3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
2YJEA 3GBTA 2Q1NA 3HZ6A 4WQ4C 2Q97A 1NGEA 1U2VA 3M3ZA 3AAQA 4CZGA 2Q2RA 4PKHA 4IXCA 2WUSA 2IVOA 4FWKA 2A41A 4H0YB 4QS9A 3VF4A 1ATRA 3M6GA 4BVOA 1DEJA 4B1YB 5AQMA 1RGIA 4M7YA 4H5NA 5AQGA 4A61A 2W41A 3U9ZA 3CETA 5AQPA 3A5OC 2HOEA 3CIPA 5AZJA 3WT0A 3ENOA 2J4RA 2ITMA 5ADXA 4BC4A 1CZAN 4RCHA 3MN5A 3CI5A 4CD1A 4FWQA 1NGIA 4A2AA 1TYQA 3FZLA 3VESA 2QWLA 2YHYA 2ASOA 2GWKA 2Q0UA 2FF3B 3VGKA 5JLFA 4GY2B 3FFKB 5AQNA 2GTDA 4Z94A 5AQTA 2ZF5O 1JCFA 1K8KA 1MDUB 3O8MA 2E2QA 1HKGA 3R8EA 1GLBG 2D0PA 3GE1A 3H45C 3O08A 2H3GX 4HWIA 2VCPA 4BC2A 2F9TA 2Q31A 2P9UA 3JXUA 5F2RA 1MWKA 1V4TA 2E2OA 3FGUA 1NGHA 2VYPA 2FF6A 2CGKA 4BRCA 2A3ZA 4ISGA 1YUWA 5KQ8A 3MDQA 1C0GA 5AQLA 3VERA 1TUUA 4WQ5A 3WXIA 1HKCA 2IIRA 4AM7A 4H0OA 3D2EA 1ESVA 2E2NA 3DXKB 4IO8A 4BRQA 4BRAA 1S22A 2VWBA 3FLCO 5ADXH 2PAVA 5BN8A 3WEEB 2KHOA 3ZX2A 5AFUA 3SMSA 5I9EB 3ZX3A 4H0PA 1NGDA 4BQZA 4IWVA 3RSEA 1U2VB 2P9SA 3VEZA 5KPZA 2BUPA 3H1VX 3HTVA 3AAPA 3CJAA 3KZBA 2GWJA 4BR2A 1OKJA 3MMVA 4KBOA 1HX1A 4IJNA 4XH4A 3U8XA 5FPEA 1NWKA 3CJ9A 4B1VA 1QZ6A 2HMPA 2FLOA 4CZKA 3R9PA 5FPDA 2FSJA 1Z6RA 2PBDA 3WQUA 2E1ZA 1NGCA 1DGKN 3CJBA 3EKUA 1E4GT 5BPMA 4A2BA 3VENA 1ATSA 3ATVA 4BRGA 5LJVA 3FZFA 1R59O 3JS6A 4NB4A 3TPQA 3H6EA 4B9QA 1MWMA 5AQRA 2Q36A 5AQXA 3H1QA 2QXLA 3QB0A 1NMDA 4H5RA 4BGAA 4K42A 5EOYA 4YDUA 1BUPA 3ZX0A 3AY9A 2YCHA 5AQUA 3CERA 4EHTA 4H0TB 3GOIA 3LDNA 1X3MA 2HF4A 1YVNA 4ISFA 4M7XA 4FWPA 5AFUH 3H3NO 1EQYA 1P8ZA 3LDPA 4E1JA 2YJFA 2ZWHA 5LJWA 3ZETA 2P9IA 5BRHA 5JICA 4JNEA 2F9WA 5JLHA 1JCEA 3O80A 2ASMA 3BF1A 3A8YA 4CD3A 1HPMA 2FSNA 4K43A 5ELZA 3ATUA 3QBWA 3ULEB 3CJ7A 2QWPA 3UB5A 1MA9B 3A5NC 4BREA 2P9LA 2E1YA 4BG8A 1KAXA 1IJJA 3WQTA 2QWNA 3D2EB 3BUZB 3EN9A 