4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
3FZFA 5AQTA 1BA1A 4CBUA 4LC9B 4BRCA 5AQZA 2V51B 5LY3A 4M7YA 4H0PA 3QB0A 3HTVA 5JICA 3QFUA 3H6EA 3R6MA 1HLUA 3ZX2A 3LDLA 1YXQA 2GUPA 3LDOA 2YCHA 4QS8A 1NM1A 4BRMA 3O4WA 4CZIA 4O5FA 3CJ1A 5AQNA 4IJAA 3WT0A 5AQLA 3ENOA 3SMSA 2FF6A 3D2EB 5EVZA 3D2EA 2A6AA 4A2AA 3MN5A 2IVOA 4PKIA 4JN4A 3LM2A 4M7XA 5FPNA 5BN9A 1NGDA 5AQFA 3UKRB 5FPEA 3J8AA 5AQYA 4XEIA 3TU5A 5BPMA 2P9NB 4QS9A 1T6DA 3UKUB 2P9NA 4Y0WA 4B1ZA 3WXLA 3UKUA 3FZMA 3WXKA 2FLOA 1HPMA 3VEYA 4XH1A 4BGAA 2QM1A 2QWMA 3ENHA 5AQWA 3FR0A 4IXCA 3SMPA 1HKBA 1WUAA 2CGKA 3VEOA 4H5VA 4A61A 4FWMA 1WOQA 3H45C 1DEJA 3ZX0A 1T44A 3C7NB 5AFUH 3C7NA 3H46O 4BQZA 2Q31A 4BVPA 2ITMA 5CE3A 2P9PB 3CJCA 1IG8A 2P9PA 5AZIB 3JS6A 4CBWA 4BRPA 1P8ZA 5EXWA 3M3ZA 2AP1A 3FZKA 2FSKA 2GWJA 4BRHA 1KAZA 4Z94A 3CHWA 4JAXA 3CQXA 2FXUA 1C0FA 3VGLA 3ATVA 1V4TA 4FWSA 4DHYA 3GE1A 3O8MA 3BUZB 3GOIA 5KPRA 2FSNA 4EIAA 5EX5A 2E20A 2ZWHA 1NGEA 1TUYA 4PKHA 1E4GT 2E8AA 2QWPA 4CZLA 4QS7A 2E1ZA 3L4IA 5AQQA 4XH4A 2V7YA 4B1YB 3DWLA 5AFUA 3VF6A 5ADXA 4PKGA 1GLLO 3S41A 4JD2B 1QHAA 4BR9A 4CBXA 3EKUA 4JD2A 1LCUA 1QZ5A 1R59O 3QICA 4I6MB 3VEXA 4I6MA 3O5BA 3WEEB 3WEEA 2IVNA 4BRQA 4BQLA 3FLCO 3VESA 3L6QA 4B1XB 4FPBA 4IJNA 2E88A 3O1WA 3O1BA 1HKCA 2W40A 1QQOA 2KHOA 2QWLA 4BC5A 3LDQA 1HKGA 1MDUB 4H5WA 2OANA 5BPLA 2Q36A 3BF3A 5LJWA 3UB5A 3H1QA 3U4LA 3C0BA 2Q0RA 1RGIA 2QWQA 1KXPA 4MLHA 3QBWA 4JHDB 3LM9A 4JHDA 1S22A 2FSJA 5AQIA 1HX1A 3A5MC 4BRFA 4GNIA 1SAZA 4CI6A 4A2BA 2I7NA 2QWOA 3H3OB 4B9QA 4IWVA 3CIPA 4H0YB 1GLCG 4H0OA 1LOTB 1NGJA 2NLXA 4DQ8A 5KQ8A 5LJVA 3I33A 3SJHA 1U2VB 4O8KA 4CJ7A 1U2VA 2D0PA 4CZMA 5KPZA 4RTFD 1BO5O 3UKRA 4BC4A 3A5LC 3WXJA 3CJ7A 2QWRA 1ATNA 3BF1A 2P9IB 2ZGZA 4ISEA 2P9IA 3VEZA 2V52B 