3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
3VEXA 5F2RA 1NGHA 4QS8A 5BPLA 3WT0A 1IG8A 2A41A 3ZX3A 4BRIA 3L4IA 1NGIA 4BRNA 3MK6A 3BEXA 1YUWA 4RTFD 4BQZA 2V7YA 4B9QA 3O8MA 1JCFA 3U4LA 3B8AX 3HSCA 4A2BA 4CZJA 3CI5A 3AAPA 1ATNA 2E1ZA 3SMPA 3M3ZA 1MA9B 3A0IX 1KAZA 4K25A 1X3MA 5BREA 3SMSA 5FPDA 4BR2A 3AY9A 3VETA 4CZFA 4H0VB 4HWIA 4PKIA 3EN9A 4B1VA 4CJ7A 4BVOA 4PKGA 1KXPA 5AQYA 2A3ZA 2J4RA 4H0XB 3WQUA 1RDWX 4FWRA 1JCEA 4FWNA 2QWRA 1ESVA 3M1FA 3HM8A 3U9ZA 3O1WA 1GLLO 2YHWA 2VWBA 3DWLA 5KPRA 5JLFA 5E26A 2Q36A 4AM7A 4H5WA 5AQVA 2Q31A 4YDUC 5FPMA 4BRAA 2QXLA 2IIRA 4BC2A 1QZ5A 3UKRA 5JLHA 5AR0A 5EOYA 3MMVA 1RGIA 4C23A 2QWMA 3WUHA 3GBTA 1ATSA 1YVNA 4A2AA 1T6CA 3VEYA 1P8ZA 3EKSA 3IDHA 2GEMA 1NGGA 3QFPA 4H5NA 1K8KA 2FXUA 3D7EO 3EZWA 5E84A 2W40A 3P4IA 1NM1A 2QW9A 3LDOA 3O6WA 3CJCA 3U8XA 3UKRB 5ADXH 3VERA 3MN5A 3ATVA 1GLJO 1XC3A 5BRDA 4H5TA 4H0TB 4CD1A 4KBOA 3D2FA 1KAXA 3EO3A 1ATRA 4FWLA 4CZEA 2YJEA 3KHYA 3CJAA 3BP8A 4H0OA 3FZMA 3SK3A 3F9MA 3H46O 4IJNA 5AQFA 3LDNA 1BDGA 2V51B 1K8KB 4DCHA 3VGMA 4WYBA 4IO8A 1IJJA 2Q1NA 5BN9A 4BG9A 3R6MA 1JCGA 4HTLA 5AQQA 5KPZA 1NGEA 1GLBG 1QHAA 4XEIA 4BRGA 4BRKA 2P9SA 3VGLA 2AP1A 2GUPA 3D2FB 3EKUA 4E1JA 2D1KA 4BRLA 4CZIA 3CETA 5ADXA 3IFRA 3ENOA 1S3XA 3ZETA 1BA1A 2VYPA 1R59O 1TUUA 5AQUA 3DAWA 4CZGA 4BR0A 1SAZA 4A62A 1QZ6A 4FOIA 3A8YA 4A61A 3CQXA 4FWSA 1HLUA 3L0QA 2YI1A 4BRDA 3HTVA 3I33A 3FZKA 2P9SB 3R8EA 4BC3A 2A40A 3W0LA 4NB4A 4CZHA 1C0GA 5F1XA 4MO4A 3S41A 4QS7A 1BG3A 2I7PA 2P9IA 3H1QA 3VEOA 3WXIA 4BR7A 4H5RA 3H3NO 3FZLA 3ZETB 1BWFO 1NGJA 1HKBA 3JS6A 1RFQA 3QBXA 4BREA 2E2NA 1HKCA 2Q2RA 3QDKA 3J8AA 5F0XA 5I9EB 3FLCO 1ZXOA 2FSKA 3BF3A 1QQMA 4B1XB 3LL3A 4CI6A 2V7ZA 3VENA 3FR0A 1ZC6A 4MO5A 3ULEA 4BRHA 2P9UA 4GY2B 3FZFA 