3LDLA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldlA04
4M63C 5AQJA 1LOTB 2P9IB 2BUPA 3QFPA 1DGKN 3LL3A 3UKUA 4A2AA 4FSVA 3U4LA 1SQKA 3IMXA 4BVPA 1MDUB 2QM1A 3VERA 3U8XA 1NGIA 2BTFA 2IVNA 1D4XA 5JMVA 5FPDA 2V7YA 5FPEA 2Q36A 1YUWA 4H5VA 3BP8A 3ENHA 4BRFA 3G25A 2CGLA 4M7YA 2A40A 3VETA 3VF4A 1WUAA 4BG9A 5AQUA 2IVOA 2I7PA 4EFHA 1QHAA 2FSNA 2P9NA 2GTDA 4M7XA 2HMPA 4FWMA 4JD2A 4BG8A 4HWIA 3JS6A 4H0OA 2E2QA 2AA4A 5BPNA 1C0FA 4CBWA 1ESVA 2W40A 1NM1A 3D2FA 3UB5A 3CJCA 3A5NC 3VGKA 3L4IA 3CHWA 2IIRA 2E2NA 3C0BA 3FZLA 2E2PA 3MCPA 2F9TA 4F9OA 2FSKA 4L3QA 3ID8A 4BQZA 1H1VA 4FWQA 2Q97A 3B8AX 4CZGA 2QWQA 3WXJA 3LDPA 5EY4A 3WQTA 4JN4A 2E8AA 2ITMA 2YI1A 4PKIA 1YAGA 2P9KB 5AQYA 2E2OA 4JAXA 2FSJA 4O8KA 3LM9A 1BA0A 1Z6RA 2V7ZA 5AQKA 5F2RA 3AAPA 4BGAA 3GBTA 4Z94A 5BN8A 2P9UA 3WQUA 2UYTA 2D0PA 2IVPA 3R6MA 3AY9A 2NLXA 2GUPA 3VGLA 2HOEA 3D2EB 2VYPA 3DJCA 5LJWA 4H5RA 3JXUA 5B8HA 5KPZA 3MN9A 5AQPA 3O08A 3VOVA 3SK3A 3VENA 5ADXH 5BN9A 3H45C 4JHDA 4BC4A 4WQ4C 3ULEA 4DHYA 2Q31A 1ATSA 5CE3A 3MN5A 1HKCA 3MN7A 5JLFA 1HPMA 1X3MA 1T6CA 3A5MC 4B1YB 2H3GX 3ZETB 1BOTO 3A5LC 2HF3A 3GL1A 1DEJA 1ZBSA 1GLFO 2HF4A 4C23A 3ZEUA 4BC2A 1U2VA 3DAWA 1KAXA 2AP1A 4CD3A 3QBWA 4CI6A 1JCGA 5AZIB 3CJBA 2GWKA 3RSEB 4EAHD 2V52B 4BRPA 4QS9A 2F9WA 3LDNA 5LJVA 3WEEA 4E1JA 4CBXA 3SLCA 4BR9A 3EL2A 5AFUH 3QICA 3C7NA 4WYBA 1KAYA 1G99A 4FPAA 1LCUA 4FPBA 5AFUA 2EWSA 1R59O 2PAVA 1GLLO 3H46O 1U6ZA 1Z05A 4GY2B 4XH4A 4BQLA 3QFUA 3CJ1A 4XH1A 2GELA 2P9SA 3QB0A 3VESA 4BGBA 5AZJA 2PBDA 4I6MA 2FXUA 3H3OB 3ATUA 3QDKA 4BRHA 5AQOA 4PKHA 1QZ5A 3SMPA 3O4WA 1DKGD 2P9NB 3IFRA 1X3NA 4BRIA 4ISGA 2A3ZA 4B1VA 3O80A 2YHXA 4RWTA 4JD2B 1QQNA 3HI0A 4IXCA 5AQRA 4ISFA 2ASPA 3WUHA 2J4RA 4WQ5A 3VEWA 1QZ6A 1TYQA 2P9LA 