3ZEUA 4FWLA 2CH5A 3UKUB 4BGBA 2DPNA 3D7EO 3O4WA 4BROA 4EFHA 3VF2A 2YHXA 3LM2A 1BDGA 1XC3A 1XUPO 3VGLA 1G99A 4BR7A 3D2FA 1GLLO 4XEIA 3RSEB 1Q18A 4NO7A 3C0BA 2AA4A 4H0XB 3QICA 4IZ9A 2E2PA 4BRPA 4JN4A 5EVZA 1YXQA 4GNIA 5AQHA 3HM8A 2V7ZA 5AQQA 4B1ZA 5AR0A 3HSCA 3UE5A 5BPLA 4CBWA 4H5TA 1QQNA 4JHDB 2GEMA 4L3QA 4I6MB 1QQOA 2IVPA 3W0LA 3A5MC 2FXUA 4AM6A 3QFUA 4BC3A 1NBWA 1X3NA 5AQSA 2D0OA 3DXMA 4BC5A 3HBTA 3UKRA 4EHUA 3CJ1A 4MLHA 4B1UB 1QQMA 3CHWA 5JMVA 2V52B 2P9PB 3W3DA 1SZ2A 3ZETB 3LM9A 2QWRA 1X9JA 3FZKA 3TU5A 4EAHD 4FPBA 2P9NB 5FPMA 1D4XA 4BRFA 2P9KA 4IJAA 4CBXA 2ZGZA 2FSKA 1QHAA 5BRFA 3A0IX 2E8AA 5BREA 4JAXA 1BA1A 4HTLA 3B8AX 4FL9A 3AARA 2NLXA 2A40A 2P9LB 3QDKA 5BRDA 5LY3A 4RTFD 4K41A 5AZIA 3FZMA 3VF6A 1Z05A 4FOEA 4B1WB 1JCGA 3U9DA 1TUYA 1T44A 3IUCA 1ZXOA 2A6AA 1HUXA 4FWOA 3O6WA 5AZJB 2A5XA 1LCUA 4MO5A 2QW9A 4H5VA 2NRHA 3VETA 4LC9B 3BP8A 2ASPA 4PKIA 5AQOA 3EKSA 4CZJA 4CZLA 4JD2A 1TYQB 2BTFA 1ZC6A 3IMXA 3BEXA 4QS7A 4FWNA 3QBXA 3SLCA 3L0QA 3L6QA 3MCPA 3WXKA 2AP1A 3MN7A 3I8BA 2HF3A 4RWTA 2QM1A 1K8KB 5AQIA 3WXLA 3FZHA 1NGGA 1T6DA 2P9UB 3LDLA 4MO4A 3DAWA 4BR9A 1BA0A 2GUPA 4O5FA 5F1XA 4CZIA 5CE3A 3I33A 4WQ4A 4H0VB 1RDWX 3WUHA 1BG3A 2CGLA 1HKBA 1RFQA 5E26A 3CQYA 3H3OB 1NGBA 4BR0A 3DXKA 1QZ5A 3VPZA 4BRDA 3ENHA 3VEOA 4EIAA 1KXPA 3WEEA 4J8FA 5F0XA 3GDQA 2P9SB 2OANA 5EXWA 1BO5O 2E20A 4FPAA 5BN9A 4FOIA 5AZIB 4CJ7A 3O1WA 1E4FT 5TKYA 4BVPA 4CI6A 3C7NA 1H1VA 1KAYA 4F9OA 3S41A 5AQWA 4Y0WA 3QFPA 5AQVA 1GLCG 4FO0A 2E88A 3L4IA 4M63C 5AQYA 4BRHA 5FPNA 1IG8A 3WXJA 3SK3A 5KPTA 3IDHA 1GLDG 5EX5A 1GLFO 5AQZA 4CZEA 3MK6A 2EWSA 4JD2B 1HJOA 5BPNA 1NGJA 4CZMA 3DWLA 3HI0A 3CJCA 4FWRA 1NGAA 2CH6A 3U4LA 2YHWA 3VEYA 3J8AA 1LOTB 1ZBSA 4PKGA 3EZWA 2P9IB 2QWQA 3LDQA 5EY4A 4A62A 