5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Motor protein
molecule keywords DYNEIN TAIL
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
2YHYA 4FL9A 3GBTA 5BRFA 4DB3A 3A5MC 4BROA 1GLFO 3KVGA 2IVPA 4H5VA 4H5WA 3RSEA 3WXJA 4BVPA 3D2FA 1TUYA 2P9KB 2QWMA 2P9LA 3FLCO 4BRGA 3H6EA 4ISFA 3W3DA 3MMVA 4BC5A 4C23A 5LJVA 3O5BA 1WOQA 5F2RA 4CZEA 2ASOA 4FOIA 5AQGA 3VGLA 3LDQA 2QM1A 1HPMA 4IJAA 3MN7A 3O6WA 2ITMA 3QICA 4FWSA 3ATVA 3BUZB 4HTLA 3L6QA 1DEJA 3MN9A 1TYQA 1BUPA 1IJJA 3DJCA 1ZXOA 5BR9A 2ZWHA 4JN4A 4CJ7A 5AZJA 4BC4A 1J6ZA 1Y64A 4CD1A 3CIPA 3VPZA 4JNEA 4XH5A 3BF3A 2UYTA 5AQWA 5AQVA 3GDQA 1NGEA 4BRKA 5KPTA 4RTFD 3WEEA 1NGGA 2E2NA 4FWKA 4CBWA 2CGLA 3C7NB 3AAPA 1LCUA 4DQ8A 2OANA 3CJBA 2FLOA 5JICA 3D2EA 3QFPA 3ZETA 2E88A 3WUHA 3CJ9A 1G99A 3VEZA 4EHUA 3UB5A 3CJAA 2YHWA 1GLBG 4BRQA 4K42A 3U4LA 5EXWA 4EFHA 3WQTA 4JAXA 2AA4A 2AP1A 2YHXA 2P9UB 4BRIA 1JCGA 5KPRA 5BREA 4JHDB 4IO8A 5AQSA 4A62A 4H0VB 2QW9A 3FZMA 3O1BA 1C0FA 3EN9A 4MLHA 1NWKA 1BG3A 3VETA 4DHYA 1GLEG 4FO0A 3DXMA 4M7YA 4M63C 3FGUA 4CI6A 4CZLA 4BG9A 3H1VX 2P9IA 4CD3A 2P9PB 1MA9B 2CGKA 4A61A 4BC3A 5EVZA 3HZ6A 2Q1NA 5EY4A 2P9NA 1EQYA 2V7ZA 1Z05A 3GOIA 5ADXH 3L4IA 5AQQA 1HKGA 1JCFA 4H0PA 4BRPA 4PL7A 3C0BA 3O80A 3D2FB 4BGBA 4RWTA 3TU5A 4GNIA 3ID8A 5AQLA 4MO5A 1BA0A 4QS9A 5ELZA 5F1XA 1NM1A 2VWBA 4QS7A 2QWPA 4IXCA 3UKRB 4B1UB 1H1VA 1JCEA 4BREA 3H3OB 3L0QA 4JD2B 5AQFA 5BPLA 1BU6O 4CZKA 1ATNA 1YVNA 3AY9A 3CJCA 3HI0A 3MN5A 1ZC6A 2QWOA 5AQOA 1TYQB 3WXKA 4BRLA 4DCHA 3CJ7A 1RGIA 1GLJO 4WQ4C 2FF6A 1QZ5A 4BR5A 5BPMA 2D4WA 1HKBA 2E2QA 4FWMA 3F9MA 2GTDA 1S22A 2V7YA 5AFUH 1NGHA 3EL2A 4IZ9A 5FPDA 2D1KA 1CZAN 4WQ4A 4BRNA 1T6CA 2P9SA 3A0IX 3D2EB 3IFRA 5AQKA 3R9PA 3GL1A 2E8AA 1QQMA 2GWKA 1NGJA 1YXQA 4B1VA 3U8XA 4YDUC 2Q2RA 1SAZA 3U9DA 1QQNA 3FR0A 3CHWA 4CBUA 1NGDA 3TPQA 3P4IA 3VESA 3LM2A 1Z6RA 2A42A 4H0TB 4I6MB 4CZJA 5BRHA 3CQXA 3IMXA 4AM7A 3EO3A 5FPEA 1BO5O 4BR7A 2NLXA 2QXLA 