4DHYA 4BR5A 3MCPA 4AM6A 3C0BA 2PBDA 4EIAA 3ZX0A 5AQGA 4FOEA 2P9IB 3O80A 4BGAA 5BPNA 2P9LA 3DJCA 3I8BA 3H6EA 4YDUA 3A5OC 3WQTA 4EFHA 5AQWA 5CE3A 1DGKN 1DKGD 3QMLA 2CH5A 3ULEB 3VPZA 2P9UB 4BR4A 3G25A 4WQ5C 1KAYA 2V52B 2E2PA 3LM9A 3C7NA 3H3OB 5AFUH 1GLCG 3FE1A 2FLOA 2HF3A 2GWKA 2E88A 3ZX2A 3O1BA 2P9LB 4WQ4C 3EL2A 2ZGZA 5AQKA 2E8AA 4JAXA 4FWMA 3SJHA 4QS9A 2Q0RA 3UE5A 2OANA 2NRHA 3C7NB 1D4XA 2I7NA 1NLVA 2ASOA 2NLXA 4FWQA 4FWKA 3AARA 2PAVA 2F9WA 4BG8A 5EXWA 4BR9A 5AQRA 1S22A 4H0PA 4IZ9A 3ID8A 4ISGA 1BO5O 5AFUA 3ATUA 1H1VA 5KQDA 3KZBA 4LC9B 3GG4A 2FSJA 4B1ZA 1CZAN 3VF4A 2ASPA 1EQYA 2D0OA 3UKUA 2FF3B 4BVPA 5AQLA 3BUZB 4EHTA 4NO7A 1J6ZA 1QQNA 3BF1A 3SLCA 2GELA 1GLAG 4CBUA 4IXCA 4RCHA 3O08A 3W3DA 4FPAA 4K43A 3LM2A 3ZEUA 1HX1A 4CZKA 3QFUA 2BUPA 3MDQA 5BPMA 4FO0A 5FPEA 4B1YB 3LDQA 1V4TA 2Q0UA 3MN7A 3UKUB 4FWPA 2YHYA 4DB3A 1BA0A 3FZHA 3CJBA 2QWPA 3QB0A 4DQ8A 2P9NA 5KQ8A 1WOQA 2P9PA 3DXKA 3CQYA 1Q18A 3GL1A 3VEZA 2ITMA 3ZEUB 1NGFA 1NGAA 3GE1A 5AQMA 2KHOA 2BTFA 1Z05A 3VESA 1HJOA 3JXUA 1BUPA 5B8HA 4Z94A 5AQIA 2D0PA 2FF6A 3FFKB 4CBWA 1QQOA 4BROA 4PKHA 3FGUA 1XUPO 2ASMA 2F9TA 4O5FA 3CJ7A 2E20A 2P9NB 3OHRA 4XH1A 1Z6RA 5AQXA 2IVOA 2P9PB 3DXKB 5BRFA 2W41A 3VF6A 2EWSA 4BQLA 4WQ5A 2QWNA 4JNEA 3WXJA 1YAGA 1NGBA 2A6AA 4EHUA 5LJVA 3CIPA 3VEWA 4ISEA 4B1UB 1XQSC 5EY4A 5AQJA 1GLEG 5FPNA 4WQ4A 3A5MC 2QWLA 1ZBSA 1TYQA 2GWJA 4H03B 2ZF5O 2DPNA 4L3QA 4O8KA 2YCHA 4K42A 2GTDA 1HUXA 4M7YA 4IWVA 3TPQA 3QBWA 4K41A 3CJ1A 3WXLA 1X3NA 2IVNA 4MLEA 1BU6O 4CZLA 5EX5A 5LJWA 1DEJA 3RSEA 1U2VA 4FPBA 3A5NC 3L6QA 2E1YA 3U9DA 5AQSA 2WUSA 2QWOA 1TYQB 2QM1A 3H45C 4FWOA 4PL8A 4BRCA 2CGKA 3GOIA 5TKYA 4PL7A 3VGKA 3VF2A 5EVZA 1TUYA 1T6DA 2ZWHA 4I6MA 1U6ZA 3CHWA 1GLDG 4JHDA 3WEEA 3R9PA 4CD3A 4BGBA 