1SQKA 1NM1A 1BWFO 5E84A 4XH1A 4DCHA 3M1FA 4BRLA 4BRKA 4FWSA 2CGJA 3ULEA 4WQ5C 3OHRA 1GLJO 1T6CA 4BR4A 5KPRA 2YI1A 3ZEUB 3CQXA 2QWOA 1C0FA 3EO3A 4XH5A 4CBUA 3UKUA 5BR9A 3MN6A 3IFRA 1S3XA 4DB3A 2Q0RA 3LDOA 3EL2A 3KHYA 4H5WA 1NLVA 3O1BA 4FWMA 3D2FB 4CZHA 3DJCA 1Y64A 1YAGA 1NGFA 2V51B 3G25A 5B8HA 4WYBA 2W40A 2UYTA 5AQFA 2ZGYA 3VOVA 2I7PA 3C7NB 4C23A 2V7YA 4CZFA 5AQJA 3VEWA 1BU6O 1KAZA 2A42A 2D1KA 4PL7A 2I7NA 2QWMA 1BOTO 3R6MA 4JHDA 3VEXA 4I6MA 2D4WA 3FR0A 3F9MA 1GLEG 3SJHA 3SMPA 3GG4A 2IVNA 3DXMB 3H46O 4YDUC 1HLUA 4DHYA 3QMLA 1XQSC 4BRMA 3VGMA 3UKRB 4FSVA 5AQKA 3A5LC 3KVGA 4BG9A 5KQDA 4BRNA 4H03B 4BRIA 4DQ8A 2P9PA 4O8KA 4QS8A 4BQLA 1U6ZA 2GELA 3BF3A 1SAZA 3VEVA 1DKGD 3ID8A 4PL8A 3LL3A 4K25A 1GLAG 1WUAA 1J6ZA 3GL1A 3O5BA 4ISEA 2P9NA 1ATNA 4BR5A 3P4IA 4MLEA 2P9KB 4B1XB 3FE1A 3MN9A 2NZTA 1V4SA 1WOQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YJEA 1BHLA 3ZYYX 2O8CB 3LWMA 2Q2RA 4CESA 5LMNK 4PKHA 4CERA 1VQ8N 4IXCA 4FJNA 4FWKA 3OA9A 3TAGA 5AQMA 1POIA 5JVHL 4M7YA 3V9SA 5AQGA 1WSEA 3AVMA 1HNZK 3CETA 4I9QA 3A5OC 4A59A 1VQPN 1K9MO 2W6KA 5KTQA 4IOXA 1ITGA 4HUFA 2J4RA 3VN5A 3PIPL 4KHPK 4FVMA 4DQIA 1CZAN 3GKUA 3TTDA 2NUBA 2ZD1A 1NGIA 3VQ4A 1WN7A 5KI6A 4DLEA 3E7RL 3ULDA 1D9DA 4FJ7A 2QWLA 3TABA 2YHYA 3F2KA 4KHSA 4GY2B 3TAQA 3KLIA 4DR6K 4FLXA 1S1VA 4Z94A 1XHZA 4CF0A 3O8MA 5KGWA 1T1TA 1EWRA 4FK2A 3GE1A 2D0PA 2MN5A 3H45C 3PUFA 2BANA 3CCLN 3ZSQA 4BC2A 2F9TA 2Q31A 4FLTA 3AA3A 5C12A 4E1NA 1MWKA 3FGUA 2VYPA 3BY5A 3AVAA 3QI7A 3E9LA 1IKVA 3RWUA 2VG7A 2QA4N 3G71N 1IKXA 4H0OA 4Z4HA 3DXKB 3NDKA 2YEOA 4JI7K 2VWBA 3O9TA 3V9ZA 2KHOA 2M8BB 5I9EB 2YHBA 4MQ3A 3ZT3A 4AHVA 3O9QA 1TKZA 4YOXA 4M42A 2P9SA 1ZU3A 2I61A 4IEEA 1L3TA 4GV9A 1U04A 3HTVA 3KZBA 1BIZA 3PX6A 4RG8A 