4PKGA 4MO5A 1RDWX 4FWLA 2QWOA 1HKGA 1Y64A 3D2FB 3R8EA 3AAQA 5KQ8A 1BA1A 1KAZA 3MMVA 2ZF5O 1NGFA 4QS7A 4H0YB 1T44A 1MWMA 1Q18A 4BRQA 2QWRA 2Q0RA 1QQMA 5LY3A 3A5OC 4DCHA 4B1ZA 3FR0A 3IUCA 3HBTA 1RGIA 2D4WA 2V51B 4BC3A 5KQDA 4RTFD 3R9PA 3HTVA 4BRMA 4BRLA 3EKUA 3O5BA 2QWNA 4K42A 4BREA 3EN9A 4IO8A 1TUYA 2Q1NA 3A8YA 1IJJA 3DXMA 1SAZA 3MK6A 2ASOA 2P9UB 4CZKA 3BF1A 3ZX3A 1BDGA 4CZMA 2VWBA 3M6GA 4H0PA 4DQ8A 4XH5A 5FPMA 5BPLA 1NGHA 2NZTA 3ZX2A 2ASMA 5FPNA 1MWKA 1XQSC 5ELZA 2CH6A 4IJNA 2QW9A 5I9EB 1KXPA 2CGJA 4FL9A 3LM2A 2KHOA 2P9PA 3CJ7A 4J8FA 2QXLA 3VEOA 4CZLA 1XC3A 3BUZB 3CIPA 1XUPO 3SJHA 5AQNA 5AQQA 1NLVA 5BREA 4BR4A 3ULEB 4MLEA 4LC9B 1NGBA 4FWPA 3W0LA 3KZBA 3CQYA 3M3ZA 3DXKA 3D2EA 4K25A 4FO0A 3UKRA 4NB4A 3EKSA 5BRFA 5AQHA 2D1KA 2VCPA 3VF2A 1OKJA 3GG4A 3ZEUB 3QBXA 2E88A 2A6AA 1U2VB 2A41A 4H0XB 1HJOA 3LDQA 5EX5A 3QMLA 2QWPA 3CI5A 3D7EO 5EVZA 1BUPA 5JICA 1GLJO 4NO7A 2W41A 4B1UB 3WEEB 4CZEA 3TU5A 1K8KB 3WXIA 3FZHA 4FWKA 1ZXOA 3WXLA 4HTLA 4IWVA 3FE1A 4FWSA 2FLOA 1HUXA 1WOQA 5BRHA 3HM8A 5AQFA 4FWOA 4H0TB 3UKUB 3H6EA 3VEZA 1EQYA 5AQLA 1ATRA 4WQ5C 4AM6A 4MO4A 5AZIA 3CERA 5JLHA 4BR2A 4WQ4A 1GLBG 1BU6O 2FF3B 3F9MA 1ATNA 4Y0WA 3L6QA 5BPMA 2YJFA 4YDUA 2E1ZA 3EO3A 4MLHA 1HKBA 5AZJB 1S3XA 1NMDA 2P9IA 1T6DA 3H1QA 4I6MB 2QWLA 3LDLA 3I8BA 3CJAA 1YVNA 4IJAA 3GDQA 2CH5A 5AQVA 3UE5A 4A62A 3O1BA 4K41A 4B1WB 1NGDA 5AQSA 3SMSA 4H0VB 3VEYA 2NRHA 3OHRA 1TYQB 2P9LB 4CZJA 3KHYA 4B1XB 3HSCA 3I33A 1HX1A 1NBWA 4IZ9A 5AQIA 1J6ZA 5AQXA 3MN6A 1ZC6A 5AQWA 1GLDG 4XEIA 3HZ6A 4GNIA 4EIAA 4BRGA 4EHUA 3A0IX 1NGEA 1V4TA 3O1WA 1TUUA 4PL8A 5AR0A 1JCFA 3P4IA 4CZFA 4FOIA 3VGMA 1GLAG 1E4GT 3TPQA 5E84A 4BR5A 4BROA 4DB3A 4H5NA 4QS8A 1BWFO 1RFQA 3O6WA 3VEXA 4BR7A 2WUSA 2ZGZA 4BR0A 