5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
1V4TA 2P9PA 4I6MB 5BN8A 5FPEA 1BOTO 2W40A 2E2PA 4B9QA 2E2NA 3MN9A 1X3NA 1DKGD 4XEIA 3CJAA 3U8XA 4Y0WA 4K43A 5AQIA 4H0YB 3P4IA 3FZMA 1QQMA 2H3GX 4YDUA 1C0GA 2PAVA 3FZKA 1Y64A 1GLFO 4BRNA 2Q36A 2I7PA 5EY4A 4JHDA 3D2FB 5F2RA 4BC3A 2IVOA 3VGMA 3FZHA 2E20A 4BRPA 4YDUC 3WQTA 3CQYA 3VEYA 3VF2A 2GUPA 4BRMA 2YJFA 4BRDA 3AARA 1KAXA 1TYQB 3U9DA 3A0IX 4BRFA 3AAQA 4QS9A 5BRDA 5AQHA 4FWOA 1SZ2A 4XH5A 2FF3B 1BA0A 2ZWHA 4AM6A 2QWMA 3KVGA 2HMPA 1NMDA 2YHWA 1HKGA 1NGCA 3JXUA 3W0LA 2ITMA 4CBUA 3DXMA 4B1XB 1GLLO 2V7YA 5ELZA 5F1XA 1QQOA 5BR9A 4AM7A 3MN6A 1NBWA 2PBDA 2VCPA 4FL9A 3VGKA 4B1VA 4DB3A 4DHYA 3I33A 2CGKA 2Q97A 3WXKA 5AZJA 1BA1A 4BR5A 1NGHA 2QWRA 3BUZB 3L6QA 3SMPA 3FZLA 1E4FT 3BF1A 1NGEA 2YCHA 3O8MA 2P9KB 3CQXA 3IDHA 4B1YB 5AQYA 4CZGA 3VPZA 4BC2A 1U6ZA 5ADXH 1HKBA 3CJ7A 3ZEUB 3ZX0A 3GDQA 3UKRA 2ZGYA 3H1QA 1U2VA 1JCGA 3U9ZA 4FOEA 3R8EA 2A42A 4B1ZA 1GLBG 2GWJA 5EX5A 1GLJO 3SJHA 3FZFA 3ZX2A 3H1VX 5LJVA 4H0TB 4XH1A 3HTVA 4ISGA 4F9OA 4L3QA 4FWSA 2BUPA 3LL3A 4BVOA 5KQ8A 4EIAA 4IWVA 1NGFA 2F9TA 2V52B 4PL8A 3CI5A 3M3ZA 1XC3A 1RDWX 4FPBA 5KPZA 1Z05A 3BF3A 3CJ9A 4BQZA 3O5BA 4FWQA 4DQ8A 1E4GT 3LDLA 5KPTA 4BRGA 3RSEB 5AQRA 3MK6A 3UKUB 1MA9B 2FSJA 1NWKA 4XH4A 3S41A 5AFUH 3I8BA 1XQSC 3WEEB 4CZKA 4RWTA 3QFUA 4A2AA 1CZAN 3D2FA 3SK3A 3ZX3A 3WQUA 4BG9A 2Q1NA 4CZJA 2VWBA 3FE1A 1XUPO 4WQ4A 3VF6A 4FWPA 3HI0A 4B1UB 3A5OC 1ATSA 1TYQA 2NRHA 3D2EB 4H0VB 4M7XA 2CGLA 1ZC6A 5E84A 4CBWA 2GELA 3FGUA 5BPLA 3ENHA 2AA4A 2YI1A 3A5LC 4BRCA 1HX1A 3WXLA 3GOIA 4A62A 4DCHA 4JN4A 1MWKA 3FR0A 4WQ4C 3VGLA 2Q2RA 3QBWA 3ULEB 3M1FA 3GL1A 1C0FA 2FSNA 1YAGA 3QMLA 3IMXA 4CI6A 2P9KA 1HLUA 3CETA 2UYTA 1BDGA 5FPNA 4PKGA 1NGDA 3O4WA 2A6AA 5AQFA 2ZF5O 1SQKA 4KBOA 3EKSA 1NGJA 2QM1A 3ZEUA 1HJOA 3HSCA 3LDQA 5EXWA 5TKYA 1BO5O 2ASMA 3CJCA 5BREA 1NGBA 3DAWA 1T6DA 3HBTA 4FO0A 2IVNA 2ZGZA 4M63C 3HZ6A 1BU6O 