3QFUA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) complexed with adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
NYGTVIGIDLGTTYSCVAVMKNGKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDIKHLPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKSDKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKAFKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 110
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfuA04
3RSEB 3IUCA 2P9PB 3H6EA 3MMVA 4WYBA 3CQXA 2ASOA 1HKBA 3R8EA 2E1YA 3AARA 2ZGYA 1BU6O 5FPNA 4QS7A 4HWIA 4Z94A 2QWMA 3KVGA 3CJBA 1LOTB 1NMDA 3FFKB 3FZHA 3R9PA 2P9NA 5AZJB 5EY4A 4H5RA 3ATVA 1Y64A 2ZF5O 5EVZA 3ID8A 4ISEA 5F1XA 3TU5A 3A5MC 1S22A 5AQQA 1U2VA 4BQLA 4FOIA 4BRLA 1ZXOA 2IVNA 1ZBSA 2UYTA 3VENA 3FZFA 4H0TB 3OHRA 3VEZA 1DGKN 5BPNA 3HBTA 3H3OB 1V4TA 5BREA 1WOQA 3QICA 5AQWA 3FZMA 1YUWA 3D2FA 1KAZA 5FPEA 1P8ZA 3A5OC 2QWRA 4ISGA 2ASPA 2Q36A 3UE5A 4BR4A 4B9QA 4M63C 4IO8A 5BN9A 4FWPA 1NGJA 5EXWA 3ENOA 1BA0A 2P9IA 5KPZA 4QS9A 2P9IB 4H0YB 5AQHA 1HLUA 2A40A 4JD2A 4K43A 5AZIA 3WQTA 1HUXA 4FWRA 4JHDA 5ADXA 2GELA 1BG3A 5AQOA 3EN9A 4A61A 1EQYA 5AZIB 3MCPA 1CZAN 3DWLA 4I6MA 3O08A 1JCFA 3ULEA 3UKUA 3A5LC 1MWMA 1C0GA 4NO7A 1XUPO 1K8KB 2P9SB 3ULEB 3UKUB 1GLEG 4BRCA 3WT0A 3FGUA 2CH6A 2E1ZA 4H5NA 4M7XA 1SAZA 1TUUA 2A5XA 2W41A 4Y0WA 1NGAA 1BO5O 1NGHA 2HOEA 3IMXA 3BF1A 4FWQA 1C0FA 3VOVA 4ISFA 3CJ7A 1BA1A 5LJVA 3ZETA 3LM9A 4BRIA 3A0IX 5KQDA 1MDUB 3CJCA 3FE1A 4BVOA 3H1VX 3TPQA 4H5VA 5AR0A 4QS8A 4K42A 4BR0A 2QWPA 1SQKA 1SZ2A 3B8AX 2QW9A 1NGDA 3VEOA 2YHYA 3LL3A 5AQTA 2Q31A 3BUZB 2P9KB 3BF3A 4JN4A 3QDKA 3VGLA 4O5FA 3GL1A 3FR0A 3DJCA 2ZWHA 3O6WA 3LDOA 2P9LB 5BRDA 2I7PA 2E88A 4BRHA 3VGMA 1IG8A 2YHWA 4CZIA 4FWOA 1GLJO 2V51B 4BRQA 3H45C 4EFHA 2GWJA 3CJ1A 3GBTA 1E4FT 3AAPA 2QWLA 5AZJA 4HTLA 4CZHA 3HSCA 3SJHA 