3EZWA 1P8ZA 3BF3A 3FGUA 3J8AA 5KPRA 3FZFA 1MA9B 4FWNA 3DXMB 2A42A 1GLCG 2E1YA 3ATVA 4CZIA 4BRAA 2YHYA 2ZWHA 5KPTA 2DPNA 5EOYA 4CBUA 1CZAN 4BVOA 4H03B 2E20A 1IG8A 1NGJA 2P9KA 2ZGYA 5EXWA 4CJ7A 3WXKA 5TKYA 3S41A 4BRCA 2YHWA 3H3NO 5BRDA 3IDHA 2P9PB 4O5FA 1C0GA 4H5TA 4JHDB 2FF6A 3ZX0A 2D0OA 1GLEG 4H5WA 2YCHA 3VPZA 3FZMA 3DWLA 1SZ2A 2YJEA 5AQTA 4EHTA 3CETA 3DXKB 1QQOA 1V4SA 4ISEA 2GWJA 3UKRB 5AQGA 1E4FT 1HLUA 2CGKA 3CQXA 5AQZA 3AARA 4CD1A 2I7NA 3H1VX 2A5XA 1JCEA 1NWKA 1YXQA 3GOIA 4RCHA 5F1XA 1BO5O 3U9DA 3GE1A 3LDOA 3FFKB 3BEXA 3FZKA 3U9ZA 5BR9A 5ADXA 4YDUC 1BG3A 4BC5A 4BRDA 3L0QA 2QWMA 3ZETA 5E26A 3MDQA 4CZHA 3FLCO 2OANA 3WT0A 4A2BA 3VF6A 4A61A 2GEMA 3VEVA 3C7NB 4JNEA 2Q2RA 3ENOA 5AQMA 5F0XA 1NGAA 4B9QA 4FOEA 4K43A 4KBOA 1NGGA 4FWRA 3RSEA 3W3DA 4BRNA 4BRKA 3M1FA 1X9JA 4PL7A 1NGCA 2Q0UA 1K8KA 4AM7A 2P9SB 3O8MA 1S22A 3KVGA 3CJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BGRA 4OVLA 2P9IB 2BUPA 4FK0A 1OVYA 1S1VA 1SQKA 1VQ7N 3QNNA 3C94A 1K8BA 4R5PA 2BTFA 3VQQA 2HB5A 2Q36A 1WNSA 4CEDA 3RRHA 4RW8A 3KWIA 2N2QA 4JRPA 3SQ1A 2B4JA 3VF4A 1M90O 1L3TA 2KYQA 4HCBA 5AQUA 2IVOA 4CERA 2I7PA 4CFCA 2O8DA 2GTDA 4M7XA 1W2BM 4C8LA 3CMAN 3NH1A 2JGUA 4BECA 4H0OA 4CFAA 4E19A 4JKHA 3P39A 5J2PA 2O8BA 3DLHA 1ESVA 2HNZA 3I0RA 3DRRA 1VAZA 3K0SA 3CHWA 3C0BA 2E2PA 4FLWA 3E7RL 5C42A 3SV4A 4BQZA 1H1VA 2FBVA 2LI7A 3OYFA 5D3GA 2WC9A 2O8CB 2N2RA 4Z0UA 2PFUA 3LDPA 3WQTA 4PHTX 2WFBA 2JLEA 2X6SA 1JKZA 4PKIA 2G8KA 1XC9A 4NCGA 3VQ5A 5TKWA 2F96A 3DI6A 4O8KA 1Z6RA 2V7ZA 5AQKA 3GBTA 4Z94A 3S3OA 1XRSB 3M8PA 3WQUA 4OPJA 3R6MA 1JLGA 4FJXA 4LF4K 1AHOA 3VGLA 3AO4A 5B8HA 2VY6A 5AQPA 4M41A 3QIOA 3R2VA 3NF8A 4DQQA 4JHDA 4BC4A 4WQ4C 4X65K 5JS1A 4NXMK 4FW1A 5JLFA 3MN7A 4DR6K 4FK4A 5FRMA 