2A5XA 3HM8A 2CH5A 1GLCG 2P9PB 5AQVA 4CZLA 4IJAA 4BRQA 2QWPA 5BPMA 2CGJA 3KZBA 4NO7A 1NM1A 4H03B 5KPRA 1ZBSA 2OANA 4MO5A 2P9UB 3AAPA 3B8AX 1T44A 2A40A 3M6GA 2Q31A 3JS6A 4HWIA 4CZMA 1BG3A 3MN7A 3MCPA 2V7ZA 3BEXA 1Q18A 4BC5A 4BROA 5ADXA 4IO8A 1QQNA 4ISEA 1KAZA 3H3NO 1BUPA 1TUUA 2A3ZA 3RSEA 1G99A 3CIPA 4H5RA 4JHDB 5AQKA 3UKUA 5AQMA 3QFPA 2IIRA 2P9SB 4JD2B 3SMSA 4CZEA 3MMVA 3FLCO 2YHYA 3C7NB 2AP1A 5F0XA 5AZIB 3WEEA 1RGIA 1OKJA 2Q0UA 1HPMA 4CJ7A 5AQGA 4I6MA 3CJ1A 3VEXA 4NB4A 3EO3A 4IXCA 3VOVA 1HUXA 1NGGA 3DXKB 2CH6A 1ZXOA 2P9NB 3D2EA 3IFRA 1SAZA 4B1WB 3H46O 4BR2A 1WOQA 1S3XA 3IUCA 3A8YA 1T6CA 4A61A 3EKUA 1YXQA 3G25A 2D0OA 4O5FA 4O8KA 2D4WA 5AQPA 4BRAA 5BPNA 1NGIA 3UE5A 3GBTA 1RFQA 4IZ9A 1QZ5A 4MLEA 3ULEA 4BGBA 4BGAA 1LOTB 5AFUA 3VEZA 4M7YA 1GLDG 3UKRB 4BR9A 3R9PA 2HOEA 4BQLA 5JMVA 2E1ZA 1D4XA 3ZETB 3O6WA 3F9MA 3VENA 4BR0A 5BRFA 4C23A 3WT0A 3TU5A 3WXIA 1QHAA 3LDPA 1WUAA 1BWFO 2NLXA 5LY3A 4RCHA 4EAHD 3A5NC 3H6EA 3QDKA 5BN9A 1IJJA 3H3OB 4FWKA 5EVZA 4CZHA 1NGAA 2W41A 1S22A 3WUHA 4A2BA 3L4IA 4H5NA 5AR0A 2E8AA 2F9WA 5FPMA 1P8ZA 1X9JA 2E2QA 2YHXA 2P9LB 2P9IB 4LC9B 3CERA 5AQQA 5I9EB 5KQDA 2P9UA 4CZIA 1KXPA 3VERA 2QWOA 4Z94A 4PL7A 4CZFA 2IVPA 4K42A 4WQ5A 3VETA 4BR4A 3DWLA 4FWNA 5JICA 2A41A 2D0PA 5CE3A 3BP8A 1ATRA 1ESVA 3O1BA 4GY2B 4CBXA 5AQZA 3U4LA 3R6MA 3VESA 1GLAG 3VEOA 1JCEA 3MDQA 4J8FA 1X3MA 1K8KB 4GNIA 4HTLA 4MO4A 4FWMA 1DGKN 2P9SA 4JD2A 4H5WA 4MLHA 5BRHA 3ENOA 3VEWA 3C7NA 3CHWA 4FOIA 4PKHA 5AZIA 2GWKA 4WQ5C 4CD1A 5AQTA 2Q0RA 3O1WA 4FWRA 2HF4A 3AY9A 3H45C 3VEVA 4BREA 5EOYA 3DXKA 1KAYA 2P9NA 3KHYA 2QWNA 3UB5A 1IG8A 4JNEA 3GG4A 3DJCA 1H1VA 2QWQA 4H0OA 3QICA 2GTDA 4FSVA 4ISFA 2QWLA 5LJWA 2DPNA 1V4SA 3ID8A 1DEJA 4BG8A 1MWMA 2KHOA 3C0BA 2VYPA 3EN9A 2J4RA 3W3DA 5AQXA 1JCFA 2FXUA 2HF3A 4FWLA 4H0XB 2GEMA 4PKIA 2EWSA 2QW9A 3OHRA 3LDNA 4BRIA 3L0QA 4H0PA 2FSKA 4EFHA 3LM9A 5B8HA 3TPQA 4BC4A 3ZETA 3A5MC 3DXMB 4H5VA 