 5EX5A 3SMSA 4A61A 4BRGA 1BUPA 3WEEB 3VF6A 1DKGD 2KHOA 3U9DA 2A5XA 4O8KA 3LDOA 5F0XA 3CJ9A 3DXKA 2YHXA 2ASPA 1ZC6A 3MMVA 2BUPA 2YHWA 3AAQA 1QHAA 5FPEA 2W40A 3FZHA 2Q0RA 3FR0A 3WQTA 3BUZB 1T44A 4FWQA 2E2NA 2P9PA 3FZKA 2FSJA 3D2EB 3GDQA 5KQDA 4CZIA 4BROA 4CBUA 3OHRA 3LDLA 2QW9A 2PBDA 2QWQA 1J6ZA 3IDHA 3VEYA 2YCHA 2ZWHA 1GLLO 4RCHA 5F2RA 2CH5A 3P4IA 3W3DA 4BRPA 4PKGA 3FE1A 3O1BA 4XH1A 4H5NA 1QQOA 1NM1A 4WQ5C 4BC3A 4BRDA 5LJWA 3UB5A 4RTFD 2V52B 1RFQA 3QDKA 4BRHA 1QQMA 4PKHA 1KAZA 3H3OB 4K25A 4BR5A 1BU6O 5KPZA 4CZHA 4BR7A 3QBXA 3WEEA 3L6QA 1LCUA 2UYTA 3UKUB 1MA9B 1NGDA 3VEVA 2GWKA 1RGIA 1SZ2A 2QWPA 1X3MA 1GLJO 1IJJA 1NGGA 5AQLA 4XEIA 3CJ7A 4FWMA 5AQQA 1NLVA 2D0PA 3ATUA 2E1YA 1YUWA 1SQKA 3JS6A 1DGKN 1TUYA 3WXKA 5LY3A 1X9JA 5AFUH 3DXKB 4YDUA 4FWKA 3AARA 1ZXOA 3QFPA 1KAYA 4RWTA 3ZX2A 2ZGYA 4WQ4C 5AQZA 2GUPA 4BG8A 4PKIA 3BP8A 4K43A 1SAZA 1QZ6A 1HKBA 3TPQA 3WXJA 2P9PB 4BRMA 3S41A 4XH4A 3FGUA 3QBWA 4IXCA 3HM8A 1HKCA 2FF6A 3J8AA 3QMLA 4H5VA 1XC3A 3QFUA 1YXQA 3GE1A 2HOEA 5BR9A 2FF3B 3CHWA 4BC5A 3CERA 3R6MA 2GTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KVCA 3O4WA 4CJKA 3FZLA 3UIQA 3T19A 3NMUA 1ZBHA 3T1HK 2QM1A 2HBJA 3SMPA 3K9KA 4LY7A 3ZX3A 1BA1A 2DFEA 5AQUA 3FFKB 1VSIA 4NLCA 5CR4A 5T7BA 3VQ4A 1NJIO 4DWIA 3KD5E 3D0PA 2XHBA 3DMJA 4OKJA 1N34K 1TL1A 4Z4HA 4NCGA 4L8RB 3THXB 2Z1HA 4JS5A 2HHXA 1C0MA 4JNEA 4JI7K 3LP1A 1JCFA 3A5OC 3P83D 3IUCA 3CCJN 5B8HA 4N56A 2GWJA 4YOTA 5AQXA 3O4NA 3C0BA 2HVIA 1MU2A 2OANA 4BACA 4Z4IA 1NKBA 2UXCK 5KGXA 2Q36A 4FWRA 1H1VA 1SL0A 1MWKA 3ZSXA 1NOZA 3TTDA 4CEBA 4B08A 2IC3A 2NRHA 2HNZA 1U4BA 4OPAA 5E84A 5FRMA 3HSCA 2E4LA 1I94K 2NRZA 1BOTO 1ZBSA 1RDWX 4CK1A 3TAQA 4CZJA 4DFPA 3HL8A 1VQ6N 1JKHA 2ASMA 3AGKA 3QEVA 5BRFA 3R8EA 4OJRA 4X65K 5M1FA 4KTQA 4K0KK 4U7BA 4BGAA 4IDHA 3V6DA 4MLHA 