3ZCMA 1C1BA 2HNDA 2B3CA 3THWA 3K5LA 1X9MA 4O0IA 4J2AA 2NRTA 3SV3A 4RW7A 3ASMA 1DEJA 3ZEUA 4E7IA 2HW3A 1JLBA 4F2SA 3LP1A 1U2VA 3AA4A 2KQ2A 2ASCA 1BCOA 1KAXA 2XRIA 2UXCK 4CD3A 4FJ9A 3HM9A 5AZIB 4EAHD 4OGEA 4BRPA 2F9WA 1D9FA 1YJWN 3LDNA 2YIPA 1TK8A 3WEEA 1XHXA 3A2FA 1BIUA 3SLCA 3SYZA 4FJ8A 3C7NA 1ICAA 3QERA 1KAYA 3P38A 4FPAA 3AVAA 1S9GA 3OYIA 4B3MK 2PAVA 5BR8K 4IG0A 4KHPK 3HOSA 4CHOA 2NRXA 3PO5A 3VESA 3JYTA 3AA3A 5M1QA 4M3TA 2FXUA 4KREA 4BRHA 4J2BA 5CHIA 2P9NB 4BRIA 4OO1J 3O80A 2KGQA 1WAJA 3HI0A 4ISFA 3WUHA 3SUQA 4CJWA 3VQBA 4DQPA 1QZ6A 1IV0A 1JKHA 1Y64A 1VSKA 4OKEA 4A57A 5KQ8A 1VNAA 3CD6N 4CJ3A 2WONA 3CCSN 3MMVA 2NY8X 5FLXO 3OYKA 4N5SA 4KTQA 4H0YB 1L5UA 4B3OA 2MBKA 1YI2N 5C24A 3TAFA 4DLGA 4ID1A 1RBSA 4B1ZA 3TAPA 4CJFA 1RGIA 2D4WA 4HUGA 1EKEA 5KQDA 4IFYA 2QTDA 4BRMA 3O5BA 2QWNA 3L2RA 4NYFA 4BREA 4BDYA 4KTWA 1HNIA 3C6UA 1IJJA 3MK6A 3P5JA 4KYPA 3BF1A 3QNOA 1HPZA 4YOYA 3MXMA 3CYMA 3SQ2A 1P90A 4FVMA 1RT1A 1PX9A 1YF5L 2VGNA 3AVBA 3MWPA 3MX2A 5I9EB 4IJNA 4UY8O 1GOBA 3QEXA 1YT3A 1VQ9N 4CJVA 2CGJA 2DFFA 4MDBA 4DR3K 5M1PA 1XUPO 5AQNA 4BR4A 1NGBA 1IBLK 4K8ZA 3CQYA 1QS4A 3MAQA 2NRWA 4RW9A 3M3ZA 4CCHA 3ZT2A 3LWMA 1ASWA 4LD0A 2IGIA 2ETJA 4FO0A 3WNGA 1T7BA 1WLJA 3OW2M 2E4LA 1N4NA 4CJUA 1JLCA 4JI2K 1DTTA 1VQPN 3CC2N 2R7YA 2IC3A 2A41A 4CK2A 1ZBIA 2XO7A 3IRXA 3ZT1A 3D7EO 5EVZA 3KLGA 1KV0A 1GLJO 1RDCA 4B1UB 1VSLA 1K8KB 4FWKA 3THXB 1P00A 3FE1A 1T05A 3T1HK 2YC1C 2KKZA 3NBPA 5AQFA 1SV5A 4JEPA 3H6EA 5AQLA 1JZAA 1ZBUA 5HROA 5AZIA 3KK2A 1GLBG 3SQ4A 2XY5A 4LFBK 3RR8A 4F4KA 1AYJA 4XJXA 2YJFA 4Z4IA 4GV6A 3SUOA 4PWDA 2P5OA 4CHQA 5AZJB 3SCXA 4CGHA 1NKBA 3H1QA 1SEGA 1Q8IA 1EO1A 3DLKA 4DU1A 4CK1A 4IEIA 2CH5A 4DU4A 4WFBL 3K5NA 3V81A 1WAFA 3S3NA 1NGDA 3C6HA 4B3SK 2NRHA 