2GWKA 3KZBA 2BUPA 4GY2B 4CD3A 2A40A 2HF3A 2HOEA 5BR9A 1U6ZA 3VERA 1XQSC 4IZ9A 1D4XA 2YHXA 4MLEA 1YVNA 4BRAA 4FOEA 5BREA 3AY9A 1QQMA 4WQ4C 5AQVA 2CGLA 3I8BA 4ISGA 4K25A 1NGCA 4EHUA 4FSVA 1CZAN 5AQJA 1ZBSA 2J4RA 5AQMA 4BR7A 1BA0A 4BR0A 3U9DA 3A5NC 5AQOA 4K43A 4WYBA 3RSEB 3RSEA 1Q18A 1BDGA 3HSCA 2CH5A 3FE1A 4WQ5C 4BVOA 2A3ZA 3A0IX 1ZXOA 5AZIA 2ZGYA 4CD1A 4KBOA 1JCEA 2GTDA 1JCFA 2Q2RA 1X3MA 3M6GA 2CGJA 2E1YA 3CI5A 1K8KB 1K8KA 2P9UB 2YHWA 1XC3A 3HZ6A 2P9UA 3FGUA 2BTFA 3F9MA 3U9ZA 1IJJA 1KAYA 5AQUA 5AQHA 1Y64A 5TKYA 4A62A 3ZX3A 4BRLA 3AAQA 3VF4A 5B8HA 5AQSA 1BU6O 1EQYA 3VEVA 1NMDA 2IVPA 4BRDA 4E1JA 5F0XA 3GG4A 5AZJB 3IDHA 5AZJA 3VENA 1GLDG 1NGIA 2W41A 3HM8A 3L0QA 2V7ZA 3H3NO 5FPDA 4K42A 5E26A 2ASMA 1NGGA 3AARA 2D0OA 3AAPA 5AQXA 4FWLA 2QWNA 5EY4A 3DAWA 3QMLA 1BUPA 1SQKA 3QFPA 3EO3A 3EL2A 3H1VX 4BRNA 2VWBA 2YJEA 4YDUC 4CZHA 5JMVA 1NBWA 1QZ6A 2QW9A 3SLCA 4J8FA 4CZFA 1GLFO 3MN9A 1V4SA 2P9LB 4BG8A 5F1XA 3DXMB 2P9LA 2HMPA 3DXMA 3ZEUB 4BR2A 1NLVA 3ZEUA 1GLEG 1ATSA 3WXIA 5ELZA 4XH5A 2ASOA 4NO7A 3VOVA 2F9WA 5BN8A 4BC3A 2GEMA 1ZC6A 4H03B 4BG9A 4FOIA 2Q0UA 3GDQA 1GLAG 2P9SB 3HBTA 2P9SA 3CQYA 4B1WB 3G25A 3DXKB 1T6CA 3DXKA 4EAHD 3MDQA 2P9KB 1G99A 5KPTA 3EKSA 4FWNA 4AM7A 3KVGA 3LL3A 3QBXA 1TUUA 2E2OA 4H0XB 3FFKB 3ID8A 1YAGA 3VETA 1GLJO 5AQRA 4L3QA 1J6ZA 3BEXA 3MCPA 3R8EA 2NZTA 1BOTO 4HWIA 1DGKN 2D4WA 3SK3A 1SZ2A 3ATUA 2GELA 3KHYA 4MO4A 4WQ4A 5AQPA 2A42A 5KQDA 2ASPA 3DJCA 4FPAA 1MWMA 3TPQA 3FZLA 1TYQB 4H5NA 2YHYA 3GL1A 1NGBA 1TYQA 1NWKA 2A41A 2PBDA 2IIRA 3OHRA 1S3XA 5JLFA 3WUHA 3O80A 3IUCA 3MN7A 2QXLA 4FWKA 4RCHA 3P4IA 4WQ5A 3FZHA 3LDPA 1DKGD 4FO0A 3IFRA 3JXUA 2UYTA 1RFQA 1Z05A 4B1VA 2VYPA 3MN6A 3EZWA 4BGBA 3WQUA 4BC2A 3MMVA 4EHTA 4B1UB 4K41A 3ULEB 5F2RA 3ULEA 