3VQPA 1RBSA 1T8EA 4I6MA 3BDPA 2GUIA 2P5OA 3MXJA 2D0BA 2BGGA 4ID1A 3VF2A 4IG0A 5CZ1A 3SYZA 3OW2M 1TAUA 3DLBA 4YY3K 2G8HA 3NF9A 1FXXA 3VMFB 3O9SA 4CEAA 4FLTA 1GOAA 3SUQA 1CZ9A 1S9EA 3C6HA 4LFCK 3O4QA 3LANA 3KK1A 2WFBA 3IRXA 4C8OA 4IJAA 4XJXA 3SZ2A 2R7YA 1KSPA 4FZXC 4H4MA 3MWPA 3K5OA 4G1QA 2P9KB 4FWPA 4BC2A 2XY5A 1VSHA 1HJOA 2FSKA 3D6RA 5CY4A 2Q2RA 3ATVA 3V1RA 3RMCA 1RBUA 3MN9A 3P38A 4DCHA 3CQYA 4BRIA 4E1NA 2BDPA 5ADXH 3LP0A 3BGRA 4FWSA 2Z1GA 3VQ5A 4CEDA 5SWMA 5AQRA 4A59A 1LW0A 4DR5K 2F9TA 3U9ZA 5EU7A 4DR1K 2NRVA 3P5JA 3ZT2A 1K6YA 1EP4A 1WNSA 4DV5K 1Q86O 1T6CA 3PX6A 3L4QA 4GV9A 2BTFA 3QINA 3ZT1A 1BHLA 1JXBA 4DR2K 1HNWK 4H5WA 5BREA 3SQ0A 3AY9A 3D45A 3V9XA 5JICA 3L8BA 3SBGA 4Z4EA 4RG8A 4OLBA 4F3OA 1TKDA 3L2VA 4JKGB 4FXDA 1JLCA 3K2PA 5HL7L 4EZ6A 5CYQA 3CCUN 3M8RA 5CHIA 1IKYA 4CHOA 3VGKA 3DI6A 1S1WA 4FOIA 4EHTA 1DLOA 2E6MA 2EWSA 1EKEA 4FOEA 3DXMB 3AVHA 1WLJA 4H0PA 4M7YA 4NXNK 2YNGA 4JHDA 3DRSA 1HPMA 1XWLA 3RVCA 1Z05A 1NMNA 4C8LA 3Q7CA 1S6QA 2LSNA 1BQMA 3QNOA 1Q18A 4FSVA 1NG9A 4EP4A 3AO5A 2P9IA 3BF3A 4CJWA 2YHBA 4WQ5A 3E66A 5AQKA 2HF4A 5LMUK 4FLWA 4DR7K 3VF4A 3F9KA 3BEXA 2Z1IA 4MO4A 3SLCA 3HTVA 2PZSA 1ATRA 1U2VB 4B9MA 4FJGA 4R5PA 1S6PA 2WC9A 4CF0A 2DFFA 2OPRA 1XHZA 3TSQA 3P1GA 3OYNA 4IEEA 3UKRB 5CYMA 4HWIA 2UUBK 3AO3A 3CG7A 2X6NA 2X74A 4JKHA 2OTLN 2HVHA 4CFAA 2EX3A 1NKCA 4FJHA 4DV1K 1J54A 4ILGB 4CK3A 1JLGA 1YF5L 3ENOA 4EZ9A 2D5RA 3M5RA 3DOKA 3D2EA 3NGZA 4CFBA 3DLGA 4IKFA 3OS0A 1HPZA 3CPEA 4B1WB 4ISFA 3EKUA 3I0RA 2FSNA 1E4FT 3M8QA 1NKEA 1K8AO 4DSFA 2VCPA 3M3ZA 3MCAB 3O8MA 4QAGA 1U49A 1ESVA 4QS9A 1SKSA 3G25A 4DSKA 2PFUA 1A5VA 4YNQA 1SL2A 1C0FA 5GIPA 1RDUA 4CJUA 3VGMA 3MCPA 4DV3K 4B1UB 3OYJA 4CJ7A 3A5MC 4W5NA 5BRDA 1HX1A 4IFVA 1EWRA 4FM2A 1Z26A 2HMPA 3VQBA 1NGFA 1MWMA 1W7AA 2QA4N 1L3VA 3UE5A 1QQNA 3KLHA 1V4SA 