2CGJA 2PAVA 3DAWA 4H03B 3S41A 1NGFA 4BR2A 4MO4A 3VF2A 1GLLO 4BRPA 3O1WA 3JXUA 4CD1A 1DKGD 1TUYA 3CIPA 1Q18A 4BC5A 2BTFA 2D1KA 3HZ6A 5EX5A 5E26A 1LCUA 1MA9B 3CJAA 4JNEA 3GDQA 1S3XA 4A2BA 1G99A 3QFUA 2D4WA 4DHYA 4BG8A 5F2RA 2IIRA 4FWKA 4DCHA 1QQMA 2GEMA 4E1JA 3L4IA 3BEXA 3FLCO 4XEIA 4CI6A 5AQMA 2V7ZA 4B1XB 4RWTA 2Q2RA 3C7NA 2QXLA 4BVPA 2E8AA 3O80A 3ZX0A 3WXIA 5AQIA 5BR9A 4BC4A 3C7NB 5AQUA 4BRGA 4IXCA 1GLDG 2H3GX 4CZKA 4CJ7A 4DQ8A 2I7NA 3QB0A 3VEWA 4CBXA 4CZLA 3UKRB 4CZFA 5AQXA 3VEVA 5AQNA 1JCEA 1YXQA 4L3QA 5EOYA 1V4SA 3U9ZA 1HPMA 2DPNA 1Z05A 4IZ9A 4F9OA 4H5WA 2GWKA 3DXKB 2NRHA 1D4XA 2CGLA 2F9WA 4IWVA 3QFPA 1NGBA 3VF6A 1K8KA 2P9SA 1BDGA 3A8YA 1T44A 1QZ6A 3EZWA 3KHYA 4CZGA 4PL7A 2YHXA 3O4WA 1RFQA 1NGIA 2A6AA 2FLOA 4DB3A 4FPAA 1XQSC 3JS6A 1ESVA 4PKHA 1NBWA 4XH4A 1NGEA 5AQYA 5JMVA 4B1YB 2OANA 2PBDA 4CBUA 3HI0A 3MN6A 1HKGA 5E84A 3SMSA 4BRNA 4BQZA 1XC3A 2FSJA 2HF4A 3CQYA 1ATSA 4H5TA 1ATRA 4FWMA 3D2EB 2YI1A 3ENHA 3CJ9A 3EO3A 4LC9B 1E4GT 4XH1A 2VWBA 2ZGZA 3EKSA 2E2QA 3H3NO 3F9MA 4WQ5C 3FZLA 1X3NA 2NLXA 2Q1NA 4RTFD 2YCHA 1RDWX 4J8FA 5ELZA 4BG9A 3VPZA 2P9KA 3SLCA 5BN8A 4FL9A 1KAYA 4B1VA 1KXPA 2P9LA 3ZX3A 3J8AA 4BRMA 3FZKA 2FSNA 2HMPA 3CETA 2EWSA 3G25A 5KQ8A 1X9JA 4WQ5A 1MWKA 4FWSA 3HM8A 3GG4A 4MLHA 3LDLA 3LDQA 3CHWA 3ZX2A 2FSKA 4H0XB 4M7YA 3AY9A 2Q0RA 3M3ZA 5AQFA 3L6QA 5JICA 5BPLA 5F0XA 3QMLA 5AQZA 5AQKA 3CERA 3GE1A 3AAQA 5B8HA 2Q0UA 3DXMB 2D0PA 3P4IA 2F9TA 5AQRA 4JAXA 5LJWA 2AA4A 4CZMA 2NZTA 1TYQB 4BREA 4WQ4A 2QWOA 3ZEUA 4EIAA 2KHOA 3WEEB 3IFRA 2QWQA 1R59O 1NM1A 3ZEUB 1QQNA 4K25A 5BPMA 2V52B 2A42A 1GLAG 4IJNA 2WUSA 4MLEA 5AFUH 4EHUA 1BWFO 3MK6A 2ASMA 1BUPA 3UB5A 1QHAA 4H0VB 2P9UA 3M6GA 1T6CA 2J4RA 1QQOA 1JCGA 1T6DA 1HX1A 2P9UB 2E2OA 2P9NB 4B1WB 3QBXA 4BRFA 2VYPA 5BRFA 2YJFA 3O5BA 2D0OA 5AQLA 2V7YA 1NGGA 2QWNA 4PKGA 5CE3A 4CD3A 