3D2EA 2HMPA 4J8FA 3O5BA 3VOVA 1E4FT 1C0FA 4XH4A 3RSEB 4F9OA 1U2VB 3TU5A 3LDPA 5KPTA 5ELZA 1LOTB 4CBXA 4JD2A 3H1VX 3HI0A 5BRHA 3WXKA 4GNIA 2E2OA 2P9KA 4BRMA 2HOEA 4I6MB 5AZIA 4JN4A 5JICA 1HKGA 1NWKA 4JHDB 3WEEB 4FL9A 5AQZA 3D2EB 4H5VA 1HPMA 3HZ6A 1MWKA 3IMXA 2A42A 1NBWA 1G99A 3A5LC 3ENHA 4BRFA 1LCUA 1SQKA 1OKJA 1NMDA 2VCPA 4JD2B 2YJFA 2E2QA 2D4WA 3UB5A 3VEVA 3DXMA 2P9KB 1NGCA 5AQTA 5AZIB 1X9JA 3CJ9A 2FSNA 4B1WB 3M6GA 5AQOA 4FSVA 4RWTA 4Y0WA 2QWQA 5BR9A 2IVPA 3GDQA 2Q97A 2HF4A 5JMVA 3LDLA 4IJAA 1V4SA 3O4WA 1SZ2A 4H0YB 3MN6A 4MLHA 3MN9A 4BC4A 2CGLA 5AQPA 4M7XA 5LY3A 1MDUB 3CERA 2A5XA 5BN8A 1MWMA 4CZMA 1BOTO 3AAQA 5AZJA 5AQNA 1WUAA 3DXMB 4BC5A 2AA4A 1NGDA 3KVGA 1YXQA 4ISFA 3QICA 2ZGYA 1E4GT 3IUCA 2CGJA 2UYTA 2YHXA 2NZTA 4EAHD 5AQHA 2H3GX 3HBTA 4XH5A 4M63C 4BRPA 1T44A 4BRQA 1GLFO 2CH6A 5AZJB 1Y64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VEXA 1VHXA 1VSHA 1NGHA 3NF8A 1N32K 3WT0A 3ZX3A 4I7FA 2O8CA 1KV0A 1S9EA 1NGIA 4NXMK 2EX3A 5CHIA 3O8MA 4JK7A 3V9WA 1NRBA 4B9NA 4CHQA 1JL2A 1OZZA 3EY1A 3M3ZA 4LF5K 4KKOA 5DM7L 1KAZA 2BGGA 1X3MA 2O8EA 2G8FA 3SMSA 2OCEA 3EN9A 4B1VA 3ZSOA 2A3ZA 3QNNA 4Z4FA 3THVA 1NOYA 4CK1A 2ATBA 1YJ9N 3U9ZA 1SN4A 3KWIA 3SBTA 4K8XA 4DFKA 4H5WA 4OO1J 1S1WA 2MN5A 2QXLA 3UKRA 5JLHA 2A1RA 3CM5A 5EOYA 3PV8A 1RGIA 5HRNA 1IKVA 4DLGA 4IOCL 3NBPA 1LWCA 3GBTA 1BCGA 4CFAA 5C2DA 5JS2A 4EZ9A 4B9SA 3IDHA 2GEMA 4DTMA 1NGGA 5FROA 2HSTA 3QFPA 4H5NA 1K8KA 3ZT3A 3T1YK 3D7EO 1A5XA 3EZWA 3P4IA 3BK3C 2XO7A 3TSUA 1CHZA 5ADXH 2PFUA 3S9HA 3L2QA 2Z1IA 4CD1A 4KHQA 4FWLA 2YJEA 3V9ZA 3FZMA 3SQ0A 1RT5A 3QEVA 4CJ5A 3F9MA 1K9MO 3QEIA 2RF2A 5AQFA 1OH5A 1R0AA 3RR7A 3NH0A 4DU4A 5KI6A 4DUZK 4B3TK 3MWTA 4DF8A 3THWA 3E7UX 3S5TA 4DFJA 3KOWA 3EZ5A 3LANA 4AILC 