3P39A 4JRQA 4IJNA 1HX1A 2FBVA 3AVNA 4B1VA 4Z4EA 4LY7A 2GMOA 5JENA 2FLOA 2HNDA 4LD0A 4CZKA 4CIFA 1M90O 1Z6RA 3TSPA 3CW4A 2PBDA 3WQUA 3CJBA 1VQ5N 1NK0A 5BPMA 4BRGA 5LJVA 4FJXA 1R59O 3JS6A 4DTMA 4NB4A 3TPQA 1NPIA 3QEWA 3J7ZO 3H1QA 5AQXA 3QB0A 3HJFA 1HNWK 4BGAA 2LI7A 2O8BA 1MYNA 1HMVA 2KW4A 5GADP 1FK9A 5EOYA 2SN3A 4YDUA 1K6YA 3M8SA 3ZSVA 2YCHA 4H0TB 3GOIA 4FJIA 2HF4A 3JYTA 3K58A 1YVNA 4DV7K 4M7XA 4IEIA 1VNAA 1EQYA 4CJLA 3LDPA 4E1JA 2ZWHA 2B3CA 5LJWA 5GIPA 3ZETA 1O13A 2P9IA 5JICA 3T69A 2IDOA 4JNEA 5HLFA 3ZT0A 1JCEA 3KOWA 2ASMA 3VA3A 3BF1A 2FSNA 3E66A 4K43A 3ZSWA 1OH8A 2OCEA 2O8FB 3ATUA 3ULEB 4LF9K 4CJVA 1MA9B 4IFEA 2P9LA 3ENBA 2ATBA 1JL1A 2IC3A 3HVRA 4YHHK 1UGLA 3BUZB 3EN9A 4NXNK 1IH7A 4AHRA 2OPQA 3O4WA 3PO4A 1PTXA 1I94K 4CW7B 5J2MA 3RSEB 4JKGA 1VSEA 3C94A 4B8CA 2QK9A 4NO7A 3C0BA 1RDUA 3I0RA 1QQCA 3AGRA 5AR0A 3HSCA 1WAFA 1HQEA 3A5MC 5CYMA 4BC3A 4E0DA 1NBWA 4O55A 5AQSA 4FK4A 3TR8A 4DSKA 1ZYWA 4MLHA 2YIPA 3CYGA 2KBKA 2PYJA 1UOCA 2OPRA 2XRIA 3H08A 3K59A 1S1TA 3KKSA 1SZ2A 1NRAA 1NNEA 5LMUK 1RILA 1X9JA 1NG9A 4BWJA 2P1JA 1NK8A 1S6PA 2ZGZA 3NVMA 3QETA 2RN2A 3KWGA 3B8AX 3SF4D 1S6QA 3QDKA 5LY3A 5T7BA 4YOYA 4DR1K 3N4PA 4FOEA 1U47A 4B1WB 4QAGA 3F73A 2P5GA 2N69A 2MZ0A 3U6FA 2FC0A 3CFPA 2A5XA 1LCUA 3A2FA 4MO5A 3O4QA 4IDKA 4LC9B 1ZBHA 2ASPA 3QNNA 1SL2A 3LDSA 4PKIA 4CEDA 1C55A 3EKSA 3SBGA 4AHSA 3KK1A 1HQUA 2BTFA 2A1RA 2VG5A 2E0HA 4KHNA 4QS7A 3QBXA 3SLCA 3L0QA 2G8VA 3OYKA 1HYZA 3CMAN 5J2QA 3MN7A 2QM1A 3WXLA 3IRXA 4CGFA 3AVFA 4IOCL 1L3UA 4JI5K 2X78A 1QE1A 4J2BA 5DMRA 3RRHA 1NGGA 4MO4A 5JVGL 3SQ1A 3MWPA 3O9SA 1OMYA 1BA0A 4N56A 1TAUA 1WBBA 3DOKA 2KGQA 3CM6A 4CJSA 5M1QA 4NXMK 4NCGA 1LAVA 3I33A 4DV1K 3OYHA 3WXMB 1RFQA 3MEGA 4GW6A 3DLGA 4FLZA 1B92A 3SV3A 4BE0A 4EIAA 