3VEVA 3IDHA 1ESVA 2GWJA 2W41A 2FSJA 2HF3A 4BR2A 2HF4A 2P9IB 4FWOA 3VF2A 3SLCA 5LJWA 4E1JA 3HTVA 4H5RA 3VEYA 3SK3A 4LC9B 3LDPA 4WQ5C 4AM6A 4B1WB 1U2VA 4NO7A 3H1QA 5AQUA 5FPMA 1E4FT 2GUPA 4PKGA 1IG8A 5AQIA 3VOVA 2H3GX 4BQLA 1X3NA 2IVNA 3QB0A 4CBXA 2E2PA 3VEWA 5EX5A 3G25A 5AQJA 4FPAA 4HWIA 1ZBSA 3O1WA 4FWQA 2Q0RA 3FFKB 3ZX0A 4B1YB 1NGCA 4IJNA 4BQZA 4MO4A 2QWRA 3FZLA 4WQ5A 4A2AA 4BVOA 4BR4A 4A2BA 3GG4A 1YUWA 3CQYA 5KPZA 2YJEA 5AZIA 2PBDA 2I7NA 3A5OC 3KHYA 1NGAA 2CGJA 3A8YA 2A41A 3BEXA 3DXKB 2NRHA 3O08A 1HX1A 1P8ZA 4M7XA 2F9WA 2QWQA 2Q36A 3UKUA 2CH6A 1V4TA 4FWNA 2VCPA 4BGAA 3WXLA 2FSNA 4BR9A 2E20A 3FE1A 4BRCA 1Q18A 3A5LC 1ATSA 5E84A 3EKUA 3RSEB 3W0LA 1ATRA 2KHOA 2P9LB 2YCHA 4BC2A 2J4RA 3MCPA 2A3ZA 2VYPA 3SJHA 1BDGA 5I9EB 1NGFA 3LDNA 1GLAG 3KZBA 3VEOA 3VEXA 2HOEA 2E1YA 4H5NA 3S41A 3WT0A 1R59O 5CE3A 4NB4A 3D7EO 3GE1A 3CI5A 3SMSA 1WUAA 5AQHA 5AQPA 5AQRA 4EIAA 1DGKN 3LDOA 3AAQA 5AQTA 3SMPA 1T6DA 3VENA 3BP8A 1D4XA 1HLUA 2GELA 3FZKA 5AZJB 4B1ZA 1YAGA 1GLDG 1QZ6A 4B1XB 1HUXA 4BRDA 5BRDA 2P9UA 4EAHD 2E1ZA 5KQ8A 3WEEB 2HMPA 2FXUA 3ENHA 4CZFA 1X3MA 1RDWX 4CZIA 3J8AA 2Q0UA 1OKJA 4O5FA 3ZETB 3QBXA 5AQMA 1BA1A 1NLVA 3DWLA 2YJFA 1QQOA 1U2VB 4FOEA 4FPBA 3VF6A 2I7PA 2PAVA 1NBWA 3O8MA 1E4GT 4GY2B 4F9OA 3ULEA 5E26A 4ISGA 3JXUA 4O8KA 5AQZA 3VERA 4RCHA 3A5NC 3U9ZA 3M1FA 1GLCG 2ZGZA 1MWMA 3AARA 4FWPA 3JS6A 3QBWA 4EHTA 4QS8A 3FZHA 4H5TA 5BPNA 1KAXA 3H3NO 2EWSA 3DAWA 2BTFA 4Z94A 5FPNA 3UKRA 1MWKA 5LY3A 2GEMA 3QFUA 4MLEA 4YDUA 5AZIB 3DXMB 4BRAA 1K8KA 4BRHA 3H46O 2E2OA 4ISEA 2A5XA 3LL3A 4JD2A 5AR0A 5JMVA 4KBOA 3ZEUA 1SQKA 3MDQA 4BRFA 3UKUB 3VF4A 4PKIA 1XQSC 3LDLA 2P9NB 4L3QA 4XH4A 1MDUB 1V4SA 3UE5A 5TKYA 1RFQA 2NZTA 1NGBA 5B8HA 4Y0WA 4K43A 3ENOA 3ATUA 3BF1A 3VGKA 3HBTA 1HJOA 2Q31A 5AQXA 2P9KA 1BOTO 3CJ1A 2CH5A 2IVOA 2ZGYA 5ADXA 1X9JA 4CZGA 1XC3A 5AQYA 2IIRA 3WXIA 1U6ZA 2A6AA 3WQUA 3MN6A 4FWLA 2V51B 1NGIA 1KAZA 1S3XA 1DKGD 2YI1A 3HM8A 3I33A 4FWRA 