4H5NA

Hsc70 nbd with po4, na, cl
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5nA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5nA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5nA04
2E20A 3DXKA 2CGLA 1NGJA 3CJBA 1YVNA 4H0TB 1K8KB 2QWNA 4IJAA 5AQPA 3O80A 3VESA 1NGDA 1QQMA 1TYQB 3D2EA 3IMXA 1MWMA 1Z05A 3U9DA 3RSEA 5BRHA 4FPBA 5AQXA 3GBTA 3U9ZA 2J4RA 2E2QA 1QQNA 5BPNA 3EO3A 4FO0A 4B1VA 3MN9A 3CETA 2ITMA 4BRDA 4MLHA 3VEOA 1GLAG 2YHWA 3KVGA 1ESVA 1TUUA 3BEXA 2HMPA 3ULEA 1E4GT 4BRFA 1NGBA 3ENOA 3FZHA 2QWLA 3VENA 4BC3A 4DQ8A 5EXWA 5AFUH 2ASPA 4K43A 3KHYA 4ISFA 1J6ZA 2FSJA 5AZJB 3CJ1A 3F9MA 3QBXA 3CJ9A 3M3ZA 5EX5A 3CQYA 4BC5A 5FPNA 5EOYA 1GLFO 1NGFA 3L4IA 5AR0A 3HM8A 3UKRA 3VGKA 5JMVA 4B1UB 4CBXA 5JLHA 3FZMA 3MK6A 5AQMA 3QDKA 3VF4A 3IFRA 2FLOA 3H1VX 4H0YB 1DGKN 4MO5A 4WQ5C 5ADXA 3G25A 5AQJA 1GLBG 2NLXA 4CD1A 2QM1A 4BRNA 2V7ZA 5AQTA 3QMLA 1ZBSA 3MDQA 3HI0A 1MWKA 4XH5A 3WEEA 3CJCA 4BRGA 3H6EA 3CERA 1GLJO 1BWFO 3D2FA 3ATVA 2FF6A 4QS8A 4H03B 1ATRA 1JCEA 1NLVA 2ZGZA 2CH6A 3BF3A 3MN5A 3BUZB 3AY9A 5AQVA 2E2PA 4B1YB 4PKHA 4BRIA 5E26A 3QFPA 1T44A 5AQSA 2W40A 4H5WA 4PKGA 2P9UA 1V4TA 2E88A 3EZWA 5AQNA 4CZGA 2Q0UA 2CGJA 2FF3B 2HF4A 1QZ6A 2P9KB 4CI6A 1MA9B 5AZIA 3FZFA 5JICA 3FGUA 4WQ4C 2AP1A 4FWMA 4H0XB 4JN4A 4JNEA 4BR9A 4EHTA 4A61A 5F0XA 3MN6A 1NGCA 2ZWHA 4BRMA 5BPMA 1BO5O 3CJ7A 4FWQA 4BQZA 3O8MA 1U2VB 4BRLA 1QHAA 2GELA 1ATSA 2DPNA 1LCUA 3A8YA 3EKUA 4LC9B 4CZHA 1X9JA 5AQQA 2OANA 1HX1A 2IVNA 4AM7A 3UKUB 3J8AA 5CE3A 2FSNA 2YJEA 4PKIA 4BGBA 2GWJA 2P9PA 4KBOA 2QWMA 5AQRA 3LM9A 3ZETA 4BRPA 4MLEA 4CZEA 2ZGYA 3WXKA 1DEJA 3VPZA 1NGEA 3O1WA 4HTLA 3MCPA 3ZX3A 2P9IA 1WOQA 1H1VA 3R9PA 3A5OC 3VGLA 4BRHA 3H46O 2PAVA 2HOEA 4BC2A 5AQGA 4BR7A 5LY3A 2YCHA 2V52B 4JHDA 3U8XA 4C23A 4FWKA 