3D6RA 4J8FA 5F0XA 4B3MK 4OO1J 3NF7A 2P9SB 4WF9L 1BO5O 2E20A 2QXFA 3ZSZA 1BGXT 3AA2A 3C6UA 4YOTA 4CJ7A 3HPHA 4C1NI 1E4FT 3C7NA 4BWMA 4Z4CA 1NKEA 3QFPA 4FO0A 1JJ2M 1Q9XA 3MX2A 2HBKA 3SK3A 5KPTA 3IDHA 2OYQA 4PA1A 1GLDG 5EX5A 3DM2A 2XY5A 2YNGA 4FZZA 5J2PA 3ZCMA 3MK6A 1NJWA 5BPNA 2Y1JA 4JEPA 4ZHRA 2CH6A 2F96A 4G9ZA 1NJIO 2P51A 1LOTB 4PKGA 2P9IB 3T1AA 3HP6A 3AVBA 4FVUA 3QO9A 3G10A 4DR2K 1P00A 1SQKA 4XH1A 4CVNE 2G8FA 3TAEA 3OTOK 3THYA 3WNEA 2W6LA 2HNZA 3J80O 3E9PA 3ALYA 3OHRA 4BY9C 1C56A 1T6CA 3OVNA 4CJTA 1P90A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YJE A;  1BHL A;  3ZYY X;  2O8C B;  3LWM A;  2Q2R A;  4CES A;  5LMN K;  4PKH A;  4CER A;  1VQ8 N;  4IXC A;  4FJN A;  4FWK A;  3OA9 A;  3TAG A;  5AQM A;  1POI A;  5JVH L;  4M7Y A;  3V9S A;  5AQG A;  1WSE A;  3AVM A;  1HNZ K;  3CET A;  4I9Q A;  3A5O C;  4A59 A;  1VQP N;  1K9M O;  2W6K A;  5KTQ A;  4IOX A;  1ITG A;  4HUF A;  2J4R A;  3VN5 A;  3PIP L;  4KHP K;  4FVM A;  4DQI A;  1CZA N;  3GKU A;  3TTD A;  2NUB A;  2ZD1 A;  1NGI A;  3VQ4 A;  1WN7 A;  5KI6 A;  4DLE A;  3E7R L;  3ULD A;  1D9D A;  4FJ7 A;  2QWL A;  3TAB A;  2YHY A;  3F2K A;  4KHS A;  4GY2 B;  3TAQ A;  3KLI A;  4DR6 K;  4FLX A;  1S1V A;  4Z94 A;  1XHZ A;  4CF0 A;  3O8M A;  5KGW A;  1T1T A;  1EWR A;  4FK2 A;  3GE1 A;  2D0P A;  2MN5 A;  3H45 C;  3PUF A;  2BAN A;  3CCL N;  3ZSQ A;  4BC2 A;  2F9T A;  2Q31 A;  4FLT A;  3AA3 A;  5C12 A;  4E1N A;  1MWK A;  3FGU A;  2VYP A;  3BY5 A;  3AVA A;  3QI7 A;  3E9L A;  1IKV A;  3RWU A;  2VG7 A;  2QA4 N;  3G71 N;  1IKX A;  4H0O A;  4Z4H A;  3DXK B;  3NDK A;  2YEO A;  4JI7 K;  2VWB A;  3O9T A;  3V9Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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