1NGCA 2YJEA 4B1ZA 1U2VB 2VCPA 4EHTA 3U9DA 4PKIA 4BR9A 2IVOA 4YDUC 4AM6A 3UKRA 4EAHD 4KBOA 4BGBA 4BROA 4FWNA 4GY2B 1HJOA 1GLFO 3DXKA 5FPDA 2GUPA 2Q97A 4AM7A 4C23A 3D2FB 5I9EB 4BR7A 3A5NC 1X3MA 4YDUA 4FO0A 2CGKA 1GLBG 3EL2A 3MN7A 2FF3B 3W0LA 2IVPA 3M1FA 3W3DA 3VF4A 1GLCG 1YVNA 4FWLA 5KPRA 5BRHA 4FSVA 4BC3A 4MO5A 4BGAA 4BRAA 5JLFA 3ATUA 3LM2A 3IDHA 3WUHA 5AQGA 4H0OA 3BP8A 3D7EO 1Z6RA 3WXKA 4IJAA 3MDQA 1J6ZA 4CZEA 1IJJA 2FXUA 3LDPA 3C0BA 3H46O 3I8BA 3D2EA 4FOEA 3I33A 4JD2B 1KAXA 4K41A 3WXJA 3O8MA 4JHDB 2ITMA 2AP1A 3GOIA 4GNIA 3HTVA 1YAGA 2BUPA 1RGIA 5AQVA 4FPBA 2HF3A 4I6MB 3QBWA 1WUAA 3VERA 3EKUA 1H1VA 1OKJA 4BC2A 4BRDA 5LY3A 3LDNA 5ADXH 5AQSA 3H1QA 3U8XA 3WXLA 5JLHA 1U6ZA 4B1UB 4O8KA 1ATNA 2A3ZA 3O1BA 4A2AA 3ZETB 3VETA 3VGKA 3CI5A 2FF6A 5TKYA 2A41A 1ZC6A 4A62A 2E20A 1NLVA 2E2NA 1BOTO 4PL8A 3MN5A 4WQ4C 4CBWA 2CH5A 2E2PA 3VESA 4XH5A 3WQUA 3VEXA 3DXMA 1QZ5A 4CZJA 1DEJA 5KPTA 4H0PA 3SK3A 5AFUA 3SMPA 3KZBA 3MN9A 2GTDA 2W40A 3L0QA 4RCHA 3U4LA 3R6MA 2QM1A 1TYQA 4NB4A 1HKCA 4BRKA 1NWKA 3VEYA 5AQJA 5FPMA 3RSEA 5AQPA 2P9PA 3WEEA 4BR5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XY6A 3IUCA 4M3XA 1SNBA 3MECA 4BE0A 3NH2A 3L8BA 3C6AA 4CFDA 4Z94A 4B3MK 1IBMK 4OPHA 3FFKB 4ILHA 4W5TA 2P9NA 4KB1A 4H5RA 5EVZA 4OO1J 3O9QA 2LT8A 5F1XA 2ATQA 2LSNA 1A5XA 4BQLA 2HHWA 4B3RK 3BY5A 3DRSA 1NRAA 4M3ZA 1ZBSA 4OJRA 5KRSA 3FZFA 1A5VA 3QERA 1VNBA 1DGKN 3NF8A 3NCIA 4CCHA 1V4TA 4NYFA 5AQWA 1GOBA 5GIPA 3D2FA 4E7KA 1KAZA 5LMNK 3A5OC 3E9OA 4JI1K 2F8TA 3A2FA 2KSKA 1A5WA 2KPYA 4IOCL 5CY0A 4AAZA 2HBJA 1U48A 1KLMA 4DSLA 3EY1A 1XHZA 1BA0A 1NH5A 1HNWK 4CEZA 4CE9A 3K9JA 2QXFA 4GV6A 2A40A 3MEGA 3VTHA 1VRUA 4K43A 1HUXA 3CC4N 5ADXA 2WC9A 1BG3A 5AQOA 5AZIB 1VNAA 3MCPA 5HBMA 1SL1A 4DR7K 3DWLA 3TSQA 4HHTA 1RNHA 1JCFA 3ULEA 3NMUA 1DT9A 2ATBA 1K8KB 2PYLA 4BRCA 1YHQN 