4EFHA 1NGIA 3MN7A 1SAZA 2E1ZA 4B9QA 3O6WA 1C0FA 1T6CA 3IUCA 1NGGA 2IIRA 1TUYA 3AAPA 4FWSA 3HBTA 5BREA 4J8FA 1YXQA 1HKGA 4CZJA 3LDLA 1KAYA 4M7XA 2V51B 3DXKB 2A3ZA 4NO7A 1KAZA 4CZIA 4RTFD 3QBWA 3H45C 3DAWA 2CGKA 3LDQA 1SZ2A 3VETA 5KPRA 2YHYA 3D2EB 3ZEUA 5AQLA 5AQIA 3RSEB 1NBWA 1SQKA 3SMSA 3OHRA 1LOTB 3LM2A 3JS6A 5JLFA 1ATNA 3M6GA 3QICA 3DXMA 2VCPA 4IJNA 3ZX2A 2P9NA 2ZF5O 2A40A 4DB3A 3L0QA 5AQZA 3CI5A 4K25A 1QZ5A 5FPMA 1YUWA 3DWLA 3ULEB 3R8EA 3O4WA 3WXJA 4IWVA 5E84A 3SJHA 4BRAA 2E8AA 1HKCA 3A5LC 5EY4A 1R59O 3VERA 4CBWA 2D0OA 3VEYA 4A62A 4EHUA 3LDPA 3FLCO 4I6MA 4K42A 2P9SA 2P9LA 3CIPA 3H3OB 3A0IX 3GL1A 1XC3A 2I7PA 5KQDA 2EWSA 2QWRA 1JCGA 5BPLA 3UKRB 3FR0A 2NRHA 3WXIA 2Q0RA 4QS9A 2Q36A 1CZAN 2QWQA 3C7NA 3UB5A 3B8AX 1IG8A 3VEZA 5BN9A 3QB0A 3JXUA 3FE1A 4FOEA 3GDQA 2BUPA 2Q2RA 3AARA 3HTVA 4BC4A 4FWRA 4FWNA 4BROA 4EAHD 1NWKA 4FWLA 2GWKA 4BG8A 5BN8A 4BR2A 2KHOA 5AQWA 2VYPA 4M7YA 4H5VA 3C0BA 3WEEB 4JD2A 5ADXH 4B1XB 4FPAA 2Q31A 5KPTA 3GG4A 4BRKA 3D2FB 2FSKA 4K41A 3W3DA 4IZ9A 3KZBA 1XUPO 1GLDG 1TYQA 4XH1A 3BP8A 3UE5A 1S22A 1JCFA 3WQUA 1NMDA 3CJAA 3VGMA 4ISGA 4H0VB 2YJFA 2P9UB 3SMPA 4BGAA 2VWBA 5EVZA 1X3MA 2IVPA 1WUAA 5AFUA 3GOIA 2A42A 5LJWA 1Q18A 1G99A 3A5NC 5AZIB 3MMVA 1RFQA 3VEXA 1RDWX 1BA0A 4PL7A 4WYBA 2HF3A 4HWIA 4FL9A 2QWOA 4O8KA 4L3QA 1HJOA 3WQTA 4XEIA 5BRDA 2QWPA 5AZJA 5AQKA 1BU6O 4AM6A 4WQ5A 2A41A 4E1JA 1NM1A 3O5BA 3GE1A 4QS7A 4MO4A 2H3GX 4H5RA 4DCHA 1ZC6A 1T6DA 2D4WA 1U6ZA 2V7YA 3I8BA 2P9PB 2GEMA 3EN9A 3ZETB 2Q1NA 4BG9A 5F2RA 1XQSC 3O08A 4BR0A 2E2OA 4CZKA 4H5NA 1BOTO 3IDHA 5BRFA 3ATUA 3ENHA 3ZX0A 4O5FA 5FPEA 3VF2A 2QXLA 4DHYA 3CHWA 1EQYA 2D1KA 2P9IB 3P4IA 3R6MA 1MDUB 2F9WA 2GUPA 4BVPA 4BRQA 4Y0WA 4JHDB 1D4XA 4F9OA 3SLCA 1NGAA 3ID8A 4FOIA 3TU5A 2NZTA 3SK3A 4CD3A 3H3NO 4XH4A 