5JLFA 3M3ZA 3VGMA 4PL8A 2ASMA 1KAYA 1T44A 2D0OA 2W40A 2ZF5O 4H0YB 1SZ2A 3FZFA 4I6MA 3H45C 3HSCA 3EZWA 3MK6A 4K41A 5EOYA 4CZHA 1HKCA 1LOTB 2FF3B 3LM9A 3CERA 4IWVA 3ZX2A 3EKSA 4BR0A 2P9SB 2A40A 2ASPA 4BG8A 2DPNA 3R6MA 3C7NA 5AFUA 4BRMA 3B8AX 4XH1A 4H0OA 3ULEB 4FSVA 2QWNA 3M6GA 3O4WA 4B9QA 2QWLA 2D0PA 3QDKA 1TUUA 3CETA 2V52B 1BWFO 2BUPA 1QHAA 4XEIA 3ZX3A 1NMDA 4PKHA 5AQNA 3R8EA 2FSKA 4JHDA 4H03B 4CZMA 1K8KB 5KQDA 4J8FA 1C0GA 5JLHA 1KXPA 3ZEUB 3QMLA 3OHRA 3IUCA 5BN9A 2F9TA 5F0XA 5BN8A 3DXKA 2Q97A 1XUPO 4WYBA 2WUSA 3I8BA 4K25A 2P9PA 4H0XB 1GLLO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OJRA 1NJXA 2O8EA 3AVHA 3A5MC 1WSEA 1QSYA 2O8CA 4E72A 1NK4A 2RKIA 1L3VA 1HYSA 1J54A 4H5VA 2YNHA 3TTDA 3OYEA 1VQ5N 4B3MK 4DU4A 3U3YA 4Z4FA 4DKWA 1LAWA 1BCMA 1S72N 2HBJA 4ZHRA 2X6NA 2YHBA 3MN7A 4JK8A 1LWEA 3Q7CA 2ITMA 3QICA 4FWSA 3I55N 3LP3A 5KRTA 4DUZK 4AF1A 1IJJA 1BUPA 4JKCA 1ZXOA 1NOYA 3K5OA 2ZWHA 4JN4A 5CYMA 4Y1DA 3MECA 1IKXA 2DY4A 1J6ZA 4F8RA 1Y64A 4JS4A 4CD1A 4BDYA 2KQ2A 2OPPA 3VPZA 4JKHA 3BF3A 1FKOA 2ITGA 5KPTA 1KC8O 4M3XA 1QVGM 3BZKA 2CGLA 1NK8A 3AAPA 3DM2A 1LCUA 4DQ8A 2FLOA 3QFPA 2HHXA 4QCLA 3RMAA 1XHZA 1HNIA 4YORA 4J2EA 2W6KA 4G9ZA 1BQMA 2AA4A 5FLXO 2UXCK 4ZTJA 4PQUA 3G10A 1JCGA 5AQSA 4H0VB 4O4GA 1C0FA 5C24A 2O8BA 3VETA 3ZSVA 4IG3A 4M7YA 2R7YA 3P5JA 3OTOK 2RF2A 1ZBUA 3AO4A 2NUBA 4BG9A 1HNWK 4JRPA 5D3GA 4CD3A 4KI4A 2VG5A 1EETA 2W00A 2CGKA 1S9GA 5FDLA 4BC3A 3KJVA 3SJJA 1VQPN 5EY4A 4LF6K 1SL1A 1X9SA 2IS3A 1Z05A 4H0PA 4BRPA 3T7ZA 2D0CA 5FROA 1Z25A 3TU5A 3AGKA 4G1QA 3HPOA 3ZLJA 1DTQA 2OZMA 1O1WA 4QS7A 2F96A 2QWPA 2VWBA 1H1VA 3H3OB 1JJ2M 2QI2A 1U4BA 3JYTA 2PZSA 4I9QA 1BIZA 3CJCA 1YVNA 5AQOA 3VEXA 2P5GA 2ZJQL 3F5TA 3O4QA 3I56N 2HMIA 2UXDK 1C1BA 4O55A 4WQ4C 1QZ5A 1C6VA 2NRZA 3ZT1A 4JRQA 4FWMA 2E2QA 5IWAK 1TKTA 2WTUA 3CCRN 4DTXA 3SI6A 3OVNA 2P51A 3VQ5A 3TAPA 3O9UA 4DQRA 3NBPA 1S1XA 5FRNA 4BE1A 4CFBA 5EU7A 3T1HK 3R9PA 4ILGB 2E8AA 