4IFVA 4DUZK 3TR8A 4M7XA 3T1AA 1SAZA 1TUUA 2A5XA 2W41A 4Y0WA 3OW2M 3OJSA 3DOLA 2HOEA 3QLHA 4WFNL 4FWQA 4B9NA 5HP1A 4LSLA 2PY5A 2YC1C 1BI4A 4YOVA 4UADE 4CF9A 3TPQA 4H5VA 4F4KA 4QS8A 4C8LA 3THYA 5C10A 4KH4A 1SQKA 2ZM6K 3B8AX 4B9MA 1KRPA 3QI7A 5AQTA 1XRSB 4KKOA 4C1NI 3VGLA 4CGIA 1J5OA 1CZ9A 4FZXC 4DQIA 2HHVA 4CJTA 3MX2A 4B8CA 4JV5K 3BZCA 3PY8A 3E9LA 4CZIA 2Z1JA 1T05A 4BRQA 2YNIA 4JYAK 3SJJA 2E5LK 4EFHA 4OPAA 2GWJA 1K9MO 1VAZA 3LANA 1E4FT 1JL2A 3AAPA 1HYZA 1U49A 5AZJA 3PSMA 1RTHA 4DTNA 3C94A 4QCLA 4CK1A 1POIA 4JI3K 1NGFA 4BR2A 4JI8K 2N2RA 1YITN 4JKHA 4M45A 4M42A 3AVJA 4BRPA 4CD1A 1DKGD 3CIPA 4AHRA 3NBPA 1MA9B 5KRTA 1B92A 4JNEA 2ZE2A 4CF8A 5GAHP 2OYQA 1RDAA 1XC9A 3VQ6A 2IIRA 4HE7A 4KH6A 4E1JA 3BEXA 5AJ3K 4XEIA 4CI6A 5FRNA 2YNFA 1B3CA 4LF4K 4UAFE 4RWTA 3HP9A 4BVPA 2E8AA 2G8VA 2JWLA 1NJXA 4W5QA 5BR9A 1GLDG 1SV5A 3KKSA 1TKTA 4OGCA 2HNDA 3AVAA 2I7NA 3LP1A 3VQBA 4CBXA 5M1FA 1HR0K 2BRZA 3DOKA 5AQNA 3VQ5A 3JSMA 4L3QA 3T19A 4KH5A 1D4XA 2CGLA 2D0CA 1L4VA 4Y1CA 1R0AA 4DSEA 4IWVA 1PX9A 1VQ6N 2P9SA 5A2QO 1WT7A 1BDGA 1C0UA 1REVA 1N4NA 1QZ6A 3BZKA 1XWLA 4O4GA 1KVCA 3EZWA 2PYJA 4LFBK 1ILYA 4CGDA 3KHYA 3AGKA 4LF7K 1RBTA 3TARA 1NGIA 3MXJA 1YJ9N 4DB3A 1XQSC 4PKHA 4RW6A 4CEDA 3KWIA 4CJSA 1I6GA 5AQYA 5JMVA 1S1TA 1VK0A 3MN6A 1HKGA 2WFBA 4FM2A 2HF4A 1IKVA 4H5TA 1ATRA 3D2EB 3LAMA 2YI1A 3F5TA 1DLOA 4HTUA 3SUPA 4XH1A 3EKSA 4PY5A 3H3NO 4WQ5C 5I42A 4V1DC 4DU1A 4BG9A 3VPZA 4CIFA 3KD1E 1RT2A 3OBWA 1ASUA 4LF9K 2DTUA 2K35A 1YI2N 4N76A 4B1VA 4AQYK 2W00A 1NPIA 3AVLA 1X9JA 1S5JA 4YOUA 1JLAA 3LDQA 4FJ9A 1VQLN 3PUFA 4C8KA 1LQIA 3AY9A 1KLNA 5M1QA 4GKKK 2RPIA 5C2FA 4CJWA 3TAGA 1NK4A 2QEXN 5J2PA 3CQ8A 3SUNA 2Q0UA 1SN4A 2EX3A 2PFUA 2OTLN 3OYNA 3RMCA 1ZVGA 5J2QA 4BREA 1UAXA 4WQ4A 4DTJA 3NF6A 4YNQA 3ZEUA 3O9TA 2KHOA 3WEEB 3J80O 2G2KA 5M1PA 1NM1A 4M3RA 4FJ8A 1QTMA 