1DKGD 4B1ZA 2A5XA 5F1XA 1NGHA 3O1BA 1BUPA 3WUHA 1C0GA 4BVOA 4JAXA 2A6AA 3FFKB 2W41A 2ASOA 1YAGA 4CBUA 3L6QA 2IVOA 2BTFA 3D7EO 4WQ4A 1QQOA 2WUSA 1IJJA 4BREA 5I9EB 2FXUA 1S3XA 1HKBA 2E2NA 3VEVA 3ZEUB 4CZMA 3H1QA 3HSCA 3I33A 3VEWA 3HZ6A 3EKSA 2YI1A 3LDNA 4IO8A 4FSVA 4NB4A 2P9KA 3DXMB 1HPMA 2P9NB 1V4SA 2ASMA 3U4LA 3VF6A 4YDUA 4PL8A 4RWTA 3BF1A 1HLUA 5AQHA 3W0LA 1KXPA 2Q97A 5TKYA 1Y64A 4A2BA 1OKJA 5B8HA 3LL3A 4CJ7A 1U2VA 1RGIA 3A5MC 1GLLO 4CZLA 1P8ZA 5LJVA 3TPQA 1BA1A 2QW9A 4ISEA 2CH5A 4RCHA 5ELZA 3WT0A 4I6MB 5BR9A 2I7NA 5KPZA 2P9SB 1KAXA 2P9LB 2AA4A 3UKUA 2PBDA 1K8KA 3S41A 4A2AA 2YHXA 4BQLA 4H5TA 1BG3A 1ZXOA 5AQUA 3LDOA 3DJCA 4FWPA 3CQXA 4FWOA 4CZFA 3M1FA 4GNIA 5AQOA 3C7NB 2F9TA 3WXLA 5FPDA 1GLEG 4H0OA 1E4FT 4BR5A 5KQ8A 2E1YA 3VOVA 4B1WB 3FZKA 1HUXA 4BRCA 3QFUA 1X3NA 4IXCA 3AAQA 4GY2B 1Z6RA 4M63C 4EIAA 3FZLA 4BR4A 5AQFA 2D0PA 4H0PA 1BDGA 1GLCG 2GTDA 3EL2A 4JD2B 2UYTA 5AQYA 4Z94A 4YDUC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K5NA 2E20A 3DXKA 1S1TA 3CJBA 1GOCA 2QWNA 4FVUA 4FYDA 1HNWK 4LF8K 1REVA 3NAEA 3KKSA 2D0BA 5C42A 1Z05A 1S6PA 3SF4D 3GBTA 4KHYA 3O4QA 1KSPA 2HNZA 1X9MA 5CYMA 2E2QA 4FO0A 2LI7A 1VQMN 3MN9A 1IV0A 3AVAA 4Z4HA 2G8WA 4IO9L 3P83D 1P0AA 1SKRA 1N8RO 4DV7K 1E4GT 2NY9X 3FZHA 3AA5X 3QIPA 3PX4A 5EXWA 3V9UA 3V4IA 2ASPA 5KI6A 3K57A 4IFVA 3L2UA 1J6ZA 1TKXA 1A5VA 2FSJA 3P38A 3OYFA 1VNAA 3CJ9A 2QK9A 4OKJA 5M1FA 3CQYA 4BC5A 2NRWA 4K0KK 5EOYA 1IKYA 1T03A 1NGFA 3UKRA 3O9UA 4B1UB 2YKMA 2Z1IA 3MK6A 4F4KA 1VQ6N 3E66A 2N2QA 3LDSA 2YV0X 2FLOA 4KHNA 4B3MK 3BDPA 5ADXA 4DQQA 4FJKA 1NK5A 5HP1A 3NHGA 4XIUA 1BCMA 4CIGA 2R7YA 3HI0A 4CFDA 1MWKA 4JK7A 4YOXA 1RT3A 4Z4EA 3CERA 1GLJO 3IAYA 2LN8A 3ATVA 3ZLJA 2FF6A 3CM5A 1EWQA 1NLVA 1ASWA 4CEEA 1LWFA 1C56A 4KPYA 2W40A 2HNYA 2P9UA 