3O9SA 2GUPA 4CJWA 5EU7A 3ZCMA 5C42A 4DV4K 5LL6Z 1N5YA 3CETA 5ADXA 3DLKA 4F4KA 2KTQA 1S3XA 3ZSWA 1BA1A 2VYPA 3ZLJA 1SAZA 1QZ6A 5D3GA 2E3GA 3CQXA 4BE7B 1HLUA 3L0QA 3LZIA 1WAJA 3HTVA 3SCXA 4YOUA 2P9SB 3KK2A 4CZHA 1C0GA 4MO4A 1QE1A 3KOXA 2NRWA 4FCYA 1BI4A 1VQ4N 3H1QA 3P83D 3WXIA 3H3NO 3ZETB 2JGUA 1WNSA 4DR6K 3QBXA 1HKCA 2Q2RA 5I9EB 1OH8A 5F0XA 4N41A 1WSJA 1JLCA 3FLCO 1J53A 3V9SA 4B1XB 3L2UA 3TTDA 1J9AA 1JLGA 4JKFA 4MO5A 4BRHA 3MAQA 3FZFA 4DHYA 2QK9A 1TL1A 3CCMN 4KI6A 4CGIA 2WTUA 1LW2A 3VTIA 1NK8A 4BACA 3KLEA 2X6SA 5KK4A 3OJUA 3K58A 3MXMA 3I8BA 4YDUA 2YNGA 2ZQBA 3LZJA 3A5OC 4EFHA 5AQWA 5CE3A 3DRRA 1O1WA 2P9UB 2Y1JA 3ZSYA 2V52B 2E2PA 3DOKA 5AFUH 3AVHA 2KSKA 2YHBA 2HF3A 1RBUA 3B6OA 2O8BA 1EETA 2P9LB 4YOVA 3B6PA 2QA4N 2NRXA 3P39A 1W9HA 1DTTA 1I94K 3DI6A 4FWQA 3IKMA 1RT2A 3KLIA 3CPWM 1FW6A 3SQ4A 2PAVA 3D0PA 1AHOA 4BG8A 3OYCA 4BR9A 1U45A 3ZSRA 2LR3A 2X6NA 4IOXA 4K0KK 1BO5O 1TV6A 5AFUA 1ZBLA 3SPYA 5KQDA 2WOMA 3KZBA 4LC9B 1NPIA 1UA1A 4HCCA 2FSJA 1VSKA 5FRNA 2O8FA 3THYA 2OTJN 5J2QA 2KYQA 1VQMN 5AQLA 1WLJA 3BUZB 4NO7A 1JKZA 2YIPA 3QIPA 3BF1A 3SUQA 4QCLA 5CY4A 3L8BA 1DQ7A 1S1UA 4X65K 3CCSN 1GLAG 3AVNA 4RCHA 3W3DA 2HHSA 3HOTA 4OKKA 4A59A 1RBRA 4E1MA 4CZKA 3S3OA 3ZT1A 3MDQA 4B1YB 3NHGA 1HYVA 4DWIA 4CQKA 4DFPA 2Z1GA 2KKZA 3CJBA 1NMNA 3P31A 1J54A 2HHXA 1KFDA 4DQ8A 1LQHA 4X66K 2HHTA 4CJPA 4JI3K 1NGFA 4GV9A 1JXCA 3SUNA 1EP4A 3CC7N 4OGEA 1HJOA 4DQIA 4OLBA 4CJSA 4C8LA 1W0HA 2DFFA 4A5AA 4FJXA 3D45A 3KC6A 1NJZA 3RVCA 2ASMA 2F9TA 2W6KA 4O5FA 3LWLA 3K9JA 1Z6RA 5AQXA 2LY6A 2IVOA 4GV6A 4ID1A 1TGOA 4IDHA 3J81O 3VF6A 2EWSA 3A2FA 2RE2A 3MEEA 1RBSA 2QWNA 5A2QO 3AO4A 3HP6A 1MYNA 3SUOA 1NK6A 2YILA 1NGBA 4ILJA 3BZKA 1XQSC 2A7TA 1GLEG 4LF8K 3NDKA 3A5MC 2N2RA 2F8TA 2DPNA 4L3QA 