2E1ZA 1BGXT 3SJHA 3T69A 1QVFM 2QWOA 3AGRA 1BIZA 1BUPA 1C1CA 4E89A 4JK9A 2UUAK 1DKGD 4CFCA 2W00A 3MXMA 2G8UA 4FLYA 1LW2A 4O8UA 3ZT4A 3SI6A 4DV4K 1QHAA 3WQTA 4M45A 3OY9A 4DV6K 4QCLA 1DTTA 3FZKA 4KHSA 3KLFA 1R0AA 5KQDA 4CBUA 3OTOK 5J2NA 4E72A 1BCOA 5J2MA 2QWQA 2X6SA 3C65A 2JWKA 1ITGA 2WOMA 3WXMB 3P4IA 4ILJA 1KC8O 4PKGA 2HHUA 1VSEA 2F7TA 3O1BA 3OBYA 4XH1A 4AHSA 3JAMO 1SL1A 4WQ5C 4KB1A 2KFZA 3PX4A 1LWCA 1ASWA 4OPHA 1O1WA 3QDKA 1QQMA 3VQEA 4LF5K 1SUQA 4M42A 4BR5A 4BR7A 1TV6A 2HHHK 4KTZA 4IOXA 3UKUB 4CJ5A 1SZ2A 3EY1A 3OYHA 4CJSA 1QSYA 4XEIA 1NLVA 4W5RA 2D0PA 3ATUA 5GINA 4DQSA 3TTCA 1VRTA 1B9FA 2FBYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1GLL O;  4DUZ K;  5KRS A;  4RCH A;  4LF4 K;  1NK4 A;  5JS2 A;  1ILY A;  1A5X A;  3CFO A;  2QEX N;  3W3D A;  3SPY A;  3FE1 A;  2XY7 A;  3CCM N;  4H5N A;  4BC3 A;  1NM1 A;  5MLC Q;  3AO4 A;  3THV A;  4BRD A;  2UUC K;  4FK2 A;  2O8F B;  2C1G A;  2F8T A;  3LAL A;  4A5B A;  3SQ4 A;  3H3O B;  4K25 A;  3HK2 A;  2QKB A;  5M1Q A;  4CZH A;  4DKW A;  3WEE A;  1NJZ A;  2KFN A;  3AVA A;  4K8Z A;  1W97 L;  2UYT A;  1VQ8 N;  1MA9 B;  1NGD A;  3VEV A;  2GWK A;  3ASM A;  3ISN C;  2ATQ A;  1IJJ A;  4R79 A;  3TSP A;  4FYD A;  3IAY A;  2E1Y A;  1CXU A;  5FDL A;  2FBV A;  1SQK A;  3AV9 A;  4DSL A;  2KZM A;  1TUY A;  1RCH A;  3WXK A;  4KPY A;  2YNI A;  4BDP A;  1X9W A;  4FWK A;  4LFA K;  4ZTJ A;  5HRP A;  4RWT A;  3PLA A;  2ZGY A;  1SKR A;  3SAG A;  4WQ4 C;  4CJP A;  5AQZ A;  3BP8 A;  3WNH A;  1XMQ K;  3TPQ A;  4CEE A;  3ZLJ A;  4CIG A;  1VRU A;  2YX6 A;  3AA5 X;  4B8C A;  1ZBL A;  2FF6 A;  4H5V A;  1YXQ A;  3S9H A;  4BC5 A;  1C1B A;  4O5B A;  4CIE A;  3N4Q A;  2GTD A;  3K5N A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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