4PL8A 3D2FB 1X3NA 5FPMA 2D1KA 2AA4A 3VPZA 3D2FA 4NB4A 4F9OA 5AQKA 2PAVA 4H0TB 4HTLA 2EWSA 1X9JA 2DPNA 2I7PA 4H0VB 3VGMA 5ADXH 3CJBA 3WQTA 2E2QA 4MO5A 3EN9A 1RDWX 4IO8A 3CETA 3M1FA 5I9EB 4CZJA 5E84A 4C23A 2H3GX 3CERA 3HI0A 4BROA 3W0LA 1NGAA 3W3DA 1NGFA 2Q97A 4JNEA 5BRFA 4FWRA 3A5OC 5JLHA 3QDKA 4DCHA 1HUXA 4BR5A 2YJFA 3D7EO 2Q1NA 1Z6RA 2VCPA 3CJ9A 4YDUA 4EFHA 1H1VA 3CJAA 1JCGA 2CH6A 1BG3A 5BRHA 3VGKA 5AR0A 5BPNA 4AM6A 3O6WA 3R9PA 4CZGA 1GLBG 3VEWA 3IMXA 1QQNA 1E4FT 2WUSA 3MK6A 3O08A 5AQGA 1MWKA 1YUWA 5EOYA 2ZF5O 3GBTA 2E2NA 2F9TA 3ZETB 4CZEA 4FWQA 3ZETA 4FWOA 3A8YA 2NRHA 3LDNA 3B8AX 4ISFA 4M63C 4BREA 1NGHA 4H5RA 2HF4A 2FF3B 4CZKA 1KAXA 1OKJA 4FWPA 5BRDA 4RWTA 4BRIA 2YI1A 4DB3A 2A5XA 1C0GA 4PL7A 3VF2A 4BRGA 4H5TA 1BWFO 2E2PA 4BR4A 4BRKA 3U8XA 3UE5A 1MA9B 1ATRA 4FL9A 2P9KA 1ESVA 3BP8A 1HJOA 1XUPO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FZFA 2HMIA 4WFAL 2ZM6K 1YJNN 1P0AA 4LC9B 3SUOA 2V51B 5BR8K 5IT9O 3S3OA 3EY1A 4M7YA 3KD5E 3QB0A 1HR0K 2G8WA 3OS1A 3H6EA 2HHUA 3ZX2A 3LDLA 2GUPA 4FLVA 1NM1A 4BRMA 3O4WA 4CZIA 2ETJA 4WE1A 1WMTA 5AQNA 3QEIA 3ENOA 4DMNA 5C2FA 2A6AA 4A2AA 2MN5A 2IVOA 1IH7A 3Q7BA 2DTUA 1NGDA 3BZCA 5AQFA 3UKRB 3ZSYA 4KB0A 5BPMA 4JI4K 2D56A 4CK2A 2P9NB 1T6DA 1XMOK 3UKUA 1HRHA 1RT4A 1NRBA 2FLOA 5GAEP 1ZYVA 1OH5A 2QM1A 2QWMA 3ENHA 1JXEA 3K5OA 3FR0A 4KI4A 1JLCA 1NOZA 4CHOA 4JI0K 3HPHA 3OYHA 4DV1K 3HOSA 1BMRA 4H5VA 2KPYA 4A61A 4JI7K 4BE7B 1DEJA 2Z1HA 4AQYK 4DV5K 4DFMA 2UXCK 3C7NB 5AFUH 4BQZA 3DOKA 4V19S 3B6PA 4FZYA 3T3FA 3CJCA 5GADP 4HUEA 1BQMA 2ZQBA 3JS6A 4CEBA 4BRPA 4BDZA 2XHBA 3EEQA 2FBXA 3I55N 3M3ZA 3TSQA 4LF8K 4FXDA 2GWJA 5GAGP 1RDDA 3DOLA 4LFCK 3VQEA 3AGRA 1YJ9N 2FXUA 4N41A 1C1CA 1V4TA 4FWSA 4DHYA 4B3RK 3GE1A 1BGXT 3BUZB 