1VRTA 4O8UA 4B1VA 1QHTA 4W5NA 1VSMA 4CJKA 2F4VK 1QQNA 5CZ1A 3MX2A 3AA4A 3AA5X 3J81O 5BRHA 3CQXA 3IMXA 4AM7A 2O8BB 5M1OA 2QXLA 3EE8A 1ESVA 3OYIA 3OYMA 2W41A 1XI1A 2Y1JA 2ZD1A 3HVTA 4JI2K 1XNRK 2OPQA 3O9SA 5LJWA 4UQGA 3I8DA 3DRRA 3SK3A 4LC9B 1N33K 3V4IA 4CEQA 5FPMA 2GUPA 1IG8A 3QEWA 1HNXK 3G6EN 4BQLA 3MWPA 3NE6A 3V9ZA 1NK6A 3PX4A 4CBXA 1VAZA 4DR5K 4FPAA 3K0SA 2OA8A 4B3TK 4FWQA 4IJNA 3FZLA 4AHCA 1P90A 1Q9XA 1TV6A 4H4OA 5AZIA 3A5OC 1K8AO 3BEXA 3FFIA 3O08A 1NKEA 3LWLA 4MFBA 4M7XA 4LY7A 4FJGA 4OGEA 2CH6A 1EP4A 4BRCA 3FE1A 2UUCK 2Y1IA 3K57A 3CC2N 5E84A 3RSEB 3DLKA 1VSKA 1J5EK 2KHOA 2P9LB 2YCHA 4BC2A 1RTDA 2J4RA 3SAHA 1D9FA 2XRIA 1GLAG 4AHSA 4DSIA 4N56A 3VQEA 3I0RA 1G15A 1R59O 1RT3A 4KB0A 1YIJN 3D7EO 3CI5A 3SMSA 5JS1A 5AQHA 4FLZA 3NH0A 3LP2A 4NLBA 1YT3A 2NRVA 3SMPA 3BP8A 1XWLA 3O3FA 2HHIA 4EP5A 3FZKA 4FVMA 5AZJB 1FK9A 3VMFB 4NYNA 1QZ6A 4BRDA 1XHXA 3AVLA 3AVMA 1T3VA 5KQ8A 4B8CA 4DTMA 1OVYA 3WEEB 4AHVA 3TWHA 4DFPA 2FBYA 3C6TA 3ENHA 1ITGA 3ZT0A 4TSXA 2BGGA 4Z4EA 4RW7A 4OGCA 1QQOA 2B6AA 4AHTA 1WSJA 3QINA 4CK1A 4FPBA 1EXQA 2O8DA 1E4GT 1Y97A 4LF8K 4M45A 5AQZA 2KZZA 3M1FA 4F3OA 3KIOA 4E89A 3CYGA 1MWMA 3AARA 3OYJA 2E5LK 5BPNA 4RW4A 2EWSA 4Z94A 3UKRA 5CR4A 4MLEA 5AZIB 1ZBLA 3DXMB 1K8KA 2E2OA 5AR0A 2A5XA 3EZ5A 2HW3A 3RWUA 1RTHA 3ZSRA 1XQSC 4DTRA 4DWIA 3RR7A 2IGIA 1MDUB 1EX4A 4O44A 3UE5A 5TKYA 1NGBA 4H4MA 3VQCA 1KD1O 1QSSA 1VSFA 3OYBA 4YOUA 1W9HA 1Q81O 4HUFA 1SKSA 5GAEP 1RDCA 4NLCA 3CCJN 1ZBHA 3HO1A 2Q31A 1NU0A 2QK9A 1BOTO 1A5WA 2CH5A 2ZGYA 1X9JA 1VK0A 3L3VA 5DM7L 1XC3A 1YF5L 5C0YA 4B9SA 3WXIA 2G8KA 5K14A 4ICLA 3CMAN 3QO9A 3WQUA 1IBLK 2ZQBA 4GV3A 4M3RA 1KAZA 1S3XA 4O0JA 4IOAL 4E19A 4FWRA 5JLFA 3OS0A 3VGMA 2NNWA 4PL8A 4CF2A 1T44A 2W40A 1JL1A 3SBGA 1SZ2A 4BACA 4DSJA 4I6MA 3HSCA 1IKWA 1WB9A 3K2PA 3IAYA 1WSIA 4AH9A 1KVCA 4OKKA 4JKBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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