1A5VA 1TYQB 3VTHA 4CZJA 4W5QA 3KHYA 1VHXA 1N33K 3HSCA 3AGRA 3I33A 1RT7A 2VG5A 4IZ9A 1NJWA 1LQIA 1VSHA 3HP9A 1J6ZA 4BE1A 5AQXA 4DTNA 3L3VA 1IG9A 2EHGA 1WSGA 3HZ6A 4CJLA 4DQSA 1J54A 4GNIA 3NF6A 1QQCA 4PA1A 1EWQA 4AAZA 3CC4N 4CEAA 1W0HA 3NHGA 4ICLA 3OBYA 1WSEA 3VGMA 3MX5A 1POIA 1E4GT 4DB3A 3PV8A 4CIGA 3VEXA 4NXNK 1KVCA 4BR7A 4WFAL 4JI8K 3K9KA 3RMBA 1P8ZA 1SNBA 5KPRA 3FZFA 1HQUA 4OPKA 3V4IA 2HHXA 3DXMB 2W6KA 1GLCG 2X74A 3FFIA 3QEIA 1NK8A 1S9EA 2DPNA 5EOYA 1Q7YO 1ZBFA 4BVOA 4F3TA 4DSIA 4DTOA 2O8FB 4KI4A 4LSLA 1QVFM 1S6QA 3HK2A 4LF7K 2EX3A 3TABA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3BGR A;  4OVL A;  2P9I B;  2BUP A;  4FK0 A;  1OVY A;  1S1V A;  1SQK A;  1VQ7 N;  3QNN A;  3C94 A;  1K8B A;  4R5P A;  2BTF A;  3VQQ A;  2HB5 A;  2Q36 A;  1WNS A;  4CED A;  3RRH A;  4RW8 A;  3KWI A;  2N2Q A;  4JRP A;  3SQ1 A;  2B4J A;  3VF4 A;  1M90 O;  1L3T A;  2KYQ A;  4HCB A;  5AQU A;  2IVO A;  4CER A;  2I7P A;  4CFC A;  2O8D A;  2GTD A;  4M7X A;  1W2B M;  4C8L A;  3CMA N;  3NH1 A;  2JGU A;  4BEC A;  4H0O A;  4CFA A;  4E19 A;  4JKH A;  3P39 A;  5J2P A;  2O8B A;  3DLH A;  1ESV A;  2HNZ A;  3I0R A;  3DRR A;  1VAZ A;  3K0S A;  3CHW A;  3C0B A;  2E2P A;  4FLW A;  3E7R L;  5C42 A;  3SV4 A;  4BQZ A;  1H1V A;  2FBV A;  2LI7 A;  3OYF A;  5D3G A;  2WC9 A;  2O8C B;  2N2R A;  4Z0U A;  2PFU A;  3LDP A;  3WQT A;  4PHT X;  2WFB A;  2JLE A;  2X6S A;  1JKZ A;  4PKI A;  2G8K A;  1XC9 A;  4NCG A;  3VQ5 A;  5TKW A;  2F96 A;  3DI6 A;  4O8K A;  1Z6R A;  2V7Z A;  5AQK A;  3GBT A;  4Z94 A;  3S3O A;  1XRS B;  3M8P A;  3WQU A;  4OPJ A;  3R6M A;  1JLG A;  4FJX A;  4LF4 K;  1AHO A;  3VGL A;  3AO4 A;  5B8H A;  2VY6 A; 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