4CHZA 3QINA 3RR8A 4OPKA 4EIAA 3I0RA 2E20A 2QA4N 4A59A 4M3TA 2ZWHA 3TTDA 4DFPA 4AB0A 4B8CA 4DR1K 4FZXC 5M1NA 3KIOA 4PY5A 4AF1A 1WNSA 4CJEA 3S9HA 2E1ZA 2P5OA 3LWMA 4B1YB 3NF6A 3PSMA 2UUCK 2JLEA 3VF6A 1Q7YO 4CF9A 1GOCA 4PKGA 2HHXA 1I2UA 4U67L 4MQ3A 3EKUA 4JD2A 4K8XA 1HPZA 4Y1CA 1PTXA 3QICA 4ELVA 3VEXA 1VSEA 1NE5A 1XI1A 4AH9A 3ASMA 4O4GA 1IKWA 4FJJA 3FLCO 4IBNA 4CEEA 2E88A 2B5JA 1BHLA 4C8OA 1QQOA 2KHOA 1LQIA 1VQPN 1SL0A 3PY8A 1HKGA 4H5WA 1WBDA 4M3RA 5GIOA 2WC9A 3OJSA 3H1QA 1N8RO 1NJZA 3CCLN 1N6QA 3VMFB 4CCHA 2BGGA 3LM9A 4JHDA 1S22A 3MEEA 2N69A 5AQIA 1HX1A 3CCUN 3TSUA 3NFAA 4CI6A 1B9FA 1YVUA 3PLAA 3T1HK 1VQ7N 4IWVA 4X66K 4H0OA 4JKGA 3TANA 2HW3A 2NLXA 1JLAA 4DQ8A 5KQ8A 2UU9K 1WAJA 3NCIA 1S9EA 4O8KA 5D3GA 3BY5A 3ENBA 3HP9A 1J54A 3SJJA 4CVNE 2Q3SA 1BO5O 3UKRA 1D8YA 4IDKA 4IFEA 2PZSA 1C0UA 4DFKA 1MU2A 3OYDA 3VQ9A 2P51A 3NH0A 4DFJA 4ISEA 3VEZA 2V52B 3OYJA 3KZBA 1I39A 2HHWA 4CD3A 2A40A 3DMJA 3LP2A 2A7TA 1XQSC 3L2UA 1W97L 1C0MA 1YVNA 2UUAK 3AY9A 1JXCA 1RT2A 3V9ZA 4W5QA 3SQ0A 2CGLA 2XY8A 2E4LA 4ISGA 4OPHA 3CMAN 2OTJN 2J4RA 4FJ8A 2UXDK 2LJ7A 4IFYA 1LWFA 3A5NC 3RSEB 3PX4A 4DV4K 1HMVA 1Q18A 1NPIA 4KHSA 3HSTB 3FE1A 4WQ5C 3ZSQA 4BVOA 4HUFA 3A0IX 1ZXOA 3LWLA 4BE1A 4KBOA 1JCEA 4CGIA 1JCFA 3MX2A 4DQSA 2CGJA 4BACA 1NK7A 1RTDA 1K8KB 4FZZA 4I7FA 2HNDA 2P9UA 4JKFA 3F9MA 3VQ8A 1IJJA 4H4OA 4JKCA 5FROA 5AQUA 4LY7A 3OS0A 4BRLA 4AEIA 5CYQA 4A5AA 5FLXO 5B8HA 1T3VA 4WFNL 3PO5A 4KREA 3P1GA 2ZJQL 3V1QA 2IVPA 2LY6A 3VENA 1GLDG 4X64K 1NGIA 1HNXK 1SS6A 3D45A 2W41A 1AYJA 4JI6K 5E26A 3CFPA 1NGGA 4AHUA 1RT1A 2QWNA 4YHHK 1ZBHA 1ASUA 2NY9X 4ELUA 1SQKA 4KRFA 1VSMA 4YDUC 3G10A 5JMVA 1NBWA 2O8EB 3U6FA 4LSNA 3MN9A 3RR7A 5F1XA 4ELTA 2P9LA 2B3CA 1ATSA 1RT5A 4E7KA 1W2BM 2KBKA 4XH5A 2ASOA 