1T8EA 3RMAA 2E88A 2CGJA 2RE2A 3NGIA 1UGLA 1WNSA 1S1XA 3FZFA 4HE7A 5M1NA 1HNZK 4WQ4C 2NRTA 4JN4A 3OYMA 2K35A 4EHTA 3NGYA 4I2PA 4A61A 3PIPL 4Q0BA 1LWEA 4FWQA 3O8MA 4DR5K 2HHVA 4NYFA 4DTNA 4BRLA 1ATSA 1NK8A 4FLXA 3A8YA 3KOYA 1W0HA 3NGZA 2I61A 4LC9B 3ZSOA 2KFZA 1K8AO 3VMFB 2XY5A 2XRIA 2P9PA 4WF9L 5AQRA 5GAEP 2WTUA 3VPZA 4M3TA 2PY5A 1GOBA 3THXA 2JLEA 2E6LA 3ALYA 1KLNA 1WOQA 1H1VA 3I56N 1D9FA 2YCHA 3L2QA 3VQ8A 3F2KA 3MN7A 1ZUTA 5HOOA 3IUCA 1NGGA 3HP6A 5M1OA 3HBTA 3K5MA 4J8FA 1KFSA 1KFDA 2V51B 2A3ZA 4NO7A 4C8OA 3TAPA 4X64K 3OYBA 3D2EB 5AQLA 1SUQA 1NBWA 4NCBA 3LM2A 1Q9XA 5JLFA 3M6GA 4I9LA 1NKEA 2VCPA 1N6QA 5AQZA 1ILYA 4K25A 4DMNA 3THYA 1KV0A 1YUWA 4PQUA 1KVAA 3E7RL 3DWLA 4OKEA 1WSFA 3R8EA 4ZTJA 1LAWA 4JKCA 1GPTA 1IKWA 3WXJA 4IWVA 1LQIA 5E84A 1EETA 3HPOA 2E8AA 3ITHA 4DV2K 3MEDA 3SAFA 1ZBLA 3CCSN 1VSMA 4DR4K 2YC1C 2JGUA 3FLCO 4CJWA 2P9SA 3KHWA 3CIPA 3A0IX 3GL1A 3MX5A 3QNNA 2E3GA 2JWKA 3MXIA 2QWRA 4WCEL 5BPLA 3FR0A 2NRHA 1T3VA 2Q0RA 2KSKA 3MX2A 4BDYA 4QCLA 4FZZA 3RMDA 2QWQA 3CCVN 4JV5K 3B8AX 1IG8A 3VEZA 3ZCMA 1HNVA 5BN9A 4FOEA 4E0DA 1IG9A 3AARA 4FWNA 1NWKA 4FWLA 4OGEA 1BK8A 5BN8A 3KK2A 3C0BA 4GV9A 4B1XB 4FPAA 2OPPA 4YY3K 4ELTA 2QTDA 2RPIA 3MXMA 3D2FB 2GX9A 4FJMA 2MZ0A 2Z1GA 2VG7A 4RW6A 4HUEA 5D3GA 1JJ2M 1ZBIA 2N2RA 3OYLA 1XUPO 3C6AA 4M3RA 1TYQA 4WFAL 4DV1K 3G0ZA 4RW7A 4CEQA 3TAQA 3DLGA 2D0AA 2O8BA 3WQUA 1R0AA 1NMDA 5DMRA 4N41A 4C1NK 1VQNN 2RKIA 3TSPA 3KP1A 2G8VA 1TKDA 4KRFA 3SMPA 1RTJA 4F3OA 2O8EB 4NLCA 1VSHA 1WUAA 1OH6A 2ZJQL 3QEIA 1G99A 1BI4B 4YOTA 3MECA 1U47A 2OPQA 2HF3A 1ZYQA 2D56A 3WQTA 2NRZA 5AZJA 4BY9C 3KP0A 1BU6O 1XWLA 4O0JA 1M90O 4ZHRA 4E1JA 4GW6A 3TTCA 4DFJA 4QOZB 5KRSA 4AILC 1VQPN 4CF1A 4DCHA 4DSEA 1T6DA 1TL1A 2O8CA 2O8DB 3TANA 4BG9A 2HVIA 2Q1NA 3HVTA 5F2RA 3VQ6A 4CZKA 