4K41A 3LM2A 5AQWA 4H5TA 5AQSA 1NLVA 3FFKB 4BR7A 5AQLA 4EHTA 5E26A 5AZJB 3LDOA 4CD3A 4K25A 1Z6RA 1YVNA 2V51B 3O80A 5AQNA 4E1JA 5FPDA 4JAXA 5AQOA 4BRLA 4IJNA 4BRKA 4QS8A 3QBXA 3O08A 1HKCA 3EZWA 1ATNA 3ATVA 1YUWA 5JLHA 2NZTA 2I7NA 4QS7A 4BRHA 2FLOA 1EQYA 2P9LA 5AQJA 2P9IA 4WYBA 2QXLA 4FPAA 1QZ6A 5AQUA 1TUYA 3ATUA 3CJBA 1U2VB 2E88A 2FF6A 4BVPA 3MN5A 1MDUB 1GLEG 2WUSA 3WXJA 2E2OA 3D7EO 1LCUA 2ASPA 3EL2A 1R59O 2YJEA 4EHUA 3SLCA 3GE1A 2BTFA 4RTFD 1J6ZA 2E1YA 2D1KA 5JLFA 2ASOA 3J8AA 3QB0A 1K8KA 3VF4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3N4PA 2LSNA 3ZSYA 1VSDA 2OPPA 1BOTO 2FBVA 4G1QA 4NYNA 1VSFA 3AVFA 4DLEA 3E9OA 5J2QA 3U8XA 3HK2A 4GMJB 4Y0WA 4K43A 5AQIA 4H0YB 3P4IA 3NF8A 3AO1A 4YDUA 1ZBHA 5KI6A 3G0ZA 4CHZA 4F3TA 3FZKA 1Y64A 4B9UA 4BRNA 1RTHA 3T1AA 3DLKA 1NK8A 5EY4A 2E4LA 3O3GA 3DOLA 4IFYA 2UUAK 3KK3A 5GAGP 3M8QA 2Z1GA 3CQYA 4BRMA 3VF2A 2GUPA 2YJFA 3CCQN 1X1PA 1SUQA 3DLRA 3A0IX 4C8LA 4QS9A 3M5RA 4GKKK 2FF3B 2HMPA 2YHWA 4LSNA 1NGCA 4CBUA 2JGUA 4FJHA 4JK8A 3IG1A 2QKBA 1RBVA 4CESA 4U67L 4JI7K 4H4OA 1VQON 5FRMA 3I33A 3SBGA 2GV9A 3CC4N 2QWRA 4CF9A 1BISA 3ZT2A 3CQXA 3IDHA 1O13A 5AQYA 3L4QA 4GVMA 5ADXH 2KLAA 4OPJA 4LF7K 2NRXA 5CZ2A 2ZM6K 4Z4GA 4V19S 2A42A 4CJPA 2ZD1A 3OBYA 2GWJA 4J2DA 5EX5A 1GLJO 1RT1A 3ENBA 1GOAA 3SV3A 4OX9K 1W97L 4ISGA 5FDLA 3TTCA 4DQRA 3BGRA 4KPYA 4EIAA 2V52B 1IH7A 3Q7BA 4C1NI 1Z05A 3BF3A 1WSIA 3PSFA 1LAWA 3CXCM 1ASUA 4DQ8A 3D0PA 3VQ5A 3HPGA 4M41A 5HROA 1HR0K 1RDDA 2O4GA 5KPTA 4WF9L 3SQ0A 4BRGA 5HL7L 3EE8A 4JS4A 5GADP 3PIOL 4E1NA 1S1UA 5TKWA 5KRTA 1NWKA 5LMUK 3I8BA 5T7BA 4RWTA 4EZ9A 1UWBA 4A2AA 4Z4IA 4BG9A 2Q1NA 1RBRA 3CC7N 4GV6A 5HP1A 1SL0A 3VQCA 3O9TA 4X62K 4E1MA 3AVBA 4KREA 1TYQA 2NRHA 4M7XA 1Q81O 1Q86O 1C1BA 3ZSRA 2GELA 3U6FA 3FGUA 2AA4A 4W5QA 4BWMA 3TTFA 4A62A 1MWKA 4I9QA 4WQ4C 3SUOA 4CIEA 3QBWA 4OVLA 3S3NA 3ULEB 3CM6A 1BGXT 3M8RA 3QMLA 3K5LA 5CYMA 4CI6A 1FK9A 4FZXC 