4KHUA 2A42A 1GLAG 2WONA 5M1OA 1OVQA 4MQ3A 1VQ8N 3K5LA 4R5PA 4MDAA 4DFJA 2NRTA 2JGUA 3ZSXA 1LW2A 1X1PA 4JK8A 1QQOA 2PZSA 2OPSA 1I39A 4UJ0A 2P9NB 2RF2A 4DSJA 5DMRA 5BRFA 5AQLA 1NGGA 1NK0A 4B1ZA 2VCPA 2GBZA 3U9DA 4DQPA 2IVOA 4LFCK 3UKRA 4FXDA 3KK7A 3AVHA 4EAHD 4UY8O 4KBOA 4X62K 4BROA 4FW2A 1HJOA 2HHTA 4JI2K 5CY4A 3OY9A 2Q97A 3AGRA 3D2FB 3DLEA 2RE2A 4BR7A 4FO0A 3K58A 3RMBA 2CGKA 1NRBA 3EL2A 3MN7A 1RBRA 3EE8A 1J53A 1YVNA 4CHQA 2NRRA 4FWLA 5BRHA 4KTQA 2NY9X 3KP1A 2G8WA 5AQGA 3D7EO 4PUOA 2BGGA 3WXKA 4BDPA 4F2RA 3AO4A 2FXUA 4DWIA 4CGFA 4B3OA 4K41A 3WXJA 1TK8A 4FJKA 4JI7K 2NRVA 1JXCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2XY6 A;  3IUC A;  4M3X A;  1SNB A;  3MEC A;  4BE0 A;  3NH2 A;  3L8B A;  3C6A A;  4CFD A;  4Z94 A;  4B3M K;  1IBM K;  4OPH A;  3FFK B;  4ILH A;  4W5T A;  2P9N A;  4KB1 A;  4H5R A;  5EVZ A;  4OO1 J;  3O9Q A;  2LT8 A;  5F1X A;  2ATQ A;  2LSN A;  1A5X A;  4BQL A;  2HHW A;  4B3R K;  3BY5 A;  3DRS A;  1NRA A;  4M3Z A;  1ZBS A;  4OJR A;  5KRS A;  3FZF A;  1A5V A;  3QER A;  1VNB A;  1DGK N;  3NF8 A;  3NCI A;  4CCH A;  1V4T A;  4NYF A;  5AQW A;  1GOB A;  5GIP A;  3D2F A;  4E7K A;  1KAZ A;  5LMN K;  3A5O C;  3E9O A;  4JI1 K;  2F8T A;  3A2F A;  2KSK A;  1A5W A;  2KPY A;  4IOC L;  5CY0 A;  4AAZ A;  2HBJ A;  1U48 A;  1KLM A;  4DSL A;  3EY1 A;  1XHZ A;  1BA0 A;  1NH5 A;  1HNW K;  4CEZ A;  4CE9 A;  3K9J A;  2QXF A;  4GV6 A;  2A40 A;  3MEG A;  3VTH A;  1VRU A;  4K43 A;  1HUX A;  3CC4 N;  5ADX A;  2WC9 A;  1BG3 A;  5AQO A;  5AZI B;  1VNA A;  3MCP A;  5HBM A;  1SL1 A;  4DR7 K;  3DWL A;  3TSQ A;  4HHT A;  1RNH A;  1JCF A;  3ULE A;  3NMU A;  1DT9 A;  2ATB A;  1K8K B;  2PYL A;  4BRC A;  1YHQ N;  4IFV A;  4DUZ K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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