1JZBA 2B4JA 2N69A 4O8KA 1YHQN 4E89A 1XNRK 2YKNA 2GTDA 3ASMA 3TPQA 4DV5K 4QOZB 3E7RL 3WXLA 1X3NA 2IVNA 3CFRA 4FK4A 2HMIA 1SKWA 3S3MA 2YKMA 3A5NC 3HVTA 4B3SK 1VQ7N 1NE5A 1TYQB 2QM1A 3T69A 3DLLL 3RR8A 1LWEA 2CGKA 2DY4A 2VG5A 1DLOA 5C10A 3VGKA 1FXXA 3VF2A 1TUYA 4FK2A 4I6MA 1BL3A 2YX6A 1U6ZA 3CHWA 4KB0A 1JZAA 3R9PA 2O8DB 3J7YP 2HMPA 4J8FA 2ZD1A 1JJ2M 1E4FT 4OGCA 3F5TA 1C0FA 5GIOA 1XRSB 4F9OA 2P5GA 4KHWA 3MX2A 1HRHA 4DSJA 4JD2A 4BDYA 4GMJB 1IV0A 2C1IA 1SL0A 4JI0K 4AQYK 4DMNA 3KHWA 3L3UA 5AZIA 1HJRA 1NWKA 4Z4HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VEX A;  1VHX A;  1VSH A;  1NGH A;  3NF8 A;  1N32 K;  3WT0 A;  3ZX3 A;  4I7F A;  2O8C A;  1KV0 A;  1S9E A;  1NGI A;  4NXM K;  2EX3 A;  5CHI A;  3O8M A;  4JK7 A;  3V9W A;  1NRB A;  4B9N A;  4CHQ A;  1JL2 A;  1OZZ A;  3EY1 A;  3M3Z A;  4LF5 K;  4KKO A;  5DM7 L;  1KAZ A;  2BGG A;  1X3M A;  2O8E A;  2G8F A;  3SMS A;  2OCE A;  3EN9 A;  4B1V A;  3ZSO A;  2A3Z A;  3QNN A;  4Z4F A;  3THV A;  1NOY A;  4CK1 A;  2ATB A;  1YJ9 N;  3U9Z A;  1SN4 A;  3KWI A;  3SBT A;  4K8X A;  4DFK A;  4H5W A;  4OO1 J;  1S1W A;  2MN5 A;  2QXL A;  3UKR A;  5JLH A;  2A1R A;  3CM5 A;  5EOY A;  3PV8 A;  1RGI A;  5HRN A;  1IKV A;  4DLG A;  4IOC L;  3NBP A;  1LWC A;  3GBT A;  1BCG A;  4CFA A;  5C2D A;  5JS2 A;  4EZ9 A;  4B9S A;  3IDH A;  2GEM A;  4DTM A;  1NGG A;  5FRO A;  2HST A;  3QFP A;  4H5N A;  1K8K A;  3ZT3 A;  3T1Y K;  3D7E O;  1A5X A;  3EZW A;  3P4I A;  3BK3 C;  2XO7 A;  3TSU A;  1CHZ A;  5ADX H;  2PFU A;  3S9H A;  3L2Q A;  2Z1I A;  4CD1 A;  4KHQ A;  4FWL A;  2YJE A;  3V9Z A;  3FZM A;  3SQ0 A;  1RT5 A;  3QEV A;  4CJ5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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