1N36K 3L3UA 4O55A 1C0MA 4CGGA 2UYTA 1BDGA 4DFKA 5FLXO 3CCMN 3QEWA 4CEOA 2ZF5O 1SQKA 1NK0A 4B9TA 2Q3SA 3O4NA 1SKRA 1I39A 4BY9C 1EO1A 3AV9A 3PX0A 1XC9A 4HUGA 3HBTA 4CEFA 4BDYA 4FO0A 3HZ6A 1FW6A 1IV0A 2A5XA 4CHYA 4CZLA 4FLXA 4BRQA 1YJNN 2QWPA 5E41A 4CEEA 5M1KA 1YTAA 4I2QA 4JI1K 2W00A 2RN2A 1TGOA 1NM1A 3ZSOA 3HP9A 4FJ9A 1T44A 2A40A 2O4IA 2Q31A 5M1NA 3U3YA 1C6VA 3AO3A 2NRWA 4CEQA 1J5EK 4JI5K 1UOCA 2KFZA 3P5JA 3TAGA 4DU4A 2O8CB 1U04A 1QQNA 4ISEA 3OBWA 2HHSA 2Z1IA 4IEEA 2A3ZA 3K58A 1M1KO 2JWKA 1BCMA 4M42A 2AP1A 5F0XA 1XNQK 4PWDA 4CJEA 3KLFA 3SYZA 1RGIA 1OKJA 4I7FA 3PO4A 5AQGA 5C24A 3SUNA 3CJ1A 3TSPA 4PHTX 4LH4A 3DXKB 2CH6A 1QTMA 3NHGA 3SAFA 3VQPA 3HXMA 1QSSA 1ZBLA 3D2EA 3K5NA 1NU0A 1S3XA 2G8IA 3A8YA 1T6CA 4JI2K 4DU3A 1KQSM 1QHTA 4O5FA 1NGIA 5C0YA 4CJRA 2XHBA 3TAQA 3CCEN 2D0AA 4BE2A 1YITN 4BDPA 1G15A 1RBUA 2Y1IA 3A2FA 4DTPA 1HJRA 3VEZA 1GLDG 3UKRB 2RF2A 1XMQK 1W2BM 4BQLA 5JMVA 2E1ZA 3ZETB 1R0AA 4FK0A 3TAFA 2OPQA 4DR1K 3V6DA 3JYTA 3QETA 3QEIA 4B3MK 2O8EA 5CY4A 3K5OA 1WUAA 3K0SA 4Z4CA 3QDKA 3NDKA 5BN9A 1HYSA 4DV1K 4FK4A 1F21A 1NGAA 3LWMA 3IAYA 2HBMA 5AR0A 5C12A 4FW2A 4E19A 2KFNA 4CEAA 4DQPA 1P8ZA 2YHXA 5GAEP 1BI4B 2IC3A 5AQQA 1J53A 3V1QA 3AA5X 3SUPA 1L3UA 3D45A 1B9DA 1TL1A 3VETA 3QEPA 1HPZA 4FJGA 3V9WA 4CBXA 2XO7A 4JS5A 2HB5A 4KB1A 1GLAG 1JCEA 3L2QA 1NKEA 3OS1A 3VQ6A 3ZT3A 4MO4A 4FWMA 2NRZA 1DGKN 4JKCA 3RRGA 4MLHA 2O8FA 3CCJN 4KHNA 3K9KA 3THVA 2GWKA 2Q0RA 1YI2N 1LWCA 1RILA 4FWRA 3UIQA 3G4SN 1Q9YA 4Q0BA 3THWA 3TAEA 3VMFB 5DK5A 3E66A 3QO9A 3KHYA 4JKAA 3RRHA 1KD1O 3KKSA 4E0DA 1JLAA 3KWIA 4JKFA 2I5JA 2VWJA 1QVFM 3HP6A 1ILYA 1YIJN 2QWQA 3KLHA 2QWLA 3LDSA 3CPWM 2DPNA 3L8BA 3ID8A 5C25A 5I42A 4BG8A 4DFPA 4C8NA 1MWMA 2KHOA 3EN9A 4LF4K 5AQXA 2FXUA 2HF3A 1KLNA 3AO4A 3CM5A 5M1FA 3T19A 1ZBIA 4CJFA 3V1RA 4WFNL 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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