2F9WA 4BC3A 4CJWA 1WSJA 2B68A 1JKZA 4BG9A 3QIPA 3GDQA 2Q0UA 1GLAG 4FOIA 5CYMA 2P9SA 4B1WB 1T6CA 3OYGA 3NH2A 5DM7L 4J2DA 2IGIA 2P9KB 4CEFA 5KPTA 5JVHL 4DF4A 3AVAA 3BZKA 1VSHA 4FWNA 3KVGA 4AM7A 1FXXA 3AVBA 4CEAA 1TUUA 3VQ6A 4H0XB 4EZ9A 5C24A 4Z4GA 3J7ZO 2P5GA 1ZFUA 2YNGA 5LL6Z 4Q5VA 4E7JA 3NF8A 3CW4A 3V1RA 1KLNA 4L3QA 3R8EA 1BOTO 2D4WA 1SZ2A 3E9LA 4KYPA 2GELA 4IOXA 1YITN 4EP5A 4MO4A 2O4IA 3L3UA 5AQPA 3KLIA 2ASPA 3O9QA 4FPAA 4OKKA 4H5NA 2BE2A 1TYQA 2N2RA 4YNQA 4UY8O 2IIRA 3DRSA 4C8NA 1L3VA 5I42A 3SUPA 3K5MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FZF A;  2HMI A;  4WFA L;  2ZM6 K;  1YJN N;  1P0A A;  4LC9 B;  3SUO A;  2V51 B;  5BR8 K;  5IT9 O;  3S3O A;  3EY1 A;  4M7Y A;  3KD5 E;  3QB0 A;  1HR0 K;  2G8W A;  3OS1 A;  3H6E A;  2HHU A;  3ZX2 A;  3LDL A;  2GUP A;  4FLV A;  1NM1 A;  4BRM A;  3O4W A;  4CZI A;  2ETJ A;  4WE1 A;  1WMT A;  5AQN A;  3QEI A;  3ENO A;  4DMN A;  5C2F A;  2A6A A;  4A2A A;  2MN5 A;  2IVO A;  1IH7 A;  3Q7B A;  2DTU A;  1NGD A;  3BZC A;  5AQF A;  3UKR B;  3ZSY A;  4KB0 A;  5BPM A;  4JI4 K;  2D56 A;  4CK2 A;  2P9N B;  1T6D A;  1XMO K;  3UKU A;  1HRH A;  1RT4 A;  1NRB A;  2FLO A;  5GAE P;  1ZYV A;  1OH5 A;  2QM1 A;  2QWM A;  3ENH A;  1JXE A;  3K5O A;  3FR0 A;  4KI4 A;  1JLC A;  1NOZ A;  4CHO A;  4JI0 K;  3HPH A;  3OYH A;  4DV1 K;  3HOS A;  1BMR A;  4H5V A;  2KPY A;  4A61 A;  4JI7 K;  4BE7 B;  1DEJ A;  2Z1H A;  4AQY K;  4DV5 K;  4DFM A;  2UXC K;  3C7N B;  5AFU H;  4BQZ A;  3DOK A;  4V19 S;  3B6P A;  4FZY A;  3T3F A;  3CJC A;  5GAD P;  4HUE A;  1BQM A;  2ZQB A;  3JS6 A;  4CEB A;  4BRP A;  4BDZ A;  2XHB A;  3EEQ A;  2FBX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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