3SNNA 1YIJN 5BRFA 3ZX0A 4MFBA 1KTQA 4KREA 4KH4A 4CHNA 1EQYA 1ICAA 1MDUB 2F9WA 3M8PA 4BRQA 4ID1A 1WMTA 3L4QA 3R3LA 5KGWA 5C10A 4N47A 1FW6A 1NGAA 4FOIA 4FJ8A 4JRPA 3NF7A 3SK3A 4CD3A 3OBYA 4Z4CA 4F3TA 3VN5A 2A5XA 4RW4A 3G4SN 4CGDA 3F9KA 2A6AA 1OVQA 4KH6A 4CIFA 3L6QA 1EP4A 5H1SQ 3D7EO 3ZSYA 2FC0A 3KIOA 2WUSA 1IJJA 5I9EB 1QVGM 4LSNA 3VEVA 1N5YA 5BR8K 4O4GA 5CYQA 2P5GA 3ID6A 3B6PA 4FSVA 4Z0UA 2P9KA 3DXMB 1ZVEA 3MWTA 1HPMA 1FXXA 4A59A 5GINA 2I5JA 3CC2N 4JI1K 4YDUA 4A2BA 4J2BA 2B4JA 4CEFA 4YOWA 2LSNA 1X9WA 3AVIA 3LL3A 4H8KA 5LJVA 3F5TA 4Z4GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K5N A;  2E20 A;  3DXK A;  1S1T A;  3CJB A;  1GOC A;  2QWN A;  4FVU A;  4FYD A;  1HNW K;  4LF8 K;  1REV A;  3NAE A;  3KKS A;  2D0B A;  5C42 A;  1Z05 A;  1S6P A;  3SF4 D;  3GBT A;  4KHY A;  3O4Q A;  1KSP A;  2HNZ A;  1X9M A;  5CYM A;  2E2Q A;  4FO0 A;  2LI7 A;  1VQM N;  3MN9 A;  1IV0 A;  3AVA A;  4Z4H A;  2G8W A;  4IO9 L;  3P83 D;  1P0A A;  1SKR A;  1N8R O;  4DV7 K;  1E4G T;  2NY9 X;  3FZH A;  3AA5 X;  3QIP A;  3PX4 A;  5EXW A;  3V9U A;  3V4I A;  2ASP A;  5KI6 A;  3K57 A;  4IFV A;  3L2U A;  1J6Z A;  1TKX A;  1A5V A;  2FSJ A;  3P38 A;  3OYF A;  1VNA A;  3CJ9 A;  2QK9 A;  4OKJ A;  5M1F A;  3CQY A;  4BC5 A;  2NRW A;  4K0K K;  5EOY A;  1IKY A;  1T03 A;  1NGF A;  3UKR A;  3O9U A;  4B1U B;  2YKM A;  2Z1I A;  3MK6 A;  4F4K A;  1VQ6 N;  3E66 A;  2N2Q A;  3LDS A;  2YV0 X;  2FLO A;  4KHN A;  4B3M K;  3BDP A;  5ADX A;  4DQQ A;  4FJK A;  1NK5 A;  5HP1 A;  3NHG A;  4XIU A;  1BCM A;  4CIG A;  2R7Y A;  3HI0 A;  4CFD A;  1MWK A;  4JK7 A;  4YOX A;  1RT3 A;  4Z4E A;  3CER A;  1GLJ O;  3IAY A;  2LN8 A;  3ATV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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